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口腔鳞状细胞癌的血清生物标志物鉴定及代谢紊乱特征研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的代谢紊乱特征,并发现和鉴定OSCC的生物标志物,为其早期诊断提供新思路。方法:本研究共纳入2019年8月至2020年1月就诊于郑州大学第一附属医院口腔颌面外科的76例OSCC患者和体检科的70名健康受试者,按照随机数表法按2∶1的比例将所有受试者分为测试组和验证组,测试组共96例受试者,其中OSCC患者51例,健康受试者45名;验证组共50例受试者,其中OSCC患者25例,健康受试者25名。收集所有受试者的血液样本及临床资料,基于超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱技术建立血清样本非靶向代谢组学分析方法,进一步结合主成分分析、偏正交最小二乘法判别分析和 t检验分析发现并鉴定测试组中OSCC患者和健康受试者之间的差异代谢物,并对得到的差异代谢物进行代谢通路分析。二元Logistic回归分析和受试者工作特征曲线分析用以进一步筛选和确定OSCC的生物标志物,构建OSCC诊断模型,用验证组检验诊断模型的诊断效能。 结果:对比分析测试组中OSCC患者和健康受试者的血清样本后得到21种内源性差异代谢物,代谢通路分析提示OSCC患者存在脂质代谢和氨基酸代谢紊乱( P<0.05)。本研究构建了由溶血磷脂酰胆碱(lysophosphatidylcholine,LysoPC)(16∶0/0∶0)、LysoPC[18∶1(9Z)/0∶0]、牛磺酸和D-谷氨酸组成的诊断模型(曲线下面积为0.998,95% CI为0.994~0.999, P<0.05)。 结论:OSCC患者体内发生了明显的脂质和氨基酸代谢紊乱,代谢组学手段是建立OSCC诊断模型的有效方法。
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编辑人员丨4天前
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二陈汤化裁方破壁饮片水溶液的化学成分及入血成分分析
编辑人员丨1周前
目的 分析二陈汤化裁方破壁饮片水溶液的化学成分及入血成分.方法 采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q-Exactive-MS)法对比复方样品、空白血清、含药血清色谱图,分析二陈汤化裁方破壁饮片水溶液在大鼠血清中的原形及代谢产物.结果 从复方样品中共鉴定出151个化学成分,通过对照品比对,最终确定了 11个成分(柠檬酸、绿原酸、橙皮苷、茯苓酸B、熊果酸、天麻素、巴利森苷A、牡荆素、金丝桃苷、人参皂苷Rg1、人参皂苷Rd).共鉴定出33个入血成分,其中28个为原形成分,5个为代谢产物.结论 本实验通过UHPLC-Q-Exactive-MS分析二陈汤化裁方破壁饮片的入血成分,为进一步阐明二陈汤化裁方破壁饮片的药效物质基础提供了参考.
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编辑人员丨1周前
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基于谱-效相关斑马鱼肺癌细胞异种移植模型西洋参抑制肺癌作用的物质基础研究
编辑人员丨3周前
目的 探究西洋参皂苷成分抗肺癌作用的药效物质基础.方法 使用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS)技术建立西洋参皂苷类成分定量指纹图谱检测方法;通过斑马鱼异种移植模型进行药效评价;采用偏最小二乘相关回归分析法分析西洋参抑制肺癌作用的活性成分.结果 通过 40 批次西洋参样品的谱、效数据检测和偏最小二乘相关回归分析发现,西洋参皂苷成分绝大多数与抑制肺癌增值呈正相关,药效贡献程度排序为丙二酰人参皂苷Rb1>人参皂苷Rb1>乙酰基人参皂苷Rb1>竹节参皂苷Ib>丙二酰人参皂苷Re>野山参皂苷B>丙二酰基Re1>人参皂苷Ro>竹节参皂苷Ⅳa(VIP>1).结论 西洋参皂苷成分能够抑制A549 肺癌细胞在斑马鱼体内增殖,筛选的药效活性成分可以为肺癌抑制药物的深入研发提供数据支撑.
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编辑人员丨3周前
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基于HPLC-Q-Exactive Orbitrap MS和特征分子网络技术快速鉴定滇白珠水提物化学成分
编辑人员丨1个月前
目的 采用高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(HPLC-Q-Exactive Orbitrap MS)结合特征分子网络(feature-based molecular networking,FBMN)技术,对滇白珠 Gaultheria leucocarpa var.crenulata 水提物化学成分进行快速分析.方法 采用Agilent Zorbax EclipseXDB-C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,5 μm),以乙腈-0.1%甲酸水为流动相进行梯度洗脱,体积流量为0.8mL/min,在正、负离子模式下,采集滇白珠水提物MS/MS数据,并在全球天然产物社会分子网络(Global Natural Products Social Molecular Networking,GNPS)网站(http://gnps.ucsd.edu)上创建 FBMN.根据 Compound Discoverer软件及GNPS数据库匹配结果,结合化合物的精确相对分子质量、特征碎片离子、色谱保留时间,参考对照品、文献及Pubchem、Massbank数据库,快速鉴定滇白珠水提物的化学成分.结果 共从滇白珠水提物中鉴定出130个成分,并区分了同分异构体,包括黄酮类40个、苯丙素类22个、糖苷类19个、有机酸类10个、生物碱类10个、酚类7个、萜类6个、酯类5个、氨基酸类4个、糖类3个、核苷酸类2个、醛类2个,其中5-O-咖啡酰奎宁酸、4-熊酰奎宁酸、邻苯二甲酸二丙酯这3个成分为根据FBMN结果推测解析.结论 FBMN弥补了传统分子网络在鉴定同分异构体方面的不足,HPLC-Q-Exactive Orbitrap MS结合FBMN能快速、准确、全面地鉴定滇白珠水提物化学成分,可为其进一步开发与应用提供依据.
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编辑人员丨1个月前
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基于UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS和网络药理学研究银甲片治疗盆腔炎的有效成分及作用机制
编辑人员丨1个月前
目的:研究银甲片治疗盆腔炎的有效成分及作用机制.方法:利用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱法(UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS),结合文献与对照品比对鉴定银甲片的化学成分.将化学成分和盆腔炎疾病的交集靶点导入String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;通过DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用Cytoscape 3.9.1 软件构建药材-成分-靶点-通路可视化图;利用Maestro 11.9 软件进行分子对接.结果:从银甲片中共鉴定 58 个化学成分,包含黄酮类、有机酸类、萜类、生物碱类.PPI分析得到类固醇受体辅激活因子(SRC)、热休克蛋白 90α家族A类成员 1(HSP90AA1)、磷脂酰肌醇 3-激酶调节亚基 1(PIK3R1)、信号转导和转录激活因子 3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)5 个核心靶点;KEGG 结果显示银甲片主要通过磷脂酰肌醇 3-激酶-蛋白激酶 B(PI3K-Akt)、MAPK 等通路发挥作用.分子对接结果表明,木犀草苷、山柰酚、木犀草素、香叶木素等成分与 SRC、HSP90AA1、PIK3R1 等 5 个核心靶点的对接构象稳定.结论:银甲片可能通过木犀草苷、山柰酚、木犀草素、香叶木素、芹菜素等活性成分调控PI3K-Akt、MAPK等通路发挥治疗盆腔炎作用.
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编辑人员丨1个月前
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基于UPLC-Orbitrap-HRMS的灵芝化学成分分析及治疗肝纤维化的FXR激活剂的虚拟筛选
编辑人员丨1个月前
采用超高效液相色谱-四极杆静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Orbitrap-HRMS)联用技术对灵芝醇提物的化学成分进行系统分析,总结其代表性化学成分的裂解规律,并对灵芝潜在作用于法尼醇X受体(farnesoid X receptor,FXR)靶点的抗肝纤维化活性物质进行研究,阐明其药效物质基础.初步鉴定出灵芝醇提物95种化学成分,包括灵芝酸类24种、灵芝烯酸类9种、赤芝酸类13种、丹芝酸类3种、灵芝内酯类1种、其他三萜类成分40种、脂肪酸类成分4种、其他类1种,并分析了其裂解规律.如灵芝酸、灵芝烯酸类成分的结构特征以C30为骨架,含有游离的-COOH及-OH,易失去H2O、CO2分子形成碎片离子,D环多为五元环,易发生断裂;赤芝酸类成分属于C27骨架的羊毛甾烷型,与灵芝酸类成分相比其侧链结构变短,由8个碳减少为5个,同灵芝酸类含有常见的游离-COOH、-OH,容易失去H2O、CO2分子.通过选取已报道的6种FXR受体激动剂组成训练集,建立基于FXR配体的药效团模型,以鉴定出的95种灵芝化学成分与药效团进行匹配,通过测试集分子对模型进行验证,选出最优药效团模型02(敏感性=0.750 00,特异性=0.555 56,ROC=0.750)用于对灵芝化合物库的虚拟筛选,经匹配筛选得到31种潜在的可用于激活FXR的灵芝活性成分,随后ADMET预测结果表明灵芝酸H和赤芝酸J与血浆蛋白的结合率低于90%,且无肝毒性,可作为FXR激活剂开发单用或联用治疗肝纤维化的临床药物.
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编辑人员丨1个月前
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基于UHPLC-Q/Orbitrap HRMS结合分子网络技术的经典名方清骨散基准样品化学成分分析
编辑人员丨1个月前
该研究采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q/Orbitrap HRMS)结合分子网络技术快速分析了经典名方清骨散基准样品中化学成分.首先采用ACQUITY UPLC BEH Shield RP18色谱柱(2.1 mm× 100 mm,1.7 μm),以乙腈-0.1%甲酸水为流动相进行梯度洗脱,流速为0.4mL·min-1,柱温30 ℃条件下,在加热电喷雾离子源正、负离子2种模式下采集质谱数据.随后将采集的清骨散基准样品质谱数据上传至全球天然产物社会分子网络(GNPS)平台进行计算分析,并运用Cytoscape 3.8.2软件构建可视化分子网络.在此基础上,根据对照品的裂解规律,结合保留时间、高分辨质谱精确相对分子质量、特征碎片离子、文献报道及数据库匹配等信息鉴定清骨散基准样品中的化学成分.最终从清骨散基准样品中共鉴定和推测出105个化学成分,包括19个环烯醚萜苷类、23个黄酮类、15个苯丙素类、11个三萜皂苷类和37个其他类化合物,其中2个成分为潜在的新化合物.该研究采用的方法不仅实现了清骨散基准样品中化学成分的快速、准确鉴定,为清骨散复方制剂的药效物质研究和质量控制提供科学依据,也为中药复方制剂中化学成分的快速鉴定提供参考.
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编辑人员丨1个月前
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UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术用于法莫替丁有关物质的结构解析
编辑人员丨1个月前
目的 对法莫替丁有关物质进行结构解析.方法 采用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q-Orbitrap HRMS)技术测定离子的准确质量,通过质谱数据,经Xcalibar软件计算元素组成,并利用Mass Frontier软件进行碎片离子匹配,推断法莫替丁强制破坏产生的有关物质结构.结果 对法莫替丁 3 个降解杂质进行了结构解析.结论 UHPLC-Q-Orbitrap HRMS方法能有效地鉴定法莫替丁中的有关物质,为其生产工艺优化和质量控制提供参考.
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编辑人员丨1个月前
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基于超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱法的清热凉血方化学成分分析
编辑人员丨2024/7/20
目的 研究清热凉血方的化学成分.方法 查阅中国知网、PubChem等数据库,检索清热凉血方药材化学成分的相关文献,建立化学成分数据库.采用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q Exactive Focus MS/MS)法分析该方剂的图谱数据,并以Xcalibur 4.0 软件拟合分子式,与自建数据库信息进行匹配,初步推测分子式信息,并结合相关化学成分数据和文献信息对目标化学成分进行鉴定和确证.结果 共鉴定出 66 个化学成分,包括单萜苷类 20 个,酚酸类 10 个,环烯醚萜苷类 8 个,糖苷类、没食子酰葡萄糖类各 4 个,有机酸类、苯乙醇苷类、香豆素类各 2 个,苯丙素类、生物碱类、黄酮类、环肽类、萘醌类、糠醛类各 1 个,其他类 8 个.结论 所建立的方法可系统地对清热凉血方中的化学成分进行定性分析.
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编辑人员丨2024/7/20
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类风湿关节炎免疫特征基因及其与土茯苓黄酮类化合物的关系研究
编辑人员丨2024/7/6
目的 基于Gene Expression Omnibus(GEO)数据集结合LASSO逻辑回归、ssGSEA 和 WGCNA 等生物信息学及统计学方法,筛选与特定免疫细胞浸润相关的类风湿关节炎(RA)诊断标志物,并分析土茯苓黄酮类化合物与其结合情况.方法 通过GEO数据库获取正常对照组和RA组基因芯片.利用R 4.3.0"WGCNA"软件包对数据集进行整合分析,识别其中的共表达模块信息,筛选出与RA密切相关的关键模块.基于R软件中"glmnet"包对差异表达基因进行LASSO回归分析,筛选 RA 的特征基因.受试者工作特征(ROC)曲线下的面积用来评估特征基因对RA的诊断价值.通过 R 中的"GSVA"、"limma"和"GSEABase"程序包对正常对照组和RA组的基因表达数据进行量化免疫细胞浸润分析.基于超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q-Exactive/MS)技术鉴定土茯苓黄酮类化合物.通过分子对接技术分析黄酮类化合物与特征基因的结合情况.结果 LASSO回归算法共筛选出 5 个特征基因(载脂蛋白D,含锌指和 BTB 域 16,趋化因子C-C亚族受体5,基质金属蛋白酶-1 和冠蛋白1A),5 个特征基因的ROC曲线下面积均大于 0.85,特征基因与多种免疫细胞呈正相关.通过UHPLC-Q-Exactive/MS鉴定出土茯苓黄酮类化合物共 20 个,其中 Mulberrin和 Neobavaisoflavone 化合物与 5个免疫特征基因均有较好的结合.结论 土茯苓黄酮类化合物与RA免疫特征基因有较好的结合,能够为RA免疫调节治疗和早期诊断提供科学依据.
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编辑人员丨2024/7/6
