目的:研究卵巢癌结构域蛋白酶-1(ovarian tumor domain-containing protease-1, OTUD1)基因对Ⅰ型干扰素信号通路的影响以及对IFN-α抗病毒效应的影响。方法:双荧光素酶报告试验检测OTUD1基因对IFN-α诱导的干扰素刺激应答元件(interferon-stimulated response elements，ISRE)启动子转录活性的影响；实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR，qPCR)检测OTUD1对IFN-α诱导的干扰素刺激基因(interferon-stimulated genes, ISGs)表达水平的影响；Western blot检测OTUD1对干扰素信号通路关键分子表达的调控作用，qPCR和ELISA检测其对IFN-α抑制乙型肝炎病毒复制的影响。结果:在HEK293T和Huh7.0细胞中，OTUD1下调了干扰素信号通路下游的ISRE启动子转录活性以及ISG15和ISG56等抗病毒基因的表达。在HEK293T细胞中，OTUD1降低了磷酸化蛋白质酪氨酸激酶(phospho-Jak1，p-JAK1)的蛋白质表达水平，但是OTUD1酶活突变体C320S不能调控ISGs和p-JAK1的表达。在Huh7.0细胞中，OTUD1降低了IFN-α抑制乙型肝炎病毒复制的效应。结论:OTUD1通过其泛素化酶活性下调p-JAK1的蛋白质表达水平，抑制干扰素JAK-STAT信号通路及ISGs表达。OTUD1拮抗IFN-α抑制病毒复制的效应可能与干扰素诱导的JAK-STAT信号通路有关。

目的:鉴定并筛选胆管癌差异性甲基化基因以预测胆管癌患者的预后。方法:选择2019年10月至2020年5月福建省立医院8例胆管癌患者胆管癌组织及癌旁组织进行850K甲基化测序分析，获取差异性甲基化基因。从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中下载2018年36例患者胆管癌全基因组甲基化数据及临床信息，从基因表达综合（GEO）数据库下载2012年胆管癌甲基化数据（GSE32879），从GEPIA2数据库下载2018年TCGA数据库胆管癌总生存（OS）及无病生存（DFS）差异生存基因组数据。联合送检样本850K甲基化测序分析的差异甲基化位点（DMP）和差异甲基化区域（DMR）结果、TCGA和GEO数据库中甲基化基因以及胆管癌生存基因，在Sangerbox VENN工具中进行多数据集合分析，交集筛选得出共同差异性甲基化基因。在Sangerbox中运用最小 P值法确定基因表达的临界值，分为差异性甲基化基因高、低表达组，比较两组胆管癌患者OS、DFS、疾病特异性生存（DSS）、无病间隔（DFI）、无进展间隔（PFI）。进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。 结果:8例患者的胆管癌组织与癌旁组织850K甲基化测序共鉴定出121 954个DMP，DMR中共鉴定出差异性甲基化基因1 399个；交集鉴定得出共同预后相关基因氨基葡萄糖（N-乙酰）转移酶1（GCNT1）和神经营养受体酪氨酸激酶3（NTRK3）。GCNT1在胆管癌组织中表达高于癌旁组织，差异有统计学意义（ P=0.040）；NTRK3在胆管癌组织中表达高于癌旁组织，差异无统计学意义（ P=0.790）。采用最小 P值法，以GCNT1及NTRK3联合表达情况预测胆管癌患者预后，按两基因表达量总和排序，以排序的30%为临界值时，胆管癌高表达组及低表达组间DFS差异最为显著（ P<0.001）；两组间OS差异无统计学意义（ P=0.065）。GO功能分析结果显示，GCNT1与蛋白质糖基化、大分子糖基化、糖化、糖蛋白生物合成过程、糖蛋白代谢过程、转移酶活性和转移糖基、蛋白质O-聚糖基化、O-聚糖加工等有关；NTRK3与神经营养素信号通路、Ras信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制、ErbB信号通路、磷脂酶D信号通路、癌症中枢碳代谢、自然杀伤细胞介导的细胞毒性等有关。KEGG分析结果显示，GCNT1主要与黏蛋白型O-聚糖生物合成、代谢途径等系统功能相关联，NTRK3主要与细胞表面受体通路、细胞内信号转导、刺激反应的正向调节、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、酶联受体蛋白信号通路、MAPK信号通路级联及调节、蛋白质磷酸化信号转导等系统功能相关联。 结论:胆管癌差异性甲基化基因GCTNT1、NTRK3表达对胆管癌患者预后有一定预测作用。

MET基因是一种原癌基因，其编码的MET蛋白具有酪氨酸激酶活性。当MET蛋白与其配体(肝细胞生长因子)结合后，能够诱导MET二聚化并激活下游信号通路，在肿瘤形成及转移中发挥至关重要的作用。赛沃替尼为一种特异性靶向MET蛋白的酪氨酸激酶抑制剂(TKI)，可选择性抑制MET激酶的磷酸化，对MET异常的肿瘤有明显抑制作用。赛沃替尼已于2021年6月22日在中国获得批准上市，用于治疗MET 14外显子跳跃突变的晚期非小细胞肺癌。MET TKI对于MET基因扩增或MET蛋白过表达的晚期实体瘤患者同样有效，相关的注册临床研究正在进行中。在应用赛沃替尼治疗期间，常见的不良反应包括恶心、呕吐、外周水肿、发热以及肝不良反应等。赛沃替尼相关不良反应管理的中国多学科专家共识基于全国范围的2轮广泛调研，旨在指导临床医师合理使用赛沃替尼，科学防治各种不良反应，提高患者的临床获益和生活质量。

目的:构建自噬基因表达特征的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者预后的预测模型。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)、基因型-组织表达研究项目(The Genotype-Tissue Expression, GTEx)数据库中分别得到所有HCC和正常肝细胞组织的基因转录表达数据，并将每个样本的基因转录表达数据统一转化为log 2(FPKM值＋1)，消除数据库之间测试平台的数据差异。根据人类自噬基因库中获取的人类自噬基因列表筛选出TCGA-GTEx整合后序列中每个样本对应的自噬基因的表达量。采用R语言limma包以错误发现率( FDR)<0.05及差异倍数|logFC|>1为筛选标准，进行自噬基因差异表达分析。采用R语言clusterProfiler包对差异表达自噬基因以 P<0.05为筛选标准，进行基因本体论(Gene Ontology，GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)富集分析。根据自噬基因的差异表达量和患者的临床信息，采用R语言survival包进行单因素的Cox回归分析。进一步将单因素的Cox回归分析中有统计学意义( P<0.05)的自噬基因纳入到多因素Cox回归分析中，以每个差异表达的自噬基因表达量和相对应的回归系数 coef值为基础，构建HCC的自噬基因预后模型：expmRNA1×βmRNA1＋expmRNA2×βmRNA2＋…＋expmRNAn×βmRNAn(exp：基因表达量；β：多因素Cox回归分析的回归系数 coef)。绘制预测模型的受试者工作特征(receiver operating characteristic，ROC)曲线并计算ROC曲线下面积(area under curve，AUC)评估模型预测价值。 结果:从TCGA-GTEx数据库中共得到HCC样本374例和正常肝组织样本160例的基因转录表达数据及临床信息。从整合后的样本序列中共筛选出205个自噬基因的表达数据，其中SPNS1、DIRAS3、TMEM74、NRG2、NRG1、IRGM、IKBKE、NKX2-3、BIRC5、CDKN2A、TP73为符合筛选标准的差异表达自噬基因。差异表达自噬基因GO主要富集在丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的调控、ErbB 2信号通路、蛋白激酶调节活性、激酶调节活性等功能。差异表达自噬基因主要富集在EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、Hippo信号通路等KEGG通路。整合并删除生存信息缺失的样本后，共418例样本表达纳入到Cox回归分析中。通过单因素、多因素Cox风险回归分析后，筛选出NRG1( HR＝1.5565，95% CI：1.1793～2.0543)、IKBKE( HR＝1.7502, 95% CI：1.2093～2.5330)这两个自噬基因并建立预后预测模型：(0.44247×NRG1的表达量)＋(0.55977×IKBKE的表达量)。预测模型的ROC曲线显示7年总体生存的AUC为0.711。 结论:基于NRG1和IKBKE表达量构建的HCC预后模型，对HCC患者远期生存率有较高的预测价值。

目的:探讨miR-15b-5p参与PD中抑郁样行为发生的机制。方法:（1）将18只C57BL/6N小鼠按随机数字表法分为PD组、干预组及对照组，每组6只。PD组小鼠通过脑立体定位仪将0.25 mg/kg鱼藤酮注射至右侧纹状体以制备PD模型，干预组小鼠接受0.25 mg/kg鱼藤酮及miR-15b-5p抑制物慢病毒注射，对照组小鼠注射等体积PBS。4周后进行旷场实验及转棒实验评价小鼠的运动能力，进行糖水偏好实验及强迫游泳实验评价小鼠的抑郁样行为表现，然后提取小鼠黑质及纹状体中相关蛋白及miRNAs，进行Western blotting实验、实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）实验以及免疫荧光染色实验检测相关指标[miR-15b-5p、酪氨酸羟化酶（TH）、脑源性神经营养因子（BDNF）、原肌球蛋白受体激酶B（TrkB）、突触后密度蛋白95（PSD95）]。（2）将100 nmol/L miR-15b-5p模拟物/抑制物序列及各自阴性对照序列分别转染至6孔板上SH-SY5Y细胞中（分别命名为miR-15b-5p模拟物组、miR-15b-5p模拟物对照组及miR-15b-5p抑制物组、miR-15b-5p抑制物对照组），48 h后进行Western blotting实验及qRT-PCR实验，以检测BDNF、TrkB、PSD95蛋白及miR-15b-5p表达改变。（3）将100 ng BDNF 3'端非编码区（3'-UTR）野生型或突变型荧光素酶报告载体质粒以及100 nmol/L miR-15b-5p模拟物/抑制物序列及各自阴性对照序列共转染至24孔板上SH-SY5Y细胞中，得到相应8组细胞，48 h后进行荧光素酶报告载体活性检测实验，以检测各组细胞的荧光素酶活性。结果:（1）与对照组相比，PD组小鼠的运动速度明显减慢、落棒潜伏期明显缩短、糖水偏好百分比明显降低、不动时间明显增加；与PD组相比，干预组小鼠的运动速度明显提高、落棒潜伏期明显延长、糖水偏好百分比明显升高，不动时间明显减少；差异均有统计学意义（ P<0.05）。（2）与miR-15b-5p模拟物对照组比较，miR-15b-5p模拟物组细胞中miR-15b-5p表达明显升高，BDNF、TrkB、PSD95表达明显降低（100.00±5.75 vs. 66.79±5.90；100.00±5.95 vs. 84.46±5.77；100.00±7.02 vs. 80.43±3.25）；与miR-15b-5p抑制物对照组比较，miR-15b-5p抑制物组细胞中miR-15b-5p表达明显降低，BDNF、TrkB、PSD95表达明显升高（100.00±6.81 vs. 119.90±5.66；100.00±2.88 vs. 110.10±4.15；100.00±2.19 vs. 124.60±11.69）；差异均有统计学意义（ P<0.05）。与对照组相比，PD组小鼠黑质中miR-15b-5p表达明显增加，TH、BDNF、TrkB、PSD95表达明显降低（100.00±9.20 vs. 63.60±12.80；100.00±9.88 vs. 71.95±10.00；100.00±5.16 vs. 70.37±8.43；100.00±7.01 vs. 68.12±10.22），BDNF荧光强度明显降低（100.00±12.99 vs. 48.23±12.58）；与PD组相比，干预组小鼠黑质中miR-15b-5p表达明显降低，TH、BDNF、TrkB、PSD95表达明显升高（63.60±12.80 vs. 90.69±9.84；71.95±10.00 vs. 93.31±4.50；70.37±8.43 vs. 88.11±4.10；68.12±10.22 vs. 89.59±5.93），BDNF荧光强度明显升高（48.23±12.58 vs. 83.65±10.52）；差异均有统计学意义（ P<0.05）。（3）与BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p模拟物对照组比较，BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p模拟物组细胞中荧光素酶活性明显降低（100.00±5.07 vs. 90.59±1.75）；与BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p抑制物对照组比较，BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p抑制物组细胞中荧光素酶活性明显升高（100.00±5.08 vs. 152.20±31.87）；差异均有统计学意义（ P<0.05）。 结论:miR-15b-5p通过下调BDNF/TrkB/PSD95表达参与PD中抑郁样行为发生。

目的:对配对盒2( Pax2)相关孤独症谱系障碍(ASD)易感基因进行生物信息学分析，探讨 Pax2基因参与ASD发病的可能机制。 方法:(1)将Pathway Commons数据库中与 Pax2基因相关的基因(606个)和Simons基金会孤独症研究计划(SFARI)数据库中ASD易感基因(1 023个)取交集得到65个 Pax2基因相关ASD易感基因。在基因功能分析网站Metascape对 Pax2基因相关ASD易感基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件cytoHubba插件的最大团中心度(MCC)算法，筛选前10个核心 Pax2基因相关ASD易感基因。(2)取3只13周龄雄性Pax2-nestin小鼠(实验组)及3只同龄雄性C57 BL/6J小鼠(对照组)，采用Western blotting实验检测2组小鼠海马组织中谷氨酸受体2B亚基(GluN2B)蛋白的表达。 结果:(1)GO分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因在生物学过程(BP)本体主要富集于跨突触信号、行为、脑发育、化学突触传递的调节、胶质细胞再生、小脑形态发育、谷氨酸能突触传递、记忆等子集，在细胞组分(CC)本体主要富集于突触后、树突、β连环蛋白-T细胞因子(TCF)复合物、树突分支等子集，在分子功能(MF)本体主要富集于突触后密度蛋白95/果蝇圆盘大肿瘤抑制蛋白/紧密连接带-1蛋白(PDZ)结合结构域、转录因子结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、谷氨酸受体活性、微管蛋白结合等子集。KEGG通路富集分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因主要分布在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、长时程抑制、谷氨酸能突触等通路。核心 Pax2基因相关ASD易感基因为 Gria1、 Dlg2、 Ntrk2、 Grid2、 Igf1、 Jmjd1c、 Ldb1、 Tcf4、 Tcf7l2、 Adrb2。(2)Western blotting实验显示，对照组、实验组小鼠海马组织中GluN2B蛋白的相对表达量分别为2.36±0.60、0.85±0.44，差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:Pax2基因异常可能导致 Pax2基因相关ASD易感基因的表达或功能异常，并通过多种机制参与ASD的发病。

目的:利用动物实验、网络药理学与分子对接技术研究人参-三七-川芎药对延缓心脏衰老的作用机制。方法:将小鼠按随机数字表法分为空白对照组、衰老模型组、二甲双胍组、中药组。除空白对照组外，其余各组小鼠采用皮下注射D-半乳糖诱导亚急性衰老小鼠模型。2周后，二甲双胍组灌胃二甲双胍混悬液150 mg/kg，中药组灌胃人参、三七、川芎冻干粉溶液650 mg/kg，空白对照组与衰老模型组灌胃等体积超纯水，1次/d，6次/周，连续灌胃10周。采用PCR检测心脏组织端粒酶蛋白催化亚基（TERT）mRNA水平，采用免疫组化染色观察心脏组织p53表达，采用HE染色观察心脏组织形态。检索TCMSP、Swiss Target Prediciton数据库中人参、三七、川芎的活性成分和靶点；利用TTD、OMIM、Gene、HAGR、DisGeNET数据库筛选心脏衰老靶点；将药物与疾病靶点取交集后得到人参-三七-川芎活性成分作用心脏衰老靶点；采用STRING数据库、Cytoscape 3.8.0软件构建交集靶点PPI网络，筛选核心靶点；利用FunRich软件对核心靶点进行细胞组分、分子功能、生物过程及通路富集分析；运用Schr?dinger Maestro软件对药物活性成分与核心靶点进行分子对接，使用PyMOL2.1软件将对接结果可视化。结果:实验结果表明，人参-三七-川芎可明显改善心脏衰老小鼠心脏组织损伤，升高TERT mRNA水平，降低p53阳性表达。共获得人参-三七-川芎活性成分32个，共对应637个靶点基因；心脏衰老靶点263个，药物活性成分靶点与心脏衰老交集靶点67个，筛选得到核心靶点31个。富集分析显示，分子功能与转录因子活性、蛋白酪氨酸激酶活性有关；生物过程涉及信号转导、细胞交流；信号通路涉及PDGFR-beta、PI3K-Akt、S1P1、Glypican、TRAIL、Glypican 1通路等。分子对接显示，人参-三七-川芎药对中山柰酚、苏齐内酯、人参皂苷Rg5和p53结合能力较强。结论:人参-三七-川芎可通过抑制p53表达延缓心脏衰老，可为益气活血药延缓心脏衰老的作用机制研究提供依据。

目的:探讨微小RNA（miR）-181c对脑出血（ICH）大鼠神经的作用及靶向半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶-3（Caspase-3）信号通路调控ICH的分子机制。方法:选取60只SD雄性大鼠，采用随机数字表法分为假手术组（Sham组）、ICH组、表达miR-181c激动剂组（ICH＋agomir组）和表达miR-181c抑制剂组（ICH＋antagomir组），每组15只。提取各组大鼠脑组织RNA，采用实时荧光定量聚合酶链反应（RT-qPCR）技术检测miR-181c的表达水平；采用苏木精-伊红（HE）染色、尼氏染色、Zea Longa评分标准评估各组大鼠脑损伤及神经功能；采集各组大鼠脑脊液，通过酶联免疫吸附实验（ELISA）检测肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、白细胞介素-1β（IL-1β）、3-硝基酪氨酸（3-NT）及4-羟基壬烯酸（4-HNE）的水平；提取各组大鼠脑组织蛋白，采用蛋白质免疫印迹实验检测Caspase-3剪切体/Caspase-3前体的表达水平。采用生物信息学分析、荧光素酶报告基因实验分析miR-181c对Caspase-3的靶向调控关系，两组间比较采用独立样本 t检验。 结果:RT-qPCR结果显示，ICH组miR-181c的表达水平低于Sham组（0.56±0.09比1.00±0.13， t＝7.230， P<0.05）。HE染色结果显示，ICH组神经元细胞数量减少、体积变小、排列不齐，出现空泡样改变，核固缩、破裂，ICH＋agomir组上述改变减轻。尼氏染色结果显示，ICH＋agomir组神经元细胞浆中的尼氏小体数量多于ICH组（98.30±14.12比48.90±9.20， t＝9.337， P<0.01），ICH＋antagomir组与ICH组比较差异无统计学意义（ P>0.05）。ELISA结果显示，ICH＋agomir组大鼠脑组织TNF-α、IL-1β、3-NT和4-HNE的水平显著低于ICH组[TNF-α：（3.30±1.25） ng/ml比（8.22±1.66） ng/ml， t＝9.120， P<0.01；IL-1β：（9.87±3.02） ng/ml比（15.14±2.93） ng/ml， t＝8.183， P<0.01；3-NT：（23.39±3.44） pg/ml比（45.61±2.65） pg/ml， t＝7.902， P<0.01；4-HNE：（10.10±1.75） pg/ml比（14.93±2.63） pg/ml， t＝5.778， P<0.05]。蛋白质免疫印迹结果显示，ICH组Caspase-3剪切体/Caspase-3前体的表达水平显著高于Sham组（2.63±0.58比1.00±0.10， t＝8.190， P<0.01），ICH＋agomir组大鼠脑组织Caspase-3剪切体/Caspase-3前体的水平显著低于ICH组（1.52±0.37比2.63±0.58， t＝5.398， P<0.05）。生物信息分析结果显示，miR-181c与Caspase-3有互补的核苷酸序列，miR-181c mimics＋野生型-Caspase-3组细胞荧光素酶活性显著低于NC mimics＋野生型-Caspase-3组（0.52±0.07比1.03±0.08， t＝6.334， P<0.01）。 结论:miR-181c通过靶向抑制Caspase-3信号通路，减轻大鼠ICH后神经功能损伤和继发性脑水肿，降低脑组织的氧化应激水平和炎性反应，对ICH大鼠具有保护作用。

严重感染、缺血缺氧等导致急性肾损伤,使肾脏血管受损、肾小管中炎症细胞和促炎性细胞因子释放增多、糖酵解过程触发并上调.其中炎症细胞增多和血管受损导致小分子核糖核苷酸表达减少,从而上调小管上皮细胞中基质金属蛋白酶.金属蛋白酶组织抑制因子-2(TIMP-2)可广泛抑制基质金属蛋白酶活性(优先与基质金属蛋白酶2结合),为恢复两者的动态平衡,TIMP-2表达增多,同时促炎性细胞因子可直接使小管上皮细胞分泌TIMP-2.转化生长因子β)参与急性肾损伤时胰岛素样生长因子结合蛋白-7(IGFBP-7)增多的过程.IGFBP-7可延长胰岛素、胰岛素样生长因子1半衰期,促进其与受体结合,延长相关通路的激活,并催化酪氨酸蛋白激酶活性,使磷酸果糖激酶活性提高,最终引起急性肾损伤肾小管上皮细胞中糖酵解过程激活、通量增多.TIMP-2与IGFBP-7能加重细胞周期停滞,可作为急性肾损伤细胞周期停滞的标志物.

目的:探讨表皮生长因子受体(EGFR)基因少见突变P733L对第 1 代和第 3 代EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)的敏感性.方法:通过四唑盐比色法和平板克隆实验分析EGFR L858R和P733L 肺癌细胞对第 1 代和第 3 代EGFR-TKI的敏感性;通过Transwell实验分析第1 代和第3 代EGFR-TKI对EGFR L858R和P733L肺癌细胞迁移的抑制作用;通过检测凋亡蛋白分析第1 代和第 3 代EGFR-TKI促进EGFR L858R和P733L肺癌细胞凋亡的作用.结果:第 1 代和第 3 代EGFR-TKI对EGFR L858R和P733L细胞的增殖、克隆形成和细胞迁移都有抑制作用.与 EGFR野生型肺癌细胞相比,第 1 代和第 3 代 EGFR-TKI处理后,EGFR L858R和P733L细胞的EGFR激酶活性受到抑制,细胞凋亡明显增加.结论:EGFR P733L突变细胞对第 1 代和第 3 代EGFR-TKI的敏感性与EGFR L858R突变细胞的敏感性相似,本研究为EGFR基因少见突变从EGFR-TKI治疗中获益提供了实验证据.