肠菌作为肠道微生态最主要的构成成分直接或间接地调控宿主的表观遗传修饰、各种代谢和黏膜乃至全身免疫功能，对结直肠癌的生物学行为产生较大的影响。尽管某些肠菌参与结直肠癌进程的详细机制尚未明了，但其作为结直肠癌早期预警、预后预测的可能标志物及治疗和预防的潜在靶点，为结直肠癌防治带来新希望。

氧化三甲胺（TMAO）是膳食中胆碱等物质经肠道微生物代谢后产生的一种生物活性分子，与诸多疾病如心血管疾病、慢性肾脏疾病（CKD）和2型糖尿病等密切相关。CKD患者的肠道微生态发生改变，参与代谢生成TMAO的菌群丰度明显升高，导致TMAO水平升高；由于TMAO主要通过肾脏排泄，肾脏功能障碍造成其在体内的进一步蓄积，导致CKD进一步恶化。本文主要阐述了TMAO与CKD的相互作用及相关机制的研究进展，提示TMAO可作为CKD疾病风险的新型生物标志物，且以TMAO为治疗靶点可减少TMAO的代谢生成，并降低循环中TMAO的水平，将为预测和改善CKD提供更多的防治思路。

菌斑微生物之间存在复杂的相互作用，在环境因素的影响下可使群落产生重构，促进牙周炎的发生与发展。关键微生物在调节微生物群落动态变化中十分重要。在牙周微生态中，共存网络构建和分析的方法有助于筛选牙周炎相关的关键微生物以便进一步进行实验研究。这些微生物如牙龈卟啉单胞菌等可以作为微生物成员的重要联络者协同调节群落毒力等特征，或作为响应环境因素的重要调控因子如介导免疫失衡推动群落结构和功能重塑。本文将从微生物共存网络构建、应用网络拓扑分析技术进行关键微生物筛选与预测，以及与牙周炎发生发展相关的关键微生物等方面进行综述，为进一步确定关键微生物以及研究此类微生物在群落动态变化中的作用提供参考。

目的:探索重度特应性皮炎（AD）成人患者急性期及缓解期皮肤微生态结构和功能的变化特点。方法:采集2019年10月至2020年11月于广州市皮肤病防治所门诊就诊的4例成人重度AD患者急性期和缓解期5个部位（面颊、肘窝、手背、腹部、下肢）皮屑标本，利用第二代高通量测序技术进行宏基因组测序，构建皮肤微生物样本基因集，获得各个样本的物种注释信息并进行生物信息学数据分析。结果:4例重度AD患者皮肤中，共检测到18个门，37个纲，73个目，142个科，237个属，331个种。与急性期相比，缓解期AD患者皮肤微生物群落多样性上升，皮肤微生物的相对丰度发生变化（ P < 0.05）。在微生物种水平上，金黄色葡萄球菌对AD急性期的影响程度最高，表皮葡萄球菌、奥斯陆莫拉菌、弗朗西丝菌、科氏葡萄球菌、沃氏葡萄球菌、球形马拉色菌以及限制性马拉色菌在AD缓解期富集（｜lg线性判别分析值｜ > 2，Kruksal-Wallis检验，均 P < 0.05）。对微生物丰度差异基因行KEGG功能通路分析，共注释富集于355个功能通路，其中显著富集的通路38个（均 P < 0.05），主要涉及金黄色葡萄球菌感染、色氨酸代谢、组氨酸代谢、氮代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成与降解、脂肪酸降解及过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路等。 结论:重度AD患者急性期和缓解期皮肤微生态结构存在显著差异，预测其可能与多个功能通路（如金黄色葡萄球菌感染、色氨酸代谢、组氨酸代谢、氮代谢等）水平相关。

糖尿病皮肤病变是最常见但最容易被忽视的糖尿病并发症之一，严重影响患者的生存质量，甚至导致糖尿病足的发生。近年来研究提出，糖尿病皮肤病变可在一定程度上预测糖尿病并发症的进展、糖尿病足的发生，因此对于糖尿病皮肤病变的早期诊断及治疗具有重要意义。但目前关于糖尿病皮肤病变的发病机制仍未完全阐明，糖尿病皮肤病变的早期防治也未引起临床上的重视，因此不乏见到因皮肤病变导致严重糖尿病足并最终截肢的病例。该文结合国内外最新进展，从皮肤结构、慢性炎症损伤、皮肤微环境等方面，归纳总结糖尿病患者皮肤病变的病理生理改变，探讨糖尿病皮肤功能障碍潜在的发病机制，阐述皮肤微生态对于糖尿病皮肤病变的影响，为糖尿病皮肤病变的早期诊断和治疗提供理论依据。

结直肠癌是常见的消化道恶性肿瘤，其发生发展与肠道微生态密切相关。肠道菌群主要通过释放毒素、产生代谢物等，改变宿主肠道免疫环境，影响肠道屏障功能，参与结直肠癌的发生发展。肠道菌群可以作为生物标志物，用于结直肠癌的早期筛查、预测预后等。此外，肠道菌群还可以影响结直肠癌的化疗、放疗及免疫治疗效果。笔者就肠道微生态在结直肠癌的发生发展、筛查、预后预测及治疗中的作用进行评述，探讨其在结直肠癌预防和治疗中的应用前景。

目的:探讨肠道菌群移植（FMT）对重症肺炎恢复期患者肠道微生态和机体的影响。方法:采用前瞻性非随机对照研究方法，选择2021年12月至2022年5月广州医科大学附属第一医院收治的接受FMT的重症肺炎恢复期患者（FMT组），以及同期住院未接受FMT的重症肺炎恢复期患者（非FMT组）。比较两组患者入组前1 d和入组后10 d临床观察指标、胃肠道功能及粪便性状等差异。采用16S rDNA基因测序技术分析FMT组患者入组前后肠道菌群多样性及差异物种的变化，并进行京都基因与基因组百科全书数据库（KEGG）代谢通路分析预测；采用Pearson相关法分析FMT组患者肠道菌群与临床观察指标的相关性。结果:FMT组患者入组后10 d三酰甘油（TG）水平较入组前显著降低〔mmol/L：0.94（0.71，1.40）比1.47（0.78，1.86）， P<0.05〕；非FMT组患者入组后10 d高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）水平较入组前显著降低（mmol/L：0.68±0.27比0.80±0.31， P<0.05）。两组患者其他临床观察指标、胃肠道功能及粪便性状评分等在入组前后差异均无统计学意义。多样性分析显示，FMT组患者入组后10 d肠道菌群?α?多样性指数均显著高于非FMT组，且?β?多样性亦与非FMT组存在显著差异。差异物种分析显示，与入组前比较，FMT组患者入组后10 d肠道菌群门水平中变形杆菌门相对丰度明显降低〔8.554%（5.977%，12.159%）比19.285%（8.054%，33.207%）， P<0.05〕，梭杆菌门相对丰度明显升高〔6.801%（1.373%，20.586%）比0.003%（0%，9.324%）， P<0.05〕；肠道菌群属水平中丁酸单胞菌属、梭杆菌属及双歧杆菌属等相对丰度均明显升高〔丁酸单胞菌属：1.634%（0.813%，2.387%）比0%（0%，0.061%），梭杆菌属：6.801%（1.373%，20.586%）比0.002%（0%，9.324%），双歧杆菌属：0.037%（0%，0.153%）比0%（0%，0%），均 P<0.05〕。KEGG代谢途径通路分析显示，FMT组患者肠道菌群在双酚降解、矿物质吸收、磷酸盐和次磷酸盐代谢、心肌收缩及帕金森病等代谢通路与疾病中发生改变。相关性分析显示，FMT组患者肠道菌群中放线菌门与前白蛋白（PA）呈显著正相关（ r＝0.53， P＝0.043），拟杆菌门与血尿素氮（BUN； r＝0.56， P＝0.029）和补体C3（ r＝0.57， P＝0.027）呈显著正相关，厚壁菌门与BUN（ r＝0.56， P＝0.029）和补体C3（ r＝0.57， P＝0.027）呈显著正相关，梭杆菌门与免疫球蛋白M（IgM）呈显著正相关（ r＝0.71， P＝0.003），变形杆菌门与降钙素原（PCT； r＝0.63， P＝0.012）和补体C4（ r＝0.56， P＝0.030）呈显著正相关。 结论:FMT能降低重症肺炎恢复期患者TG水平，重建肠道微生态结构，改变机体代谢和功能，通过降低有害菌相对丰度缓解机体的炎症反应。

目的:探究胃癌新辅助化疗不同应答肿瘤微生物组学的改变。方法:采用回顾性观察性研究的方法，收集2017年1月至2023年1月期间，青岛大学附属医院胃肠外科肿瘤样本库中病理确诊为胃腺癌、无转移及术前仅接受新辅助化疗并成功接受胃癌根治术的31例胃癌患者术后新鲜冷冻标本；排除出现转移或其他原发肿瘤病灶和术前1个月内接受过其他转化治疗包括免疫治疗、靶向治疗和益生菌的患者。采用第8版美国癌症联合委员会（AJCC）分期系统和美国病理学家协会肿瘤消退分级系统（TRG）对患者进行分级和分组，TRG 0~1级、ypT0~1和ypN0被归类为新辅助化疗有反应组（12例），而TRG 2~3级和ypT2~4或ypN+则被归类为新辅助化疗无反应组（19例）。采用16S rRNA测序技术对新鲜冷冻样本进行处理和分析。使用QIIME2的Q2-diversity插件进行Alpha多样性和Beta多样性分析，使用STAMP找出默认参数和两组之间的差异富集细菌类群。通过效应大小线性判别分析进行高维类比较，使用PICRUST2（v2.3.0-b）软件预测微生物组的潜在功能分布。结果:新辅助化疗有反应组与无反应组胃癌患者在性别、年龄、体质指数、吸烟史、肿瘤位置、新辅助化疗前的肿瘤cTNM分期和新辅助化疗方案方面比较，差异没有统计学意义（均 P>0.05），但两组的肿瘤长径和新辅助化疗后的肿瘤ypTNM分期差异均具有统计学意义（均 P=0.001）。胃部微生态的Alpha和Beta多样性结果显示，两组Alpha多样性差异没有统计学意义（ P>0.05），而两组Beta多样性差异却有统计学意义（ P=0.004）。红螺菌科（ Coriobacteriaceae）、瘤胃球菌科（ Ruminococcaceae）、韦荣球菌科（ Veillonellaceae）和毛螺菌科（ Lachnospiraceae）等4种科水平细菌分类群在新辅助化疗有反应组患者中富集，而以 Proteobacteria（变形菌门）为主的4种细菌分类群在新辅助化疗无反应组患者中富集。柠檬酸循环和丙氨酸等在内的各种氨基酸的代谢通路被发现具有潜在预测意义。 结论:不同新辅助化疗反应结果的胃癌患者在胃部微生态的丰度和组成方面存在差异。

目的:研究儿童失神癫痫（CAE）的生态学执行功能损害情况及其影响因素。方法:2017年4月至2020年7月采用执行功能行为评定量表（BRIEF）父母版对安徽省儿童医院40例CAE患儿（CAE组）和40例健康体检儿童（对照组）进行生态学执行功能评估，比较两组生态学执行功能的差异。结果:CAE组BRIEF总分、行为管理指数（BRI）和元认知指数（MI）明显高于对照组[（52.03 ± 10.89）分比（44.05 ± 5.06）分、（49.45 ± 9.93）分比（43.85 ± 4.70）分和（53.18 ± 11.24）分比（44.95 ± 5.32）分]，差异有统计学意义（ P<0.01）。多元逐步回归分析结果显示，抑制、转换、感情控制、任务启动、工作记忆、计划、组织、任务监控、MI、总分与疾病控制与否相关（ P<0.01），疾病控制与否对其有负向预测作用（总解释度 R2 = 0.174、0.158、0.234、0.325、0.383、0.337、0.378、0.199、0.463和0.435）；BRI与首发年龄、疾病控制与否相关（ P<0.01或<0.05），首发年龄、疾病控制与否对BRI有负向预测作用（总解释度 R2 = 0.336）。 结论:CAE患儿存在明显的生态学执行功能缺陷，疾病控制与否及首发年龄是影响CAE患儿生态学执行功能障碍的主要因素。

低甲烷排放转基因水稻是实现水稻低碳生产的理想材料.土壤微生物驱动了稻田甲烷的产生,低甲烷排放转基因水稻土壤微生物群落组成的变化不仅影响稻田甲烷排放,也关系到土壤微生态系统的稳定性.通过对细菌16S rRNA基因、真菌ITS基因的高通量测序及mcrA、nifH、amoA和nirS等功能基因的荧光定量PCR,分析了低甲烷排放转基因水稻(86R27-3)与野生型水稻(MH86)土壤微生物群落间的差异.结果显示:稻田土壤细菌群落的α-多样性指数在86R27-3与MH86间无明显差异,且仅在水稻分蘖期86R27-3的土壤真菌群落多样性指数Shannon、Simpson及均匀度指数Pielou_e显著高于MH86(P＜0.05);β-多样性分析表明土壤细菌或真菌群落组成在86R27-3与MH86间均没有显著差异;但在水稻齐穗期:86R27-3 土壤的放线菌门(Actinobacteria)、罗泽真菌门(Rozellomycota)的相对丰度显著高于MH86(P＜0.05),而酸杆菌门(Acidibacteria)、子囊菌门(Ascomycota)的相对丰度显著低于MH86(P＜0.05);土壤微生物群落功能预测显示,86R27-3 土壤氮、硫和锰代谢细菌功能群丰度显著低于MH86(P＜0.05),如分蘖期的土壤硝酸盐还原、硝酸盐呼吸、硫代硫酸盐呼吸及硫呼吸,齐穗期和成熟期的好氧亚硝酸盐氧化及成熟期的锰氧化等;与MH86相比,86R27-3的土壤真菌功能群丰度有减有增,如在水稻不同生育期内的其未定义腐生物银耳目、嗜热囊菌科、镰刀菌属及韦斯特氏菌功能群丰度显著降低(P＜0.05),而其分蘖期的动物内共生体腐生生物毕赤酵母属和未定义腐生物马勃科功能群丰度显著提高(P＜0.05).定量PCR分析表明86R27-3 土壤中的产甲烷细菌mcrA基因丰度显著低于MH86(P＜0.05),同时,土壤固氮菌nifH基因、氨氧化细菌amoA基因及反硝化细菌nirS基因的丰度在86R27-3土壤中也显著降低(P＜0.05).综上所述,低甲烷排放转基因水稻(86R27-3)对土壤细菌或真菌的群落组成没有影响,但可引起主要细菌或真菌种类的相对丰度及某些细菌或真菌功能群丰度发生变化,并显著降低了稻田土壤微生物功能基因丰度.