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circ_0001955靶向miR-149对前列腺癌DU145细胞系放射敏感性的实验研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨circ_0001955对前列腺癌DU145细胞系放射敏感性的影响及分子机制。方法:将si-con、si-circ_0001955、miR-con、miR-149转染至DU145细胞中,分别记为si-con、si-circ_0001955、miR-con、miR-149组;将miR-149与pc-circ_0001955共转染至DU145细胞记为miR-149+pc-circ_0001955组,以未经任何处理的细胞作为空白对照组。实时荧光定量PCR检测circ_0001955和miR-149表达水平;MTT检测细胞活力;流式细胞仪检测细胞凋亡;Transwell检测细胞迁移和侵袭;蛋白质印迹法检测MMP-2、MMP-9、Cleaved caspase-3、Cleaved caspase-9、γ-H 2AX蛋白表达;细胞克隆形成实验检测细胞放射敏感性;双荧光素酶报告实验验证circ_0001955和miR-149的靶向关系。 结果:细胞中circ_0001955高表达,miR-149低表达。沉默circ_0001955或过表达miR-149后细胞活性、迁移和侵袭数降低,MMP-2、MMP-9表达水平降低,Cleaved caspase-3、Cleaved caspase-9表达水平升高,细胞凋亡率升高( P<0.05)。4 Gy X线照射后细胞中γ-H 2AX表达水平升高,细胞存活分数降低,敏感性比1.38。circ_0001955靶向调控miR-149,同时过表达circ_0001955和miR-149后细胞增殖活性、迁移和侵袭细胞数升高,细胞凋亡率、细胞存活分数升高,敏感性比0.72。 结论:沉默circ_0001955靶向上调miR-149抑制DU145细胞增殖、迁移、侵袭,诱导细胞周期阻滞,诱导细胞凋亡和增加细胞放射敏感性。
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编辑人员丨4天前
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微小RNA-149调控肿瘤细胞增殖和转移的分子机制
编辑人员丨4天前
目的:探讨微小RNA(miRNA,miR)-149调控卵巢癌细胞增殖和转移的影响及其分子机制。方法:选取2019年1月至2021年1月河南大学淮河医院手术切除的47例卵巢癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肿瘤组织和癌旁组织中miR-149水平。并采用荧光定量PCR分析人卵巢上皮细胞HOSEpiC、卵巢癌细胞SW620和skov3中miR-149水平;采用miRNA和miR-149慢病毒感染SW620细胞,命名为miRNA组和miR-149组,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)分析两组细胞的增殖能力;采用流式细胞术分析两组细胞凋亡和周期变化;采用Transwell分析两组细胞的迁移能力;生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-149的靶基因;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析miR-149靶蛋白表达、增殖、凋亡、周期和迁移相关蛋白表达水平。组间计量数据比较采用 t检验。 结果:癌旁组织miR-149表达水平(1.07±0.15)明显高于卵巢癌组织(0.73±0.09),差异有统计学意义( t=13.490, P<0.05)。人卵巢上皮细胞HOSEpiC miR-149表达水平(1.27±0.10)明显高于卵巢癌细胞SW620和skov3(0.80±0.08、0.70±0.08),差异有统计学意义( t=8.859、10.740, P<0.05)。miRNA对照组细胞48 h吸光度值(1.91±0.08)明显高于miR-149组(1.23±0.18),差异有统计学意义( t=8.655, P<0.05)。miRNA对照组细胞凋亡比例[(3.69±1.06)%]明显低于miR-149组[(18.90±2.35)%],差异有统计学意义( t=14.470, P<0.05)。miRNA对照组细胞G 0/G 1期比例[(39.91±2.86)%]明显高于miR-149组[(31.33±2.42)%],差异有统计学意义( t=5.616, P<0.05)。miRNA对照组细胞S期比例[(16.73±1.51)%]明显低于miR-149组[(20.48±2.04)%],差异有统计学意义( t=3.619, P<0.05)。miRNA对照组细胞凋亡比例[(127.67±21.69)个]明显高于miR-149组[(99.50±10.21)个],差异有统计学意义( t=2.887, P<0.05)。miRNA对照组细胞细胞核增殖抗原(Ki-67)和黏着斑激酶(FAK)蛋白表达水平(0.94±0.06、0.91±0.05)明显高于miR-149组(0.73±0.06、0.59±0.08),差异有统计学意义( t=8.655、8.488, P<0.05)。RGS17是miR-149的靶基因。癌旁组织中RGS17蛋白表达水平(0.97±0.02)明显低于卵巢癌细胞RGS17蛋白表达水平(2.17±0.11),差异有统计学意义( t=15.620, P<0.05)。miRNA对照组细胞FAK蛋白表达水平(1.24±0.09)明显高于miR-149组(0.73±0.08),差异有统计学意义( t=10.200, P<0.05)。 结论:miR-149在卵巢癌组织和细胞呈低表达,miR-149过表达显著抑制卵巢癌细胞的增殖、周期和迁移,诱导细胞凋亡。
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编辑人员丨4天前
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环状RNA-EIF3I对肝细胞癌生长转移的影响及机制研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨环状RNA-EIF3I(circ-EIF3I)对肝细胞癌(HCC)生长转移的影响及其可能作用机制。方法:选取2014年5月至2015年10月河北医科大学第四医院收治的39例HCC患者为研究对象,其中男性29例,女性10例,年龄(62.2±5.6)岁。术中获取部分HCC组织与癌旁组织,用荧光定量聚合酶链反应或蛋白质印迹法分别检测二者circ-EIF3I和磷酸甘油酸激酶1(PGK1)的表达量;利用小分子RNA干扰和基因过表达实验调节其在Hep3B、Huh-7肝癌细胞中的表达,然后以噻唑兰细胞活力实验检测细胞增殖能力,Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力,最后以双荧光素酶报告实验检测靶向关系。结果:与癌旁组织比较,HCC组织中circ-EIF3I[(4.32±0.62)比(1.24±0.59)]和PGK1[(2.69±0.19)比(1.00±0.07)]的相对表达量升高,差异有统计学意义(均 P<0.05)。与阴性对照组比较,circ-EIF3I小分子干扰RNA组细胞活力降低[Hep3B:(55.3±7.5)%比(100.0±9.2)%;Huh-7:(42.7±6.0)%比(100.0±5.6)%],迁移细胞数减少[Hep3B:(71.0±10.0)比(130.0±15.0)个;Huh-7:(50.0±8.5)比(125.0±10.0)个],侵袭细胞数亦减少[Hep3B:(52.0±7.0)比(105.0±13.0)个;Huh-7:(60.0±8.0)比(144.0±11.0)个],差异均有统计学意义(均 P<0.05)。双荧光素酶报告实验证实circ-EIF3I可靶向结合miR-149-5p/miR-1271-5p,miR-149-5p/miR-1271-5p可靶向结合PGK1;PGK1过表达可明显逆转敲低circ-EIF3I对肝癌细胞增殖、迁移及侵袭的作用。 结论:敲低circ-EIF3I可通过调控miR-149-5p/miR-1271-5p/PGK1分子轴从而抑制HCC细胞增殖、迁移及侵袭。
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编辑人员丨4天前
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强直性脊柱炎患者外周血环状RNA的表达谱研究
编辑人员丨4天前
目的:筛选AS患者PBMCs中差异表达的环状RNA(circRNA),分析其表达谱以探讨circRNAs在AS发病中的作用。方法:采用circRNA微阵列芯片技术检测3例AS活动期(ASA)患者,3例AS稳定期(ASS)患者和3名健康对照者(HC)PBMCs中circRNAs的表达并通过倍数变化(FC)和 P值进行筛选,找到差异表达的circRNAs;从差异表达靠前的circRNAs中随机选择4个circRNAs,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证芯片结果;对差异表达的circRNAs进行基因本体论(GO)分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,并通过微RNA(miRNA)靶标预测软件对circRNA/miRNA相互作用关系进行预测。采用 t检验和Mann-Whitney U检验等方法对数据进行统计分析。 结果:芯片结果显示,ASA组较HC组共有800个显著差异表达的circRNAs(FC>1.5, P<0.05),其中466种上调,334种下调;ASS组较HC组共有1 149个显著差异表达的circRNAs(FC>1.5, P<0.05),其中589种上调,560种下调;ASA组较ASS组间共有233个显著差异表达的circRNAs(FC>1.5, P<0.05),其中145种上调,88种下调。RT-qPCR验证结果提示,4个差异表达的circRNAs表达趋势与芯片结果一致。GO分析结果提示,这些差异表达的circRNAs主要参与无义介导的mRNA衰变、Rho GTPase酶结合等过程;KEGG分析结果在辅助性T细胞(Th)17细胞分化、趋化因子信号通路等处得到富集;miRNA靶标预测软件结果提示差异表达的circRNAs可能靶向结合miR-650、let-7b-5p等miRNAs发挥作用。 结论:和HC组相比AS患者PBMCs中存在差异表达的circRNAs,推测这些circRNAs可能参与AS的发病。
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编辑人员丨4天前
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臭椿酮抑制ENST00000441270/miR-149轴影响结直肠癌细胞增殖和凋亡的实验研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨臭椿酮对结直肠癌细胞增殖和凋亡的影响。方法:根据检测结果实施分组,采用低(0.2 μmol/L)、中(0.4 μmol/L)、高剂量(0.6 μmol/L)的臭椿酮干预结直肠癌SW1116细胞24 h,细胞计数试剂盒(CCK-8)检测细胞活力,集落形成实验检测克隆形成数,流式细胞术检测细胞凋亡,实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测ENST00000441270和微小RNA-149(miR-149)的表达水平。转染ENST00000441270小干扰RNA(si-ENST00000441270)至SW1116细胞,采用上述方法检测干扰ENST00000441270表达对SW1116细胞活力、克隆形成以及凋亡的影响。双荧光素酶报告基因实验验证ENST00000441270与miR-149之间靶向关系。两组间比较采用 t检验,多组间比较采用单因素方差分析和LSD- t检验。 结果:臭椿酮低剂量组SW1116细胞的活力[(0.84±0.05)比(0.84±0.05), t=0.529, P>0.05]、克隆形成数[(110.00±3.56)个比(111.33±3.86)个, t=0.499, P>0.05]、凋亡率[(7.56±0.80)%比(7.35±0.63)%, t=0.307, P>0.05]、ENST00000441270[(0.98±0.06)比(0.99±0.06), t=0.238, P>0.05]和miR-149[(1.01±0.07)比(0.99±0.07), t=0.303, P>0.05]表达与对照组比较,差异均无统计学意义。臭椿酮中、高剂量组SW1116细胞的活力(0.63±0.04、0.40±0.03比0.84±0.05, t=7.667、12.667, P<0.05]、克隆形成数[(85.67±2.87)个、(58.33±2.62)个比(111.33±3.86)个, t=9.487、24.666, P<0.05]、ENST00000441270表达[(0.69±0.05)、(0.41±0.03)比(0.99±0.06), t=7.138、13.799, P<0.05]低于对照组,差异均有统计学意义,细胞凋亡率[(12.61±0.91)%、(21.66±0.97)%比(7.35±0.63)%, t=7.715、12.036, P<0.05]、miR-149表达[(1.48±0.08)、(1.92±0.10)比(0.99±0.07), t=7.415、14.074, P<0.05]高于对照组,差异均有统计学意义。si-ENST00000441270组SW1116细胞活力[(0.35±0.02)比(0.88±0.05), t=17.047, P<0.05]、克隆形成数[(49.67±2.87)个比(112.67±3.40)个, t=24.525, P<0.05]低于阴性对照(si-NC)组,细胞凋亡率[(22.62±0.82)%比(7.58±0.65)%, t=24.896, P<0.05]高于si-NC组,差异均有统计学意义。miR-149是ENST00000441270的靶基因。 结论:0.4、0.6 μmol/L的臭椿酮能够抑制结直肠癌细胞SW1116增殖,诱导细胞凋亡,其机制可能与抑制ENST00000441270/miR-149分子轴有关。
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编辑人员丨4天前
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微小RNA-149靶向P-糖蛋白对皮肤基底细胞癌顺铂耐药的影响
编辑人员丨4天前
目的:观察微小RNA(miRNA,miR)-149靶向P-糖蛋白(P-gp)对皮肤基底细胞癌阿霉素耐药的影响。方法:选取2014年8月到2018年8月河南省人民医院皮肤科收治的74例皮肤基底细胞癌患者作为研究对象。根据患者对顺铂化疗的敏感性程度,分为敏感组和耐药组。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析两组肿瘤组织中miR-149表达水平。采用脂质体法转染miR-149模拟物和对照miRNA至皮肤基底细胞株癌细胞株A431,分别作为miR-149组和对照组。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷(EdU)染色分析顺铂对两组细胞增殖能力的影响。采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-149的靶基因;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析肿瘤组织中靶基因的表达和miR-149对靶基因表达的影响。组间数据比较采用 t检验。 结果:耐药组患者肿瘤组织miR-149表达水平(0.48±0.18)较敏感组miR-149表达水平(1.21±0.23)显著下降,差异有统计学意义( t=3.126, P<0.05)。CCK-8和EdU染色结果显示,经顺铂处理后,miR-149组细胞增殖能力(0.59±0.17)较对照组细胞(1.27±0.21)明显下降,差异有统计学意义( t=3.010, P<0.05)。miR-149组细胞EdU染色阳性率[(35.56±6.90)%]较对照组细胞[(79.32±8.01)%]明显下降,差异有统计学意义( t=3.399, P<0.05)。生物信息学和双荧光素酶报告基因显示P-gp是miR-149靶基因。耐药组肿瘤组织中P-gp蛋白表达水平(1.24±0.19)明显高于敏感组肿瘤组织(0.61±0.18),差异有统计学意义( t=2.091, P<0.05)。miR-149组细胞P-gp蛋白表达水平(0.57±0.18)较对照组细胞(1.97±0.32)明显增加,差异有统计学意义( t=2.581, P<0.05)。 结论:miR-149通过调节P-gp蛋白的表达,介导了皮肤基底细胞癌顺铂化疗耐药。
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编辑人员丨4天前
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P物质活化NK92-MI细胞脱颗粒及差异circRNA表达的研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨神经肽P物质(substance P,SP)活化NK92-MI细胞脱颗粒作用,分析差异表达circRNA调控NK92-MI细胞可能的机制。方法:将培养后的NK92-MI细胞分为空白对照组、SP刺激组和NK-1受体拮抗剂(neurokinin-1 receptor antagonist,NK-1RA)组。荧光定量PCR(real-time quantification PCR,qRT-PCR)法检测并分析NK92-MI细胞经SP刺激后穿孔素mRNA表达的时间效应,流式细胞术检测NK92-MI细胞脱颗粒标志物CD107a的表达,高通量测序技术分析circRNA表达谱,qRT-PCR法验证差异倍数最大的circZNF609和circAMBRA1的表达。生物信息学分析circZNF609、circAMBRA1与穿孔素相关的微小RNA(microRNA,miRNA),并分析circZNF609、circAMBRA1与穿孔素mRNA表达的相关性。结果:刺激12 h后,SP刺激组穿孔素mRNA表达较对照组升高约2.06倍,刺激24 h后,穿孔素mRNA表达继续升高,约为对照组3.65倍,差异均具有统计学意义( t值分别为4.00、4.72, P值均<0.05);在12 h时,NK-1RA组穿孔素mRNA的表达高于对照组,差异具有统计学意义( t=2.39, P<0.05),但在24 h时,与对照组比较差异无统计学意义( P>0.05)。与静息NK92-MI细胞组相比,K562刺激组、K562+SP组、K562+SP+NK-1RA组中NK92-MI细胞CD107a的表达显著升高{(0.81±0.38)%比[(9.59±2.52)%,(17.78±1.94)%,(10.19±2.04)%], t值分别为6.27、12.19、7.83, P值均<0.05}。SP作用NK92-MI细胞后共有9个差异表达的circRNAs:circZNF609、circAMBRA1、circCAMSAP1、circAAGAB、circLMBR1、circGNB1、circBPTF、circGPI和circCSNK1G3。NK-1RA可以阻断除circCSNK1G3外的上述8个circRNAs的表达。qRT-PCR验证circZNF609和circAMBRA1的表达与测序结果一致。生物信息学预测,circZNF609、circAMBRA1与穿孔素相关的miRNAs为miR-149-5p、miR-940和miR-942-5p。circZNF609、circAMBRA1与穿孔素mRNA的表达均呈负相关( r值分别为-0.57、-0.74, P值均<0.05)。 结论:SP可以通过与NK-1R结合活化NK92-MI细胞,下调circZNF609和circAMBRA1的表达,上调穿孔素mRNA的表达,促进NK92-MI细胞脱颗粒增强其杀伤功能。
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编辑人员丨4天前
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miR-149-5p在白藜芦醇减轻LPS诱导的大鼠心肌细胞损伤中的作用
编辑人员丨4天前
目的:评价微小RNA-149-5p(miR-149-5p)在白藜芦醇减轻LPS诱导的大鼠心肌细胞损伤中的作用。方法:大鼠心肌细胞系H9C2经培养后,采用随机数字表法分为5组( n=27):对照组(C组)、LPS组、白藜芦醇组(RSV组)、miR149-5p抑制剂阴性对照组(LRN组)和miR149-5p抑制剂组(LRI组)。采用含10 μg/ml LPS的培养液孵育细胞24 h制备心肌细胞损伤模型。RSV组经白藜芦醇(终浓度10 μmol/L)孵育24 h,随后用含10 μg/ml LPS的培养液孵育24 h;LRN组和LRI组分别转染miR149-5p抑制剂阴性对照品和miR149-5p抑制剂,随后操作同RSV组。采用CCK-8法检测细胞活力,流式细胞仪检测细胞凋亡率,微板法检测上清液LDH浓度和细胞还原型谷胱甘肽(GSH)含量,TBA反应法检测MDA含量,WST-1法检测SOD活性,DCFH-DA荧光探针检测ROS水平,ELISA法检测上清液TNF-α和IL-6浓度,RT-qPCR法检测miR-149-5p表达。 结果:与C组比较,LPS组miR-149-5p表达下调,细胞活力降低,上清液LDH、TNF-α和IL-6浓度、细胞凋亡率、ROS水平和MDA含量升高,GSH含量和SOD活性降低( P<0.05)。与LPS组比较, RSV组miR-149-5p表达上调,细胞活力升高,上清液LDH、TNF-α和IL-6浓度、细胞凋亡率、ROS水平和MDA含量降低,GSH含量和SOD活性升高( P<0.05)。与RSV组或LRN组比较,LRI组细胞miR-149-5p表达下调,细胞活力降低,上清液LDH、TNF-α和IL-6浓度、细胞凋亡率、ROS水平和MDA含量升高,GSH含量和SOD活性降低( P<0.05)。 结论:白藜芦醇减轻LPS诱导大鼠心肌细胞损伤的机制与上调miR-149-5p表达,抑制细胞凋亡、氧化应激和炎症反应有关。
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编辑人员丨4天前
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化疗中期RECIL与Lugano标准在淋巴瘤疗效及预后评价中的对比研究
编辑人员丨4天前
目的:对比化疗中期淋巴瘤疗效评价标准(RECIL)与Lugano标准在 18F-FDG亲和性高的霍奇金淋巴瘤(HL)和非霍奇金淋巴瘤(NHL)患者中的疗效及预后评价作用。 方法:回顾性分析2015年1月至2021年8月在山西省肿瘤医院初诊的经病理证实的240例淋巴瘤患者[男149例、女91例,年龄50.0(32.0,62.0)岁],患者均于治疗前及治疗中期行 18F-FDG PET/CT显像。比较不同类型淋巴瘤患者PET/CT显像结果差异( χ2检验或Kruskal-Wallis秩和检验)。在化疗中期进行疗效评价,依据Lugano标准,疗效分为完全缓解(CR)、部分缓解(PR)、疾病稳定(SD)、疾病进展(PD);依据RECIL,疗效分为CR、PR、轻微缓解(MiR)、SD、PD。为了更好地与Lugano标准进行比较,将MiR分别纳入PR组(记作RECIL-1)及SD组(记作RECIL-2)。随访分析无进展生存(PFS)情况。采用 Kappa检验、 χ2检验或Fisher确切概率法分析数据,采用ROC曲线比较不同标准的预测效能。 结果:240例中,HL 96例、滤泡型淋巴瘤(FL)30例、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)114例。不同类型淋巴瘤患者的病灶基线SUV max( H=54.96, P<0.001)、最大径总和(SLD)( H=15.85, P<0.001)的差异均有统计学意义。随访12~89个月,依据RECIL评价时,26例(10.8%)患者评估为MiR。RECIL-1、RECIL-2与Lugano标准在化疗中期疗效评价结果的一致性( Kappa)分别为0.84和0.74(均 P<0.001)。依据Lugano标准,CR、PR、SD、PD患者的PFS率分别为91.4%(148/162)、57.1%(36/63)、1/3和3/12;依据RECIL-1的对应结果分别为91.3%(136/149)、62.8%(49/78)、1/2和2/11;依据RECIL-2的对应结果分别为91.3%(136/149)、57.7%(30/52)、71.4%(20/28)和2/11;不同标准各反应类别患者间PFS率的差异有统计学意义( χ2值:46.64~52.44,均 P<0.001)。Lugano标准预测PFS的AUC略高于RECIL-1及RECIL-2的AUC(0.774、0.758和0.746; z值:1.28和1.61, P值:0.200和0.107)。 结论:化疗中期RECIL与Lugano标准对 18F-FDG亲和性高的HL和NHL患者疗效及预后评价作用相当。
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编辑人员丨4天前
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类风湿关节炎患者外周血单个核细胞中环状RNA差异表达分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨环状RNA(circRNA)在RA PBMCs表达谱的差异及临床意义。方法:收集4例RA患者(T组)及4名健康体检者(C组)静脉血,运用Arraystar circRNA微阵列芯片检测2组PBMCs中circRNA表达谱,应用相关数据库进行生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证表达失调circRNA的表达情况,并对目标circRNA构建circRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)调控网络(即ceRNA网络)。建立受试者工作特征曲线(ROC曲线),对潜在诊断价值进行分析。采用SPSS Statistics 23.0和Graphpad Prism 8.0分析数据,采用两独立样本 t检验分析2组间差异。 结果:①微阵列芯片结果显示,与C组比较,T组PBMCs中异常表达的circRNA共有399个,其中149个上调,250个下调。②生物信息学分析:circRNA与miRNA结合位点预测提示RA中差异表达的circRNA可能通过靶向结合miR-140-5p、miR-338-5p和miR-9-5p等分子影响炎症反应;基因本体论分析发现差异表达的circRNA主要在细胞质、蛋白质结合等方面;京都基因与基因组百科全书通路分析发现涉及的通路多与人体免疫调节相关。③多样本RT-qPCR验证结果显示T组中hsa_circRNA_009012的相对表达量显著高于C组( t=-4.417, P<0.01),hsa_circRNA_101328的表达水平显著低于C组( t=-1.042, P<0.01),hsa_cir-cRNA_058230的表达无明显改变( t=4.691, P>0.05)。④ ROC曲线分析提示hsa_circRNA_009012具有诊断RA的潜在价值(ROC曲线下面积=0.96)。 结论:circRNA在RA患者PBMCs中表达失调,可能参与RA发生发展的调控,其中hsa_circRNA_009012有望成为RA诊疗的新型生物学标志物。
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编辑人员丨4天前
