目的:探索序列相似性83家族成员A（family with sequence similarity 83 member A，FAM83A）在结直肠癌的表达情况，和敲低FAM83A对结直肠癌细胞增殖能力的影响及相关机制。方法:用免疫组化检测102例结直肠癌患者组织及其癌旁组织标本中FAM83A的表达情况。将HCT116细胞分为实验组和对照组，实验组细胞转染FAM83A-siRNA质粒，对照组细胞转染MOCK-siRNA质粒，荧光定量PCR检测各组细胞FAM83A mRNA含量，蛋白质印迹法检测各组细胞的FAM83A、P13K、p-AKT、p-mTOR表达情况，CCK8实验和克隆形成实验检测各组细胞的增殖能力。结果:结直肠癌患者组织FAM83A阳性率为88.23%（90/102），癌旁组织中表达率为10.78%（11/102），FAM83A在结直肠癌组织中的表达率显著高于癌旁组织，差异具有统计学意义（ P<0.001）。转染siRNA后，实验组和对照组HCT116细胞中FAM83A mRNA表达量分别为1.23±0.20和0.43±0.12，FAM83A蛋白表达量分别为1.19±0.11和0.23±0.08，P13K的表达量分别为1.21±0.17、0.28±0.09，p-AKT的表达量分别为1.35±0.23、0.57±0.18，p-mTOR表达量分别为1.48±0.20、1.05±0.14，P13K、p-AKT、p-mTOR表达均下调（均 P<0.05）。实验组和对照组HCT116细胞CCK8实验120 h的吸光度分别为1.09±0.22和2.21±0.27，实验组和对照组HCT116细胞的克隆形成率分别为21.6%±2.4%和62.7%±4.1%，实验组细胞增殖能力明显下降（ P<0.05）。 结论:FAM83A在结直肠癌组织中表达明显升高，可能与结直肠癌的恶性程度相关；且FAM83A通过P13K/AKT/mTOR信号通路影响结直肠癌细胞的增殖能力。

目的:探讨沉默FAM83D对X线照射后食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞增殖、存活能力及侵袭、迁移能力的影响及机制。方法:采用免疫组化法检测69例ESCC患者组织中FAM83D、E-cadherin、vimentin的表达。免疫印迹法检测ECA109、KYSE30细胞FAM83D基因沉默效果。MTS、克隆形成实验和Transwell方法检测ECA109、KYSE30细胞增殖活性、存活能力及侵袭能力。流式细胞术和免疫印迹法检测ECA109、KYSE30细胞凋亡分布、上皮-间质转化(EMT)及凋亡相关蛋白表达。结果:ESCC组织中55%(38/69) FAM83D强表达，36%(25/69) E-cadherin强表达，61%(42/69) vimentin强表达；FAM83D强表达与E-cadherin强表达呈负相关( r＝-0.350， P<0.01)，与vimentin强表达呈正相关( r＝0.470， P<0.01)。ECA109、KYSE30细胞沉默FAM83D后降低了FAM83D蛋白表达( P<0.01)。MTS和克隆形成实验数据显示照射后沉默FAM83D显著抑制了ECA109、KYSE30细胞增殖水平( P<0.05)、增加了放射敏感性( P<0.01)。照射后FAM83D shRNA组ECA109、KYSE30细胞侵袭力降低( P<0.01)、E-cadherin表达增加，而N-cadherin、vimentin、Snail、p-Akt、p-GSK-3β表达降低( P<0.01)。照射后FAM83D shRNA组ECA109、KYSE30细胞凋亡率明显增加( P<0.01)，同时Bcl-2、Mcl-1表达下调，Cleaved caspase-3的表达上调( P<0.01)。 结论:FAM83D与ESCC的侵袭发展密切相关。沉默ECA109、KYSE30细胞FAM83D表达联合X线照射降低了其增殖、侵袭和存活能力，诱导了细胞凋亡，增加了放射敏感性，该作用可能通过Snail/Akt/GSK-3β信号途径来调控EMT。

目的:通过分析FAM83H基因突变导致遗传性牙釉质发育不全（amelogenesis imperfecta，AI）病例的牙萌出异常特征，揭示FAM83H基因可能存在的新表型和新功能，为精准诊治AI等遗传性疾病奠定基础。方法:通过PubMed数据库检索已发表的FAM83H突变导致的AI病例，检索关键词为“（FAM83H）AND（amelogenesis imperfecta）”，文献发表时间为2008年1月1日至2023年2月28日。文献纳入标准为能够提供患者详细的影像学资料或牙萌出信息以及FAM83H基因突变资料。收集文献来源的每位患者的基本信息、牙齿表型特征和突变基因信息，分析和总结其牙萌出异常的部位和数量特征。结果:在检索到的45篇相关文献中，20篇符合纳入标准，并提供了50例具有影像学资料或牙萌出详细资料、携带FAM83H突变的AI患者的相关信息，共有12例（24%）患者出现了牙萌出异常，累计34颗患牙，其中85%（29/34）的患牙无任何萌出阻力，为埋伏牙［74%（25/34）］或部分萌出［12%（4/34）］。牙位分析发现，尖牙和第二磨牙萌出异常占比最高，均占38%（13/34）。结论:FAM83H基因突变导致AI的同时，还可引起特定牙位牙萌出异常。

目的 探讨83序列相似成员A(FAM83A)与 β-连环蛋白(β-catenin)在宫颈病变组织中的表达差异及潜在临床意义.方法 利用UALCAN和GEPIA2.0在线数据库分析FAM83A在正常宫颈和宫颈鳞癌(CSCC)中的表达差异及FAM83A表达与CSCC患者预后的关系,使用LinkedOmics数据库分析FAM83A mRNA共表达基因,利用R语言进行KEGG富集分析.免疫组化方法检测60例正常宫颈组织、80例低级别鳞状上皮内病变(LSIL)、90例高级别鳞状上皮内病变(HSIL)、70例CSCC中FAM83A与β-catenin表达情况.分析FAM83A、β-catenin表达与临床病理特征之间的关系及FAM83A与 β-catenin表达的相关性.结果 UALCAN数据库分析显示FAM83A在CSCC组织中高表达,GEPIA 2.0数据库分析提示FAM83A高表达者预后不良.LinkedO-mics数据库进行KEGG富集分析提示FAM83A的表达与Wnt/β-catenin信号通路的异常激活呈正相关.FAM83A在CSCC中的表达率高于LSIL和正常宫颈组织(P<0.001),而与HSIL相比差异无统计学意义(P=0.401);FAM83A的表达与年龄无相关性(P=0.231),与分化程度(P=0.001)和临床分期(P=0.038)的相关性差异有统计学意义.β-catenin在CSCC中的异常表达率高于LSIL和正常宫颈组织(P<0.001),而与HSIL相比差异无统计学意义(P=0.734);β-catenin的表达与年龄无关(P=0.088),与分化程度(P=0.001)和临床分期(P<0.001)有关,FAM83A与β-catenin表达具有正相关性(P<0.05).结论 FAM83A与β-catenin在HSIL及CSCC组织中均高表达,两者之间表达存在正相关性.FAM83A的高表达与CSCC患者预后存在一定的相关性,可作为判断CSCC预后的潜在标志物.

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)序列相似家族83成员A-反义核糖核酸1(FAM83A-AS1)在视网膜母细胞瘤(RB)细胞中的作用及其潜在的分子机制.方法 体外培养RB细胞,将Vector、pcDNA-FAM83A-AS1、NC-siRNA、FAM83A-AS1-siRNA分别转染至细胞中(依次为pcDNA-FAm83A-AS1组、NC-siRNA组、FAm83A-AS1-siRNA组),检测RB细胞中FAM83A-AS1的表达、RB细胞增殖能力、凋亡率.生物信息学方法和双荧光素酶报告基因实验预测和验证FAM83A-AS1与miR-150以及miR-150与高迁移率族蛋白A2(HMGA2)的靶向关系.RT-qPCR检测RB细胞中miR-150、HMGA2 mRNA的表达;Western blot检测RB细胞中HMGA2蛋白的表达;MTT实验和流式细胞术检测转染后RB细胞增殖和凋亡能力.结果 pcDNA-FAM83A-AS1 组细胞中FAM83A-AS1 的表达显著高于Vector组,低于NC-siRNA组(P<0.05).pcDNA-FAM83A-AS1组较Vector组的细胞增殖能力显著升高,细胞凋亡率显著降低(P<0.05).FAM83A-AS1-siRNA组较NC-siRNA组的细胞增殖能力显著降低,细胞凋亡率显著升高(P<0.05).miR-150 mimic可显著抑制RB细胞增殖能力,促进细胞凋亡.而pcDNA-HMGA2可显著逆转miR-150 mimic对RB细胞增殖和凋亡的作用.结论 敲低lncRNA FAM83A-AS1通过调控miR-150/HMGA2轴抑制RB细胞增殖,促进细胞凋亡.

目的 基于胰腺癌相关的高通量基因表达(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据,采用生存相关算法筛选并验证参与胰腺癌患者生存的关键预后基因.方法 采用 GEO 数据库 2 个胰腺癌基因芯片(Microarray)和 TCGA 数据库胰腺癌转录组测序(RNA-seq)数据,利用Kaplan-Meier(KM)分析和Cox比例风险模型进行生存相关基因的过滤并取目的基因交集;对交集基因进行多因素回归分析与临床相关性分析筛选预后相关基因;对预后相关基因进行通路富集分析和CIBERSORT免疫富集分析寻找其调控胰腺癌的潜在分子机制.结果 本研究借助TCGA和GEO 数据库中包含的生存信息与临床特征的 3 个胰腺癌数据集,筛选得到了 5 个与胰腺癌生存相关的基因(CDO1、DCBLD2、FAM83A、ITGA3 和SLC16A3),且多因素Cox回归分析和临床相关性分析表明,CDO1 高表达是胰腺癌预后的保护性因素,其抑癌作用与抑制肿瘤细胞恶性生物学行为和促进胰腺癌抗肿瘤活性免疫细胞浸润相关.结论 本研究首次提出了CDO1 是与胰腺癌预后显著相关的保护性基因,并发现CDO1 的抑癌机制与抗肿瘤免疫微环境形成密切相关,为后续胰腺癌基础研究与临床治疗提供了新靶点.

目的 对1例遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征(hereditary breast and ovarian cancer syndrome,HBOC)家系的易感基因进行初步筛选. 方法 该家系4代46名成员中有4例为乳腺癌和卵巢癌双源肿瘤,1例为双侧卵巢癌.选择3个核心成员的血样进行全外显子组测序(whole exome sequencing,WES),对突变位点进行注释和分析.于TCGA(the cancer genome atlas)和GEO(gene expression omnibus)数据库下载乳腺癌和卵巢癌患者资料,分析mRNA表达数据. 结果 WES筛选的突变位点进行dbSNP过滤,得到可能跟疾病相关的16个突变基因.继而在其余7个家系成员中进行重测序验证,发病者中均有FAM83E基因突变(NM-017708:p.Ser387Gly).通过生物信息学分析TCGA和GEO数据,发现FAM83E基因在乳腺癌和卵巢癌组织中的表达,较正常组织明显升高. 结论 FAM83E基因可能在乳腺癌和卵巢癌发生发展中具有重要作用,值得进一步研究.

利用生物信息学方法筛选肺癌H460 顺铂耐药细胞(H460/DDP)中的差异表达基因,从Gene Expression Omnibus (GEO)公共数据库获得肺癌H460 及其顺铂耐药细胞株的基因表达芯片GSE21656,利用GEO2R软件分析差异表达基因,利用DAVID 在线数据库对差异基因进行重注释和功能富集分析.本研究共筛选出相关的差异表达基因75个,与H460 细胞相比,H460/DDP 细胞中有24个表达上调,51个表达下调,差异均具有统计学意义.预后分析的结果表明,高表达RAB3C [HR 1.33(1.13～1.56), p＜0.01]、SERPINB1 [HR 1.32(1.12～1.56), p<0.01]、CHRNA9 [HR 1.25(1.1～1.42), p<0.01]、FAM83A [HR 1.27 (1.08～1.5), p<0.01]、IGFBP4[HR 1.35 (1.19～1.53), p<0.01]和IGF2BP1 [HR 1.47(1.24～1.73), p<0.01]基因的肺癌患者拥有较差的总生存期.

目的 探讨FAM83A对胰腺癌细胞PANC-1干细胞样表型和放射敏感性的影响,旨在为胰腺癌靶向治疗提供新思路.方法 慢病毒感染构建稳定沉默FAM83A的PANC-1细胞株,qPCR和Western blot进行验证;流式细胞仪检测干细胞标记物CD133阳性的细胞数;肿瘤细胞成球实验检测PANC-1细胞成球能力;MTT检测吉西他滨对PANC-1稳转株细胞活力的影响;平板克隆形成实验检测X射线照射对PANC-1稳转株细胞增殖的影响;流式细胞术检测吉西他滨和X射线照射对PANC-1稳转株细胞凋亡的影响;Western blot检测PANC-1稳转株细胞中Wnt/β-catenin信号通路表达变化.结果 沉默FAM83A后PANC-1细胞中FAM83A蛋白表达(0.83±0.08)和mRNA表达(0.29±0.03)较阴性对照组FAM83A蛋白表达(1.95±0.19)和mRNA表达(0.98±0.09)显著降低(t=9.410、12.600,P<0.05);沉默FAM83A后CD133阳性PANC-1细胞率(8.97±0.62)％ 较阴性对照组(21.60±2.60)％ 显著降低(t=8.184,P<0.05),且细胞成球数(8±1)较阴性对照组(25±3)亦显著降低(t=9.311,P<0.05),PANC-1细胞干细胞样表型显著被抑制;沉默FAM83A联合50μmol/L吉西他滨处理PANC-1细胞72 h后细胞活力(32.33±3.05)％ 较吉西他滨处理组(63.06±5.98)％显著降低,细胞凋亡率(76.52±8.34)％ 较吉西他滨处理组(40.88±4.91)％ 显著增加,差异有统计学意义(t=6.378、7.929,P<0.05);沉默FAM83A联合X射线照射后,PANC-1细胞活力(43.25±4.21)％较X射线照射组(78.13±7.98)％明显降低,细胞凋亡率(44.56±5.32)％ 较X射线照射组(15.15±1.95)％ 明显增加,差异有统计学意义(t=6.694、8.990,P<0.05);沉默FAM83A后细胞中Wnt/β-catenin信号通路蛋白Active-β-catenin表达降低,p-β-catenin表达增加,且细胞核中 β-catenin表达也降低,差异有统计学意义(t=10.290、8.521、8.969,P<0.05),而Totalβ-catenin无明显变化,细胞中Wnt/β-catenin信号通路活性明显被抑制.结论 沉默FAM83A可能通过Wnt/β-catenin信号抑制胰腺癌细胞干细胞样表型,增强细胞对化疗药物吉西他滨及放射敏感性,FAM83A将可为胰腺癌临床治疗提供新靶点.

目的:探讨FAM83A在肺腺癌组织中的表达及临床意义.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载癌旁正常及肺腺癌组织中FAM83A mRNA表达的数据及其相关的临床资料.根据FAM83A mRNA表达量将肺腺癌患者分为FAM83A mRNA低表达组与高表达组,分析FAM83A mRNA的表达与患者临床病理特征的关系.结果:肺腺癌组FAM83A mRNA的表达高于癌旁正常对照组(P=0.001).FAM83A mRNA的表达量与肺腺癌患者的临床分期、TNM分期中的T分期和N分期有关(P均<0.05).FAM83A mRNA低表达组的中位生存时间为1622 d,高于高表达组(1357 d)(P=0.001).结论:肺腺癌组织中FAM83A mRNA的表达升高;FAM83A mRNA高表达及临床分期较晚与肺腺癌预后不良有关.