目的:探讨青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫菌规律间隔成簇短回文重复序列（CRISPR）的基因型及其地区分布。方法:选取青海省地方病预防控制所保存的1954-2011年在不同地区宿主、媒介体内分离的1 004株鼠疫菌作为实验对象，采用传统的苯酚-氯仿混合抽提法提取鼠疫菌DNA。分别对3个CRISPR位点（YPa、YPb和YPc）进行PCR扩增、测序，将所测得CRISPR序列与文献最新报道的CRISPRDictionary数据库进行检索比对，以鉴定间区序列（spacer）；对CRISPR各位点新发现的spacer，在美国国家生物技术信息中心（NCBI）数据库进行Blast序列比对，推测基因序列来源。根据CRISPR spacer阵列的多态性对青藏高原鼠疫菌进行基因分型。结果:1 004株鼠疫菌共发现53种spacer，其中新发现6种，分别为a105、a106、a107、b51、b52、c14；1 004株鼠疫菌被分成44个不同的CRISPR基因型，10大类群，新发现基因型15种，喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫菌CRISPR基因型以G26-a1′、G7、G22、G24-a1′、G22-a1′、G9、G26-a1′a60型为主，青海田鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌CRISPR基因型为G37-a6′型。结论:青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫菌CRISPR基因型具有高度多样性，且地区分布特征显著。

目的:分析青海省鼠疫疫情监测结果，掌握青海省鼠疫流行态势，为今后的鼠疫防控工作提供科学依据。方法:收集2011-2020年青海省人间鼠疫疫情资料（来自青海省地方病预防控制所人间病例数据库）和动物间鼠疫疫情资料（来自青海省鼠疫监测数据和鼠疫疫源地调查数据），采用描述性流行病学方法进行分析，包括人间鼠疫疫情，动物间鼠疫疫情地区分布，宿主动物、病原学和血清学监测结果等。结果:2011-2020年，青海省发生人间鼠疫疫情1起，因剥食旱獭时不慎划伤右手中指感染，自死者的心、肝、肺、淋巴结穿刺液、气管分泌物和咽拭子样本中均分离出鼠疫耶尔森菌。共发生动物间鼠疫疫情16起，流行地区分布在海西州、玉树州和海北州，其中海西州动物间鼠疫流行最多，10年间共发生13起。宿主动物监测显示，主要宿主动物为喜马拉雅旱獭，其平均密度为0.07匹/hm 2。病原学监测显示，共分离出鼠疫耶尔森菌31株，其中海西州分离出27株；分离出鼠疫耶尔森菌的宿主动物以喜马拉雅旱獭为主，占总数的77.42%（24/31）。血清学监测显示，共检出鼠疫F1抗体阳性血清66份，其中犬阳性血清最多，为43份；喜马拉雅旱獭次之，为20份。 结论:2011-2020年青海省动物间鼠疫连年不断，局部地区呈活跃态势，鼠疫防控总体形势严峻。

目的:了解甘肃省肃南裕固族自治县（肃南县）喜马拉雅旱獭鼠疫流行态势及耶尔森菌感染状况，为防控鼠疫提供新思路。方法:2014 - 2018年，在肃南县现场采集喜马拉雅旱獭肝脾、盲肠、咽拭子及血液样本，分离鉴定耶尔森菌菌株类型，并进行鼠疫F1抗原、抗体检测。结果:共采集喜马拉雅旱獭肝脾组织634份、盲肠样本427份、咽拭子样本426份，分别检出鼠疫耶尔森菌23株、马赛耶尔森菌2株、弗氏耶尔森菌1株，检出率依次为为3.63%（23/634）、0.47%（2/427）、0.23%（1/426）；不同年份鼠疫耶尔森菌检出率比较，差异有统计学意义（χ 2 = 13.19， P = 0.010）。共检测喜马拉雅旱獭血清1 822份，检出F1抗体阳性样本5份，阳性率为0.27%，不同年份间比较差异有统计学意义（χ 2 = 25.22， P < 0.001）；检测喜马拉雅旱獭肝脾组织匀浆282份，检出F1抗原阳性样本22份，阳性率为7.80%，不同年份间比较差异无统计学意义（χ 2 = 7.85， P = 0.097）。检出的23株鼠疫耶尔森菌分布在马蹄藏族乡（12株）、大河乡（6株）、祁丰藏族乡（5株）；1株弗氏耶尔森菌和2株马赛耶尔森菌均在大河乡。 结论:2014 - 2018年肃南县有动物间鼠疫流行，检出鼠疫耶尔森菌和非致病性耶尔森菌的地区有重叠。

目的:掌握甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫流行特征，为结合当地实际，创新开展鼠疫防控工作提供科学依据。方法:采用回顾性研究，收集2011-2018年甘肃省鼠疫自然疫源地监测数据（来源于甘肃省疾病预防控制中心疫情监测档案、网络直报信息）。采用描述性流行病学方法，分析2011-2018年甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地的鼠疫流行特征，包括宿主动物分布情况、鼠疫菌的病原学及血清学检测结果、人间鼠疫流行特征等。结果:2011-2018年，甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地总平均獭密度为0.21只/hm 2，其中天祝县平均獭密度最高，为0.58只/hm 2；嘉峪关市平均獭密度最低，为0.01只/hm 2。疫源地内共分离鼠疫菌381株，其中分离自人尸4株、宿主动物298株、染疫媒介79株；分离菌株前3位的县（市）依次为阿克塞县（38.85%，148株）、肃北县（31.50%，120株）、玉门市（16.27%，62株）。共检测旱獭血清6 860份、犬血清1 769份，F1抗体阳性率分别为2.70%（185/6 860）、8.42%（149/1 769）；动物材料814份，F1抗原阳性率为4.30%（35/814）。共发生人间鼠疫4起，发病4人，死亡4人；其中3起发生在肃北县、1起在玉门市；发病月份分别为7、9、11、12月，主动接触牧羊犬等染疫动物是主要感染途径，外来放牧雇工为重点职业人群。 结论:甘肃省祁连山-阿尔金山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地动物间疫情活跃，且各地区鼠疫疫情呈现不同流行状态；应采取因地制宜、分类指导的防控措施严防鼠疫的发生和传播。

目的:探讨基于单核苷酸多态性（SNP）的甘肃省鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）的基因分型及其地区分布特征。方法:选取1962 - 2017年甘肃省喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地和阿拉善黄鼠鼠疫疫源地分离的52株鼠疫菌，培养并提取基因组DNA，进行Illumina PE150二代测序，鉴定鼠疫菌SNP位点。基于SNP位点，采用Mega 10.0软件中邻接法的Kimura-2-parameter模型确定甘肃省鼠疫菌种群特征，并对群内菌株采用最大似然法的Hasegawa-Kishino-Yano模型构建分子进化树。结果:甘肃省52株鼠疫菌共鉴定出103个SNP位点，其中，基因间区位点28个，非同义突变位点43个，同义突变位点31个，无义突变位点1个。52株鼠疫菌划分为2个生物型3个群，分别为古典型（1.IN2、3.ANT），中世纪型（2.MED）。其中，35株属于1.IN2群，13株属于3.ANT群，4株属于2.MED群。1.IN2群内菌株进一步划分为肃北县鱼儿红乡、党城湾镇，肃南县马蹄乡、大河乡，夏河县5个亚群。3.ANT群内菌株进一步划分为阿克塞县红柳湾镇和肃北县党城湾镇马场2个亚群。结论:SNP方法能够对甘肃省不同鼠疫疫源地的鼠疫菌进行基因分型，且具有一定的区域性特征。

青藏高原东南部的东喜马拉雅地区和横断山区是全球生物多样性热点区,也是青藏高原重要的生态安全屏障区,但对该区域森林群落的生态位特征以及多样性相关研究较少.收集和整理了分布于青藏高原东南部的乔木植物及其科属特征,并分析主要优势物种的生态位特征以及森林群落多样性的影响因素.采用"Levins"方法计算优势物种的生态位宽度和生态位重叠值;随后,使用方差比率法、x2检验、Association coefficient联结系数和Ochiai指数等方法分析了种间联结性;最后,使用方差分解方法计算了每个环境因素对植物多样性的解释率.研究结果表明:(1)位于东喜马拉雅地区和横断山区森林群落共有植物42科71属119种,物种组成主要以松科(17种)、杜鹃花科(10种)、桦木科(9种)、无患子科(8种)和樟科(6种)为主;(2)该地区所有种植物生态位重叠值较低(平均值为0.027),并且生态位重叠值为0的种对数最多,说明森林群落整体竞争较小,处于一个相对稳定的状态;(3)生态位宽度值由高到低的物种依次为:冷杉、杜鹃、云南铁杉、川西云杉、落叶松、黄背栎、高山栎、花楸、石栎和云南松,这10种植物在森林群落占据优势地位;(4)种间关联结果显示方差比率大于1,说明森林群落中物种间存在较强的正关联,群落内各个物种占据的不同生态位,合理地利用各种资源;(5)年均温和坡向被认为是影响该地区森林群落物种多样性最关键的两个环境因子;(6)森林群落在年均温为7-11℃的地区和半阳坡的地形中,群落植物多样性最高.

物种编目是生物多样性研究和保护的基础,长期开展野生动物多样性监测、提供物种分布影像资料佐证对于更新本底物种编目至关重要.祁连山国家公园青海祁连县片区自东向西差异明显的自然生态系统孕育了诸多野生动物类群.2017年9月至2021年12月,为了调查该片区内雪豹(Panthera uncia)及同域分布物种本底数据,在雪豹适宜生境选取187个位点利用红外相机开展野生动物监测.调查期间,累积获得44946个有效相机工作日,收集独立有效照片14330张(含雪豹466张),共鉴定出野生动物78种,其中兽类5目12科27种,鸟类7目18科51种.记录到国家Ⅰ级重点保护野生动物9种,包含雪豹、荒漠猫(Felis bi-eti)、白唇鹿(Cervus albirostris)、马麝(Moschus chrysogaster)、藏野驴(Equus kiang)、胡兀鹫(Gypaetus barba-tus)、秃鹫(Aegypius monachus)、金雕(Aquila chrysaetos)和红喉雉鹑(Tetraophasis obscurus);国家 Ⅱ 级重点保护野生动物20种;"三有"动物40种.被IUCN红色名录评估为濒危(EN)的野生动物1种,易危(VU)3种,近危(NT)5种;被《中国脊椎动物红色名录》评估为极危(CR)、濒危、易危和近危的分别有3、5、7和17种.相对多度指数(RAI)排名前5位的兽类依次是岩羊(Pseudois nayaur,RAI=128.18)、喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana,RAI=50.17)、赤狐(Vulpes vulpes,RAI=11.30)、灰尾兔(Lepus oiostolus,RAI=10.72)和雪豹(RAI=10.37);RAI 排名前 5 位的鸟类依次为赭红尾鸲(Phoenicurus ochruros,RAI=8.30)、藏雪鸡(Tetraogallus ti-betanus,RAI=5.18)、红嘴山鸦(Pyrrhocorax pyrrhocorax,RAI=3.87)、棕颈雪雀(Pyrgilauda ruficollis,RAI=4.32)和喜鹊(Pica pica,RAI=3.65).本次在祁连县境内监测到的斯氏高山?(Alticola stoliczkanus)、藏雪雀(Montifringilla henrici)和黄腰柳莺(Phylloscopus proregulus)为祁连山地区新记录物种.此外,红外相机还监测到较多的放牧活动(RAI=56.09).本研究为祁连山国家公园区域物种编目以及制定野生动物保护与管理政策提供了数据支持.

基于形态学和分子系统学方法,对1974、2019-2023年间采自雅鲁藏布江下游(我国实际控制区内,下同)的403尾鮡科鱼类标本进行分类整理.标本检视结果及结合历史记录表明,雅鲁藏布江下游共分布有鮡科鱼类6属10种,即黑斑原鮡Glyptosternon maculatum(Regan 1905)、穴形纹胸鮡Glyptothorax cavia(Hamilton 1822)、墨脱纹胸鮡G.medogensis Chen&He sp.nov.、疑似细体纹胸鮡G.cf.gracilis(Günther 1864)、稀有纹胸鮡G.rara Chen&He sp.nov.、西仁褶鮡Pseudecheneis sirenica Vishwanath&Darshan 2007、扁头异鮡Creteuchiloglanis kamengensis(Jayaram 1966)、细尾鰋Exostoma tenuicaudatum Tamang,Sinha&Gurumayun 2015、西藏鰋E.tibetanum Gong,Lin,Liu&Liu 2018和无斑平唇鮡Parachiloglanis immaculata Chen&He sp.nov..新种墨脱纹胸鮡是安氏纹胸鮡G.annandalei Hora 1923种名的修订,其偶鳍具羽状皮褶,项背骨前突与上枕骨棘相离,腹鳍起点位于背鳍基后缘垂直下方之后,腹鳍末端远离臀鳍起点,更细的尾柄,以及更长的头长等联合特征区别于同属其他物种.新种稀有纹胸鮡其偶鳍腹面光滑,无羽状皮褶;胸部吸着器心形,皮纹向前延伸至咽部,附着器后缘中部微陷、开放,皮纹不明显;臀鳍不分枝鳍条11根;项背骨前突与上枕骨棘间隔距离远;上颌须延伸超过胸鳍基末端,达胸鳍长的1/2处,其长为头长的134.2%等特征区别于同属其他种.新种无斑平唇鮡是霍氏平唇鮡P.hodgarti(Hora 1923)种名修订,其上颌齿带两侧向后延伸,内侧内凹,呈弯月形,横向宽约为纵向深的2倍;下颌齿带前缘和后缘中部微凹,左右两块紧靠,无明显间隔;鳃孔下角限于胸鳍基前1/3处;脂鳍末端游离,与尾鳍起点有一缺刻;胸鳍分枝鳍条16-17根;尾鳍末端明显内凹;侧线明显,侧线孔周围具白色稀疏圆点,体表和各鳍无明显的斑纹等特征有别于同属其他物种.穴形纹胸鮡为我国新记录种.西仁褶鮡为黄斑褶鮡P.sulcata(McClelland 1842)种名的修订.文章对10种鮡科鱼类的主要鉴别特征进行了描述,并编制了属种分类检索表.

于西藏喜马拉雅南坡的陈塘沟开展植物多样性调查过程中,发现一种在《中国植物志》中未记录的马先蒿属(Pedicularis)植物.通过文献查阅和详细的形态学比较,确定其为中国新记录种Pedicularis tamuren-sis T.Yamaz.,为其新拟中文名称:陈塘马先蒿.该种以前仅发现于尼泊尔,现也发现于中国西藏自治区日喀则市定结县陈塘镇.此新记录种生长于海拔约2?900 m的冷杉(Abies fabri(Mast.)Craib)林下,与光唇马先蒿(Pedicularis fletcheri P.C.Tsoong)相似,主要识别特征为:叶对生,两面均密生短毛,羽状全裂至深裂;花序总状,花白色,盔瓣呈镰刀状弯弓,中间渐狭成喙,顶端2裂,下唇完全包围盔瓣.本文对陈塘马先蒿进行了详细的形态描述,介绍了其分布信息,并提供彩色图片便于鉴别.该新记录种的发现更新了国产马先蒿属植物的资料,丰富了中国植物多样性的内容.

我国现分布有 4 种类型的旱獭,其中喜马拉雅旱獭分布地域最广,所在鼠疫自然疫源地面积最大.喜马拉雅旱獭是鼠疫杆菌的主要动物宿主之一,主要分布在青藏高原地区,该地区动物间鼠疫频发,是我国最活跃的鼠疫疫源地之一.近年来在喜马拉雅旱獭体内检测出多种病原体,其中部分病原体对人群具有潜在致病性且在一定条件下具备引起人兽共患病流行的风险.因此,由喜马拉雅旱獭引起的疫源性疾病对人群健康和畜牧业的发展具有潜在危害性,一定程度影响区域经济发展.对已在喜马拉雅旱獭中检测出病原体进行整理,以期为动物疫源性传染病的研究及防控工作提供参考,并就如何降低其对人群和生态环境的影响提出建议.