为探究外源五价砷(arsenate,As(Ⅴ))输入对砷污染环境沉积物原位微生物厌氧发酵和群落结构影响,阐释As(Ⅴ)与砷污染河口沉积物微生物群落结构互作效应,本研究以辽宁省葫芦岛市某锌厂排污口下游高砷污染的五里河河口沉积物为对象,通过外源添加As(Ⅴ)(1、10、60mg·L-1)进行富集培养,测定产氢产酸、pH与碳源消耗等理化参数,结合高通量测序技术检测沉积物中微生物群落组成变化;同时采用平板稀释涂布方法筛选高浓度As(Ⅴ)富集菌液中优势菌株.结果表明,富集培养过程中,所有处理组的砷形态都发生了转化,其中在60 mg·L-1外源As(Ⅴ)投加下,约43％的As(Ⅴ)转化为三价砷(tarsenite,As(Ⅲ));微生物群落组成自原始沉积物的11个门转为单一厚壁菌门(Firmicutes),优势菌属狭义梭菌属1(Clostridium_sensu_stricto_1)占据优势生态位.自60 mg·L-1的As(Ⅴ)输入的富集菌群中,筛选分离出一株厌氧发酵丁酸梭菌(Clostridium butyricum CXL-1),该菌株具有较高的As(Ⅲ)耐受性(≥200 mg·L-1),并能利用葡萄糖发酵代谢产生有机酸和H2等发酵产物,为硫酸盐还原菌、产甲烷古菌等提供氢气和碳源.本研究结果可为砷污染环境微生物厌氧矿化修复提供参考.

为降低发酵成本,提高微生物采油效率,本研究开展了采油功能菌SQ6(鼠李糖脂产生菌)的开放式发酵探索研究.考察了菌株SQ6在常规发酵和开放式发酵方式不同温度下的生长、鼠李糖脂产量、表面张力及乳化指数等参数,采用液相色谱高分辨质谱联用仪分析了鼠李糖脂产物同系物组成,高通量测序分析了开放式发酵的细菌群落结构和杂菌率.结果表明:菌株SQ6最高生长温度是45℃,能够合成大量鼠李糖脂的最高温度是40℃;开放式发酵产量最高、杂菌率最低的发酵温度是37℃,鼠李糖脂产量达到7050.1 mg·L-1,仅比常规发酵的10513.2 mg·L-1降低了 33％,杂菌率最低,达到3.13％;针对SQ6菌株,高温发酵并没有更好的杂菌抑制效果并且降低了鼠李糖脂产量,发酵产物结构显示产物以单鼠李糖脂为主,占比达到96.1％.高浓度单鼠李糖脂的合成可能是中温条件下开放式发酵具有较好杂菌抑制率的主要原因.菌株SQ6是一株具有较大开放式发酵潜力的采油功能菌.

目的:分析广东省50家医院血液内科血标本来源细菌的构成和耐药性，了解血液内科血流感染（BSI）的流行病学特征。方法:基于国家细菌耐药监测网（CARSS）平台，对2019年广东省50家医院血液内科、呼吸内科和ICU由血标本分离的病原菌分布和碳青霉烯类耐药革兰阴性菌（CRO）检出率进行分析，同时对大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌药敏特征分儿童组（≤14岁）和成人组（>14岁）进行分析。参考CLSI 2019年M100文件标准判断结果。结果:共收集广东省50家医疗机构（三级医院48家）血液内科、呼吸内科、重症监护治疗病房（ICU）三个科室各1618、1026、3626株血标本分离菌完整微生物信息资料。其中血液内科革兰阴性杆菌占71.8%，革兰阳性球菌占28.2%。血液内科分离前5位细菌是：大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、凝固酶阴性葡萄球菌和草绿色链球菌群。葡萄球菌属中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）、耐甲氧西林的凝固酶阴性葡萄球菌（MRSCN）的检出率分别为19.7%和80.6%，未发现对万古霉素、利奈唑胺、替考拉宁耐药的菌株，无利奈唑胺耐药的肠球菌。草绿色链球菌群对青霉素G的耐药率为6.9%，对头孢曲松和头孢噻肟耐药率均超过25.0%。肠杆菌科细菌中大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌儿童组耐药率普遍高于成人组。成人组肺炎克雷伯菌对美罗培南耐药率为14.1%，阴沟肠杆菌对碳青霉烯类耐药率超过25.0%，非发酵菌中铜绿假单胞菌对大部分抗菌药物敏感性超过80.0%，但儿童组对美罗培南的耐药率高于成人组（11.8%对6.5%）。鲍曼不动杆菌无对替加环素耐药菌株。科室之间比较，ICU和呼吸内科血标本革兰阳性球菌比例高于血液内科。呼吸内科碳青霉烯类耐药大肠埃希菌（CREC）和碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌（CRKP）检出率最低，分别为0.3%和3.7%。血液内科碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌（CRPA）和碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌（CRAB）检出率最低，分别为8.3%和25.8%。ICU整体碳青霉烯类耐药的革兰阴性杆菌检出率都最高。结论:血液内科血标本来源细菌构成比与重要细菌耐药性与呼吸内科、ICU存在差异，广东地区血液内科肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、阴沟肠杆菌及以草绿色链球菌群为主的链球菌属比例明显高于ICU和呼吸内科。

目的:了解山西省家禽中艾伯特埃希菌的带菌情况。方法:采集山西省不同禽类定点屠宰场鸡肠内容物经EC肉汤增菌后，PCR对其进行 eae基因检测，阳性增菌液接种麦康凯琼脂，挑取不发酵乳糖菌落进行三重PCR（ clpX、 lysP和 mdh基因）、16S rRNA基因序列分析及多位点序列分型（Multiocus sequence typing，MLST）鉴定。 结果:本研究共采集了250份样品，经 eae基因检测、生化鉴定、三重PCR检测、16S rRNA及MLST聚类分析，确定2株不发酵乳糖、木糖，无动力， eae、 clpX、 lysP和 mdh基因阳性的菌株为艾伯特埃希菌。进一步对该2株艾伯特埃希菌毒力基因分析发现，该菌株携带Ⅱ/Ⅲ/Ⅴ组亚型 cdtB基因，但均不携带 stx基因。 结论:本研究表明山西省鸡类中存在艾伯特埃希菌带菌的情况。

目的:对从临床伤口标本中分离出的贪铜菌SZY C1进行形态学及分子生物学鉴定和分析，了解其微生物学特性及明确分类学地位。方法:将菌株SZY C1复苏培养后，依次进行形态学、生理生化鉴定、16S rRNA基因测序、全基因组测序，并应用生物信息学软件对其基因组和毒力基因进行分析。结果:菌株SZY C1为不发酵糖革兰阴性菌，菌体无鞭毛、不形成芽孢，可在哥伦比亚血琼脂平板上培养24 h呈现灰白色、圆形、突起、不透明、边缘整齐的菌落。基于16S rRNA基因序列分析结果显示，菌株SZY C1与耐金属贪铜菌( Cupriavidus metallidurans)的相似度为98.52%。菌株SZY C1测得基因组大小为5 515 517 bp，G＋C含量为67.87%，全基因系统发育分析显示，菌株SZY C1与根际贪铜菌亲缘化关系最近，两者之间平均核苷酸一致性值84.76%，数字DNA-DNA杂交值为29.1%，低于原核生物物种的鉴定阈值。基因预测显示菌株SZY C1携带多种毒力基因、耐药基因和抗重金属基因。 结论:根据表型和基因组分析，菌株SZY C1为贪铜菌属中潜在的新种。

为探讨糖尿病患者足趾感染的病因，采用微生物形态学结合分子生物学方法对2021年9月海南省人民医院的1例老年糖尿病患者足趾伤口分泌物培养分离出的白喉棒状杆菌溯源分析，为临床感染诊断提供参考。通过革兰染色、Albert法染色镜检、VITEK 2 Compat鉴定仪和MALDI-TOF MS质谱仪鉴定结合16S rRNA基因序列溯源分析，同时开展 tox毒力基因检测。结果显示分离菌株镜检为革兰阳性杆菌，有异染颗粒，可发酵大多数糖类，符合白喉棒状杆菌生物学特性；16S rRNA序列与白喉棒状杆菌标准菌株 Corynebacterium diphtheriae NCTC 11397 T（GenBank登记号：MW682323.1）同源性为100%； tox毒力基因阴性。本研究结果为临床微生物实验室准确鉴定非产毒白喉棒状杆菌奠定了基础，同时为临床认识非产毒白喉棒状杆菌的感染风险提供依据。

目的:利用毕赤酵母高效表达新型冠状病毒刺突蛋白受体结合域(receptor binding domain，RBD)，并评估以该RBD蛋白作为抗原所制备的疫苗组合物的免疫原性。方法:选取RBD蛋白并合成对应基因片段，将其构建至pPICZαA质粒，质粒经线性化转化后整合到毕赤酵母基因组中进行重组表达。Western blot和基于BLI(Biolayer Interferometry)技术的定量分析方法对培养上清中RBD蛋白进行检测，筛选能够分泌表达RBD蛋白的单克隆菌株。通过优化发酵工艺，包括培养基的盐浓度调整和诱导条件优化(pH、温度和时间等参数)，实现RBD蛋白的高效表达，并在小鼠体内评估其免疫原性。结果:筛选获得重组RBD蛋白表达效果较好的RBD-X33单克隆菌株。通过优化后的发酵工艺，即采用HBSM培养基、诱导pH为6.5±0.3、诱导温度为22℃、诱导时间持续120 h，实现发酵收获上清中重组RBD的表达量达到240 mg/L。在小鼠免疫原性试验中，采用铝+CpG双佐剂系统吸附重组RBD蛋白的疫苗组合物能够激发小鼠产生2.7×10 6结合抗体滴度和726.8活病毒(野生型)中和抗体滴度。 结论:采用毕赤酵母表达系统能够高效表达重组RBD蛋白，且所表达的RBD蛋白能够有效激发动物产生免疫应答。本研究为基于RBD蛋白的重组新型冠状病毒疫苗的开发提供了参考。

目的:对临床血液标本分离的细菌7712(＝CGMCC 1.17031＝NBRC 113783＝KCTC 15766)进行生物学特性和系统进化分析，明确其分类学地位。方法:观察菌株的培养特性并进行形态学、生理生化鉴定、基质辅助激光解吸电离子飞行时间质谱鉴定和基因组测序鉴定，并构建基因组发育树以分析其分类学位置。采用在线毒力基因数据库和抗生素抗性数据库，分别对分离株及近缘菌株进行基于全基因组的毒力基因和耐药基因的比较分析。结果:分离株7712为脲酶阳性的需氧革兰阴性非发酵菌，VITEK GN鉴定为人苍白杆菌。16S rRNA基因序列分析显示，分离株7712与苍白杆菌属及布鲁菌属均具有较高的序列一致性；而基于全基因系统发育分析显示，分离株7712与油葫芦苍白杆菌LCB8 T和嗜血苍白杆菌CCUG 38531 T聚类成一个分支，并与其他苍白杆菌属细菌和布鲁菌属聚类成一个大的分支。基因组亲缘性指数分析显示，分离株7712和油葫芦苍白杆菌LCB8 T的平均核苷酸一致性为98.22%，高于原核生物物种的鉴定阈值95%。分离株7712携带多种毒力基因和耐药基因，其中 OCH基因可能与头孢菌素耐药有关。 结论:确定了1例由油葫芦苍白杆菌引起的临床感染，丰富了苍白杆菌属生物多样性信息。

目的:了解新疆某医院肝硬化患者合并细菌感染病原菌种类、分布及耐药程度。方法:回顾分析1 271例肝硬化患者合并感染时病原菌种类及不同菌属耐药情况。结果:1 271例肝硬化患者其中合并感染患者为480例，感染率为37.8%，感染患者中失代偿期居多（438例）。常见感染部位为腹膜（327例，60.8%），其次为肺部（16.9%）等。在480例感染患者中，分离出343株病原体，其中非重复细菌中前10种常见细菌有289株，革兰阴性菌占76.5%，革兰阳性菌占23.5%，前3种菌株为大肠埃希菌（33.2%）、肺炎克雷伯菌（11.4%）、屎肠球菌（11.1%），且各菌属耐药率不同。结论:新疆某三甲医院失代偿期肝硬化患者细菌感染率高，病原菌种类多样，主要为革兰阴性菌感染，但肠球菌等革兰阳性菌感染率逐渐增加。根据细菌属性分为4类（肠杆菌、肠球菌、非发酵糖菌及葡萄球菌），发现即使同种菌属耐药率都不相同。

目的 筛选埃博霉素B产生菌,并优化发酵培养基,以提高发酵产量.方法 利用高效液相色谱法和薄层色谱法对次级代谢产物进行分析鉴定,从实验室保存的菌库中筛选出埃博霉素B产生菌,再通过单因素实验和正交试验优化发酵培养基成分.结果 获得1株产埃博霉素B的黏细菌A96-1,采用优化后的发酵培养基:马铃薯淀粉6g/L,玉米浆干粉2g/L,CaCl2 2 g/L,MgSO4·7H2O 3 g/L,微量元素溶液1 mL/L,树脂添加量2％,埃博霉素B发酵产量为251.4 mg/L,较优化前提高了3.83倍.结论 通过菌株筛选和优化的培养基大幅提高了埃博霉素B的产量,为今后其资源开发利用及产业化提供参考.