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无鼾男性唾液蛋白昼夜差异的研究
编辑人员丨3天前
目的:阻塞性睡眠呼吸暂停(obstructive sleep apnea and hypopnea syndrome, OSAHS)是一种睡眠疾病,对体内代谢有多方面的影响,生物标志物研究成为热点和方向。但是很多蛋白表达本身存在昼夜变化,本研究拟对早晚采样时间点蛋白差异变化进行探索性研究。方法:研究对象是经整夜睡眠监测确定为非OSAHS的无鼾成年男性28例。采集整夜睡眠监测前后的早晚唾液样本。每份唾液样本中都加入内参蛋白(牛胎球蛋白和酿酒酵母乙醇脱氢酶),同步进行平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM),通过靶向蛋白质组学方法定量分析98种与OSAHS相关的唾液蛋白。结果:唾液蛋白的个体差异较大,总计平均变异系数为95.9%,其95%置信区间为(84.7%,107.2%)。以差异倍数>2倍且 P<0.05的标准筛选早晚差异表达蛋白,得到早晨表达上调蛋白有13个,未见下调蛋白,表达无差异蛋白72个。无表达差异蛋白主要为细胞骨架蛋白及相关结合蛋白、氧化应激相关蛋白、免疫炎症相关蛋白和代谢相关蛋白等。表达差异蛋白功能涉及方面较广,包括机体免疫、血管生成、物质与能量代谢、神经发育和钙离子结合等。 结论:本研究发现部分唾液蛋白存在早晚明显差异,提示无鼾正常男性部分唾液蛋白的昼夜节律性变化。研究OSAHS患者生物标志物时,应考虑部分唾液蛋白固有的昼夜节律特性,规定时间段采样,并推荐早晚都进行采样。
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编辑人员丨3天前
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抗病毒颗粒治疗流行性感冒有效性和安全性的多中心随机对照研究
编辑人员丨3天前
目的:观察抗病毒颗粒治疗流行性感冒的有效性及安全性。方法:采用多中心、随机、双盲双模拟、阳性药平行对照试验设计,在中国27家三级甲等医院筛选流行性感冒患者,按1∶1随机分配至抗病毒颗粒试验组或磷酸奥司他韦胶囊对照组,每组计划入组受试者200例。试验组给予抗病毒颗粒(每次18 g,每日3次)及磷酸奥司他韦模拟剂口服,对照组给予磷酸奥司他韦胶囊(每次75 mg,每日2次)及抗病毒颗粒模拟剂口服,疗程均为5 d。主要疗效指标包括临床主要症状缓解时间和完全退热时间。次要疗效指标包括对乙酰氨基酚使用剂量、中医证候积分改变、其他重要临床症状缓解时间。对比抗病毒颗粒试验组和磷酸奥司他韦对照组疗效指标差异,同时监测不良事件或不良反应评估抗病毒颗粒的安全性。结果:共入组受试者393例,抗病毒颗粒试验组195例,完成试验191例(97.95%)。磷酸奥司他韦对照组198例,完成试验195例(98.48%),两组脱落率和剔除率差异无统计学意义( P>0.05)。全分析数据集(FAS)中试验组年龄(34.9±14.4)岁,男性83例(42.78%);对照组年龄(33.3±13.5)岁,男性78例(39.59%)。两组受试者人口学资料、体格检查、病毒病原学检测、基线中医证候总分及各单项症状评分等比较差异均无统计学意义( P>0.05)。FAS中试验组临床主要症状缓解时间 M( Q1, Q3)为3.0(3.0,4.0) d,对照组为3.0(3.0,4.0)d,差异无统计学意义( P>0.05)。完全退热时间 M( Q1, Q3)试验组为34.0(20.3,49.0) h,对照组为36.5(19.6,48.8) h,差异无统计学意义( P>0.05)。抗病毒颗粒在对乙酰氨基酚使用剂量、中医证候疗效、多数重要临床症状消失率等方面与磷酸奥司他韦胶囊疗效相当( P>0.05),且抗病毒颗粒组第3天的头昏、胸闷症状消失率优于磷酸奥司他韦胶囊组( P<0.05)。 结论:抗病毒颗粒治疗流行性感冒疗效与磷酸奥司他韦胶囊相当,且药物安全性良好。
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编辑人员丨3天前
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大承气汤能够通过调节肠道微生物群抑制轻症急性胰腺炎患者炎症反应并促进胃肠功能恢复
编辑人员丨3天前
目的:探讨大承气汤对轻症急性胰腺炎(MAP)患者的疗效及其治疗机制。方法:采用平行分组随机对照研究方法,选择2018年3月至2021年2月上海市中西医结合医院收治的68例急性胰腺炎(AP)患者。结合患者入院时病情及是否同意使用大承气汤,按照1∶1等量随机原则分为常规治疗组和大承气汤组;同时招募20例健康志愿者作为对照。两组患者均予以奥曲肽+禁食、胃肠减压、解热镇痛、抗炎、抑制胃酸和胰液分泌、维持电解质平衡等常规西医治疗;大承气汤组在常规治疗基础上口服大承气汤,每次100 mL,每日2次,连续观察7 d。记录患者治疗前后炎症指标〔白细胞计数(WBC)、C-反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、白细胞介素-6(IL-6)〕和胃肠功能恢复时间(首次排气时间、恢复肠鸣音时间、首次排便时间),并对粪便样本进行16S rRNA基因测序,对经质量控制等相关处理后获得的归一化数据进行多样性分析(Alpha多样性和Beta多样性)及线性判别分析效应量分析(LEfSe分析),观察MAP患者肠道微生物区系变化;采用Spearman等级相关系数分析炎症指标与肠道属水平微生物的相关性。治疗期间监测MAP患者血、尿、粪三大常规及肾功能和心电图,以评估安全性。结果:68例AP患者中,排除中重症AP患者16例、未收集到标本或自动放弃治疗患者4例,最终48例MAP患者纳入分析,常规治疗组和大承气汤组各24例。两组治疗7 d炎症指标均较治疗前明显降低,其中大承气汤组CRP、PCT、IL-6水平显著低于常规治疗组〔CRP(mg/L):8.50(3.50,13.00)比16.00(9.25,29.75),PCT(μg/L):0.06(0.03,0.08)比0.09(0.05,0.11),IL-6(ng/L):6.36(3.96,10.79)比13.24(6.69,18.87),均 P<0.05〕;且大承气汤组胃肠功能恢复时间也较常规治疗组明显缩短〔首次排气时间(d):1.62±0.65比2.80±0.65,恢复肠鸣音时间(d):1.13±0.58比2.31±0.76,首次排便时间(d):3.12±0.75比4.39±0.76,均 P<0.05〕。肠道菌群多样性分析显示,无论是微生物群落的多样性还是丰富度,健康对照组均最高,常规治疗组均最低;且健康对照者微生物群落与MAP患者的重合度均较小,而不同治疗方法间MAP患者的重合度相对较大。LEfSe分析显示,大承气汤降低了大肠埃希菌-志贺菌属和丹毒梭状芽孢杆菌属的相对丰度,同时提高了乳杆菌属、罗姆布茨菌属、布劳特菌属3个有益菌属的相对丰度;在MAP患者肠道中,黏液乳杆菌属和联合乳杆菌属均明显富集。相关性分析显示,大肠埃希菌-志贺菌属与WBC、CRP、PCT、IL-6这4个炎症指标均呈显著正相关( r值分别为0.31、0.41、0.57、0.43,均 P<0.05);其他菌属与炎症指标无明显相关性。治疗过程中,MAP患者血、尿、粪三大常规及肾功能和心电图指标均未见明显异常。 结论:大承气汤可通过调节MAP患者肠道微生物区系的组成,抑制炎症反应,促进肠道微生态平衡和胃肠功能恢复,改善肠道屏障功能;治疗期间未出现明显的不良反应。
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编辑人员丨3天前
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原发性急性闭角型青光眼患者房水蛋白质组学分析
编辑人员丨3天前
目的::探究不同眼压的原发性急性闭角型青光眼(PAACG)患者房水蛋白的差异性表达,寻找青光眼性视神经损伤的可能机制,为青光眼性视神经保护的可能作用靶点提供实验依据。方法::病例对照研究。通过简单随机抽样选取2019年3月至2020年9月期间于吉林大学第二医院眼科中心入院治疗的PAACG患者共88例(88眼)。根据PAACG患者的眼压将88个选定的样本分为2组:A组36个样本,眼压≥50 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa);B组52个样本,眼压≤21 mmHg。以上样本被分为2个队列:发现队列(A组26个样本;B组37个样本)和验证队列(A组10个样本;B组15个样本)。分别通过数据独立采集(DIA)方法和平行反应监测(PRM)方法分析房水蛋白。采用独立样本 t检验分析蛋白表达差异。 结果::本研究从发现队列的A、B组中63个房水样本中共检测出636个蛋白,去除默认蛋白后得到506个蛋白用于后续分析,其中51个蛋白在发现队列A、B组间差异有统计学意义( P=0.020)。在这51个差异蛋白中,A组存在17个蛋白表达上调,B组存在34个蛋白表达上调。抽取上述51个差异蛋白中APOA2、TIMP1、LRP2和VASN进行PRM验证,结果显示这4个差异蛋白在发现队列及验证队列中保持一致。 结论::PAACG患者房水中差异蛋白的表达与炎症反应以及小梁网细胞外基质重塑、神经损伤相关,可能是导致青光眼患者眼压升高以及视神经损伤的重要原因。
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编辑人员丨3天前
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先天性肾盂输尿管连接部狭窄的比较蛋白质组学研究
编辑人员丨3天前
目的:对先天性肾盂输尿管连接部(ureteropelvic junction,UPJ)狭窄患儿狭窄段输尿管组织与邻近正常输尿管组织进行比较蛋白质组学研究,探索先天性UPJ狭窄的可能病因及发病机制。方法:以厦门大学附属第一医院收治的30例先天性UPJ狭窄并在本院行Anderson-Hynes术的患儿为研究对象,标本离体后立即取狭窄段输尿管组织(A组, n=30)及与狭窄段远端邻近的正常输尿管组织(B组, n=30)。采用基于串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)标记的高通量蛋白质组相对定量方法对两组中的差异蛋白进行高通量筛选,随后对筛选出的差异蛋白进行平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)的靶向蛋白质组学定量验证,利用生物信息学方法对差异蛋白进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注释的富集分析,并对蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络进行分析。 结果:两组标本共鉴定出蛋白质6 093种,包含差异蛋白160种,其中表达上调的65种,表达下调的95种。进行PRM相对定量分析的9种目标蛋白中,碳酸酐酶1等7种蛋白质在A组与B组的蛋白含量比值,在PRM和TMT的定量结果中均小于1;磷脂酰肌醇蛋白聚糖-6和具有多重剪接的RNA结合蛋白在A组与B组的蛋白含量比值,在PRM和TMT的定量结果中均大于1。GO功能富集分析发现,两组中差异表达蛋白质在体液免疫反应、抗微生物体液反应、对真菌的反应、对真菌的防御反应和对细菌的防御反应等生物学过程的GO功能富集度具有高的显著性水平( P<0.05)。KEGG通路富集分析结果表明,氮代谢、PPAR信号通路等20条信号通路富集度具有高的显著性水平( P<0.05)。在PPI网络中,连接度最高的蛋白质是:中性粒细胞弹性蛋白酶(连接度为9)和组织蛋白酶抑制素抗菌肽(连接度为8)。 结论:比较蛋白质组学研究结果提示,先天性UPJ狭窄的发病与微生物感染相关,这为进一步研究先天性UPJ狭窄的病因及发病机制提供了参考。
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编辑人员丨3天前
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恩格列净对2型糖尿病合并高血压患者血压变异性和左心室质量指数的影响
编辑人员丨3天前
目的:探讨恩格列净对2型糖尿病(T2DM)合并高血压患者血压变异性(BPV)和左心室质量指数(LVMI)的影响。方法:采用前瞻性平行对照研究设计,选取2020年10月至2021年4月在安徽医科大学第二附属医院内分泌科住院的90例血糖控制欠佳的T2DM合并高血压患者作为研究对象,均为使用1种或以上降糖药物血糖仍未达标者。采用随机数字表法将患者分为对照组和恩格列净组,对照组调整原有降糖药物剂量或加用其他降糖药物(除外钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂和胰高糖素样肽-1受体激动剂),恩格列净组维持原有降糖方案加用恩格列净(10 mg/d),连续观察48周。收集患者治疗前后的体重指数(BMI)、收缩压(SBP)、舒张压(DBP)等临床资料。检测空腹血糖(FPG)、餐后2 h血糖(2hPG)、糖化血红蛋白(HbA 1c)以及血脂。使用24 h动态血压监测仪监测24hDBP、日间SBP(dSBP)、日间DBP(dDBP)、24 h SBP标准差(24hSBPSD)等BPV指标。通过超声心动图测量左心室内径(LVDd)、室间隔厚度(IVS)等指标,并计算LVMI。观察治疗过程中不良反应等情况。采用 t检验、 χ2检验、非参数检验对各组间指标的差异进行比较。 结果:90例患者中,恩格列净组有2例因经济因素退出研究、3例失访,对照组中5例失访,最终各组均有40例患者顺利完成随访观察。基线状态下,两组患者年龄、性别、BMI、糖尿病病程、LVMI、BPV差异无统计学意义( P>0.05)。与治疗前比较,治疗48周后,恩格列净组FPG、HbA 1c、BMI、LVMI、24hSBP、24hDBP、dSBP、dDBP水平[分别为(5.78±0.84)和(7.96±1.45)mmol/L、(6.30±0.72)%和(9.06±1.76)%、(24.39±2.52)和(26.97±2.71)kg/m 2、(80.80±10.78)和(92.96±11.19)g/m 2、(125±7)和(132±12)mmHg(1 mmHg=0.133 kPa)、(78±11)和(81±10)mmHg、(123±7)和(131±11)mmHg、(79±12)和(83±10)mmHg]均降低,杓型血压占比增高[分别为10.0%(4/40)和35.0%(14/40)],差异均具有统计学意义( P<0.05)。与对照组治疗48周后相比,恩格列净组治疗后BMI、DBP、HbA 1c、FPG、2hPG、甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇、LVDd、IVS、dSBP、24hSBPSD均显著降低,差异具有统计学意义( P<0.05)。两组不良反应比较差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:恩格列净可显著降低T2DM合并高血压患者的LVMI,改善血压昼夜节律,显著降低血压、BMI、血糖、血脂,且不增加低血糖等不良反应。
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编辑人员丨3天前
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血清外泌体Annexin A11检测方法学构建及其在胰腺癌中的临床应用
编辑人员丨3天前
目的:探讨胰腺癌(PC)血清外泌体人膜联蛋白A11(ANXA11)的检测方法,初步评估ANXA11在PC中的临床应用价值。方法:选择2016年12月至2019年7月南通大学附属医院确诊为PC、胰腺良性占位、胰腺炎患者的血清标本分别70例、15例、70例,选取同期健康体检者70名作为对照组。利用基于高分辨率、高精度质谱仪的平行反应监测(PRM)方法检测血清外泌体及无外泌体血清中ANXA11蛋白丰度。自建检测人血清外泌体ANXA11的点免疫印迹法(dot immunoblotting)并进行方法学评价;分析所有受试者血清外泌体ANXA11的水平;采用受试者工作特征(ROC)曲线的曲线下面积(AUC)评价ANXA11、糖类抗原19-9(CA19-9)、癌胚抗原(CEA)对PC的诊断效能;分析ANXA11与PC患者临床病理参数、疗效及预后生存期的关系。两组间比较采用Mann-Whitney U检验,四组间比较采用Kruskal-Wallis检验。 结果:自建的点免疫印迹法检测血清外泌体ANXA11具有较高的敏感度和重复性。利用构建的方法检测研究对象发现ANXA11在PC组升高最明显,与其余三组比较,差异有统计学意义( Hc=58.079, P<0.01)。ROC曲线表明,ANXA11(AUC=0.836)对PC的诊断效能高于CEA(AUC=0.656),与CA19-9(AUC=0.870)相当,联合CA19-9可提高诊断PC的敏感度,且保持较高的特异度。PC患者治疗前血清外泌体ANXA11水平与年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤生长部位、淋巴结转移、远处转移及TNM分期均无关( Z值分别为0.052、-0.285、-0.402、0.324、0.888、0.658、1.734, P均>0.05),且PC患者术后第10天血清外泌体ANXA11水平与术前相比,差异无统计学意义( Z=-1.569, P=0.12)。PC患者生存时间与是否存在淋巴结转移、远处转移、TNM分期及治疗方式有关(χ 2分别为9.354、6.086、9.389、16.998, P均<0.05),而与ANXA11、CA19-9及CEA等无相关性(χ 2分别为1.516、0.011、0.159, P均>0.05)。 结论:本研究成功建立了检测人血清外泌体ANXA11的方法。血清外泌体ANXA11联合CA19-9可提高PC诊断敏感度。
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编辑人员丨3天前
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床旁超声测量胃窦横截面积评估大承气汤治疗脓毒症胃肠功能障碍的临床研究
编辑人员丨3天前
目的:探讨床旁超声测量胃窦横截面积(CSA)评估大承气汤治疗脓毒症胃肠功能障碍的临床价值。方法:采用平行分组随机对照研究方法,选择南京中医药大学第二附属医院急危重症医学科2021年1月至2022年10月收治的80例脓毒症合并胃肠功能障碍的患者作为研究对象,根据患者入院后是否同意使用大承气汤,按照1∶1等量随机原则分为大承气汤组(观察组)和常规治疗组(对照组),每组40例。两组患者均给予液体复苏、抗感染、维持呼吸循环稳定、早期滋养型喂养、促进胃肠道动力、调节肠道菌群等处理。观察组在西医常规治疗的基础上联合大承气汤口服治疗,30 mL浓煎剂早晚分服。两组疗程均为7 d。分别于治疗前及治疗后采用床旁超声测量两组患者的CSA,分别用公式、传统胃管回抽方式计算胃残余量(GRV1、GRV2),并检测患者胃肠功能障碍评分、急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHEⅡ)、腹腔内压(IAP)、血清前蛋白(PA)、白蛋白(Alb)、白细胞计数(WBC)、降钙素原(PCT)、超敏C-反应蛋白(hs-CRP)、重症监护病房(ICU)住院时间及误吸发生率,评估大承气汤的临床疗效,并对比分析床旁超声测量CSA与脓毒症胃肠道功能障碍的其他评价指标的相关性及优劣性。结果:两组患者治疗前各指标差异均无统计学意义,具有可比性。与治疗前比较,两组患者治疗后CSA、GRV、胃肠功能障碍评分、APACHEⅡ评分、IAP、WBC、PCT、hs-CRP均明显下降,PA、Alb明显升高,且观察组治疗后各指标下降或升高均较对照组更为显著〔CSA(cm 2):4.53±1.56比6.04±2.52,GRV1(mL):39.85±8.21比53.05±11.73,GRV2(mL):29.22±5.20比40.91±8.97,胃肠功能障碍评分(分):0.87±0.19比1.35±0.26,APACHEⅡ评分(分):11.54±3.43比14.28±3.07,IAP(cmH 2O,1 cmH 2O≈0.098 kPa):9.79±2.01比13.30±2.73,WBC(×10 9/L):9.35±1.24比12.35±1.36,PCT(μg/L):3.68±1.12比6.43±1.45,hs-CRP(mg/L):24.76±5.41比46.76±6.38,PA(mg/L):370.29±45.89比258.33±34.58,Alb(g/L):38.83±5.64比33.20±4.98,均 P<0.05〕。观察组患者ICU住院时间较对照组明显缩短(d:10.56±3.19比14.24±3.45, P<0.05),误吸发生率较对照组明显降低(12.5%比25.0%, P<0.05)。相关性分析显示,床旁超声测量CSA与GRV2、胃肠功能障碍评分、APACHEⅡ评分、IAP呈正相关( r值分别为0.84、0.78、0.75、0.72,均 P<0.01),与PA、Alb呈负相关( r值分别为-0.64、-0.62,均 P<0.01)。 结论:大承气汤能够显著改善脓毒症胃肠功能障碍患者的临床症状,减轻全身炎症反应,提高营养状态,缩短ICU住院时间;床旁超声监测CSA是一种简便、精确、有效地评估胃肠功能障碍的手段,值得临床进一步推广。
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编辑人员丨3天前
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基于蛋白质组学探讨电针治疗血管性痴呆的作用机制
编辑人员丨2024/7/27
目的:基于串联质谱标签(TMT)定量蛋白质组学技术,探讨电针治疗血管性痴呆(VD)的可能作用机制.方法:选用SPF级雄性SD大鼠 80 只,采用Morris水迷宫实验筛选出符合标准的78只SD大鼠,将其随机分为假手术组(18 只)和手术组(60 只).手术组采用四血管阻断(4-VO)法复制VD模型,将造模成功的 36 只大鼠随机分为模型组(18 只)和电针组(18 只).每组进一步按干预时间分为 3 个亚组,每亚组 6 只.造模后7 d对电针组大鼠行电针干预,穴取左右"四神聪"和双侧"风池",予连续波,频率2 Hz,电流强度1 mA,每日1次,每次30 min,3个亚组分别干预7、14、21 d.采用Morris水迷宫实验于干预前后评估大鼠学习记忆能力,并选择干预后学习记忆能力最优的电针组亚组及相应假手术组、模型组亚组进行蛋白质组学检测,鉴定电针干预VD相关差异表达蛋白并进行生物信息学分析,采用平行反应监测(PRM)技术和Western blot法验证差异表达的目标蛋白.结果:与假手术组比较,模型组大鼠逃避潜伏期延长、穿越原平台次数减少(P<0.01);与模型组比较,电针组大鼠干预 7、14、21 d逃避潜伏期缩短、穿越原平台次数增加(P<0.01,P<0.05).与干预 7、14 d比较,电针组大鼠干预21 d逃避潜伏期缩短、穿越原平台次数增加(P<0.01,P<0.05),选择该亚组进行后续蛋白质组学检测、PRM分析及Western blot验证.与假手术组比较,模型组大鼠差异表达蛋白有71种,其中上调的有50种,下调的有21种;与模型组比较,电针组大鼠差异表达蛋白有54种,其中上调的有30种,下调的有24种.功能富集分析、聚类分析发现,差异表达蛋白主要与细胞过程、代谢过程、吞噬识别、免疫反应、细胞外基质组织的调节等生物过程有关.在哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路及神经营养因子信号通路中均富集到了糖原合成酶激酶3β(GSK3β)和丝裂原活化蛋白激酶激酶2(Map2k2)蛋白,PRM分析和Western blot验证与蛋白质组学分析结果一致,即与模型组比较,电针组大鼠海马GSK3β和Map2k2蛋白表达升高(P<0.01,P<0.05).结论:电针"四神聪""风池"可改善VD大鼠认知功能,其作用机制涉及多靶点、多通路,可能与GSK3β、Map2k2蛋白及mTOR、神经营养因子信号通路相关.
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编辑人员丨2024/7/27
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CPB2为晚期肺腺癌EGFR-T790M耐药基因突变的潜在生物标志物
编辑人员丨2024/7/6
目的 通过平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)定量蛋白组学技术验证晚期肺腺癌患者表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)-T790M耐药突变的生物标志物.方法 纳入2018年1月至2018年12月就诊于新疆医科大学附属肿瘤医院的口服EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)吉非替尼的具有EGFR 19del或EGFR 21 L858R基因突变的晚期肺腺癌患者44例.在患者疾病进展后行组织活检,使用下一代测序(next generation sequencing,NGS)方法检测出EGFR-T790M突变患者24例,非EGFR-T790M突变20例.提取44例患者的血清蛋白,通过SDS-PADE进行质量评估,两组分别得到10例质量合格血清蛋白样本.质量合格的血清蛋白样品分别进行丝氨酸蛋白酶酶解,通过 PRM 方法进行纳米液相色谱-串联质谱分析法(nanometer liquid chromatography-tandem mass spectrometry,nanoLC-MS/MS)检测.运行Skyline软件进行数据分析,得出与EGFR-T790M突变相关的差异表达蛋白.将基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库的各节点映射,进行功能富集分析,并利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库提供的绘图模块进行差异表达蛋白表达含量渲染,采用STRING数据库构建差异表达蛋白的蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,寻找关键差异表达蛋白.结果 通过PRM方法确定14种与晚期肺腺癌EGFR-T790M突变相关的差异表达蛋白.GO富集分析显示,这些差异表达蛋白在参与细胞组分方面,主要构成细胞外区域的部分;在发挥的分子功能方面,主要为抗原结合、作用于L氨基酸肽的肽酶活性和免疫球蛋白受体结合.KEGG富集通路分析显示,补体和凝血级联反应差异表达蛋白富集指数最高.该通路上的差异蛋白为凝血因子X(coagulation factor X,F10)、F9、纤溶酶原(plasminogen,PLG)和羧肽酶B2(carboxypeptidase B2,CPB2).其中F10为上调蛋白,其余为下调蛋白.PPI网络构建分析显示,CBP2为差异表达蛋白中的关键节点.结论 CBP2是晚期肺腺癌EGFR-T790M耐药突变发生的潜在生物标志物.
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编辑人员丨2024/7/6
