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基于转录组测序探讨加味桃红四物汤缓解大鼠心肌缺血再灌注损伤的作用机制
编辑人员丨2天前
目的 基于转录组测序研究加味桃红四物汤对大鼠心肌缺血再灌注损伤的影响及作用机制.方法 将15只SPF级大鼠随机分为假手术组、模型组和加味桃红四物汤组,每组5只,加味桃红四物汤组予加味桃红四物汤预灌胃5 d,假手术组和模型组灌胃等体积蒸馏水,建立心肌缺血再灌注损伤大鼠模型.心脏超声检测大鼠心功能,试剂盒检测血清氧化应激和炎症因子含量,TUNEL染色检测心肌细胞凋亡,取心肌组织进行转录组测序,对差异基因进行韦恩图及热图分析,对共同差异基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析.RT-qPCR验证差异基因PTX3和EGR2表达.结果 与假手术组比较,模型组大鼠射血分数(EF)和短轴缩短率(FS)明显降低(P<0.01),心肌组织细胞凋亡率及血清乳酸脱氢酶(LDH)、肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-1β、IL-6含量明显升高(P<0.01),SOD活性和IL-10含量明显降低(P<0.01);与模型组比较,加味桃红四物汤组大鼠EF和FS明显升高(P<0.05),心肌组织细胞凋亡率及血清肌酸激酶同工酶、LDH、TNF-α、IL-1β、IL-6含量明显降低(P<0.01),SOD活性和IL-10含量明显升高(P<0.01).转录组测序得到假手术组与模型组差异基因4 227个(2 259个上调、1 968个下调),假手术组与加味桃红四物汤组差异基因1 933个(1301个上调、632个下调),模型组与加味桃红四物汤组差异基因94个(46个上调、48个下调),3组共同差异基因35个,差异基因主要富集到流体剪切力和动脉粥样硬化、泛素介导的蛋白质降解、C型凝集素受体信号通路、鞘脂类信号通路、细胞周期、趋化因子信号通路、脂质和动脉粥样硬化等信号通路.RT-qPCR验证结果显示,模型组心肌组织PTX3和EGR2基因表达较假手术组明显升高(P<0.01),加味桃红四物汤组PTX3和EGR2基因表达较模型组明显降低(P<0.01).结论 加味桃红四物汤对心肌缺血再灌注损伤具有缓解作用,表现为改善模型大鼠心功能、减少细胞凋亡和炎症因子释放及减轻氧化应激水平,其机制可能与调控PTX3和EGR2基因表达有关.
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编辑人员丨2天前
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短链脂肪酸对胰腺星状细胞氧化应激和活化的调控作用
编辑人员丨2天前
目的:探讨短链脂肪酸(SCFA)对缺氧诱导的胰腺星状细胞(PSCs)氧化应激和活化的调控作用。方法:常氧及缺氧培养PSCs建立常氧组和缺氧组,SCFA工作液(10 mmol/L乙酸钠、0.5 mmol/L丙酸钠及0.5 mmol/L丁酸钠)和生理盐水分别预处理PSCs后进行缺氧培养建立缺氧SCFA组和缺氧对照组。采用CCK-8法检测各组PSCs生长活力,采用DCFH-DA荧光探针法检测PSCs活性氧(ROS)的相对水平,JC-1荧光探针检测线粒体膜电位的变化,蛋白质免疫印迹法检测PSCs周期相关蛋白cyclin A和cyclin D、缺氧标志蛋白HIF1α、活化标志蛋白α-SMA及抗氧化蛋白NRF2和HO-1的表达。结果:缺氧组PSCs在培养48 h时的相对活力显著高于常氧组(1.23±0.05比0.99±0.04),而缺氧SCFA组在培养36 h和48 h时的相对活力均显著低于缺氧对照组(0.69±0.01比0.86±0.03,0.86±0.02比1.25±0.05)。缺氧组ROS相对水平显著高于常氧组(1.74±0.11比1.00±0.10),而缺氧SCFA组ROS相对水平显著低于缺氧对照组(1.39±0.14比1.66±0.11)。缺氧组JC-1聚合体的荧光信号明显高于常氧组(1.36±0.05比1.00±0.11),而缺氧SCFA组JC-1聚合体的荧光信号明显低于缺氧对照组(1.11±0.03比1.32±0.06)。缺氧组cyclin A、cyclin D、HIF1α、α-SMA、NRF2和HO-1表达量显著高于常氧组(1.19±0.01比0.63±0.02,0.93±0.02比0.83±0.03,1.18±0.07比0.41±0.02,1.19±0.14比0.66±0.04,1.22±0.11比0.61±0.04,1.28±0.12比0.68±0.02),而缺氧SCFA组cyclin A、cyclin D、α-SMA、NRF2和HO-1的表达量显著低于缺氧对照组(0.79±0.04比1.15±0.03,0.88±0.01比0.95±0.03,0.87±0.01比1.18±0.05,0.84±0.01比1.22±0.04,0.92±0.02比1.27±0.06)。以上差异均有统计学意义( P值均<0.05)。 结论:SCFA显著改善缺氧状态下PSCs的氧化应激状态,维持线粒体膜电位的稳定,抑制缺氧诱导的PSCs活化。
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编辑人员丨2天前
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费城染色体阳性急性髓系白血病3例并文献复习
编辑人员丨2天前
目的:分析费城染色体阳性急性髓系白血病(Ph + AML)的临床特点。 方法:收集2021年9月至2022年9月盐城市第一人民医院收治的3例Ph + AML患者资料,分析诊疗经过,并复习相关文献。 结果:3例患者经形态学及免疫分型检查诊断为急性髓系白血病(AML),且检测到t(9;22)。其中例2合并近四倍体染色体核型,例3合并+8号染色体。例1及例3均检测到BCR-ABL p210;例2 BCR-ABL检测阴性,考虑与其复杂核型相关。例1检测到IDH1突变,例2合并WT1高表达(表达量2.28%),且检测到RUNX1、IDH1、STAG2突变。例1采用传统"3+7"方案化疗后达完全缓解(CR),后因经济原因于第2个周期巩固治疗后放弃,仅口服达沙替尼,2022年7月28日复发后死亡;例2采用伊马替尼、阿扎胞苷联合HAG(高三尖杉酯碱、阿糖胞苷、粒细胞集落刺激因子)方案化疗后达CR,截至2022年9月仍处于缓解状态;例3采用伊马替尼、阿扎胞苷联合维奈克拉治疗未达CR,截至2022年9月仅口服伊马替尼靶向治疗。结论:Ph + AML发病率较低,预后不佳,目前尚无统一治疗方案,酪氨酸激酶抑制剂(TKI)联合化疗可提高CR率,CR后尽早行异基因造血干细胞移植,可改善患者预后。
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编辑人员丨2天前
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CDK12蛋白在前列腺癌中的表达及与临床病理特征的关系
编辑人员丨2天前
目的:探讨细胞周期依赖性蛋白12(CDK12)在前列腺癌(PCa)中的表达,并分析其与患者临床病理特征间的关系。方法:选取2015年1月至2016年10月本院行前列腺癌根治术的PCa患者89例(PCa组)和行前列腺电切术的良性前列腺增生(BPH)患者50例(BPH组),收集两组术中病理标本,采用免疫组化(IHC)染色检测组织中CDK12表达量,并分析CDK12蛋白与PCa患者临床病理特征间的关系。PCa患者根据生存情况将其分为生存组与死亡组,先后行COX单因素及多因素分析PCa患者预后的危险因素。根据病理检查中CDK12蛋白表达结果,将PCa患者分为阳性组与阴性组,绘制生存曲线,比较3年生存状况。结果:PCa组的CDK12蛋白阳性表达率显著高于BPH组( P<0.05);PCa患者中阳性组与阴性组的年龄比较,差异无统计学意义( P>0.05),而前列腺特异抗原(PSA)水平、Gleason评分及肿瘤分期与CDK12蛋白表达呈正相关( r=0.311、0.457、0.441, P<0.05)。89例PCa患者3年期间死亡33例,存活56例。COX回归模型单因素分析提示,存活组和死亡组的PSA、Gleason评分、肿瘤分期及病理组织的CDK12蛋白表达情况比较,差异有统计学意义( P<0.05),COX多因素分析提示,PSA水平>20 μg/L、Gleason评分>7分、肿瘤分期T3期、CDK12蛋白阳性表达均是影响PCa患者预后的独立危险因素。CDK12蛋白阳性表达者的3年累积生存率低于阴性表达者,差异有统计学意义( χ2=5.912, P<0.05)。 结论:CDK12蛋白的过度表达可能在PCa发生发展过程中发挥重要作用,且其阳性表达水平可能与PCa恶性程度呈正相关,研究CDK12阳性表达量在评估PCa进展风险,规划临床治疗方案中具有潜在价值,CDK12表达情况也是影响PCa患者预后的关键因素。
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编辑人员丨2天前
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BICD1基因促进脑胶质瘤恶性进展的多组学研究
编辑人员丨2天前
目的:基于空间转录组、单细胞转录组和RNA转录组测序数据探讨BICD1基因促进脑胶质瘤恶性进展的分子机制。方法:基于空间转录组公共数据集分析BICD1基因在正常脑组织(样本"248_C")和胶质母细胞瘤组织(样本"275_T")中的空间分布特征。采用R语言软件包分析中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库中单细胞测序数据(来源于14例患者的6 148个细胞),明确BICD1基因在胶质瘤不同细胞类型中的表达差异。基于CGGA数据库中693例脑胶质瘤患者的RNA测序数据,采用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析及基因本体论分析BICD1基因相关基因的生物学功能。结果:BICD1基因在正常脑组织中表达广泛,在胶质母细胞瘤组织中特异性地表达于肿瘤干细胞与肿瘤细胞的分界处。根据单细胞测序数据进行的细胞分群分析表明,BICD1基因主要在星形胶质细胞中高表达。在Neftel分型中,BICD1基因高表达细胞主要分布在星形胶质细胞样细胞群和神经前体样细胞群中。BICD1基因表达水平相关差异基因的KEGG通路富集分析显示,BICD1基因高表达与细胞衰老( P=0.003)、癌症中的蛋白聚糖( P=0.004)等癌症相关生物学功能的聚集相关,与肌动蛋白细胞骨架的调节( P=0.010)等胞内运输过程的功能聚集相关;BICD1基因低表达与核糖体相关功能( P<0.001)及氧化磷酸化( P<0.001)等生物学过程的聚集相关。BICD1基因表达水平相关差异基因的生物学功能聚类分析显示,与BICD1基因表达水平相关性较强的生物学功能有细胞质翻译( P<0.001)、核糖体亚单位装配( P=0.001)、染色体分离调控( P=0.004)及染色体分离( P=0.004)等。BICD1基因的表达水平与多泛素修饰依赖性蛋白结合( P=0.046)、泛素-泛素连接酶活性( P=0.033)、蛋白质解聚负调控( P=0.010)、单泛素化蛋白质去泛素化( P=0.026)、肌动蛋白丝加帽( P=0.007)、肌动蛋白丝解聚( P=0.013)等生物学过程相关。 结论:BICD1蛋白可能在脑胶质瘤前体肿瘤细胞中参与蛋白泛素化降解及细胞骨架相关的胞内运输,调控细胞衰老和细胞分裂等生物学过程,在这些细胞的恶性转变过程中起到关键作用。
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编辑人员丨2天前
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五倍子酸通过TGF-β/Smads信号通路对人瘢痕成纤维细胞生长抑制效应的初步研究
编辑人员丨2天前
目的:研究五倍子酸对瘢痕疙瘩成纤维细胞的形态、增殖、细胞周期、胶原收缩程度及对转化生长因子β(TGF-β)/Sma和Mad相关蛋白(Smads)信号通路的影响,探讨五倍子酸治疗瘢痕疙瘩的作用及机制。方法:2022年8 - 12月在武汉市第一医院皮肤外科获取术中切除的经临床及病理确诊的瘢痕疙瘩组织标本3份,采用组织块培养法进行原代成纤维细胞培养,取第3 ~ 8代细胞进行实验。设置低、中、高剂量五倍子酸组(分别用0.025、0.05、0.1 mg/ml五倍子酸干预细胞)及对照组(仅用含10%胎牛血清的DMEM培养细胞)。培养24、48、72 h后,细胞计数(CCK8)法检测各组细胞增殖活性,三维培养观察胶原收缩情况。按上述分组培养细胞24 h后,在微分干涉倒置荧光显微镜下拍照并使用流式细胞仪分析各组细胞周期变化。使用0.1 mg/ml五倍子酸干预细胞作为实验组(高剂量五倍子酸组),与对照组细胞分别培养24 h后,酶联免疫吸附试验(ELISA)测定两组TGF-β1、2、3浓度变化,实时荧光定量PCR检测TGF-β1、2、3,Smad2、3、4及α平滑肌肌动蛋白(SMA)mRNA相对表达水平。统计学分析采用 t检验、单因素方差分析及两因素方差分析,两两多重比较采用LSD- t检验。 结果:与对照组相比,随五倍子酸剂量增加,镜下瘢痕疙瘩成纤维细胞形态发生改变,逐渐出现胞体缩小、细胞间距变大、萎缩、凋亡细胞增多现象。CCK8结果显示,随五倍子酸剂量增加及作用时间延长,细胞增殖活力变化显著( F组别 = 78.31, P < 0.001; F时间 = 4.17, P = 0.037),其中高剂量五倍子酸组24、48、72 h时瘢痕疙瘩成纤维细胞增殖活力均显著低于对照组(均 P < 0.05)。三维培养显示,随培养时间延长,各组胶原均发生收缩,但收缩程度不同,对照组胶原明显收缩,各浓度五倍子酸组胶原收缩程度较低;作用24、48、72 h,中、高剂量五倍子酸组胶原收缩指数均显著低于对照组(均 P < 0.05)。流式细胞仪检测显示,处理24 h后,低、中、高剂量五倍子酸组细胞凋亡率(38.68% ± 3.05%、41.82% ± 2.19%、43.56% ± 3.58%)均显著高于对照组(12.58% ± 1.56%,均 P < 0.001);与对照组相比,中、高剂量五倍子酸组G0/G1期细胞比例显著较低(均 P < 0.01),而S期和G2/M期细胞比例则显著较高(均 P < 0.05)。ELISA结果显示,高剂量五倍子酸组TGF-β1浓度[(758.58 ± 31.42)pg/ml]显著低于对照组[(1 081.30 ± 44.72)pg/ml, t = 11.81, P < 0.001],TGF-β2浓度[(71.05 ± 7.40)pg/ml]与对照组[(76.43 ± 6.51)pg/ml]相比差异无统计学意义( t = 1.09, P = 0.317),而TGF-β3浓度[(5.70 ± 3.87)pg/ml]高于对照组[(0.00 ± 0.00)pg/ml, t = 2.94, P = 0.026]。实时荧光定量PCR显示,与对照组相比,高剂量五倍子酸组TGF-β1、Smad2、Smad3、Smad4、α-SMA mRNA表达量均较低(均 P < 0.05),TGF-β3 mRNA表达量较高( t = 6.78, P = 0.002),而TGF-β2 mRNA表达量无明显变化( t = 0.05, P = 0.962)。 结论:五倍子酸可通过改变瘢痕疙瘩成纤维细胞周期,抑制其增殖,促进其凋亡,改变细胞形态,从而减少瘢痕形成及挛缩,其机制可能与抑制TGF-β/Smads信号通路有关。
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编辑人员丨2天前
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紫云英苷上调miRNA-513表达对前列腺癌细胞增殖和细胞周期的影响
编辑人员丨2天前
目的:探讨紫云英苷上调miRNA-513(miR-513)对前列腺癌细胞株C4-2B细胞增殖能力及细胞周期的影响。方法:选取前列腺癌细胞株C4-2B,采用125 μg/L紫云英苷作用48 h者为紫云英苷组,未处理者为对照组。采用四甲基偶氮唑盐(MTT)法检测两组C4-2B细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞周期。采用miRNAMap预测软件预测miR-513的靶基因为叉头框蛋白R2(FOXR2),并采用双荧光素酶报告基因实验进行验证。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测两组细胞miR-513和FOXR2 mRNA的相对表达水平,蛋白质印迹法检测两组细胞中FOXR2、细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)、β-actin和细胞周期蛋白H(cyclin H)的表达。结果:与对照组比较,培养第2、3、4、5天紫云英苷组C4-2B细胞增殖活力均降低(均 P<0.05)。对照组和紫云英苷组S期细胞比例分别为(48.1±3.2)%和(36.0±2.1)%,紫云英苷组S期细胞比例降低( t=3.12, P=0.021);G 2期细胞比例分别为(24.9±3.3)%和(11.8±2.4)%,紫云英苷组G 2期细胞比例降低( t=3.18, P=0.019)。对照组和紫云英苷组C4-2B细胞中miR-513的相对表达水平分别为1.01±0.22和6.55±0.61,紫云英苷组C4-2B细胞中miR-513的相对表达水平升高( t=7.70, P<0.01)。双荧光素酶报告基因实验验证FOXR2为miR-513的靶基因。对照组和紫云英苷组C4-2B细胞中FOXR2 mRNA相对表达水平分别为1.04±0.14和0.19±0.06,差异有统计学意义( t=5.53, P=0.002),提示紫云英苷促进miR-513表达后,FOXR2 mRNA表达降低。紫云英苷组C4-2B细胞FOXR2、CDK7和cyclin H蛋白相对表达水平较对照组均降低。 结论:紫云英苷可能通过上调miR-513的表达,抑制前列腺癌C4-2B细胞增殖,诱导细胞周期停滞。
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编辑人员丨2天前
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CDC45在甲状腺癌中的表达模式及临床应用价值
编辑人员丨2天前
目的:利用生物信息学探索细胞分化周期蛋白45(cell differentiation cycle protein 45,CDC45)在甲状腺癌中的表达模式,并分析其潜在功能及涉及的信号通路,探索CDC45在甲状腺癌中的临床应用价值。方法:利用癌症基因组图谱计划(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载甲状腺癌的基因表达和临床生存数据;通过Timer,人类蛋白质图谱(the human protein atlas,HPA)和SPSS分析CDC45在甲状腺癌中的基因及蛋白表达模式;利用Kaplan-Meier曲线分析CDC45表达与预后之间的相关性;使用Cox回归对甲状腺癌预后影响因素进行分析,并利用R软件对结果进行可视化;使用String预测CDC45的蛋白互作网络,并利用基因本体数据库(gene ontology,GO),东京基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和GSEA软件进行功能和通路富集分析;分别通过R软件和Timer分析CDC45与免疫浸润以及各个免疫细胞之间的相关性。结果:与癌旁组织相比,甲状腺癌组织中CDC45基因水平显著上调,差异具有统计学意义[(-4.10±1.95)比(-2.04±1.24), t=11.28, P<0.001]。免疫组化染色结果显示,与癌旁组织相比,甲状腺癌中CDC45蛋白表达明显上升。TCGA数据库分析结果显示,CDC45的表达量与甲状腺癌患者年龄、性别以及M分期无关( P>0.05);但N1分期甲状腺癌患者CDC45表达量显著高于N0分期患者,差异具有统计学意义[(-2.19±1.31)比(-1.82±1.09), t=-3.40, P<0.05];甲状腺癌Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ期患者CDC45表达水平显著高于Ⅱ期患者,差异具有统计学意义[(-1.99±1.20)或(-1.94±1.20)或(-1.82±1.22)比(-2.56±1.28), t=3.09、3.02、3.05, P值均<0.001]。CDC45对甲状腺癌患者总体生存期(overall survival,OS)和疾病特异性生存期(disease free survival,DSS)无显著影响( P>0.05),但高表达的CDC45显著减少了甲状腺癌患者无疾病间隔期(disease free interval,DFI)和无进展间隔期(progression free interval,PFI),差异具有统计学意义( P=6.2e -9、2.5e -5)。多因素Cox回归分析发现,CDC45、M分期和T分期都可以作为甲状腺癌患者DFI时间的独立影响因子;而CDC45、年龄和M分期可以作为PFI时间的独立影响因子。通过蛋白互作网络挑选相关性最高的40个基因进行富集分析,GO富集分析结果表明CDC45相关蛋白主要在核浆和染色体中参与DNA的复制、代谢与结合;KEGG富集分析结果表明CDC45相关蛋白主要参与DNA复制、细胞周期、核苷酸切除修复等;GSEA富集分析发现CDC45还富集在免疫相关的通路上。免疫浸润结果表明,CDC45与B细胞,CDC8 +T细胞,CD4 +T细胞,巨噬细胞,中性粒细胞以及髓样树突细胞之间呈显著正相关,差异有统计学意义( r=0.35、0.25、0.14、0.16、0.27、0.39, P值均<0.05)。 结论:CDC45在甲状腺癌中显著高表达,可以独立预测甲状腺癌患者的DFI和PFI时间。
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编辑人员丨2天前
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小剂量阿司匹林联合来曲唑对多囊卵巢综合征患者血清内脂素、单核细胞趋化蛋白1及妊娠率的影响
编辑人员丨2天前
目的:探讨小剂量阿司匹林联合来曲唑对多囊卵巢综合征患者血清内脂素、单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)及妊娠率的影响。方法:选择大同市第三人民医院2016年11月至2018年11月接诊的多囊卵巢综合征患者110例,采用随机数字表法分为观察组60例、对照组50例,对照组给予来曲唑治疗,观察组在对照组基础上联合小剂量阿司匹林治疗,均连续治疗3个月经周期。比较两组治疗前后血清内脂素、MCP-1、性激素、子宫动脉血流及妊娠情况、不良反应。结果:治疗后,观察组血清内脂素、MCP-1、睾酮(T)、促黄体生成素(LH)、促黄体生成素/卵泡刺激素(LH/FSH)、子宫动脉搏动指数(PI)和阻力指数(RI)分别为(11.03±2.17)ng/mL、(99.31±14.50)ng/L、(1.57±0.29)mmol/L、(6.57±1.30)U/L、(1.16±0.22)、(1.07±0.24)、(0.41±0.08),均明显低于对照组的(15.57±2.56)ng/mL、(121.29±20.37)ng/L、(1.78±0.32)mmol/L、(8.40±1.88)U/L、(1.50±0.27)、(1.45±0.29)、(0.57±0.11),差异均有统计学意义( t=10.068、6.593、3.608、6.012、7.278、7.521、8.815,均 P<0.05);观察组排卵率、妊娠率分别为81.67%(49/60)、35.00%(21/60),均高于对照组的64.00%(32/50)、18.00%(9/50)(χ 2=4.385、3.974,均 P<0.05);两组不良反应发生率差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:小剂量阿司匹林联合来曲唑促排卵治疗多囊卵巢综合征,可明显降低血清内脂素、MCP-1表达,调节性激素水平,改善子宫动脉血流,提高妊娠率,且不增加药物不良反应。
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编辑人员丨2天前
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基于全长16S rRNA测序的血清高二胺氧化酶人群肠道菌群特征
编辑人员丨2天前
目的:探索肠道菌群与血清二胺氧化酶(diamine oxidase,DAO)水平之间的相关性,对DAO高水平(DAO-H)人群和正常人群的肠道菌群特征进行差异性分析。方法:在战略支援部队特色医学中心2021年健康体检人群中招募62名成年志愿者,其中DAO-H人群31名,正常人群31名,采集粪便样本,通过使用16S rRNA全长基因测序技术,对所有受试者粪便样本进行分析,研究不同DAO水平人群的肠道菌群构成特征。结果:DAO-H人群肠道菌群α多样性与正常人群差异无统计学意义,但是菌群结构和功能改变:共生细菌减少,如 Phocaeicola、拟杆菌科细菌等;潜在致病菌增加,如肺炎克雷伯菌。DAO-H组的菌群代谢发生变化,菌群鞘脂代谢水平降低,万古霉素类抗生素生物合成(biosynthesis of vancomycin group antibiotics)、叶酸一碳库(one carbon pool by folate)、萜类骨架生物合成(terpenoid backbone biosynthesis)、细胞周期-Caulobacter(cell cycle-Caulobacter)、蛋白质输出(protein export)、碱基切除修复(base excision repair)、氮代谢(nitrogen metabolism)水平较正常组升高。 结论:血清中DAO-H人群与正常人群比较,存在特有的肠道菌群构成与菌群代谢特征。
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编辑人员丨2天前
