目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨芬氟拉明治疗癫痫的潜在作用机制.方法 从GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库中对癫痫的相应疾病靶点进行筛查,利用drug-bank、pharmmapper、swisstarget等数据库筛选芬氟拉明的药物靶点.取癫痫和芬氟拉明的交集靶点,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络,将其导入Cytoscape 3.9.1软件作网络拓扑分析筛选核心靶点并处理可视化.通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.利用分子对接技术验证芬氟拉明与关键靶点的相互作用.结果 获得139个癫痫与芬氟拉明的交集靶点基因,并根据网络拓扑分析筛选出33个核心靶点.GO分析结果显示,核心靶点主要涉及化学突触传递及信号转导等生物过程(BP);离子体膜、细胞质及质膜等细胞成分(CC);蛋白结合、神经递质受体活性等分子功能(MF).KEGG富集分析结果显示,芬氟拉明可能通过调控多巴胺能神经突触、神经活性配体-受体相互作用及PI3K-Akt等多个信号通路治疗癫痫.分子对接结果显示,芬氟拉明与DRD2、EGFR、HSP90AA1、SLC6A4、GSK3β及GRIN2B等关键靶点稳定结合.结论 本文利用网络药理学和分子对接技术分析得到芬氟拉明可能通过作用于DRD2,从而调控多巴胺能突触信号通路抑制癫痫发作,为进一步研究其治疗癫痫的具体机制提供了新的线索,亦为后续临床和实验研究提供理论基础,从而有助于开发治疗癫痫的有效新药.

目的:运用超高效液相色谱-飞行时间质谱联用技术（UPLC-Q/TOF-MS）整合网络药理学研究刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的物质基础及潜在作用机制。方法:利用UPLC-Q/TOF-MS鉴定刺五加注射液的化学成分，通过Swiss Target Prediction、GeneCards和OMIM数据库预测刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的潜在作用靶点，利用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络，通过Omicshare平台对治疗靶点进行GO和KEGG富集分析，运用Autodock软件进行分子对接。结果:分析鉴定了刺五加注射液中53种成分，并以此为基础得到刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的相关靶点189个及10个核心靶点，反向筛选发现刺五加注射液中的25个成分可能是治疗缺血性脑卒中的主要有效成分；KEGG富集结果显示，刺五加注射液可能主要通过调节PI3K-Akt信号通路来治疗缺血性脑卒中。结论:刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的作用机制可能与抑制炎症反应、抗氧化应激、促进血管新生和保护神经细胞等作用有关。

目的:结合HPLC和网络药理学方法对三化汤治疗脑缺血的活性成分进行含量测定，预测其发挥作用的潜在靶点。方法:采用HC-C18色谱柱(250 mm×4.6 mm，5 μm)，流动相为甲醇-乙腈-0.05%磷酸水，梯度洗脱，流速1.0、0.8 ml/min；检测波长254 nm，柱温30 ℃，进样量10 μl。运用TCMIP V 2.0平台检索大黄酸、大黄素、大黄酚、橙皮苷、厚朴酚和羌活醇6种成分作用靶点，以Cerebral ischemia为关键词，检索GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、疗效药靶数据库(TTD)、Disgenet数据库，筛选6种活性成分治疗脑缺血潜在靶点，构建蛋白质相互作用网络和疾病-成分-靶点-通路整合网络。结果:三化汤中6种活性成分大黄酸、大黄素、大黄酚、橙皮苷、厚朴酚和羌活醇线性范围分别为0.080 4~0.804 0 μg、0.015 3~0.382 0 μg、0.041 8~0.626 4 μg、0.312 6~3.908 0 μg、0.037 9~0.568 8 μg、0.045 3~1.359 6 μg，相关系数均大于0.999 0。经测定7份样品中上述6个成分含量范围分别为0.887~0.971 mg/g、0.094~0.101 mg/g、0.110~0.119 mg/g、1.494~1.669 mg/g、0.126~0.145 mg/g、0.153~0.167 mg/g。网络药理学分析发现，TNF、TP53、MAPK14、JUN、IL1B、MYC、ESR1、ICAM1、PTGS2、PPARG为三化汤中6种活性成分治疗脑缺血的核心靶点。结论:建立了三化汤治疗脑缺血6种活性成分质量控制方法，该方法样品处理简便，色谱条件简单，结果准确。明确了三化汤中6种活性成分治疗脑缺血的10个潜在靶点，为进一步研究其作用机制奠定基础。

目的:运用网络药理学探讨温胆汤治疗高血压的分子机制。方法:通过TCMSP和中医药整合药理学研究平台(TCMIP)筛选温胆汤的潜在活性成分和作用靶点，通过药物靶标数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、GeneCards数据库收集高血压疾病靶点，STRING数据库进行蛋白相互作用分析，采用Cytoscape v3.7.1构建网络，再用ClueGO进行GO功能和KEGG通路富集分析，最后以适合的分子和靶点进行分子对接。结果:共筛选出温胆汤141个潜在活性成分和108个潜在治疗靶点；通过cytoHubba中MCC算法筛选出排位前20的核心靶点，GO分析包含164条显著性条目，包括生物过程133条、分子功能24条、细胞定位7条。KEGG通路富集筛选出7条枢纽通路，且活性成分与靶点间对接良好。结论:温胆汤可通过多途径、多靶点治疗高血压，可为其临床应用提供数据。

目的:使用网络药理学分析柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的机制。方法:以柴芩清宁胶囊的主要成分黄芩苷、柴胡、人工牛黄为研究对象，在中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)和中国中药整合数据库(TCMID)筛选活性成分，通过Drugbank和TCMSP数据库进行靶点预测分析；通过Genecards、人类在线孟德尔遗传平台(OMIM)、MalaCards数据库筛选出上呼吸道感染疾病相关基因；采用omicshare平台对药物靶点和疾病靶点进行匹配；使用Uniprot数据库和Cystoscope软件构建蛋白质相互作用网络；用Cystoscope软件构建"化合物-靶点-作用通路"网络图，对柴芩清宁胶囊关键作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。结果:柴芩清宁胶囊20个化合物对应的215个靶标，上呼吸道感染相关基因102个，化合物对应靶点与疾病相关靶点取交集，共得到18个共有靶基因，柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的互作网络靶标合集，56个靶点共形成986条蛋白互作关系。其中673条互作关系≥0.9，为置信度高的互作对。对潜在靶点进行拓扑学参数分析发现，共18个基因为柴芩清宁胶囊治疗上呼吸道感染的靶点。通过对这些关键基因进行KEGG通路富集分析发现，这些基因主要富集到免疫系统活化、应激反应、炎症因子释放、凋亡进程、细胞增殖、胞内氧化代谢等相关的信号通路中。结论:柴芩清宁胶囊通过多成分、多靶点、多通路影响免疫系统活化、应激反应、炎症因子释放、凋亡进程、细胞增殖、胞内氧化代谢等信号通路及病理生理学进程，从而起到治疗上呼吸道感染的作用。

目的:基于整合药理学平台联合GEO芯片差异基因分析的方法，分析开心散治疗AD的作用机制。方法:通过检索中医药整合药理学研究平台（TCMIP）和Drugbank数据库，获得开心散组方药物活性成分和相关分子靶点。通过GEO数据库获取GSE4757芯片数据，使用R语言获取其差异基因，绘制热图和火山图。通过Cytoscape 3.7.2构建开心散与AD的差异基因分子靶点图，使用Bisogenet和CytoNCA绘制靶点拓扑网络，并进行开心散与AD基因的GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果:获得开心散治疗AD的活性成分86个，与GEO共有的差异基因29个，构建PPI拓扑网络，筛选出核心的候选基因6个，与KEGG通路富集基因合并，获得治疗疾病的重要基因为CHRM1、CHRM2、ACHE、CHRM3、CASP8、PTGS2、DRD1、CACN1S、ADRB1。GO功能条目获得375条，主要涉及血管收缩、突触后膜可塑性，神经递质传递等。KEGG富集分析主要涉及胆碱能突触信号通路、cAMP信号通路、钙信号通路、神经-配体-受体相互作用信号通路等。结论:开心散治疗AD具有多成分、多靶点、多通路的特点，可通过抑制炎症反应、降低乙酰胆碱酯酶活性、调节钙离子浓度等通路发挥治疗AD的作用。

目的:揭示角药"黄芩-知母-石膏"治疗流感病毒性肺炎可能的作用机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台（traditional Chinese medicine systematic pharmacology，TCMSP）、中药分子机制生物信息学分析网络（Bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine，BATMAN-TCM）、基因和化学物质相互作用预测数据库（search tool for interacting chemicals，STITCH）筛选黄芩、知母和石膏的活性成分并进行靶点预测，通过人类基因数据库（GeneCards）获取流感病毒性肺炎的疾病靶点。将药物与疾病的共同靶点导入蛋白相互作用数据库（STRING）进行蛋白质相互作用（protein-protein interaction，PPI）网络分析，利用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络和核心靶点网络，利用注释及可视化整合分析工具（database for annotation，visualization and integrated discovery，DAVID）进行基因本体（gene ontology，GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG）富集分析，随后构建流感病毒性肺炎动物模型，通过苏木素-伊红（Hematoxylin-Eosin，HE）染色观察肺组织病变情况，实时荧光定量聚合酶链反应（quantitative real-time polymerase chain reaction，qRT-PCR）法验证网络药理学分析所得靶点。结果:研究共获取黄芩、知母、石膏的活性成分51个，相关靶点305个，其中与流感病毒性肺炎靶点重合的靶点有80个，关键靶点包括白细胞介素-6（interleukin 6，IL6）、肿瘤坏死因子（tumor necrosis factor，TNF）、白细胞介素-1β（interleukin 1β，IL1B）、骨髓趋化因子2（C-C motif chemokine ligand 2，CCL2）等。GO富集共得到432个富集结果，KEGG富集分析共获得143个富集结果。动物实验表明，"黄芩-知母-石膏"能够显著改善流感病毒性肺炎小鼠的肺指数，减轻肺组织炎症，调节IL6、TNFA、IL1B、CCL2、RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（RAC-alpha serine/threonine-protein kinase，AKT1）、胱天蛋白酶3（Caspase-3，CASP3）等关键基因表达。结论:角药"黄芩-知母-石膏"可以通过调控细胞凋亡、减轻炎症反应改善流感病毒性肺炎，本研究为该药物组合的深入研究和临床推广提供了依据。

目的:通过网络药理学方法及分子对接技术，分析蒙药嘎日迪十三味丸中诃子-珍珠干预脑卒中的药效物质基础、作用靶点及作用通路，为理解其"解毒"机制奠定基础。方法:利用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、中药分子作用机制的网络药理学在线分析工具(BATMAN-TCM)预测诃子-珍珠成分靶点，利用GeneCards数据库检索脑卒中相关靶点。将2个平台的重叠靶点导入Metascape软件，进行GO生物过程分析、KEGG通路分析。应用LEDOKE进行关键分子及靶点的分子对接。结果:共收集诃子-珍珠活性成分22个，预测得到与脑卒中相关靶点217个。其中1-O-没食子酰基-葡萄糖、铜、鞣花酸、诃子鞣酸、科里拉京等为诃子-珍珠发挥"解毒"作用的关键物质，IL6、TNF、热休克蛋白90 AA1 (HSP90AA1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、CASP3、孕烷X受体(NR1I2)、维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1(VKORC1)、Na +/K +ATP酶A1亚基(ATP1A1)等靶点为其"解毒"关键靶点。这些靶点显著富集在有机环状化合物的细胞反应、体液水平调节、止血、对类固醇激素的反应、类固醇代谢过程、凝血等生物过程及氮代谢、IL-17信号通路等通路。分子对接从计算机模拟层面上验证了前期预测结果的准确性。 结论:诃子-珍珠干预脑卒中的过程与清除有害代谢产物、平息体内的炎症反应密切相关，与现代医学对脑卒中的病理过程的研究结论相符，也与蒙医理论对"邪毒"的阐释相符。

目的:探讨院内制剂养阴益气合剂对不同类型肺炎恢复期的作用机制，以期为肺炎的中药防治提供更多的临床选择。方法:基于异病同治理论，借助中医药整合药理学研究平台（TCMIP）V 2.0，对养阴益气合剂中药有效成分、作用靶点、疾病靶点进行筛选，利用Cytoscape软件构建“疾病-靶点-方药”网络，对关键靶点进行Reactome富集分析。结果:确立了7个不同类型肺炎恢复期临床表现，包括乏力（Fatigue）、气短（Tachypnea）、口渴（Xerostomia）、心悸（Palpitations）、汗多（Hyperhidrosis）、纳差（Poor Appetite）、咳嗽（Cough）。获得养阴益气合剂全方化学成分276个，“疾病-方药”关键核心靶点177个，药物与疾病共有靶点37个，关键靶点与细胞代谢、细胞凋亡、炎症反应及免疫应答、应激反应等相关。合剂中黄精与肺炎恢复期的7个病症有17个共有靶点。Reactome富集分析显示，养阴益气合剂治疗不同类型肺炎恢复期主要症状的核心基因参与的通路主要富集在：通过调控基因与蛋白质翻译，影响病毒或细胞功能；机体免疫调节及炎症反应；调节机体神经系统功能；防止病毒感染型癌变。结论:养阴益气合剂有效成分可能通过干预PIK3CA、MAPK3、BCL2、NFκB2等靶点调节PI3K、IL-4、IL-13、抑制性卡巴蛋白（IκBα）表达，促进肺炎的恢复。本研究可为不同类型肺炎恢复期的中药防治提供理论依据。

目的 运用数据挖掘和网络药理学技术探究王雪峰教授运用中药治疗小儿脑瘫的用药规律和潜在作用机制.方法 通过Excel、OriginPro 2021、IBM SPSS Modeler 18.0等软件整合王雪峰教授近年临床医案,对其进行数据挖掘,总结核心处方及用药规律;将核心处方通过BATMAN-TCM、GeneCards、OMIM、TTD等数据库提取核心药物和疾病的潜在基因靶点,通过Venny 2.1.0提取交集基因,其结果依次进行蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI)分析,基因本体分析以及信号通路富集分析,最后通过Cytoscape 3.7.2构建"药物-成分-靶点-通路-疾病"网络.结果 共纳入临床医案97则,涉及辨证论治处方97个,中药126味,其中21味高频中药,性味以温、甘、辛为主,主要归脾、肝、肺经;聚类分析得到5个有效聚类群;关联分析得到113条关联规则,并总结出王雪峰教授治疗脑瘫的核心处方为"白芍-甘草-大枣-黄芪-桂枝-茯苓";核心处方有效活性成分158个,涉及基因靶点621个,疾病靶点974个,药物与疾病交集靶点67个;PPI网络分析共得到67个节点,304条边,平均节点度值9.07;基因本体(gene ontology,GO)分析中涉及生物过程(biological process,BP)229条,细胞组成(cellular component,CC)57条,分子功能(molecular function,MF)59条.京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析出71条信号通路;复杂网络分析共有793个节点,2107条边,度值阈值为5.314,平均度值2.03.茯苓酸B(Poricoic Acid B)、芍药内酯苷(Albiflorin)以及乳酸菌素(Lactiflorin)可能是治疗脑瘫发挥关键作用的活性成分.结论 王雪峰教授治疗脑瘫从肝脾论治,以补虚扶正、和血通痹为治疗大法,选用黄芪桂枝五物汤为底方临证加减疗效确切,有理可依,有据可循.