目的:通过网络药理学研究半枝莲-党参药对治疗膀胱癌的作用机制。方法:查询中药系统药理学数据库分析平台（TCMSP）筛选半枝莲-党参药对的药物成分，使用Swiss Target Prediction预测药物成分的作用靶点；运用GeneCards获取膀胱癌的疾病靶点，利用venny 2.1获取交集靶点。使用STRING进行蛋白-蛋白相互作用分析并使用Cytoscape构建"药物-靶点-通路"网络，利用Metascape进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析。将裸鼠随机分为模型组和治疗组，建立膀胱癌小鼠模型。模型组小鼠灌胃等剂量溶剂，治疗组建模后第8天灌胃半枝莲-党参药对0.2 ml，剂量为342.86 mg/kg，2次/d。建模后第28天，测量裸鼠瘤体大小，并采用酶联免疫吸附试验法检测前列腺素G/H合成酶2（PTGS2）、PTGS1、核受体辅活化子2（NCOA2）、维甲酸X受体α（RXRA）、孕酮受体（PGR）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、网状内皮增生病毒癌基因同源物A（RELA）、蛋白激酶B1（Akt1）水平。结果:半枝莲-党参药对的45个药物成分通过多条通路直接作用于187个疾病靶点治疗膀胱癌，主要核心成分为槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、黄芩素、β-谷甾醇和豆甾醇等，关键靶点为PTGS2、PTGS1、NCOA2、RXRA、PGR、MAPK1、RELA和Akt1等。GO富集分析显示，生物过程主要涉及对激素的反应、细胞对脂质的反应、对外来刺激的反应、对细菌分子的反应等，细胞组分主要涉及转录调控复合体、膜筏、膜微区、RNA聚合酶Ⅱ转录调控复合物等，分子功能主要涉及转录因子结合、DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、核受体活性、配体激活的转录因子活性等。KEGG通路富集分析显示半枝莲-党参药对治疗膀胱癌的主要信号通路为晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）、白细胞介素-17（IL-17）、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）、肿瘤坏死因子（TNF）、MAPK、缺氧诱导因子-1（HIF-1）、细胞凋亡、p53、Toll样受体等。动物实验验证显示，半枝莲-党参药对能够明显改善裸鼠的瘤体大小，同时也能改善PTGS2、PTGS1、NCOA2、RXRA、PGR、MAPK1、RELA、Akt1表达水平。结论:半枝莲-党参药对主要通过调节AGE-RAGE、IL-17、PI3K-Akt、TNF、MAPK、HIF-1、细胞凋亡、p53、Toll样受体等信号通路的PTGS2、PTGS1、NCOA2、RXRA、PGR、MAPK1、RELA、Akt1等靶点治疗膀胱癌。

目的:采用网络药理学和分子对接技术探索参芪五味子抗焦虑(AD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选参芪五味子主要的活性成分，通过TCMSP数据库和SymMap数据库获取其活性成分对应的靶点，利用Cytoscape将药物-有效成分-靶点关系网络进行可视化展示。利用TTD、OMIM、NCBI、Drugbank、GeneCards数据库直接获取焦虑的潜在靶点。基于String数据库构建潜在靶点的相互作用图，利用Cytoscape工具得到关键的靶蛋白。基因本体(GO)富集分析和东京基因组百科全书(KEGG)信号通路分析获取参芪五味子抗焦虑的关键靶点及信号通路。利用AutodockTools软件对关键有效成分和关键靶点蛋白进行分子对接并计算得出其结合能，通过PyMol软件将分子对接结果进行可视化处理。结果:参芪五味子中63个有效成分可通过69个靶点作用于焦虑症。其中以槲皮素、木犀草素、豆甾醇为主要的药物活性成分，丝氨酸苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)蛋白和白介素-6(IL-6)蛋白为关键靶蛋白。分子对接技术验证了这些关键活性成分和关键靶蛋白之间具有良好的结合能力。参芪五味子主要通过调节Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、癌症通路等发挥治疗焦虑症的作用。结论:参芪五味子可能是通过调节AKT1、IL-6等相关靶点，调控炎性反应、细胞凋亡等过程，发挥抗焦虑的作用。

目的:探究浙贝母-金银花药对治疗糖尿病足的作用机制。方法:通过TCMSP筛选浙贝母-金银花药对的药物成分，使用Swiss Target Prediction预测药物成分的作用靶点，运用GeneCards获取糖尿病足的疾病靶点，利用Venny 2.1获取交集靶点。使用STRING进行蛋白质间作用网络（PPI）分析并使用Cytoscape构建网络图，利用Metascape进行基因本体（GO）及京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析。使用Cytoscape软件构建"药物-靶点-通路"网络图。建立糖尿病足大鼠模型并用浙贝母-金银花药对局部外敷治疗患处，观察治疗效果及检测血清筛选靶点表达。结果:浙贝母-金银花药对中的38个有效成分通过多条通路直接作用于339个疾病靶点治疗糖尿病足，其中木犀草素（Luteolin）、苦叶草素（Picropodophyllin）、天竺葵素（Pelargonidin）、紫鄂贝碱（Ziebeimine）、浙贝乙素（Peiminine）、腺苷（Adenosine）等是核心成分，TP53、EP300、HSP90AA1、CTNNB1、Akt1是至关重要的靶点。基因功能注释分析结果显示，交集基因最可能相关的生物过程主要涉及细胞转录因子结合、细胞对氮化合物反应、激素反应等，细胞组分主要涉及膜筏、质膜筏、小窝等，分子功能主要涉及蛋白激酶活性、磷酸激酶活性、激酶活性等。通路富集分析结果提示浙贝母-金银花药对主要参与PI3K/AKT、HIF-1、EGFR、MAPK等信号通路。浙贝母-金银花药对修复糖尿病足鼠模型的病变部位的效果明显，且血清TP53、EP300、HSP90AA1、CTNNB1、Akt1蛋白表达明显增加。结论:浙贝母-金银花药对治疗糖尿病足的机制是通过调节PI3K/AKT、HIF-1、EGFR、MAPK等信号通路的TP53、EP300、HSP90AA1、CTNNB1、Akt1等疾病靶点，进而调节酶类活性、抗炎等生物过程。

目的:通过网络药理学及分子对接技术探究黄莪胶囊治疗慢性前列腺炎（CP）的作用机制。方法:查询中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及中医药百科全书数据库（ETCM）及相关文献筛选黄莪胶囊的药物成分，使用Swiss Target Prediction预测药物成分的作用靶点；运用GeneCards、OMIM及GisGeNET获取CP的疾病靶点，利用Venny 2.1.0获取交集靶点。使用STRING进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析并使用Cytoscape构建网络图，利用Metascape进行基因本体（GO）富集分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路分析。使用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点-通路"网络图。利用PubChem、PDB及PyMoL、AutoDock软件进行分子对接。结果:研究发现黄莪胶囊中的142个有效成分通过多条通路直接作用于286个疾病靶点治疗CP，其中杯苋甾酮、桑色素、槲皮素、山柰酚、木犀草素、异鼠李素等是核心成分，ESR1、CDK1、APP、SYK、EGFR是重要靶点。基因功能注释分析结果显示，交集基因最可能相关的BP主要涉及细胞对含氮化合物、无机物、有机环化合物的反应等，CC主要涉及膜筏、受体复合物、膜侧等，MF主要涉及蛋白激酶活性、核受体活性、激酶结合等。通路富集分析结果提示黄莪胶囊主要参与磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（PKB/Akt）信号通路、缺氧诱导因子-1（HIF-1）等信号通路。分子对接结果提示核心成分与重要靶点间的结合性较好。结论:黄莪胶囊主要通过调节PI3K/Akt、HIF-1等信号通路的ESR1、CDK1、APP、SYK、EGFR等疾病靶点，干预酶的活性、炎症反应等生物学过程进而治疗CP。

目的:利用网络药理学及分子对接技术探讨黄芪解毒汤(HQJD)治疗乳腺癌正虚毒炽证的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台筛选HQJD的主要活性成分及靶点，利用OMIM、GeneGards和Drugbank数据库等获取乳腺癌正虚毒炽证相关靶点，取交集获得HQJD治疗乳腺癌正虚毒炽证的相关靶点；使用Cytoscape 3.9.1软件在String 11.0数据库基础上构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络以及"药物-活性成分-靶点-疾病"网络，并根据拓扑参数推断HQJD治疗乳腺癌正虚毒炽证的核心活性成分及核心靶点。通过R语言对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析；并对主要活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:筛选得到HQJD活性成分的有效作用靶点230个，乳腺癌正虚毒炽证活性成分15 467个；交集靶点217个；GO功能富集分析显示，HQJD治疗乳腺癌正虚毒炽证主要涉及氧化应激、细胞化学应激等；KEGG通路富集分析显示，HQJD治疗乳腺癌正虚毒炽证主要与磷脂酰肌醇3-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、白介素-17(IL-17)等信号通路有关，分子对接结果显示β-谷甾醇、豆甾醇、木犀草素等主要活性成分与核心靶点具有较好的结合能力。结论:HQJD治疗乳腺癌正虚毒炽证具有多成分、多靶点和多通路的特点，其主要机制可能与PI3K-Akt、IL-17、P53等信号通路有关。

目的:运用网络药理学探讨银杏叶提取物治疗糖尿病视网膜病变(DR)的药理机制和关键靶点。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Swiss target prediction数据库，筛选银杏叶活性成分及其靶点。同时检索GeneCards和DisGENET数据库中DR相关的治疗靶点。取银杏叶活性成分潜在的作用靶点和与DR高度相关治疗靶点的交集作为共有靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析并构建活性成分－靶点网络。根据网络节点的度值参数获取关键活性成分和关键靶点，采用分子对接验证银杏叶关键活性成分与关键靶点的结合作用。结果:筛选得到银杏叶提取物治疗DR的活性成分27个和潜在治疗靶点34个。GO富集分析表明，这些靶点主要与炎症、氧化应激、血管生成和低氧损伤相关；KEGG富集分析表明，通路主要富集于晚期糖基化终末产物及其受体、丝裂原活化蛋白激酶、磷脂酰肌醇3激酶－蛋白激酶B、缺氧诱导因子1、肿瘤坏死因子(TNF)和白细胞介素(IL)-17信号通路。银杏叶活性成分－潜在治疗靶点网络度值显示排名前4位的关键活性成分分别是槲皮素、山柰酚、木犀草素和异鼠李素，排名前8位的关键靶点分别是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、血管内皮生长因子A、IL-6、TNF、内皮型一氧化氮合酶3、过氧化物酶体增生物激活受体γ、IL-10和基质金属蛋白酶9。分子对接显示4个关键活性成分与8个关键靶点之间均具有较好的结合活性。结论:银杏叶提取物含有多种有效成分，可以作用于多个DR治疗靶点，从而调节相应的信号通路，发挥对DR的治疗作用。

[目的]结合数据挖掘及网络药理学,探讨运脾法治疗儿童功能性便秘的用药规律及作用机制.[方法]收集562例功能性便秘患儿病案,采用SPSS Statistic 24.0软件进行聚类分析,SPSS Modeler 18.0软件进行关联规则分析,Liquorice软件进行复杂网络分析,得出核心方药.运用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中药分子机制 生物信息学分析工具(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)数据库筛选核心方活性成分及靶点,通过基因组注释数据平台(Genome Annotation Database Platform,GeneCards)数据库筛选功能性便秘相关靶点,取交集后获得预测靶标.基于蛋白质基因相互作用分析(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,STRING)数据库构建靶基因蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI),利用Cytoscape 3.8.0软件建立核心方成分-便秘-靶点网络图,借助Network Analyzer工具进行拓扑分析,确定核心靶点.基于STRING数据库,使用R语言4.2.2进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析.[结果]所纳病案包含1 121诊次方药记录,各疗程的症状改善率在86％～97％,便秘三大主症的改善率均在90％左右.涉及中药119味,药性以寒、平为主,药味以苦、甘居多,归经多属胃、脾.通过药物关联、聚类和复杂网络分析得到9味药物构成的核心组方.核心组方调治便秘的主要活性成分为槲皮素、甲基庚烯酮、胆汁三烯、烟酸、木犀草素、山柰酚、汉黄芩素.关键靶点包括前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、V-Jun肉瘤病毒17癌基因同源物(V-Jun sarcoma virus 17 oncogene homolog,JUN)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,AKT1)、磷酸肌醇-3-激酶调节亚基 1(phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1,PIK3R1)、磷脂酰肌醇-3-激酶 α 催化亚基(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate-3-kinase catalytic subunit alpha isoform,PIK3CA).对炎症相关通路如磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶 B(phosphatidylinositol-3-kinase/protein kinase B,PI3K/AKT)的调节可能是核心组方改善便秘的作用机制.[结论]运脾法治疗小儿便秘核心方包括麸炒枳实、厚朴、生白术、鸡内金、焦山楂、连翘、决明子、火麻仁、胡黄连,其主要成分可能通过影响炎症因子水平、修复肠道黏膜以恢复肠道平滑肌功能,改善便秘症状,对运脾法的临床应用及儿童功能性便秘的中医药治疗有一定借鉴意义.

目的 基于网络药理学探讨温胆汤对心力衰竭合并抑郁共病同治机制,并通过分子对接初步验证.方法 通过TCMSP数据库与文献搜索得到温胆汤有效成分并预测作用靶点;在GeneCards、OMIM、DisGeNET以及TTD数据库搜索心力衰竭、抑郁症相关疾病靶点,与温胆汤作用靶点取交集.通过STRING平台完成交集靶点的蛋白质相互作用网络的构建并预测核心靶点,并对交集靶点进行基因本体注释及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最后利用分子对接验证核心成分及核心靶点的结合能力.结果 温胆汤治疗心力衰竭合并抑郁的核心成分为木犀草素、川陈皮素、β-谷甾醇、黄芩苷、豆甾醇等,核心靶点主要包括肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、蛋白激酶B1、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53等,通过KEGG主要富集在晚期糖基化终产物及其受体、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B、环磷酸腺苷、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路.分子对接结果表明,木犀草素等核心成分与肿瘤坏死因子、白细胞介素-6等核心靶点的结合活性较好.结论 温胆汤可能通过抑制炎症反应及氧化应激反应、调节神经递质的释放等方面来治疗心力衰竭合并抑郁.

目的:应用网络药理学分析蒲公英-桑叶在急性髓系白血病(AML)发生发展过程的作用,阐明其治疗AML的活性成分和作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)筛选蒲公英-桑叶的活性成分,采用SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶点,在症状映射(SymMap)数据库、人类基因数据库(GeneCards)、DisGeNET数据库和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库中检索AML相关基因和蛋白靶点.对AML相关基因和蒲公英-桑叶靶基因进行比较,确定富集基因,并进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.采用Cytoscape 3.8.0软件根据靶点信息构建药物-有效成分-靶点网络和蛋白-蛋白互作(PPI)网络,采用CytoNCA插件筛选出核心基因,通过AutoDock软件进行分子对接验证.结果:对数据库检索结果进行筛选后得到39种有效成分,收集蒲公英-桑叶与AML的共同靶点148个.GO功能富集分析主要涉及细胞因子介导的信号传导途径、激酶活性正向调节和氧化应激反应等.KEGG信号通路富集分析主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路和Janus激酶/信号转导和转录激活因子(JAK/STAT)信号通路等.拓扑分析得到信号转导和转录激活因子3(STAT3)、表皮生长因子受体(EGFR)、蛋白激酶B1(AKT1)、重组人表皮生长因子(EGF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、原癌基因MYC、肿瘤蛋白P53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3(CASP3)、肉瘤基因SRC、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、连环蛋白B1(CTNNB1)、磷酸肌醇3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、白细胞介素6(IL-6)、TNF、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和磷酸肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)等核心靶点.分子对接,结合亲和力最高的配对结果为蒲公英萜醇(taraxerol)与MYC(-8.74 kcal·mol-1),槲皮素(quercetin)、kaemfprol、木犀草素(luteolin)和 artemetin 与各个靶点均有很好的结合亲和力.结论:蒲公英-桑叶主要活性成分quercetin、taraxerol、kaemfprol、luteolin和 artemetin可能通过调控 AKT1、STAT3、HSP90AA1、IL-6 和 MAPK1 发挥抗 AML 的作用,对PI3K-AKT信号通路的调节是蒲公英-桑叶发挥抗AML作用的重要机制.

目的:网络药理学探究壮医清毒伸筋方治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制.方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、人类在线孟德尔遗传数据库(OMIM)、人类基因数据库(GeneCards)获取清毒伸筋方与RA交集靶点.网络可视化和分析软件(Cytoscape)获取主要活性成分,归一化相互匹配法(NCC)计算核心靶点.对核心靶点进行基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,用分子对接分析主要活性成分与核心靶点的结合力.构建胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠模型验证主要蛋白浓度.结果:获得145种活性成分和238个药靶点,交集靶点151个.富集分析提示交集靶点涉及19个GO富集分析条目和晚期糖基化终末产物(AGEs)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等75条信号通路.主要活性成分为槲皮素、柄花黄素、豆甾醇、木犀草素、β-谷甾醇;分子对接结果显示它们与前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)等蛋白具有良好的结合性.动物实验验证,清毒伸筋方有效减轻CIA大鼠关节肿胀程度,显著降低血清MMP9、AKT1和PTGS2浓度.结论:清毒伸筋方发挥多成分、多靶点、多通路特点作用于RA的炎症级联反应.