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一例先天性糖基化障碍患者的 ALG11基因变异分析
编辑人员丨23小时前
目的:分析1例先天性糖基化障碍(congenital disorders of glycosylation,CDG)患者的临床特征和基因变异特点,明确其致病原因。方法:分析1例CDG患者的临床资料,采集患者及其父母的外周血样并提取基因组DNA,应用高通量测序技术对患者进行基因检测,对疑似致病变异进行Sanger测序验证及生物信息学分析。结果:患者表现为肌张力低、惊厥,伴代谢性酸中毒、喂养困难,高通量测序示 ALG11基因存在第1外显子c.44G>C(p.Arg15Thr)杂合变异,第3外显子c.806 G>A(p.Trp269*)杂合变异,生物信息学分析预测均为致病性。Sanger测序验证示:患者母亲存在c.44G>C(p.Arg15Thr)杂合变异,患者父母均未发现c.806 G>A(p.Trp269*)变异。 结论:ALG11基因变异可能为CDG患者的致病原因,新变异的检出丰富了基因变异谱,为该家系的遗传咨询提供了依据。
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编辑人员丨23小时前
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ALG13基因变异相关先天性糖基化缺陷Ⅰ型4例临床特点
编辑人员丨23小时前
目的:总结 ALG13基因变异相关的先天性糖基化缺陷Ⅰ型临床表型及基因突变特点。 方法:收集2016年1月至2019年7月在北京大学第一医院儿科就诊的4例 ALG13基因变异癫痫患儿,对其临床资料和基因结果进行分析。 结果:4例患儿中,男1例,女3例。3例错义变异(p.N107S),1例无义变异(p.W112X);2例为新发变异,2例为遗传性变异。癫痫发作起病年龄为3个月~2岁,局灶性发作1例,痉挛发作2例;1例兼有痉挛发作、局灶性发作和强直发作;其中3例为婴儿痉挛症。4例均有发育迟缓,其中孤独症样表现3例,肌张力低下2例,视觉损害1例。脑电图示高峰失律3例,前头部棘波1例,痉挛发作2例。3例头颅磁共振成像正常,1例脑萎缩。末次随访年龄为2岁2个月~4岁4个月,经抗癫痫药物治疗4例仍有发作。结论:ALG13基因以新生变异为主,热点变异为p.N107S;该基因变异多在婴儿期起病,主要表现为发育迟缓和癫痫发作,以婴儿痉挛症表型最常见,部分可出现孤独症样表现、肌张力低下和视觉损害,部分患儿有脑萎缩。
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编辑人员丨23小时前
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全外显子组测序技术在遗传性肾囊肿诊断中的应用价值
编辑人员丨1天前
回顾性分析2023年1月至2024年3月于郑州大学第一附属医院就诊的57个肾囊肿患者家系的临床及分子遗传学资料。先证者年龄3个月~60岁,男31例,女26例。其中48个家系通过全外显子组测序(WES)检测到致病性或疑似致病性变异(P/LP),检出率为84.2%(48/57),包括PKD1、PKD2、PKHD1、LRP5、COL4A4、ALG8基因变异及拷贝数变异(CNV),同时检测到4个PKD1基因意义未明变异(VUS)。在5个WES检测阴性家系中,通过长片段PCR(LR-PCR)+Oxford 纳米孔测序检出1例PKD1基因的无义变异,通过多重连接依赖探针扩增(MLPA)技术检测出1例PKD1基因第22外显子杂合缺失变异。可见,WES可以检出肾囊肿相关基因多种变异类型,有助于肾囊肿患者的早期诊断和预后预测,但对PKD1基因的检测仍有一定漏诊风险,对于WES检测阴性家系仍需警惕。
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编辑人员丨1天前
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基于糖酵解基因表达谱筛选皮肤黑色素瘤预后风险标志物
编辑人员丨1天前
目的:通过生物信息学方法对皮肤黑色素瘤中糖酵解相关基因进行分析并构建预后模型,对黑色素瘤患者进行精准分组以提高治疗的针对性。方法:获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中皮肤黑色素瘤患者[470例,男290例,女180例,中位年龄58岁(15~90岁)]的mRNA表达谱和临床相关数据,并以基因型和基因表达量关联数据库(GTEx)中的正常皮肤组织样本(812例,男467例,女345例)作为对照。采用基因集富集分析(GSEA)富集出与皮肤黑色素瘤显著相关的糖酵解通路差异表达基因。通过Cox回归分析筛选与黑色素瘤预后显著相关的mRNA,并构建黑色素瘤患者预后风险评分(RS)模型。根据风险评分模型RS值的中位值,将符合生存分析条件的450例黑色素瘤患者分为高风险组和低风险组,分析两组生存时间、生存率的差异,并通过绘制ROC曲线,评估RS值对黑色素瘤患者10年、20年死亡风险的预测价值。结果:通过GSEA分析发现糖酵解相关的REACTOME_GLYCOLYSIS通路在黑色素瘤样本中显著富集,标准化富集评分(NES)为1.74,错误发现率(FDR)为0.016。通过对该通路117个差异表达基因(上调71个,下调46个)的单因素和多因素Cox回归分析,筛选出9个与皮肤黑色素瘤预后密切相关的mRNA分子,包括4个保护性因子(STAT3、MLXIPL、IDUA和AURKA)和5个危险性因子(KIF20A、PGM1、GYS1、ALG1和HDAC4)。根据多因素Cox回归分析的回归系数及各基因mRNA表达水平,建立预后风险评分模型:RS=0.31×KIF20A + 0.19×PGM1 - 0.27×STAT3 + 0.24×GYS1 - 0.25×MLXIPL - 0.19×IDUA + 0.33×ALG1 - 0.28×AURKA + 0.26×HDAC4。以RS值的中位值0.83作为cut-off值,将患者分为高风险组(225例)和低风险组(225例),高风险组的总体生存时间为(6.72±0.55)年,明显少于低风险组的(13.60±1.03)年( P<0.001);且高风险组的10年、20年生存率明显低于低风险组(24.1% vs. 50.9%;0 vs. 25.2%; P值均<0.001);RS值对黑色素瘤患者的10年和20年生存预测的ROC曲线下面积分别为0.730、0.749。多因素Cox回归分析显示,RS值是黑色素瘤预后的独立预测因素。 结论:所构建的皮肤黑色素瘤预后风险评分模型可以有效地对患者进行预后风险评价,为后续筛选与糖酵解相关的预后较差患者并进行针对性治疗的研究提供基础。
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编辑人员丨1天前
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19个常染色体显性遗传多囊肾新型基因突变位点的特征研究
编辑人员丨1天前
通过分析具有肾脏多发囊肿的患者及其家属的基因检测资料,找出尚未报道的常染色体显性遗传多囊肾(ADPKD)新型基因突变位点。采用结构预测软件,研究突变前后蛋白结构变化,探索基因型与表型关联,丰富ADPKD基因数据库。本研究为单中心回顾性研究,纳入2019年1月至2023年2月于东南大学附属中大医院就诊的影像学检查示肾脏存在多发囊肿的患者,收集患者及其家属的基因及临床资料。应用AlphaFold v2.3.1软件预测蛋白结构,研究尚未报道的ADPKD新型基因突变前后蛋白结构变化。结果显示,52个家系检出12个可导致肾脏囊肿的突变基因,发现19个ADPKD新型基因突变位点,包含17个多囊蛋白1(PKD1)基因突变(1个剪接突变,7个移码突变,4个无义突变,1个整码突变,4个错义突变);1个α-1,2-甘露糖基转移酶(ALG9)错义突变和1个染色体结构变异。PKD1基因的截短突变与更重的临床表型相关,而非截短突变则与更多的临床异质性相关。目前仍有大量ADPKD新型基因突变位点尚未报道,有必要分析新型突变位点致病性,建立基因型与表型关联,丰富ADPKD基因数据库。
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编辑人员丨1天前
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原代成骨细胞来源胞外囊泡促进破骨细胞分化
编辑人员丨2周前
目的:观察原代成骨细胞来源胞外囊泡(OB-EV)对破骨细胞增殖、分化的作用,探究胞外囊泡参与成骨细胞和破骨细胞之间通信的可能分子机制.方法:采用酶消化法分离原代成骨细胞,并以β-甘油磷酸钠、抗坏血酸、地塞米松成骨诱导液诱导培养,通过碱性磷酸酶染色及茜素红S染色鉴定成骨细胞分化及矿化功能.收集成骨细胞培养上清液,采用超速离心法提取囊泡分泌物,并通过透射电镜观察囊泡形态,蛋白质印迹法鉴定胞外囊泡表面特征性标志物肿瘤易感基因101(TSG101)、ALG-2相互作用蛋白X(Alix)和分化抗原9(CD9).采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)实验检测OB-EV对RAW264.7的增殖作用.进一步通过蛋白质印迹法检测OB-EV与核因子κB受体活化因子配体(RANKL)联合作用后RAW264.7破骨分化标志物的表达水平.将OB-EV处理的小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMM)通过抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)染色观察并比较破骨细胞数,明确OB-EV对破骨细胞分化的影响.结果:透射电镜观察提取的OB-EV呈直径为30~150 nm的双层杯状结构,且TSG101、Alix、CD9呈阳性表达.CCK-8实验结果显示高浓度(20 μg/mL以上)OB-EV抑制RAW264.7增殖(P<0.05).蛋白质印迹法检测发现RAW264.7中c-Fos、活化T细胞核因子(NFATc1)、c-Jun氨基末端激酶(JNK)等破骨细胞分化标志蛋白表达明显增加,且随OB-EV浓度增加而增加(P<0.05).此外,将OB-EV与RANKL联合作用于BMM,结果显示TRAP阳性细胞较RANKL对照组显著增多(P<0.05).结论:OB-EV可促进破骨前体细胞向破骨细胞分化,但高浓度OB-EV会抑制细胞增殖.
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编辑人员丨2周前
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细胞死亡诱导p53靶蛋白1—一种新型凋亡蛋白的功能研究进展
编辑人员丨2023/9/30
细胞死亡诱导p53靶蛋白1(CDIP1)是一种新型凋亡蛋白,参与外源性凋亡通路、内源性凋亡通路及细胞焦亡相关通路,是多通路介导细胞凋亡的关键调节因子.近年来研究发现,CDIP1通过与凋亡因子相结合,参与多种肿瘤、心血管疾病的发生发展.然而,目前CDIP1调控细胞凋亡的分子机制、上下游调控因子及在各类肿瘤及疾病的作用机理亟待深入研究和挖掘.该文就CDIP1在细胞凋亡通路中的功能研究进展,不同凋亡通路中与B细胞受体相关蛋白31(BAP31)、凋亡相关基因-2(ALG2)等蛋白分子的作用机制及其在疾病中的作用进行综述.
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编辑人员丨2023/9/30
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先天性糖基化障碍Ⅰg型一例报告并文献复习
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨先天性糖基化障碍(congenital disorders of glycosylation,CDG) Ⅰg型的临床特征及遗传学特点,提高临床对CDG-Ⅰg型的认识.方法 对上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心收治的1例CDG-Ⅰg型患儿资料进行回顾性分析.以“先天性糖基化障碍Ⅰg型”、“ALG12”、“先天性糖基化缺陷Ⅰg”和“CDG-Ⅰg”、“congenital disorders of glycosylation type Ⅰg”、“congenital disorder of glycosylation Ⅰg”、“ALG12”为关键词,分别对中国知网、维普数据库和万方数据库、生物医学文献数据库(PubMed)、Web of Science数据库自建库至2018年1月收录的文献进行检索,总结CDG-Ⅰg型患儿的临床特征及遗传学特点.结果 本院收治患儿男,生后ld,因“反应差伴低血糖”入院,以面部畸形、肌张力减退、双乳头凹陷、阴茎短小、隐睾为主要表现.入院后因间歇性低血糖、反复感染给予抗感染、静脉补充葡萄糖及激素治疗.内分泌相关激素检查、血尿串联质谱检测结果均正常.全外显子高通量测序分析回报ALG12基因存在复合杂合突变,外显子4存在c.432C>A(p.Cys144*)无义突变,来自父亲,外显子7存在c.904T>C(p.Tyr302His)错义突变,来自母亲,均为新发突变.随访患儿死亡,原因不详.文献检索目前国内尚无CDG-Ⅰg型病例报道.国外文献共收集8例CDG-Ⅰg型患儿,其中男4例,女4例,5例于新生儿期起病,主要临床表现为面部畸形、肌张力低下、生殖腺异常、凝血功能异常、免疫功能低下、反复感染、电解质紊乱等;ALG12基因突变8例,共有11个突变位点;存活6例,死亡2例.结论 CDG-Ⅰg型较罕见,为常染色体隐性遗传,目前报道病例多在新生儿期起病,主要表现为多系统受累,如面部畸形、发育迟缓、肌张力减退、凝血因子减少、男性患儿性腺机能减退、低血糖等,可行ALG12基因检测明确诊断.
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编辑人员丨2023/8/6
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先天性糖基化异常Id型1例临床与基因分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨先天性糖基化异常Id型(CDG-Id)的临床及基因特点.方法 回顾分析1例CDG-Id型婴儿的临床资料及基因检测结果,并复习相关文献.结果 患儿,男,生后2个月开始出现抽搐,运动发育落后于同龄儿,肌力、肌张力偏低.头颅磁共振成像示两侧额颞部脑外间隙增宽,两侧侧脑室饱满.基因测序显示患儿ALG3基因存在两处杂合突变点,分别为c.494A>G(p.His165Arg)和c.33del(p.Gly12fs),确诊为CDG-Id.结论 CDG-Id是常染色体隐性遗传病,为CDG中的罕见类型,以神经系统症状最为突出,ALG3基因检测有助诊断.
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编辑人员丨2023/8/6
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抗人胸腺细胞免疫球蛋白/抗淋巴细胞免疫球蛋白联合环孢素A与异基因造血干细胞移植治疗再生障碍性贫血的疗效比较
编辑人员丨2023/8/6
目的 比较抗人胸腺细胞免疫球蛋白(ATG)/抗淋巴细胞免疫球蛋白(ALG)联合环孢素A与异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)治疗再生障碍性贫血(AA)的疗效及安全性.方法 选择2012年2月至2017年2月,于第四军医大学唐都医院血液科接受住院治疗的全部68例AA患者为研究对象.按照接受治疗方案的不同,将其分为ATG/ALG联合环孢素A组(n=27)与allo-HSCT组(n=41).回顾性分析2组患者的临床资料,比较2组患者的疗效及治疗相关不良反应.采用两独立样本t检验或者Mann-Whitney U检验比较2组患者年龄、中性粒细胞绝对值(ANC)、血小板计数、网织红细胞绝对值、血红蛋白(Hb)值、随访时间的差异;采用x2检验或者校正x2检验比较2组患者的重型再生障碍性贫血(SAA)患者比例、良好血液学反应率、血液学反应率、治疗相关不良反应发生率、早期病死率、总病死率、复发或者进展患者比例的差异;采用Kaplan-Meier法及Log-rank检验对2组患者的总体生存(OS)率、无进展生存(PFS)率进行生存分析.本研究遵循的程序符合2013年修订版《世界医学会赫尔辛基宣言》的要求,征得2组患者的知情同意,并与之签署临床研究知情同意书.结果 ①ATG/ALG联合环孢素A组患者的男、女性别构成比为0.6∶1,低于allo-HSCT组的2.1∶1,并且差异有统计学意义(x2=5.052,P=0.025);2组患者平均年龄、平均ANC数、中位血小板计数、中位网织红细胞绝对值、中位Hb值、SAA患者比例分别比较,差异均无统计学意义(P>0.05).②allo-HSCT组患者的良好血液学反应率(58.5%,24/41)及血液学反应率(82.9%,34/41)分别高于ATG/ALG联合环孢素A组的14.8%(4/27)与51.9%(14/27),并且差异均有统计学意义(x2=12.850,P<0.001;x2=7.572,P=0.006).③ATG/ALG联合环孢素A组患者的治疗相关不良反应发生率为22.2% (6/27),包括4例血清病,2例新发肺部感染及1例肛周感染;allo-HSCT组患者的治疗相关不良反应发生率为63.4% (26/41),包括10例新发感染,16例移植物抗宿主病(GVHD),10例细胞病毒(CMV)感染及2例EB病毒(EBV)感染;并且2组比较,差异有统计学意义(x2=11.090,P<0.001).④ATG/ALG联合环孢素A组患者的早期病死率、总病死率、AA患者疾病复发或进展患者比例分别为3.7%(1/27)、3.7%(1/27)和0(0/27),allo-HSCT组患者分别为7.3%(3/41)、12.2%(5/41)和7.3%(3/41);2组分别比较,差异均无统计学意义(P>0.05).⑤ATG/ALG联合环孢素A组中位随访时间为9.0个月(5.0~19.0个月),allo-HSCT组为12.0个月(7.0~22.5个月),2组比较,差异无统计学意义(P>0.05).生存分析结果显示,ATG/ALG联合环孢素A组与allo-HSCT组患者的3年OS率分别为96.3%与86.2%,PFS率分别为92.4%与84.0%,2组分别比较,差异均无统计学意义(P>0.05).结论 采用ATG/ALG联合环孢素A治疗AA的临床疗效不及allo-HSCT,但是安全性高于allo-HSCT.在采用allo-HSCT对AA患者进行治疗时,应该高度重视移植相关不良反应的预防及治疗.
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编辑人员丨2023/8/6
