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ESR1和 PRKN基因甲基化在多囊卵巢综合征发病中的作用及机制研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨 ESR1和 PRKN基因甲基化水平与多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)发生的关系及其机制。 方法:采用病例对照研究,选取2021年1月至2021年6月期间在山西医科大学第一医院生殖医学科就诊的60例PCOS患者(PCOS组)及40例正常育龄妇女(对照组)为研究对象,提取全血DNA及总RNA,采用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific polymerase chain reaction,MS-PCR)技术检测研究对象外周血 ESR1和 PRKN基因启动子区的甲基化状态,并采用实时荧光定量PCR检测 ESR1和 PRKN基因mRNA表达水平,分析 ESR1和 PRKN基因启动子区甲基化状态和mRNA表达水平与PCOS发生的关系。 结果:PCOS组患者外周血 ESR1基因启动子区甲基化水平[56.7%(34/60)]显著低于对照组[77.5%(31/40), P=0.035]; PRKN基因启动子区甲基化水平[76.7%(46/60)]显著高于对照组[52.5%(21/40), P=0.012]。PCOS组患者外周血 ESR1 mRNA表达水平(1.30±0.93)显著高于对照组(0.97±0.50, P=0.034);PCOS组患者的 PRKN mRNA表达水平(1.06±0.83)与对照组相比差异无统计学意义(1.15±1.01, P>0.05)。 结论:PCOS患者 ESR1和 PRKN基因甲基化水平改变导致其表达水平改变,进而在PCOS的发生中发挥了重要作用。
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编辑人员丨1天前
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124例年龄≤60岁上尿路尿路上皮癌患者的胚系基因检测结果分析与解读
编辑人员丨1天前
目的:分析年龄≤60岁上尿路尿路上皮癌(UTUC)患者的胚系致病性突变,探讨胚系致病性突变携带者的临床病理特征。方法:回顾性分析复旦大学附属肿瘤医院2008年9月至2023年2月接受胚系基因检测的124例年龄≤60岁UTUC患者的临床资料。男86例,女38例;年龄55.0(49.8,58.0)岁;原发肿瘤位于肾盂81例(65.3%),位于输尿管34例(27.4%),二者兼有9例(7.3%)。低级别UTUC 13例(10.5%),原位癌8例(6.5%)。12例(9.7%)有膀胱癌病史,12例(9.7%)有其他恶性肿瘤病史。取患者外周血标本,行全基因组外显子测序或靶向测序寻找UTUC相关的胚系突变。按照美国医学遗传学与基因组学/美国分子病理学协会(ACMG/AMP) 2015版指南,对胚系基因检测数据进行解读,分析胚系致病性突变率,并探究胚系致病性突变携带者的临床病理特征。进一步与东亚健康人群的胚系致病性突变率比较,分析与UTUC致病风险相关的胚系突变。结果:本研究124例中,28例(22.6%)共检测到31个胚系致病性突变。有胚系致病性突变患者与无胚系致病性突变患者的年龄[54.0(47.0,58.0)岁与56.0(50.8,58.0)岁]、性别(男/女:21/7岁与65/31岁)、有膀胱癌病史(0与12/96)、T分期(T 3~4期:12/28与41/96)、组织学高级别比例(26/28与85/96)的差异均无统计学意义( P>0.05)。31个胚系致病性突变位于22个基因上,分别为BRCA2(4例,12.9%)、MSH2(3例,9.7%)、RAD54L(2例,6.5%)、BRCA1(2例,6.5%)、BRIP1(2例,6.5%)、NOTCH3(2例,6.5%)、XRCC2(1例,3.2%)、VEGFA(1例,3.2%)、TBX3(1例,3.2%)、RET(1例,3.2%)、PRKN(1例,3.2%)、PALB2(1例,3.2%)、NTRK1(1例,3.2%)、NCOA3(1例,3.2%)、MSH6(1例,3.2%)、LRP1B(1例,3.2%)、KMT2D(1例,3.2%)、KMT2A(1例,3.2%)、FANCA(1例,3.2%)、BARD1(1例,3.2%)、ARID1A(1例,3.2%)和AR(1例,3.2%)基因。对124例患者的胚系致病性突变率与东亚健康人群的胚系致病性突变率进行比较,结果显示BRCA2 ( OR=11.9, 95% CI 3.8 ~37.7, P<0.001)、MSH2( OR=11.9, 95% CI 3.2~44.5, P<0.001)、RAD54L( OR=14.2, 95% CI 2.7~73.8, P=0.002)和BRCA1 ( OR=11.8, 95% CI 2.4~59.1, P=0.003)基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。 结论:本研究年龄≤60岁UTUC患者的胚系致病性突变率为22.6%,携带BRCA2、MSH2、RAD54L或BRCA1基因的胚系致病性突变可显著增加UTUC的发病风险。
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编辑人员丨1天前
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PRKN基因突变引起青少年型帕金森综合征一例报道并文献复习
编辑人员丨1天前
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编辑人员丨1天前
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东南景天提取物减缓人小肠上皮细胞HIEC-6辐射损伤机制的初步研究
编辑人员丨1天前
目的:初步确定东南景天提取物(SafE)缓解人小肠上皮细胞HIEC-6辐射损伤的机制。方法:将HIEC-6细胞分为对照组(Con)、照射组(IR)、单独提取物组(SafE)、提取物照射组(SafE+IR)。SafE组使用0.02 g/ml(W/V)SafE处理24 h后,给予2、4、6 Gy γ射线照射,照后24 h检测细胞活力(CCK-8法)和细胞内活性氧(ROS)水平;4 Gy照后24 h取样进行转录组分析,检测细胞内E3泛素连接酶PRKN表达水平,使用荧光染料观察内质网,并统计内质网厚度。结果:与IR组相比,SafE+IR组照射后细胞活力值显著增加( t=2.94~10.40, P<0.05);与对照组相比,SafE+IR组照射后胞内ROS水平显著降低( t=-13.29~-4.53, P<0.05)。初步筛选出SafE靶基因为PRKN;SafE可维持照射后PRKN转录水平和内质网厚度,IR组与对照组比较,差异有统计学意义( t=-5.55、3.27, P<0.05);SafE组与SafE+IR组比较,差异无统计学意义( P>0.05)。 结论:SafE可有效维持内质网厚度,减少细胞辐射损伤,其靶基因PRKN受电离辐射调控。
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编辑人员丨1天前
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PRKN基因合并APOB基因突变的早发型帕金森病1例
编辑人员丨1个月前
帕金森病的发病率位居神经系统退行性疾病的第二,仅次于阿尔茨海默病.早发型帕金森病(early-onset Parkinson's disease,EOPD)指50岁前出现首发症状的帕金森病.EOPD与基因突变有一定的关系,并有独特的临床特征.本文报告1例PRKN基因合并APOB基因突变的EOPD,该患者于28岁时出现行走不稳的首发症状,后续出现动作迟缓、四肢震颤等症状.体格检查示:面具脸,慌张步态,双上肢肌张力齿轮样增高.总胆固醇6.48 mmol/L,低密度脂蛋白胆固醇4.13 mmol/L.PRKN基因外显子5缺失,外显子7点突变[c.850G>C(p.Gly284Arg)];APOB基因外显子26点突变[c.10579C>T(p.Arg3527Trp)].根据上述临床表现及检查结果,该患者被诊断为EOPD.PRKN基因的复合杂合突变及PRKN基因合并APOB基因突变均为首次报道,这丰富了EOPD的基因突变类型谱.
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编辑人员丨1个月前
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PRKN基因复合杂合突变致青少年型帕金森病1例报告及文献复习
编辑人员丨2024/3/16
目的:对1例青少年型帕金森病(JP)患者家系进行基因分析,探讨PRKN基因复合杂合突变所致JP患者临床表现、基因突变特点和诊治方案,以提高临床医生对该病的认识.方法:分析1例PRKN基因突变所致JP患者临床资料,对其临床表现和基因突变特点进行总结,并结合相关文献进行复习.结果:患者,男性,16岁,因行走不稳、四肢抖动伴双下肢僵硬3年入院.查体,慌张步态,神志清楚,言语流利,四肢肌力正常,双上肢呈"齿轮样"肌张力增高,双下肢呈"铅管样"强直,感觉功能正常,腱反射正常.头部、颈部和胸部磁共振成像(MRI)未见异常.18F脱氧葡萄糖(18F-FDG)正电子发射断层显像/计算机断层扫描(PET/CT)显示头部大小和形态正常,左小脑和颞中回的葡萄糖代谢减少,双侧丘脑、右额叶、顶颞叶和左内侧额叶糖代谢略有增加.多巴胺转运体(DAT)PET/CT显示脑皮质中无放射性分布,两侧壳核后部DAT分布不均匀减低.全外显子组基因检测,患者PRKN基因存在2处基因突变,为密码子c.8T>A/c.850G>C复合杂合突变,2处突变分别来自父母,父亲携带c.8T>A基因突变,母亲携带c.850G>C基因突变,患者姐姐基因突变位点与父亲相同.结论:PRKN基因复合杂合突变可能是该家系疾病的基础.基因突变c.8T>A的鉴定扩大了PRKN基因的突变谱,为研究JP患者致病性基因突变提供了有效信息.
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编辑人员丨2024/3/16
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pink1-prkn PARK2通路与线粒体自噬和肝脏急性缺血再灌注损伤的关联研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨pink1-prkn PARK2通路与线粒体自噬和肝脏急性缺血再灌注损伤的关联.方法 选择C57BL/6小鼠,将Pink1-KO小鼠与Park2-KO小鼠杂交以产生Pink1Park2 double-KO小鼠,制作肝脏急性缺血再灌注损伤模型.取肝脏组织行SP3的免疫组织化学染色.用质粒DNA或RNAi瞬时转染HK-2细胞;HK-2细胞在含20 mM CCCP的无糖RKRB缓冲液诱导ATP耗竭,模拟再灌注;进行细胞凋亡分析;分离线粒体,测量线粒体DNA(mtDNA)的相对含量;测量HK-2细胞中的线粒体ROS;免疫印迹测定蛋白质浓度.结果 缺血性急性肝脏损伤体外和体内模型的肝脏近端肝脏细胞中可诱导线粒体自噬.Pink1和Park2的缺失可消除这种条件下的线粒体自噬,证明PINK1-PARK2途径在肝脏细胞线粒体自噬中的关键作用.pink1和park2单基因或双基因敲除的小鼠中,缺血性急性肝脏损伤均加剧.Pink1和Park2缺失会增加线粒体损伤,活性氧产生和炎症反应.结论 PINK1-PARK2介导的线粒体自噬对急性肝脏损伤期间的线粒体质量控制,肝脏细胞存活和肝脏功能起重要作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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阿尔茨海默症潜在风险基因的预测
编辑人员丨2023/8/6
目的 运用生物信息学方法揭示阿尔茨海默症(AD)的生物学过程和通路,预测疾病潜在风险基因.方法 首先对收集的 AD易感基因进行基因本体论分析和通路富集分析发掘易感基因涉及的生物学过程和通路,并且提取关键的通路串话聚类模块;应用施泰纳最小树算法构建 AD特异性蛋白质子网络,预测潜在风险基因.结果 研究得到 587个AD易感基因.进行GO和通路富集分析得到参与 AD的显著性生物学过程和 48条关键通路.通过分析特异性子网络,预测出 5个潜在风险基因: HSP90AB1 、PRKACA 、GRB2 、PPP1CA和 PRKN.结论 AD的发生可能是不同系统的通路共同异常所导致,免疫系统在其中发挥较为重要的作用;预测得到 5个AD潜在易感基因.
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编辑人员丨2023/8/6
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Oxidative stress factors in Parkinson's disease
编辑人员丨2023/8/5
Parkinson's disease (PD) is the second most common cause of neurodegeneration. Over the last two decades, various hypotheses have been proposed to explain the etiology of PD. Among these is the oxidant-antioxidant theory, which asserts that local and systemic oxidative damage triggered by reactive oxygen species and other free radicals may promote dopaminergic neuron degeneration. Excessive reactive oxygen species formation, one of the underlying causes of pathology in the course of PD has been evidenced by various studies showing that oxidized macromolecules including lipids, proteins, and nucleic acids accumulate in brain tissues of PD patients. DNA oxidation may produce various lesions in the course of PD. Mutations incurred as a result of DNA oxidation may further enhance reactive oxygen species production in the brains of PD patients, exacerbating neuronal loss due to defects in the mitochondrial electron transport chain, antioxidant depletion, and exposure to toxic oxidized dopamine. The protein products of SNCA, PRKN, PINK1, DJ1, and LRRK2 genes are associated with disrupted oxidoreductive homeostasis in PD. SNCA is the first gene linked with familial PD and is currently known to be affected by six mutations correlated with the disorder: A53T, A30P, E46K, G51D, H50Q and A53E. PRKN encodes Parkin, an E3 ubiquitin ligase which mediates the proteasome degradation of redundant and disordered proteins such as glycosylated α-synuclein. Over 100 mutations have been found among the 12 exons of PRKN. PINK1, a mitochondrial kinase highly expressed in the brain, may undergo loss of function mutations which constitute approximately 1–8% of early onset PD cases. More than 50 PD-promoting mutations have been found in PINK1. Mutations in DJ-1, a neuroprotective protein, are a rare cause of early onset PD and constitute only 1% of cases. Around 20 mutations have been found in DJ1 among PD patients thus far. Mutations in the LRRK2 gene are the most common known cause of familial autosomal dominant PD and sporadic PD. Treatment of PD patients, especially in the advanced stages of the disease, is very difficult. The first step in managing progressive PD is to optimize dopaminergic therapy by increasing the doses of dopamine agonists and L-dopa. The next step is the introduction of advanced therapies, such as deep brain stimulation. Genetic factors may influence the response to L-dopa and deep brain stimulation therapy and the regulation of oxidative stress. Consequently, research into minimally invasive surgical interventions, as well as therapies that target the underlying etiology of PD is warranted.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于TCGA数据库的肝细胞癌自噬相关基因预后风险模型的建立
编辑人员丨2023/8/5
目的 基于自噬相关基因(ATGs)构建肝细胞癌病人预后风险模型.方法 TCGA数据库下载374例肝细胞癌及50例正常肝组织的转录组数据和临床信息,首先筛选出差异表达基因(DEGs),然后从中筛选出差异表达的ATGs(DEATGs),最终利用单因素Cox回归分析、LASSO回归分析以及多因素Cox回归分析构建预后风险模型,并应用ROC曲线评估模型对于肝细胞癌病人预后的预测能力.结果 肝细胞癌组织与正常肝组织筛选得到12471个DEGs,其中包含62个DEATGs.单因素Cox回归分析得到40个预后相关DEATGs,LASSO回归分析以及多因素Cox回归分析得到7个风险自噬基因(RAB7A、FOS、ATG9A、HSPA8、PRKN、TUSC1和GAPDH)用于构建预后风险模型.Kaplan-Meier分析显示,高风险组病人的总体生存期显著低于低风险组(χ2=36.972,P<0.05).多因素Cox回归分析表明,预后风险模型可以作为一个独立预后因素(HR=2.574,P<0.01).结论 基于ATGs构建的预后风险模型是一个独立的预后因素,可有效预测肝细胞癌病人的预后.
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编辑人员丨2023/8/5
