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沉默FAM83D基因调控上皮-间质转化对食管鳞癌放射敏感性影响
编辑人员丨4天前
目的:探讨沉默FAM83D对X线照射后食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞增殖、存活能力及侵袭、迁移能力的影响及机制。方法:采用免疫组化法检测69例ESCC患者组织中FAM83D、E-cadherin、vimentin的表达。免疫印迹法检测ECA109、KYSE30细胞FAM83D基因沉默效果。MTS、克隆形成实验和Transwell方法检测ECA109、KYSE30细胞增殖活性、存活能力及侵袭能力。流式细胞术和免疫印迹法检测ECA109、KYSE30细胞凋亡分布、上皮-间质转化(EMT)及凋亡相关蛋白表达。结果:ESCC组织中55%(38/69) FAM83D强表达,36%(25/69) E-cadherin强表达,61%(42/69) vimentin强表达;FAM83D强表达与E-cadherin强表达呈负相关( r=-0.350, P<0.01),与vimentin强表达呈正相关( r=0.470, P<0.01)。ECA109、KYSE30细胞沉默FAM83D后降低了FAM83D蛋白表达( P<0.01)。MTS和克隆形成实验数据显示照射后沉默FAM83D显著抑制了ECA109、KYSE30细胞增殖水平( P<0.05)、增加了放射敏感性( P<0.01)。照射后FAM83D shRNA组ECA109、KYSE30细胞侵袭力降低( P<0.01)、E-cadherin表达增加,而N-cadherin、vimentin、Snail、p-Akt、p-GSK-3β表达降低( P<0.01)。照射后FAM83D shRNA组ECA109、KYSE30细胞凋亡率明显增加( P<0.01),同时Bcl-2、Mcl-1表达下调,Cleaved caspase-3的表达上调( P<0.01)。 结论:FAM83D与ESCC的侵袭发展密切相关。沉默ECA109、KYSE30细胞FAM83D表达联合X线照射降低了其增殖、侵袭和存活能力,诱导了细胞凋亡,增加了放射敏感性,该作用可能通过Snail/Akt/GSK-3β信号途径来调控EMT。
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编辑人员丨4天前
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肺腺癌组织中FAM83A的表达
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨FAM83A在肺腺癌组织中的表达及临床意义.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载癌旁正常及肺腺癌组织中FAM83A mRNA表达的数据及其相关的临床资料.根据FAM83A mRNA表达量将肺腺癌患者分为FAM83A mRNA低表达组与高表达组,分析FAM83A mRNA的表达与患者临床病理特征的关系.结果:肺腺癌组FAM83A mRNA的表达高于癌旁正常对照组(P=0.001).FAM83A mRNA的表达量与肺腺癌患者的临床分期、TNM分期中的T分期和N分期有关(P均<0.05).FAM83A mRNA低表达组的中位生存时间为1622 d,高于高表达组(1357 d)(P=0.001).结论:肺腺癌组织中FAM83A mRNA的表达升高;FAM83A mRNA高表达及临床分期较晚与肺腺癌预后不良有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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miR-495通过靶向FAM83D抑制结肠癌细胞的增殖和迁移
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨miR-495通过靶向FAM83D抑制结肠癌细胞的增殖和迁移行为及其作用机制.方法 qPCR检测结肠癌和癌旁正常组织、不同结肠癌细胞株中miR-495的表达情况;CCK-8细胞增殖实验检测miR-495对结肠癌细胞增殖能力的影响;流式细胞术实验检测miR-495对结肠癌细胞周期的影响;双荧光素酶报告基因检测miR-495与FAM83D的相互作用;Transwell侵袭实验检测miR-495对结肠癌细胞侵袭能力的影响.结果 与癌旁正常组织相比,结肠癌组织中miR-495表达明显增高;结肠癌细胞HT29中miR-495的表达水平最高;抑制miR-495的表达后结肠癌细胞增殖能力减弱,促进其凋亡行为;miR-495能与FAM83D的3'UTR特异性结合,调控FAM83D的表达活性;抑制miR-495的表达后,HT29细胞的侵袭能力受到相应的抑制.结论 miR-495在结肠癌的发生发展过程中起重要作用,可以通过靶向调节FAM83D的表达影响结肠癌细胞的增殖和迁移.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于TCGA数据库分析肝细胞肝癌组织中HMMR表达与患者临床特征及预后的相关性
编辑人员丨2023/8/5
目的:研究透明质酸介导的运动受体(hyaluronan-mediated motility receptor,HMMR)的表达与肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生发展以及预后的关系.方法:在本研究中,我们通过从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载HCC有关的数据进行生物信息学分析,探讨HMMR表达在HCC发生、发展和预后中的价值.根据HMMR mRNA表达的中位值将患者分为两组(HMMR高表达组和HMMR低表达组),应用Kruskal-Wallis检验和Logistic回归分析HMMR表达与患者临床特征之间的关系,利用Kaplan-Meier和Cox分析观察HMMR表达对HCC患者生存的影响,并进行PPI蛋白互作网络、GO富集和KEGG通路分析.最后通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证HMMR mRNA在HCC组织样本中的表达.结果:HCC组织中HMMR的高表达与组织学分级(G3 vs G1,OR=2.675)、癌组织阶段(ⅢvsⅠ,OR=2.509)、T分期(T4 vs T1,OR=3.568)相关(P均<0.05).Kaplan-Meier生存分析显示,HMMR高表达的HCC预后比HMMR低表达的患者差(P=6.858E-05).Cox分析显示HMMR高表达是总体生存(overall survival,OS)的危险因素(HR:1.166,95%CI:1.027~1.324,P=0.018).PPI蛋白互作、GO富集和KEGG通路分析鉴定了与HMMR存在相互作用的10个基因,分别为:FAM83D、CD44、TPX2、PLK4、AURKA、PLK1、NEK2、CDK1、BUB1及DLGAP5,它们主要富集在有丝分裂细胞周期相变的调控、细胞周期过程、ECM-受体相互作用、FoxO信号通路、EB病毒感染等.qRT-PCR结果显示,HMMR mRNA在HCC癌组织中高表达(P<0.05).结论:HMMR mRNA的高表达与HCC的发生发展密切相关,是HCC预后不良的独立危险因素.
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编辑人员丨2023/8/5
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miR-206靶向FAM83A影响Wnt/β-catenin通路调控胰腺癌放疗敏感性
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究microRNA-206(miR-206)对胰腺癌细胞放疗敏感性的影响.方法 通过2 Gy照射胰腺癌细胞(AsPC-1、Capan-2、PL45、PANC-1),以人类正常胰腺上皮细胞(HPNE)作为对照,荧光定量聚合酶链反应(qPCR)实验观察细胞中miR-206的表达量;细胞克隆实验检测过表达miR-206对PANC-1细胞存活率的影响,流式细胞术分析其凋亡率;在线软件Targetscan预测miR-206的靶基因,双荧光素酶报告基因验证miR-206与序列相似性家族83成员(FAM83)A的靶向关系;过表达/敲低miR-206对FAM83A蛋白水平的影响;Western印迹检测共转染过表达miR-206和FAM83A对FAM83A蛋白及β-catenin、细胞周期蛋白(Cyclin)D1蛋白水平的影响.结果 miR-206在放射照射的胰腺癌多种细胞系中表达量显著降低(P<0.05);过表达miR-206显著促进其凋亡(P<0.05);FAM83A是miR-206的直接靶基因;miR-206可负反馈调节FAM83A表达量;共转染过表达miR-206和FAM83A可显著逆转miR-206对FAM83A蛋白水平的抑制作用,恢复其对PANC-1细胞存活分数的抑制、凋亡促进作用,改善miR-206对Wnt/β-catenin信号通路的抑制作用.结论 miR-206靶向抑制FAM83A表达影响Wnt/β-catenin信号通路的活性,从而介导胰腺癌PANC-1细胞的放疗敏感性.
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编辑人员丨2023/8/5
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Lnc⁃FAM83D⁃3通过miR⁃504⁃3p-FAM83D轴调控三阴性乳腺癌的机制研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA FAM83D?3(lnc?FAM83D?3)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的表达及其对HCC1937、MDA?MB?231生物学行为的影响及作用机制.方法 通过TCGA数据库分析lnc?FAM83D?3在乳腺癌中的表达情况及病理相关性.RT?qPCR检测lnc?FAM83D?3和微小RNA?504?3p(miR?504?3p)在组织标本和乳腺癌细胞系中的表达;慢病毒转染干扰lnc?FAM83D?3表达,利用MTT、细胞划痕实验、侵袭实验和流式细胞术检测实验组与对照组细胞功能改变.使用生物信息学软件和双荧光素酶报告基因实验分析lnc?FAM83D?3和miR?504?3p及FAM83D之间的关系.FISH实验证实lnc?FAM83D?3在胞浆内的表达,Western bolt检测下游蛋白变化情况.结果 在乳腺癌组织、癌细胞HCC1937和MDA?MB?231中lnc?FAM83D?3的表达增加(P<0.01).与对照组相比,干扰lnc?FAM83D?3表达后,TNBC细胞株增殖、迁移和侵袭能力降低,凋亡比例增加;miR?504?3p表达上升,FAM83D表达下降;双荧光素酶报告基因实验结果显示lnc?FAM83D?3靶向调控miR?504?3p表达,miR?504?3p进一步负向调控FAM83D的水平.结论 Lnc?FAM83D?3在TNBC细胞株中表达增加且通过抑制miR?504?3p促进FAM83D表达,影响乳腺癌恶性生物学行为.
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编辑人员丨2023/8/5
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FAM83D在胰腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨FAM83D在胰腺腺癌(PAAD)组织中的表达及临床意义.方法 基因表达谱动态分析(GEPIA)工具在线分析FAM83D基因表达及预后,KMplot数据库进行验证;选择2018年1月至2019年12月皖南医学院附属弋矶山医院病理科PAAD术后组织蜡块60对,包括癌组织和癌旁组织,使用免疫组织化学染色(IHC)检测FAM83D蛋白的表达;FAM83D作用机制使用基因集富集分析.结果 与正常组织比较,肿瘤组织中FAM83D mRNA表达明显升高(P<0.01).与癌旁组织比较,癌组织IHC评分显著增高(P<0.01).PAAD患者FAM83D蛋白高表达与淋巴结转移有关(P<0.05).与FAM83D mRNA低表达组比较,FAM83D mRNA高表达组总生存期、无进展生存期明显缩短(P<0.01).FAM83D上调与多个基因集呈正相关(P<0.05).结论 FAM83D在PAAD发生发展中具有重要作用,可望成为潜在治疗靶点和新型分子标志物.
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编辑人员丨2023/8/5
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多数据库联合分析卵巢癌预后相关基因
编辑人员丨2023/8/5
目的 寻找卵巢癌预后的关键基因,为卵巢癌治疗提供新的靶点.方法 从基因表达汇编(GEO)数据库GSE18520和GSE14407数据集、癌症基因组图谱(TCGA)数据库及基因型-组织表达(GTEx)数据库中下载卵巢癌相关数据,用R 3.6.2软件limma包进行差异表达基因分析,随后使用R 3.6.2软件clusterProfiler包对差异表达基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.使用STRING数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用Cytoscape软件cytoHubba插件筛选核心基因,利用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库验证核心基因在卵巢癌组织中的表达情况,随后使用Kaplan-Meier Plotter数据库对核心基因进行生存分析.结果 通过GEO数据库GSE18520、GSE14407数据集及TCGA、GTEx数据库共同筛选获得69个差异表达基因,主要富集在ABC转运体、视黄醇代谢及Wnt信号通路.蛋白质-蛋白质相互作用网络分析提示共有9个核心基因,GEPIA数据库分析结果表明这9个基因在卵巢癌中高表达.Kaplan-Meier Plotter数据库分析结果表明,中心体相关蛋白55(CEP55)、序列相似性83家族蛋白成员D(FAM83D)、驱动蛋白家族成员20A(KIF20A)、细胞周期依赖性激酶亚基蛋白2(CKS2)和中心体相关激酶2(NEK2)基因高表达的卵巢癌患者总生存期比低表达的患者缩短,CEP55、FAM83D、KIF20A、叉头框蛋白M1(FOXM1)和TTK蛋白激酶(TTK)基因高表达的患者无进展生存期比低表达的患者缩短.结论 CEP55、FAM83D、KIF20A、CKS2、NEK2、FOXM1和TTK的表达与卵巢癌患者的预后密切相关.
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编辑人员丨2023/8/5
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LncRNA FAM83H-AS1 调控 miR-136-5p/HOXC10轴对胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA(LncRNA)序列相似性家族83成员H反义RNA 1(lncRNA FAM83H-AS1)调控微小RNA-136-5p(miR-136-5p)/同源异型盒基因10(HOX10)轴对胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响.方法 体外培养人胶质瘤细胞U87,对U87细胞转染质粒,并将细胞分为对照组、si-NC组、si-FAM83H-AS1 组、miR-NC 组、miR-136-5p mimics 组、si-FAM83H-AS+NC inhibitor 组、si-FAM83H-AS+miR-136-5p inhibitor 组、miR-136-5p mimics+HOXC10 NC 组、miR-136-5p mimics+HOXC10 组.检测胶质瘤组织与细胞U87中FAM83H-AS1、miR-136-5p、HOXC10的表达.细胞计数盒8(CCK-8)法检测U87细胞增殖;流式细胞仪检测U87细胞凋亡;蛋白免疫印迹(WB)法检测U87细胞中HOXC10、Cyclin D1、Bcl-2、Bax蛋白的表达;双荧光素酶报告系统分析miR-136-5p与FAM83H-AS1、HOXC10的靶向关系.结果 胶质瘤组织中FAM83H-AS1表达水平显著升高,miR-136-5p表达水平降低(P<0.05);沉默FAM83H-AS1表达或过表达miR-136-5p,U87细胞凋亡率、Bax蛋白表达显著升高,细胞存活率、HOXC10 mRNA、Cyclin D1、Bcl-2蛋白表达显著降低(P<0.05);双荧光素酶报告基因显示,miR-136-5p与FAM83H-AS1、HOXC10均有靶向关系;抑制miR-136-5p表达可逆转沉默FAM83H-AS1表达对U87细胞增殖的抑制作用,HOXC10过表达可逆转过表达miR-136-5p对U87细胞增殖的抑制作用.结论 FAM83H-AS1通过调控miR-136-5p/HOXC10轴促进胶质瘤细胞增殖,抑制细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/8/5
