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支气管肺发育不良中新型miRNA-TF-mRNA共调控网络的鉴定
编辑人员丨1天前
目的:筛选与新生儿支气管肺发育不良(BPD)发病相关的关键转录因子(TF)、微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA),并构建了调控网络。方法:从高通量基因表达数据库GEO获取mRNA芯片数据集GSE108756,筛选出的差异表达基因(DEGs)进行京都基因和基因百科全书(KEGG)、基因本体注释(GO)功能富集分析;参照HumanTFDB数据库获取与DEGs对应的TF后利用cytoHubba插件筛选出degree值前10的Hub TF;通过hTFtarget数据库找出Hub TF中7个TF所对应的靶基因;在GSE108756中获取7个TF及其靶基因所对应的探针表达量后做相关性分析,筛选出最终纳入研究的6个Hub TF及所对应的正相关TF-mRNA关系队;利用Targetscan Human数据库获取靶向调控6个Hub TF的miRNAs,并与miRNA芯片数据集GSE166762差异miRNAs取交集后匹配出负向调节的miRNA-TF关系队,最后构建BPD患儿潜在miRNA-TF-mRNA调控网络,进一步筛选出关键miRNA、mRNA。结果:共筛选出201个差异表达基因,KEGG富集结果主要涉及B细胞受体信号通路、造血系统、原发免疫缺陷等作用,GO功能富集分析主要富集在B细胞增殖活化及免疫应答调节细胞表面受体等生物学过程中。与Hub TF(EBF1、TCF4、JUN、BCL11A、SPIB、E2F1)表达谱强关联的正相关下游靶基因有159个,负相关的上游miRNA有120个。BPD患儿发病潜在的关键miRNA-TF-mRNA网络包括has-miR-217-TCF4-Pou2AF1、has-miR-150-5p-E2F1-ADM。结论:本研究构建了新生儿BPD的miRNA-TF-mRNA共调控网络,从转录调控的崭新视角为揭示BPD发病机制奠定理论基础。
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编辑人员丨1天前
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血清miR-23a、miR-150、miR-150-5p水平与糖尿病性骨质疏松症的相关性
编辑人员丨2周前
目的 分析微小核糖核酸(miR)-23a、miR-150、miR-150-5p水平与糖尿病性骨质疏松症(DOP)的相关性.方法 选取2020年3月至2022年3月于医院就诊的糖尿病患者200例,随访2年,将发生DOP、未发生DOP的患者分别纳入DOP组、无DOP组.比较两组一般资料及血清miR-23a、miR-150、miR-150-5p水平;经Pearson相关性分析法分析血清miR-23a、miR-150、miR-150-5p水平与骨密度的相关性;经Logistic回归模型分析DOP的影响因素.结果 DOP发生率为28.89%;DOP组血清miR-23a、miR-150、miR-150-5p水平均高于无DOP组(P<0.05);Pearson相关性分析显示,糖尿病患者血清miR-23a、miR-150、miR-150-5p水平与骨密度均呈负相关(P<0.05);logistic回归模型分析显示,年龄、体质量指数(BMI)、miR-23a、miR-150、miR-150-5p是DOP的影响因素(P<0.05).结论 DOP患者中血清miR-23a、miR-150、miR-150-5p水平升高,三者均与骨密度均呈负相关,且均是DOP发生的影响因素.
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编辑人员丨2周前
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精神分裂症患者外周血中mRNA/miRNA网络综合分析
编辑人员丨3周前
目的 探索精神分裂症患者外周血中mRNA/微小核糖核酸(miRNA)网络综合分析.方法 纳入2022年12月至2023年2月就诊于该院的精神分裂患者6例作为实验组,志愿者4例作为对照组.收集两组人群血液样本,采用RNA-seq技术检测mRNA及miRNA的表达水平.最后利用基因表达综合数据库中GSE145554基因集进行生物信息学验证分析.结果 与对照组相比,实验组中共分析出差异mRNA 2 133个,其中包括上调mRNA 1 410个,下调mRNA 723个;差异miRNA 150个,其中包括上调miRNA 72个,下调miRNA 78个.京都基因与基因组百科全书和基因本体论富集的生物学过程和信号途径主要包括哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT)信号通路、坏死性凋亡及内质网中的蛋白质加工信号通路等.结论 PI3K-AKT、mTOR、坏死性凋亡及内质网中的蛋白质加工信号通路参与精神分裂的发生发展过程,为阐明精神分裂症的预防、诊断及治疗提供新的研究方向.
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编辑人员丨3周前
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血清微小RNA-141-3p、微小RNA-150-5p与鼻咽癌患者临床病理特征和放疗敏感性的关系研究
编辑人员丨2024/4/13
目的:探讨血清微小核糖核酸(miRNA)-141-3p、miR-150-5p与鼻咽癌(NPC)患者临床病理特征和放疗敏感性的关系.方法:收集2019年1月~2022年7月在我院接受放疗的92例NPC患者为NPC组,根据放疗疗效分为抵抗组和敏感组,另选取同期80名在我院体检的健康志愿者为对照组.比较对照组、NPC组血清miR-141-3p、miR-150-5p表达.分析NPC患者血清miR-141-3p、miR-150-5p表达与临床病理特征的关系.利用单因素和多因素Logistic回归分析NPC患者放疗抵抗的影响因素.结果:与对照组比较,NPC组血清miR-141-3p表达升高,miR-150-5p表达降低(P<0.05).NPC患者血清miR-141-3p、miR-150-5p表达在不同分化程度、TNM分期和淋巴结转移中比较有差异(P<0.05).92例NPC患者放疗抵抗发生率为22.83%(21/92).单因素分析显示,抵抗组TNM分期Ⅲ~Ⅳa期和miR-141-3p ≥ 2.60比例高于敏感组,miR-150-5p ≥ 0.80比例低于敏感组(P<0.05).多因素Logistic回归分析显示,miR-141-3p≥2.60为NPC患者放疗抵抗的独立危险因素,miR-150-5p≥0.80为独立保护因素(P<0.05).结论:NPC患者血清miR-141-3p高表达,miR-150-5p低表达,与分化程度、TNM分期、淋巴结转移和放疗敏感性有关,有望成为NPC患者放疗抵抗的评价指标.
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编辑人员丨2024/4/13
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脓毒症患者外周血miR-125b、miR-150表达及其临床意义
编辑人员丨2024/3/30
目的 探讨脓毒症患者外周血微小核糖核酸-125b(miR-125b)、微小核糖核酸-150(miR-150)表达及其临床意义.方法 选取邢台市中心医院收治的 103 例脓毒症患者为研究组,另选取体检健康者 82 例为健康组,均测定外周血miR-125b、miR-150 表达及血清白细胞介素-6(IL-6)、C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)水平.对比研究组、健康组各指标水平,采用Pearson相关性分析法分析脓毒症患者miR-125b、miR-150 表达与IL-6、CRP、PCT水平的关系;比较不同严重程度脓毒症患者及不同预后患者的miR-125b、miR-150 表达;采用多因素Logistic回归分析法分析miR-125b、miR-150 表达与预后的关系;通过受试者工作特征曲线分析miR-125b、miR-150 表达对脓毒症预后的预测价值.结果 研究组外周血miR-125b表达与IL-6、CRP、PCT水平分别为(2.43±0.35)、(159.42±26.81)pg/mL、(115.47±20.38)mg/L、(10.57±2.03)ng/mL,均高于健康组(t =31.012、52.149、48.978、46.945,均P=0.000),miR-150 表达(0.21±0.04)低于健康组(t=52.008,P=0.000);经Pearson相关性分析,脓毒症患者外周血miR-125b表达与IL-6(r=0.706,P=0.016)、CRP(r=0.711,P=0.013)、PCT(r=0.759,P=0.001)水平均呈正相关,miR-150 与IL-6(r=-0.702,P=0.018)、CRP(r=-0.709,P=0.015)、PCT(r=-0.728,P=0.006)水平均呈负相关;脓毒症者外周血miR-125b表达(2.16±0.43)低于严重脓毒症者(2.82±0.27)(t=8.815,P=0.000),脓毒症者外周血miR-150 表达(0.24±0.02)高于严重脓毒症者(0.16±0.03)(t =16.248,P=0.000);入院 28d生存者外周血miR-125b表达(2.25±0.41)低于死亡者(3.13±0.36)(t=8.982,P= 0.000),生存者外周血miR-150 表达(0.23±0.04)高于死亡者(0.13±0.02)(t=11.078,P=0.000);年龄、急性生理学与慢性健康状况评分系统Ⅱ(APACHEⅡ)评分、疾病严重程度及外周血miR-125b表达均是脓毒症患者预后的危险因素(OR=2.438、2.689、2.866、2.824,P=0.036、0.012、0.000、0.005),miR-150 表达是其保护因素(OR= 0.390,P=0.003);外周血miR-125b、miR-150 表达预测脓毒症预后的最佳截断点分别为 2.854、0.179,灵敏度分别为 76.19%、80.95%,特异度分别为 79.27%、75.61%,曲线下面积分别为 0.861、0.843.结论 与健康人群比较,脓毒症患者外周血miR-125b表达升高,而miR-150 表达降低,且miR-125b、miR-150 表达均与炎症因子水平、疾病严重程度及预后相关,并对预后具有一定的预测价值,可作为临床判断病情严重程度及预后的指标.
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编辑人员丨2024/3/30
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LncRNA FAM83A-AS1通过miR-150/HMGA2轴对视网膜母细胞瘤细胞增殖和凋亡的影响
编辑人员丨2023/12/30
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)序列相似家族83成员A-反义核糖核酸1(FAM83A-AS1)在视网膜母细胞瘤(RB)细胞中的作用及其潜在的分子机制.方法 体外培养RB细胞,将Vector、pcDNA-FAM83A-AS1、NC-siRNA、FAM83A-AS1-siRNA分别转染至细胞中(依次为pcDNA-FAm83A-AS1组、NC-siRNA组、FAm83A-AS1-siRNA组),检测RB细胞中FAM83A-AS1的表达、RB细胞增殖能力、凋亡率.生物信息学方法和双荧光素酶报告基因实验预测和验证FAM83A-AS1与miR-150以及miR-150与高迁移率族蛋白A2(HMGA2)的靶向关系.RT-qPCR检测RB细胞中miR-150、HMGA2 mRNA的表达;Western blot检测RB细胞中HMGA2蛋白的表达;MTT实验和流式细胞术检测转染后RB细胞增殖和凋亡能力.结果 pcDNA-FAM83A-AS1 组细胞中FAM83A-AS1 的表达显著高于Vector组,低于NC-siRNA组(P<0.05).pcDNA-FAM83A-AS1组较Vector组的细胞增殖能力显著升高,细胞凋亡率显著降低(P<0.05).FAM83A-AS1-siRNA组较NC-siRNA组的细胞增殖能力显著降低,细胞凋亡率显著升高(P<0.05).miR-150 mimic可显著抑制RB细胞增殖能力,促进细胞凋亡.而pcDNA-HMGA2可显著逆转miR-150 mimic对RB细胞增殖和凋亡的作用.结论 敲低lncRNA FAM83A-AS1通过调控miR-150/HMGA2轴抑制RB细胞增殖,促进细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/12/30
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支气管哮喘患者血清miR-29a-3p、miR-98-5p表达水平与肺功能、气道炎症和糖皮质激素治疗敏感性的关系研究
编辑人员丨2023/10/21
目的:探讨支气管哮喘(BA)患者血清微小核糖核酸(miR)-29a-3p、miR-98-5p表达水平与肺功能、气道炎症和糖皮质激素(GC)治疗敏感性的关系.方法:选取2020年1月~2022年1月潍坊市人民医院收治的150例BA患者为BA组,根据BA患者GC治疗敏感性将其分为抵抗组43例和敏感组107例,另选取同期57名体检健康者为对照组.收集BA组、对照组肺功能和气道炎症指标资料,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测两组血清miR-29a-3p、miR-98-5p表达水平 通过Spearman相关性分析BA患者血清miR-29a-3p、miR-98-5p表达水平与肺功能和气道炎症指标的相关性,单因素和多因素Logistic回归分析BA患者GC治疗抵抗的影响因素.结果:与对照组比较,BA组血清miR-29a-3p、miR-98-5p表达水平和第1秒用力呼气容积占预计值百分比(FEV1%)、第1秒用力呼气容积/用力肺活量(FEV1/FVC)、峰值呼气流速(PEF)降低,呼出气一氧化氮(FeNO)水平升高(P均<0.05).Spearman相关性分析显示,BA患者血清miR-29a-3p、miR-98-5p表达水平与FEV1%、FEV1/FVC、PEF呈正相关,与FeNO水平呈负相关(P均<0.05).单因素分析显示,抵抗组体质指数>24 kg/m2、吸烟比例高于敏感组,血清miR-29a-3p、miR-98-5p表达水平低于敏感组(P<0.05).多因素Logistic回归分析显示,体质指数>24 kg/m2、吸烟为BA患者GC治疗抵抗的独立危险因素,血清miR-29a-3p、miR-98-5p表达水平升高为其独立保护因素(P均<0.05).结论:BA患者血清miR-29a-3p、miR-98-5p水平降低,与肺功能下降、气道炎症和GC治疗抵抗有关.
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编辑人员丨2023/10/21
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miR-155、PDCD4、GSN在高血压性脑出血中的表达及预后价值研究
编辑人员丨2023/8/19
目的 探讨微小核糖核酸(miRNA)-155(miR-155)、程序性细胞死亡蛋白 4(PDCD4)、凝溶胶蛋白(GSN)在高血压性脑出血(HICH)中的表达及在预后判断中的价值.方法 将 2021 年 1 月至 2022 年 1 月该院收治的 150 例 HICH 患者纳入研究作为研究组.另外,将同期 150 例无脑出血的高血压患者纳入研究作为对照组.比较研究组、对照组及不同严重程度、不同预后患者 miR-155、PDCD4、GSN水平及一般资料.分析各指标与疾病严重程度、预后的相关性.分析 HICH 预后不良的独立危险因素及各指标单独及联合检测在预后判断中价值.结果 研究组 miR-155 和 PDCD4 水平均高于对照组,而 GSN 水平低于对照组(P<0.05).随HICH 严重程度加重,miR-155、PDCD4 水平增高,GSN水平降低(P<0.05).预后不良组 miR-155 和PDCD4水平均高于预后良好组(P<0.05),而GSN水平低于预后良好组(P<0.05).miR-155、PDCD4 与HICH 严重程度呈正相关(r=0.653、0.642,P<0.05),与 HICH 预后呈负相关(r=-0.625、-0.575,P<0.05);GSN 与HICH 严重程度呈负相关(r=-0.591,P<0.05),与 HICH 预后呈正相关(r=0.583,P<0.05).预后不良组出血量≥60 mL占比高于预后良好组(P<0.05).miR-155、PDCD4 水平升高,GSN水平降低是HICH 患者预后不良的危险因素(P<0.05).miR-155、PDCD4、GSN联合检测用于 HICH 患者预后不良预测的曲线下面积为 0.954,高于 miR-155、PDCD4、GSN单独检测(P<0.05).结论 miR-155、PDCD4 在 HICH 患者中呈高表达,GSN呈低表达.miR-155、PDCD4 水平升高,GSN水平降低是 HICH 患者预后不良的危险因素.3 项联合检测用于 HICH 患者预后判断中的价值较高.
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编辑人员丨2023/8/19
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血清miR-150-5p和miR-155-5检测对老年糖尿病肾病的诊断价值
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨血清miR-150-5p和miR-155-5p对老年糖尿病肾病(DN)的诊断价值.方法 采用实时定量PCR(RT-PCR)法检测126例老年DN患者(DN组),140例2型糖尿病患者(2型糖尿病组)和65例健康体检者(对照组)的血清miR-150-5p和miR-155-5p水平,分析其对老年DN患者的诊断价值.结果 DN组血清miR-150-5p(3.35±1.26 vs 1.04±0.63和0.79±0.25)和miR-155-5p(5.47±1.80 vs 1.60±0.95和1.28±0.86)表达水平均明显高于2型糖尿病组和对照组(F/χ2=8.214,10.327,均P<0.01).2型糖尿病组与对照组血清miR-150-5p和miR-155-5p表达水平比较,差异无统计学意义(P>0.05).ROC曲线分析显示,血清miR-150-5p和miR-155-5p诊断老年DN的最佳截值分别为2.65,4.16,二者联合诊断老年DN的AUC(95%CI)为0.892(0.834~0.953),明显优于miR-150-5p[0.805(0.749~0.865)]和miR-155-5p[0.837(0.779~0.894)],Z=7.215,4.692,P<0.05.其敏感度(90.4%)和特异度(85.7%)最好.结论 血清miR-150-5p和miR-155-5p水平在老年DN患者中明显升高,有望作为老年DN诊断的生物学标志物.
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编辑人员丨2023/8/6
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HIV感染与差异表达的miRNA之间的相互作用
编辑人员丨2023/8/6
目的 探究艾滋病病毒(HIV)感染与差异表达的微小核糖核酸(miRNAs)之间的关联及机制.方法 基因芯片分析3例HIV感染者、3例治疗者及2例健康对照的外周血单个核细胞(PBMC)中miRNAs表达情况并选出差异表达miRNAs,于150例样本中再次定量验证.检测转染mimic/inhibitor或过表达质粒的体外模型中p24水平改变,探究miRNAs对HIV复制的影响.通过定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)和构建报告基因验证靶标.结果 芯片筛选出3组间表达差异显著的miRNAs共11条,大部分在HIV感染者中呈下调趋势,但定量验证结果中仅hsa-miR-191-5p的差异有统计学意义(F=92.560,P<0.05)且趋势与芯片结果一致.Hsa-miR-191-5p在体外模型实验中抑制了HIV复制,后续NUP50和CCR1被证实为其靶标.结论 因HIV感染引起PBMC中miRNAs差异表达,总体呈下调趋势.hsa-miR-191-5p可抑制HIV复制,可能是通过CCR1和(或)NUP50实现的.
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编辑人员丨2023/8/6
