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基于RNA-seq的脓毒症相关性脑病小鼠海马转录组分析及竞争性内源性RNA调控网络的构建
编辑人员丨1天前
目的:采用转录组测序技术(RNA-seq)筛选脓毒症相关性脑病(SAE)小鼠海马差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)及mRNA,构建竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络。方法:清洁级健康雄性C57BL/6小鼠10只,6~8周龄,体质量20~25 g,采用随机数字表法分为2组( n=5):假手术组(Sham组)和脓毒症组(Sepsis组)。Sepsis组采用盲肠结扎穿孔(CLP)法制备小鼠脓毒症模型,Sham组只开腹不进行盲肠结扎和穿孔。分别于术前1 d及术后3 d时行Morris水迷宫实验和条件恐惧实验检测小鼠认知功能。随后Sham组随机处死3只小鼠,Sepsis组处死认知功能测试最差的3只小鼠,取海马组织,通过BGISEQ-500平台行转录组测序,得到差异表达的mRNA和lncRNA,测序结果通过深圳华大基因科技服务有限公司提供的Dr.Tom平台行可视化分析,利用Cytoscape软件构建ceRNA调控网络。 结果:与Sham组比较,Sepsis组逃避潜伏期延长,靶向限停留时间百分比和僵直时间百分比降低( P<0.05)。转录组数据分析共获得差异表达的lncRNA 62个,其中45个lncRNA表达上调,17个lncRNA表达下调;差异表达的mRNA 282个,其中173个mRNA表达上调,109个mRNA表达下调。对差异表达的mRNA进行生物学过程的GO富集分析,结果显示差异表达的mRNA参与了记忆、学习或记忆、炎症应答、衰老相关行为减退的调空、突触可塑性调节等生物学过程;对差异表达的mRNA进行KEGG通路富集分析,结果显示差异表达的mRNA富集于IL-17信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路等。对差异表达的mRNA进行KDA分析,结果示Ch25h、Il6ra、Lcn2、Sgk1、Nr4a3、Osm、Saa3、Ccl7、Sqle、Dhcr24为SAE的关键基因。基于9个lncRNA、28个mRNA和134个miRNA成功构建了SAE小鼠海马的ceRNA调控网络。 结论:RNA-seq结果分析发现Ch25h、Il6ra、Lcn2、Sgk1、Nr4a3、Osm、Saa3、Ccl7、Sqle、Dhcr24 10个mRNA以及Rian、Gm35874、Gm34347等lncRNA是调控小鼠SAE的关键基因;同时成功构建了SAE小鼠海马基于lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络。
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编辑人员丨1天前
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雄激素替代对兔混合性干眼的治疗效果
编辑人员丨1天前
目的:探索雄激素替代对合并雄激素水平低下和睑板腺功能障碍的兔干眼模型的治疗效果。方法:将6月龄雄性青紫蓝兔计算机随机分为治疗组、造模组及对照组各10只。治疗组及造模组利用电凝笔烧灼封闭2/3睑板腺开口,并切除双侧睾丸。造模28 d起治疗组在两侧眶周皮肤涂抹1%睾酮凝胶1 g/d,造模组及对照组涂抹凡士林,共治疗28 d。监测泪液分泌、泪膜破裂时间(TBUT)、角膜荧光染色及血清游离睾酮。实验终点取眼球及眼睑进行苏木精-伊红(HE)染色和过碘酸希夫(PAS)染色,测量结膜miRNA-744-5p和白细胞介素6(IL-6)的表达量并检测睑脂脂肪酸成分。结果:造模28 d后兔出现典型干眼体征及雄激素缺乏。雄激素替代治疗28 d后,与造模组相比,治疗组泪液分泌[(14.7±5.2)比(10.3±3.6) mm, P=0.001]、TBUT[(15.0±4.2)比(10.2±3.6) s, P=0.003]及角膜荧光染色评分[0(0,1)比2(1,4)分, P<0.001]均改善,穹窿杯状细胞数量增加[(27.2±7.6)比(10.7±4.8)个, P<0.001]。与造模组相比,治疗组结膜miRNA-744-5p(1.67±0.24比2.63±0.58, P<0.001)及IL-6[2.38(1.84,4.61)比4.82(3.99,6.36), P=0.022]的表达水平均降低,睑脂16∶1, Δ9脂肪酸[(10.31±1.00)%比(3.87±0.45)%, P<0.001]及 iso-18∶0脂肪酸[(7.09±0.93)%比(2.44±0.70)%, P<0.001]相对含量增加, iso-26∶0[(5.72±1.07)%比(8.02±0.65)%, P<0.001]相对含量降低。 结论:雄激素替代能够改善合并雄激素水平低下及睑板腺功能障碍的兔干眼治疗效果。
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编辑人员丨1天前
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CircHECTD1 up-regulates mucin 1 expression to accelerate hepatocellular carcinoma development by targeting microRNA-485-5p via a competing endogenous RNA mechanism
编辑人员丨1天前
Background::Non-coding RNAs have attracted considerable attention for their vital role in cancer. The purpose of this study was to determine the effects of non-coding RNAs on hepatocellular carcinoma (HCC) and reveal their regulatory mechanism in the pathophysiological process.Methods::We measured the expression of mucin 1 (MUC1) and miR-485-5p in tissues from 15 HCC patients and in liver cancer cell lines by quantitative real-time polymerase chain reaction and Western blot, screened for aberrantly expressed microRNAs (miRNAs) by miRNA microarrays. Bioinformatics tools were used to find the miRNA and circular RNA that regulated MUC1, which were validated by RNA immunoprecipitation assay and luciferase reporter assay. Cell counting kit-8, Transwell assays, and flow cytometry were used to conduct functional experiments. Proteins were examined by western blot and immunohistochemical staining assays. Significant differences between groups were estimated using the one-way analysis of variance. A P < 0.05 was considered statistically significant. Results::MUC1 was overexpressed in HCC tissues compared with that in paratumor tissues (normal vs. tumor, 1.007 ± 0.215 vs. 75.213 ± 18.403, t = 18.401, P < 0.001) while miR-485-5p was down-regulated (normal vs. tumor, 4.894 ± 0.684 vs. 1.586 ± 0.398, t= 16.191, P < 0.001). Inhibition of miR-485-5p promoted cell proliferation (73.33% ± 5.13% vs. 41.33% ± 3.51%, t= 8.913, P < 0.001), migration (102 ± 8 cells vs. 46 ± 8 cells, t= 8.681, P < 0.001), invasion (59 ± 7 cells vs. 28 ± 2 cells, t = 8.034, P < 0.01), and suppressed apoptosis (22.64% ± 6.97% vs. 36.33% ± 3.96%, t = 2.958, P < 0.05) of HepG2 cells with which MUC1 is knocked down. Mechanically, miR-485-5p binds to MUC1, while circHECTD1 binds to miR-485-5p, resulting in the indirect up-regulation of the MUC1 level. Conclusions::Our findings reveal that circHECTD1 facilitates HCC progression by sponging miR-485-5p to up-regulate MUC1.
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编辑人员丨1天前
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FEN1、miR-215-5p在宫颈脱落细胞中的表达及其临床诊断价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨瓣状核酸内切酶1(FEN1)、微小RNA-215-5p(miR-215-5p)在宫颈脱落细胞中的表达水平,并对其临床诊断进行分析。方法:前瞻性选取2017年5月至2019年5月在辽宁电力中心医院进行液基薄层细胞学检查(TCT)的236例患者作为研究对象,并根据TCT结果进行分组:正常宫颈或慢性宫颈炎56例(对照组),宫颈上皮内瘤样病变(CIN)Ⅰ级组73例,CIN Ⅱ级组57例,CIN Ⅲ级组28例,宫颈癌组22例。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测宫颈脱落细胞中FEN1 mRNA、miR-215-5p表达水平;免疫印迹(WB)法检测宫颈脱落细胞中FEN1蛋白水平;Pearson法分析宫颈脱落细胞中FEN1 mRNA、miR-215-5p表达的相关性;ROC曲线分析宫颈脱落细胞中FEN1 mRNA、miR-215-5p表达水平对宫颈癌的诊断价值。结果:对照组、CIN Ⅰ级、Ⅱ级、Ⅲ级组宫颈脱落细胞中FEN1 mRNA和FEN1蛋白表达水平依次升高,miR-215-5p表达水平依次降低(均 P<0.05);CIN Ⅲ级组与宫颈癌组宫颈脱落细胞中FEN1 mRNA、FEN1蛋白和miR-215-5p表达水平比较,差异无统计学意义(均 P>0.05)。miR-215-5p与FEN1 mRNA水平呈负相关( r=-0.696, P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,以宫颈脱落细胞中FEN1 mRNA、miR-215-5p水平诊断宫颈癌的曲线下面积(AUC)分别为0.850(95% CI:0.785~0.914)、0.845(95% CI:0.778~0.912);二者联合检测诊断宫颈癌的AUC为0.861(95% CI:0.798~0.923)。 结论:CIN及宫颈癌患者宫颈脱落细胞中FEN1 mRNA和FEN1蛋白表达水平升高,miR-215-5p表达水平降低,与CIN及宫颈癌的发生密切相关,可能作为潜在的诊断标志物。
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编辑人员丨1天前
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LncRNA MIR503HG通过调控miR-224-5pCHSY1表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响
编辑人员丨1天前
目的:探讨长链非编码RNA微小RNA-503宿主基因(LncRNA MIR503HG)通过调控miRNA-224-5p硫酸软骨素合酶1 (miR-224-5pCHSY1 )的表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响。方法:选取2019年3月至2022年1月火箭军特色医学中心收治的48例结肠癌患者为组织样本获取对象,进行回顾性分析,其中男性28例、女性20例,年龄(57.43±5.28)岁。根据放疗后的病灶情况将患者分为放射抵抗组(23例)和放射敏感组(25例)。采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测2组患者结肠癌组织及各细胞株(CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116)中LncRNA MIR503HG、miR-224-5pCHSY1的表达情况;构建放射抵抗的结肠癌细胞株HCT116R,将HCT116R细胞株分为过表达LncRNA MIR503HG(MIR503HG)组及其阴性对照组(mimiC-NC)、miR-224-5pCHSY1抑制组(anti-miR-224-5p)及其阴性对照组(anti-miR-NC)、过表达LncRNA MIR503HG+过表达miR-224-5pCHSY1组(MIR503HG+miR-224-5p)、过表达LncRNA MIR503HG+阴性对照组(MIR503HG+miR-NC);通过双荧光素酶报告验证LncRNA MIR503HG与miR-224-5pCHSY1的靶向作用;检测各组细胞的存活分数(SF)和凋亡率。两组间数据的比较使用 t检验。 结果:与放射敏感组相比,放射抵抗组结肠癌组织中LncRNA MIR503HG的相对表达量明显降低(1.40±0.36对0.72±0.17),miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显升高(1.06±0.25对1.54±0.27 ),且差异均有统计学意义( t=8.247、6.529,均 P<0.05)。CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116及HCT116R各细胞株LncRNA MIR503HG的相对表达量分别为2.38±0.06、1.03±0.05、0.87±0.03、0.86±0.02、0.77±0.04、0.54±0.09,miR-224-5pCHSY1的相对表达量分别为0.38±0.06、0.56±0.01、0.59±0.02、0.59±0.05、0.63±0.04、0.82± 0.06,与正常细胞株CCD841相比,结肠癌细胞株COLO320、SW480、RKO、HCT116的LncRNA MIR503HG相对表达量均明显降低( t=2.061、1.665、4.058、6.201,均 P<0.05),miR-224-5pCHSY1的相对表达量均明显增加( t=1.238、1.930、2.037、1.742,均 P<0.05 )。与HCT116细胞株相比,HCT116R的LncRNA MIR503HG相对表达量明显降低[(0.77±0.04)对(0.54±0.09)],miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显增加[(0.63±0.04)对(0.82±0.06)],差异均有统计学意义( t=1.267、2.370,均 P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,MIR503HG组的HCT116R细胞SF明显低于mimic-NC组[(7.25±1.11)%对(11.34±2.65)%、(2.85±0.58)%对(6.08±1.10)%、(0.58±0.05 )%对(3.08±0.84)%],且差异均有统计学意义( t=1.064、1.937、2.650,均 P<0.05 )。过表达LncRNA MIR503HG后,MIR503HG组HCT116R的放射增敏比(SER)为1.399。mimic-NC组、MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组、MIR503HG+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(8.10± 0.23)%、(18.44±1.57)%、(17.33±2.35)%、(29.83±1.89)%,与mimic-NC组相比,MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组HCT116R细胞的凋亡率均明显升高,且差异均有统计学意义( t=2.003、1.475,均 P<0.05 )。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Wt的荧光素酶活性明显增加(1.02±0.20对1.60±0.25 ),且差异有统计学意义( t=5.366, P<0.05);miR-224-5pCHSY1与LncRNA MIR503HG结合位点突变后,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Mut的活性无明显变化(0.97±0.25对1.00±0.22),2组间的差异无统计学意义( t=0.291, P> 0.05 )。与mimic-NC组相比,MIR503HG组miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.97±0.13对1.12±0.12),差异有统计学意义( t=3.915, P<0.05)。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组中miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.99±0.19对0.92±0.18 ),差异有统计学意义( t=2.664 , P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SF均明显低于anti-miR-NC组[(0.59±0.08 )%对(0.79±0.12)%、(0.39±0.06 )%对(0.67±0.07)%、(0.19±0.04 )%对(0.52±0.04)%],且差异均有统计学意义( t=1.281、2.034、2.911,均 P<0.05)。抑制表达miR-224-5pCHSY1后,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为1.403。anti-miR-NC组、anti-miR-224-5p组、anti-miR-NC+4 Gy组、anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(5.08±0.78)%、(14.48±1.21)%、(13.89±1.36)%、(23.64±1.03)%,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组与anti-miR-NC+4 Gy组的细胞凋亡率均明显增加,且差异有统计学意义( t= 2.067、1.934,均 P<0.05 );与anti-miR-NC+4 Gy组相比,anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率明显增加,差异均有统计学意义( t=4.026 , P<0.05 )。照射剂量为4 Gy时,mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的SF分别为(0.82±0.17)%、(0.53±0.12)%、(0.54±0.11)%、(0.78±0.15)%,照射剂量为6 Gy时,分别为(0.66±0.13)%、(0.38±0.09)%、(0.35±0.08)%、(0.57±0.10)%,照射剂量为8 Gy时,分别为(0.49±0.10)%、(0.15±0.06)%、(0.13±0.05)%、(0.43±0.11)%,与mimic-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.609、1.533、1.927,均 P<0.05 ),MIR503HG+ miR-NC组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.294、1.490、1.825,均 P<0.05 );与MIR503HG+ miR-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SF明显增加,且差异均有统计学意义( t=1.573、1.204、1.937,均 P<0.05 ),过表达miR-224-5pCHSY1后,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为0.825,相比MIR503HG组明显降低。mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的细胞凋亡率分别为(11.61±2.10)%、(24.97±0.91)%、(24.81±1.27)%、(16.15±1.10)%,与mimic-NC组比较,MIR503HG组和MIR503HG+miR-NC组HCT116R的细胞凋亡率明显增高,且差异有统计学意义( t=2.304、2.159,均 P<0.05 );与MIR503HG+miR-NC组比较,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R的细胞凋亡率明显降低,且差异有统计学意义( t=2.067, P<0.05)。 结论:过表达LncRNA MIR503HG可通过抑制miR-224-5pCHSY1表达增加结肠癌细胞的放射敏感性。
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编辑人员丨1天前
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ICE方案联合甲氨蝶呤对弥漫大B细胞淋巴瘤患者的临床疗效及miR-451a、miR-15a表达的影响
编辑人员丨1天前
目的:探讨ICE方案(异环磷酰胺、卡铂、VP16)联合甲氨蝶呤对弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者的临床疗效及miR-451a、miR-15a表达的影响。方法:前瞻性选取2013年3月至2018年5月长沙市第三医院56例DLBCL患者作为研究对象,依据随机数字表法分为观察组与对照组,各28例。对照组予以ICE方案治疗,观察组予以ICE方案联合甲氨蝶呤治疗。对比两组肿瘤控制率、毒副反应、治疗前后血清miR-451a及miR-15a表达水平、免疫功能(CD3 +、CD4 +、CD8 +、CD4 +/CD8 +)、血清肿瘤标志物[β 2微球蛋白(β 2-MG)、糖类抗原125(CA125)、乳酸脱氢酶(LDH)]水平,随访6~12个月统计两组生存率。 结果:观察组肿瘤控制率(92.86%)高于对照组(71.43%)( P<0.05);治疗后两组miR-15a较治疗前降低,miR-451a较治疗前增高,且观察组miR-15a低于对照组,miR-451a高于对照组( P<0.05);治疗后两组CD3 +、CD4 +、CD4 +/CD8 +较治疗前降低,CD8 +较治疗前增高( P<0.05),但组间比较差异无统计学意义( P>0.05);治疗后两组CA125、LDH及β 2-MG水平较治疗前降低,且观察组低于对照组( P<0.05);观察组毒副反应发生率、治疗后6、9、12个月生存率与对照组间差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:ICE方案联合甲氨蝶呤治疗DLBCL可通过调节血清miR-451a、miR-15a表达,进一步提高治疗效果,降低血清肿瘤标志物水平,且毒副反应及对免疫损害小,安全性高。
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编辑人员丨1天前
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腺苷激酶基因修饰的间充质干细胞移植对氯化锂-匹罗卡品颞叶癫痫模型癫痫发作和海马神经元的保护性作用
编辑人员丨1天前
目的:探讨抑制腺苷激酶表达的间充质干细胞(ADK --MSCs)脑内移植对氯化锂-匹罗卡品模型癫痫发作和海马神经元损伤的影响。 方法:利用包含抑制腺苷激酶表达的慢病毒载体转染小鼠骨髓间充质干细胞,制作抑制腺苷激酶表达的间充质干细胞(ADK --MSCs),检测其腺苷分泌量,将其移植入准备进行氯化锂-匹罗卡品造模的小鼠海马区。实验分组对照组,氯化锂-匹罗卡品造模组TLE组,和ADK --MSCs移植后氯化锂-匹罗卡品造模组ADK --MSCs组。造模28 d后,使用视频脑电图监测造模后自发性癫痫发作。使用尼氏染色和活性半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶(Caspase)-3免疫组织化学评估海马神经元的损伤和凋亡。造模45 d后,观察移植ADK --MSCs细胞的存活情况。两组间比较采用 t检验。 结果:1×10 5个ADK --MSCs细胞上清中的腺苷浓度为12.1 ng/ml。ADK --MSCs组自发性癫痫发作频率为(8.20±2.38)次/周,明显低于TLE组[(16.40±3.20)次/周, t=4.584, P<0.01]。尼氏染色显示400倍放大视野中ADK --MSCs组CA1区存活神经元为(91.00±6.51)个,明显高于TLE组[(71.80±5.06)个, t=5.199, P<0.001];CA3区存活神经元ADK --MSCs组[(64.20±7.98)个]明显高于TLE组[(45.75±7.63)个, t=3.511, P<0.01]。活性Caspase-3免疫染色显示ADK --MSCs组海马锥体神经元阳性细胞明显低于TLE组,蛋白质印迹法(Western blot)分析证实ADK --MSCs组活性Caspase-3蛋白表达明显低于TLE组( n=3, t=4.302, P<0.05)。造模45 d后,通过荧光显微镜可观察到海马区存活的绿色荧光蛋白(GFP)阳性绿色荧光ADK --MSCs细胞。 结论:抑制ADK表达的间充质干细胞脑内移植在氯化锂-匹罗卡品颞叶癫痫模型中具有抗癫痫发作和减轻神经损伤的作用。
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编辑人员丨1天前
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miRNA-324-5p和转录因子叉头框C1在脑胶质瘤中的表达及其临床意义
编辑人员丨1天前
目的:探讨miRNA-324-5p(miR-324-5p)、转录因子叉头框C1(FOXC1)在脑胶质瘤中的表达及与患者预后的关系。方法:收集2012年3月至2015年3月重庆海吉亚肿瘤医院和重庆市南川区人民医院收治的72例脑胶质瘤患者脑胶质瘤组织以及28例因颅脑手术切除的正常人脑组织。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-324-5p、FOXC1 mRNA表达水平,采用免疫组织化学法检测FOXC1蛋白表达情况。采用Pearson法分析脑胶质瘤组织miR-324-5p、FOXC1表达的相关性;Kaplan-Meier法对脑胶质瘤患者进行生存分析;Cox回归分析影响脑胶质瘤患者预后的危险因素。结果:FOXC1蛋白主要定位于脑胶质瘤细胞质,在脑胶质瘤组织中的阳性表达率为81.94%(59/72),高于其在正常脑组织中的阳性表达率[17.86%(5/28)],差异有统计学意义( χ2=35.938, P<0.01)。与正常脑组织相比,miR-324-5p在脑胶质瘤组织中表达下调(0.62±0.19比0.98±0.02, t=9.974, P<0.05),FOXC1 mRNA表达上调(1.41±0.29比0.99±0.02, t=7.633, P<0.05)。miR-324-5p、FOXC1蛋白表达水平与脑胶质瘤原发灶数目、分化程度、TNM分期及淋巴结转移有关(均 P<0.05)。脑胶质瘤组织中miR-324-5p、FOXC1 mRNA表达水平呈负相关( r=-0.550, P<0.01)。miR-324-5p高表达组患者5年总生存率高于低表达组(45.71%比24.33%, χ2=6.531, P=0.011),FOXC1蛋白高表达组患者5年总生存率低于低表达组(30.41%比42.34%, χ2=3.631, P=0.047)。多因素Cox回归分析结果显示,肿瘤分化程度低、TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移、miR-324-5p低表达、FOXC1蛋白高表达是影响脑胶质瘤患者预后的独立危险因素(均 P<0.05)。 结论:脑胶质瘤组织中miR-324-5p呈低表达,FOXC1呈高表达,二者可能参与调控肿瘤分化转移,并与患者预后不良有关,可能作为脑胶质瘤的潜在治疗靶点。
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编辑人员丨1天前
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微RNA单核苷酸多态性与慢性自发性荨麻疹发病风险的关联分析
编辑人员丨1天前
目的:探讨微RNA(miRNA)单核苷酸多态性与慢性自发性荨麻疹(CSU)的风险关联。方法:采用病例对照研究,收集2019年1-6月在济宁医学院附属医院皮肤科诊治的98例CSU患者及同期148例健康对照,均为山东籍汉族,采集静脉血后提取基因组DNA,针对miRNA多态性位点rs2431697(miR-146a)、rs57095329(miRNA-146a)、rs3746444(miRNA-499)、rs11614913(miRNA-196a2)和rs895819(miRNA-27a)行多重PCR扩增反应和单碱基延伸反应,进行单核苷酸多态性(SNP)位点分型。采用 χ2检验分析组间等位基因、基因型及遗传模型分布差异,非条件Logistic回归分析基因SNP与疾病发生风险的关系。 结果:所有样本SNP均成功分型。miRNA-196a2 SNP位点rs11614913等位基因为T/C,病例组等位基因T频数110(56.1%),对照组131(44.3%),两组T/C频率分布差异有统计学意义( χ2 = 6.64, P = 0.010),该位点等位基因T可能是CSU发生的危险因素( OR = 1.61,95% CI:1.12 ~ 2.32)。病例组rs11614913基因型CC、CT、TT频数分别为16(16.3%)、54(55.1%)、28(28.6%),对照组为48(32.4%)、69(46.6%)、31(20.9%),两组基因型分布差异有统计学意义( χ2 = 8.16, P = 0.017);两组显性遗传模型(TT+CT与CC)分布差异亦有统计学意义( χ2=7.95, P = 0.005),显性遗传模型可能增加了CSU发病风险( OR=2.46,95% CI:1.30 ~ 4.65)。 结论:我国山东汉族人群miRNA-196a2 SNP与CSU风险可能存在关联,rs11614913可能会增加CSU发病风险。
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编辑人员丨1天前
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微小RNA-324-5p在胰腺癌中的表达及对胰腺癌细胞增殖和迁移能力的影响
编辑人员丨1天前
目的:检测分析微小RNA(miR)-324-5p在胰腺癌中的表达情况及临床意义,并探究其对胰腺癌细胞增殖和迁移能力的影响及潜在分子机制。方法:实时定量PCR方法检测34对2018年10月至2019年9月在北京大学第一医院手术切除的胰腺癌和癌旁组织中miR-324-5p表达水平,结合癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析其与胰腺癌临床病理特征及预后的相关性。实时定量PCR方法检测miR-324-5p在胰腺癌细胞系中表达情况,在PANC-1细胞中转染miR-324-5p mimic后通过细胞增殖实验(CCK8)、细胞迁移实验(Transwell)和划痕实验检测miR-324-5p对胰腺癌细胞增殖、迁移能力的影响,蛋白质电泳检测相关蛋白表达变化并结合miRNA在线靶点预测分析工具和基因功能分析,寻找miR-324-5p直接调控的下游靶基因。结果:TCGA数据库资料显示miR-324-5p在胰腺癌中的表达水平显著低于正常胰腺组织,且低表达miR-324-5p的胰腺癌患者预后更差;34对胰腺癌及癌旁组织检测结果证实miR-324-5p在胰腺癌中的表达水平(11.7±2.0)低于癌旁胰腺组织(70.9±14.4),低表达miR-324-5p的患者神经侵犯率(82.1%,23/28)高于高表达患者(33.3%,2/6),差异具有统计学意义( P<0.05)。胰腺癌细胞系中miR-324-5p表达水平降低,上调PANC-1细胞中miR-324-5p表达后细胞增殖能力显著下降,细胞垂直迁移数量(30.11±5.2)个和水平运动能力(174.6±27.0)μm也较对照组(63.6±4.2)个和(458.3±22.3)μm降低,差异有统计学意义(均 P<0.05)。在线靶点预测工具和基因功能分析结果发现4个与肿瘤转移或EMT调控相关的基因(KLF3、MGAT3、PBX1、ZNRF2)可能是miR-324-5p直接调控的下游靶基因。 结论:胰腺癌中miR-324-5p具有抑癌作用,其低表达与肿瘤神经侵犯、预后差相关。胰腺癌细胞中miR-324-5p可能直接调控KLF3、MGAT3、PBX1、ZNRF2等基因表达,进而抑制细胞增殖、迁移能力。
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编辑人员丨1天前
