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急性胰腺炎患者血清miR-148a-3p和miR-551b-3p的表达水平及其临床价值
编辑人员丨6天前
目的:探讨AP患者血清miR-148a-3p和miR-551b-5p的表达水平及其临床价值。方法:选取2017年1月至2020年9月间儋州市人民医院收治的152例AP患者的临床资料,根据病情严重程度将患者分为MAP组(70例)、MSAP组(40例)和SAP组(42例),SAP组又根据患者预后情况分成生存组(25例)和死亡组(17例)。另选取50例体检健康者作为对照组。于患者发病当天采集空腹静脉血,采用实时定量PCR法检测各组血清miR-148a-3p和miR-551b-5p表达水平。绘制受试者工作特征曲线(ROC),计算曲线下面积(AUC),分析血清miR-148a-3p和miR-551b-5p表达水平对SAP预后判断的价值。采用Pearson法分析SAP患者血清miR-148a-3p与miR-551b-5p表达水平的相关性。结果:AP组患者血清miR-148a-3p和miR-551b-5p表达水平均明显高于对照组(3.18±1.27比0.96±0.28,1.94±0.85比0.51±0.12, P值均<0.001)。SAP组血清miR-148a-3p及miR-551b-5p表达水平均明显高于MSAP组、MAP组(4.36±1.70比2.84±1.10、2.50±0.92,2.80±1.04比1.68±0.53、1.42±0.45, P值均<0.001)。死亡组血清miR-148a-3p及miR-551b-5p表达水平均明显高于生存组(5.30±1.95比3.47±1.40,3.62±1.37比2.08±0.91, P值均<0.001)。ROC曲线分析显示,miR-148a-3p与miR-551b-5联合判断SAP预后的AUC值明显高于miR-148a-3p、miR-551b-5p单项指标[0.943(95% CI0.886~0.997)比0.860(95% CI0.797~0.924)、0.822(95% CI0.765~0.880)],其灵敏度为98.3%,特异度为84.6%。相关分析显示,SAP患者血清miR-148a-3p与miR-551b-5p表达水平呈正相关( r=0.835, P<0.001)。 结论:AP患者血清miR-148a-3p及miR-551b-5p表达水平明显升高,两者联合检测对判断SAP患者预后具有较好的价值。
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编辑人员丨6天前
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过表达环状RNA HIPK3抑制大鼠小胶质细胞活化的研究
编辑人员丨1个月前
目的 探讨环状RNA同源域相互作用蛋白激酶3(circHIPK3)与大鼠小胶质(RM)细胞活化的关系.方法 体外培养RM细胞,并随机分为正常组和氧糖剥夺/再灌注(OGD/R)组,RT-qPCR检测各组细胞内circHIPK3表达水平.构建具有嘌呤霉素抗性的circHIPK3慢病毒载体,设置过表达(OE)组和阴性对照(NC)组,根据荧光表达强度选择RM细胞最佳感染复数(MOI),采用嘌呤霉素筛选稳定表达circHIPK3的RM细胞.将OE组和NC组细胞置于OGD/R条件下培养,Western blot检测各组细胞中小胶质细胞活化标志蛋白钙结合衔接分子1(Iba-1)、肿瘤坏死因子受体超家族成员5(CD40)表达水平.通过circRNAdb数据库分析circHIPK3翻译蛋白潜能,利用circBank和Starbase数据库预测circHIPK3潜在结合的微小RNA(miRNA).结果 与正常组相比,OGD/R组RM细胞中circHIPK3的表达水平显著下调(P<0.0001).测序比对结果正确,成功构建cir-cHIPK3过表达慢病毒载体.感染RM细胞最佳MOI=80,以2μg/ml嘌呤霉素筛选得到稳定过表达circHIPK3的RM细胞.RT-qPCR结果显示,OE组细胞中circHIPK3表达水平较NC组显著增高(P<0.01).Western blot结果显示,在OGD/R培养条件下,OE组细胞中Iba-1和CD40蛋白表达水平较NC组显著降低(P<0.05).蛋白翻译分析显示,cir-cHIPK3具有2个内部核糖体进入位点(IRES)和1个开放阅读框(ORF),可编码由404个氨基酸组成的多肽.miRNA结合分析显示,circHIPK3可能与8个靶向miRNAs结合:hsa-miR-3529-5p、hsa-miR-379-5p、hsa-miR-506-3p、hsa-miR-33、hsa-miR-450b-5p、hsa-miR-551b-3p、hsa-miR-193、hsa-miR-508-3p.结论 过表达circHIPK3显著抑制OGD/R诱导的RM细胞活化、circHIPK3有编码多肽潜能,可能通过海绵miRNA发挥功能.
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编辑人员丨1个月前
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差异表达miRNA 在胰腺癌预后判断中的价值
编辑人员丨2023/8/6
目的:分析胰腺癌组织和正常组织差异表达的miRNA,筛选与胰腺癌预后相关的生物标志.方法:下载并整理基因芯片表达汇编数据库(GEO)中GSE32678和GSE71533芯片数据集原始数据,应用R语言筛选差异表达miRNA,结合GSE24279数据集,获得差异表达的miRNA并取交集.应用生物信息学分析工具对交集miRNA进行靶基因预测,进而对靶基因进行功能分析,构建蛋白互作网络(PPI)、miRNA-mRNA调控网络、miRNA-mRNA-pathway调控网络,结合肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中胰腺癌样本的miRNA表达及预后数据,筛选出胰腺癌预后相关标志物.结果:共筛选出胰腺癌组织和正常组织22个交集miRNA,其中hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375与胰腺癌患者的生存预后密切相关.hsa-miR-125b-5p、hsa-miR-221-3p、hsa-miR-31-5p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-10a-5p是miRNA-mRNA调控网络中的核心miRNA.结论:通过对GEO和TCGA数据库胰腺癌相关数据的分析发现hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375显著影响胰腺癌患者的预后,可以作为判断预后的标志.
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编辑人员丨2023/8/6
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利用生物信息学分析甲状腺髓样癌和乳头状癌的差异表达miRNA
编辑人员丨2023/8/5
目的 利用生物信息学分析甲状腺髓样癌和乳头状癌的差异表达miRNA,并分析与患者预后相关的差异miRNA.方法 利用GEOquery分析甲状腺髓样癌数据集GSF40807和GSE97070,乳头状癌数据集GSE73182和GSE113629的差异表达miRNA,分别利用韦恩图寻找共同差异miRNA,分析甲状腺髓样癌和乳头状癌差异表达miRNA的差别.利用on-comiR网站分析甲状腺乳头状癌差异表达miRNA患者生存情况.明确与甲状腺乳头状癌患者生存相关的miRNA,应用miRDB,miRTarBase和TargetScanHuman 7.2预测差异表达miRNA的靶基因,利用韦恩图寻找共同差异靶基因,进行富集分析.结果 通过分析发现甲状腺乳头状癌的共同差异miRNA分别是下调的hsa-miR-144-3p、hsa-miR-204-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-7-5p和上调的hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-181a-5p、hsa-miR-21-5p、hsa-miR-221-3p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-551b-3p;甲状腺髓样癌的共同差异miRNA分别是下调的hsa-miR-630和上调的hsa-miR-375、hsa-miR-429、hsa-miR-127-3p、hsa-miR-487b、hsa-miR-410.oncomiR网站分析hsa-miR-146b-5p与甲状腺乳头状癌患者生存相关.通过miRDB,miRTarBase and TargetScanHuman 7.2分析共发现11个差异靶基因,GO功能分析发现PPP1R11/TRAF6/ZNRF3聚集在泛素蛋白连接酶活性和泛素样蛋白连接酶活性等分子功能上.KEGG通路分析差异靶基因主要集中在MAPK信号通路上.结论 Hsa-miR-146b-5p可能通过靶向IRAK1/ERBB4/TRAF6调控MAPK信号通路,影响甲状腺乳头状癌患者的长期生存,hsa-miR-146b-5p可能成为甲状腺乳头状癌预后的预测靶标之一.
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编辑人员丨2023/8/5
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前列腺炎合并不育症患者弹性蛋白酶、miR-551b水平及诊断疾病价值
编辑人员丨2023/8/5
目的:分析前列腺炎合并不育症患者前列腺按摩液(EPS)中弹性蛋白酶(NE)、miR-551b表达水平及其对疾病的诊断价值.方法:2017年7月-2019年5月本院收治的前列腺炎合并不育症患者60例作为观察组,同期选取60例健康志愿者为对照组.比较两组男性EPS中NE和miR-551b表达水平及其相关性,以及水平对前列腺炎合并不育症诊断效能.结果:NE水平[1472.25(812.23,1735.65)]高于对照组[156.38(76.35,226.52)],miR-551b[5.13(2.34,13.47)]低于对照组[22.31(8.64,42.23)](P<0.05).Spearman秩相关分析显示,观察组NE与miR-551b表达呈显著负相关(r=-0.874,P<0.05).NE和miR-551b联合诊断前列腺炎合并不育症的敏感度(79.2%)、特异度(81.5%)和准确性(84.3%)均高于单一检测,AUC(0.786)高于单独检测(P<0.05).结论:NE和miR-551b联合检测EPS具有较好的诊断价值,有望成为诊断前列腺炎患者不育症的分子标志物.
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编辑人员丨2023/8/5
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急性胰腺炎患者体表胃电参数与外周血miR-551-5p、MicroRNA141变化的关系
编辑人员丨2023/8/5
目的 研究急性胰腺炎患者体表胃电参数与外周血miR-551-5p、MicroRNA141变化的关系.方法 选取2017年4月至2020年7月南通大学附属如皋医院收治的重症急性胰腺炎患者98例,随机分为A组和B组,各49例.另选取98例年龄与所选患者相符的健康者作为健康组.A组给予常规治疗;B组在A组的基础上给予33%硫酸镁,10 mL,3次/d,胃管注入,西沙必利10 mg/次,3次/d.两组患者均治疗7 d.分别于治疗前后测定血清胃肠激素:胆囊收缩素(CCK)、血清胃动素(MTL)、血管活性肠肽(VIP)和胃泌素(GAS)水平;测定胃电图参数:振幅(AP)、主频率(FP)和平均频率(FC).采用实时定量PCR扩增法检测miR-141和miR-551-5p水平;采用Spearman分析胃电图参数与血清胃肠激素水平和微循环mRNA水平的相关性;记录受试者肛门排气的时间和肠鸣音恢复的时间,记录患者住院时间.结果 治疗组胃肠激素中CCK和MTL水平显著低于健康组(P<0.05),VIP和GAS水平显著高于健康组(P<0.05);胃电图参数AP、FP和FC水平均显著低于健康组(P<0.05);微循环mRNA中miR-141显著低于健康组,miR-551-5p显著高于健康组(P<0.05).治疗后,两组患者CCK和MTL水平均增加,且B组显著高于A组(P<0.05);两组患者VIP和GAS水平均降低,且B组显著低于A组(P<0.05).治疗后,两组患者胃电图参数AP、FP和FC水平均增加,且B组显著高于A组(P<0.05).治疗后两组患者miR-141水平均增加,miR-551-5p水平均降低,且B组增加或降低幅度显著高于A组(P<0.05).B组患者肛门排气的时间和肠鸣音恢复的时间和住院时间均显著少于A组(P<0.05),急性胰腺炎患者和健康者胃电图参数AP、FP和FC和血清胃肠激素CCK和MTL均成正相关,与VIP和GAS均成负相关,与miR-141成正相关,与miR-551-5p成负相关.结论 血清胃肠激素、胃电图参数及微循环mRNA水平具有密切关系,硫酸镁联合西沙必利治疗急性胰腺癌患者可以显著改善患者血清胃肠激素、胃电图参数及微循环mRNA水平,且胃电图参数与胃肠激素和微循环mRNA具有一定的相关性.
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编辑人员丨2023/8/5
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姜黄素调控miR-551b-3p对食管癌EC9706细胞增殖、迁移、侵袭及凋亡的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨姜黄素对食管癌EC9706细胞增殖、迁移、侵袭、凋亡的影响及其对miR-551b-3p的作用机制.方法 体外培养食管癌细胞EC9706,采用不同浓度(5、10、20μmol/L)的姜黄素处理细胞;实验分组:miR-NC、miR-551b-3p mim-ics分别转染入EC9706细胞(miR-NC组、miR-551b-3p组),anti-miR-NC、anti-miR-551b-3p分别转染入EC9706细胞后加入姜黄素处理细胞(高剂量姜黄素+anti-miR-NC组、高剂量姜黄素+anti-miR-551b-3p组);采用qRT-PCR法检测正常食管上皮细胞HEEC与EC9706细胞中miR-551b-3p的表达量;CCK-8、Transwell小室实验分别检测细胞活力、迁移及侵袭;采用流式细胞术检测细胞凋亡.结果 姜黄素处理后细胞活力明显降低,迁移侵袭数均明显减少,凋亡率明显升高(P<0.05);与HEEC细胞比较,EC9706细胞中miR-551b-3p表达水平明显降低(P<0.05),而姜黄素处理后miR-551b-3p表达水平明显升高(P<0.05);与miR-NC组比较,miR-551b-3p组细胞活力明显降低,迁移侵袭数均明显减少,凋亡率明显升高(P<0.05);与高剂量姜黄素+anti-miR-NC组比较,高剂量姜黄素+anti-miR-551b-3p组细胞活力明显升高,迁移及侵袭细胞数均明显增多,凋亡率明显降低(均P<0.05).结论 姜黄素可通过促进miR-551b-3p的表达而抑制食管癌细胞增殖、迁移及侵袭,并可诱导细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/8/5
