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甘氨酸脑病两例
编辑人员丨5天前
本文报道2例新生儿期发病的甘氨酸脑病患儿,主要表现为反应差、肌张力低下、呼吸节律改变、惊厥及打嗝等,并且症状在短期内进行性加重,治疗效果差,均因呼吸衰竭死亡。基因检测分别发现GLDC基因和AMT基因突变,均为甘氨酸脑病的致病基因。新生儿期发病的甘氨酸脑病预后差、病死率高,临床医生应提高对该病的认识。
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编辑人员丨5天前
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AMT基因突变致非酮性高甘氨酸血症家系的临床表型及遗传学分析一例
编辑人员丨5天前
非酮性高甘氨酸血症(NKH)是一种罕见的先天性遗传代谢性疾病,临床上存在诊断率低的情况。文中报道1例AMT基因突变所致NKH病例,该患儿以疑似新生儿败血症起病,之后病情迅速恶化,出现呼吸暂停、呃逆、昏迷、惊厥等。查血糖、酮体、血气分析电解质、血氨等均大致正常。血、尿筛查结果提示甘氨酸水平稍高,脑脊液与血清甘氨酸浓度比增高。脑电图提示暴发抑制。高通量全外显子组测序结果检出存在AMT基因的母源外显子3 c.664C>T(p.Arg222Cys)致病变异,父源外显子3 c.793C>T(p.Arg265Cys)疑似致病变异,为常染色体隐性遗传复合杂合致病。现将该患儿的临床诊疗经过、基因突变特点进行总结。
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编辑人员丨5天前
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新生儿非酮症性高甘氨酸血症1例并文献复习
编辑人员丨5天前
目的:探讨新生儿非酮症性高甘氨酸血症(nonketotic hyperglycinemia,NKH)的临床表型和基因型特点。方法:对苏州大学附属儿童医院收治的1例重症NKH患儿临床资料进行回顾性分析。并以“甘氨酸裂解酶”、“甘氨酸脱羧酶”、“非酮症性高甘氨酸血症”、“甘氨酸脑病”为关键词,检索中国知网、维普数据库、万方数据库和中华医学期刊全文数据库,以“glycine cleavage enzyme”、“glycine decarboxylase”、“nonketotic hyperglycinemia”、“glycine encephalopathy”为关键词检索生物医学文献数据库、web of science数据库和Embase数据库,检索时间自建库至2022年12月31日。总结新生儿NKH的临床表型和基因型特点。结果:本例患儿生后第2天出现反应差、纳差,继而出现阵发性惊厥、呼吸不规则,需要机械通气,于3周龄死亡。全外显子组基因测序发现GLDC基因中有两个复合杂合变异,分别为母源的c.848C>G(p.A283G)和父源的c.1607G>A(p.R536Q),前者为未报道过的变异。检索国内外文献共收集到基因变异所致新生儿NKH 53例,加上本例共54例。NKH患儿主要表现为纳差、肌张力减低、呃逆、进行性嗜睡、呼吸不规则或呼吸暂停、新生儿惊厥。54例变异序列中GLDC基因变异42例(77.8%),AMT基因变异9例(16.7%),LIAS基因变异2例(3.7%),GCSH基因变异1例(1.9%)。结论:新生儿NKH临床表现多样,以神经系统表现最多见,GLDC基因变异为主要致病变异。
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编辑人员丨5天前
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肌肉注射含内皮PAS结构域蛋白1(EPAS1)基因的慢病毒改善外周动脉血管病模型大鼠后肢缺血及其机制
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究内皮PAS结构域蛋白1(EPAS1)过表达对外周动脉病大鼠模型的保护作用.方法 利用单侧髂外动脉结扎法制备大鼠外周动脉血管病模型,将带有EPAS1基因的慢病毒注射到大鼠右侧大收肌.利用步态分析仪检测大鼠步态改变,激光多普勒检测大鼠后肢血流量变化,实时定量PCR检测EPAS1和促血管生长的肝细胞生长因子(HGF)、碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)和血管内皮细胞生长因子(VEGF)的mRNA水平,免疫组织化学染色检测α平滑肌肌动蛋白(αSMA)水平.结果 成功制备了大鼠后肢缺血模型,与注射对照病毒lenti-EGFP组相比,从手术后7d开始,lenti-EPAS1注射组大鼠步态障碍得到明显缓解,后肢血流量明显恢复;缺血大鼠大收肌中HGF、bFGF、VEGF的mRNA水平增加,肌组织中αSMA表达明显增多.结论 过表达EPAS1能改善大鼠缺血部位血流量,促进相关细胞因子表达和新生血管生成.
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编辑人员丨2023/8/6
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大叶藻基因组铵根转运蛋白AMT的生物信息学特征
编辑人员丨2023/8/6
本研究利用生物信息学方法,对大叶藻基因组中8个铵根转运蛋白(ZrnAMTs)基因特征、氨基酸组成成分、理化性质以及二级结构进行预测和分析,同时还分析了大叶藻与拟南芥、水稻、烟草及百脉根的AMT基因家族之间的联系.大叶藻基因组中8个AMT基因分为AMT1(5个成员)和AMT2(3个成员)两个子家族,所编码的蛋白质含有9~11个跨膜区,且均为疏水性蛋白质,二级结构均由α螺旋、直链延伸和无规卷曲三种形式构成.除此之外,大叶藻AMT家族蛋白具有相似的三维结构,多数成员定位于细胞质、质膜和叶绿体膜上.本研究对大叶藻铵根转运蛋白进行了详细的生物信息学分析,可为今后深入研究该家族基因的结构特征和功能提供参考.
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编辑人员丨2023/8/6
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意大利蜜蜂工蜂中肠响应Nosema ceranae胁迫的高表达基因分析
编辑人员丨2023/8/6
东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae是专性寄生蜜蜂中肠上皮细胞的单细胞真菌,对意大利蜜蜂(意蜂)具有较强的侵染性.本研究利用RNA-seq技术对正常10 d(Apis mellifera ligustica control group,AmCK)和N.ceranae胁迫10 d的意蜂工蜂中肠(Apis mellifera ligustica treatment group,AmT)进行测序,共得到160 847 237 100条原始读段,过滤后得到1 066 955 298条有效读段.主成分分析结果显示AmCK与AmT测序样品的组内重复性较好,组间的基因表达模式差异明显.GO分类结果显示,AmCK与AmT的前100位高表达基因(HEGs)分别分布于32和33个GO terms,基因富集数最多的均为代谢进程.KEGG代谢通路(pathway)富集分析结果显示,AmCK的前100位HEGs富集在21个pathways,基因富集数最多的是内吞作用、信号通路和嘌呤代谢;AmT的前100位HEGs富集在26个pathways,基因富集数最多的是内吞作用、RNA转运和蛋白质的内质网加工.前100位HEGs的Venn分析结果显示AmCK与AmT的共有HEGs为87个,特有HEGs分别均为13个.研究结果揭示了Ⅳ.ceranae胁迫意蜂工蜂中肠过程中的基因表达谱信息,也为解析Ⅳ.ceranae致病的分子机理提供了有益信息和线索.
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编辑人员丨2023/8/6
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混合砷暴露对Nrf2抑制细胞Keap1和N6AMT1表达的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探究混合砷染毒对核转录因子红细胞系-2p45(NF-E2)因子-2(nuclear erythroid 2-related factor,Nrf2)抑制的人永生化角质形成细胞(human immortalized keratinocytes,HaCaT细胞)Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白1(Kelch-like ECH-associated protein,Keap1)和N-6-腺嘌呤DNA甲基转移酶(N-6-adenine DNA methyltransferase,N6AMT1)表达的影响.方法 细胞培养72 h,分为4组:空白对照组、Keap1抑制对照组、Nrf2抑制对照组和三个Nrf2抑制混合染砷组,混合砷染毒浓度分别为2.1μmoL/L、4.2μmol/L、21.0 μmol/L;采用实时荧光定量PCR和蛋白质分子印记(western blot)方法测定各组细胞N6AMT1、Keap1的mRNA和蛋白水平.结果 与Nrf2抑制对照组比较Keap1和N6AMT1 mRNA表达不全相等(均有P<0.05).与Nrf2抑制对照组比较,低、中、高剂量Keap1蛋白表达促进(均有P<0.05),N6AMT1蛋白表达呈低剂量促进(t=-3.18,P=0.034),中、高剂量抑制(均有P<0.05).结论 Nrf2抑制状况下,N6AMT1基因可能与Keap1-Nrf2通路调控有关.低剂量砷暴露时,Keap1激活可促进N6AMT1基因表达,促进砷代谢;高剂量砷暴露N6AMT1蛋白表达下调,抑制砷代谢.Keap1-Nrf2通路可能参与N6AMT1表达调控,而影响砷毒性作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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As3MT、N6AMT1基因-环境交互作用对砷暴露所致皮肤损伤影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨砷甲基转移酶(As3MT)和N-6-腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1(N6AMT1)基因多态性及基因-环境交互作用与砷暴露所致皮肤损伤(AISL)的关联性.方法 于2010年9月到2011年12月在内蒙古五原县入选饮水型砷暴露人群335人,65例被确诊患有AISL.应用MassARRAY(R)分子量阵列平台检测基因型,高效液相色谱-电感耦合等离子体质谱联用法测定尿砷代谢物,砷暴露时间由其高砷水饮用时间确定,多因子降维法与岭回归模型分析基因型、环境因素的单独效应及基因-环境的交互作用.结果 As3MT基因rs3740400位点CA/AA基因型、N6AMT1基因rs1006903位点GC/CC基因型和尿二甲基胂酸(DMA)升高为AISL的独立危险因素(P< 0.05).rs3740400位点基因型-尿无机砷(iAs)-单甲基胂酸(MMA)的交互作用与AISL发生风险间存在显著的统计学关联(OR=0.62,95%CI=0.41~ 0.94,P=0.024),模型的验证样本准确率为0.577 6,交叉验证一致性为9/10.结论 As3MT、N6AMT1基因多态性及尿砷化合物水平均与AISL独立相关,rs3740400位点基因型、尿iAs和MMA的交互作用在慢性砷中毒的发生发展中具有重要作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达微小RNA及其靶基因分析
编辑人员丨2023/8/6
[目的]蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis(简称球囊菌)是一种特异性侵染蜜蜂幼虫肠道的致死性真菌病原.微小RNA(microRNA,miRNA)是一种在转录后水平对mRNA进行负调控的关键调控因子.本研究旨在对意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica(简称意蜂)幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达miRNAs(DEmiRNAs)及其靶基因进行深入分析,为揭示DEmiRNAs在胁迫应答中的作用提供重要信息.[方法]利用small RNA-seq (sRNA-seq)技术对正常及球囊菌侵染的意蜂6日龄幼虫肠道(分别表示为AmCK和AmT)进行测序,通过相关生物信息学软件对DEmiRNAs进行预测和分析.利用TargetFinder软件预测DEmiRNAs的靶基因,然后利用Blast软件对靶基因进行GO和KEGG数据库的功能注释.通过Cytoscape软件构建DEmiRNAs与其靶mRNAs的调控网络.通过茎环实时荧光定量PCR(stem-loop RT-qPCR)验证测序数据的可靠性.[结果]AmCK和AmT的测序分别得到9 230 496和10 823 667条有效序列标签;AmCKvsAmT比较组中包含15个上调和6个下调miRNAs,分别结合3 503和3 252个靶基因,它们可分别注释到40和39个GO terms以及104和99条代谢通路;进一步分析发现调控网络中的17个DEmiRNAs靶向结合116个与丝氨酸蛋白酶相关的mRNAs,14个DEmiRNAs靶向结合54个与泛素介导的蛋白水解相关的mRNAs.Stemloop RT-qPCR验证结果显示随机选择的4个DEmiRNAs(miR-251-x,miR-9277-y,miR-1672-x和miR-4968-y)的表达量变化趋势与测序结果一致,表明测序数据真实可信.[结论]本研究率先对意蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的DEmiRNAs及其靶基因进行预测与分析,提供了miRNAs的表达谱和差异表达信息.ame-miR-927b,miR-429-y和miR-8440-y等DEmiRNAs可能参与对丝氨酸蛋白酶的调控和对泛素介导的蛋白水解的调控,DEmiRNAs与靶基因之间存在复杂的调控网络关系.DEmiRNAs可参与到意蜂幼虫肠道与球囊菌间的互作.
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编辑人员丨2023/8/6
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淋巴细胞性结肠炎患者褪黑素的合成和代谢变化
编辑人员丨2023/8/6
目的 评价褪黑素的合成和代谢在淋巴细胞性结肠炎(LC)患者体内的变化.方法 检测LC患者(LC组,32例)和健康人(NC组,20例)尿液6-羟基硫酸褪黑素(aMT6s)含量,采用荧光定量PCR检测褪黑素合成相关基因色氨酸羟化酶1(TPH1)、5-羟色氨酸脱羧酶(5-HTPDC)、芳烷基胺-N-乙酰转移酶、N-乙酰血清素甲基转移酶以及代谢相关基因细胞色素P450酶CYP1A2 mRNA表达情况.结果 与NC组比较,LC组尿液aMT6s含量较低,结肠组织中TPH1和5-HTPDC mRNA相对表达量均降低(P<0.05).两组结肠组织中CYP1A2 mRNA表达无统计学差异(P>0.05).结论 LC患者尿液中aMT6含量降低是由于褪黑素的合成减弱,这一过程受基因TPH1和5-HTPDC的调控,与褪黑素的代谢无关.
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编辑人员丨2023/8/6
