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DNM1L基因变异致线粒体过氧化物酶体裂殖缺陷型致死性脑病1型三例并文献复习
编辑人员丨4天前
目的:探讨DNM1L基因R403C位点变异所致儿童期起病的线粒体过氧化物酶体裂殖缺陷型致死性脑病1型(EMPF1)的临床特征。方法:回顾性总结2018年2月至2020年2月于中南大学湘雅医院儿科就诊的3例DNM1L基因R403C位点变异导致的EMPF1患儿的临床资料。以“DNM1L”“EMPF1”“encephalopathy,lethal,due to defective mitochondrial peroxisomal fission 1”或“线粒体过氧化物酶体裂殖缺陷型致死性脑病1型”为检索词分别查阅在线人类孟德尔遗传数据库、PubMed数据库、中国知网数据库及万方数据库建库至2020年7月相关文献,总结DNM1L基因R403C位点变异患儿临床表现、实验室及影像学检查、治疗及预后特点。结果:例1 男,7岁时咳嗽不伴发热9 d后出现抽搐,表现为全面强直阵挛发作,后转变为局灶性癫痫持续状态、局灶性肌阵挛,多种抗癫痫药物及止惊药物联合治疗后无效,起病后第2周死亡。例2 男,7岁时“扁桃体炎”10 d后出现抽搐,表现为局灶继发全面强直阵挛发作,后转变为局灶性癫痫持续状态、局灶性肌阵挛,多种抗癫痫药物及止惊药物、生酮饮食、甲泼尼龙治疗后反应欠佳,监护室治疗期间合并多重耐药菌感染,起病1个月后死亡。例3 女,3岁5月龄时“病毒性肺炎”2周后出现抽搐,表现为局灶性阵挛发作,后转变为局灶性癫痫持续状态,多种抗癫痫药物及止惊药物、生酮饮食治疗后改善不佳,起病3个月后死亡。3例患儿起病后早期头颅磁共振成像均提示颅内多发T1加权像低信号,T2加权像、液体衰减反转恢复序列、弥散加权像高信号灶,急性期后头颅磁共振成像可见弥漫性脑萎缩。血代谢、脑脊液免疫相关检查均无异常。遗传学检查提示DNM1L基因存在NM_012062.4:c.1207C>T,p.R403C新发、杂合、错义变异,结合临床表现,均明确诊断为EMPF1。文献检索未见国内报道,R403C位点变异国外文献8篇11例,总结包含本组3例的14例患儿临床表现,其中起病前有感染病史8例,轻、中度智力或运动发育落后8例。14例患儿均有癫痫发作,其发作形式主要包括局灶性癫痫持续状态(9例)、局灶性肌阵挛发作(6例)、全面强直阵挛发作(5例)以及局灶性阵挛发作(4例)。14例均为药物难治性癫痫,文献无推荐有效抗癫痫治疗药物。早期头颅磁共振成像见多发异常信号灶10例,以丘脑(7例)、海马(5例)、基底节区(4例)、额叶(3例)、顶叶(2例)多见,病程后期可见弥漫性进行性脑萎缩10例。14例患儿中5例死亡。 结论:DNM1L基因R403C位点变异常导致线粒体裂殖障碍,患儿可表现为轻微感染刺激后或无明显诱因突发的难治性癫痫持续状态,伴智力运动发育倒退、脑萎缩。
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编辑人员丨4天前
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一例线粒体过氧化物酶分裂缺陷致死性脑病患儿的 DNM1L基因变异分析
编辑人员丨4天前
目的:对1例线粒体过氧化物酶分裂缺陷致死性脑病患儿的临床特征及DNM1L基因变异进行分析,明确其可能的致病原因,为临床诊断提供依据。方法:选择四川大学华西第二医院确诊的1例线粒体过氧化物酶分裂缺陷致死性脑病患儿,分析临床表现、实验室检查及DNM1L基因变异情况。结果:患儿主要表现为发热、头痛、呕吐,随即出现抽搐及进行性意识障碍;脑电图示背景波慢化,广泛性尖或棘(慢)波、多形慢波发放;头颅MRI示脑沟加深、侧脑室扩张,脑内多发斑片状信号异常;全外显子测序结果显示DNM1L基因存在c.1207C>T( p.Arg403Cys)杂合错义变异,Sanger测序验证其父母均未检测到该变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,c.1207 C>T判定为致病性变异(PS1+PS2+PM2+PP3)。予丙种球蛋白、糖皮质激素、"线粒体鸡尾酒疗法"及抗癫痫治疗后,患儿癫痫发作较前减少,意识水平好转。结论:DNM1L基因c.1207 C>T变异可能为患儿的致病原因,基因检测结果为患儿的临床诊断提供了依据。
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编辑人员丨4天前
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发动蛋白1在结直肠癌中的表达和临床意义及其与自噬的关系
编辑人员丨4天前
目的:分析发动蛋白1(DNM1)基因表达与结直肠癌(CRC)患者临床病理参数及预后的关系,探究DNM1与自噬机制的关联。方法:应用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库分析DNM1在CRC患者正常肠黏膜与癌组织中、肿瘤早期(TNMⅠ期与Ⅱ期)与晚期(TNM Ⅲ期与Ⅳ期)癌组织中的mRNA水平差异,用Kaplan-Meier法进行生存时间估计及预后分析;用免疫组织化学染色检测118例CRC患者癌组织的DNM1蛋白表达情况,分析其表达特点与临床病理参数及预后的关系;用基因集富集分析(GSEA)CRC患者癌组织中DNM1与自噬相关的信号通路;使用共聚焦显微镜检测并分析DNM1(和其他5个自噬相关蛋白ATG9B、ULK1、Beclin-1、P62/SQSTM1、ATG16L1)与自噬标志物微管相关蛋白1轻链3(LC3)的免疫荧光双染色的皮尔逊相关系数(PCC)。结果:DNM1在CRC肿瘤组织中表达升高,在肿瘤晚期的表达显著升高( P<0.05);Kaplan-Meier生存分析示:DNM1的表达量与肿瘤预后负相关[ HR=1.71,95% CI(1.21,2.40), P<0.01]。DNM1阳性强度与肿瘤的浸润深度、淋巴结转移、癌结节、远处转移、神经及脉管侵犯、分化程度、组织学分型、特殊组织学分型有关(均 P<0.01)。有序logistic回归模型验证了肿瘤分化及DNM1的阳性程度均为CRC患者不良预后的危险因素,DNM1强阳性与腺癌复发正相关( P<0.05)。DNM1高表达涉及负调控雷帕霉素靶蛋白复合物1(mTORC1)、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B/雷帕霉素靶蛋白(PI3K/AKT/mTOR)等自噬的关键信号通路( P<0.05, FDR<0.001)。六组免疫荧光双染色中DNM1与LC3B两基因表达模式的相关性最大。 结论:DNM1高表达是CRC患者的不良预后因素,可能通过正向调控自噬与肿瘤进展有关。
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编辑人员丨4天前
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Dynamin 3在胃癌中的作用机制及预后价值
编辑人员丨4天前
目的:探讨Dynamin 3(DNM3)在胃癌中的作用机制及预后价值。方法:采用生物信息分析、实验研究方法和回顾性队列研究方法。收集2013年1月至2018年7月福建医科大学附属协和医院收治的153例行根治性胃切除术胃癌患者的临床病理资料、新鲜胃癌及配对正常组织样本和石蜡切片,行实时荧光定量聚合酶链式反应检测、免疫印迹实验、流式细胞周期实验、免疫组织化学染色检测和预后分析。收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库的胃腺癌(STAD)数据集进行生物信息分析。观察指标:(1)胃癌中DNM3基因在TCGA-STAD中的表达情况。(2)胃癌中DNM3的突变和拷贝数改变。(3)胃癌中DNM3的启动子甲基化水平。(4)胃癌中DNM3、p53的蛋白相对表达量。(5)胃癌中DNM3相关性和富集性分析。(6)流式细胞周期G0/G1期、S期、G2/M期的比例。(7)胃癌中免疫细胞浸润和DNM3之间的相关性。(8)免疫组织化学染色检测与临床特征之间的相关性。(9)影响胃癌患者5年总生存率的独立因素分析。正态分布的计量资料以 x± s表示,多组间比较采用方差分析,进一步两两比较采用LSD法;两组间比较采用 t检验;偏态分布的计量资料以 M( Q1, Q3)表示,组间比较采用Mann-Whitney U检验。计数资料以绝对数或百分比表示,组间比较采用 χ2检验或Fisher确切概率法。配对样本采用威尔科克森符号秩检验。等级资料采用秩和检验。运用Pearson相关系数或Spearman相关系数检验两组的相关性。单因素和多因素分析采用COX比例风险回归模型。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并计算生存率,采用Log-Rank检验进行生存情况分析。使用Benjamini-Hochberg错误发生率校正对 P值进行调整。 结果:(1)胃癌中DNM3基因在TCGA-STAD中的表达情况。TCGA-STAD数据库中DNM3基因在27个肿瘤组织和配对正常组织中的表达水平分别为0.775(0.605,1.161)和1.216(0.772,1.681),两者比较,差异有统计学意义( Z=-2.64, P<0.05)。DNM3基因在笔者中心48对胃癌组织和配对正常组织中mRNA表达水平分别为4.370(2.870,6.040)和2.520(0.850,4.170),两者比较,差异有统计学意义( Z=-4.39, P<0.05)。(2)胃癌中DNM3的突变和拷贝数改变。TCGA-STAD数据库中16例胃癌患者发生DNM3突变或体细胞拷贝数改变,其中6个错义突变,1个截断突变,8个拷贝数增加,1个拷贝数减少。TCGA-STAD数据库370例胃癌患者中DNM3突变前后的mRNA表达水平分别为6.13(5.40,7.08)和5.02(3.98,5.46),两者比较,差异有统计学意义(Log 2FC=-1.11, Z=-2.59, P<0.05)。(3)胃癌中DNM3的启动子甲基化水平。TCGA-STAD数据库中372例胃癌患者DNM3甲基化水平与DNM3 mRNA的检测结果显示:DNM3甲基化水平为0.198(-0.458,0.301),DNM3 mRNA表达水平为6.014(5.141,6.628),DNM3甲基化水平与DNM3 mRNA表达水平呈负相关( r=-0.38, P<0.05)。32例患者随访结果显示:16例DNM3高甲基化组和16例DNM3低甲基化组患者3年总生存率分别为18.8%和41.3%,两者比较,差异有统计学意义(风险比=1.40, P<0.05)。免疫印迹实验结果显示:AGS细胞用0、0.5、1.0 μmol/L 5-azacytidin处理后的DNM3相对表达量分别为0.270±0.020、0.357±0.051、0.599±0.039,3组比较,差异有统计学意义( F=57.84, P<0.05)。HGC-27细胞用0、0.5、1.0 μmol/L 5-azacytidin处理后的DNM3相对表达量分别为0.316±0.038、0.770±0.031、0.877±0.052,3组比较,差异有统计学意义( F=156.30, P<0.05)。(4)胃癌中DNM3、p53的蛋白相对表达量。免疫印迹实验结果显示:转染DNM3质粒和对照质粒的AGS细胞中DNM3、p53的蛋白相对表达量分别为0.688±0.047、0.872±0.041和0.249±0.029、0.352±0.020;转染DNM3质粒和对照质粒的AGS细胞比较,上述蛋白相对表达量差异均有统计学意义( t=13.77,19.74, P<0.05)。转染DNM3质粒和对照质粒的HGC-27细胞中上述蛋白相对表达量分别为0.969±0.069、1.464±0.081和0.456±0.048、0.794±0.052,差异均有统计学意义( t=10.57,12.06, P<0.05)。(5)胃癌中DNM3相关性和富集性分析。相关性分析结果显示:DNM3与胃癌中RBMS3、CNTN4、PDE1A基因呈正相关( r=0.52,0.52,0.50, P<0.05),与SLC25A39、PAICS、GAPDH基因呈负相关( r=-0.41,-0.40,-0.40, P<0.05)。基因集富集分析结果显示:与核糖体和氧化磷酸化有关的基因集在DNM3低表达组中上调[富集分数(NES)=-3.30,-2.16, P<0.05],而淋巴细胞和非淋巴细胞之间的免疫调节相互作用在DNM3高表达组中上调(NES=1.67, P<0.05)。基因本体论分析结果显示:DNM3低表达与有丝分裂姐妹染色体分离(编号:0000070)、无义介导衰变的核转录mRNA分解过程、姐妹染色体分离(编号:0000819)、核转录mRNA分解代谢过程、氧化磷酸化的调控有关(NES=-2.29,-3.10,-2.33,-2.56,-2.68, P<0.05)。京都基因与基因组百科全书分析结果显示:DNM3低表达在核糖体和氧化磷酸化中存在上调和串联(NES=-3.34,-2.21, P<0.05)。(6)流式细胞周期G0/G1期、S期、G2/M期的比例。流式细胞周期实验结果显示:转染pCMV-DNM3质粒的AGS细胞G0/G1期、S期、G2/M期的比例分别为65.1%±3.0%、17.3%±3.0%、17.6%±1.0%,转染对照质粒的AGS细胞上述指标分别为53.4%±4.0%、26.3%±2.0%、20.3%±3.0%。转染DNM3质粒与转染对照质粒的AGS细胞比较,G0/G1期、S期差异均有统计学意义( t=4.05,4.32, P<0.05)。(7)胃癌中免疫细胞浸润和DNM3之间的相关性。免疫细胞浸润实验结果显示:DNM3 mRNA表达水平与肥大细胞,NK细胞,pDCs,B细胞,滤泡辅助T细胞,有效记忆T细胞,T细胞,中央记忆T细胞,CD8 T细胞,DC细胞,巨噬细胞,γ-δT细胞(Tgd),iDCs,嗜酸性粒细胞浸润水平呈正相关(Spearman相关系数分别为0.41,0.29,0.26,0.20,0.22,0.22,0.13,0.16,0.15,0.14,0.14,0.17,0.18,0.22, P<0.001,<0.001,<0.001,<0.001,<0.001,<0.001, P=0.015,0.002,0.004,0.005,0.005, P<0.001,<0.001,<0.001);与Th17细胞,Th2细胞,NK CD56dim细胞浸润水平呈负相关( r=-0.18,-0.23,-0.10, P<0.001, P=0.001和 P=0.046)。(8)免疫组织化学染色检测与临床特征之间的相关性。免疫组织化学分析结果显示:DNM3在105例胃癌组织和105例配对正常组织中的免疫组织化学染色评分分别为3(2,4)分和6(4,9)分,差异有统计学意义( Z=-7.35, P<0.05)。70例DNM3低表达与35例DNM3高表达胃癌患者性别、肿瘤部位、N分期比较,差异均有统计学意义( χ2 =4.29,7.67,6.86, P<0.05)。(9)影响胃癌患者5年总生存率的独立因素分析。多因素分析结果显示:病理学T分期为T3~4期和DNM3染色评分低是胃癌患者5年总生存率的独立危险因素(风险比=1.91,0.51,95%可信区间为1.06~3.43,0.26~0.98, P<0.05)。DNM3低表达组胃癌患者和高表达组胃癌患者的5年总生存率分别为44.3%和65.7%,两者比较,差异有统计学意义( χ2=5.02, P<0.05)。 结论:DNM3是一种肿瘤抑制因子,也是胃癌预后不良的独立预测因子,它可能通过甲基化调控胃癌的细胞周期和肿瘤微环境中的免疫抑制。
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编辑人员丨4天前
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DNM1L基因变异致线粒体和过氧化物酶体裂变缺陷相关脑病 1例
编辑人员丨5天前
DNM1L基因变异所致线粒体和过氧化物酶体裂变缺陷相关脑病是一种罕见的、致死性的癫痫性脑病,具有临床表型和遗传异质性特点。急性期为药物难治性癫痫,预后差,可遗留严重神经系统后遗症。现报道1例经基因确诊的线粒体和过氧化物酶体裂变缺陷相关脑病患者,总结其临床资料及诊治过程,并进行文献复习,以提高对该疾病的认识。
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编辑人员丨5天前
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DNM1L基因变异致线粒体过氧化物酶体分裂缺陷型脑病2例并文献复习
编辑人员丨2023/12/30
线粒体是人体内唯一一个半自主性细胞器,具有生产能量、维持细胞钙稳态及参与细胞凋亡的作用,线粒体功能障碍性疾病往往具有神经退行性病变.在各种组织中,线粒体不断变化其结构、形状及动力学,以适应环境的变化.动力相关蛋白 1(dynamin related protein 1,DRP1)是线粒体和过氧化物酶体分裂中最重要的物质,其由DNM1L基因编码,因DNM1L基因突变导致的疾病,以精神运动发育迟缓、肌张力障碍、癫痫、视神经萎缩及不良结局为特征,现报道如下.
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编辑人员丨2023/12/30
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成年人T细胞性急性淋巴细胞白血病磷酸酶及张力蛋白同源基因突变特点和临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨成年人T细胞性急性淋巴细胞白血病(T-ALL)中磷酸酶及张力蛋白同源基因(PTEN)突变特点及其与预后的关系.方法 选择2010年2月至2016年4月在江苏省人民医院就诊的成年T-ALL患者55例,采用Ficoll密度梯度离心法提取骨髓单个核细胞,从分离出来的单个核细胞中提取基因组DNA,聚合酶链反应(PCR)特异性扩增PTEN外显子,DNA纯化,测序,比对,分析突变发生率、突变类型及其与各临床指标的关系.结果 55例成年T-ALL患者中,5例检测出PTEN突变,共检测到8种突变类型,均位于外显子7,突变发生率为9.1%(5/55).PTEN突变的5例患者均合并有NOTCH1、DNM2等其他基因的突变.PTEN突变组患者中位乳酸脱氢酶(LDH)水平高于非突变组(3358 U/L比755 U/L),差异有统计学意义(Z=-2.014,P=0.044);两组患者性别、年龄、白细胞计数、血红蛋白、血小板计数、总生存率、无事件生存率、无复发生存率差异均无统计学意义(均P>0.05).结论 PTEN作为一种重要的肿瘤抑制基因,其突变在成年人T-ALL的发生发展中起重要作用,可能与预后不良有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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神经细胞黏附分子阳性初治原发急性髓系白血病临床特点分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析神经细胞黏附分子(CD56)阳性的初治原发急性髓系白血病(AML)患者的临床特征.方法 回顾性分析2015年1月至2016年12月该院血液科144例初治原发A M L住院患者的临床资料,其中男76例,女68例,根据患者免疫分型是否伴有CD56表达,分为CD56+组(n=48)和CD56-组(n=96).分别采用t检验、秩和检验或 χ2检验比较各组临床特征的差异.结果 CD56+组出现发热症状、AML-M2b亚型、伴有AML-ETO融合基因和IKZF1基因突变患者比例高于CD56-组(χ2=4.064、11.359、11.359、4.781,P<0.05);CD56+组出现乏力症状、出血、AML-M3亚型、伴有PML-RARA融合基因和DNMT3A基因突变患者比例低于CD56-组(χ2=4.704、5.262、6.272、4.013、4.442,P<0.05).结论 CD56+患者多为W HO急性髓系白血病分型中伴有重现性遗传学异常的M2b型,常见发热症状,易伴IKZF1基因突变;而少见WHO急性髓系白血病分型中伴有重现性遗传学异常的M3型、乏力和出血症状,少伴DNM T3A基因突变.
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编辑人员丨2023/8/6
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动力蛋白2基因型中央核肌病患者剖宫产麻醉一例
编辑人员丨2023/8/6
患者,女,35岁,59 kg,停经37+2周,入院待产. 既往史:患者于 1995 年我院神经内科确诊为中央核肌病(centronuclear myopathy,CNM)[1],2017 年于华大基因检测中心确定其致病基因为动力蛋白2基因( DNM2) ,慢性乙型肝炎病史. 查体:T 36. 5 ℃, HR 99次/分, RR 20次/分, BP 122/70 mmHg;双肺呼吸音清,心音正常;四肢肌力3—4级,上楼费力,鸭步步态,无呼吸吞咽困难. 心脏彩超:左室壁运动欠协调,二、三尖瓣轻度反流,EF 57%;肺功能:轻度限制性通气障碍,FEV12. 15 L;肌电图:提示肌源性损害. 术前检查:孕37+2周,ASA Ⅲ级,NYHA 心功能Ⅲ级,高腭弓,小下颌,张口度3指,轻度限制性通气障碍. 四肢远端或下肢肌力3-4级,腱反射减弱. 拟于2017年12月22日行剖宫产手术,麻醉方式选择气管插管全身麻醉.
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编辑人员丨2023/8/6
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遗传性视神经病变患者临床表型及基因检测多态性分析——单中心队列研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析临床常见遗传性视神经病变(HON)患者基因突变的基因型及临床表现的多样性.方法 2013年5月~2021年10月本院神经眼科中心纳入的拟诊遗传性视神经病变患者,经二代基因测序分析与疾病相关的线粒体环状DNA基因突变,并进行多态性分析.结果 537例拟诊HON患者,其中遗传性视网膜病变88例(16.4%)、视神经病变449例(83.6%).完成基因检测者375例,阳性率为66.4%(249/375).249例基因检测阳性患者中男女比为3.7:1,以40岁以下的儿童及青少年为主.其中主要致病基因突变为线粒体环基因点突变导致的Leber遗传性视神经病变(LHON)及核基因OPA1突变导致的显性遗传性视神经病变(DOA).在103例LHON阳性样本中检测出线粒体chrM-11778 G>A突变,占41.4%;其他特殊线粒体点突变有3291、8344、13413等.发现罕见基因突变包括OPA3、WSF1、CISD2、DNM1L、ACO2、AFG3L2、SPG7、NDUFS2、FGFR2、BBS10、TUBA8、NBAS、RAB18等,均与视神经萎缩相关.结论 临床拟诊HON及不明原因的视神经萎缩患者中,线粒体相关的遗传性疾病占比高.这类患者通过有针对性的基因检测技术可以最大限度明确潜在的突变位点及多态性,为精准医疗及基因治疗奠定基础.
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编辑人员丨2023/8/5
