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支气管肺发育不良中新型miRNA-TF-mRNA共调控网络的鉴定
编辑人员丨4天前
目的:筛选与新生儿支气管肺发育不良(BPD)发病相关的关键转录因子(TF)、微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA),并构建了调控网络。方法:从高通量基因表达数据库GEO获取mRNA芯片数据集GSE108756,筛选出的差异表达基因(DEGs)进行京都基因和基因百科全书(KEGG)、基因本体注释(GO)功能富集分析;参照HumanTFDB数据库获取与DEGs对应的TF后利用cytoHubba插件筛选出degree值前10的Hub TF;通过hTFtarget数据库找出Hub TF中7个TF所对应的靶基因;在GSE108756中获取7个TF及其靶基因所对应的探针表达量后做相关性分析,筛选出最终纳入研究的6个Hub TF及所对应的正相关TF-mRNA关系队;利用Targetscan Human数据库获取靶向调控6个Hub TF的miRNAs,并与miRNA芯片数据集GSE166762差异miRNAs取交集后匹配出负向调节的miRNA-TF关系队,最后构建BPD患儿潜在miRNA-TF-mRNA调控网络,进一步筛选出关键miRNA、mRNA。结果:共筛选出201个差异表达基因,KEGG富集结果主要涉及B细胞受体信号通路、造血系统、原发免疫缺陷等作用,GO功能富集分析主要富集在B细胞增殖活化及免疫应答调节细胞表面受体等生物学过程中。与Hub TF(EBF1、TCF4、JUN、BCL11A、SPIB、E2F1)表达谱强关联的正相关下游靶基因有159个,负相关的上游miRNA有120个。BPD患儿发病潜在的关键miRNA-TF-mRNA网络包括has-miR-217-TCF4-Pou2AF1、has-miR-150-5p-E2F1-ADM。结论:本研究构建了新生儿BPD的miRNA-TF-mRNA共调控网络,从转录调控的崭新视角为揭示BPD发病机制奠定理论基础。
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编辑人员丨4天前
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微小RNA-217靶向调控骨巨细胞瘤自噬的研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨骨保护素(OPG)/细胞核因子-κB受体活化因子(RANK)/细胞核因子-κB受体活化因子配体(RANKL)信号通路介导的自噬及微小RNA(miRNA,miR)-217的靶向调控在骨巨细胞瘤(GCT)中作用。方法:在建立肿瘤异种移植模型和体外培养GCT0404细胞的基础上,分为空白对照组,神经钙黏蛋白(N-cadherin)组(miR-217类似物组),转染miR-217组。评估各组骨巨细胞瘤的活性、增殖及迁移水平;检测miR-217、OPG、RANK、RANKL、自噬相关蛋白5(ATG5)、自噬相关蛋白7(ATG7)、Beclin-1和微管相关蛋白轻链3(LC3)在骨巨细胞瘤细胞中的mRNA和蛋白表达变化;多组间均数比较采用单因素方差分析(ANOVA),组间比较采用多重极差最小显著性差异(LSD)。结果:(1)miR-217在肿瘤异种移植模型和体外培养GCT0404细胞的调控都显著抑制GCT细胞的增殖和肿瘤细胞的发生[对照组吸光度( A)值为0.620±0.019,inhibitor NC组为0.640±0.019,miR-217 inhibitor组为0.950±0.030,inhibitorNC组和对照组比较,差异无统计学意义( P>0.05),而miR-217 inhibitor组与inhibitor NC组比较,差异有统计学意义( F=128.600, P<0.01)]。(2)miR-217抑制GCT细胞的碱性磷酸酶(ALP)活性,并抑制OPG/RANKL/RANK信号通路相关因子及自噬相关蛋白表达(OCN 1.41±0.06,OPG 1.41±0.04,RANKL 0.54±0.01,ATG 50.65±0.12,ATG 70.67±0.03,Beclin-1 0.56±0.10,LC3 0.83±0.04, F=265.100, P<0.01)。 结论:miR-217可能通过抑制OPG/RANKL/RANK信号通路相关因子表达来抑制GCT自噬,从而抑制GCT的发生。
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编辑人员丨4天前
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微小RNA217靶向人沉默调节蛋白1对结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响
编辑人员丨4天前
目的:探讨微小RNA-217(miR-217)对结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响途径。方法:采用反转录实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测人正常结肠上皮细胞NCM460和人结直肠癌细胞SW620、RKO、HT-29、HCT116中miR-217表达水平。将miR-217模拟物(mimic)与阴性对照(mimic NC)分别转染于RKO细胞系,检测miR-217表达水平。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)与平板克隆实验检测细胞增殖活力;采用划痕愈合实验、Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力;采用RT-qPCR与蛋白质印迹法(Western blot)检测沉默信息调节因子1(SIRT1) mRNA与蛋白表达水平。两组间比较采用 t检验,多组间比较采用单因素方差分析(ANOVA)。 结果:miR-217在人结直肠癌细胞系中表达水平降低,其中RKO细胞系明显低于NCM460细胞系[(0.286±0.022)倍比(1.000±0.090)倍, t=13.360, P<0.01],差异有统计学意义。RKO细胞系转染miR-217 mimic后,miR-217表达水平高于NC组[(5.276±0.437)倍比(1.000±0.168)倍, t=15.820, P<0.01],差异有统计学意义。CCK-8实验表明miR-217 mimic组细胞24、48、72 h吸光度值低于NC组[(0.867±0.030)倍比(1.260±0.0222)倍, t=18.440, P<0.01],差异有统计学意义。平板克隆实验表明miR-217 mimic组细胞集落形成能力低于NC组[(80.570±43.320)倍比(116.600±81.230)倍, t=3.823, P<0.01],差异有统计学意义。划痕实验及Transwell实验证实miR-217 mimic组细胞迁移及侵袭能力低于NC组[划痕实验:(0.133±0.009)倍比(0.365±0.010)倍, t=29.960, P<0.01;Transwell迁移实验:(157.000±3.000)倍比(248.300±13.580)倍, t=11.380, P<0.01;Transwell侵袭实验:(149.000±7.937)倍比(287.000±5.568)倍, t=24.650, P<0.01],差异有统计学意义。通过生物信息学分析并筛选出miR-217靶基因人SIRT1,RT-qPCR结果表明miR-217 mimic组细胞中SIRT1 mRNA表达水平低于NC组[(0.682±0.162)倍比(1.000±0.075)倍, t=3.090, P<0.05],差异有统计学意义。Western blot表明,转染miR-217 mimic后,结直肠癌细胞中SIRT1蛋白表达水平发生显著下降。 结论:miR-217在人结直肠癌中低表达,且可能通过SIRT1抑制结直肠癌细胞增殖、迁移、侵袭能力。
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编辑人员丨4天前
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鞘内注射microRNA-217对坐骨神经部分结扎大鼠痛行为与神经炎性因子的影响
编辑人员丨4天前
目的:观察microRNA-217(miR-217)在坐骨神经部分结扎(partial sciatic nerve ligation,pSNL)大鼠的神经性疼痛及和神经炎症中的作用。方法:24只健康成年雄性SD大鼠随机分成3组:pSNL组(坐骨神经部分结扎)、Sham组(假手术组)、正常组(不进行任何处理),每组8只。于手术前第1,2,3天以及手术后第1,3,7,14天进行机械缩足阈 (mechanical withdrawal threshold,MWT) 和热缩足潜伏期 (paw withdrawal thermal latency,PWTL)值测定。qRT-PCR实验检测大鼠手术侧脊髓组织miR-217和TLR5的mRNA表达变化。另外取24只健康成年雄性SD大鼠随机分成3组:pSNL-LV-miR-217组(坐骨神经部分结扎+鞘内注射LV-miR-217)、pSNL- LV-NC组(坐骨神经部分结扎+鞘内注射LV-NC)、假手术组,每组8只。于手术前第1,2,3天以及手术后第1,3,7,14天进行MWT和PWTL测定,并利用qRT-PCR实验和Western blot实验检测TLR5、COX-2、IL-6和TNF-α在大鼠脊髓组织中的表达情况。结果:痛行为结果显示,与Sham组[7 th d(13.58±0.30)g,14 th d(14.54±0.51)g]相比,pSNL组的MWT在术后第7天[(6.72±0.15)g, t=11.79, P<0.05]和第14天均降低[(5.72±0.22)g, t=17.83, P<0.05),差异有统计学意义。pSNL组的PWTL在术后第7天以及第14天分别为(6.78±0.21)s 、(5.99±0.22)s,与Sham组[(14.86±0.35)s,(14.50±0.51)s]比较均降低,差异有统计学意义( t=4.86,7.13,均 P<0.05)。qPCR实验显示,pSNL组的大鼠脊髓中miR-217表达下调、TLR5表达上调,与假手术组相比差异有统计学意义( t=8.94, P<0.01; t=7.54, P<0.01)。鞘内注射miR-217后连续测定MWT和PWTL实验显示:pSNL-LV-miR-217组的MWT与pSNL-LV-NC组相比差异有统计学意义(7 th d: t=14.79, P<0.01;14 th d: t=15.83, P<0.01)。pSNL-LV-miR-217组的PWTL在术后第7天及第14天均明显升高(7 d: t=14.95, P<0.01;14 d: t=16.27, P<0.01)。qRT-PCR实验显示,与pSNL-LV-NC组相比,pSNL-LV-miR-217组的miR-217明显上升( t=7.49, P<0.01),TLR5、COX-2( t=8.82, P<0.05)、IL-6( t=6.42, P<0.05)和TNF-α( t=7.46, P<0.05)的表达明显降低。Western blot实验显示,pSNL-LV-miR-217组的TLR5、COX-2、IL-6和TNF-α的蛋白表达在术后第7天明显降低。 结论:鞘内注射miR-217能明显缓解坐骨神经结扎大鼠的神经性疼痛,并且可能通过调控TLR5抑制神经炎症。
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编辑人员丨4天前
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circBIRC6 contributes to the development of non-small cell lung cancer via regulating microRNA-217/amyloid beta precursor protein binding protein 2 axis
编辑人员丨4天前
Background::Circular RNAs (circRNAs) are considered to be important regulators in cancer biology. In this study, we focused on the effect of circRNA baculoviral inhibitor of apoptosis protein (IAP) repeat containing 6 (circBIRC6) on non-small cell lung cancer (NSCLC) progression.Methods::The NSCLC and adjacent non-tumor tissues were collected at Shanghai Ninth People's Hospital. Quantitative real-time polymerase chain reaction was conducted for assessing the levels of circBIRC6, amyloid beta precursor protein binding protein 2 (APPBP2) messenger RNA (mRNA), baculoviral IAP repeat containing 6 mRNA (BIRC6), and microRNA-217 (miR-217). Western blot assay was adopted for measuring the protein levels of APPBP2, E-cadherin, N-cadherin, and vimentin. Colony formation assay, transwell assay, and flow cytometry analysis were utilized for evaluating cell colony formation, metastasis, and apoptosis. Dualluciferase reporter assay and RNA immunoprecipitation assay were carried out to determine the interaction between miR-217 and circBIRC6 and APPBP2 in NSCLC tissues. The murine xenograft model assay was used to investigate the function of circBIRC6 in tumor formation in vivo. Differences were analyzed via Student's t test or one-way analysis of variance. Pearson's correlation coefficient analysis was used to analyze linear correlation. Results::CircBIRC6 was overexpressed in NSCLC tissues and cells. Knockdown of circBIRC6 repressed the colony formation and metastasis and facilitated apoptosis of NSCLC cells in vitro and restrained tumorigenesis in vivo. Mechanically, circBIRC6 functioned as miR-217 sponge to promote APPBP2 expression in NSCLC cells. MiR-217 inhibition rescued circBIRC6 knockdown-mediated effects on NSCLC cell colony formation, metastasis, and apoptosis. Overexpression of miR-217 inhibited the malignant phenotypes of NSCLC cells, while the effects were abrogated by elevating APPBP2. Conclusion::CircBIRC6 aggravated NSCLC cell progression by elevating APPBP2 via sponging miR-217, which might provide a fresh perspective on NSCLC therapy.
Non-small cell lung cancer Circular RNA baculoviral inhibitor of apoptosis protein repeat containing 6 MicroRNA-217 Amyloid beta precursor protein binding protein 2...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
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桃红四物汤对缺血性脑卒中损伤后微小RNA的影响
编辑人员丨4天前
目的 研究桃红四物汤(Taohong Siwu Decoction,THSWD)对缺血性脑卒中的微小RNA(microRNA,miR-NA)表达谱的影响,探讨THSWD治疗缺血性脑卒中的分子机制.方法 建立大脑中动脉闭塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)诱导的局灶性脑缺血大鼠模型,采用单细胞RNA测序技术检测THSWD治疗后MCAO大鼠miRNA表达谱.采用GO和KEGG富集分析方法分析miRNA作用于靶基因的功能.对表达差异显著的miRNA进行RT-qPCR实验验证.结果 THSWD干预后,MCAO大鼠脑梗死区有13个miRNA表达发生变化,其中6个miRNA表达上调,7个miRNA表达下调.利用miRanda进行预测,确定了这13个miRNA的靶基因,构建了miRNA-mRNA网络,通过RT-qPCR验证了其中6个差异表达的miRNA(rno-miR-653-5 p、rno-miR-216 b-5 p、rno-miR-3547、rno-miR-217-5p、rno-miR-758-3p和rno-miR-223-3p).结论 THSWD可以通过逆转某些miRNA的异常表达来治疗缺血性脑卒中.
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编辑人员丨4天前
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出血性脑卒中患者血清miR-217-5p表达及临床意义
编辑人员丨2024/1/20
目的 探讨血清miR-217-5p在出血性脑卒中患者中的表达水平及其临床意义.方法 选取2019年5月至2021年5月邯郸市第一医院收治的出血性脑卒中患者135例作为观察组,另选取同时期健康体检者 127 例为对照组.采用实时荧光定量聚合酶链式反应法检测所有受试者血清miR-217-5p表达水平并对比;根据美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分将观察组患者分为轻度、中度和重度,比较不同病情程度患者血清miR-217-5p表达水平;根据治疗后随访3个月的预后情况将观察组分为预后良好组和预后不良组,比较预后良好组和预后不良组血清miR-217-5p表达水平及一般资料;采用多因素Logistic回归分析法分析出血性脑卒中患者预后不良的影响因素,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-217-5p表达水平对出血性脑卒中患者预后情况的预测价值.结果 观察组血清miR-217-5p表达水平低于对照组(t=37.182,P<0.05);观察组中度、重度患者血清miR-217-5p表达水平低于轻度者(P<0.05),重度者血清miR-217-5p表达水平低于中度者(P<0.05).随访 3 个月,135 例患者发生预后不良的有 51 例,发生率为37.78%;预后不良组血清miR-217-5p表达水平低于预后良好组(t=13.525,P<0.05);预后不良组年龄大于预后良好组(t=2.900,P<0.05),合并脑疝占比、白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、C反应蛋白(CRP)、白细胞介素-6(IL-6)、NIHSS评分高于预后良好组(t=4.676、6.949、6.332、5.712、3.062、12.066,P<0.05),格拉斯哥昏迷指数(GCS)评分低于预后良好组(t=10.457,P<0.05).经Logistic回归分析显示,年龄、合并脑疝、IL-1β、TNF-α、CRP、IL-6、NIHSS评分、GCS评分、miR-217-5p表达水平均是出血性脑卒中预后不良的影响因素(OR=5.073、3.009、5.801、5.392、5.223、5.109、7.294、7.621、0.685,P<0.05);ROC曲线结果显示,血清miR-217-5p表达水平预测出血性脑卒中患者预后不良的曲线下面积(AUC)、敏感度、特异度、阳性预测价值、阴性预测价值分别为 0.832、86.27%、79.76%、72.13%、90.54%.结论 出血性脑卒中患者血清miR-217-5p呈低表达,且该指标与预后密切相关,可作为预测出血性脑卒中患者预后的重要生化指标.
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编辑人员丨2024/1/20
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CT灌注成像参数联合血清miR-217-5p对缺血性脑卒中的诊断价值
编辑人员丨2023/12/30
目的 分析研究CT灌注成像参数联合血清miR-217-5p水平对缺血性脑卒中患者的诊断价值.方法 选取2020年1月至2022年12月辽宁省健康产业集团阜新矿总医院收治的124例疑似缺血性脑卒中患者作为研究对象,根据检查结果,将确诊为缺血性脑卒中的患者分为缺血性卒中组(n=68),非缺血性脑卒中的患者分为对照组(n=56).对两组患者进行CT灌注成像检查,比较两组的脑血流量(CBF)、脑血容量(CBV)平均通过时间(MTT)、到达峰值时间(TTP);比较两组血清miR-217-5p表达水平;采用多因素Logistic回归分析发生缺血性脑卒中的影响因素,并采用ROC曲线分析CT灌注成像参数(CBF、CBV、MTT、TTP)联合血清miR-217-5p表达水平对诊断缺血性脑卒中的预测价值.结果 年龄、高血压病史、CBF、CBV、MTT、TTP与血清miR-217-5p表达水平均是发生缺血性脑卒中的影响因素,差异均具有统计学意义(P<0.05);多因素Logistic回归分析显示,年龄>60 岁(OR= 2.102)、有高血压病史(OR=1.793)、CBF水平降低(OR=1.891)、CBV水平降低(OR=1.914)、MTT水平升高(OR=2.121)、TTP水平升高(OR=1.889)和miR-217-5p表达水平降低(OR=2.090)均是发生缺血性脑卒中的独立危险因素(P<0.05).ROC曲线分析显示CBF、CBV、MTT、TTP、血清miR-217-5p表达水平及联合检测的曲线下面积(AUC)分别为0.899、0.947、0.909、0.916、0.822、0.999,联合检测优于单一检测(P<0.05).结论 CT灌注成像参数与血清miR-217-5p表达水平对缺血性脑卒中具有一定的诊断价值,联合检测的诊断价值优于单一检测.
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编辑人员丨2023/12/30
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microRNA-196b、microRNA-217与TGFβR1蛋白在胰腺导管腺癌组织中的表达及其意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 检测胰腺导管腺癌组织中微小RNA (microRNA,miR)-196b、miR-217与转化生长因子β受体l(transforming growth factor β receptor 1,TGFβR1)蛋白的表达水平,并探讨其临床意义.方法 前瞻性收集2014年3月到2017年3月期间在重庆医科大学附属第二医院行胰腺癌根治术的30例胰腺导管腺癌患者的组织标本(包括胰腺导管腺癌组织及其癌旁组织),利用实时荧光定量聚合酶链反应法检测miR-196b和miR-217的表达水平,采用Western blotting法检测TGFβR1蛋白的表达水平.结果 胰腺导管腺癌组织中miR-196b和TGFβR1蛋白的表达水平均高于癌旁组织(P<0.001),而miR-217的表达水平低于癌旁组织(P=0.001).胰腺导管腺癌组织中miR-196b的表达水平与TGFβR1蛋白的表达水平呈正相关(r=0.803,P<0.001),而miR-217的表达水平与TGFβR1蛋白的表达水平呈负相关(r=-0.839,P<0.001).结论 胰腺导管腺癌组织中TGFβR1蛋白的表达可能同时受miR-196b和miR-217的双向调控,这种双向调控机制可能是制约胰腺导管腺癌发生和发展的重要机制之一,也可能是治疗胰腺导管腺癌的潜在靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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补肾活血方对动脉粥样硬化新西兰兔miRNA-217/Sirt1/FoxO1信号通路的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 观察补肾活血方对动脉粥样硬化新西兰兔MicroRNA-217(miRNA-21 7)/沉默信号调节器1(Sirt1)/叉头转录因子(FoxO1)信号通路的影响.方法 将新西兰兔44只随机分为对照组、模型组、补肾活血方组和阿托伐他汀钙组,除对照组外,其余3组高脂饲料喂养16周,灌胃8周后实时荧光定量PCR检测miRNA-217基因表达水平,免疫印迹实验检测Sirt1、FoxO1蛋白表达水平.结果 与模型组相比,补肾活血方组和阿托伐他汀钙组miRNA-217表达降低(P<0.01),Sirt1、FoxO1表达增高(P<0.01).补肾活血方组miRNA-217水平低于阿托伐他汀钙组(P<0.05),Sirt1蛋白水平高于阿托伐他汀钙组(P<0.05).结论 补肾活血方可能通过调控miRNA-217/Sirt1/FoxO1信号通路延缓内皮细胞衰老从而起到抗动脉粥样硬化作用.
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编辑人员丨2023/8/6
