目的:通过对两个Coffin-Siris综合征家系先证者的临床表征及基因变异分析，揭示其可能的遗传发病机制，为家系的遗传咨询提供依据。方法:应用全外显子组测序技术对两例先证者进行致病原因筛查，结合临床表型确定可能致病的候选基因，用Sanger测序法对先证者及其家系成员进行变异验证。结果:WES检测结果显示家系1先证者 ARID1B基因存在c.5467delG(p.Gly1823fs)杂合变异。家系2先证者检出 ARID1B基因c.5584delA(p.Lys1862fs)杂合变异。Sanger测序结果表明两家系先证者父母 ARID1B基因均为野生型，经检索人类变异数据库，两变异均为未报道过的新变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会指南， ARID1B基因的c.5467delG和c.5584delA变异均为致病变异(PVS1+PS2+PM2)。 结论:ARID1B基因c.5467delG(p.Gly1823fs)及c.5584delA(p.Lys1862fs)可能分别为两家系的致病原因，基因检测结果为家系的遗传咨询提供了依据。

目的:探讨上皮样肉瘤（ES）的临床病理及分子遗传学特征。方法:收集解放军东部战区总医院（南京大学医学院附属金陵医院）2006—2018年病理科共10例ES病例进行回顾性研究，分析其临床病理特征，并利用二代测序检测其相关分子遗传学特征。结果:10例ES中，男性7例，女性3例；年龄26~64岁（平均年龄37.3岁）。组织学诊断包括经典型9例、近端型1例。在10例ES标本中，发生SWI/SNF复合物家族基因突变7例，其中SMARCB1拷贝数缺失4例，是最常见的分子遗传学改变。其次，还包括ARID1A基因突变2例、ARID5B基因突变1例、ARID1B基因突变1例及SMARCA4基因突变1例；同时还检测到5例存在PI3K-Akt信号通路的突变。同一个病例亦可同时存在多种SWI/SNF复合物家族基因的异常：其中以SMARCB1和其他基因突变共存较为常见。结论:ES有多种形态学亚型，诊断上较为困难，SWI/SNF复合物家族基因突变在ES中频繁出现。其中SMARCB1的占比最高，其失活的分子机制通常为拷贝数缺失。二代测序作为近年来发展起来的一种比较先进的测序方法，可有效筛选相关基因突变，为临床医师提供潜在治疗靶点，从而改善患者预后。

目的:分析年龄≤60岁上尿路尿路上皮癌(UTUC)患者的胚系致病性突变，探讨胚系致病性突变携带者的临床病理特征。方法:回顾性分析复旦大学附属肿瘤医院2008年9月至2023年2月接受胚系基因检测的124例年龄≤60岁UTUC患者的临床资料。男86例，女38例；年龄55.0(49.8，58.0)岁；原发肿瘤位于肾盂81例(65.3%)，位于输尿管34例(27.4%)，二者兼有9例(7.3%)。低级别UTUC 13例(10.5%)，原位癌8例(6.5%)。12例(9.7%)有膀胱癌病史，12例(9.7%)有其他恶性肿瘤病史。取患者外周血标本，行全基因组外显子测序或靶向测序寻找UTUC相关的胚系突变。按照美国医学遗传学与基因组学/美国分子病理学协会(ACMG/AMP) 2015版指南，对胚系基因检测数据进行解读，分析胚系致病性突变率，并探究胚系致病性突变携带者的临床病理特征。进一步与东亚健康人群的胚系致病性突变率比较，分析与UTUC致病风险相关的胚系突变。结果:本研究124例中，28例(22.6%)共检测到31个胚系致病性突变。有胚系致病性突变患者与无胚系致病性突变患者的年龄[54.0(47.0，58.0)岁与56.0(50.8，58.0)岁]、性别(男/女：21/7岁与65/31岁)、有膀胱癌病史(0与12/96)、T分期(T 3~4期：12/28与41/96)、组织学高级别比例(26/28与85/96)的差异均无统计学意义( P>0.05)。31个胚系致病性突变位于22个基因上，分别为BRCA2(4例，12.9%)、MSH2(3例，9.7%)、RAD54L(2例，6.5%)、BRCA1(2例，6.5%)、BRIP1(2例，6.5%)、NOTCH3(2例，6.5%)、XRCC2(1例，3.2%)、VEGFA(1例，3.2%)、TBX3(1例，3.2%)、RET(1例，3.2%)、PRKN(1例，3.2%)、PALB2(1例，3.2%)、NTRK1(1例，3.2%)、NCOA3(1例，3.2%)、MSH6(1例，3.2%)、LRP1B(1例，3.2%)、KMT2D(1例，3.2%)、KMT2A(1例，3.2%)、FANCA(1例，3.2%)、BARD1(1例，3.2%)、ARID1A(1例，3.2%)和AR(1例，3.2%)基因。对124例患者的胚系致病性突变率与东亚健康人群的胚系致病性突变率进行比较，结果显示BRCA2 ( OR＝11.9, 95% CI 3.8 ~37.7, P<0.001)、MSH2( OR＝11.9, 95% CI 3.2~44.5, P<0.001)、RAD54L( OR＝14.2, 95% CI 2.7~73.8， P＝0.002)和BRCA1 ( OR＝11.8, 95% CI 2.4~59.1， P＝0.003)基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。 结论:本研究年龄≤60岁UTUC患者的胚系致病性突变率为22.6%，携带BRCA2、MSH2、RAD54L或BRCA1基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。

目的:分析1例精神发育迟滞患儿的临床表型及遗传学特点，明确其致病原因。方法:应用二代测序对患儿进行遗传学检测并对变异位点进行生物信息学软件分析。结果:全外显子组高通量测序显示患儿携带新发的 ARID1B基因c.4035G>C (p.Gln1345His)杂合变异，该变异国内外尚无报道。生物信息学软件分析该位点变异导致蛋白结构不稳定，致病性高。 结论:ARID1B基因错义变异可能导致患儿精神发育迟滞，变异的检出可以为家系的遗传咨询及产前诊断提供依据。

目的:探讨不同的错配修复（MMR）蛋白和微卫星不稳定性（MSI）状态检测方法在子宫内膜癌分子分型中的一致性及差异原因。方法:收集2021年1月至2023年4月北京大学第三医院病理科诊断的214例子宫内膜癌患者，对其MMR蛋白的免疫组化（MMR-IHC）检测结果进行复核，通过二代测序（NGS）技术进行MSI状态（MSI-NGS）及多基因体细胞突变、胚系MMR基因突变检测，计算肿瘤突变负荷（TMB）值。对MMR-IHC检测与MSI-NGS检测结果不相符的患者进一步进行MSI-PCR检测和MLH1基因启动子甲基化检测，并结合TMB值综合评估MMR、MSI状态，明确分子分型。结果:（1）214例子宫内膜癌患者中，POLE突变（POLEmut）型22例，错配修复缺陷（MMR-d）型55例，p53异常（p53abn）型29例，无特殊分子改变（NSMP）型108例。其中，MMR-d型患者的中位确诊年龄为54岁、侵袭性病理亚型（包括子宫内膜样癌G 3和非子宫内膜样癌）的比例为40.0%（22/55），均高于NSMP型［分别为50岁、12.0%（13/108）］，两者分别比较，差异均有统计学意义（ P均<0.05）。（2）214例患者中，MMR-IHC检测显示，153例患者判定为错配修复正常（MMR-p），49例判定为MMR-d，12例患者难以直接判读；MSI-NGS检测显示，164例患者判定为微卫星稳定性（MSS；与MMR-p对应），48例患者判定为高度微卫星不稳定性（MSI-H；与MMR-d对应），2例患者因有效测序深度未满足质控标准而无MSI结果。MMR-IHC检测与MSI-NGS检测结果的一致率为94.3%（200/212），12例不符合患者的MMR-IHC检测结果为MMR-d或亚克隆缺失，但MSI-NGS检测均判定为MSS，其中MLH1和PMS2蛋白表达共缺失或亚克隆缺失10例。12例不符合患者中，3例检出POLE基因致病性突变而归为POLE突变型；另外9例患者中，8例有MSI-PCR检测结果的患者中5例为MSI-H、3例为低度微卫星不稳定性（MSI-L），7例TMB值高于10个突变/Mb，6例检出MLH1基因启动子甲基化，综合分析后9例患者均判定为MMR-d。（3）55例MMR-d型子宫内膜癌患者中，15例（27.3%，15/55）确诊为Lynch综合征。15例Lynch综合征相关MMR-d型子宫内膜癌患者的TMB值［（71.5±20.1）个突变/Mb］显著高于40例散发性MMR-d型子宫内膜癌患者［（41.9±24.3）个突变/Mb； t=3.51， P=0.001］；20例MSH2和（或）MSH6蛋白表达缺失患者的TMB值［（71.0±26.2）个突变/Mb］显著高于35例MLH1和（或）PMS2蛋白表达缺失者［（38.2±19.1）个突变/Mb； t=-4.71， P<0.001］。55例MMR-d型子宫内膜癌患者中，突变率排序前10个的基因是PTEN（85.5%，47/55）、ARID1A（80.0%，44/55）、PIK3CA（69.1%，38/55）、KMT2B（60.0%，33/55）、CTCF（45.5%，25/55）、RNF43（40.0%，22/55）、KRAS（36.4%，20/55）、CREBBP（34.5%，19/55）、LRP1B（32.7%，18/55）、BRCA2（32.7%，18/55）基因，其中PTEN、ARID1A、PIK3CA基因共突变率为50.9%（28/55）。 结论:MMR-IHC检测与MSI-NGS检测结果的—致率较高，两种方法检测结果不一致多见于MLH1基因启动子高甲基化状态导致的MLH1和PMS2蛋白表达共缺失或MMR蛋白亚克隆缺失，必要时应结合MLH1基因甲基化、MSI-PCR、MMR基因胚系突变及TMB值综合评估MMR、MSI状态，为子宫内膜癌患者提供精准的分子分型。

目的:分析2例无明显原因精神运动发育迟缓、面容异常的患儿的基因特征，加强对Coffin-Siris综合征(CSS)的认识与了解。方法:选取2019年7月至2021年1月因"发育迟缓"就诊于中国人民解放军联勤保障部队第九八〇医院新生儿科的2例CSS患儿，其中男性1例，女性1例，及其家系成员2代，共计7人作为研究对象。收集患儿及家庭成员的临床资料和家族史，对患儿进行详细的体格检查，完善实验室及相关辅助检查。对患儿及其父母进行全外显子组测序(WES)和基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)，确认变异基因位点及拷贝数变异(CNV)。结果:患儿1为8月龄女性，存在小头畸形、房间隔缺损、第五指/趾侧弯、四肢肌张力低下。患儿2为2岁6个月男性，存在语言迟缓、社交障碍、毛发浓密，第五指无弯曲。基因检测发现患儿1在 ARID1B基因存在第8～21外显子杂合缺失，家系验证显示其父母均为野生型，考虑为新发变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)和美国分子病理学会发布的序列变异解读标准和指南，该变异评级为致病性变异(PVS1＋PS2＋PM2_Supporting)。患儿2的 ARID1B基因存在1个杂合变异c.4263-6(IVS17)T>G，转录组测序结果显示该变异会影响正常剪接，致第17内含子中5 bp序列滞留，家系验证显示其父母均为野生型，考虑为新发变异。根据ACMG变异标准与指南，c.4263-6(IVS17)T>G评级为致病性变异(PS2＋PM2_Supporting＋PP3＋PS3)。 结论:利用WES和CNV-seq技术确诊了2例CSS患儿，发现的变异拓展了CSS新的致病基因变异谱，为家庭遗传咨询提供了可靠的依据。

目的:对2例不相关的临床表现为发育迟缓和粗犷面容的患儿进行表型和基因变异分析，探讨表型和基因型的相关性，为家系遗传咨询提供依据。方法:收集2例患儿及其家系成员的临床资料和家族史，采用全外显子组测序分析患儿致病基因，确定可疑变异位点后对家系成员行Sanger测序验证。结果:两例患儿临床均表现为整体发育迟缓、粗犷面容、低张力、先天性心脏病、漏斗胸等，患儿1携带 ARID1B基因c.3586delC(p.Gln1196Serfs*15)杂合新发变异，患儿2携带 ARID1B基因c.4954_4957delACGT(p.Thr1652Glyfs*31)杂合新发变异，两个变异均未见既往研究报道，且均未见gnomAD数据库收录。 结论:明确了 ARID1B基因的无义变异为两个Coffin-Siris综合征1型患者的致病原因。进一步丰富了中国Coffin-Siris综合征1型患者的表型谱和突变谱，并为受累家庭的产前诊断提供依据。

目的:探讨胃SWI/SNF复合体缺失的伴横纹肌样特征未分化癌的临床病理学和分子遗传学特征。方法:收集河南省肿瘤医院2019年1月至2021年12月诊断胃SWI/SNF复合体缺失的伴横纹肌样特征未分化癌6例，对其进行组织学观察、免疫组织化学染色及二代测序，并行错配修复（MMR）蛋白、EB病毒编码的RNA（EBER）、HER2检测，总结其临床病理及分子特点，进行相关文献复习。结果:6例患者均为男性，年龄48~75岁，首发症状主要为腹痛、黑便、吞咽不利，内镜提示胃部溃疡型肿物，镜下形态相似：肿瘤细胞呈弥漫浸润性生长，细胞异型性明显，核分裂象易见，并可见到比例不等的丰富嗜酸性胞质呈横纹肌样形态细胞。免疫组织化学3例广谱细胞角蛋白（CKpan）为阴性，但其他上皮标志物如上皮细胞膜抗原（EMA，6/6）、细胞角蛋白（CK）8/18（4/6）、CK7（1/6）可见灶性区阳性表达；p53蛋白4例弥漫强阳性（4/6），1例为阴性（1/6）；Ki-67阳性指数60%~90%。其他间叶源性肿瘤、淋巴造血系统肿瘤、色素细胞肿瘤、生殖细胞肿瘤等相关标志物均为阴性表达。SWI/SNF复合体亚基检测，即INI1（SMARCB1）、BRG1（SMARCA4）、ARID1A蛋白检测，5例为SMARCA4缺失表达（5/6），1例为ARID1A缺失表达（1/6），所有病例SMARCB1均未缺失；进行MMR检测，其中1例为MMR缺陷。3例HER2表达为0（3/6），1例为1+（1/6），2例为2+（2/6），行荧光原位杂交（FISH）检测HER2基因均无扩增；6例患者EBER均为阴性。4例手术根治标本行二代测序，3例检测到TP53突变（3/4），1例检测到ARID1A基因移码缺失突变，同时存在ATM、PTEN等突变，1例检测到SMARCA4基因拷贝数变异，同时存在ALK、BRAF、CDKN1B、BRCA2等基因突变。结论:胃SWI/SNF复合体缺失的伴横纹肌样特征未分化癌是一种分化极差且罕见的肿瘤，进行SWI/SNF复合体相关蛋白检测有助于诊断，与SWI/SNF复合体相关的基因改变将成为以后诊断、预后评估的新指标以及潜在的分子治疗新靶点，值得进一步关注。

患者，女，44岁。主因"反复乏力、晕厥3个月"入院。查体：体重30.0 kg，身高130 cm，发育不良，重度贫血面容，右手拇指畸形，双手部分手指弯曲状。既往史：自幼中耳炎史，后渐耳聋、失聪，未就医诊治。家族史：患者父亲已故；母亲体健，身高约150 cm，怀孕时有多种药物服药史；丈夫身体健康，育一女，身体健康，身高160 cm，智力正常。血常规：WBC 4.05×10 9/L，HGB 59 g/L，PLT 213×10 9/L，网织红细胞比值（Ret）0.30%，平均红细胞体积（MCV）94.7 fl，红细胞分布宽度（RDW）13.8%，平均血红蛋白浓度（MCHC）333 g/L。血清铁蛋白590.19 μg/L，叶酸>45.30 nmol/L，维生素B 12 414.05 pmol/L。自身抗体全套：抗核抗体（ANA)核颗粒型（1∶80）阳性，抗心磷脂抗体弱阳性，余正常。细小病毒B19 IgG、IgM均阴性。外周血T淋巴细胞亚群：CD3 + 90%，CD3 + CD4 + 60%，CD3 +CD8 + 27%。溶血性贫血组套、直接抗人球蛋白试验（DAT）、CD55、CD59正常。骨髓涂片：增生活跃骨髓象，红系有核红细胞少见，仅晚期幼稚红细胞0.5%。粒系中原始粒细胞以下可见，中、晚期幼稚粒细胞及分叶核粒细胞比例偏高，形态大致正常。全片巨核细胞15个，其中颗粒巨核细胞8个，产板巨核细胞5个，裸核型巨核细胞2个。骨髓铁染色：外铁（++）；内铁：有核红细胞少见，内铁阳性率不宜评估。骨髓活检：未见幼稚细胞增多，巨核细胞未见明显病态造血，红系细胞少见；染色体核型：46，XX[20]。骨髓流式细胞未检测到明显的免疫表型异常证据。血液病常见56种融合基因筛查阴性。骨髓标本ARID1B基因插入突变：c.1041_1043dupGGC（p.A350dupA），突变频率31.9%。丝裂霉素C染色体畸变结果正常。彗星试验：外周血淋巴细胞DNA存在损伤，彗星细胞率17%，未见凋亡细胞。遗传性血液病相关基因单核苷酸变异（SNV）检测：①未检测到受检者血液系统遗传病相关基因的微小致病性基因变异；②拷贝数变异（CNV）检测提示15号染色体q26.2q26.3区域存在大小约5.1 Mb的大片段杂合缺失，该区域包含40个基因，其中OMIM收录的基因有MEF2A、LINS1、ADAMTS17、CERS3、ALDH1A3、CHSY1、IGF1R等，建议应用CMA方法进行确认。染色体微阵列（CMA）检测：应用CytoScan HD芯片证实chr15q26.2q26.3存在约5.2 Mb缺失，基因组位点：arr [GRCh37]15q26.2q26.3(97236143_102429112)x1，CNV类型：缺失，长度：5.2 Mb，与15q26缺失综合征有关。诊断：15q26末端缺失综合征、纯红细胞再生障碍（PRCA）。予泼尼松1 mg/kg治疗，3周后复查HGB 90 g/L，WBC 10.80×10 9/L，PLT 360×10 9/L，摆脱输血依赖，目前一般情况良好，3个月后血常规完全恢复正常。

卵巢透明细胞癌（OCCC）是卵巢上皮性癌中少见的病理亚型，目前的治疗以手术和化疗为主。但是OCCC对化疗药物不敏感，晚期及复发患者的预后差。近年来，随着分子生物学技术的发展，OCCC的分子特征及靶向治疗的研究得以不断深入，此外，免疫治疗在部分OCCC患者中也显示出一定的临床疗效。本文就抗血管生成药物、靶向ARID1A基因突变药物、磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）/雷帕霉素靶蛋白（mTOR）信号通路抑制剂和免疫检查点抑制剂治疗OCCC的研究进展作一综述，为探索新的OCCC治疗策略提供参考。