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MALAT1靶向miR-142-3p在卵巢癌化疗耐药中的机制研究
编辑人员丨4天前
目的:研究肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)靶向调控微小RNA-142-3p(miR-142-3p)导致卵巢癌化疗耐药的机制。方法:收集2016年2月至2019年2月陕西省人民医院80对卵巢癌组织及对应非癌正常组织标本,通过实时荧光定量PCR法检测卵巢癌组织和非癌正常组织中MALAT1及miR-142-3p的相对表达量,并分析二者表达的相关性;通过CCK-8实验验证异常表达的MALAT1及miR-142-3p对卵巢癌Hey细胞增殖和化疗药物5-氟尿嘧啶及顺铂敏感性的影响;通过双荧光素酶报告基因实验(分4组:MALAT1 wt组、MALAT1 wt+miR-142-3p mimic组、MALAT1 mut组和MALAT1 mut+miR-142-3p mimic组)检测miR-142-3p与MALAT1的靶向关系;通过RNA免疫沉淀反应实验验证MALAT1与miR-142-3p的靶点。结果:在卵巢癌组织和对应非癌正常组织中,MALAT1的相对表达量分别为0.000 52(0.002 56)、0.000 47(0.000 89),差异有统计学意义( Z=2.365, P=0.018);miR-142-3p的相对表达量分别为0.001 19(0.002 69)、0.001 61(0.008 48),差异有统计学意义( Z=2.935, P=0.003);二者在卵巢癌组织中的表达呈负相关( r=-0.474, P<0.001)。miR-142-3p在miR-142-3p mock组的相对表达量明显低于MALAT1+miR-142-3p mimic组(0.004 18±0.001 24 vs. 0.006 51±0.000 28; t=3.174, P=0.017)。MALAT1 wt组与MALAT1 wt+miR-142-3p mimic组的相对荧光富集度分别为2.27±0.86、31.10±6.05,差异具有统计学意义( t=8.172, P<0.001)。Hey细胞转染MALAT1过表达质粒48、72、96 h后,MALAT1过表达组和对照组的吸光度( A)值(0.522±0.021 vs. 0.433±0.021;0.644±0.012 vs. 0.544±0.051;0.887±0.055 vs. 0.698±0.042)差异均有统计学意义(均 P<0.05)。Hey细胞过表达MALAT1后,5-氟尿嘧啶0.10 ng/μl浓度时,MALAT1过表达组的细胞增殖速度明显较对照组快(0.615±0.036 vs. 0.506±0.042; t=4.432, P=0.002),5-氟尿嘧啶1.00、10.00、100.00 ng/μl浓度时显示出同样的趋势(均 P<0.05);顺铂0.01 ng/μl浓度时,MALAT1过表达组的细胞增殖速度明显较对照组快(0.777±0.015 vs. 0.733±0.039; t=2.355, P=0.023),顺铂0.10、1.00、10.00、100.00 ng/μl浓度时显示出同样的趋势(均 P<0.05)。Hey细胞过表达miR-142-3p后,5-氟尿嘧啶0.10 ng/μl浓度时,miR-142-3p过表达组的细胞增殖速度明显较对照组细胞慢(0.512±0.051 vs. 0.744±0.119; t=4.028, P=0.004),5-氟尿嘧啶1.00、10.00、100.00 ng/μl浓度时显示出同样的趋势(均 P<0.05);顺铂0.10 ng/μl浓度时,miR-142-3p过表达组的细胞增殖速度明显较对照组慢(0.520±0.043 vs. 0.674±0.096; t=3.441, P=0.009),顺铂1.00、10.00、100.00 ng/μl浓度时显示出同样的趋势(均 P<0.05)。采用0.10、1.00、10.00、100.00 ng/μl浓度的5-氟尿嘧啶和顺铂分别处理卵巢癌Hey细胞后,MALAT1过表达组、MALAT1+miR-142-3p组与对照组间的细胞增殖差异均具有统计学意义(均 P<0.05),进一步两两比较发现,MALAT1+miR-142-3p组均显著慢于MALAT1过表达组(均 P<0.05)。 结论:MALAT1通过靶向调控miR-142-3p使卵巢癌细胞对5-氟尿嘧啶及顺铂的敏感性降低,导致卵巢癌化疗耐药。
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编辑人员丨4天前
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创伤后长链非编码RNA转移相关肺腺癌转录本1对机体调控机制的研究进展
编辑人员丨4天前
创伤状态下机体处于一种十分复杂的病理生理状态,包括缺血缺氧,感染、组织坏死引起的炎症,以及代谢废物堆积等。转移相关肺腺癌转录本1(MALAT1)参与调控多种细胞行为,如增殖、凋亡、分化、迁移、上皮-间充质转化、自噬和形态维持等。在创伤状态下,MALAT1表达明显增高,在不同的损伤模型中,MALAT1的作用略有区别,具体机制不详。笔者就MALAT1的生物学特性及在创伤条件下对机体的调控作用研究进展进行综述,为临床控制炎症发展、改善疾病预后提供参考。
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编辑人员丨4天前
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血小板和内皮细胞黏附分子1表达水平和免疫浸润与肺腺癌预后的关系
编辑人员丨4天前
目的:探讨血小板和内皮细胞黏附分子1(PECAM1)表达水平和免疫浸润与肺腺癌预后的关系。方法:从基因表达数据库(GEO)下载3个肺腺癌数据集验证PECAM1在肺腺癌与正常肺组织中的差异表达。收集2019年9月至2020年1月郑州大学第一附属医院胸外科的肺腺癌手术标本36例,采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)验证PECAM1在肺腺癌与正常肺组织中的差异表达。通过免疫组织化学(IHC)染色数据分析人类蛋白质图谱(HPA)数据库中肺腺癌组织与正常肺组织中PECAM1蛋白水平的表达。下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库中肺腺癌患者临床数据,利用Kaplan-Meier法分析PECAM1表达与肺腺癌总生存时间的相关性,利用单因素和多因素COX回归分析PECAM1是否可以作为肺腺癌预后分析的独立分子标志物。通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)在肺腺癌样本数据上评估,确定PECAM1表达与免疫浸润之间的相关性,评估PECAM1表达与肿瘤浸润免疫细胞的基因标志物之间的相关性。结果:在GSE40791( t=23.550, P<0.01)、GSE32863( t=27.960, P<0.01)和GSE75037( t=23.440, P<0.01)数据集中,PECAM1在肺腺癌中的表达水平明显低于正常组织。同时RT-qPCR验证PECAM1在肺腺癌标本中的表达明显低于对应的正常组织( t=5.410, P<0.01)。HPA蛋白质表达数据表明肺腺癌组织中未检测到PECAM1的蛋白表达,正常肺组织为中表达。单因素COX回归分析得出PECAM1的表达[风险比( HR),0.634;95%可信区间( CI),0.473~0.874, P<0.01]、肿瘤大小( HR,2.295;95% CI,1.554~3.388, P<0.01)、淋巴结转移( HR,2.468;95% CI,1.830~3.328, P<0.01)、远处转移( HR,1.926;95% CI,1.086~3.416, P<0.05)和临床分期( HR,2.446;95% CI,1.778~3.363, P<0.01)都为肺腺癌患者不良预后的预测因素。多因素分析显示,PECAM1的表达( HR,0.704;95% CI,0.518~0.957, P<0.05)可以作为肺腺癌患者预后的独立分子标志物。TIMER数据库分析发现PECAM1的表达与免疫浸润细胞及其标记基因之间明显相关。 结论:PECAM1基因可以作为候选基因通过免疫浸润影响肺腺癌患者的预后。
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编辑人员丨4天前
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长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录本1在血液系统肿瘤中的研究进展
编辑人员丨4天前
肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)在多种肿瘤的发生过程中具有重要作用。近年来研究表明MALAT1在血液系统肿瘤中表达升高,且可以作为竞争性内源RNA从转录和转录后水平等多层面参与血液系统肿瘤的发生、发展及预后,因此,MALAT1有可能成为新型标志物,为血液系统肿瘤的诊断、治疗及预后评估提供有价值的依据。
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编辑人员丨4天前
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长链非编码RNA MALAT1在膀胱癌中的研究进展
编辑人员丨4天前
膀胱癌是泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一,具有较高的发病率和病死率。虽然近十几年来针对膀胱癌的治疗手段已经得到了很大的提升,但其治疗效果仍不理想。因此,探索膀胱癌发生发展的具体分子机制以开发新的、更为有效的诊断和治疗方法具有极为重要的临床意义。转移相关的肺腺癌转录物1(MALAT1)是长链非编码RNA家族的重要成员之一,已被证明在膀胱癌的发生发展和转移中起着关键的作用。本文综述了MALAT1在膀胱癌中的作用机制及其作为膀胱癌诊断、治疗和预后的生物标志物的潜力。
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编辑人员丨4天前
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泛素特异性蛋白酶7基因的泛癌分析及其在瘢痕溃疡癌变中的表达
编辑人员丨4天前
目的:探讨泛素特异性蛋白酶7(USP7)在瘢痕溃疡癌变过程中的生物学作用及其临床意义。方法:采用回顾性观察性研究结合生物信息学分析方法。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库中获取USP7在肿瘤和/或其对应癌旁正常组织中的RNA表达谱数据,并将RNA测序数据进行log 2转化。通过多维度癌症基因集cBioPortal数据库分析 USP7基因变异情况,并分析其突变位点。通过TIMER 2.0数据库中“差异表达”模块获得TCGA数据库中肿瘤、癌旁正常组织USP7 mRNA表达情况。使用基因表达谱交互分析2(GEPIA2)数据库分析皮肤黑色素瘤(SKCM)、宫颈鳞状细胞癌(CESC)、肺鳞状细胞癌(LUSC)和头颈鳞状细胞癌(HNSC)中高表达USP7患者与低表达USP7患者的生存率并绘制Kaplan-Meier生存曲线。利用Sangerbox数据库分析USP7在泛癌中的表达与微卫星不稳定性(MSI)或肿瘤突变负担(TMB)的相关性。通过GEPIA2数据库中“相关性分析”模块,评估USP7在泛癌中的表达与5种DNA错配修复基因( MLH1、 MSH2、 MSH6、 PMS2和 EPCAM)表达水平和3种必需DNA甲基转移酶(DNMT)——DNMT1、DNMT3A、DNMT3B表达水平的相关性。通过TIMER 2.0数据库中“免疫-基因”模块分析USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中表达及其与免疫细胞(B细胞、CD4 +T细胞、CD8 +T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞)浸润的相关性。利用GEPIA2数据库的“相似基因检测”模块获得与USP7表达模式相似且排名前100的蛋白集。将前述蛋白集与利用STRING数据库获得的与USP7有直接物理结合作用且排名前50的蛋白集进行交集分析。通过DAVID数据库对上述2个蛋白集进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。收集2018年10月—2022年10月武汉大学附属同仁医院暨武汉市第三医院病理科有相应临床病理特征的正常皮肤、增生性瘢痕、瘢痕溃疡、瘢痕癌的术后标本,采用免疫组织化学法检测组织中USP7表达情况,样本数为6。对数据行Log-rank检验、单因素方差分析及Bonferroni检验。 结果:在泛癌中, USP7的主要基因变异类型为突变和扩增,变异频率(>6%)居前3位的肿瘤依次为膀胱尿路上皮癌、SKCM和子宫内膜癌。 USP7基因在泛癌中的主要突变为错义突变。在突变频率最高的SKCM中,主要突变类型是USP7_ICP0_bdg结构域的错义突变。USP7 mRNA在乳腺浸润癌、胆管癌、结肠癌、食管癌、HNSC、肾嫌色细胞癌、肝细胞肝癌、肺腺癌、LUSC、前列腺癌和胃癌肿瘤组织中的表达均明显高于其对应的癌旁正常组织( P<0.05),在多形成性胶质细胞瘤、肾透明细胞癌、肾乳头状细胞癌和甲状腺癌中的表达均明显低于其对应的癌旁正常组织( P<0.05);此外,USP7 mRNA在SKCM转移组织中的表达远高于其原发肿瘤组织( P<0.05)。生存曲线显示,在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中,高表达USP7患者与低表达USP7患者的存活率比较,差异均无统计学意义(Log-rank P>0.05,风险比分别为1.00、0.99、1.00、1.30)。USP7在结肠癌、结直肠癌、胸腺癌、甲状腺癌中的表达均与TMB呈显著负相关(Pearson相关系数分别为-0.26、-0.19、-0.19和-0.11, P<0.05);USP7在神经胶质瘤、CESC、肺腺癌、混合肾癌、LUSC中的表达均与MSI呈显著正相关(Pearson相关系数分别为0.22、0.14、0.15、0.08和0.14, P<0.05),在结肠癌、结直肠癌、乳腺浸润癌、前列腺癌、HNSC、甲状腺癌和弥漫性大B细胞淋巴瘤中的表达均与MSI呈显著负相关(Pearson相关系数分别为-0.31、-0.27、-0.13、-0.19、-0.16、-0.18和-0.53, P<0.05)。USP7在CESC中的表达与MSH2和MSH6的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.51和0.44, P<0.05),在HNSC中的表达与EPCAM、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.39、0.14、0.49、0.54和0.41, P<0.05),在LUSC中的表达与EPCAM、MSH2、MSH6和PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.20、0.36、0.40和0.34, P<0.05),在SKCM中的表达与EPCAM、MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的表达均呈明显正相关(Spearman相关系数分别为0.11、0.33、0.42、0.55和0.34, P<0.05);USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中的表达与DNMT1、DNMT3A和DNMT3B的表达均呈显著正相关(Spearman相关系数分别为0.42、0.34和0.22,0.45、0.52和0.22,0.36、0.36和0.22,0.38、0.46和0.21, P<0.05)。USP7在CESC、HNSC、LUSC和SKCM中的表达仅与CD4 +T细胞浸润呈显著正相关(Partial相关系数分别为0.14、0.22、0.13、0.16, P<0.05)。与USP7表达模式相似且排名前100的蛋白集中,排名前5的蛋白依次是C16orf72、BCLAF1、UBN、GSPT1、ERI2(Spearman相关系数分别为0.83、0.74、0.73、0.73和0.72, P值均<0.05)。与USP7有直接物理结合作用且排名前50的蛋白集与前述蛋白集的交集仅有1个蛋白,即为甲状腺激素受体相互作用因子12。KEGG富集分析显示,USP7相关基因涉及细胞周期、剪接体、细胞衰老和p53信号通路等。GO富集分析显示,USP7相关基因涉及转录调控、蛋白质泛素化、DNA修复和细胞质模式识别受体信号通路等。临床样本分析显示,USP7在增生性瘢痕(0.35±0.05)、瘢痕溃疡(0.43±0.04)和瘢痕癌(0.61±0.03)中的表达均明显高于正常皮肤(0.18±0.04), P<0.05。 结论:USP7可能为临床瘢痕溃疡癌变恶化的生物标志物。
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编辑人员丨4天前
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外泌体长链非编码RNA在胰腺癌诊断中的应用现状与展望
编辑人员丨4天前
胰腺癌发病率逐年升高,早期诊断困难,现有血清标志物难以满足临床需求,需要开发新的诊断标志物。液体活检技术在胰腺癌诊断及疗效评估中具有较好的应用前景,检测分析胰腺癌细胞来源外泌体中特异性分子标志物有助于胰腺癌的诊断及预后评估。目前在外泌体长链非编码RNA(lncRNA)检测应用领域还处于探索阶段。本文针对外泌体lncRNA在胰腺癌诊断中的研究现状与进展进行综述,旨在评价循环外泌体lncRNA检测在胰腺癌诊断中的潜在价值与应用前景。近年研究证实了检测循环外泌体lncRNA用于胰腺癌诊断具有可行性,部分lncRNAs如转移相关肺腺癌转录物(MALAT1)、结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)、肝癌高表达转录本(HULC)、SOX2重叠转录本(Sox2ot)、AK296146和尿路上皮癌相关基因1(UCA1)等具有成为胰腺癌诊断标志物的潜能,联合检测多种lncRNAs可能具有更高的诊断价值。然而,目标lncRNA的筛选、循环外泌体富集纯化流程的标准化和外泌体lncRNA的检测及定量方法等,尚需进一步探索。
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编辑人员丨4天前
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MALAT1、SP1在前列腺癌组织中的表达及其与预后的相关性
编辑人员丨4天前
目的:探讨肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)、转录因子特异性蛋白1(SP1)在前列腺癌(PCa)组织中的表达并分析二者与PCa患者预后的关系。方法:选取2015年1月至2017年8月本院收治的97例PCa患者为研究对象,选取同期在本院因良性前列腺增生(BPH)进行电切手术的97例患者作为对照组。采用免疫组织化学法检测PCa及BPH组织中MALAT1、SP1的表达;分析PCa组织中MALAT1、SP1表达与患者临床病理特征之间的关系;采用Spearman法分析PCa组织中MALAT1、SP1的关系。记录患者生存状态并分析MALAT1、SP1表达与PCa患者预后的关系及影响患者预后的危险因素。结果:与对照组比较,PCa组织中的MALAT1、SP1阳性表达率均升高(均 P<0.001),PCa组织中的MALAT1、SP1表达与Gleason评分、T分期及淋巴结转移有相关性(均 P<0.05)。MALAT1与SP1呈正相关( r=0.453, P<0.05)。PCa组织中的MALAT1、SP1阳性表达患者3年内的生存率均低于阴性表达患者。多因素Cox分析结果表明,淋巴结转移、MALAT1、SP1阳性表达是影响PCa患者预后的危险因素(均 P<0.05)。 结论:MALAT1、SP1在PCa组织中存在差异性表达,与患者预后均有关,可能是评估PCa预后的潜在生物学指标。
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编辑人员丨4天前
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长链非编码RNA MALAT1调控NEAT1对肝细胞癌增殖和侵袭的影响
编辑人员丨4天前
目的:探索长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录物1(MALAT1)通过调控核富集转录物1(NEAT1)对人肝癌细胞外泌体分泌和肿瘤细胞增殖、侵袭的影响。方法:肝癌细胞HuH-7细胞敲低MALAT1表达(si-MALAT1)转染获得si-MALAT1组细胞,转染无意义的小干扰RNA (si-RNA)作为si-NC组,比较si-MALAT1组和si-NC组NEAT1表达、细胞增殖和侵袭能力的变化。过表达NEAT1载体的慢病毒(lv)与HuH-7细胞共培养72 h后获取NEAT1过表达细胞(lv-NEAT1组),感染空转载体的lv作为lv-control组,比较lv-NEAT1组和lv-control组外泌体相关基因表达差异。使用lv-NEAT1组细胞转染si-MALAT1获得si-MALAT1+lv-NEAT1组细胞,与si-NC组、si-MALAT1组细胞比较外泌体分泌能力变化。将si-MALAT1组细胞与lv-NEAT1组细胞的外泌体共培养获得si-MALAT1+ lv-NEAT1 外泌体组细胞,将si-MALAT1组细胞与lv-control组细胞的外泌体共培养获得si-MALAT1+lv-control 外泌体组,考察si-MALAT1+ lv-NEAT1 外泌体组和si-MALAT1+lv-control 外泌体组细胞的增殖和侵袭功能。 结果:与si-NC组相比,si-MALAT1组中NEAT1的相对表达量[(0.72±0.02)比(0.98±0.01)]、72 h吸光度[(0.66±0.03)比(0.98±0.04)] 、下室细胞数量[(88.33±7.26)比(147.70±13.62)]均降低,差异有统计学意义( P<0.05)。与si-NC组相比,si-MALAT1组外泌体CD9、CD63表达减弱;而与si-MALAT1组相比,si-MALAT1+lv-NEAT1组外泌体CD9、CD63表达增加。与si-MALAT1+lv-control 外泌体组相比,si-MALAT1+ lv-NEAT1 外泌体组吸光度[(0.97±0.03)比(0.74±0.05)]和下室细胞数量[(132.70±7.36)比(98.33±6.01)]均增加,差异有统计学意义( P<0.05)。lv-NEAT1组外泌体相关基因HSPA8、SLC3A2、SLC7A5的相对表达量分别为(5.53±0.31)、(0.32±0.07)、(0.77±0.45),与lv-control组表达水平(0.98±0.15)相比,差异均具有统计学意义( P<0.05)。 结论:MALAT1可通过调控NEAT1改变肝癌细胞外泌体分泌功能,NEAT1可改变外泌体相关基因的表达,进而促进了肝癌细胞的增殖和侵袭。
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编辑人员丨4天前
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肺腺癌组织lncRNA CCAT1、ZEB1表达与患者临床病理参数和预后的关系
编辑人员丨3周前
目的:探讨肺腺癌组织中长链非编码RNA(LncRNA)结肠癌相关转录因子1(CCAT1)、锌指结合蛋白1(ZEB1)表达及与患者临床病理参数和预后的关系.方法:选取2017年2月至2020年2月期间我院收治的138例肺腺癌患者.取手术切除的癌组织以及癌旁组织(距离癌组织边缘2cm以上).采用实时荧光定量聚合酶链反应检测癌组织及癌旁组织中lncRNACCAT1、ZEB1 mRNA表达.分析癌组织lncRNACCAT1、ZEB1 mRNA表达之间的相关性及与肺腺癌患者临床病理参数的关系.Kaplan-Meier法分析lncRNA CCAT1(高低表达)、ZEB1 mRNA(高低表达)肺腺癌患者的预后.多因素Cox比例风险模型分析影响肺腺癌患者预后因素.结果:肺腺癌癌组织lncRNACCAT1、ZEB1 mRNA相对表达量分别高于癌旁组织(P<0.05).肺腺癌患者癌组织lncR-NA CCAT1与ZEB1mRNA相对表达量呈正相关(r=0.532,P<0.05).肿瘤TNM分期Ⅲa期、淋巴结转移肺腺癌患者lncRNA CCAT1、ZEB1 mRNA相对表达量高于Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移患者(P<0.05).lncRNA CCAT1高表达组和低表达组3年总生存例数分别为39(60.00)、65(92.86);ZEB1 mRNA高表达组和低表达组3年总生存例数分别为41(62.12)、63(91.30).与lncRNA CCAT1低表达组、ZEB1 mRNA低表达组相比,lncRNACCAT1高表达组、ZEB1 mRNA高表达组3年累积生存率更低(P<0.05).lncRNA CCAT1高表达、ZEB1 mRNA高表达以及淋巴结转移是肺腺癌患者不良预后的独立危险因素(P<0.05).结论:肺腺癌组织中lncRNACCAT1、ZEB1 mRNA表达上调,两者表达上调与淋巴结转移有关,且可导致不良预后,有望成为评估肺腺癌患者预后的潜在标志物.
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编辑人员丨3周前
