耶尔森菌噬菌体是以耶尔森菌属细菌为宿主的病毒，不仅影响宿主菌的生存和进化，而且在生物量循环和能量流动中发挥重要作用。至2022年11月，美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NBCI）共上传了119株耶尔森菌噬菌体完整基因组序列。不同耶尔森菌噬菌体的基因组大小和遗传内容不同，基因组之间的相似性较低。本文综述了耶尔森菌噬菌体基因组的基本特征和基因功能，并探讨不同种耶尔森菌噬菌体基因组间的差异，以期为解释耶尔森菌噬菌体间基因功能差异及其遗传进化提供参考。

丙型肝炎病毒感染是引起病毒性肝炎、肝硬化和肝细胞癌等肝脏相关疾病的主要原因。宿主体内的抗体亲合力大小可以提示病毒感染的时间长度。本文从抗-HCV IgG亲合力检测方法学及该方法在辅助急性丙型肝炎诊断、鉴别急慢性丙型肝炎病毒感染等方面的应用研究进行综述。

目的:分析结节型肺隐球菌病（PC）患者的 18F-氟脱氧葡萄糖（FDG) PET/CT显像特点。 方法:回顾性分析2011年1月至2017年1月于福建省肿瘤医院经病理确诊的PC患者22例，其中男性17例、女性5例，年龄（54.77±7.93）岁。所有患者均行 18F-FDG PET/CT显像，分析结节的数目、大小、分布、最大标准摄取值（SUV max）及结节征象。计量资料的比较采用 t检验或 Pearson相关性分析，不同组别结节征象的差异比较采用 χ2检验、连续校正 χ2检验或 Fisher确切概率法。 结果:①22例PC患者的PET/CT显像共发现235个结节， 18F-FDG代谢增高结节130个，SUV max（3.5±2.9）与直径[（0.9±0.5） cm］呈正相关（ r=0.702， P=0.000 ）。②结节分布以右肺（57.4%，135/235）、下叶（64.3%，151/235）、肺野外带或胸膜下（80.0%，188/235）多见。③9例免疫功能受损宿主的代谢增高结节SUV max（5.7±4.7）高于13例非免疫功能受损宿主（3.0±2.0），且差异有统计学意义（ t=2.731， P=0.011）；前者（17.5%，10/57）的宽基底贴胸膜征象高于后者（6.2%，11/178），而后者（25.3%，45/178）的晕征高于前者（10.5%，6/57），差异均有统计学意义（ χ2=7.911、4.628， P=0.005、0.031）。④单个肺叶受累和多个肺叶受累的患者各为11例，前者的代谢增高结节SUV max（5.6±3.4）高于后者（3.2±2.7），且差异有统计学意义（ t=2.652， P=0.016）；前者出现分叶征、毛刺征、胸膜凹陷征的比例均高于后者，差异均有统计学意义（ χ2=32.911、47.022、17.395，均 P<0.01）。⑤误诊和正确诊断的患者各为11例，前者的代谢增高结节SUV max（5.0±4.6）高于后者（3.2±2.4），差异无统计学意义（ t=16.825， P=0.106）；分叶征、毛刺征、胸膜凹陷征出现的比例前者均高于后者，差异均有统计学意义（ χ2=9.570、35.951、5.720，均 P<0.05）；后者（26.2%，50/191）晕征的比例高于前者（2.3%，1/44），且差异有统计学意义（ χ2=12.027， P=0.000）。 结论:结节型PC患者PET/CT显像的SUV max与直径呈正相关。晕征是诊断的可靠征象。对于单个肺叶受累者，类肿瘤征象及 18F-FDG代谢增高的表现易造成误诊。

目的:了解我国呼吸学科肺隐球菌病的诊疗现状，完善对HIV阴性肺隐球菌病临床特征的认识。方法:采用前瞻性、多中心、开放性队列研究设计，通过涂片培养、抗原检测及组织病理学检查等病原学诊断方法，在22家参研单位呼吸科普通病房和呼吸重症监护室筛检肺隐球菌病，连续纳入研究期间收治的所有HIV阴性肺隐球菌病病例，采集并分析主要临床资料。结果:共入选肺隐球菌病患者457例，其中播散性感染占3.28%（15/457），病死率0.88%（4/457），主要的诊断依据为组织标本病理检查的阳性结果（74.40%，340/457）和隐球菌抗原检测的阳性结果（37.64%，172/457）。肺隐球菌病占同时期呼吸科住院患者总人数的2.04‰（457/223 748），华南地区、华东地区该比例最高；70.24%（321/457）的患者不合并任何基础疾病，87.75%（401/457）的患者无已知免疫缺陷；咳嗽、咳痰为最常见的临床症状，25.16%（115/457）的患者无任何临床症状和体征。在影像表现方面，肺内多发病变多于孤立病变，胸膜下病变多于肺门周围或内中带病变，形态上则以直径1~5 cm的中等大小结节和直径3 mm~1 cm的小结节最为常见。血清隐球菌抗原的敏感率为71.99%（203/282）， 抗原阳性患者在基础免疫状态、临床症状、影像学表现以及感染类型等方面均有别于抗原阴性患者。免疫缺陷患者在临床症状和体征、感染相关炎症指标水平、影像学特点、血清隐球菌抗原阳性率以及预后等方面有别于非免疫缺陷患者。结论:我国HIV阴性肺隐球菌病多数无合并基础疾病或免疫缺陷，总体预后良好，但临床类型多样，临床表现和影像表现复杂多变，早期诊断难度较大。

长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类转录本长度大于200个核苷酸的不具备蛋白质编码能力或仅具备有限的蛋白质编码能力的RNA分子，其广泛参与肿瘤的发生发展过程。核内小RNA宿主基因14（small nucleolar RNA host gene 14，SNHG14）是一种新发现的lncRNA，在诸多人类肿瘤中呈现异常表达，对肿瘤的增殖、侵袭转移、耐药等恶性生物学行为起到调控作用，与患者的淋巴侵袭和肿瘤大小等密切相关，并可作为预后的独立危险因素。

目的 明确89K样毒力岛(PAI)的基因组特征及其在猪链球菌致病及耐药传播方面的作用.方法 通过生物信息学方法分析89K样PAIs的基因组特征;通过接合实验比较两种89K样PAIs的转移能力;采用最小抑菌浓度法测定临床分离株及接合子的耐药谱;通过C57BL/6小鼠和斑马鱼感染模型分别评估两个临床菌株及其89K样PAIs的接合子的致病性.结果 携带89K样PAIs的猪链球菌临床菌株GX54和GX82的序列型(ST)分别为ST665和ST107.菌株GX54携带的PAI大小为75Kb,在核苷酸水平上与ST7流行型菌株携带的89K PAI具有99.21％的相似性和79.00％的覆盖率,而菌株GX82携带的PAI大小为87Kb,与89K PAI具有98.80％的相似性和86.00％的覆盖率.这两个PAIs的插入位点与89K PAI相同,均位于rplL位点,且PAIs的两端均含有一段15 bp的att序列(5'-TTATTTAAGAGTAAC-3').此外,这两个PAIs均具有完整的模块化结构,包含完整的NisK-NisR样双组分信号转导系统和Ⅳ型分泌系统(T4SS).而在SalR-SalK样双组分信号转导系统中,仅SalR基因保持完整,SalK基因发生错义突变.与89K PAI相比,本研究中的两个PAIs在基因组成上呈现出一定的差异.75K PAI插入了4个基因,包括两个假定蛋白基因和两个耐药基因tet(O)和erm(B).而87K PAI则插入了12个基因,主要涉及编码与质粒相关的重组酶和假基因,以及与耐药相关的cat、tet(L)、erm(B)基因.此外,还包括编码转座酶、拓扑异构酶等基因.菌株GX54携带的75K PAI的转移频率为4.61×10-5,显著高于菌株GX82携带的87K PAI的转移频率8.46×10-6.与受体菌P1/7RIF相比,两个89K样PAIs的接合子P1/7RIF-GX54与P1/7RIF-GX82的四环素类和大环内酯类抗生素的抗性水平,以及对斑马鱼的致病力均显著增加,且两接合子组间的致病力差异无统计学意义(P＞0.05).菌株GX54和菌株GX82感染C57BL/6小鼠后,菌株GX54感染组小鼠死亡率显著高于菌株GX82感染组(P＜0.05).攻毒8 h后,两感染组小鼠的外周血细菌载量无统计学意义(P＞0.05),但菌株GX54感染组小鼠血清中的TNF-α水平显著高于菌株GX82感染组小鼠(P＜0.05),而IL-6水平在两感染组间无统计学意义(P＞0.05).sly、mrp、epf,ofs,revS,nadR,SSU05_0473,neuB及neuC等在高致病型猪链球菌中常见的毒力基因在GX54与GX82也存在.结论 本研究首次发现了猪链球菌ST665和ST107型临床菌株携带可移动的89K样PAIs.携带不同89K样PAIs的菌株毒力水平具有显著差异,该差异与菌株在感染早期诱导宿主产生TNF-α的水平密切相关,且并非由外周血中的细菌载量差异所引起.仅以包括89K样PAIs在内的已知毒力基因存在与否做为判断猪链球菌毒力水平的方法存在不足.

附生维管植物对维持森林生态系统的生物多样性、碳储量、生态水文和养分通量有重要贡献.评估附生植物的多样性格局可以为其群落构建机制以及全球变化背景下附生植物的保护和资源利用提供依据.本文以哀牢山中山湿性常绿阔叶林1.44 ha塔吊样地中的附生维管植物为研究对象,综合分析了6种优势乔木宿主植株上附生维管植物的物种丰富度(S)、系统发育多样性(PD)、系统发育结构及其与宿主胸径、树高和物种的相关性.结果表明:哀牢山中山湿性常绿阔叶林311株优势乔木上共调查到26科44属62种附生维管植物.附生植物物种丰富度和系统发育多样性与宿主胸径和树高均呈极显著正相关(P＜0.001).标准化的系统发育多样性(SES.PD)与附生植物物种丰富度无显著相关关系,随宿主胸径的增加而显著增加(P＜0.05),随宿主树高的增加而显著减小(P＜0.05).折柄茶(Stewartia pteropetiolata)上附生植物的物种丰富度与PD极显著低于其他宿主物种(P＜0.001),但6种宿主物种上附生植物的SES.PD无显著差异(P＞0.05).变色锥(Castanopsis wattii)和多花含笑(Michelia floribunda)上的附生植物系统发育结构呈发散状态,木果柯(Lithocarpus xylocarpus)和折柄茶上的附生植物系统发育结构呈聚集状态,其余宿主上的附生植物系统发育结构不明显.综上所述,宿主特征包括宿主大小和物种的差异是维持附生维管植物多样性格局的关键,这一结果可为今后从多维度、多角度解析附生维管植物多样性的格局及其维持机制奠定坚实基础.

寄生感染能够通过调节宿主种群的种间竞争关系影响种群动态,进而干扰整个竞争群落的稳定性与物种多样性.通过构建寄生物种干扰下的循环竞争系统,探讨不同时间尺度上的种群动态与物种续存对寄生特征的响应机制.模拟结果显示,寄生物种的入侵是影响循环竞争系统不稳定性的重要驱动因素之一.首先,寄生的入侵能够显著改变种群周期振荡模式,导致寄生调节的竞争系统在大时间尺度上呈现群落水平上的周期振荡,小时间尺度上呈现单种群的周期振荡.同时,种群生物量的时间序列自相关性和偏自相关性分析显示,大时间尺度上的群落周期振荡和小时间尺度上的种群周期振荡动态均是平稳的时间序列.其次,寄生入侵可导致阶段性平衡动态下的两物种灭绝,续存单物种的周期振荡动态,而局部稳定状态下,寄生入侵可引起循环竞争系统中三物种呈现完全一致的周期性振荡.同时,寄生循环竞争系统在达到平稳的过程中,产生生态系统中的瞬时动态行为,即两种动力学行为上突然转变的现象.此外,寄生物种的三个主要特征参数(传播率,脱落率以及致死率)均被证实能够改变大时间尺度或小时间尺度上的周期大小以及对应的物种丰富度.总之,寄生物种的入侵能够显著地改变竞争群落的稳定性与物种多样性,具有一定的研究意义.

目的 探究卵巢癌(ovarian cancer)患者血清长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)小核仁RNA宿主基因 11(small nucleolar RNA host gene 11,SNHG11)和缺氧诱导因子 1α(hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)表达与组织血管生成拟态(vasculogenic mimicry,VM)的关系.方法 以 2019 年 10 月～2023 年 1 月于唐山市妇幼保健院收治的116例卵巢癌患者为研究对象,根据是否形成VM将卵巢癌患者分为VM组(n=51)和无VM组(n=65),另选取同期进行健康体检者50例为对照组.采用实时荧光定量PCR法(real-time quantitative PCR,qPCR)检测卵巢癌患者及对照组血清LncRNA SNHG11和HIF-1α表达水平;Spearman相关性分析LncRNA SNHG11,HIF-1α与VM形成之间的关系;通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析LncRNA SNHG11,HIF-1α及联合检测对卵巢癌患者形成VM的诊断价值.结果 与对照组相比,卵巢癌患者VM组和无VM组血清LncRNA SNHG11(3.01±0.88,2.21±0.68 vs 12±0.35),HIF-1α(2.16±0.67,1.60±0.44 vs 1.01±0.31)水平均显著升高(t=12.136,9.006;19.890,16.591),且VM组患者血清LncRNA SNHG11,HIF-1α水平均显著高于无VM组(t=8.957,8.595),差异有统计学意义(均P＜0.05);LncRNA SNHG11,HIF-1α表达及VM的形成与年龄、组织类型无关(t=1.036,0.976,0.218;1.254,1.390,0.368,均P＞0.05),而与肿瘤大小、FIGO分期、淋巴结转移及病理分级有关(t=5.351,5.186,13.264;5.465,5.227,10.898;6.063,6.016,5.374;4.030,5.871,5.509,均P＜0.05);Spearman相关性分析显示,LncRNA SNHG11,HIF-1α与VM的生成均呈显著正相关(r=0.560,0.494,均P＜0.05);ROC曲线结果显示,血清LncRNA SNHG11,HIF-1α单独诊断卵巢癌患者形成VM的曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.860,0.824,其敏感度分别为80.4%,75.6%,特异度分别为58.9%,51.9%;两者联合诊断卵巢癌患者形成VM的AUC为0.941,其敏感度、特异度分别为 92.2%,79.9%.结论 LncRNA SNHG11 和HIF-1α的异常表达与卵巢癌患者形成VM密切相关,两者可作为潜在判断VM的生物学指标.

[背景]人源诺如病毒是急性胃肠炎暴发的主要原因,GII.4 是过去几十年的主要流行基因型.2014/2015 年出现的GII.17 型变异株是中国首例导致大规模暴发的非GII.4 流行株.通过对来自华南地区的诺如病毒GII.17 型毒株的完整基因组序列进行分析,证实了该GII.17 型突变株与先前确定的GII型变异株不同.[目的]制备广州地区GII.17 型诺如病毒GZ-L343 的病毒样颗粒,并系统表征其免疫原性及功能特性.[方法]借助杆状病毒表达系统制备GII.17-GZ-L343 的病毒样颗粒,并通过氯化铯梯度超速离心对其进行纯化,制备抗血清并对其免疫功能进行评价.[结果]聚丙烯酰胺凝胶电泳和蛋白质免疫印迹结果表明所得蛋白分子量大小约为 58 kDa;透射电镜结果表明病毒样颗粒直径约为 30 nm;酶联免疫吸附测定结果显示该病毒样颗粒具有较好的免疫原性;唾液组织血型抗原的体外受体结合测定表明,该病毒样颗粒与部分A型、B型、O型及AB型分泌及非分泌血型样本存在阳性结合;效价测定结果表明免疫所得血清效价在 104 以上;交叉反应结果表明该抗血清与异型病毒样颗粒不存在交叉反应.此外,体外阻断结果表明,该抗血清仅能阻断相应型别病毒样颗粒与受体的结合作用,与异型病毒样颗粒不存在交叉阻断.[结论]GII.17-GZ-L343 具有广泛的结合谱,其抗血清对异型病毒样颗粒不具有广谱性,且只对同型病毒样颗粒存在阻断作用,结果将为进一步揭示该病毒的宿主适应特性、进化机制及研发多价疫苗提供理论支持.