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基于网络药理学研究三七治疗血小板聚集的作用机制
编辑人员丨6天前
目的:通过网络药理学研究三七治疗血小板聚集的作用机制。方法:查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选三七的药物成分,使用Swiss Target Prediction预测药物成分的作用靶点;运用GeneCards获取血小板聚集的疾病靶点,利用venny 2.1获取交集靶点。使用String进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析并使用Cytoscape构建网络图,使用Cytoscape软件构建"药物-靶点-通路"网络图。利用Metascape进行基因本体(GO)富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果:三七中的7个有效成分通过多条通路直接作用于142个疾病靶点治疗血小板聚集,其中β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素和人参皂苷Rh 2等是核心成分,肿瘤蛋白p53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、JUN、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、蛋白激酶B1(AKT1)是重要靶点。GO富集分析显示,生物过程(BP)主要涉及细胞对脂质的反应、对激素的反应、细胞对氮化合物的反应等;细胞组分(CC)主要涉及膜筏、膜微区、小窝和质膜筏等;分子功能(MF)主要涉及DNA结合转录因子结合、转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异度DNA结合转录因子结合等。KEGG通路富集分析表明,三七治疗血小板聚集的信号通路主要有晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/Akt、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、TNF、MAPK等。 结论:三七主要通过调节AGE-RAGE、PI3K/Akt、HIF-1、TNF、MAPK等信号通路的TP53、MAPK1、JUN、TNF、IL-6、AKT1等疾病靶点,调节酶类活性治疗血小板聚集。
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编辑人员丨6天前
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基于网络药理学探讨三七抗肿瘤转移作用机制
编辑人员丨6天前
目的:利用网络药理学方法探讨三七抗肿瘤转移的作用机制。方法:检索TCMSP筛选三七的有效成分及靶点,运用GeneCards数据库筛选抗肿瘤转移相关靶点,将有效成分靶点与疾病靶点进行Venn分析,得到三七抗肿瘤转移的关键靶点。借助Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点-疾病网络。运用STRING数据库构建PPI网络。借助Bioconductor对靶点基因进行KEGG信号通路和GO生物过程富集分析。结果:从三七中筛选出活性成分119个,符合条件的有效成分8个,对应162个相关靶点,与抗肿瘤转移有关靶点121个,PPI网络筛选出关键靶点30个,包括AKT1、MAPK1、JUN、RELA、IL6等。GO功能富集分析主要涉及细胞因子受体结合、血红素结合、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、泛素蛋白连接酶结合、类固醇激素受体活性等生物过程,KEGG通路富集分析得到与三七抗肿瘤转移相关的信号通路149条,主要涉及AGE-RAGE、PI3K-Akt等信号通路,以及乙型肝炎、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、人巨细胞病毒感染等多种病毒感染及多种肿瘤。结论:三七可通过人参皂苷f2、人参皂苷rh2、β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素等多个活性成分,通过AKT1、MAPK1、JUN、RELA、IL6等多个靶点作用于PI3K-Akt等信号通路,发挥抗肿瘤转移作用。
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编辑人员丨6天前
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补肺益肾组分方Ⅲ调节慢性阻塞性肺疾病黏液高分泌的配伍特点
编辑人员丨6天前
目的:评价补肺益肾组分方Ⅲ(ECC-BYFⅢ)阻抑慢性阻塞性肺疾病(COPD)黏液高分泌的配伍特点。方法:将ECC-BYFⅢ组分按原方药物功效分成补气(人参皂苷Rh1+黄芪甲苷)、补肾(淫羊藿苷)、化痰(川陈皮素)、活血(丹皮酚)4组,按数学排列组合的方法将其分为不同组分配伍组(14组)。①按随机数字表法将大鼠分为对照组、模型组、ECC-BYFⅢ及不同组分配伍组,共17组。采用香烟烟雾暴露联合反复细菌感染的方法复制COPD稳定期大鼠模型。于制模第9周开始给予相应的药物灌胃,16周结束后取材。用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清及支气管肺泡灌洗液(BALF)中基质金属蛋白酶9(MMP-9)、基质金属蛋白酶抑制剂1(TIMP-1)水平,以及肺组织和BALF中黏蛋白(MUC)5AC水平。②将人肺上皮细胞BEAS-2B分为空白组、模型组、ECC-BYFⅢ及不同组分配伍组。于相应药物预处理后4 h建立缺氧诱导的BEAS-2B细胞黏液高分泌模型。采用定量聚合酶链反应(PCR)检测MUC5AC、MUC5B、MUC1的mRNA表达。采用Region(R)值综合评价法评价大鼠及BEAS-2B细胞黏液分泌指标。结果:①与对照组比较,模型组大鼠血清及BALF中MMP-9显著升高,TIMP-1水平显著降低;肺组织及BALF中MUC5AC显著升高。R值综合评价结果显示,除补气组和补肾组外,ECC-BYFⅢ及其组分配伍均能显著纠正COPD大鼠黏液高分泌,以ECC-BYFⅢ、补肾祛邪、扶正化痰、祛邪组分配伍效果较优(R值分别为2.15±0.42、2.11±0.23、2.16±0.23、2.16±0.55),与模型组(R值:3.00±0.00)比较差异均有统计学意义(均 P<0.05)。②与空白组比较,模型组细胞MUC5AC、MUC5B、MUC1的mRNA表达均升高;但不同组分配伍对BEAS-2B细胞黏液分泌没有明显的作用特点。③综合体内外实验,R值综合评价结果显示,ECC-BYFⅢ及其活血、祛邪、补肾活血、扶正化痰、补气祛邪组分配伍可显著纠正COPD黏液高分泌状态(R值分别为2.30±0.43、2.33±0.44、2.12±0.68、2.27±0.64、2.24±0.27、2.29±0.47),与模型组(R值:3.00±0.00)比较差异均有统计学意义(均 P<0.01);其作用强度为:祛邪>扶正化痰>补肾活血>补气祛邪>ECC-BYFⅢ>活血。 结论:ECC-BYFⅢ组分配伍对COPD黏液分泌相关指标效应不同,含化痰(川陈皮素)或活血(丹皮酚)的组分配伍抑制黏液分泌效果较好。
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编辑人员丨6天前
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基于网络药理学和高通量分子对接虚拟筛选参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎活性成分及作用机制
编辑人员丨6天前
目的:筛选参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性成分并探讨其作用机制。方法:基于网络药理学和高通量分子对接技术,从TCMSP、中药分子作用机制的网络药理学在线分析工具(BATMAN-TCM)及Targetnet数据库中检索参麦注射液的化合物和预测靶点,并构建成分-靶点网络;从在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和GeneCards数据库中检索"coronavirus pneumonia"相关基因,与化合物作用靶点共有的部分构建靶基因间的蛋白相互作用网络;使用DAVID6.8进行基因功能、通路富集分析;通过PDB数据库获取蛋白质的晶体结构,采用AutoDock Vina和Python脚本进行高通量分子对接。结果:共获得27个化合物和224个靶基因,鉴定出干预冠状病毒的15个核心成分与15个核心靶点,分别为CASP3、NOS2、PARP1、CASP8、NOS3、BCL2、ADA、OPRM1、TGFB1、TLR9、ACHE、SLC29A1、BAX、ADK、PNP。核心靶点主要作用于肺结核、癌症通路、乙型肝炎、细胞凋亡等信号通路。虚拟筛选后得到与冠状病毒相关靶点对接较好的成分有薯蓣皂苷元、豆甾醇、β-谷甾醇、人参皂苷Rh1苷元。结论:本研究筛选出了参麦注射液干预冠状病毒的主要活性成分及作用靶点,为参麦注射液治疗COVID-19提供参考。
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编辑人员丨6天前
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人参皂苷Rh2对香烟烟雾致慢性阻塞性肺疾病小鼠肺损伤的拮抗作用
编辑人员丨3周前
目的 探讨人参皂苷Rh2对香烟烟雾致慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)BALB/c小鼠肺损伤的拮抗作用.方法 将50只健康6~8周龄SPF级BALB/c雌性小鼠随机分为空白对照组、COPD模型组、普米克令舒组和0.5、1 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组,每组10只.COPD模型组、普米克令舒组、0.5 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组和1 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组均被动吸烟1次/d,0.5 h/次,2支/次,每周5 d,连续12周;各浓度人参皂苷Rh2染毒组在烟熏前1 h,采用经口灌胃方式染毒人参皂苷Rh2进行预干预,染毒容量为20 ml/kg,隔日1次,每周3次,连续12周.烟熏结束后,COPD模型组和普米克令舒组利用雾化机进行雾化吸入3min,1次/d,连续15d;各浓度人参皂苷Rh2染毒组按照上文继续进行灌胃染毒.检测肺动态顺应性(Cdyn)、功能残气量(FRC)、最大呼气量(FVC)、气道阻力(RI)和平均肺泡数(MAN)、肺泡平均截距(MLI)及血管壁和支气管壁平滑肌肌动蛋白α(α-SMA)的含量以及血清白细胞介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)的含量和超氧化物歧化酶(SOD)的活力.结果 与空白对照组比较,COPD模型组和各浓度人参皂苷Rh2染毒组小鼠小鼠肺功能Cdyn和RI较高,而FRC和FVC较低,除1 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组Cdyn、RI、FRC外,差异均有统计学意义(P<0.05).与COPD模型组比较,各浓度人参皂苷Rh2染毒组小鼠肺功能Cdyn和RI较低,而FRC和FVC较高,除0.5 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组Cdyn外,差异均有统计学意义(P<0.05),且随着人参皂苷Rh2染毒浓度的升高,小鼠Cdyn和RI呈下降趋势,而FRC和FVC呈上升趋势.与空白对照组比较,COPD模型组和各浓度人参皂苷Rh2染毒组小鼠肺组织MAN降低,而MLI升高,除1 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组MLI外,差异均有统计学意义(P<0.05).与COPD模型组比较,各浓度人参皂苷Rh2染毒组小鼠肺组织MAN升高,而MLI降低,除0.5 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组MLI外,差异均有统计学意义(P<0.05).且随着人参皂苷Rh2染毒浓度的升高,小鼠MAN呈下降趋势,而MLI呈上升趋势.与空白对照组比较,COPD模型组、普米克令舒组和各浓度人参皂苷Rh2染毒组小鼠肺内血管壁和支气管壁平滑肌α-SMA及血清IL-1β、TNF-α含量较高,而血清SOD活力较低,除1 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组肺内血管壁和支气管壁平滑肌α-SMA和血清SOD外,差异均有统计学意义(P<0.05).与COPD模型组比较,各浓度人参皂苷Rh2染毒组小鼠肺内血管壁和支气管壁平滑肌α-SMA及血清IL-1β、TNF-α含量较低,而血清SOD活力较高,除0.5 mg/ml人参皂苷Rh2染毒组肺内血管壁和支气管壁平滑肌α-SMA和血清SOD外,差异均有统计学意义(P<0.05).且随着人参皂苷Rh2染毒浓度的升高,小鼠肺内血管壁和支气管壁平滑肌α-SMA及血清IL-1β、TNF-α含量呈下降趋势,而血清SOD活力呈上升趋势.结论 人参皂苷Rh2可通过提高机体免疫功能、抑制肺内小血管壁和肺内支气管平滑肌α-SMA蛋白表达,改善肺泡结构、黏膜上皮杯状细胞数量,从而改善COPD模型小鼠肺功能、缓解肺损伤.
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编辑人员丨3周前
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西洋参-红花有效成分治疗早期糖尿病肾病的网络药理学和实验验证
编辑人员丨3周前
目的:通过网络药理学、分子对接技术及细胞实验探讨西洋参-红花有效成分治疗早期糖尿病肾病(DN)的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获得西洋参-红花活性成分的干扰靶点,再与GeneCards、TTD等数据库中早期DN基因靶点相映射即为交集靶点.采用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,运用Cytoscape 3.8.2软件筛选出核心靶点;通过DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,运用Cytoscape 3.8.2软件进行"有效成分-关键靶点-通路-疾病"网络图展示;通过Autodock Tools软件进行分子对接,采用MTT法检测有效成分对脂多糖(LPS)诱导的人肾小球系膜细胞(HMC)活性,利用酶联免疫吸附试验检测有效成分对炎症介质的影响.结果:得到西洋参-红花治疗早期DN的活性成分有24个,对应的药物靶点207个,其中72个和早期DN相关.网络拓扑参数分析得出了肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、IL-1β等15个关键靶点,KEGG通路分析筛选出晚期糖基化终末产物(AGE)-AGE受体(RAGE)、TNF、低氧诱导因子-1(HIF-1)、IL-17、核因子κB等20个信号通路;分子对接表明IL-6与槲皮素、木犀草素、黄芩素、人参皂苷rh2稳定结合.细胞实验得出西洋参-红花活性成分槲皮素、木犀草素、黄苓素能显著抑制IL-6、TNF-α和IL-1 β表达.结论:本研究初步证实西洋参-红花有效成分能有效抑制早期DN炎症,对肾脏具有保护作用,为后期深入研究提供了依据.
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编辑人员丨3周前
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珠子参叶皂苷对脂肪酶抑制机制及降血脂研究
编辑人员丨1个月前
珠子参叶是五加科(Araliaca)植物珠子参(Panax japonicas var.major)的干燥带梗叶,为秦巴地区特色中药材.为合理开发利用珠子参叶并阐明其化学成分,该研究利用HPLC方法分析珠子参叶皂苷部位的主要化学成分,测定珠子参叶皂苷部位的脂肪酶抑制活性及抑制类型,通过分子对接及动物实验验证脂肪酶抑制机制及降血脂作用.结果表明:(1)珠子参叶皂苷部位主要成分为20(S)-人参皂苷Rg2、20(R)-人参皂苷Rg2、人参皂苷Rb2、人参皂苷Rb3、人参皂苷Rd、人参皂苷Rh2.(2)珠子参叶皂苷部位、20(R)-人参皂苷 Rg2对脂肪酶具有较强的抑制作用,其IC50分别为 0.14、2.30 μmol·L-1.(3)珠子参叶皂苷部位、20(R)-人参皂苷Rg2、人参皂苷 Rb3 对脂肪酶的抑制为可逆性抑制,抑制类型为非竞争型抑制.(4)配体与ARG337B、ASP331B、ILE248B残基结合可能有助于提高配体的脂肪酶抑制活性.(5)珠子参叶总皂苷可以显著降低高脂血症小鼠血清中胆固醇和甘油三酯的含量.该研究为珠子参叶在降血脂方面的深入开发和利用提供了理论参考.
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编辑人员丨1个月前
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基于权重基因共表达网络分析挖掘人参皂苷Rh1生物合成相关基因
编辑人员丨2024/6/15
目的 通过权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)挖掘人参皂苷Rh1生物合成相关基因.方法 以种植于吉林省人参主产区304个农家品种的转录组测序数据为基础,以人参皂苷Rh1含量为表型进行差异表达基因的挖掘.结果 通过WGCNA获得6个与人参皂苷Rh1含量密切相关的基因共表达模块,根据关联分析结果确定Green模块为与人参皂苷Rh1含量显著相关的关键模块.功能注释结果显示Green模块内的基因富集到mRNA结合、蛋白修饰等多个相关途径.通过构建基因互作网络筛选获得7个核心基因,功能预测表明这些基因可能在人参皂苷Rh1的生物合成途径中起着重要作用.对7个候选基因进行茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)体外调控分析.对人参不定根进行MeJA诱导处理,随MeJA的诱导,comp9517_c0_seq1、comp10896_c0_seq1、comp43180_c0_seq2、comp64014_c0_seq8 的表达量与人参皂苷Rh1的含量同时呈现显著变化,但只有comp64014_c0_seq8的表达趋势与人参皂苷Rh1在MeJA诱导下的表达趋势相同,表明这条候选基因可能与人参皂苷Rh1的合成密切相关.结论 为人参皂苷Rh1生物合成途径的解析提供了理论基础.
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编辑人员丨2024/6/15
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基于网络药理学和分子对接探讨胃复春治疗慢性浅表性胃炎作用机制
编辑人员丨2024/6/1
目的:基于网络药理学探讨胃复春(WFC)治疗慢性浅表性胃炎(CSG)的分子机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药综合资源数据库(TCMID)及SwissTargetPrediction网站检索WFC的相关化学成分及其对应的作用靶点;利用GeneCard数据库、OMIM数据库筛选CSG的作用靶点,通过韦恩在线网站获取WFC与CSG的交集靶点,并通过Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作网络图;根据拓扑学参数查找WFC治疗CSG的核心靶点,运用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-核心靶点网络图筛选WFC作用于CSG的关键成分.利用David网站对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路富集分析,采用R软件绘制可视化气泡图.通过SYBYL-X2.1.1软件对WFC治疗CSG的主要活性成分及关键靶点进行分子对接.结果:WFC治疗CSG的关键成分为人参皂苷Rh2、柚皮素、14-乙酰基-耐阴午茶菜素b、β-谷甾醇等,关键靶点有白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、抑癌基因53(TP53)等.WFC治疗CSG主要作用于癌症信号通路、脂质与动脉粥样硬化信号通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染等信号通路,其功能主要有参与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、信号转导及细胞凋亡过程的负调控,在蛋白质结合、ATP结合方面起重要作用等.分子对接结果显示,WFC中的关键成分14-乙酰基-耐阴午茶菜素b、人参皂苷Rh2、川陈皮素与关键靶点IL-6、AKT1、VEGFA的结合活性较强.结论:WFC可能通过调节IL-6、TNF、AKT1等靶点治疗CSG,其作用机制与癌症信号通路,脂质与动脉粥样硬化信号通路密切相关.
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编辑人员丨2024/6/1
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基于UPLC-Q-TOF-MS/MS和MALDI-MSI的多蒸西洋参皂苷成分识别及可视化分析
编辑人员丨2024/4/13
为研究多次蒸晒西洋参中皂苷成分变化及其在组织中的空间分布特征,采用超高效液相色谱四极杆飞行时间串联质谱仪(ultra performance liquid chromatography quadrupole time-of-flight tandem mass spectrometry,UPLC-Q-TOF-MS/MS)对西洋参提取液进行检测和鉴定.采用基质辅助激光解吸电离质谱成像(matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging,MALDI-MSI)对西洋参中原型皂苷及其代谢产物的空间分布和时空变化进行可视化分析.UPLC结果显示从 0~9 次蒸制西洋参中共鉴定出 90 种主要人参皂苷,在西洋参的反复蒸晒过程中,极性人参皂苷转化成低极性或非极性人参皂苷,原型皂苷含量减少,稀有皂苷含量增加,主要为人参皂苷 20(S/R)-Rg3、20(S/R)-Rh2、Rk1、Rg5、Rs5、Rs4 等.MALDI-MSI组织分布结果表明生西洋参中皂苷主要分布于表皮及韧皮部,蒸晒过程导致皂苷成分发生转化,木质部和髓质中的分布增加.该研究为西洋参蒸制引起的生物活性和药理作用的变化提供了基础信息,为扩大西洋参的药用范围提供了参考.
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编辑人员丨2024/4/13
