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lncRNA CALCOCO1调控miR-200a-3p抑制膀胱癌细胞增殖和迁移
编辑人员丨6天前
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)CALCOCO1在膀胱癌组织中的表达及其通过调控miR-200a-3p对膀胱癌细胞增殖和迁移的影响。方法:通过TCGA数据库分析膀胱癌组织和癌旁组织中CALCOCO1的相对表达水平。选择人膀胱癌细胞UM-UC-3,将细胞分为阴性对照组和CALCOCO1组,分别将NC质粒和CALCOCO1质粒转染UM-UC-3细胞。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测各组细胞CALCOCO1的表达水平。采用噻唑蓝(MTT)法和Transwell迁移实验检测UM-UC-3细胞的增殖情况和迁移能力。生物信息学技术预测及双荧光素酶报告基因实验验证CALCOCO1与miR-200a-3p的靶向关系。qRT-PCR检测各组UM-UC-3细胞miR-200a-3p的表达水平。Western blotting法检测各组UM-UC-3细胞增殖和迁移表型蛋白的表达。计量资料以均数±标准差( ± s)表示,两组间比较采用 t检验,不同时间点比较采用重复测量资料方差分析。 结果:与癌旁组织相比,膀胱癌组织中CALCOCO1相对表达水平明显降低,差异具有统计学意义( P<0.01)。CALCOCO1组和阴性对照组UM-UC-3细胞中CALCOCO1相对表达水平分别为9.66±2.51和1.07±0.59,CALCOCO1组CALCOCO1相对表达水平明显高于阴性对照组,差异具有统计学意义( P<0.01)。与阴性对照组相比,CALCOCO1组UM-UC-3细胞增殖活性降低( P<0.05),UM-UC-3细胞迁移数目显著减少( P<0.01)。CALCOCO1与miR-200a-3p存在结合位点。CALCOCO1组和阴性对照组UM-UC-3细胞miR-200a-3p的相对表达水平分别为1.02±0.31和5.79±1.68,差异具有统计学意义( P<0.01)。与阴性对照组相比,CALCOCO1组UM-UC-3细胞增殖表型蛋白CCNB1、CCNE1、CCND2表达水平降低,迁移表型蛋白FOXC2、Fibronectin表达水平降低。 结论:膀胱癌组织中CALCOCO1表达下调,促进CALCOCO1表达可通过靶向下调miR-200a-3p表达,从而抑制膀胱癌UM-UC-3细胞的增殖和迁移。
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编辑人员丨6天前
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沉默信息调节因子1基因启动子区域单核苷酸多态性与老年退行性心脏瓣膜病的相关性分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨沉默信息调节因子1(SIRT1)基因启动子序列单核苷酸多态性(SNPs)与老年退行性心脏瓣膜病(SDHVD)的相关性。方法:对236例SDHVD组成员(2012年2月至2016年10月济宁医学院附属医院确诊为SDHVD的患者)与285名健康对照组成员(同期于济宁医学院附属医院体检中心体检的健康体检者)的SIRT1基因启动子序列进行统计分析。Sanger测序法检测SIRT1基因启动子序列SNPs;χ 2、Logistic回归对SNPs进行基因型、等位基因分析和相关性分析,Haploview 4.2软件对SNPs进行连锁不平衡分析,SHEsis程序进行单倍型分析,凝胶迁移率变异实验(EMSA)分析SNPs对转录因子与SIRT1基因启动子相结合的影响,Transfac程序预测受多态性影响的与SIRT1基因启动子相结合的转录因子。 结果:rs3740051位点GG基因型与SDHVD的发生具有相关性,校正年龄后,其致SDHVD效应是AA基因型的3.079倍( OR=3.079,95 %CI:1.156~8.201, P=0.024)。SIRT1基因启动子中,5个SNPs位点间呈强连锁不平衡(均D′>0.8),共形成11种 P<0.05的单倍型,其中*A**C、AA**C、*AG*C、AAG*C、AA*AC、*AGAC和AAGAC在SDHVD组中具有更高的频率(均 P<0.05, OR>1,95 %CI不包含1)。EMSA示正常序列探针与核蛋白所孵育出的结合条带较突变序列探针与核蛋白所孵育出的结合条带颜色深。 结论:rs3740051位点GG基因型与SDHVD具有相关性且可能是SDHVD发生的危险性基因型。单倍型AC(跨rs932658和rs2394443)可能是SDHVD发生的危险性单倍型。rs3740051可能通过干扰FOXC蛋白与SIRT1基因启动子的结合影响SDHVD的发生发展。
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编辑人员丨6天前
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miRNA-324-5p和转录因子叉头框C1在脑胶质瘤中的表达及其临床意义
编辑人员丨6天前
目的:探讨miRNA-324-5p(miR-324-5p)、转录因子叉头框C1(FOXC1)在脑胶质瘤中的表达及与患者预后的关系。方法:收集2012年3月至2015年3月重庆海吉亚肿瘤医院和重庆市南川区人民医院收治的72例脑胶质瘤患者脑胶质瘤组织以及28例因颅脑手术切除的正常人脑组织。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-324-5p、FOXC1 mRNA表达水平,采用免疫组织化学法检测FOXC1蛋白表达情况。采用Pearson法分析脑胶质瘤组织miR-324-5p、FOXC1表达的相关性;Kaplan-Meier法对脑胶质瘤患者进行生存分析;Cox回归分析影响脑胶质瘤患者预后的危险因素。结果:FOXC1蛋白主要定位于脑胶质瘤细胞质,在脑胶质瘤组织中的阳性表达率为81.94%(59/72),高于其在正常脑组织中的阳性表达率[17.86%(5/28)],差异有统计学意义( χ2=35.938, P<0.01)。与正常脑组织相比,miR-324-5p在脑胶质瘤组织中表达下调(0.62±0.19比0.98±0.02, t=9.974, P<0.05),FOXC1 mRNA表达上调(1.41±0.29比0.99±0.02, t=7.633, P<0.05)。miR-324-5p、FOXC1蛋白表达水平与脑胶质瘤原发灶数目、分化程度、TNM分期及淋巴结转移有关(均 P<0.05)。脑胶质瘤组织中miR-324-5p、FOXC1 mRNA表达水平呈负相关( r=-0.550, P<0.01)。miR-324-5p高表达组患者5年总生存率高于低表达组(45.71%比24.33%, χ2=6.531, P=0.011),FOXC1蛋白高表达组患者5年总生存率低于低表达组(30.41%比42.34%, χ2=3.631, P=0.047)。多因素Cox回归分析结果显示,肿瘤分化程度低、TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移、miR-324-5p低表达、FOXC1蛋白高表达是影响脑胶质瘤患者预后的独立危险因素(均 P<0.05)。 结论:脑胶质瘤组织中miR-324-5p呈低表达,FOXC1呈高表达,二者可能参与调控肿瘤分化转移,并与患者预后不良有关,可能作为脑胶质瘤的潜在治疗靶点。
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编辑人员丨6天前
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一个淋巴水肿-双行睫综合征家系的 FOXC2基因变异分析
编辑人员丨6天前
目的:对1个淋巴水肿-双行睫综合征(lymphedema-distichiasis syndrome,LDS)家系患者的FOXC2基因进行变异分析,明确患者的致病原因。方法:采集家系成员血液样本并提取DNA和蛋白,对先证者进行全外显子组测序及生物信息学分析,确定可疑致病变异后应用Sanger测序进行家系验证、Western印迹技术检测蛋白表达量的变化。结果:测序结果显示先证者和患病母亲均携带FOXC2基因c.177C>G(p.Tyr59X)杂合无义变异,该变异目前尚未被报道过,Western印迹检测显示FOXC2蛋白表达下降。其母在早孕期B超提示胎儿NT增厚,孕21 +1周行羊水穿刺对胎儿进行产前诊断,产前基因诊断结果提示胎儿也携带c.177C>G变异。 结论:FOXC2基因c.177C>G无义变异是患儿的致病原因,并导致Foxc2蛋白表达下降,胎儿NT增厚可能和Foxc2表达量下降有关。本研究结果扩大了FOXC2基因变异谱。
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编辑人员丨6天前
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Axenfeld-Rieger综合征临床特征及遗传变异相关研究
编辑人员丨6天前
Axenfeld-Rieger综合征(ARS)是一种罕见的、涉及眼前节发育异常的常染色体显性遗传病,可伴有颅面部发育异常、牙齿缺失或小牙、脐部皮肤突出等全身其他器官发育缺陷。ARS在眼部主要表现为角膜后胚胎环、虹膜发育异常和前粘连、瞳孔偏位或多瞳孔,以及上述的不同组合,青光眼发生率较高。ARS具有表型异质性,即使在同一家系中,具有相同基因型的人表型也不尽相同。目前报道的ARS相关遗传变异主要涉及编码转录因子的 PITX2、 FOXC1基因,基因内点突变和基因删除为常见变异类型,具体致病机制尚不明确,可能与基因突变导致的基因表达量异常和蛋白质功能改变有关。个别ARS患者携带 COL4A1、 PRDM5、 CYP1B1基因突变,但其致病性仍有待进一步研究证实。本文将对ARS临床特征、相关基因以及和临床表型的关系、基因功能研究现状等进行综述。
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编辑人员丨6天前
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长链非编码RNA叉头框蛋白C1基因启动子上游转录体通过Janus激酶信号对乳腺癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响
编辑人员丨6天前
目的:观察长链非编码RNA(lncRNA)叉头框蛋白C1(FOXC1)基因启动子上游转录体(FOXCUT)调控JAK信号在乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用。方法:采用实时定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测lncRNA FOXCUT在乳腺癌细胞株(MCF-7和MDA-MB-231)和人正常乳腺上皮细胞(MCF-10A)中的表达。体外干扰lncRNA-FOXCUT在乳腺癌细胞MCF-7中表达,利用细胞计数试剂盒(CCK-8)法、伤口愈合法和细胞侵袭实验检测lncRNA FOXCUT对乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。同时,用qRT-PCR和蛋白质印迹法(Western blot)检测B细胞淋巴瘤2(bcl-2)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)和Janus激酶1(JAK1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)的表达。多组间比较采用单因素方差分析,两两比较采用SNK- q检验。 结果:lncRNA FOXCUT在乳腺癌细胞MCF-7(1.567±0.270, t=5.086, P<0.01)和MDA-MB-231(1.513±0.387, t=3.533, P<0.01)中表达明显高于MCF-10A细胞(1.004±0.193),差异有统计学意义。siRNA-FOXCUT组细胞增殖活力明显低于NC组(48 h时0.790±0.068比0.991±0.165, t=2.516, P<0.05;72 h时0.928±0.135比1.500±0.311, t=3.775, P<0.01),差异有统计学意义。同时,siRNA-FOXCUT组MCF-7细胞的迁移率[(30.163±4.133)%比(79.330±4.952)%, t=13.200, P<0.01]和侵袭[(101.000±13.115)个比(244.667±18.771)个, t=10.870, P<0.01]能力均低于NC组,差异有统计学意义。siRNA-FOXCUT组细胞中bcl-2(0.565±0.058比1.075±0.242, t=3.555, P<0.01)和MMP-9(0.527±0.138比0.982±0.172, t=3.574, P<0.01)在mRNA和蛋白水平均低于NC组,同时p-JAK1(0.185±0.031比1.095±0.134, t=11.460, P<0.01)和p-STAT3(0.298±0.029比0.948±0.235, t=4.755, P<0.01)蛋白表达低于NC组,差异有统计学意义。 结论:lncRNA FOXCUT可能通过JAK1/STAT3途径参与调控乳腺癌的增殖、迁移和侵袭。
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编辑人员丨6天前
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FOXC1人表皮干细胞向汗腺细胞分化的影响
编辑人员丨2024/6/8
目的 探究叉头框C1(FOXC1)对人表皮干细胞向汗腺细胞分化的影响及可能机制.方法 收集2021年1月至2022年6月行包皮环切术7例的患者正常包皮组织,分离培养得到表皮干细胞,采用慢病毒介导FOXC1基因进行转染,并为过表达组、干扰组和对照组,RT-PCR及Western blot检测细胞FOXC1 mRNA及蛋白表达,MTT实验及吉姆萨染色检测细胞增殖水平、克隆形成率,ELISA检测培养基中基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、MMP-9表达,激光共聚焦显微镜检测Ca2+荧光强度,Western blot检测细胞角蛋白(CK19)、CK18、癌胚抗原(CEA)、β1整合素(ITGB1)表达.结果 与对照组比较,过表达组细胞中FOXC1 mRNA及蛋白相对表达量、细胞增殖水平、细胞克隆形成率、Ca2+荧光强度、MMP-2、MMP-9、表皮干细胞标记物CK18、CEA蛋白表达量升高(P<0.05),ITGB1、CK19蛋白表达量降低(P<0.05);与对照组比较,干扰组中FOXC1 mRNA及蛋白相对表达量、细胞增殖水平、细胞克隆形成率、Ca2+荧光强度、MMP-2、MMP-9、表皮干细胞标记物CK18、CEA蛋白表达量降低(P<0.05),ITGB1、CK19蛋白表达量升高(P<0.05).结论 FOXC1可促进表皮干细胞向汗腺细胞分化的表型改变,其作用可能与其能促进表皮干细胞增殖及上调 Ca2+、MMP-2、MMP-9 表达有关.
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编辑人员丨2024/6/8
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化瘀散水煎剂通过调控miR-129-5p/FOXC1轴抑制肝癌裸鼠移植瘤生长
编辑人员丨2024/4/27
目的:探讨化瘀散水煎剂通过调控微小RNA-129-5p/叉头框蛋白C1(FOXC1)轴对肝癌裸鼠移植瘤生长的影响.方法:建立肝癌裸鼠移植瘤模型,并分为裸鼠NC组、化瘀散水煎剂组、化瘀散水煎剂+ inhibitor-NC组、化瘀散水煎剂+miR-129-5p inhibitor组,每组8 只.qRT-PCR法检测miR-129-5p、FOXC1 mRNA表达水平,双荧光素酶报告基因实验验证miR-129-5p与FOXC1 靶向调控关系,观察记录裸鼠的瘤重及移植瘤体积,HE染色观察移植瘤组织形态,TUNEL检测肿瘤组织细胞凋亡,免疫组织化学染色检测瘤组织 Ki-67、Cleaved Caspase-3、FOXC1 表达,Western blot 检测 Ki-67、Cleaved Caspase-3、FOXC1 蛋白表达.结果:miR-129-5p在肝癌细胞中表达显著下降,FOXC1 mRNA表达显著升高,其中HepG2 细胞变化最显著(P<0.05);双荧光素酶报告基因实验表明miR-129-5p与FOXC1 存在靶向调控关系;与NC组相比,化瘀散水煎剂组肿瘤细胞出现坏死,凋亡数增加,miR-129-5p、Cleaved Caspase-3显著升高,移植瘤质量和体积、FOXC1、Ki-67 表达显著降低(P<0.05);下调miR-129-5p逆转化瘀散水煎剂对肝癌移植瘤的抑制作用(P<0.05).结论:化瘀散水煎剂可能通过上调miR-129-5p从而下调FOXC1 表达,进而抑制肝癌移植瘤生长.
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编辑人员丨2024/4/27
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三阴型乳腺癌基于组织学、免疫组化分型的分析
编辑人员丨2024/4/27
目的 探讨基于组织学、免疫组化的三阴型乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)分型标准,为完善TNBC分型治疗提供理论依据.方法 根据组织学特点和免疫组化标志物AR、CD8、FOXC1的表达对TNBC进行分型,比较TNBC亚型的临床病理特征、预后差异.结果 93例TNBC中腔面雄激素受体型23例(24.7%),免疫调节型24例(25.8%),基底样免疫抑制型39例(42.0%),间充质型7例(7.5%).TNBC亚型的临床病理特征:pT分期(P=0.030)、组织学分级(P<0.001)、肿瘤间质淋巴细胞浸润模式(P<0.001)、PD-L1(P<0.001)、HER2低表达(P=0.024)差异均有统计学意义;各亚型间的无瘤生存率差异无统计学意义(P>0.05).单因素分层生存分析:亚型间pT1分期的无瘤生存率差异有统计学意义(P=0.011),其余临床病理特征均为非独立预后因素.结论 TNBC基于组织学、免疫组化分型的临床病理特征有差异,有望替代复杂基因表达谱分型,为TNBC分型和靶向治疗提供理论依据.
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编辑人员丨2024/4/27
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基于随机森林和人工神经网络构建种植体周炎的诊断模型
编辑人员丨2024/4/27
目的 本研究旨在揭示种植体周炎发生发展过程中参与调控的关键基因,并通过随机森林(RF)和人工神经网络(ANN)构建种植体周炎的诊断模型.方法 本研究从GEO数据库中获取GSE33774、GSE106090和GSE57631数据集.对GSE33774和GSE106090数据集进行差异表达和功能富集分析,通过蛋白质互作网络(PPI)和RF筛选出关键基因,利用ANN建立种植体周炎的诊断模型,并在GSE33774 和GSE57631数据集中进行验证.同时,构建转录因子-基因相互作用网络和转录因子-微小RNA(miRNA)调控网络.结果 本研究共筛选出124个参与调控种植体周炎的差异表达基因(DEGs).富集分析结果表明,DEGs主要和免疫受体活性蛋白及细胞因子受体活性相关,主要参与白细胞和中性粒细胞迁移的过程.PPI和RF筛选出6个关键基因,分别为CD38、CYBB、FCGR2A、SELL、TLR4和CXCL8.受试者操作特征曲线(ROC)表明ANN模型具有较好的诊断性.本研究还发现FOXC1、GATA2和NF-κB1可能是种植体周炎中重要的转录因子,hsa-miR-204可能是关键的miRNA.结论 RF和ANN构建的种植体周炎的诊断模型可信度高,CD38、CYBB、FCGR2A、SELL、TLR4和CXCL8是潜在的诊断标志物.FOXC1、GATA2和NF-κB1可能是种植体周炎中重要的转录因子,hsa-miR-204作为关键的miRNA在其中扮演着重要角色.
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编辑人员丨2024/4/27
