目的:探讨上皮样肉瘤（ES）的临床病理及分子遗传学特征。方法:收集解放军东部战区总医院（南京大学医学院附属金陵医院）2006—2018年病理科共10例ES病例进行回顾性研究，分析其临床病理特征，并利用二代测序检测其相关分子遗传学特征。结果:10例ES中，男性7例，女性3例；年龄26~64岁（平均年龄37.3岁）。组织学诊断包括经典型9例、近端型1例。在10例ES标本中，发生SWI/SNF复合物家族基因突变7例，其中SMARCB1拷贝数缺失4例，是最常见的分子遗传学改变。其次，还包括ARID1A基因突变2例、ARID5B基因突变1例、ARID1B基因突变1例及SMARCA4基因突变1例；同时还检测到5例存在PI3K-Akt信号通路的突变。同一个病例亦可同时存在多种SWI/SNF复合物家族基因的异常：其中以SMARCB1和其他基因突变共存较为常见。结论:ES有多种形态学亚型，诊断上较为困难，SWI/SNF复合物家族基因突变在ES中频繁出现。其中SMARCB1的占比最高，其失活的分子机制通常为拷贝数缺失。二代测序作为近年来发展起来的一种比较先进的测序方法，可有效筛选相关基因突变，为临床医师提供潜在治疗靶点，从而改善患者预后。

目的:探讨不同的错配修复（MMR）蛋白和微卫星不稳定性（MSI）状态检测方法在子宫内膜癌分子分型中的一致性及差异原因。方法:收集2021年1月至2023年4月北京大学第三医院病理科诊断的214例子宫内膜癌患者，对其MMR蛋白的免疫组化（MMR-IHC）检测结果进行复核，通过二代测序（NGS）技术进行MSI状态（MSI-NGS）及多基因体细胞突变、胚系MMR基因突变检测，计算肿瘤突变负荷（TMB）值。对MMR-IHC检测与MSI-NGS检测结果不相符的患者进一步进行MSI-PCR检测和MLH1基因启动子甲基化检测，并结合TMB值综合评估MMR、MSI状态，明确分子分型。结果:（1）214例子宫内膜癌患者中，POLE突变（POLEmut）型22例，错配修复缺陷（MMR-d）型55例，p53异常（p53abn）型29例，无特殊分子改变（NSMP）型108例。其中，MMR-d型患者的中位确诊年龄为54岁、侵袭性病理亚型（包括子宫内膜样癌G 3和非子宫内膜样癌）的比例为40.0%（22/55），均高于NSMP型［分别为50岁、12.0%（13/108）］，两者分别比较，差异均有统计学意义（ P均<0.05）。（2）214例患者中，MMR-IHC检测显示，153例患者判定为错配修复正常（MMR-p），49例判定为MMR-d，12例患者难以直接判读；MSI-NGS检测显示，164例患者判定为微卫星稳定性（MSS；与MMR-p对应），48例患者判定为高度微卫星不稳定性（MSI-H；与MMR-d对应），2例患者因有效测序深度未满足质控标准而无MSI结果。MMR-IHC检测与MSI-NGS检测结果的一致率为94.3%（200/212），12例不符合患者的MMR-IHC检测结果为MMR-d或亚克隆缺失，但MSI-NGS检测均判定为MSS，其中MLH1和PMS2蛋白表达共缺失或亚克隆缺失10例。12例不符合患者中，3例检出POLE基因致病性突变而归为POLE突变型；另外9例患者中，8例有MSI-PCR检测结果的患者中5例为MSI-H、3例为低度微卫星不稳定性（MSI-L），7例TMB值高于10个突变/Mb，6例检出MLH1基因启动子甲基化，综合分析后9例患者均判定为MMR-d。（3）55例MMR-d型子宫内膜癌患者中，15例（27.3%，15/55）确诊为Lynch综合征。15例Lynch综合征相关MMR-d型子宫内膜癌患者的TMB值［（71.5±20.1）个突变/Mb］显著高于40例散发性MMR-d型子宫内膜癌患者［（41.9±24.3）个突变/Mb； t=3.51， P=0.001］；20例MSH2和（或）MSH6蛋白表达缺失患者的TMB值［（71.0±26.2）个突变/Mb］显著高于35例MLH1和（或）PMS2蛋白表达缺失者［（38.2±19.1）个突变/Mb； t=-4.71， P<0.001］。55例MMR-d型子宫内膜癌患者中，突变率排序前10个的基因是PTEN（85.5%，47/55）、ARID1A（80.0%，44/55）、PIK3CA（69.1%，38/55）、KMT2B（60.0%，33/55）、CTCF（45.5%，25/55）、RNF43（40.0%，22/55）、KRAS（36.4%，20/55）、CREBBP（34.5%，19/55）、LRP1B（32.7%，18/55）、BRCA2（32.7%，18/55）基因，其中PTEN、ARID1A、PIK3CA基因共突变率为50.9%（28/55）。 结论:MMR-IHC检测与MSI-NGS检测结果的—致率较高，两种方法检测结果不一致多见于MLH1基因启动子高甲基化状态导致的MLH1和PMS2蛋白表达共缺失或MMR蛋白亚克隆缺失，必要时应结合MLH1基因甲基化、MSI-PCR、MMR基因胚系突变及TMB值综合评估MMR、MSI状态，为子宫内膜癌患者提供精准的分子分型。

目的:分析年龄≤60岁上尿路尿路上皮癌(UTUC)患者的胚系致病性突变，探讨胚系致病性突变携带者的临床病理特征。方法:回顾性分析复旦大学附属肿瘤医院2008年9月至2023年2月接受胚系基因检测的124例年龄≤60岁UTUC患者的临床资料。男86例，女38例；年龄55.0(49.8，58.0)岁；原发肿瘤位于肾盂81例(65.3%)，位于输尿管34例(27.4%)，二者兼有9例(7.3%)。低级别UTUC 13例(10.5%)，原位癌8例(6.5%)。12例(9.7%)有膀胱癌病史，12例(9.7%)有其他恶性肿瘤病史。取患者外周血标本，行全基因组外显子测序或靶向测序寻找UTUC相关的胚系突变。按照美国医学遗传学与基因组学/美国分子病理学协会(ACMG/AMP) 2015版指南，对胚系基因检测数据进行解读，分析胚系致病性突变率，并探究胚系致病性突变携带者的临床病理特征。进一步与东亚健康人群的胚系致病性突变率比较，分析与UTUC致病风险相关的胚系突变。结果:本研究124例中，28例(22.6%)共检测到31个胚系致病性突变。有胚系致病性突变患者与无胚系致病性突变患者的年龄[54.0(47.0，58.0)岁与56.0(50.8，58.0)岁]、性别(男/女：21/7岁与65/31岁)、有膀胱癌病史(0与12/96)、T分期(T 3~4期：12/28与41/96)、组织学高级别比例(26/28与85/96)的差异均无统计学意义( P>0.05)。31个胚系致病性突变位于22个基因上，分别为BRCA2(4例，12.9%)、MSH2(3例，9.7%)、RAD54L(2例，6.5%)、BRCA1(2例，6.5%)、BRIP1(2例，6.5%)、NOTCH3(2例，6.5%)、XRCC2(1例，3.2%)、VEGFA(1例，3.2%)、TBX3(1例，3.2%)、RET(1例，3.2%)、PRKN(1例，3.2%)、PALB2(1例，3.2%)、NTRK1(1例，3.2%)、NCOA3(1例，3.2%)、MSH6(1例，3.2%)、LRP1B(1例，3.2%)、KMT2D(1例，3.2%)、KMT2A(1例，3.2%)、FANCA(1例，3.2%)、BARD1(1例，3.2%)、ARID1A(1例，3.2%)和AR(1例，3.2%)基因。对124例患者的胚系致病性突变率与东亚健康人群的胚系致病性突变率进行比较，结果显示BRCA2 ( OR＝11.9, 95% CI 3.8 ~37.7, P<0.001)、MSH2( OR＝11.9, 95% CI 3.2~44.5, P<0.001)、RAD54L( OR＝14.2, 95% CI 2.7~73.8， P＝0.002)和BRCA1 ( OR＝11.8, 95% CI 2.4~59.1， P＝0.003)基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。 结论:本研究年龄≤60岁UTUC患者的胚系致病性突变率为22.6%，携带BRCA2、MSH2、RAD54L或BRCA1基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。

目的:探讨胃SWI/SNF复合体缺失的伴横纹肌样特征未分化癌的临床病理学和分子遗传学特征。方法:收集河南省肿瘤医院2019年1月至2021年12月诊断胃SWI/SNF复合体缺失的伴横纹肌样特征未分化癌6例，对其进行组织学观察、免疫组织化学染色及二代测序，并行错配修复（MMR）蛋白、EB病毒编码的RNA（EBER）、HER2检测，总结其临床病理及分子特点，进行相关文献复习。结果:6例患者均为男性，年龄48~75岁，首发症状主要为腹痛、黑便、吞咽不利，内镜提示胃部溃疡型肿物，镜下形态相似：肿瘤细胞呈弥漫浸润性生长，细胞异型性明显，核分裂象易见，并可见到比例不等的丰富嗜酸性胞质呈横纹肌样形态细胞。免疫组织化学3例广谱细胞角蛋白（CKpan）为阴性，但其他上皮标志物如上皮细胞膜抗原（EMA，6/6）、细胞角蛋白（CK）8/18（4/6）、CK7（1/6）可见灶性区阳性表达；p53蛋白4例弥漫强阳性（4/6），1例为阴性（1/6）；Ki-67阳性指数60%~90%。其他间叶源性肿瘤、淋巴造血系统肿瘤、色素细胞肿瘤、生殖细胞肿瘤等相关标志物均为阴性表达。SWI/SNF复合体亚基检测，即INI1（SMARCB1）、BRG1（SMARCA4）、ARID1A蛋白检测，5例为SMARCA4缺失表达（5/6），1例为ARID1A缺失表达（1/6），所有病例SMARCB1均未缺失；进行MMR检测，其中1例为MMR缺陷。3例HER2表达为0（3/6），1例为1+（1/6），2例为2+（2/6），行荧光原位杂交（FISH）检测HER2基因均无扩增；6例患者EBER均为阴性。4例手术根治标本行二代测序，3例检测到TP53突变（3/4），1例检测到ARID1A基因移码缺失突变，同时存在ATM、PTEN等突变，1例检测到SMARCA4基因拷贝数变异，同时存在ALK、BRAF、CDKN1B、BRCA2等基因突变。结论:胃SWI/SNF复合体缺失的伴横纹肌样特征未分化癌是一种分化极差且罕见的肿瘤，进行SWI/SNF复合体相关蛋白检测有助于诊断，与SWI/SNF复合体相关的基因改变将成为以后诊断、预后评估的新指标以及潜在的分子治疗新靶点，值得进一步关注。

患者，女，44岁。主因"反复乏力、晕厥3个月"入院。查体：体重30.0 kg，身高130 cm，发育不良，重度贫血面容，右手拇指畸形，双手部分手指弯曲状。既往史：自幼中耳炎史，后渐耳聋、失聪，未就医诊治。家族史：患者父亲已故；母亲体健，身高约150 cm，怀孕时有多种药物服药史；丈夫身体健康，育一女，身体健康，身高160 cm，智力正常。血常规：WBC 4.05×10 9/L，HGB 59 g/L，PLT 213×10 9/L，网织红细胞比值（Ret）0.30%，平均红细胞体积（MCV）94.7 fl，红细胞分布宽度（RDW）13.8%，平均血红蛋白浓度（MCHC）333 g/L。血清铁蛋白590.19 μg/L，叶酸>45.30 nmol/L，维生素B 12 414.05 pmol/L。自身抗体全套：抗核抗体（ANA)核颗粒型（1∶80）阳性，抗心磷脂抗体弱阳性，余正常。细小病毒B19 IgG、IgM均阴性。外周血T淋巴细胞亚群：CD3 + 90%，CD3 + CD4 + 60%，CD3 +CD8 + 27%。溶血性贫血组套、直接抗人球蛋白试验（DAT）、CD55、CD59正常。骨髓涂片：增生活跃骨髓象，红系有核红细胞少见，仅晚期幼稚红细胞0.5%。粒系中原始粒细胞以下可见，中、晚期幼稚粒细胞及分叶核粒细胞比例偏高，形态大致正常。全片巨核细胞15个，其中颗粒巨核细胞8个，产板巨核细胞5个，裸核型巨核细胞2个。骨髓铁染色：外铁（++）；内铁：有核红细胞少见，内铁阳性率不宜评估。骨髓活检：未见幼稚细胞增多，巨核细胞未见明显病态造血，红系细胞少见；染色体核型：46，XX[20]。骨髓流式细胞未检测到明显的免疫表型异常证据。血液病常见56种融合基因筛查阴性。骨髓标本ARID1B基因插入突变：c.1041_1043dupGGC（p.A350dupA），突变频率31.9%。丝裂霉素C染色体畸变结果正常。彗星试验：外周血淋巴细胞DNA存在损伤，彗星细胞率17%，未见凋亡细胞。遗传性血液病相关基因单核苷酸变异（SNV）检测：①未检测到受检者血液系统遗传病相关基因的微小致病性基因变异；②拷贝数变异（CNV）检测提示15号染色体q26.2q26.3区域存在大小约5.1 Mb的大片段杂合缺失，该区域包含40个基因，其中OMIM收录的基因有MEF2A、LINS1、ADAMTS17、CERS3、ALDH1A3、CHSY1、IGF1R等，建议应用CMA方法进行确认。染色体微阵列（CMA）检测：应用CytoScan HD芯片证实chr15q26.2q26.3存在约5.2 Mb缺失，基因组位点：arr [GRCh37]15q26.2q26.3(97236143_102429112)x1，CNV类型：缺失，长度：5.2 Mb，与15q26缺失综合征有关。诊断：15q26末端缺失综合征、纯红细胞再生障碍（PRCA）。予泼尼松1 mg/kg治疗，3周后复查HGB 90 g/L，WBC 10.80×10 9/L，PLT 360×10 9/L，摆脱输血依赖，目前一般情况良好，3个月后血常规完全恢复正常。

目的:探讨1例非典型智力障碍伴射精障碍患者的临床特征与遗传学病因。方法:选取2021年11月18日于空军军医大学第一附属医院就诊的1例非典型智力障碍伴射精障碍患者为研究对象。采集患者相关临床资料，抽取患者及其父母外周静脉血样，应用全外显子组测序(WES)对患者进行基因检测，采用Sanger测序进行家系验证，并对候选变异进行致病性分析。结果:本研究患者为26岁男性，临床表现为非典型智力障碍伴射精障碍。WES检测结果提示，患者携带 ARID1B基因c.5776C>T(p.Arg1926X)杂合变异。经Sanger测序验证，患者父母均未携带该变异，提示该变异为新发变异。 ARID1B基因c.5776C>T(p.Arg1926X)变异在1000 Genomes、ExAC、gnomAD及ClinVar等数据库中已见报道；dbSNP数据库检索结果显示，该变异在正常人群中的携带频率为0.000 4%；Mutation Taster、CADD及MutPred等在线软件预测结果显示，该变异为有害性变异；Clustal Omega在线软件分析结果显示，该变异位点编码氨基酸在不同物种间高度保守；PyMOL软件分析结果显示，该变异可能影响编码蛋白功能；根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)与ClinGen联合制订的相关指南与标准，该变异被判定为致病性变异。 结论:ARID1B基因c.5776C>T(p.Arg1926X)变异可能是本研究患者智力障碍伴射精障碍的遗传学病因，拓宽了 ARID1B基因的变异谱与表型谱，为患者的治疗提供了参考依据。

为探讨地宝兰属植物的叶片解剖结构及光合特性,该研究对狭域濒危种贵州地宝兰(Geodorum eulophioides)及广布种地宝兰(G.densiflorum)、大花地宝兰(G.attenuatum)的叶片解剖结构、光合日变化、光响应曲线、CO2响应曲线、叶绿素含量等指标进行测定.结果表明:(1)3种地宝兰属植物的叶肉细胞没有海绵组织和栅栏组织分化,气孔仅分布于下表皮;与地宝兰和贵州地宝兰相比,大花地宝兰具有更大的叶片厚度和较小的气孔密度,表现出更适应弱光环境的结构特征.(2)3种地宝兰属植物的净光合速率(Pn)日变化均呈"双峰型"曲线,其光合"午休"主要由非气孔限制引起;Pn和水分利用效率(WUE)日均值大小均表现为大花地宝兰＞地宝兰＞贵州地宝兰,表明贵州地宝兰积累光合产物的能力更弱,对干旱环境的适应能力可能更差.(3)3种地宝兰属植物均为阴生植物,地宝兰的光补偿点(LCP)最小、光饱和点(LSP)最大,对光强适应范围较宽;大花地宝兰具有较高的最大净光合速率(Pmax)和表观量子效率(AQY),其光合能力较强;贵州地宝兰的Pmax和潜在最大净光合速率(Amax)最小,其光合能力和对CO2的利用能力更弱.(4)地宝兰和大花地宝兰的叶绿素a(Chl a)、叶绿素b(Chl b)和总叶绿素(Chl)含量均显著(P＜0.05)高于贵州地宝兰.(5)3种地宝兰属植物的叶片厚度、叶肉厚度、叶绿素含量与Pmax间存在显著(P＜0.05)相关性.综上认为,与地宝兰和大花地宝兰相比,贵州地宝兰的光合能力和适应性较差,这可能与其濒危有很大关系;适当遮阴和增加CO2浓度有利于3种地宝兰属植物的光合作用.该研究结果为贵州地宝兰濒危原因的分析及3种地宝兰属植物种质资源保育提供了参考依据.

目的 探讨扁桃体鳞状细胞癌(tonsil squamous cell carcinoma,TSCC)的临床病理学特征、全外显子突变和肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB).方法 回顾性分析10例TSCC临床病理特征,采用EnVision两步法检测CK(AE1/AE3)、CK5/6、p63、p40、p16和Ki67等蛋白的表达,并对其中3例TSCC病例行全外显子组测序及TMB分析.结果 10例患者中,男性6例,女性4例,年龄43～76岁,光镜下癌细胞呈巢状和不规则条索状浸润至隐窝上皮下,伴有粉刺样坏死,见细胞间桥及多少不一的角化,异型性明显,核分裂象易见.随访6～45个月,9例存活.免疫表型:CK(AE1/AE3)、CK5/6、p63和p40均阳性,3例p16弥漫强阳性,Ki67增殖指数40％～90％.3例TSCC的全外显子组测序结果显示ARID1B、LRP6等为常见的癌症易感基因,WDFY4、ZFHX4基因表现出较高的突变比例,均为3/3.TMB分析结果显示3例突变中1例TMB值＞9 mut/Mb.结论 TSCC早期症状不明显,容易漏诊误诊.全外显子组测序结果显示WDFY4、ZFHX4基因存在较高的突变率.TMB结果提示TSCC部分患者可在免疫治疗中获益.

[目的]总结原因不明矮身材儿童的临床特征并探讨其致病基因,为临床精准诊疗提供依据.[方法]收集我院儿科内分泌专科2018年1月至2022年8月就诊的未能明确诊断的矮身材儿童临床表现、实验室检查及全外显子组测序(WES)结果进行回顾性分析,根据不同作用机制对致病基因进行归纳总结.[结果]纳入患儿48例(男性30例,女性18例),年龄(7.73±3.97)岁,身高标准差分值为-3.63±1.67;临床表现:特殊面容33例(68.8%),体型或骨骼系统异常31例(64.6%),围产期异常26例(54.2%,其中61.5%为小于胎龄儿),内分泌系统异常24例(50.0%,其中87.5%生长激素(GH)峰值低于正常),矮身材家族史21例(43.8%);实验室检查:GH激发试验峰值(9.72±7.25)ng/mL,IGF-1 标准差分值为-0.82±1.42,骨龄与年龄差值(-0.93±1.39)岁;WES共发现相关基因变异者25例,其中14例(56.0%)为致病变异,6例(24.0%)为可能致病变异,5例(20.0%)为意义未明变异;评价为致病及可能致病变异的基因共14个,其中影响细胞内信号通路10个(PTPN11、RAF1、RIT1、ARID1B、ANKRD11、CSNK2A1、SRCAP、CUL7、SMAD4和FAM111A),影响细胞外基质(ECM)4个(ACAN、FBN1、COL10A1和COMP).[结论]临床上表现为严重矮身材伴特殊面容、非匀称体型、骨骼系统异常、小于胎龄儿、GH峰值低于正常和矮身材家族史等特征的儿童,其病因需考虑罕见单基因疾病的可能,WES是提高单基因性矮小症诊断效能的重要手段.本组患儿致病基因中,主要致病机制是影响细胞内信号通路和ECM组分或功能,进一步研究有助于发现和研究新的矮小症致病变异和基因功能.

藜科植物Grayia spinosa是美国西部地区的特有种,多生长在干旱盐碱地,具有重要的生态价值.该研究测定了采自美国西部犹他州G. spinosa 的nrDNA ITS序列,与GenBank中已提交的G. spinosa 的所有ITS序列以及G. spinosa的四个近缘种作为外类群进行比较,分析了美国西部不同地区G. spinosa ITS序列的一级结构与其RNA二级结构的变异规律.结果表明:所有G. spinosa样品的nrDNA ITS序列长度在611~623 bp之间,GC含量在60.35%~61.0%之间,序列间共存在22个变异位点,5个为简约信息位点.各样品间的遗传距离在0.0018~0.0089之间,不同样品间的遗传距离与地理距离的相关性不显著.邻接法构建的系统发育树显示所有G. spinosa聚为一大支,与外类群形成明显分支.此外,利用RNAfold在线软件预测了G. spinosa ITS序列的RNA二级结构,将8个G. spinosa样品的RNA二级结构根据构型差异大体上分为四类,分别记为type A,B,C和D四类,主要变异出现在ITS1和ITS2区.所不同的是在G. spinosa ITS的一级结构分析中GSNE1与GSWA8体现出更近的亲缘关系,但二者的 RNA二级结构差异明显,同时 GSNE2、GSUT3、GSUT4、GSCA5、GSCA6、GSCO7在ITS序列一级结构分析中也体现出较近的亲缘关系,但是他们的RNA二级结构差异明显.这可能与ITS序列的RNA二级结构在进化中体现出更大的保守性有关.