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人类白细胞抗原Ⅰ、Ⅱ类等位基因及单倍体多态性与中国南方汉族白血病的相关性
编辑人员丨1周前
目的:探讨人类白细胞抗原(HLA)Ⅰ类(A、B、C)、Ⅱ类(DRB1、DQB1、DPB1)等位基因和单倍体多态性与中国南方汉族急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性髓系白血病(AML)以及慢性粒细胞白血病(CML)的相关性。方法:收集深圳市血液中心845例中国南方汉族白血病患者(323例ALL、350例AML及172例CML)和745名中国南方汉族健康献血者的外周血样本。应用聚合酶链反应反向序列特异性寡核苷酸探针杂交(PCR-rSSO)及测序分型(PCR-SBT)方法对HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1进行基因分型,鉴定HLA等位基因前4位数。采用Arlequin 3.5软件分析HLA单倍体;从HLA低分辨水平(等位基因前2位数)及高分辨水平(等位基因前4位数)分别统计分析HLA等位基因和单倍体多态性与3种白血病的相关性。结果:经Bonferroni校正,ALL组A*02(36.22%比28.26%, χ2=13.41, PC<0.01)及其单倍体A*02-B*46-C*01(15.35%比10.23%, χ2=10.90, PC=0.02)、DRB1*12(15.79%比11.10%, χ2=9.02, PC=0.03)、A*02:03(9.75%比5.32%, χ2=14.25, PC=0.002)及其单倍体A*02:03-B*38:02-C*07:02(3.80%比1.51%, χ2=10.41, PC=0.02)的频率均高于对照组,是ALL易感因素;AML组A*11-B*15-C*08-DRB1*15-DQB1*06-DPB1*02的频率高于对照组(1.34%比0.07%, χ2=12.54, PC=0.003),是AML易感单倍体;CML组A*02(36.63%比28.26%, χ2=9.33, PC=0.02)及其单倍体A*02-B*15-C*04(2.17%比0.29%, χ2=11.74, PC=0.02)、DRB1*03:01-DQB1*02:01-DPB1*02:01(1.86%比0.14%, χ2=13.10, PC=0.01)的频率均高于对照组,是CML易感因素;CML组DRB1*13的频率低于对照组(1.45%比5.25%, χ2=9.29, PC=0.03),是CML拮抗基因。 结论:在HLA低分辨及高分辨水平发现了白血病易感或拮抗HLA等位基因和单倍体,可为探究中国南方汉族白血病发病机制并制订有效治疗策略提供参考。
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编辑人员丨1周前
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山东省潍坊市RhD初筛结果呈阴性汉族无偿献血者的Rh血型表型及RHD基因多态性分布研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨山东省潍坊市RhD初筛结果呈阴性汉族无偿献血者的Rh血型表型及RHD基因多态性分布特点。方法:选择2015年3月至2017年7月,于潍坊中心血站参加无偿献血的1 307例RhD初筛结果呈阴性的汉族献血者为研究对象。其中,男性献血者为921例,女性为386例,年龄为18~55岁。采用血清学检测方法对1 307例RhD初筛结果呈阴性献血者的RhD阴性进行确认。血清学检测采用3个不同厂家的抗-D血型定型试剂和间接抗人球蛋白试验。对经血清学检测确认为RhD阴性的献血者,进行Rh血型表型分型,并且计算各RhCcEe的表型频率和单倍型频率。选择2015年9月至2016年3月参加无偿献血的116例RhD初筛结果呈阴性献血者进行RHD基因检测。RHD基因检测采用PCR-序列特异性引物(SSP)法和人类红细胞RHD基因分型试剂盒,并且进行基因多态性分析。Rh血型表型频率和单倍型频率,采用方根法计算。各Rh血型表型频率分布的Hardy-Weinberg遗传平衡检验采用 χ2检验。本研究遵循的程序符合2013年修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并且与所有献血者签署临床研究知情同意书。 结果:①本研究对1 307例RhD初筛结果呈阴性献血者的RhD阴性进行确认的结果显示,RhD阴性献血者为1 244例(95.2%),RhD变异型为63例(4.8%)。②本研究1 244例RhD阴性献血者中,ccee、Ccee、ccEe、CCee、CcEe、CCEe表型献血者分别为773例(62.14%)、329例(26.45%)、83例(6.66%)、40例(3.22%)、18例(1.45%)、1例(0.08%)。cde、CdE、Cde、cdE单倍型频率分别为78.83%、0.06%、16.99%和4.12%。经Hardy-Weinberg遗传平衡检验,本研究纳入的1 244例RhD阴性献血者的Rh血型表型频率观察值与期望值比较,差异无统计学意义( χ2=2.17, P>0.05)。③本研究116例RhD初筛结果呈阴性献血者的RHD基因分型结果显示,RHD外显子全部缺失基因型为77例(66.4%),RHD-CE(2-9)-D型为13例(11.2%),弱D15型为3例(2.6%),DEL RHD1227A纯合型为19例(16.4%),DEL RHD1227A杂合型为4例(3.5%)。 结论:本研究初步探明本地区RhD阴性献血者的Rh血型表型及RHD基因分布特点,可为确保本地区Rh阴性血型患者的临床输血安全,并为Rh阴性稀有血型库建立,提供参考依据。
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编辑人员丨1周前
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LncRNA-GAS5基因多态性与广西人群系统性红斑狼疮的相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨 lncRNA-GAS5基因rs55829688和rs75315904多态性与广西人群系统性红斑狼疮(SLE)易感性的相关性。 方法:选取2017年5月至2019年5月于右江民族医学院附属医院和百色市人民医院就诊的302例SLE患者与396名健康受试者为研究对象。采集SLE组与对照组受试者的静脉血样,提取基因组DNA,用SNPscan技术和Sanger测序对 lncRNA-GAS5基因rs55829688和rs75315904位点进行基因分型与分析。 结果:rs55829688和rs75315904位点的基因型频率在两组之间差异无统计学意义( P>0.05),而rs55829688位点C等位基因的频率在两组之间差异有统计学意义( P<0.05);rs55829688位点C等位基因以及CT+CC基因型在伴有肾炎的患者中的频率显著低于不伴肾炎的患者( P<0.05);单倍型分析发现,rs55829688 C/rs75315904 A等位基因频率在SLE组中显著低于对照组( P<0.05)。 结论:在广西人群中, lncRNA-GAS5基因rs55829688位点携带C等位基因可能降低SLE及其并发肾炎的发病风险,并且rs55829688 C/rs75315904 A单倍型也可能降低SLE的发病风险。
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编辑人员丨1周前
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合并丙型肝炎病毒感染对HIV-1感染者特异性杀伤性CD4 + T细胞免疫的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨合并HCV感染对HIV-1感染者特异性杀伤性CD4 + T细胞免疫应答的影响。 方法:选取2015年9月至2016年5月在广州市第八人民医院就诊的49例HIV-1感染者,根据是否合并HCV感染,分为HIV-1单纯感染组(26例)和HIV-1合并HCV感染组(23例)。以HIV-1 P24蛋白上的氨基酸序列人工合成的12个重叠肽段组成肽段库,体外刺激已接受HAART的外周CD4 + T细胞,采用酶联免疫斑点试验方法检测特异性CD4 + T细胞分泌IFN-γ分泌细胞个数,根据斑点形成细胞(SFC)数计算抗原特异性CD4 + T细胞应答频率。以1×10 6个细胞产生的SFC>50,且大于各自非特异性刺激对照孔SFC的3倍作为HIV-1抗原特异性CD4 + T细胞阳性反应。 结果:HIV-1单纯感染组的特异性杀伤性CD4 + T细胞阳性应答率为80.8%,应答频率为250(100,700)SFC/10 6个细胞,均高于HIV-1合并HCV感染组的52.2%和50(0,250)SFC/10 6个细胞,组间比较差异具有统计学意义( χ 2=4.538, Z=-2.432, P均<0.05)。 结论:HIV-1感染者合并HCV感染可能抑制特异性杀伤性CD4 + T细胞反应。
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编辑人员丨1周前
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HLA-G 3′UTR基因多态性与不明原因复发性流产发生风险的相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨人类白细胞抗原G 3′非翻译区(human leucocyte antigen-g 3′ untranslated region,HLA-G 3′ UTR)基因单核苷酸多态性以及单倍型在不明原因复发性流产患者中的分布情况及可能的预测作用。方法:采用病例对照研究。选择2017年6月至2018年7月温州市中医院70例不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)妊娠患者(病例组)以及54例产前检查健康妇女(对照组),采集外周全血和血清。离心柱法提取外周全血基因DNA,PCR扩增HLA-G 3′UTR DNA。Sanger测序法测得基因序列并进行基因分型。SHEsis在线软件分析单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点等位基因和基因型的频率,比较分析对照组和病例组的分布差异。Phase软件构建单倍型。ELISA检测血清可溶性HLA-G(soluble human leucocyte antigen-G,sHLA-G)浓度。两组间SNP位点基因型及单倍型比较采用χ 2检验,两组sHLA-G浓度比较采用 t检验。 结果:URSA组和对照组均检测出8个多态性位点,包括14bp ins/del、+3003C/T、+3010G/C、+3027A/C、+3035C/T、+3142C/G、+3187A/G及+3196C/G,均符合哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinberg,H-W)检验平衡检验,比较分析显示+3010G/C、+3142C/G、+3187A/G三个位点在两组间的分布差异有统计学意义(χ 2=8.514, P=0.004;χ 2=0.552, P=0.021;χ 2=8.183, P=0.005)。携带+3010C等位基因、+3142G等位基因患病风险相对较高( OR=2.131,95 %CI=1.278~3.552,χ 2=8.514, P=0.004; OR=1.813,95 %CI=1.091~3.013,χ 2=0.552, P=0.021);携带+3187G等位基因患病风险相对较低( OR=0.476,95 %CI=0.285~0.794,χ 2=8.183, P=0.005)。8个位点紧密连锁,单倍型分析显示UTR-1(DTGCCCGC)可能是URSA的保护因素( OR=0.497,95 %CI=0.295~0.837,χ 2=6.987, P=0.008),UTR-3(DTCCCGAC)可能是URSA的危险因素( OR=1.732,95 %CI=1.009~2.974,χ 2=3.998, P=0.045)。UTR-1/UTR-1纯合子频率在URSA患者中显著低于健康妊娠人群( OR=0.381,95 %CI=0.165~0.879,χ 2=5.292, P=0.024),可能是URSA的一个保护因素。未发现血清sHLA-G与HLA-G 3′UTR基因单倍型的关联性( t=1.578, P=0.119)。 结论:HLA-G 3′UTR基因多态性及单倍型与URSA具有一定相关性,可能为临床诊疗和预测提供依据。
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编辑人员丨1周前
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HDAC2基因多态性与汉族男性酒精使用障碍的关联性
编辑人员丨1周前
目的:探究组蛋白去乙酰化酶2(histone deacetylase 2,HDAC2)基因多态性与汉族男性酒精使用障碍(alcohol use disorder,AUD)之间的关联性,为早期识别和干预酒精使用障碍提供参考。方法:选择194例汉族AUD患者(病例组)和310例正常人(对照组),提取两组外周血基因组DNA,从HapMap数据库获得HDAC2基因的13个SNP位点,采用Agena MassARRAY SNP基因分型法对两组进行基因分型。SPSS 25.0分析两组基因型频率和等位基因频率的差异,并使用Haploview 4.2软件进行连锁不平衡以及单倍体分析,利用置换次数为50 000次的置换检验进行多重检验矫正。结果:HDAC2基因3个SNP位点(rs9481408,rs6568819,rs9488289)的基因型在病例组和对照组之间均差异有统计学意义(均 P<0.05)。进一步在5种不同遗传模型中分析这3个位点,结果显示病例组与对照组相比,三个位点在隐性遗传模式下与AUD存在显著相关( P=0.033,T/T与C/C-C/T基因型比较, OR=1.78,95% CI: 1.05~3.03; P=0.032,T/T与C/C-C/T基因型比较, OR=1.79,95% CI: 1.05~3.03; P=0.022,G/G与C/C-C/G基因型比较, OR=1.85,95% CI: 1.09~3.13)。构建7个SNP单倍型,其中GATCTGCCAATAA在病例组和对照组之间关联比值比为2.44,差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:HDAC2基因多态性位点rs9481408、rs6568819、rs9488289以及GATCTGCCAATAA单倍型与汉族男性人群酒精使用障碍的发病具有相关性,HDAC2基因是AUD易感基因之一。
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编辑人员丨1周前
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沉默信息调节因子1基因启动子区域单核苷酸多态性与老年退行性心脏瓣膜病的相关性分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨沉默信息调节因子1(SIRT1)基因启动子序列单核苷酸多态性(SNPs)与老年退行性心脏瓣膜病(SDHVD)的相关性。方法:对236例SDHVD组成员(2012年2月至2016年10月济宁医学院附属医院确诊为SDHVD的患者)与285名健康对照组成员(同期于济宁医学院附属医院体检中心体检的健康体检者)的SIRT1基因启动子序列进行统计分析。Sanger测序法检测SIRT1基因启动子序列SNPs;χ 2、Logistic回归对SNPs进行基因型、等位基因分析和相关性分析,Haploview 4.2软件对SNPs进行连锁不平衡分析,SHEsis程序进行单倍型分析,凝胶迁移率变异实验(EMSA)分析SNPs对转录因子与SIRT1基因启动子相结合的影响,Transfac程序预测受多态性影响的与SIRT1基因启动子相结合的转录因子。 结果:rs3740051位点GG基因型与SDHVD的发生具有相关性,校正年龄后,其致SDHVD效应是AA基因型的3.079倍( OR=3.079,95 %CI:1.156~8.201, P=0.024)。SIRT1基因启动子中,5个SNPs位点间呈强连锁不平衡(均D′>0.8),共形成11种 P<0.05的单倍型,其中*A**C、AA**C、*AG*C、AAG*C、AA*AC、*AGAC和AAGAC在SDHVD组中具有更高的频率(均 P<0.05, OR>1,95 %CI不包含1)。EMSA示正常序列探针与核蛋白所孵育出的结合条带较突变序列探针与核蛋白所孵育出的结合条带颜色深。 结论:rs3740051位点GG基因型与SDHVD具有相关性且可能是SDHVD发生的危险性基因型。单倍型AC(跨rs932658和rs2394443)可能是SDHVD发生的危险性单倍型。rs3740051可能通过干扰FOXC蛋白与SIRT1基因启动子的结合影响SDHVD的发生发展。
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编辑人员丨1周前
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DTNBP1基因多态性与中国北方地区汉族人群精神分裂症易感性的关联研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨肌营养不良蛋白结合蛋白1( DTNBP1)基因多态性与中国北方地区汉族人群精神分裂症易感性之间的关联。 方法:收集精神分裂症汉族患者150例(病例组)和汉族健康志愿者160例(对照组)外周血样本,提取基因组DNA。采用多重高温连接酶检测反应技术(improved multiple ligase detection reaction,iMLDR)对 DTNBP1基因的rs909706、rs2619539、rs9370822和rs4236167位点进行基因分型。 结果:DTNBP1基因的rs909706、rs2619539、rs9370822和rs4236167位点的等位基因、基因型和单倍型频率在病例组和对照组间的分布差异无统计学意义( P>0.05)。按照性别分组rs909706位点的等位基因频率在男性、女性组间的差异具有统计学意义( P=0.000),携带有C等位基因的男性患精神分裂症的风险增高。 结论:DTNBP1基因的rs909706位点与中国北方地区汉族男性人群精神分裂症的易感性相关。
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编辑人员丨1周前
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淀粉样前体蛋白基因多态性与汉族儿童青少年双相情感障碍的关联研究
编辑人员丨1周前
目的:探究淀粉样前体蛋白(amyloid precursor protein,APP)基因多态性与汉族儿童青少年双相情感障碍(bipolar disorder,BD)之间关联,寻找合适的单核酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点,为提前诊断和干预儿童青少年BD提供参考。方法:选择178例汉族儿童青少年BD患者(病例组)和178例正常儿童青少年(对照组),提取两组外周血基因组DNA,从APP基因上取4个SNP(single nucleotide polymorphisms)位点,采用LDR-PCR SNP基因分型方法对儿童青少年BD患者和正常儿童青少年进行SNP分析。SPSS 22.0分析两组基因型频率和等位基因频率的差异,并使用软件SHEsis进行连锁不平衡分析和单倍型分析。结果:APP基因4个SNP位点的基因型频率及等位基因频率在病例组和对照组差异有统计学意义( P<0.05)。APP基因4个SNP位点rs2040273、rs466433、rs463946、rs364048与BD相关联,差异有统计学意义( P<0.05)。构建4个SNP单倍型表明AACT、AGGC、GACT占总数的80%以上,单倍型中AGGC在病例组中所占百分比(11.9%)高于对照组(4.7%),差异有统计学意义( P<0.05),而且AGGC单倍体的关联比值比为2.727。 结论:APP基因4个SNP位点rs2040273、rs466433、rs463946、rs364048以及AGGC单倍型与汉族儿童青少年BD关联,APP基因是BD易感基因之一。
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编辑人员丨1周前
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CDKN2B-AS1基因多态性与克罗恩病发病风险的相关性分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨细胞周期依赖性激酶抑制因子2B反义链1(CDKN2B-AS1)基因多态性与克罗恩病(CD)发病风险的相关性。方法:选择2012年1月至2021年1月于温州医科大学附属第二医院消化内科收集的207例CD患者[男133例,女74例,年龄(31.6±10.8)岁]及年龄、性别相匹配的545名健康对照者[男337名,女208名,年龄(31.7±9.3)岁]。采用基质辅助激光解吸电离-时间飞行质谱技术检测两组受试者CDKN2B-AS1(rs1063192、rs10757274、rs10757278、rs1333048、rs2383207)的基因型。在CD组和健康对照组之间,采用非条件logistic回归分析CDKN2B-AS1基因多态性的分布差异及其对CD患者临床病理特征的影响。采用Haploview 4.2软件进行连锁不平衡(LD)及单倍型分析。结果:CD组中rs1063192的变异基因型(AG+GG)和变异等位基因(G)的频率均高于健康对照组(32.4%比24.8%, P=0.036;18.8%比13.6%, P=0.011)。CD组中rs10757274的纯合子变异基因型(GG)和变异等位基因(G)的频率亦显著高于健康对照组(19.8%比12.8%, P=0.017;45.2%比38.1%, P=0.012)。根据蒙特利尔CD表型分类法对患者进行分层分析发现,(狭窄型+穿透型)CD患者中rs10757278的纯合子变异基因型(GG)和变异等位基因(G)的频率均显著低于非狭窄非穿透型CD患者(13.7%比29.9%, P=0.015;37.7%比50.4%, P=0.022)。上述结果经Bonferroni校正后差异均无统计学意义(均 P>0.05)。LD分析结果显示CDKN2B-AS1基因上rs10757274、rs2383207、rs10757278和rs1333048彼此紧密连锁。CD组中单倍型AGAC的频率显著低于健康对照组(1.5%比4.5%, χ2=7.61, P=0.006),但单倍型GGAC的频率显著高于健康对照组(3.0%比0.6%, χ2=14.25, P<0.001)。进一步分层分析发现,(狭窄型+穿透型)CD患者中单倍型AGAC的频率高于非狭窄非穿透型CD患者(3.1%比0.4%, χ2=5.31, P=0.021)。 结论:CDKN2B-AS1基因上rs1063192、rs10757274、rs10757278、rs1333048和rs2383207发生变异可能不会独立影响CD发病风险。rs10757274、rs2383207、rs10757278和rs1333048彼此紧密连锁,虽然携带单倍型AGAC可能降低CD发病风险,但可能提高CD患者发生狭窄或穿透的风险。另外,携带单倍型GGAC可能增加CD发病风险。
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编辑人员丨1周前
