目的:建立水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus，VZV)的重组酶等温扩增(recombinase-aid amplification，RAA)快速检测方法。方法:通过全球共享数据库下载VZV全基因组序列进行比对分析，针对四个保守基因分别设计特异性引物与探针并筛选出最佳组合，通过引物与探针浓度梯度筛选出最佳反应体系，建立荧光型RAA检测方法。用VZV阳性质粒标准品与梯度稀释的临床样本评价方法的灵敏度，以最低检出极限浓度的阳性质粒标准品进行重复实验评价方法的重复性，以其他病毒核酸评价方法的特异性，同时用本方法和荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time PCR，qPCR)对临床样本进行检测并对检测结果进行比较。结果:本方法筛选出针对开放阅读框架(open reading frame，ORF)28基因的引物对F2/R2与探针P2为最佳组合；考虑到成本因素，最佳引物浓度为500 nmol/L，最佳探针浓度为280 nmol/L；最低检出极限为10 1拷贝/μL，最低可检测到Ct值为36.027的临床阳性样本；重复实验的检测结果一致；该方法与其他病毒核酸无交叉反应；临床阳性样本的检出率为93.33%，与qPCR检测结果几乎完全一致。 结论:本方法操作简便、灵敏度高、特异性强、对实验条件要求低、检测结果直观可视，在20 min内就能够检测出样本中的VZV核酸，是一种可以被临床检测考虑的VZV快速检测方法。

目的:验证脓毒症中特异分化的单核细胞亚群，并筛选及构建用于早期诊断脓毒症的单核细胞差异基因集。方法:选择广东省人民医院2020年6月至2021年3月收治的脓毒症患者，提取外周血单个核细胞（PBMC），应用单细胞测序技术和拟时序分析对单核细胞差异亚群进行验证。利用生物信息学手段分析差异亚群中的基因表达，并筛选出差异基因用于初步构建候选差异基因集。利用数字聚合酶链反应（PCR）技术分别在脓毒症患者PBMC以及脓毒症人髓系白血病单核细胞株（THP-1）模型中对候选差异基因进行验证，并利用韦恩图构建最终的单核细胞差异基因集。使用基因表达数据库（GEO）对差异基因集进行外部数据验证。结果:①细胞注释及拟时序分析结果显示，NEAT1 +CD163 +单核细胞的分化明显区别于其他亚群，并在脓毒症早期就已经出现，是脓毒症病理过程中的特征亚群。②从NEAT1 +CD163 +单核细胞的基因表达中筛选出22个与脓毒症相关的差异基因，经过数字PCR进一步验证后，最终筛选出碱性亮氨酸拉链ATF样转录因子（BATF）、原癌基因JUNB、癌胚抗原相关细胞黏附分子4（CEACAM4）、第9号染色体上95开放阅读框（C9orf95）、G蛋白α亚基15（GNA15）、补体C3A受体1（C3AR1）、转录生长因子β1（TGFB1）、线粒体载体同源物1（MTCH1）8个基因，用于构建最终的单核细胞差异基因集。③外部验证结果显示，由于C9orf95基因在GEO数据库的GSE154918及GSE133822两个数据集中均无数据，因此在验证时将其排除。在GSE154918数据集，单核细胞差异基因集中BATF、JUNB、CEACAM4、GNA15、C3AR1、TGFB1、MTCH1的表达在脓毒症组均较健康对照组明显升高（log 2表达量：BATF为12.78±0.08比11.39±0.35，JUNB为16.88±0.07比16.04±0.03，CEACAM4为14.73±0.08比13.77±0.05，GNA15为13.16±0.06比12.30±0.04，C3AR1为14.62±0.13比12.87±0.05，TGFB1为16.95±0.05比16.57±0.36，MTCH1为14.80±0.02比14.61±0.15，均 P<0.05）；在GSE133822数据集，基因集中BATF、CEACAM4、GNA15、C3AR1的表达在脓毒症组明显高于健康对照组（log 2表达量：BATF为8.66±0.16比7.92±0.14，CEACAM4为9.20±0.16比8.36±0.20，GNA15为10.66±0.18比10.13±0.16，C3AR1为11.49±0.27比10.48±0.16，均 P<0.05），而JUNB、TGFB1、MTCH1的表达在两组人群中差异无统计学意义。基因集差异分析（GSVA）显示，在GSE154918及GSE133822两个数据集中，脓毒症组单核细胞差异基因集的富集分数均显著高于健康对照组（GSE154918：0.38±0.04比-0.44±0.02，GSE133822：0.56±0.02比0.20±0.05，均 P<0.01）。受试者工作特征曲线（ROC曲线）分析显示，单核细胞差异基因集在GSE154918及GSE133822两个数据集中对脓毒症早期诊断的ROC曲线下面积（AUC）及95%可信区间（95% CI）分别为0.993（0.980～1.000）和0.944（0.873～1.000），提示其具有可靠的诊断价值。 结论:通过单细胞测序技术及数字PCR技术筛选得到的BATF、JUNB、CEACAM4、GNA15、C3AR1、TGFB1、MTCH1单核细胞差异基因集对脓毒症患者具有良好的早期诊断效能，或许能够为早期诊断脓毒症提供新思路。

目的:观察19号染色体开放阅读框5（C19ORF5）调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法:选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织，采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶链反应法检测C19ORF5蛋白和mRNA的表达情况，探讨C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的相关性。141例患者均行术后化疗，91例采用常规化疗方案（卡培他滨联合奥沙利铂，常规化疗组），50例采用常规方案联合紫杉醇化疗（紫杉醇组），两组均治疗6个疗程。结果:癌组织在透射电镜下可见自噬体，C19ORF5蛋白为淡黄色至棕褐色颗粒，表达于细胞质；癌组织C19ORF5蛋白染色强度明显强于正常组织，且Ⅱ期染色强度明显高于Ⅳ期。Ⅰ~Ⅱ期患者C19ORF5蛋白高表达率明显高于Ⅲ~Ⅳ期患者[83.3%（25/30）比17.1%（19/111）]，差异有统计学意义（ P<0.01）。癌组织C19ORF5 mRNA表达水平明显高于正常组织（1.17 ± 0.45比0.82 ± 0.29），差异有统计学意义（ P<0.05）。癌组织C19ORF5蛋白表达水平与肿瘤分期、癌胚抗原和肝转移有关（ P<0.01或<0.05），癌组织C19ORF5蛋白表达水平与淋巴结转移无关（ P>0.05）。常规化疗组91例患者中，有效70例（76.9%），无效21例（23.1%）；紫杉醇组50例患者中，有效42例（84.0%），无效8例（16.0%），两组有效率比较差异无统计学意义（ P>0.05）。在常规化疗组中，有效患者和无效患者化疗前癌组织与化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异均无统计学意义（ P>0.05）；有效患者与无效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异无统计学意义（ P>0.05）。在紫杉醇组中，有效患者化疗前癌组织C19ORF5蛋白表达水平明显高于化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平（0.9 ± 0.3比0.5 ± 0.2），有效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平明显低于无效患者（0.5 ± 0.2比0.8 ± 0.2），差异有统计学意义（ P<0.05）。 结论:C19ORF5蛋白的高表达可以提高结直肠癌组织的自噬活性；C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关；C19ORF5蛋白可能通过增强自噬活性提高紫杉醇化疗的敏感性。

乙型肝炎病毒（HBV）是导致肝炎、肝硬化等肝脏疾病的重要病原体。HBV前基因组RNA（pgRNA）在其生命周期中发挥着重要作用，它既是翻译病毒核心蛋白和聚合酶蛋白（polymerase，P）的信使RNA，也是病毒进行逆转录的模板。作为HBV的重要结构蛋白，P蛋白和core蛋白的比例在HBV复制中受到严格调控。由于二者均由pgRNA翻译产生，且P蛋白的开放阅读框（ORF）位于核心蛋白ORF的下游，P蛋白的翻译如何启动是一个十分关键的科学问题。既往研究认为，P蛋白可能通过泄露扫描、翻译再起始等机制来启动翻译。本文通过文献阅读与推演，对HBV pgRNA选择性翻译P蛋白的机制进展进行综述，并尝试总结了起始P蛋白翻译的可能机制。

MOTS-c是线粒体DNA(mtDNA)短开放阅读框(sORF)编码的小分子多肽，由线粒体12S rRNA编码，作为最新被发现的线粒体衍生肽(MDPs)，是目前研究的热点，其可以改善胰岛素抵抗(IR)预防2型糖尿病(T2DM)；增加棕色脂肪(BAT)产热，促进白色脂肪(WAT)棕色化，以适应寒冷；防止肥胖和脂质代谢紊乱；降低非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的发生率；保护血管内皮细胞，预防冠心病，延缓骨质疏松(OP)。MOTS-c对改善多种代谢相关性疾病的不良结局发挥着积极作用，本文主要围绕MOTS-c与代谢相关性疾病的关系及其作用机理展开综述。

目的:分析临床诊断为病毒性前葡萄膜炎患者眼内水痘-带状疱疹病毒（VZV）感染情况及基因特征。方法:收集全国范围内2018年6月至2019年7月临床诊断为病毒性前葡萄膜炎感染患者房水样本共计83份。使用实时荧光定量多聚核苷酸链式反应技术筛查被VZV感染的阳性样本，扩增并分析阳性样本开放阅读框22、38和62上的单核苷酸多态性位点，根据扩增目的片段基因特征，鉴别参考株（包括8个疫苗株，其余均为野毒株），确定基因型别。结果:83份共来源于病毒性前葡萄膜炎感染患者样本，年龄为51.0（45.5，61.0）（15~83）岁，女31例，男52例，其中50岁及以上患者占57.8%（48例），所有患者均无水痘或带状疱疹疫苗接种史。83份感染患者样本中，VZV阳性样本共57份（68.6%），其中14份成功扩增获得目的片段基因序列，经分析均为野毒株，且基因分型均属分支（Clade）2，与我国水痘和带状疱疹患者感染的VZV疫苗株型别相同。结论:2018—2019年我国病毒性前葡萄膜炎患者感染VZV均为野毒株，基因型别与疫苗株相同均属Clade2，与我国水痘和带状疱疹患者感染VZV的主要流行基因型相同。

目的:分析莆田市2019新型冠状病毒(2019 novel coronavirus，2019-nCoV)感染患儿的临床特征，为诊治儿童2019-nCoV感染提供参考依据。方法:回顾性分析2021年9月10日至10月20日莆田市儿童医院收治的78例2019-nCoV感染患儿的临床症状、实验室检查结果、肺部计算机断层成像表现、治疗、预后转归资料。结果:78例患儿中，无症状感染者2例(2.6%)，轻型36例(46.2%)，普通型40例(51.3%), 5例患儿已接种2019-nCoV疫苗。患儿临床表现以发热(24例)、咳嗽(13例)、乏力(9例)为主。患儿中性粒细胞计数减少34例(43.6%)，淋巴细胞计数减少29例(37.2%)，D-二聚体升高36例(46.2%)，低钾血症38例(48.7%)，低血糖27例(34.6%)，肌酸激酶同工酶升高11例(14.1%)。患儿中性粒细胞计数减少多发生于入院第2～4天。56例(71.8%)出现肺部计算机断层成像检查异常。入院第1次病毒核酸检测中，患儿的2019-nCoV开放阅读框(open reading frame， ORF)1 ab基因循环阈值为20.90±7.15， N基因循环阈值为20.29±7.78。78例患儿核酸转阴时间为(20.73±6.94) d。5例已接种疫苗患儿的入院第1天IgM抗体为0.36(0.34，4.89)，IgG抗体为10.42(0.50，19.42)，病程≥10 d的IgM抗体为1.82(1.66，8.12)，IgG抗体为76.63(16.92，79.84)。除9例复阳(11.5%)患儿继续至隔离点诊治，其余患儿均治愈出院。 结论:2019-nCoV感染患儿临床症状较轻，部分患儿病程中出现淋巴细胞计数减少、中性粒细胞计数减少、D-二聚体升高等，但总体预后较好，接种2019-nCoV疫苗患儿有更高的抗体水平。

目的:分析2019新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者的临床特征，为奥密克戎变异株的防控提供参考。方法:纳入2021年12月23日至2022年1月31日深圳市第三人民医院收治的38例2019新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者，回顾性分析患者的流行病学资料、临床表现、新型冠状病毒疫苗接种和实验室检查情况。采集鼻咽拭子样本进行病毒核酸检测，采用实时荧光聚合酶链反应扩增2019新型冠状病毒的开放阅读框(open reading frame， ORF)1 ab基因和 N基因。采集血液样本检测2019新型冠状病毒IgM和IgG抗体水平。 结果:38例患者中输入性病例35例(92.1%)，其中美国输入20例(57.1%)。36例(94.7%)患者接种过新型冠状病毒疫苗，其中末次接种后≤1个月发病者占5.7%(2/35)，>3个月发病者占65.7%(23/35)。3例为无症状感染者。35例确诊患者中，咳嗽31例(88.6%)，咽痛14例(40.0%)，发热13例(37.1%)，鼻塞10例(28.6%)，流涕8例(22.9%)；入院时白细胞计数正常者33例(94.3%)，降低者1例(2.9%)；淋巴细胞计数减少者19例(54.3%)；C反应蛋白升高者18例(51.4%)；白细胞介素6水平升高者35例(100.0%)；降钙素原升高者10例(28.6%)；D-二聚体升高者6例(17.1%)；ALT升高者1例(2.9%)；血钾降低者10例(28.6%)。 ORF1 ab基因循环阈值(Ct值)为22.15±6.00，最低值为14.22， N基因循环阈值为21.86±5.72，最低值为13.04。2019新型冠状病毒IgM抗体水平为0.46(0.21，1.12) AU/mL；IgG抗体水平为126.55(8.31，289.85) AU/mL，其中20例患者IgG抗体>100 AU/mL，12例IgG抗体>200 AU/mL，最高达414.48 AU/mL。 结论:目前奥密克戎变异株感染者的主要临床表现为咳嗽、咽痛、发热、鼻塞，接种新型冠状病毒疫苗后仍有可能感染奥密克戎变异株，且病毒核酸水平较高，需注意防护。

目的:基于苍白密螺旋体属（TP）TP0136蛋白的异质性，建立一种新的TP分子分型方法。方法:从GenBank中查询9株梅毒苍白密螺旋体（TPA）、3株雅司苍白密螺旋体（TPE）、1株未分类的类人猿密螺旋体（FB）和1株地方密螺旋体（TEN）的TP0136开放阅读框（ORF）氨基酸序列并进行多重序列比对，得出TP0136蛋白分子分型结果。利用建立的TP0136蛋白分子分型方法，对2015年1月至2018年12月南方医科大学皮肤病医院收集的23株TPA临床分离株进行分类，并将分型结果与传统的Arp/Tpr/TP0548三基因分型方法进行比较。结果:TP0136蛋白在不同种TP株中具有高度异质性，根据TP0136氨基酸序列，TPE、FB和TEN分为Ⅰ~ Ⅳ 4个亚型，TPA分为Ⅴ~ Ⅹ 6个亚型，TPA临床株分为Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ 4个亚型。通过TPA传统的三基因分型方法可将23株TPA临床株分为13D/d、14D/f、14D/g、15D/f、16A/e 5型。将TP0136分型法与传统分型法相结合，可将上述临床株进一步细分为10型，其中14D/f型应用TP0136分型法可进一步分为3个亚型。结论:TP0136分子分型方法可用于TP种的区分，有助于传统TPA分子分型的进一步完善。

目的:了解云南省蝙蝠体表寄生蛛蝇中肯科伊病毒(Kaeng Khoi virus，KKV)的感染情况。方法:2014年在保山市和2017年在瑞丽市采集蝙蝠体表寄生蛛蝇标本并进行鉴定，应用细胞组织培养法进行病毒分离，对阳性分离物进行序列扩增测序，对病毒全基因序列进行同源性和系统进化分析。结果:用蛛蝇标本研磨上清液接种BHK-21细胞，从瑞丽市和保山市蛛蝇标本分离到3株阳性分离物(WDBC1704、WDBC1710和BSBC1406)，均能使BHK-21细胞出现圆缩、脱落的细胞病变。经RT-PCR和高通量测序扩增后，获得3株阳性分离物的全基因组序列。系统进化分析显示3株阳性分离物的S、M、L基因均与泰国分离的KKV原型株PSC-19在同一进化支。本次分离的3株KKV与云南省既往分离株WDBC1403亲缘关系最近，其中BSBC1406株又形成一个独立的小分支。序列对比显示3株分离株之间在M基因上存在较大差异，BSBC1406与其他2株相似度仅为78.0%~78.1%，开放阅读框区中Gc蛋白的氨基酸相似度均为85.3%。结论:从云南蝙蝠寄生蛛蝇中新分离的3株KKV与原型株有较大差异，特别是BSBC1406株与其他分离株存在一定差异，可能已发生了变异，应加强云南省媒介昆虫携带KKV的监测及其与人类疾病关系的研究。