目的:探讨INHBA在结直肠癌中的表达及其与微卫星状态、临床病理特征之间的关系。方法:基于基因表达综合（GEO）数据库及基因表达谱交互分析（GEPIA）数据库进行生物信息学分析，选定结直肠癌差异表达预后相关目标基因。收集2016年1月至2022年6月于锦州医科大学附属第三医院行手术治疗的107例结直肠癌患者蜡块组织，制备组织芯片，采用免疫组织化学法检测结直肠癌组织中微卫星状态[错配修复（MMR）蛋白MLH1、MSH2、MSH6、PMS2均为阳性表达为错配修复完整（pMMR），代表微卫星低度不稳定或微卫星稳定；若其中任何一个指标为阴性，则判定为错配修复缺陷（dMMR），代表微卫星高度不稳定]和INHBA的表达情况。回顾性分析患者临床病理资料，分析INHBA与微卫星状态及临床病理特征之间的关系。结果:从GEO数据库筛选出结直肠癌3个数据集：GSE110223（13个癌组织、13个癌旁组织）、GSE110224（17个癌组织、17个癌旁组织）、GSE113513（14个癌组织、14个癌旁组织），筛选出癌组织和癌旁组织间差异表达上调和下调的前50个基因，经韦恩图分析3个数据集的交集基因，筛选出上调基因12个，下调基因17个；根据GEPIA数据库，共有的上调和下调差异基因中AQP8、ZG16、INHBA基因与结直肠癌预后相关，INHBA在结直肠癌组织中表达水平较癌旁（距肿瘤边缘≥5 cm）组织高（ P<0.05），选定INHBA基因进行分析。对收集的结直肠癌蜡块组织进行免疫组织化学检测显示，结直肠癌组织INHBA高表达患者比例高于癌旁组织INHBA高表达患者比例[85.05%（91/107）比67.29%（72/107）， P<0.05]。癌组织INHBA高表达与病灶部位[右半结肠比左半结直肠：94.00%（47/50）比77.19%（44/57）]、肿瘤长径[>5 cm比≤5 cm：92.73%（51/55）比76.92%（40/52）]、浸润深度[T 3~4期比T 1~2期：96.43%（54/56）比72.55%（37/51）]、分化程度[低、中分化比高分化：91.04%（61/67）比75.00%（30/40）]、淋巴结转移[是比否：93.02%（40/43）比78.13%（50/64）]均有关（均 P<0.05），与年龄、性别、脉管癌栓、神经侵犯情况均不相关（均 P>0.05）。pMMR组结直肠癌组织INHBA高表达患者比例高于dMMR组患者[93.22%（55/59）比75.00%（36/48）， χ2＝6.91， P＝0.008]。 结论:INHBA在结直肠癌组织中高表达，并且高表达的INHBA与结直肠癌的临床病理特征以及微卫星状态密切相关；INBHA可能为结直肠癌诊断、治疗及预后的新标靶。

目的:构建inhba基因过表达的慢病毒载体(lenti-EGFP-inhba),观察体外转染大鼠卵巢颗粒细胞的有效性.方法:pLVX-EGFP-3 FLAG质粒系统经EcoRI酶切使之线性化.inhba基因(NM 008380)PCR扩增后同源重组入线性化的表达质粒系统.Western blot法检测表达质粒目的基因表达.将构建成功的慢病毒载体(lenti-EGFP-inhba)转染大鼠卵巢颗粒细胞(MOI=20),检测目的基因表达.结果:PCR扩增产物与目的基因大小吻合,重组质粒系统经转化后获得阳性克隆,转染293 T细胞可见EGFP-inhba融合蛋白表达.Western blot获得76 kDa分子量大小阳性条带,与融合蛋白分子量大小一致.lenti-EGFP-inhba体外转染大鼠卵巢颗粒细胞,倒置荧光显微镜下可见EGFP表达.结论:len-ti-EGFP-inhba表达载体成功构建,并可在体外有效转染大鼠卵巢颗粒细胞.

目的 初步探讨左、右半结肠癌基因转录水平的分子差异,及其差异表达基因INHBA与结肠癌临床病理特征及预后的相关性.方法 收集具有完整随访资料的结肠癌标本,分析左、右半结肠癌患者的生存情况,同时利用公共数据库中的结肠癌数据,筛选左、右半结肠癌组织的差异表达基因,并应用RT-PCR及免疫组化分析差异表达基因INHBA的表达水平与结肠癌临床病理特征及预后的相关性.结果 结直肠癌公共数据库分析结果显示,左、右半结肠癌转录组水平差异表达基因在TGF-β、NF-κB等信号通路中显著富集,TGF-β通路中的相关差异表达基因INHBA在右半结肠癌组织中的mRNA及蛋白表达水平显著高于左半结肠癌(P＜0.05),并且INHBA高表达与右半结肠癌的脉管浸润、远处转移及不良预后呈正相关(P＜0.05).结论 INHBA基因在右半结肠癌组织中的表达水平显著高于左半结肠癌,并且其表达与患者的恶性进展及不良预后密切相关,INHBA表达上调可能在右半结肠癌的发生和演进过程中发挥着重要作用.

为了探究水貂季节性睾丸退化的分子机制,本研究利用HE染色技术对不同退化时期的水貂睾丸组织进行了组织学研究,同时利用荧光定量PCR技术对不同退化时期的水貂睾丸组织中TGFB家族生长因子及其受体基因表达量变化进行了研究.结果发现在水貂睾丸退化期间,其直径逐渐缩短到原来的1/2,重量逐渐降低到原来的1/8.HE染色结果发现,4～7月水貂睾丸经历了严重退化,而且曲细精管的管腔逐渐消失,同时曲细精管的直径减小到其最大尺寸的1/3.荧光定量PCR结果发现TGFB3、INHBA、TGFBR1、ACVR2A、ACVR2B、SMAD2、SMAD4基因相对表达量在水貂睾丸退化期间都呈下降趋势.本研究表明TGFB信号通路可能在水貂睾丸退化期间发挥了重要功能.

鼻咽癌和口腔鳞癌是两种在临床上高度相关的疾病,从分子层面系统性研究这两种疾病的相互关系却鲜见报道.本研究通过大规模的转录组数据分析识别鼻咽癌和口腔鳞癌的共享功能模块及其核心基因(一因多效模块和基因),以期阐明这两种疾病共享的分子机制.从GEO数据库获取这两种癌症的两套转录组数据,应用倍数法和经验贝叶斯方法筛选出鼻咽癌差异表达基因1279个,口腔鳞癌差异表达基因1293个,其中两者共享基因278个.以共享基因为种子,通过蛋白质-蛋白质互作知识引导构建基因网络,其中最大子网包含1290个基因和1766互作对.应用Newman算法提取了15个共享功能模块.对这些模块进行拓扑学分析,挖掘出58个核心基因,包括已知的与鼻咽癌或口腔鳞癌相关的基因(如PCNA、CDK1、STAT1、CCL5和MMP1等)和鲜有报道的基因(如MELK、NME1、RACGAP1、INHBA和NID1等).通路富集分析发现鼻咽癌和口腔鳞癌的共享功能模块参与多个生物学通路,包括p53信号通路、ECM受体相互作用、黏着斑、细胞周期等.本研究表明鼻咽癌和口腔鳞癌具有相似的致癌机制,所挖掘的共享模块可能是这两种疾病演化的核心分子相互作用机制.

目的 研究活动性肺结核患者外周血单个核细胞( peripheral blood mononuclear cells, PBMCs)中抑制素βA亚基(inhibin, beta A, INHBA)基因的表达特点.方法 使用密度梯度离心法分离PBMCs,然后用TRIzol提取细胞RNA,逆转成cDNA后,进行荧光定量PCR分析INHBA的表达.结果 结核分枝杆菌H37Rv菌体裂解液和结核分枝杆菌特异性抗原ESAT-6和CFP-10的多肽,显著性提高PBMCs中INHBA基因的表达,配对t检验p值分别为0.019和0.0013;在无抗原刺激的情况下,活动性肺结核与正常对照之间无显著差别(P=0.52);当使用结核分枝杆菌H37Rv菌体裂解液和结核分枝杆菌特异性抗原ESAT-6和CFP-10的多肽刺激PBMCs,INHBA在活动性肺结核患者组的表达显著性的高于正常对照组, t检验P值分别为0.016和0.010.结论 INHBA在结核抗原刺激后在PBMCs表达显著性升高,且在活动性肺结核患者组显著高于正常对照组,可能作为活动性肺结核的诊断标志物.

目的:通过分析GEO数据库结直肠癌相关芯片集,寻找差异基因,并在TCGA数据库和GEO数据库进行验证,为结直肠癌的早期诊断寻找标志物.方法:分析GEO数据库结直肠癌相关芯片集GSE21510、GSE25071、GSE32323.分别分析差异基因,采用文恩图软件查找共同差异基因.进一步在TCGA数据库查找差异基因在结直肠癌中的表达及生存曲线.最后通过GEO数据库GSE24514验证差异基因的表达.结果:GSE21510,包含104例样本,共筛选出251个差异基因,其中上调基因146个,下调基因105个.GSE25071,包含50例样本,共筛选出669个差异基因,其中上调基因312个,下调基因357个.GSE32323,包含10例样本,共筛选出353个差异基因,其中上调基因115个,下调基因238个.在样本中上调基因为促癌基因,下调基因为抑癌基因.经文恩图分析,3个基因集交集共有15个基因,其中上调基因3个,下调基因12个.在TCGA数据库中查找差异基因的表达量和生存曲线,生存曲线选择结肠癌数据集,选取279个样本进行分析.根据差异基因的表达和生存曲线,最终确定促癌基因INHBA和抑癌基因CLCA4、CA4为结直肠癌的标志物.最后在GSE24514芯片集验证差异基因的表达.结论:通过GEO和TCGA数据库筛选及验证,发现在结直肠癌组织中INHBA基因明显上调,CLCA4、CA4基因明显下调.最终确定促癌基因INHBA和抑癌基因CLCA4、CA4可作为结直肠癌早期诊断的标志物.

目的 通过分析GEO数据库中的基因芯片数据,筛选宫颈癌相关的差异表达基因.方法 从GEO数据库中下载宫颈癌相关基因表达数据集GSE9750和GSE63514,利用GEO2R工具筛选差异表达基因;利用DAVID在线工具进行GO和KEGG富集途径分析;利用GSE7803、GSE39001和TCGA中的数据对结果进行验证.结果 共筛选出176个宫颈癌相关差异表达基因,包括上调基因41个,下调基因135个;INHBA基因在宫颈癌组织中高表达,且与患者的总生存期(HR=2.5,P<0.01)和无病生存期呈负相关(HR=2.7,P<0.01).结论 通过分析GEO中的基因芯片数据获得多个宫颈癌发病相关的基因,INHBA基因可作为患者的诊断及预后评估的潜在新分子标记.

目的:本研究拟通过生物信息学分析的方法分析胃癌及癌旁正常组织差异表达的基因,探索胃癌的发病机制,为胃癌的早期诊断和治疗评估提供新思路.方法:从基因表达数据库中获取GSE79973和GSE19826基因表达谱,使用GCBI在线实验室筛选差异表达基因,并使用基因本体论分析、代谢通路分析、基因信号通路网络分析、共表达分析对所获得基因进行分析.结果:与对照组相比,在胃癌组织中筛选出共1206个基因呈差异表达.其中,542个基因表达下调,664个基因表达上调;差异基因主要涉及细胞粘附、细胞外基质组织、细胞外基质分解、胶原蛋白分解代谢过程等方面,pathway分析发现核心信号通路主要涉及粘附力、糖酵解/糖异生、Wnt信号通路、癌症通路等方面;基因信号通路网络分析发现的关键节点基因为UGT2B15、ITGA2、ITGB1、CYP3A4;共表达网络分析推测的关键节点基因为SH3GL2、CKMT2、CHIA、ATP4A.结论:INHBA、UGT2B15、ITGA2、ITGB1、SH3GL2等基因及其相关的生物过程可能是胃癌的潜在生物标志物和治疗靶标,生物信息学有助于全面深入研究疾病发生机制,筛选可能的核心靶点,为临床诊断及疾病治疗提供参考.

目的:通过数据库数据分析INHBA基因在结肠腺癌中的表达及意义.方法:通过Oncomine数据库分析INHBA基因在结肠腺癌中的差异性表达,基于GEPIA网站分析INHBA基因表达与结肠腺癌患者生存周期的关系,MethHC数据库分析INHBA基因甲基化水平,通过String数据库分析INHBA基因的蛋白相互作用及上下游调控关系.结果:结肠腺癌组织中INHBA的mRNA表达较正常对照组明显增高.Meta分析进一步证实INHBA基因的表达在结肠腺癌组织中明显增高.甲基化分析中发现INHBA启动子甲基化水平肿瘤组明显低于正常组.GEPIA分析发现高表达组患者生存周期明显短于低表达组.蛋白质网络分析发现,IN-HBA可能与ACVRL1、ACVR1C、ACVR1、ACVR1B、ACVR2A、ACVR2B、SMAD4、SMAD2、FSHB、FST等蛋白相互作用.结论:通过数据挖掘发现,INHBA在结肠腺癌组织中高表达,参与肿瘤的发生发展,可作为诊断和治疗的潜在靶点.