目的:探讨神经梅毒患者脑脊液(CSF)中的视黄酸受体应答基因2(RARRES2)、微管微丝交联因子1(MACF1)和核心蛋白多糖(DCN)的表达及其对神经梅毒的诊断价值。方法:纳入2020年6月至2022年9月期间南京市第二医院收治的64例非神经梅毒的梅毒患者(梅毒组)和78例神经梅毒患者(神经梅毒组)。神经梅毒患者中包括48例早期神经梅毒患者(早期组)和30例晚期神经梅毒患者(晚期组)。神经梅毒患者均给予常规对症治疗及抗生素驱梅治疗。通过qRT-PCR检测各患者治疗前及神经梅毒患者治疗前后的CSF中RARRES2、MACF1和DCN mRNA水平。采用美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评估神经梅毒患者治疗前后的神经功能。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析各指标对神经梅毒的诊断价值。结果:神经梅毒组患者CSF中的RARRES2、MACF1和DCN mRNA水平均高于梅毒组(均 P<0.001)。晚期神经梅毒组患者CSF中的RARRES2、MACF1和DCN mRNA水平均高于早期组(均 P<0.001)。与治疗前相比，神经梅毒患者治疗后的NIHSS评分以及RARRES2、MACF1和DCN mRNA水平均降低(均 P<0.001)。CSF中RARRES2、MACF1和DCN mRNA联合诊断神经梅毒的曲线下面积(AUC)、灵敏度和特异度分别为0.995、100.00%和93.75%，AUC和灵敏度高于单独诊断。 结论:神经梅毒患者CSF中RARRES2、MACF1和DCN表达升高，并且与疾病严重程度和治疗反应有关，这三种基因可能是诊断神经梅毒的候选生物标志物。

目的:通过对抗黑色素瘤分化相关基因5（MDA5）抗体阳性和抗Jo-1抗体阳性的肌炎患者外周血单个核细胞（PBMCs）进行基因表达谱的分析，以阐明特发性炎性肌病亚型的病理生理学机制。方法:①用Illumina HT-12 v4表达谱芯片对12例抗MDA5抗体阳性和16例抗Jo-1抗体阳性的肌炎患者及43名健康对照者的PBMCs进行基因表达谱筛查和分析。应用非配对 t检验，经Benjamini-Hochberg校正，选取基因表达信号倍数变化的绝对值≥2且校正 P<0.05为差异表达基因。将差异基因集进行基因本体论数据库（GO）功能富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，以 P<0.05作为显著性富集的阈值。②用实时荧光聚合酶链反应（real time-PCR）对差异表达基因进行验证，采用Kolmogorov-Smirnov检验对连续型变量进行正态性检验，符合正态分布且方差齐性，采用单因素方差分析，不符合正态分布则用Kruskal-Wallis检验， P<0.05为差异有统计学意义。 结果:①分析抗MDA5抗体和抗Jo-1抗体阳性患者PBMCs的基因表达谱，发现2种肌炎亚型患者PBMCs的基因表达存在明显差异。抗MDA5抗体阳性患者特异性表达上调的差异基因为407个，GO功能富集分析主要富集于固有免疫应答（ P<0.001）、病毒应答（ P<0.001）和干扰素应答（ P<0.001）等生物过程，KEGG通路富集分析主要富集于病毒感染相关通路（ P<0.001）、视黄酸诱导基因Ⅰ（RIG-Ⅰ）样受体通路（ P<0.001）和Toll样受体通路（ P=0.002）等。抗MDA5抗体阳性组中特异性下调的259个差异基因，GO功能富集分析主要富集于免疫应答（ P=0.006）、TGF-β受体信号通路（ P=0.010）和自然杀伤细胞介导的免疫（ P=0.015）等生物过程。抗Jo-1抗体阳性患者特异性表达上调的差异基因有162个，GO功能富集分析主要富集于核小体组装（ P<0.001）、细胞增长的负调控（ P=0.001）、凋亡负调控（ P=0.004）和黏膜固有免疫（ P=0.012）等生物过程，KEGG通路富集分析主要富集于代谢相关信号通路（ P<0.001）和免疫相关通路（ P<0.001）等。②Real time-PCR证实与健康对照组相比RIG-Ⅰ样受体通路中的干扰素诱导的解旋酶C结构域1（IFIH1）（ P=0.037）、干扰素刺激基因15（ P<0.001）和DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp）盒多肽58（DDX58）（ P=0.032）以及人单核细胞趋化蛋白1（MCP-1）（ P<0.001）、人单核细胞趋化蛋白2（MCP-2）（ P<0.001）和转录因子人碱性亮氨酸拉链转录因子激活蛋白1家族样转录因子2（BATF2）（ P<0.001）、炎症信号通路相关的髓样分化因子88（MYD88）（ P<0.001）在抗MDA5抗体阳性肌炎患者的PBMCs呈高表达。 结论:抗MDA5抗体阳性患者PBMCs基因表达谱特征提示其发病机制与固有免疫应答、病毒应答和干扰素应答等生物过程密切相关。

糖尿病心肌病(DCM)是糖尿病患者死亡的主要原因,但确切调控机制仍不清楚.近年研究发现,固有免疫应答是DCM发展过程的中心环节.模式识别受体是执行固有免疫功能的重要分子,主要包括Toll样受体、NOD样受体、视黄酸诱导基因Ⅰ样受体、C型凝集素受体、黑色素瘤缺乏因子2样受体、清道夫受体和环状GMP-AMP合成酶.现就上述几种模式识别受体在DCM中作用的研究进展进行综述,以期为DCM的临床治疗提供新思路和新靶点.

目的 探讨香雪抗病毒口服液对甲型流感病毒的活性及其在炎症免疫应答中的潜在作用机制.方法 采用噻唑蓝(MTT)染色法检测香雪抗病毒口服液对MDCK细胞和A549细胞的细胞毒性作用.采用细胞病变抑制法(CPE)及空斑减少实验对香雪抗病毒口服液进行抗病毒活性检测.采用免疫荧光法检测 NP 蛋白.实时荧光定量PCR测定炎症细胞因子的表达情况.采用蛋白印迹实验检测香雪抗病毒口服液对炎症相关信号通路的蛋白表达的影响.结果 香雪抗病毒口服液对甲型流感病毒 A/PR/8/34(H1N1)和 A/Aichi/2/68(H3N2)均有一定的抗病毒抑制作用,半数细胞毒性浓度(TC50)分别为42.12、79.36 mg/mL,半数抑制浓度(IC50)分别为 8.665、5.260 mg/mL,并可减少H1N1 病毒空斑形成.香雪抗病毒口服液能呈剂量相关性地降低H1N1诱导的A549 细胞炎症因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、视黄酸(维甲酸)诱导基因蛋白I(RIG-I)、趋化因子(CC基序)配体 5(CCL5)、巨噬细胞炎症蛋白-1β(MIP-1 β)、干扰素诱导蛋白-10(IP-10)、白细胞介素-10(IL-10)、λ干扰素(IFN-λ)、β干扰素(IFN-β)、白细胞介素-8(IL-8)mRNA的表达(P＜0.05、0.01、0.001).在流感病毒单复制周期中,香雪抗病毒口服液在早期阶段 0～2 h干预,具有良好的抗流感病毒效果.香雪抗病毒口服液能显著抑制Toll样模式识别受体 3(TLR3)、RIG-I、黑色素瘤分化相关基因 5(MDA-5)受体的表达,下调核转录因子-κB亚基p65(NF-κB p65)、NF-κB抑制蛋白α(IκBα)、信号转导和转录激活因子 1(STAT1)、STAT2、STAT3 的磷酸化水平,且在 20 mg/mL浓度下明显下调这些蛋白的表达.结论 香雪抗病毒口服液不仅能有效抑制甲流感病毒在人宿主细胞中复制,降低流感病毒诱导的炎症因子表达,而且能显著抑制流感病毒诱导天然免疫信号通路的相关蛋白表达,表明香雪抗病毒口服液具有防治流感病毒的潜力.

《中国心血管病报告2017》结果显示,目前,中国心血管病患病率及死亡率仍处于持续上升阶段.心血管病死亡率居各病因之首,高于肿瘤及其他疾病,占居民疾病死亡构成的40％以上[1].近年来研究发现,炎症免疫因素在心血管病发生、发展过程中扮演着重要的角色,但对其具体的作用机制目前尚存在争议[2].炎性小体是近年来研究的热点,可参与到固有免疫系统应答的过程当中.固有免疫也称为非特异性免疫,是指机体出生就具有的非特异性天然免疫防御功能.固有免疫是机体免疫系统识别自身和异己物质抵抗微生物感染的第1道防线,模式识别受体与病原生物表面的病原体相关分子模式的相互识别和作用是启动固有免疫应答的关键.机体内模式识别受体主要有Toll样受体、核苷酸结合寡聚化结构域样受体(NLR)、视黄酸诱导基因1样受体、C型凝集素受体和黑色素瘤缺乏因子2样受体几大类.

冠状病毒是人类及动物常见的病原体,具有独特的生物学特性及基因组结构,其传染性及致病性极强,对全球经济及公共卫生构成重大威胁.中国武汉出现的新型冠状病毒导致病毒性肺炎爆发,国际病毒分类委员会将新病毒命名为严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2).现有关于SARS-CoV-2的研究基本以新病毒的基因结构、流行病学、临床特征为主,涉及其免疫反应的研究较少.SARS-CoV-2与严重急性呼吸综合征(SARS)-CoV具有遗传相似性,因此SARS-CoV、中东呼吸综合征(MERS)-CoV相关的免疫应答也是研究SARS-CoV-2免疫应答的基础.研究表明,冠状病毒感染后可诱导宿主产生特定的免疫反应,如介导先天性免疫系统中的干扰素应答、视黄酸诱导基因样受体表达以及激活适应性免疫系统中相应的T细胞、B细胞等.冠状病毒与宿主免疫系统间的相互作用是病毒感染的基本发病机制,而机体的免疫应答对于控制和消除冠状病毒感染至关重要.深入了解近年来冠状病毒的生物学特性、基因组结构及其诱导的免疫应答,可为SARS-CoV-2的科学性防治提供理论依据.

应用生物信息学方法初步筛选缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的关键基因并探索发病机制,进而预测治疗IS的潜在中药.基于美国国家生物技术信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)下的基因芯片原始数据集GSE22255,纳入对象为20例缺血性脑卒中患者及20例性别和年龄匹配的对照者.基于R语言软件筛选差异表达基因(dif-ferentially expressed genes,DEGs),应用DAVID工具和R语言软件进行基因本体论(gene ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)通路分析,将DEGs导入STRING软件构建蛋白-蛋白互作网络,利用Cytoscape软件MCODE插件对关键功能模块进行可视化.通过将关键基因与医学本体信息检索平台(Coremine Medi-cal)相互映射,筛选治疗IS的中药,并构建药物-活性成分-作用靶点网络.与对照组相比,IS患者中筛选出14个DEGs,其中12个基因上调,2个基因下调.DEGs主要参与免疫反应、炎症过程、信号转导、细胞增殖调控等生物过程.KEGG通路分析显示 DEGs 主要富集于白细胞介素 17(interleukin-17,IL-17)、核因子 κB(nuclear factor kappaB,NF-κB)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、核苷酸结合寡聚化结构域(nucleotide binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路.DEGs 编码蛋白互作网络的关键模块主要集中于TNF、JUN、早期应答基因3(recombinant immediate early response 3,IER3)、早期生长应答因子 1(recombinant early growth response protein 1,EGR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、趋化因子配体 8(C-X-C motif chemokine ligand 8,CXCL8)、趋化因子配体2(C-X-C motif chemokine ligand 2,CXCL2)7个基因,参与神经炎症、免疫反应等生物过程.其中TNF和JUN作为该模块下的关键节点,可能成为IS诊断和预后评估的潜在生物学标志物.筛选得到治疗IS的潜在中药为丹参、西红花、黄芩、火麻仁.IS的发生是多因素共同作用的结果,免疫和炎症相关基因和通路调控网络失衡可能是IS发生发展中的关键环节,该研究为进一步探索中药治疗IS的作用机制,寻找潜在药物靶标提供了研发方向和理论依据.

目的 从基因水平上探讨儿童慢性鼻窦炎(CRS)可能的分子生物学机制,为儿童CRS的防治提供理论依据.方法 通过GEO Datasets数据库获取儿童CRS的基因表达谱GSE10406数据集,并筛选儿童CRS组与正常对照组的鼻窦黏膜组织上差异表达基因(DEGs),采用DAVID及GSEA对DEGs进行基因本体论(GO)分析和KEGG信号通路分析,采用String在线软件和Cytoscape软件对DEGs进行蛋白互作网络构建分析.结果 以校正后的P值＜0.05且| log2 FC |＞2为标准共筛选出儿童CRS相关的DEGs有92个,其中57个上调DEGs,35个下调DEGs.GO分析结果显示上调的DEGs显著富集在吞噬作用、β细胞受体信号通路、对细菌的防御反应、免疫应答、浆膜外等生物学进程,KEGG分析显示上调的DEGs富集在唾液分泌等信号通路,下调的DEGs显著富集在视黄醇代谢、化学致癌、酪氨酸代谢等信号通路.PPI分析结果显示,49个儿童CRS相关DEGs参与了网络构建,该蛋白网络共有61条边,蛋白评价节点度为1.51,局部聚类系数为0.387,蛋白互作网络差异有统计学意义(P＜0.001),前 10 位的关键基因分别为 ASPM、NCAPG、TPX2、MCM10、TOP2A、STATH、ADH1C、ADH6、CYP26A1、UGT2A2.除STATH,其余9个关键基因编码的蛋白均在MCODE模块1和模块2中.结论 儿童CRS可能通过其关键基因调节白介素、炎症、免疫反应、β细胞受体信号通路、对细菌的防御、唾液分泌等一系列生物学进程来影响其发生发展,可能的分子生物学机制需要进一步的探讨.

目的 探讨黄连解毒汤抗脓毒症的药效学物质和机制.方法 在网络药理学基础上,采用中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)、化合物靶标预测平台工具SwissTargetPrediction服务器、分子对接服务器、人类孟德尔遗传在线(OMIM)数据库、药物靶标数据库(TTD)、毒性与基因比较数据库(CTD)、零代码功能富集分析用于注释可视化和集成发现的数据库(DAVID)6.8和京都基因与基因组百科全书(KEGG)等筛选黄连解毒汤以及脓毒症治疗的靶标,再采用String和CytoScape等软件构建出黄连解毒汤抗脓毒症"化学成分-作用靶标-相关通路-疾病靶标"的网络图;初步明确黄连解毒汤中能发挥抗脓毒作用的化学成分,并明确这些成分是如何发挥作用的.结果 通过网络药理学方法筛选出黄连解毒汤中81个活性成分,其中43个活性成分与脓毒症相关,对应13个靶蛋白是血小板活化因子受体(PAFR)、腺苷受体A1(ADORA1)、雌激素β受体(ERβ)、诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、内皮型一氧化氮合酶(eENOS)、腺苷受体A2a(ADORA2a)、腺苷受体A2b(ADORA2b)、巨噬细胞移动抑制因子(MIF)、信号转导和转录激活因子1(STAT1)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)、神经元乙酰胆碱受体亚基α-7(CHRNA7)和血管紧张素转换酶2(ACE2).将预测出的靶蛋白通过DAVID 6.8进行KEGG通路解析,共得到12条作用通路,包括钙信号通路、精氨酸生物合成信号通路、神经活性配体-受体相互作用(NLRI)信号通路、精氨酸和脯氨酸代谢信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、利什曼病信号通路、缺氧诱导因子(HIF)信号通路、雌激素信号通路、鞘磷脂信号通路、催产素信号通路、环鸟苷酸/蛋白激酶G(cGMP/PKG)信号通路和调节脂肪细胞脂解信号通路,5条与脓毒症相关的作用途径包括调节血液循环、调节血管参数、调控外部刺激应答、调控压力应答和调控防御反应.结论 黄连解毒汤发挥抗脓毒作用是通过其存在多种化学成分,多个靶标及多条通路模式.