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产免疫分枝杆菌引起的多发皮肤软组织感染1例
编辑人员丨6天前
产免疫分枝杆菌是一种罕见的非结核分枝杆菌,属于快生长型分枝杆菌,可引起皮肤感染、角膜炎、导管相关感染、慢性肺炎和脓毒症等,其感染多发生在美洲,国内诊治经验很少。本文报道1例由产免疫分枝杆菌引起的全身多发皮肤软组织感染病例,经培养、质谱鉴定和宏基因组二代测序检测明确病原体,最终参考抗菌药物敏感性试验结果,通过联合抗分枝杆菌治疗取得了良好疗效。面对罕见感染病例,临床微生物实验室采用全面的诊断方法和应用新技术对于精准诊治具有重要价值。
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编辑人员丨6天前
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高毒力肺炎克雷伯菌临床感染特征及质谱同源性分析
编辑人员丨6天前
目的:从敏感和多重耐药的肺炎克雷伯菌中筛选出hvKP表型株,对比探讨其临床感染特征的分布和同源性。方法:回顾性收集2014至2018年中山大学附属第三医院临床感染标本所分离的敏感和多重耐药的肺炎克雷伯菌共158株,通过黏液拉丝试验(string test,ST)初筛hvKP感染情况,共筛选到65例患者,男性51例,女性14例,平均年龄56岁。构成比分析其临床感染相关信息,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)对筛选出的hvKP进行种属鉴定及建立新数据库,利用分析软件对所有符合实验条件的菌株进行生物树聚类分析和主成分分析,获得蛋白水平的同源性。结果:根据ST试验,158株肺炎克雷伯菌株中,65例患者共筛选到hvKP 65株,其中62株为全敏感菌株,3株为多重耐药菌株,感染者入院主要疾病诊断集中在肝胆疾病、脑病及肝脓肿;人群基础病主要为糖尿病与高血压。聚类分析将hvKP在距离水平线550处分为3群;主成分分析发现部分菌株具有较近亲缘关系,其中占比最大的Kc群主要与肝胆管疾病有关。Ka群主要与手术后感染有关。结论:hvKP具有高侵袭力,临床感染表现多样,感染病患多为免疫力低下老年患者。MALDI-TOF MS质谱快速同源性分析对hvKP感染快速筛查具有重要临床意义。
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编辑人员丨6天前
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产气克雷伯菌引起新生儿感染的临床分布特征及质谱同源性分析
编辑人员丨6天前
目的:分析产气克雷伯菌引起新生儿感染的临床分布特征及质谱同源性,为防控新生儿感染提供依据。方法:回顾性收集2021年4月至2023年4月苏州市立医院新生儿科收集的58株非重复的产气克雷伯菌分离物。利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术进行蛋白水平的同源性分析建库。使用MALDI Biotyper 3.1生成主成分分析(principal component analysis,PCA)和主谱图(main spectrum profile,MSP)树状图,以获得蛋白水平的同源性。结果:51例感染患儿中以重症监护室、早产患儿及低体重感染患儿为主,分别占84.31%(43/51)、86.27%(44/51)和84.31%(43/51)。重症监护室内早产患儿气管插管患儿42例,占97.67%,低出生体重患儿气管插管患儿32例,占74.44%。51例产气克雷伯菌感染患儿绝大多数住院时间较长,住院时长> 60 d的占25.49%。58株产气克雷伯菌临床标本主要从血、导管头、痰液、胃液、眼分泌物和尿液中分离出。6例患儿在不同样本类型中同时检出产气克雷伯菌。MSP聚类分析显示,58株产气克雷伯菌分为3个群,其中KA群14株,KB群6株,KC 38株。KC群主要与重症监护室有关,多伴有气管插管和血流感染。KB群主要与早产低体重患儿相关,而KA群主要与普通病房患儿相关。结论:产气克雷伯菌具有高侵袭力,MALDI-TOF MS质谱快速同源性分析对产气克雷伯菌感染快速筛查具有一定的临床意义。
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编辑人员丨6天前
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基于基质辅助激光解析电离飞行时间质谱的B组链球菌血清型预测模型验证
编辑人员丨6天前
目的:验证基于基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术的B组链球菌(Group B streptococcus,GBS)在线血清型预测模型的分型效能,为临床GBS菌血清型快速分型提供参考。 方法:选取2015至2018年全国多中心新生儿侵袭感染分离GBS菌237株,均已经应用血清凝集试验结合PCR法确认血清型和多重PCR法多位点序列分型(MLST),包括Ⅰa型18株、Ⅰb型70株、Ⅲ型140株、Ⅴ型8株、Ⅵ型1株。运用乙醇灭活-甲酸(乙腈)提取法提取蛋白,用微生物质谱仪采集蛋白指纹图谱,将图谱以m/z和峰强度数据格式输入GBSTyper,以传统血清凝集法血清型为金标准,采用召回率、精确率、 F值(精确率和召回率的调和平均值)来评价GBSTyper分型效果。 结果:GBSTyper对120株(50.63%)GBS菌血清型分型正确,各血清型召回率从高到低依次为Ⅲ型(71.43%)、Ⅴ型(37.50%)、Ⅰb型(21.43%)、Ⅰa型(11.11%),Ⅲ型精确率最高(86.96%),血清型分型精确率仅为3.57%~46.88%,Ⅲ型 F值最高(78.43%),Ⅰa、Ⅰb、Ⅴ型等 F值仅为6.52%~29.41%。 结论:GBSTyper血清型快速分型模型对Ⅲ型血清型菌株分型有效性较高,而对Ⅰa、Ⅰb、Ⅴ型分型有效性很低。该模型能快速识别高危Ⅲ型GBS,对于围产期新生儿GBS感染预防及患儿的临床管理有重要指导意义。
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编辑人员丨6天前
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霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的基因组流行病学分析
编辑人员丨6天前
目的:研究多重耐药霍氏肠杆菌霍夫曼亚种临床分离株C37携带 blaNDM-1基因质粒的遗传特征,并对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组进行系统发育分析,以研究霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的全球流行情况。 方法:收集2014年8月至2021年8月中山大学附属第一医院分离的耐碳青霉烯阴沟肠杆菌复合物(CRECC)。采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)和16S rRNA Sanger测序对C37进行菌种鉴定。使用微量肉汤稀释法进行抗菌药物敏感性试验。采用聚合酶链反应(PCR)检测C37菌株携带的β内酰胺酶耐药基因和质粒介导的喹诺酮类耐药(PMQR)基因。使用接合试验确认C37菌株抗性基因的接合转移性。对C37菌株进行全基因组测序,提取霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组,对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种进行系统发育分析。结果:霍氏肠杆菌霍夫曼亚种C37菌株对三代头孢、碳青霉烯类、氨基糖苷类及喹诺酮类抗菌药物耐药,携带 blaACT-5、 blaNDM-1、 qnrA1、 aac( 6′) -Ib-cr、 oqxAB、 fosA、 dfrA15等多种抗性基因及IncX3、IncX4、IncFIB和IncFII质粒。多位点序列分型(MLST)分析显示其属于阴沟肠杆菌复合体(ECC)ST78型。系统发育分析显示ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关。 结论:ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关,是传播碳青霉烯耐药基因的高风险克隆,需密切监测其流行情况。
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编辑人员丨6天前
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蜈蚣毒液中钾离子通道Kv4.1抑制剂SsTx-P2的分离和结构鉴定
编辑人员丨2024/5/25
目的:挖掘蜈蚣毒液中的电压门控钾离子通道Kv4.1多肽抑制剂,确定其一级结构,并对其空间结构进行建模分析.方法:利用离子交换层析和反相高效液相色谱对蜈蚣毒液的多肽组分进行分离纯化,通过全细胞膜片钳技术鉴定能够抑制Kv4.1通道的多肽;运用基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱鉴定多肽的分子量,借助Edman降解测序和二维质谱测序确定多肽的一级结构;基于迭代线程装配细化在线分析建立多肽空间结构模型.结果:从蜈蚣毒液中分离纯化得到一条能够抑制Kv4.1通道的多肽SsTx-P2,分子量为6122.8,氨基酸序列为NH2-ELTWDFVRTCCKLFPDKSECTKACATEFTGGDESRLKDVWPRKLRSGDSRLKD-OH,其在1.0 μmol/L浓度下能够抑制Kv4.1通道超过95%的电流.空间结构模型显示,多肽SsTx-P2拥有一个保守的螺旋结构.结论:本文通过分离纯化从蜈蚣毒液中得到一条多肽SsTx-P2,能够强效抑制钾离子通道Kv4.1,其空间结构具有一定的保守性.
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编辑人员丨2024/5/25
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环卫工人血培养检出创伤弧菌并成功治愈1例
编辑人员丨2024/4/27
报道1例于山西省汾阳医院确诊的由创伤弧菌引起的血流感染病例,为创伤弧菌感染诊治提供参考依据.患者男性,系环卫工人,工作时不慎划伤右前臂,因右前臂肿痛伴发热入院,该患者近期居住当地,无外出务工史,无近期接触海水或生食海鲜史,入院第2天上午4瓶血培养瓶均报阳,对阳性血培养瓶肉汤直接涂片,同时转种至血平板、嗜血巧克力平板,镜下为革兰阴性杆菌,菌体呈弯曲杆状,下午(培养约7h)取菌膜经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometer,MALDI-TOF MS)鉴定后为创伤弧菌.创伤弧菌所致的败血症死亡率较高,还可引起坏死性筋膜炎,在多学科的相互配合下,患者好转出院.通过此病例,对于发热和肢体红肿疼痛(肢体有外伤史)患者应将创伤弧菌感染纳入鉴别诊断,通过血培养等技术,及时找到病原菌,尽早手术干预,并成立多学科联合小组,可改善患者预后.
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编辑人员丨2024/4/27
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昆虫肠道微生物及其功能研究方法进展
编辑人员丨2024/2/3
昆虫是世界上种类最为丰富、分布最为广泛的动物类群,其肠道内栖息着复杂且多样的微生物.不同昆虫因肠道结构、肠道内环境、食性、龄期、外界环境不同,肠道内微生物组成与丰度也存在差异.肠道微生物主要通过垂直方向与水平方向在种群与个体间传播,对昆虫宿主营养代谢、生理行为、防御、解毒等诸多方面有重要影响;通过体外培养的方法可从培养基对昆虫肠道微生物进行分离,用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)及16S rRNA基因测序技术等可迅速鉴定微生物;宏基因组学、蛋白质组学、代谢组学等多种组学技术联合运用,使得肠道微生物鉴定与功能推测更为高效;体外试验、微生物补充、菌群移植、沉默微生物成员相关基因等试验方法使微生物功能验证更为准确;利用高温处理、溶菌酶处理、无菌饲养处理及抗生素处理等方式能清除肠道内的微生物群落,获得无菌昆虫用于功能验证试验,但当前使用最广的抗生素法在实际应用中仍存在一定局限;利用肠道微生物特性,通过共生菌基因工程防治有害生物与虫媒传染病.目前,昆虫肠道微生物在生态、经济、能源、环保等领域发挥着重要作用,随着新兴技术的发展融合,更多昆虫-微生物互作机制将会被揭示,通过昆虫肠道微生物控制有害生物控制手段也将更为多样、环保和高效.
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编辑人员丨2024/2/3
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一起猪霍乱沙门菌和鼠伤寒沙门菌引起食源性暴发事件同源性分析
编辑人员丨2024/2/3
目的 对三亚市2022年7月15日发生一起食源性暴发事件进行同源性分析,为临床治疗和防控提供科学依据,探讨脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术和基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(ma-trix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术在沙门菌同源分析中的应用可行性.方法 通过传统的细菌检验方法、PFGE和MALDI-TOF MS技术与临床症状、流行病特征相结合,准确对食物中毒事件溯源分析.结果 本起事件中出现发热、恶心、呕吐等中毒症状共14例,均有在同一餐厅就餐经历,发病过程和临床表现相似,其中1例为该餐厅制蛋炒饭厨师.经病原学培养鉴定显示为猪霍乱沙门菌和鼠伤寒沙门菌共同引起,其中采集患者14例,检出猪霍乱沙门菌5例,鼠伤寒沙门氏菌3例,阳性率为57.14%(8/14).环境样本检出1份,食品样本2份.PFGE图谱结果显示9种PFGE型,7株菌株同源性为95.0%,4株菌株同源性为94.0%.结论 此次食物中毒原因是食用被猪霍乱沙门菌的蛋炒饭和含鼠伤寒沙门菌污染的猪肉肠.今后应加强食品污染和有害因素风险监测,从食品供应源头保证食品安全,严防食源性感染事件发生.同时规范相关人员健康体检,多渠道宣教食源性疾病危害和预防知识也至关重要.
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编辑人员丨2024/2/3
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启脾丸微生物限度检查法的研究及微生物污染情况分析
编辑人员丨2024/2/3
启脾丸是含药材原粉的中药制剂,易受到微生物污染.按现行标准检验了 10家生产企业的149批启脾丸样品,并分析结果.随后,通过探索性研究建立启脾丸的微生物限度检查方法,并采用基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)或16S rRNA基因测序技术鉴定检出的微生物,分析其微生物污染状况.结果显示,149批样品微生物限度检查结果均符合规定.建立的启脾丸微生物限度检查法为需氧菌总数1:20平皿法、霉菌和酵母菌总数计数1:10平皿法,控制菌大肠埃希菌、耐胆盐革兰阴性菌、沙门菌均采用常规法;污染菌鉴定结果中,90%为芽孢杆菌属,提示各生产企业仍需加强微生物的过程控制.
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编辑人员丨2024/2/3