-
不同正畸矫治阶段的唾液多肽组学分析
编辑人员丨4天前
目的:探讨不同正畸矫治阶段唾液多肽组学的差异。方法:纵向观察不同矫治阶段(初戴矫治器2个月、矫治18个月)的正畸患者共30例,在两个时间点分别收集其总唾液,利用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)结合弱阳离子磁珠进行检测分析,并利用数据库和软件进行蛋白预测。结果:MALDI-TOF质谱分析结果平均检测到了130个有意义的多肽谱峰,两组比较结果显示不同矫治阶段患者的唾液多肽组分存在明显差异,统计分析发现两组共有7个多肽峰其峰值的差异具有统计学意义,其中有5个谱峰在18个月组的峰值强度高于2个月组,另外2个谱峰在18个月组的峰值强度低于2个月组;此外本研究预测2022.1Da为C3补体,2863Da为载脂蛋白A1。结论:本研究提示正畸矫治及牙齿移动的过程中唾液多肽组分存在着变化和差异,相关生物学标记物可能发挥重要作用,可能与正畸过程中的机械力作用产生的牙槽骨改建、牙根吸收等有关,提出了基于唾液检测的精准医疗探索正畸矫治及牙齿移动相关的生物标记物的新思路。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
环状RNA生物特性与非小细胞型肺癌的研究进展
编辑人员丨4天前
环状RNA(circRNA)是一类反向剪切、由下游剪接供体与上游剪接受体相连接,形成一个共价闭合环路结构的非编码RNA。它既没有5′-7甲基鸟嘌呤的帽结构,也没有3′-腺苷酸尾结构,不被核酸外切酶水解,在细胞、组织、唾液及外泌体中稳定存在。circRNA可以通过"海绵"miRNA直接参与基因转录、转录后及剪接过程,可作为模板直接翻译成多肽或蛋白质等发挥作用。近年来的研究发现,circRNA在非小细胞肺癌的发生与发展中发挥重要作用,可能成为非小细胞肺癌诊断、治疗及预测预后的生物标志物。
...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
-
家蝇AMP17基因的克隆及其分子特性和表达模式研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 克隆家蝇AMP17基因并进行、序列分析,对其时空表达模式进行初步探索. 方法 从微生物诱导的家蝇转录组数据库中筛选差异高表达唾液腺蛋白AMP17基因.以该基因的cDNA文库质粒为模板进行PCR扩增,运用生物信息学方法对其编码蛋白进行结构与功能分析.取家蝇不同生活史时期标本(卵,各龄幼虫,蛹,雄雌成虫)及3龄幼虫不同组织部位(体壁、气管、唾液腺、脂肪体、马氏管及中肠)标本,采用实时荧光定量PCR检测AMP17基因表达情况. 结果 PCR扩增得到约495 bp的特异性AMP17基因片段.AMP17基因ORF全长495 bp,编码164个氨基酸,理论分子质量单位17.4×103,等电点为6.09,整个多肽链表现为亲水性.该蛋白属于分泌蛋白,主要分布在细胞外(包括细胞壁).磷酸化位点分析该蛋白,有5个丝氨酸、3个苏氨酸、1个色氨酸可能成为蛋白激酶磷酸化位点.其二级结构中主要以α-螺旋,不规则卷曲和延伸链为蛋白最大量的结构元件.时空表达谱显示,家蝇不同发育时期中,以卵期作为参照,AMP17基因在3龄及雄成虫时期表达量高,表达水平排列顺序为3龄幼虫>雄成虫>1龄幼虫>雌成虫>蛹期>2龄幼虫>卵,3龄幼虫时期表达量比卵期上调了20 320.98倍(P<0.01);雄成虫上调了10 936.37倍(P<0.01).以体壁作为参照,AMP17基因在家蝇3龄幼虫不同组织的表达以马氏管表达最高,比体壁上调了2.40倍(P<0.05);其次为唾液腺,比体壁上调了1.31倍(P<0.01). 结论 成功克隆了家蝇AMP17基因并初步探索了其时空表达模式,为进一步研究其功能奠定了基础.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
蚂蟥Guamerin基因的克隆及吸食后时空表达分析
编辑人员丨2023/8/6
该研究对非吸血蛭蚂蟥体中弹性蛋白酶抑制剂基因(wpGuamerin)进行了克隆和生物信息学分析,同时对该基因在蚂蟥不同组织、不同吸食阶段的时空表达特点进行研究.结果表明,蚂蟥wpGuamerin基因全长295 bp,相对分子质量为9 145.95 Da,包含1个编码83个氨基酸的开放阅读框,与吸血蛭Guamerin氨基酸序列相似性均在29% ~ 65%;wpGuamerin编码的蛋白无信号肽,属于亲水性蛋白,二级结构主要由α-螺旋、延伸链、折叠和无规则卷曲组成.wpGuamerin在肌肉中表达量显著高于唾液腺,在嗉囊和肠中无表达;吸食后wpGuamerin在肌肉和唾液腺的表达量分别在第1,3天达到最高.因此,wpGuamerin是有别于吸血蛭Guamerin的小分子多肽蛋白,在蚂蟥消化道中不表达,主要在肌肉中表达,吸食行为可刺激蚂蟥肌肉和唾液腺wpGuamerin基因的表达而不能诱导蚂蟥消化道wpGuamerin的表达.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
基于唾液宏蛋白质组学的重度低龄儿童龋患者唾液微生物群落分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 采用宏蛋白质组学技术研究重度低龄儿童龋患者唾液微生物群落的特征.方法 采集重度低龄儿童龋及无龋儿童非刺激性唾液,提取唾液中的蛋白质、酶解形成多肽后进行质谱分析,对比微生物库分析唾液微生物群落的特征.结果 无龋儿童唾液微生物来源于19个门1216个种,高丰度的微生物以变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、梭杆菌门以及乳糖奈瑟氏菌、肺炎链球菌、干燥奈瑟氏菌、副流感嗜血杆菌、脑膜炎奈瑟氏菌、流感嗜血杆菌、浅黄奈瑟氏菌、淋病奈瑟氏菌、金氏金菌、黏膜奈瑟氏菌、多糖奈瑟氏菌等11种细菌为主;重度低龄儿童龋儿童唾液微生物来源于24个门1698个种,高丰度的微生物以变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、蓝藻菌门以及肺炎链球菌、乳糖奈瑟氏菌、干燥奈瑟氏菌、流感嗜血杆菌等4种细菌为主.结论 宏蛋白质组技术可以全面、快速分析口腔唾液微生物群落的构成.重度低龄儿童龋儿童唾液微生物群落结构相比无龋儿童更加复杂,这种复杂性可能与龋病的产生及唾液微生态失衡有关.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
应用质谱技术检测牙龈炎治疗前后唾液及龈沟液多肽组的变化
编辑人员丨2023/8/6
目的 通过基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(matrix?assisted laser desorption?ionization time?of?flight mass spectrometry,MALDI?TOF MS)探索菌斑性龈炎患者治疗前后唾液和龈沟液多肽组的特征性变化,为多肽标志物应用于疾病监测奠定基础.方法 从北京大学口腔医学院·口腔医院预防科2017年1至9月就诊患者中选择符合标准的17例菌斑性龈炎患者(男性6例,女性11例,年龄24~62岁),分别于基线、洁治后1周记录受试者的探诊出血、出血指数,收集唾液、龈沟液样本,处理后利用MALDI?TOF MS检测样本中多肽表达水平差异.纳米液相色谱?电喷雾?串联质谱技术(nano?liquid chromatography?electrospray ionization?tandem mass spectrometry,nano?LC/ESI?MS/MS)用于识别差异多肽的蛋白质来源.结果 17例菌斑性龈炎受试者治疗前后的唾液样本经比较筛选出4个具有统计学意义的差异多肽峰(P<0.05),这4个差异多肽峰在治疗后均呈下降趋势,质荷比分别为1 030.6、1 043.4、1 053.4和1 064.6;治疗前后的龈沟液样本经比较筛选出5个具有统计学意义的差异多肽峰(P<0.05),其中多肽峰1 055.5和1 168.3在治疗后强度显著下降(P<0.05),而3 363.7、3 480.9和3 489.5则呈显著上升趋势(P<0.05).唾液、龈沟液的个别差异多肽峰之间、差异多肽峰强度与探诊出血、出血指数之间呈正相关关系,利用这些差异多肽峰进行的主成分分析显示治疗前与治疗后个体的分布集中趋势不同,龈沟液差异多肽峰代表的个体分离趋势略明显.经nano?LC/ESI?MS/MS鉴定,龈沟液中多肽峰1 055.5来源于血清白蛋白,唾液中1 064.6来源于补体C3.结论 唾液和龈沟液中存在与牙龈炎治疗相关的差异多肽峰,可成为潜在的生物学标志物.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
绝经后骨质疏松症关联长链非编码RNA uc431+相互作用蛋白质组学分析
编辑人员丨2023/8/5
背景:过表达LncRNA TUG1促进破骨细胞的增殖及抑制凋亡,采用siRNA敲低则取得了相反的结果,表明敲低LncRNA TUG1可能成为一个骨质疏松治疗的潜在靶点.目的:研究与绝经后骨质疏松症关联非编码RNA uc431+相互作用的蛋白组并进行生物信息学分析.方法:将甲醛交联的人单核细胞白血病细胞株(THP-1)细胞超声破碎,实验组与结合生物素标记的特异性探针的磁珠进行杂交,对照组与非特异性探针的磁珠进行杂交,获得的与非编码RNA uc431+结合的多肽进行质谱分析,获得的数据使用MaxQuant进行搜库和定量分析.对2组样品的定量结果进行统计学分析,得到对应的富集蛋白,并进行GO、KEGG通路、蛋白互作分析和展示,构建蛋白质相互作用网络.结果与结论:①获得的多肽总数为918条,蛋白总数为271个,过滤后蛋白总数为241个,与对照组相比,实验组差异蛋白为10个:DDOST、DMBT1、HPD、IGLL5、IGK、LTF、LYZ、MUC5AC、PIGR及RPL23;②GO富集分析表明,它们参与防御反应、白细胞激活等生物学过程及核糖体rRNA结合、溶菌酶活性等分子功能;③KeggG通路分析预测它们参与辅酶Q生物合成、苯丙氨酸代谢、核糖体信号肽及唾液分泌等信号通路;④结合蛋白质组学及生物信息学分析,预测绝经后骨质疏松症关联非编码RNA uc431+可能通过互作蛋白参与免疫调节及骨代谢过程.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
组蛋白Histatin 1研究进展
编辑人员丨2023/8/5
组蛋白Histatin是一组富含组氨酸的小分子、阳离子同源多肽,由腮腺、下颌下和舌下腺的浆液性腺泡分泌,在人和高等灵长类动物的唾液中表达,具有广谱抗菌活性[1].现已分离出12种Histatin,即Histatin?1~12[2].Histatin?1(Hst?1)和?Histatin?3(Hst?3)分别是由基因HIS1和HIS2编码的全长产物,其余组蛋白均由Hst?1和Hst?3蛋白水解切割产生[3].Hst?1在人类唾液的组蛋白中含量最多,具有促进细胞扩散、迁移、粘附和抗菌等作用.近年来,有学者检测到Hst?1在除口腔外的其他组织中表达,如泪腺和副泪腺、黑色素瘤细胞系[4-5]等.本文重点介绍Hst?1的主要生物学功能、信号传导通路,为Hst?1的临床应用前景提供思路.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
-
牙周炎与慢性阻塞性肺疾病患者的唾液多肽组学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析牙周炎(periodontitis,PD)与慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)患者唾液中与疾病相关的差异性表达多肽,寻找具有潜在诊断意义的生物标志物,为探讨COPD的早期防治开辟新视角.方法 筛选PD患者10例(PD组)、PD伴COPD患者10例(PD伴COPD组)及健康对照人群8例(对照组),收集各组临床资料及唾液样本.应用弱阳离子交换磁珠(weak-cation-exchange magnetic beads,WCX-MB)分离纯化唾液上清样本,应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统获取样本生物学信息,进行多肽差异性质谱分析,筛选出组间差异性多肽,并通过液相色谱-质谱/质谱联用技术(liquid chromatography tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)对差异性多肽进行鉴定.结果 三组样本共检测出77个差异多肽峰,其中PD伴COPD组和PD组间显著性差异多肽峰10个,PD伴COPD组有8个多肽峰(1 193.5、1 836.2、1 735.1、1 321.3、1 356.8、2 086.8、1 863.6、2 230.9)表达增高,2个多肽峰(1 067.3、1 124.4)表达减低.其中1 193.5、1 356.8多肽峰被鉴定为富组蛋白1、颌下腺激素调节蛋白3B及唾液酸性富脯磷蛋白1/2.结论 本研究通过WCX-MB和MALDI-TOF-MS分析出PD伴COPD患者唾液中存在与疾病相关的差异性表达多肽,筛选出的差异性表达多肽有望成为早期诊断COPD的辅助指标.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/5
