目的:探讨甘肃省肾综合征出血热（HFRS）自然疫源地现状特征。方法:收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物（鼠类）密度监测资料，应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果:2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例，死亡4例，年发病率在0.05/10万~1.21/10万之间，病例主要分布于甘肃省东部的平凉市、东南部的天水市、南部的甘南藏族自治州（甘南州），以及中部以南的定西市；20~60岁年龄组居多，男女性别比为1.85∶1（564∶305），职业以农民（61.80%，537/869）、牧民（19.79%，172/869）和学生（6.33%，55/869）为主。野鼠型发病以每年11月至次年1月为高峰。啮齿类宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主，汉滩病毒携带率分别为2.79%（21/754）、0.42%（5/1 179）和0.31%（2/643）。甘肃省目前确定了3个疫源地，其中2个分别是平凉市和甘南州的新发疫源地，另1个为定西市的老疫源地。结论:甘肃省南部、中部以南和东部地区是目前主要的HFRS疫源地，宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主，病毒基因型为汉滩病毒。病例报告地区应加强疫情的监测，疫情重点地区应强化和落实各项预防和控制措施，以减少HFRS带来的危害。

目的:调查确定云南省玉龙县鼠疫自然疫源地的流行范围，并评估其流行风险，为鼠疫监测及防控工作提供依据。方法:2017年，在玉龙县8个乡镇，每个乡镇根据地理景观、海拔、人口、面积等各选取2 ~ 3个自然村作为调查样点，10 - 11月采用夹（笼）夜法捕获小型兽类宿主动物及其寄生蚤，采集宿主动物脏器等分离鼠疫菌，并用胶体金试纸条检测鼠疫F1抗原和抗体，自毙小型兽类标本同时进行反向间接血凝试验（RIHA）检测鼠疫特异性抗原；采集犬、猫、鼠等指示动物血清使用间接血凝试验（IHA）进行鼠疫F1抗体检测。结果:共获包括自毙小型兽类在内的宿主动物1 019只，隶属4目6科12属22种。其中工具捕获小型兽类1 016只，室外996只，室外捕获率为25.28%（996/3 940），其构成为齐氏姬鼠占30.32%（302/996）、斯氏家鼠占22.09%（220/996）、大绒鼠占17.37%（173/996）、灰麝鼩占12.35%（123/996），均是调查区小型兽类的优势种；社鼠占8.13%（81/996）、大足鼠占4.02%（40/996）、褐家鼠占1.81%（18/996），均为常见种。居民区室内共捕获小型兽类9种20只，捕获率为1.11%（20/1 800）。其中褐家鼠占30.00%（6/20）、大足鼠占25.00%（5/20）、小家鼠占10.00%（2/20），均为居民区优势鼠种。8种18只小型兽类染带寄生蚤67匹，隶属3科5属5种，总染蚤率为1.77%（18/1 019），总蚤指数为0.070。居民区室内获寄生蚤49匹，3种4只小型兽类染带寄生蚤，染蚤率为19.05%（4/21），蚤指数为2.333。其中缓慢细蚤染蚤率最高，为9.52%（2/21），蚤指数为0.571；猫栉首蚤指名亚种蚤指数最高，为1.571，染蚤率为4.76%（1/21），二者为居民区小型兽类体表主要寄生蚤种。室外5种14只小型兽类染带寄生蚤18匹，染蚤率为1.40%（14/998），蚤指数为0.018。其中缓慢细蚤染蚤率最高，为0.50%（5/998），蚤指数为0.005；特新蚤指名亚种染蚤率次之，为0.40%（4/998），蚤指数为0.004；方叶栉眼蚤的蚤指数最高，为0.007，染蚤率排第三，为0.30%（3/998）；棕形额蚤指名亚种的染蚤率和蚤指数均最低，分别为0.20%（2/998）和0.002。方叶栉眼蚤、缓慢细蚤和特新蚤指名亚种为室外小型兽类体表主要寄生蚤种。共采集指示动物血清419份，其中犬血清402份，IHA检测结果阳性1份，阳性率为0.25%（1/402）；猫、鼠血清共17份，IHA检测结果均为阴性。小型兽类脏器分离培养鼠疫菌、胶体金试纸条检测均为阴性；自毙小型兽类RIHA检测阴性。结论:玉龙县鼠疫自然疫源地新增一个鼠疫指示动物阳性点，应加强该区域的鼠疫疫情监测和防控。

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌（以下简称鼠疫菌）引起的一种烈性传染病，发病急、传播快且病死率极高。历史上发生过3次鼠疫大流行，导致上亿人口死亡。近20年来全球鼠疫疫情呈上升趋势，2000 - 2018年，世界卫生组织（WHO）共收到来自美洲、非洲和亚洲21个国家报告的2万多起鼠疫病例 [1]。我国动物间鼠疫一直较为活跃，且除个别年份外，几乎每年都有人间鼠疫发生。2019年11月，北京市首先出现2例内蒙古自治区输入性肺鼠疫病例，随后内蒙古自治区又报道2例腺鼠疫病例，提示这一甲类传染病仍对人们的生命安全具有极大的潜在威胁 [2,3,4]。链霉素是WHO鼠疫手册 [5]和我国《鼠疫诊疗方案（试行）》（卫办应急发[2011]第18号） [6]中治疗鼠疫的首选药物。但值得注意的是，2021年Dai等 [7]发现国内1株鼠疫菌因编码核糖体蛋白S12的rpsL基因第128 bp位点的碱基发生了突变，从而产生了对链霉素的高度耐药性。为此，本研究应用基于TaqMan-MGB荧光探针的实时荧光PCR法（简称MGB荧光探针法），选取鼠疫流行较为严重的玉树藏族自治州（以下简称玉树州）鼠疫自然疫源地内分离的鼠疫菌，检测链霉素耐药位点rpsL基因第128 bp位点碱基的突变情况，判断当地菌株的耐药情况，为鼠疫疫情的防控提供参考。

目的:研究甘肃省鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）的规律成簇的间隔短回文重复序列（CRISPR）位点多态性及地区分布。方法:选取1962-2014年分离的203株鼠疫菌，培养并提取DNA。采用3对CRISPR引物对菌株DNA进行PCR扩增，对PCR产物进行测序。根据菌株CRISPR位点的间区序列种类和排列情况，确定菌株的基因型（类群），采用BioNumerics 5.10软件进行聚类分析。结果:203株鼠疫菌发现有16种间区序列，包括YPa位点9种、YPb位点4种、YPc位点3种，发现新的间区序列a1′。共发现5个CRISPR基因簇，分别为Cb2、Ca7、Ca7′、CaΔ5′、Ca35′。不同的基因簇呈现区域性特征：Cb2主要分布在会宁县、平川区，Ca7主要分布阿克塞哈萨克族自治县；Ca7′主要分布在夏河县；Ca35′主要分布肃北蒙古族自治县、玉门市；CaΔ5′主要集中在肃南裕固族自治县。结论:CRISPR分子分型方法能够较好地区分甘肃省不同疫源地的菌株，且各基因簇呈现一定的区域性特征。对研究甘肃省鼠疫菌进化规律和人间疫情分子生物学溯源有一定意义。

目的:了解甘肃喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物耶尔森菌感染状况，为探索该疫源地鼠疫流行状态提供依据。方法:2014 - 2018年，现场采集20世纪50 - 60年代鼠疫活跃疫源地甘肃夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物肠回盲部及内容物、咽拭子（或舌根部）、血液样本，分别进行耶尔森菌分离、毒力测定及鼠疫耶尔森菌F1抗体检测。结果:958份回盲部及内容物样本检出24株耶尔森菌，检菌率为2.51%，分别为13株小肠结肠炎耶尔森菌（ Yersinia enterocolitia，Y.e）、1株克氏耶尔森菌（ Yersinia kristensenii，Y.k）、2株弗氏/中间耶尔森菌（ Yersinia frederiksenii/intermedia，Y.f/i）、6株中间耶尔森菌（ Yersinia intermedia，Y.i）、1株奥氏耶尔森菌（ Yersinia aldouae，Y.a）、1株 Yersinia massiliensis（Y.m）。958份咽拭子（或舌根部）样本检出19株耶尔森菌，检菌率为1.98%，分别为8株Y.e、1株假结核耶尔森菌（ Yersinia pseudotuberculosis，Y.p）、4株Y.k、1株Y.f/i、4株Y.i、1株 Yersinia ruckeri（Y.r）。检出的21株Y.e均没有致病性，毒力型别有ail -ystA -ystB +yadA -virF -rfbc -、ail -ystA -ystB -yadA -virF -rfbc -两种，分别占9.52%（2/21）、90.48%（19/21）。1 079份血清样本F1抗体检测结果均为阴性。 结论:夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物咽部及肠道内广泛存在耶尔森菌群，检出的Y.e均为非致病性菌株。本次调查结果为进一步研究该疫源地鼠疫耶尔森菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。

目的:分析甘肃省肃北、肃南县喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地内气象因素对鼠疫流行的影响。方法:收集1973 - 2016年肃北、肃南2个县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫监测资料（来源于甘肃省疾病预防控制中心）和当年及领先1、2、3年（相对于当年作为参照的前1、2、3个年份）的气象因素（年均降雨量、气温、相对湿度）资料（来源于中国气象数据共享服务网）。采用R2.3.2软件，以年鼠疫检菌阳性率为因变量，气象因素为自变量建立时间序列半参数广义相加模型（generalized additive model，GAM），采用非线性效应关系定量研究气象因素对鼠疫的影响。结果:2006 - 2016年与1974 - 1983年相比，年均气温、相对湿度、降雨量的平均值肃北县分别上升了0.99 ℃、3.55%RH、12.16 mm；肃南县分别上升了1.00 ℃、2.01%RH、14.60 mm。1973 - 2016年共发生11起人间鼠疫，发病12例，死亡7例。肃北县鼠疫疫源地内领先3年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加0.40%；领先2年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.66%。肃南县鼠疫疫源地内领先1年年均降雨量在一定范围内每升高1.00 mm，动物鼠疫发生增加1.32%；领先3年年均相对湿度在一定范围内每升高1.00%RH，动物鼠疫发生增加11.96%。另外，肃北、肃南县领先2年年均气温在一定范围内每升高1.00 ℃，动物鼠疫发生分别增加73.17%、70.18%。结论:甘肃省肃北、肃南县鼠疫的发生流行与气象因素关系密切，一定范围内的年均气温上升对鼠疫的流行不仅有明显的促进作用，而且存在滞后效应。另外，同一疫源地内不同类型气候对动物鼠疫流行的影响存在一定差异。

目的:了解云南省大臭鼩携带鼠疫噬菌体情况，探讨其流行病学意义。方法:2015 - 2018年，在云南省家鼠鼠疫历史疫源地、新增疫源地（1982年后）和顽固疫源地的10个调查点进行鼠疫宿主动物调查。利用大臭鼩的肠道标本分离培养鼠疫噬菌体，采用双层平板法观察噬菌斑的生长情况，电镜下观察鼠疫噬菌体的形态结构，同时检测肠道标本鼠疫耶尔森菌特异标识基因F1抗原结构基因caf1。结果:共捕获大臭鼩157只，分离出16株鼠疫噬菌体，总分离率为10.19%；历史疫源地（10.00%，1/10）与顽固疫源地（16.22%，12/74）、新增疫源地（4.11%，3/73）的鼠疫噬菌体分离率比较差异均无统计学意义（χ 2 = 0.00， P = 0.965；Fisher检验， P = 1.000），而顽固疫源地与新增疫源地鼠疫噬菌体分离率比较差异有统计学意义（χ 2 = 5.88， P = 0.015）；不同性别、生长发育期和生境鼠疫噬菌体的分离率比较差异均无统计学意义（均 P > 0.05）；分离噬菌体的噬菌斑形态表现多样；电镜下显示4株噬菌体均为肌尾病毒科噬菌体；所有标本F1抗原结构基因caf1检测均为阴性。 结论:大臭鼩在云南省家鼠鼠疫疫源地分布广泛，且该动物携带一定数量的鼠疫噬菌体。定期对大臭鼩及其携带噬菌体进行监测，对云南省鼠疫监测预警有一定的指导意义。

目的:调查云南省3个县（市）人群和犬猫弓形虫血清流行病学现状及其影响因素，评估犬猫将弓形虫传播给人类并致病及流行的风险。方法:选择云南省弥勒市、芒市和梁河县3个家鼠鼠疫疫源地所在县（市）作为调查地区，采集16个自然村的人群及犬猫血样，采用间接酶联免疫吸附试验检测血清弓形虫IgG抗体，并对其影响因素进行logistic回归分析。结果:共检测368份人血清、307份犬血清、12份猫血清，弓形虫IgG抗体阳性率分别为54.62%（201/368）、90.88%（279/307）、91.67%（11/12）。logistic回归分析显示，芒市和梁河县人群弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）分别是弥勒市的8.20倍（ AOR = 8.20，95% CI：4.38 ~ 15.36）、2.22倍（ AOR = 2.22，95% CI：1.24 ~ 3.97）；30 ～ < 40岁年龄组人群弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）比< 30岁年龄组减少57%（ AOR = 0.43，95% CI：0.19 ~ 0.98，均 P < 0.10）。梁河县犬弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）比弥勒市减少89%（ AOR = 0.11，95% CI：0.02 ～ 0.47）；2岁及以上犬弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）是2岁以下犬的2.05倍（ AOR = 2.05，95% CI：0.91 ～ 4.64，均 P < 0.10）。 结论:云南省3个家鼠鼠疫疫源地所在县（市）人群和犬猫血清弓形虫IgG抗体阳性率均较高，人群和犬弓形虫感染风险（血清IgG抗体阳性）与地区和年龄有关，犬猫将弓形虫传播给人类及其他动物的风险较大，应加强重点区域监测，开展健康教育，并采取相应卫生措施。

目的:了解舟山海岛地区蜱类所携带的病原体多样性及其基因同源性。方法:2020年4—11月，采用布旗法收集舟山海岛地区发热伴血小板减少征病例居住地周围环境中的游离蜱，采用畜体检查法采集家畜身上的寄生蜱。蜱样本提取RNA或DNA进行荧光RT-PCR检测，以嗜吞噬细胞无形体、立克次体、查菲埃里克体、新型布尼亚病毒、汉坦病毒、汉城病毒、沃尔巴克体、山羊无形体为引物进行PCR扩增初筛。扩增序列测序后进行同源性分析，以邻接法构建系统进化树。结果:共采集蜱样本99只，其中游离蜱样本39只，寄生蜱样本60只。在蜱样本中检出嗜吞噬细胞无形体、立克次体、沃尔巴克体和山羊无形体核酸阳性。此次检出的沃尔巴克体与日本报道的沃尔巴克体（AB025965）同源性为98.70%；立克次体与中国云南立克次体03（KY433580）、日本立克次体LA16同源性为99.83%；嗜吞噬细胞无形体有2个进化分支：一个进化分支与安徽桐城（MK045683）及韩国济州岛（GU064903）的嗜吞噬细胞无形体同源性为100.00%，另一个进化分支与安徽金寨的嗜吞噬细胞无形体（MK045694）同源性为99.70%。结论:舟山海岛地区是嗜吞噬细胞无形体、山羊无形体和日本立克次体的自然疫源地，暴露居民存在感染风险。

目的:分析贵州省鼠疫疫源地监测结果，掌握当地鼠疫疫情动态，以便制订防控措施。方法:于中国疾病预防控制信息系统鼠疫防治信息管理系统，收集2018 - 2020年贵州省鼠疫监测点的鼠疫监测数据，分析贵州省鼠疫疫情。监测数据中鼠类动物捕获方法为笼夹法、5 m笼夹法和逐日捕鼠法，实验室检测采用细菌培养法和血球凝集法。结果:室内采用笼夹法共捕获鼠类动物2 273只，以褐家鼠为优势种，占47.29%（1 075/2 273）；黄胸鼠和小家鼠为常见种，分别占43.55%（990/2 273）和5.10%（116/2 273）。室外采用5 m笼夹法共捕获鼠类动物1 460只，以斯氏家鼠为优势种，占35.48%（518/1 460）；黄胸鼠和大绒鼠为常见种，分别占16.03%（234/1 460）和8.70%（127/1 460）。共检查鼠类动物5 742只（其中包括笼夹法和5 m笼夹法捕获的3 733只以及逐日捕鼠法捕获的2 009只），检出带蚤鼠类动物1 176只，鼠体染蚤率为20.48%；印鼠客蚤占56.63%（3 020/5 333），为优势蚤种，印鼠客蚤指数为0.53。实验室检测结果均为阴性。结论:贵州省鼠疫疫源地仍然处于静息状态，但不能排除复燃的可能。应进一步加强鼠疫监测工作，提高鼠疫监测质量，做好健康教育宣传，严防人间鼠疫暴发流行。