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RPS:一种为合成代谢途径推荐宿主生物和外源酶的软件工具
编辑人员丨6天前
为合成代谢途径选择宿主生物,并为合成代谢途径中的外源反应确定外源酶是合成生物学和代谢工程的两大挑战问题.自然界中存在成千上万种微生物和生物合成反应,仅通过生物实验来确定这些目标既昂贵又耗时.本文设计开发了一种名为RPS(recommend metabolic pathway's species)的新型生物推理软件系统,以辅助合成代谢途径的设计.RPS软件可根据竞争性内源反应的比例和途径末端代谢物的数量为合成代谢途径推荐合适的宿主生物,并通过酶的系统发育距离和反应动力学信息为宿主生物中的外源反应识别合适的外源酶.有别于已有的以宿主为中心的合成代谢途径设计工具,RPS软件以代谢途径为中心的特点可帮助研究人员以不同视角评估合成代谢途径设计.实验结果表明,RPS软件工具可准确识别合成代谢途径潜在的宿主生物,并为合成代谢途径中的外源反应发现合适的外源酶.用户可通过https://biolab.gxu.edu.cn/RPS在线使用RPS软件工具.
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编辑人员丨6天前
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中国网民对糖尿病的关注程度和信息需求分析
编辑人员丨6天前
目的:分析中国网民对糖尿病的关注程度和信息需求。方法:利用百度指数,对截至2019年4月4日的网络用户检索关键词“糖尿病”的数据从趋势分析、地域分布、人群属性分析、热门检索词分析等四个维度进行分析。结果:我国网民对“糖尿病”整体搜索量呈现上升趋势,尤其是移动端搜索;检索量排名前十的地区以经济发达地区为主(如广东、江苏、浙江等),其糖尿病发病率高于全国平均水平;糖尿病发病率最高的人群(≥50岁组)和网民数量最多的人群(<30岁组)均很少使用网络搜索糖尿病相关信息(分别占比10.0%和17.0%);网民数量及糖尿病患病率无男女差异,但男性比女性更倾向于搜索糖尿病相关信息(分别占比63.0%和37.0%)。热门检索词分析发现早期症状、治疗目标和饮食处方是出现频次最高的词类。结论:我国网民对糖尿病相关信息保持较高关注度,还具有信息内容需求差异、获取信息的渠道变化、信息传播的时间波动性、信息需求的地域和年龄差异等特点。
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编辑人员丨6天前
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中国5岁以下儿童个体呼吸道合胞病毒重症感染风险预测工具开发及验证
编辑人员丨6天前
目的:构建适用于中国五岁以下儿童的呼吸道合胞病毒(RSV)重症感染风险预测模型,应用外部数据对模型进行初步验证,开发可供儿童家长使用的个体化风险预测工具。方法:以RSV感染后入院作为重症感染标志,应用RSV住院相关危险因素证据和中国5岁以下儿童中各危险因素流行率等真实世界数据,构建基于蒙特卡罗方法的5岁以下儿童个体RSV住院风险预测模型,以苏州市为例,对模型进行外部验证,并在微信小程序平台开发交互式风险预测工具(RSV HeaRT)。结果:模型估算结果显示,在中国5岁以下儿童中,如人群不具有任何RSV重症感染风险因素,则RSV 年住院率为2.2/1 000(95% CI:0.9/1 000~7.5/1 000),基于该基线住院率,代入苏州市相关危险因素流行率,模型预测苏州市每年5岁以下儿童RSV住院率为8.0/1 000(95% CI:4.6/1 000~24.4/1 000),与文献报道的苏州RSV住院率(10/1 000~20/1 000)接近。在开发的RSV HeaRT微信小程序中,目标用户(如儿童家长)在小程序中输入儿童的基本信息、疾病史和社会环境因素等信息后,工具可实时反馈以下预测结果:与一般儿童相比,当前儿童因感染RSV而住院的相对风险;未来一年内因感染RSV而住院的概率;如发生RSV感染住院,住院期间出现不良结局的相对风险。 结论:本研究基于RSV住院风险相关的真实世界证据,结合中国5岁以下儿童的危险因素流行现状,构建了适用于中国儿童的RSV住院风险预测模型,初步证明了该预测模型结果的准确性,基于此设计开发的RSV HeaRT可便于家长对儿童住院风险进行评估。
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编辑人员丨6天前
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基于Raystation计划系统实现多病种多类型自动计划技术的研究
编辑人员丨6天前
目的:使用Raystation计划系统脚本,开发一种适用于多病种多计划类型的自动计划平台,以此提高计划设计效率。方法:采用IronPython计算机语言和WPF用户界面框架编写应用程序,针对不同病种不同类型计划在设计中的差异问题,分别从处方识别、可视化计划参数输入和目标优化函数的设置方面进行程序设计。将该自动计划程序应用于全脑照射、鼻咽癌、宫颈癌、食管癌、乳腺癌病种的测试,包括IMRT和VMAT,对比人工计划评估计划设计效率,并选择全脑照射评估计划剂量学参数。结果:程序应用中物理师只需输入并选择必需的计划参数,即可实现放疗计划自动设计。对比5个病种自动计划程序设计效率最大可以提高至2.4倍,全脑照射剂量学参数评估中,人工计划和自动计划均满足临床需求,靶区D 2%、CI、HI相近( P>0.05),人工计划靶区D 98%和晶体D max的平均值高于自动计划0.4%和7.1%( P<0.05)。 结论:本程序具备了自动计划系统的功能,能够实现多病种多类型放疗计划的自动设计,大幅提高计划设计效率,具有重要的临床应用价值。
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编辑人员丨6天前
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基于共同空间模式与迁移学习的脑电识别研究
编辑人员丨6天前
目的:针对目标用户的脑电识别问题,提出了基于共同空间模式(CSP)与迁移学习的脑电识别方法。方法:首先对脑电数据进行预处理,选择事件相关去同步(ERD)现象存在明显差异的时间窗0.5~2.5 s及包含α和β波的宽频带8~30 Hz脑电,然后对多用户利用CSP分别提取特征得到特征向量,最后利用迁移学习进行目标用户的脑电识别。结果:用户aa在Cz通道处想象右手的ERD高于想象双脚的ERD。用户aa、al、av、aw、ay的分类正确率分别为93.8%、100.0%、84.2%、94.6%、94.4%,平均分类正确率为92.4%,优于常用分类器SVM和期望最大化EM,仅比竞赛第一名清华大学所采用的方法低1.8%。结论:基于CSP与迁移学习的脑电识别方法能够利用非目标用户提高目标用户的脑电识别性能,对运动想象脑-机接口系统的研究具有重要意义。
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编辑人员丨6天前
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基于社交软件的男性同性性行为者丙型肝炎认知、检测意愿及其影响因素研究
编辑人员丨6天前
目的:了解社交软件上男性同性性行为者(MSM)的丙型肝炎(简称"丙肝")知识知晓、检测意愿情况及其影响因素。方法:采用网络问卷,对Blued平台用户的目标人群进行调查,内容包括一般人口学特征、性行为、吸毒行为、丙肝防治知识、丙肝既往检测情况和未来检测意愿等。知识部分共14题,以答对10题及以上定义为"知晓"。分析不同特征人群丙肝知识知晓率、检测意愿及相关影响因素。对数据采用单因素、多因素logistic回归分析。结果:共完成1 800份有效问卷,其中58.9%(1 061/1 800)听说过丙肝,总体丙肝知识知晓率为33.5% (603/1 800)。年龄30岁、月收入在5 000~10 000元、高中及以上学历、既往做过人类免疫缺陷病毒(HIV)检测者,其丙肝知识知晓率分别为42.5%(371/873)、36.7%(191/520)、35.1%(584/1 663)和37.4%(544/1 453),高于相应低年龄、低收入、低学历、未做过HIV检测及未坚持使用安全套者,差异均有统计学意义( P值均< 0.05)。调查对象未来3个月愿意进行丙肝检测的比例为82.5%(851/1 031);既往做过HIV检测、近6个月有肛交行为以及有高风险行为者,其愿意检测的比例分别为85.2%(766/899)、86.1%(609/707)和86.6%(610/704),高于未做过HIV检测、近6个月无肛交及无高风险行为者,差异均有统计学意义( P值均< 0.05)。 结论:调查对象丙肝知识知晓率较低,但有较高的检测意愿,应针对该人群加强针对性宣传教育,并提供便利条件促进其定期检测。
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编辑人员丨6天前
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Python爬虫技术在信息流行病学中的应用
编辑人员丨6天前
Python网络爬虫技术是一种通过模拟用户的网络浏览行为以实现从网络中自动、大量提取信息的技术,是信息流行病学研究收集并整合多源异构信息数据的关键基础。Python网络爬虫可分为简单爬虫与大型爬虫,集数据采集与数据库构建于一体,语法简洁、灵活性高、学习成本低、维护成本低。它适用于信息流行病学的各种应用场景,通过对互联网中健康相关信息的分析,实现多种公共卫生监测、健康干预实施及效果评价、智慧寻医方略优化等目标。近年,我国政府开始鼓励对含互联网信息在内的多源大数据的整合利用,在此背景下,Python爬虫技术的应用场景势必会越来越多,相应的人才培养、技术革新建议纳入到公共卫生教育和科研体系之中。
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编辑人员丨6天前
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基于无人机影像的鼠害地秃斑识别算法筛选
编辑人员丨6天前
鼠害型秃斑是反映草地鼠害的重要表征.利用无人机遥感技术识别高原鼠兔危害型秃斑对于评价其危害情况具有重要意义.本研究基于无人机可见光影像,使用最小距离(MinD)、最大似然(ML)、支持向量机(SVM)、马氏距离(MD)和神经网络(NN)5种监督分类算法对高原鼠兔危害地特征进行分类识别,并采用混淆矩阵对5种分类方法精度进行评价.结果表明:相较于其他3种方法,NN和SVM对高原鼠兔危害地特征进行识别分类的效果更好.其中,NN对草地与秃斑2种目标地物的制图精度分别为98.1%和98.5%,用户精度分别为98.8%和97.7%,模型总体精度为98.3%,Kappa系数为0.97,像元错分、漏分现象较低.经实践验证,NN表现出较好的稳定性.综上,神经网络方法是高寒草甸鼠害型秃斑识别的优选方法.
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编辑人员丨6天前
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基于知识图谱的"四维"《内科护理学》智慧服务体系的构建
编辑人员丨2周前
目的 依托"互联网+教育"融合教学手段的不断更新与发展,构建基于知识图谱的"四维"《内科护理学》智慧服务体系,并进行可用性预测试.方法 2023年3月-2024年2月,基于建构主义学习理论、教学体系设计模型,以及知识图谱的构建方法,构建了基于知识图谱的"四维"《内科护理学》智慧服务体系,即"课程目标层+基础知识层+问题体系层+教学资源层".采用《健康信息技术可用性评估量表》进行基于知识图谱的"四维"《内科护理学》智慧服务体系的可用性预测试.结果 基于知识图谱的"八步"构建法完成了《内科护理学》智慧服务体系的构建,主要包含血液系统疾病、内分泌与代谢疾病、风湿性疾病、神经系统疾病、呼吸系统疾病、循环系统疾病、消化系统疾病和泌尿系统疾病.可用性预试验中的工作生活质量、感知有用性、感知易用性和用户控制4个维度的条目平均分分别为(4.57±0.46)分、(4.48±0.44)分、(4.29±0.62)分、(4.16±0.62)分.结论 基于知识图谱的"四维"《内科护理学》智慧服务体系具有一定的科学性和可用性,可为护理教育工作者构建医学知识图谱提供在线教育学习工具和方法学参考.
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编辑人员丨2周前
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老年人主动健康管理平台的建设及应用
编辑人员丨2024/4/6
探讨了主动健康理念下智能服务管理平台的定义、功能、架构、评估指标、应用场景和发展趋势,基于主动健康服务需求,采用"系统+服务+用户+终端"的架构,构建支撑主动健康应用的智能服务管理平台,打造以"呼叫救助、居家照料、健康服务"为中心的智能居家养老服务网络,可为目标人群提供便捷、优质、可信赖的检查检验、护理、康复、生活照料及志愿者上门服务.老年人主动健康管理平台是推动主动健康服务和医疗信息创新的重要载体,是我国主动健康和老龄化科技应对的积极探索和良好示范.
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编辑人员丨2024/4/6
