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KDM2A在博来霉素诱导肺纤维化小鼠中的表达
编辑人员丨5天前
目的 探讨KDM2A在肺纤维化进展中的表达变化,以期为寻求肺纤维化的发病机制提供具有潜力的新方向.方法 将8~10周的C57BL/6J雄性小鼠随机分配为正常组、14d模型组与21 d模型组.取模型组小鼠麻醉后,气道滴定博来霉素诱导建立肺纤维化模型.分别于造模后第14天、第21天取材14 d模型组与21 d模型组小鼠肺组织,最后取材正常组小鼠肺组织.通过HE染色,Masson染色来评估小鼠肺泡炎及纤维化程度.免疫组化分析3组肺组织α-SMA、FN、TGF-β1及KDM2A蛋白表达情况并进行免疫组化评分.Western Blot法检测α-SMA、FN、TGF-β1及KDM2A蛋白表达量.结果 与正常组比较,14 d模型组肺泡炎评分明显增加(P<0.001);21 d模型组较14 d模型组比较,肺泡炎评分轻度增加,但差异无统计学意义(P>0.05).与正常组比较,14 d模型组纤维化评分明显增加(P<0.01);21 d模型组较14 d模型组比较,纤维化评分明显增加(P<0.01).免疫组织化学染色结果显示:与正常组比较,14 d 模型组 α-SMA(P<0.01)、FN(P<0.01)、TGF-β1(P<0.01)、KDM2A(P<0.01)蛋白免疫组化评分明显升高;21 d 模型组较 14 d 模型组比较,α-SMA(P<0.01)、FN(P<0.05)、TGF-β1(P<0.01)、KDM2A(P<0.01)蛋白免疫组化评分升高.Western Blot 结果显示:与正常组比较,14 d 模型组 α-SMA(P<0.01)、FN(P<0.01)、TGF-β1(P<0.01)、KDM2A(P<0.01)蛋白表达量明显升高;21 d 模型组较 14 d 模型组相比,α-SMA(P<0.01)、FN(P<0.01)、TGF-β1(P<0.01)、KDM2A(P<0.01)蛋白表达量升高.结论 KDM2A在BLM诱导的肺纤维化小鼠肺组织中表达增强,其可能通过调控TGF-β1的表达来参与肺纤维化的形成.
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编辑人员丨5天前
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KDM6B在乙型肝炎病毒X基因介导的足细胞-巨噬细胞转分化中的作用
编辑人员丨5天前
目的:分析赖氨酸特异性去甲基化酶6B(KDM6B)在乙型肝炎相关性肾炎(HBV-GN)患者肾组织及乙型肝炎病毒X基因(HBx)转染的人足细胞中的表达,及其在HBx介导的足细胞-巨噬细胞转分化(PMT)中的作用。方法:选取2013至2018年在上海交通大学附属第一人民医院经肾穿刺活检病理诊断为HBV-GN的48例患者肾活检标本,以30例原发性肾小球肾炎(PGN)肾活检标本及15例肾肿瘤患者癌旁正常肾组织作为对照。利用免疫荧光及免疫组化法观察HBV-GN患者肾组织KDM6B及巨噬细胞标志物F4/80的表达。分析肾组织KDM6B表达水平与HBV-GN患者临床特征的关系。Western印迹法检测足细胞中KDM6B、F4/80、主要组织相容性复合体Ⅱ(MHC-Ⅱ)以及共刺激分子CD40的表达;ELISA法测定细胞上清中γ干扰素(IFN-γ)、白细胞介素(IL)-6的含量;同时利用KDM6B小干扰RNA(siRNA)沉默HBx质粒转染的人足细胞中KDM6B基因表达后,Western印迹法检测细胞中KDM6B、F4/80及组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化(H3K27me3)的表达变化。结果:与正常对照组相比,HBV-GN患者肾组织KDM6B表达增加(0.022±0.004比0.006±0.002, P=0.006)。HBV-GN不同病理类型组间KDM6B阳性率差异无统计学意义( P=0.139)。此外,在HBV-GN患者足细胞中可观察到KDM6B和F4/80的共表达。估算肾小球滤过率(eGFR)<60 ml·min -1·(1.73 m 2) -1或尿蛋白≥3.5 g/d的患者肾组织KDM6B表达分别高于eGFR≥60 ml·min -1·(1.73 m 2) -1或尿蛋白<3.5 g/d的患者(均 P<0.05)。HBx转染人足细胞后KDM6B、F4/80、MHC-Ⅱ以及CD40表达均上调(均 P<0.05),上清IFN-γ和IL-6含量均增加(均 P<0.05);将KDM6B基因沉默后,HBx所诱导的足细胞F4/80表达下调,H3K27me3表达则上调(均 P<0.05)。 结论:HBx可通过诱导足细胞KDM6B表达启动PMT,可能参与HBV-GN局部组织免疫微环境紊乱的发生。
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编辑人员丨5天前
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KDM6A突变及表达对胃癌预后的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨KDM6A突变或表达与胃癌临床病理特征的关系及其对胃癌患者预后的影响。方法:通过二代测序对57例胃癌组织进行全外显子测序,以及Cbioportal、Kaplan Meier-Plotter和the Human Protein Atlas等生物信息数据库资料,分析KDM6A突变与胃癌临床病理特征和胃癌患者总生存时间的关系。结果:57例胃癌样本中,KDM6A突变14例,突变率为24.6%。突变组与未突变组比较,Borrmann分型、T分期、TNM分期和肿瘤直径差异有统计学意义(均 P<0.05),突变组患者的中位生存时间(53.5个月)短于未突变组(72.0个月, P=0.007)。Kaplan Meier-Plotter数据库的875例胃癌患者中,KDM6A低表达者655例,高表达者220例,低表达患者的中位生存时间(23.5个月)短于高表达患者(30.8个月, P=0.002)。在男性、Ⅲ期、肠型、弥漫型、单纯手术治疗和含氟尿嘧啶方案化疗的患者中,KDM6A表达与患者的总生存时间有关(均 P<0.05)。Cbioportal数据库的1 172例胃癌患者中,KDM6A突变者70例,未突变者1 100例,突变患者的总生存时间(28.9个月)短于未突变患者(35.9个月, P<0.001)。the Human Protein Atlas数据库的355例胃癌患者中,KDM6A高表达97例,KDM6A低表达258例,低表达患者的中位生存时间(13.7个月)短于高表达患者(19.8个月, P=0.022)。 结论:KDM6A突变、低表达胃癌患者的生存时间更短,且与临床病理因素相关,有可能成为胃癌诊断及治疗的潜在靶点。
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编辑人员丨5天前
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KDM6A基因突变致歌舞伎综合征胎儿的1个三代家系的临床特征及遗传咨询
编辑人员丨5天前
目的:探讨1例具有不良孕产史的女性的遗传学病因。方法:以1例曾有1次胎停和2次横膈疝伴心脏复杂畸形胎儿引产史的女性作为研究对象,采集其第2次引产儿的组织,提取基因组DNA进行全外显子组测序,对候选变异进行Sanger测序家系验证。结果:测序发现胎儿的 KDM6A基因存在c.1228_1229del(p.Gln410GlufsTer2)半合子移码终止变异,既往未见报道。根据美国医学遗传学与基因组学学会相关指南判断为可能致病(PVS1+PM2_Supporting)。该变异可导致歌舞伎综合征2型。孕妇及其母亲均携带相同的变异。孕妇身材矮小、眉毛外1/3稀疏,智力正常,存在女性生殖器官先天性发育异常(阴道不完全纵膈、双宫颈、双子宫和单侧卵巢缺失),其外祖母表型大部分相似。对胎儿的产前影像学表型进行描述,对孕妇持续随访,探讨其在社区随访实践中的疾病管理策略。 结论:KDM6A基因的c.1228_1229del(p.Gln410GlufsTer2)变异可能是导致胎儿膈疝伴心脏结构畸形的遗传学病因。歌舞伎综合征2型胎儿的超声表型以及携带者双子宫畸形既往报道很少。本研究丰富了上述表型谱,为临床诊断和遗传咨询提供了依据。
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编辑人员丨5天前
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JMJD3在新生儿坏死性小肠结肠炎肠道组织中的表达变化
编辑人员丨5天前
目的:探讨组蛋白去甲基化酶含Jumonji结构域的蛋白3(Jumonji domain-containing protein D3,JMJD3)在新生儿坏死性小肠结肠炎(necrotizing enterocolitis,NEC)肠道组织中的表达情况。方法:收集对照(先天性小肠闭锁)患儿及NEC患儿手术中切除的回肠组织进行RNA测序,筛选出差异基因。对差异基因进行组蛋白甲基化修饰酶相关基因聚类分析,筛选出目的基因赖氨酸特异性去甲基化酶6B[lysine(K)-specific demethylase 6B,KDM6B],并采用实时荧光定量聚合酶链反应扩大样本量进行验证。蛋白免疫印迹和免疫组织化学检测JMJD3以及其底物组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化(trimethylation of histone H3 at lysine 27,H3K27me3)在肠道组织中的蛋白表达情况。组间比较根据数据分布特点采用 t检验或Mann-Whitney U检验。 结果:RNA测序筛查出1 481条差异基因,其中643条基因上调,838条基因下调。筛查NEC肠道组织中30种组蛋白甲基化修饰酶的表达情况,其中KDM6B在NEC样本中差异表达最显著[Log 2(fold change)=0.769 104, P=0.009 009]。实时荧光定量聚合酶链反应结果显示,与对照组相比,KDM6B在NEC肠道组织中高表达( P<0.05);蛋白免疫印迹和免疫组织化学结果显示JMJD3蛋白水平在NEC肠道组织中明显增高,H3K27me3蛋白水平在NEC肠道组织中降低。 结论:在NEC肠道组织中组蛋白去甲基化酶JMJD3高表达,H3K27me3低表达。JMJD3可能通过降低H3K27me3的表达水平调控NEC的发生发展。
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编辑人员丨5天前
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组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A对结直肠癌进展的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨组蛋白赖氨酸去甲基化酶4A(KDM4A)在结直肠癌发生发展中的作用及可能的机制。方法:2019年1月至2019年6月,构建高(KDM4A)、低表达(ShKDM4A#1,ShKDM4A#2)KDM4A的结直肠癌细胞株(购自美国典型菌种保藏中心公司),同时设立对照组(NC,ShNC)。通过四甲基偶氮唑盐微量酶反应比色法(MTT)检测KDM4A对细胞增殖的影响。利用细胞侵袭小室法(Transwell)检测KDM4A对结直肠癌细胞迁移/侵袭能力的影响。通过蛋白质印迹法(Western blot)检测高、低表达KDM4A后细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)和基质金属蛋白酶-9(MMP-9)的表达。两组间统计学差异通过双尾 t检验进行分析。 结果:KDM4A高表达组与对照组比较,细胞增殖率明显提高[(50.233±3.430)%和(35.417±4.501)%, t=3.900、2.942, P<0.05]。低表达KDM4A与对照组比较,细胞增殖能力明显受抑制[(58.056±2.750)%和(57.386±8.228)%, t=4.558、4.419, P<0.05]。Transwell实验显示高表达KDM4A后穿孔细胞数[(304.000±62.466)个]比对照组[(64.000±20.833)个]增多( t=5.154, P<0.01);低表达KDM4A后穿孔细胞数[(47.333±13.573)个]较对照组[(93.667±18.874)个]减少( t=2.819, P<0.05)。KDM4A可以正向调节Cyclin D1和MMP-9的蛋白表达。 结论:KDM4A在结直肠肿瘤发生发展中起到重要作用,其机制可能是通过调节Cyclin D1和MMP-9的表达。
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编辑人员丨5天前
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X连锁智力障碍17个家系的临床特征及遗传学分析
编辑人员丨5天前
目的:对17个X连锁智力障碍(XLID)家系进行临床特征与遗传学病因分析。方法:回顾性纳入2021年5月至2023年5月因不明原因智力障碍就诊于河南省人民医院遗传疾病科,并经核心家系全外显子组测序(trio-WES)确定为X连锁智力障碍的家系。收集先证者及其家系成员的临床资料,对其进行家系全外显子组测序、Sanger测序、X染色体失活(XCI)等检测,并根据美国医学遗传学与基因组学学会相关指南和家系共分离分析判断变异的致病性。结果:17个家系的先证者男女比例为9∶8,年龄0.6 ~ 8岁,均表现为智力障碍和发育迟缓。共检测出14种变异,其中4种被评级为致病性( MECP2: c.502C>T、c.916C>T、c.806delG, IQSEC2:c.1417G>T),4种被评级为可能致病性( MECP2:c.1157_1197del、c.925C>T, KDM5C:c.2128A>T, SLC6A8:c.1631C>T),6种被评级为临床意义不明( KLHL15:c.26G>C, PAK3:c.970A>G、c.1520G>A, GRIA3:c.2153C>G, TAF1:c.2233T>G, HUWE1:c.10301T>A)。家系12、14、15经共分离分析,提示 PAK3:c.970A>G、 GRIA3:c.2153C>G、 TAF1:c.2233T>G可能为其遗传学病因。XCI实验提示家系13表达母源X染色体与表达父源X染色体的比值约为81∶19,为非随机失活, PAK3:c.1520G>A可考虑为该家系的致病原因。 结论:本研究通过trio-WES诊断了17个XLID家系的遗传学病因。Sanger测序和XCI技术能够为诊断XLID提供帮助。
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编辑人员丨5天前
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血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤75例基因突变特征分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(angioimmunoblastic T-cell lymphoma,AITL)的基因突变特征。方法:收集2021年6月至2023年6月经上海交通大学医学院附属瑞金医院病理科诊断为AITL,并用石蜡包埋组织或新鲜组织进行靶向测序检测的75例病例资料,分析AITL患者的突变基因分布和突变类型。结果:在75例AITL标本中均检测出基因突变,共检测到492个变异位点,分别位于84个基因列表中的74个基因。在≥10%的AITL病例中检测到的突变基因依次是TET2(89.3%)、RHOA(57.3%)、IDH2(37.3%)、DNMT3A(36.0%)、KMT2C(21.3%)、PLCG1(12.0%)和KDM6B(10.7%)。TET2和RHOA、TET2和IDH2、RHOA和IDH2基因突变之间均具有显著的共现关系( P<0.05),TET2和KDM6B基因突变之间具有显著的互斥关系( P<0.05)。 结论:应用二代测序技术可揭示AITL基因突变的独特特征,为AITL的诊断和靶向治疗提供参考依据。
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编辑人员丨5天前
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一例 KDM6A新发变异所致的Kabuki综合征2型伴继发性肺部感染患儿的治疗与基因分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨1例表现为反复感染、多发畸形以及异常面容的患儿的遗传学病因。方法:对患儿及其父母进行家系全外显子组测序。结果:患儿以"发热咳嗽"为代主诉就诊,具有睑裂细长、睫毛长等特殊面容。基因检测提示其 KDM6A基因发生非三联体缺失,既往未见报道。该变异可导致移码并提前终止转录,父母该位点为野生型。患儿因免疫低下导致严重的继发性肺炎,经抗感染及免疫球蛋白治疗后好转。 结论:结合实验室、影像学及基因检测结果,患儿最终被诊断为Kabuki综合征2型。Kabuki综合征相关的免疫缺陷可能导致常规抗感染治疗无效,值得临床关注。
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编辑人员丨5天前
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以低血糖为首发表现的新生儿歌舞伎综合征1例
编辑人员丨5天前
报告1例以低血糖为首发表现的新生儿歌舞伎综合征,主要表现为反复低血糖、特殊面容、喂养困难、智力低下,基因检测发现KDM6A基因杂合变异,变异位点为c.3492_3493delTG(缺失变异),诊断歌舞伎综合征Ⅱ型,随访至3岁时渐出现弓形眉、下眼睑外翻等典型面容。
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编辑人员丨5天前
