目的:分析SSc合并心脏受累的临床特点及预测因素。方法:收集2016年1月至2021年12月宁波市医疗中心李惠利医院明确诊断的SSc患者临床资料，根据是否合并心脏受累分为阳性组和阴性组，8名健康对照组来自体检中心。采用 t检验、秩和检验或 χ2检验比较2组患者及健康对照组的临床特征，Logistic回归及ROC曲线分析SSc合并心脏受累的危险因素。同时利用转录组测序分析2组患者及健康对照组差异基因表达。 结果:①共纳入75例SSc患者，剔除其中6例重叠综合征和1例合并先天性心脏病患者，分析68例患者临床资料发现：合并心脏受累者（阳性组）16例（23.5%），未合并心脏受累者（阴性组）52例（76.5%），16例心脏受累患者中出现心电图异常12例（75.0%），心脏瓣膜病变9例（56.2%），心脏结构异常8例（50.0%），生物标志物升高10例（83.3%），心包积液8例（50.0%）。②2组相比，阳性组病程更长[120（11.2，132）个月与48（24，90）个月， Z=-2.08， P=0.037）]，阳性组肺动脉高压（PAH）（50.0%与11.5%， χ2=11.07， P<0.001）和肾功能不全（50.0%与3.8%， χ2=20.78， P<0.001）的发生率明显高于阴性组。进一步Logistic多因素回归分析证明，长病程[ OR值（95% CI）=1.011（1.001，1.021）， P=0.031]、PAH[ OR值（95% CI）=5.431（1.065，27.710）， P=0.042]、肾功能不全[ OR值（95% CI）=30.444（4.139，223.938）， P<0.001]是SSc合并心脏受累的独立危险因素。③68例SSc患者中共63例完成了甲襞微循环（NVC）检查，发现2组异常NVC改变差异具有统计学意义（93.3%与58.3%， χ2=5.87， P=0.013）；阳性组毛细血管总数明显少于阴性组[3.5（2，4.8）与6（5，7）， Z=-2.97， P=0.003]；进一步行ROC曲线分析得出，毛细血管总数<4.5预测心脏受累的发生（灵敏度为80.0%，特异度83.8%），ROC曲线下面积95% CI为0.805（0.061，1.000）， P=0.003。④共11例SSc患者（阳性组6例，阴性组5例）和8名健康对照组行转录组测序，最后筛选得到同步下调基因TNFRSF13B，3组间差异有统计学意义（ χ2=11.88， P=0.003），且在阳性组与健康对照组比较差异有统计学意义（ χ2=11.19， P=0.004）。 结论:SSc伴随PAH和肾功能不全的长病程患者易合并心脏受累，早期行毛细血管镜检查有助于预测SSc患者发生心脏疾病的风险，而TNFRSF13B基因检测在SSc及其心脏受累中具有一定的价值及研究前景。

目的:探讨与多发性骨髓瘤（MM）患者长生存相关的骨髓免疫微环境特征。方法:在中山大学附属第一医院明确诊断为新诊断MM并接受新药诱导续贯自体造血干细胞移植以及免疫调节剂维持治疗的随访队列中，在2019年8月至2020年5月横断面研究期间，通过高通量NanoString技术比较16例无进展生存≥5年患者［长生存组，其中微小残留病（MRD）持续阴性亚组9例、MRD持续阳性亚组7例］与5例疾病进展患者（疾病进展组）骨髓中免疫细胞亚群及770个与免疫相关标志物的RNA表达。通过细胞特征性基因表达水平综合计算各免疫细胞功能分值，从而间接得出各免疫细胞亚群比例。统计学分析主要采用Mann-Whitney U检验、Kruskal Wallis秩和检验。 结果:（1）长生存组患者骨髓中中性粒细胞比例较疾病进展组显著增加［功能分值：13.61（13.33，14.25）比12.93（12.58，13.38）； Z=2.31， P=0.021］；与MRD持续阴性长生存亚组相比，MRD持续阳性长生存亚组患者骨髓肥大细胞显著增多［功能分值：7.09（6.49，8.57）比6.03（5.18，6.69）； H=2.18， P=0.029］。（2）相比疾病进展组，长生存组显著上调基因4个（CTSG、IFIT2、S100B、CHIT1），显著下调基因6个（C4B、TNFRSF17、CD70、IRF4、C2、GAGE1）；相比MRD持续阴性长生存亚组，MRD持续阳性长生存亚组显著上调基因CMA1，下调基因10个（ISG15、OAS3、MX1、IFIT2、DDX58、SIGLEC1、CXCL10、IL1RN、SERPING及TNFSF10），其中前5个基因均为干扰素反应通路相关基因。 结论:骨髓中性粒细胞增多、肥大细胞增多可能与移植后MM患者长生存相关。干扰素反应通路激活可能是MRD持续阴性长生存MM患者骨髓免疫微环境的特征之一。

目的:探讨铁死亡相关的长链非编码RNA（lncRNA）特征预测食管癌预后的价值。方法:基于肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库铁死亡相关差异表达lncRNA构建食管癌预测模型。结果:确定了17种与食管癌预后相关的不同表达的lncRNAs（AC108673.2、LINC00942、CASC8、AP003696.1、LINC02154、AC092969.1、AC245100.5、AC011379.1、TMEM161B-AS1、LINC00092、LINC01977、AC107308.1、LINC00261、LINC00592、AP000553.2、HOXC-AS1、Z93403.1）。Kaplan-Meier分析显示高风险组与食管癌预后不良相关（ P<0.01）。预测模型的曲线下面积在1年时为0.861，2年时为0.828，3年时为0.764；同时发现预测模型在预测食管癌预后方面优于传统的临床病理学特征。高、低风险组在肥大细胞表达存在差异；同时发现在TNFSF9、CD70、TNFRSF25等免疫检查点表达也存在显著差异。 结论:铁死亡相关的lncRNAs特征可以预测食管癌的预后并提供治疗靶点。

患者，男，57岁，因"发现全身多处淋巴结肿大半年余，乏力消瘦2个月余"于2022年6月21日入院。患者半年余前无明显诱因出现发热，体温最高达39 ℃，伴咽痛，伴颈部、腋下、腹股沟多发淋巴结肿大，无压痛，自行服用药物后可退热，反复发热3 d就诊于当地医院，查血常规：WBC 7.7×10 9/L，HGB 123 g/L，PLT 165×10 9/L；EB病毒（EBV）DNA：2.77×10 3/L；浅表淋巴结超声：双侧颈部、腹股沟多发淋巴结肿大；PET-CT：横膈上下多发肿大淋巴结，氟代脱氧葡萄糖（FDG）代谢增高（SUVmax＝15.79）；脾大（SUVmax＝4.08）。患者2021年12月2日于外院行左侧锁骨上淋巴结切检，病理会诊符合EBV相关性淋巴组织增生性病变，建议密切随访观察，观察期间出现双腿一过性片状红斑及瘙痒。2022年3月7日复查血常规：WBC 5.7×10 9/L，HGB 130 g/L，PLT 113×10 9/L，外周血涂片可见2%异型淋巴细胞，外院予干扰素α2a 135 μg皮下注射2次，后逐渐出现乏力、纳差、发热、周身水肿，伴双下肢一过性皮疹，伴恶心、呕吐，伴尿量减少，乏力呈进行性加重，2022年4月急查血肌酐1 030.4 μmol/L；24 h尿蛋白2.86 g；血、尿免疫固定电泳κ轻链阳性；骨髓涂片可见42%浆细胞，以淋巴样浆细胞为主；骨髓流式细胞术：可见异常B细胞6.953%，异常浆细胞11.535%；骨髓病理：造血组织增生尚活跃（35%），浆细胞片状分布，考虑浆细胞增生性病变。为明确病因行肾穿刺活检：肾活检组织改变以急性重度肾小管损伤为主，同时存在间质弥漫浸润细胞，肾小球病变较轻，经免疫电镜检查证实存在轻链近端肾小管病（LCPT），但不能排除其他因素（如药物）引起急性肾小管损伤可能。综合考虑为急性肾衰竭，行血液透析数次、甲泼尼龙治疗后肌酐逐渐降至300 μmol/L，尿量逐渐恢复。2022年4月为明确诊断再次行左侧颈深淋巴结切除术，病理会诊考虑符合浆细胞肿瘤；淋巴结流式细胞术：异常浆细胞占19.0%。复查骨髓穿刺：淋巴样浆细胞28%，易见异常淋巴浆细胞。B细胞淋巴瘤基因突变提示：TNFRSF14突变41.5%，该基因突变可能常见于滤泡性淋巴瘤；MYD88（-）。2022年5月复查PET-CT：横膈上下多发肿大淋巴结，部分融合，较前大致相似（SUVmax＝10.82）；脾大，FDG代谢增高（SUVmax＝4.32）；全身骨髓FDG代谢弥漫性增高；考虑浆细胞性淋巴瘤浸润所致。两肺多发多形性病变，FDG代谢未见增高，考虑淋巴瘤浸润可能性大。外院考虑淋巴瘤，暂予对症支持治疗，患者乏力、纳差无明显缓解，为进一步诊治就诊于中国医学科学院血液病医院。患者自发病以来，精神欠佳，食欲明显减退，睡眠可，大小便正常，体重下降12 kg，2013年因胃恶性肿瘤行胃切除术。

目的:揭示黑素瘤中可能与泛素结合酶2S（UBE2S）存在相互作用的基因，探讨UBE2S参与调控黑素瘤细胞生物学行为的分子机制。方法:将A375黑素瘤细胞分为基因敲降组和阴性对照组，分别用含LV-UBE2S-RNAi（14011-1）的慢病毒和CON053慢病毒转染细胞构建UBE2S敲降细胞株和阴性对照细胞株。提取两组细胞株RNA，并将其纯化及片段化，与芯片探针杂交洗染获取芯片数据。采用Ingenuity路径分析软件对获得的差异表达基因的芯片数据进行进一步解析，鉴定可能与UBE2S存在相互作用的基因，应用免疫印迹法对UBE2S调控的下游分子进行验证。采用双尾 t检验筛选差异基因。 结果:在基因敲降组与阴性对照组之间共筛选出差异倍数绝对值> 2且 P < 0.05的差异基因512个，其中上调基因247个，下调基因265个。差异基因信息的Ingenuity路径分析结果证实，干扰素信号和肝X受体/视网膜X受体活化通路显著激活，真核起始因子2和核因子κB信号通路则被抑制。预测上游调控因子中IFNA2为强烈激活，核因子κB（复合物）被抑制。综合以上生物信息学分析结果，推测黑素瘤细胞UBE2S基因可通过调节IFITM1、STAT1、ISG15和TNFRSF11B基因的表达发挥功能。免疫印迹显示，A375细胞UBE2S基因敲降前后，IFITM1蛋白均未表达，敲降后ISG15蛋白表达上调19.94倍，STAT1蛋白表达上调1.47倍，TNFRSF11B蛋白表达下调79.1%。 结论:UBE2S可能通过与STAT1、ISG15和TNFRSF11B的相互作用，共同调控黑素瘤肿瘤细胞生物学行为。

目的 探讨IL-1β表达与食管癌患者细胞免疫水平的相关性.方法 收集38例食管癌患者外周血标本,流式细胞仪检测血清中IL-1β的水平及CD4+T/CD8+T细胞比值;收集8例PD-1免疫治疗前后食管癌患者外周血标本,采用酶联免疫吸附法检测血清中IL-1β的水平;利用TIMER数据库分析IL-1β表达与免疫细胞浸润及关键调控基因的关系.结果 外周血中IL-1β的水平和CD4+T/CD8+T细胞比值呈负相关(P=0.047);血清中IL-1β的水平在PD-1单抗免疫治疗后显著下降(P=0.038);食管癌组织中IL-1β的表达与巨噬细胞浸润呈负相关(P=0.00241),与中性粒细胞浸润呈正相关(P=0.00324);食管癌组织中IL-1β表达与B2M(P=0.0128)和PD-L1(P=0.00174)的表达呈正相关,与TNFRSF13C的表达呈负相关(P=0.0094).结论 IL-1β的表达与食管癌患者细胞免疫水平呈负相关,其机制与抑制免疫细胞浸润有关.

目的 通过生物信息学方法及实验验证探索抗中性粒细胞胞质抗体(ANCA)相关性血管炎炎症应答候选基因及潜在的分子机制,为治疗ANCA相关性血管炎潜在炎症靶标提供科学的理论依据.方法 从 GEO数据库检索获得GSE108109 芯片数据,利用R语言相关程序包处理、分析并筛选出差异基因.利用DAVID在线网站进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)富集分析,并通过STRING网站构建炎症候选基因编码蛋白的相互作用网络.进一步通过miRWalk和DIANA-LncBase 数据库预测并构建内源性竞争性RNA(ceRNA)调控网络,并从网络中筛选出关键基因绘制ROC曲线.纳入西南医科大学附属医院确诊并经肾穿刺活检证实的ANCA相关性血管炎患者肾组织标本进行验证,以非ANCA相关性血管炎患者肾组织标本(IgA肾病、微小病变型肾病)为对照组.对收集到的肾组织标本进行免疫组化染色,并通过免疫组化染色半定量分析计算平均光密度,进一步验证生信分析筛选出的关键基因的表达情况,同时将关键基因的平均光密度值与炎症指标进行Pear-son线性相关性分析.结果 共筛选出差异表达基因 846个,其中 444 个基因表达明显上调,402 个基因表达明显下调.通过KEGG和GO富集分析获得了与炎症调控相关的重要差异表达基因,其中CSF1R和TNFRSF1B为首次在AN-CA相关性血管炎中报道的差异基因.同时构建了包括KC-NQ1OT1-hsa-miR-125a-5p-TNFRSF1B在内的多条内源性竞争RNA(ceRNA)调控轴.收集到ANCA相关性血管炎标本15 例,IgA肾病标本 6 例,微小病变型肾标本 3 例.肾穿组织标本的免疫组化结果提示CSF1R、TNFRSF1B在ANCA相关性血管炎肾组织表达较对照组均有升高,对ANCA组患者临床数据做Pearson相关性分析,得出CSF1R的表达量与中性粒细胞计数含量呈正相关(r=0.587),TNFRSF1B的表达量和血清C反应蛋白含量呈正相关(r=0.646).结论 通过生物信息学的方法筛选出CSF1R和TNFRSF1B等参与炎症调节的关键基因,构建了严密的ceRNA调控网络,并通过免疫组化验证了CSF1R和TNFRSF1B在ANCA血管炎中的表达较对照组升高.为深入探究ANCA相关性血管炎发生发展的炎症分子机制及发掘新的炎症治疗靶点提供科学的理论依据.

目的 研究玄参干预对大鼠基因表达谱的影响,探讨玄参干预对大鼠的潜在保护和毒性作用及其机制.方法 将20只雄性SD(Sprague-Dawley)大鼠随机分为玄参组和空白组,每组10只.玄参组大鼠给予玄参提取物1350 mg· kg-1灌胃,空白组灌胃给予等容积0.9％氯化钠溶液,均为1次/d,连续15 d.分别于灌胃15 d后,检测肝脏组织的基因表达谱,通过时间序列趋势分析软件(Short Time-Series Expression Miner,STEM)筛选具有趋势表达的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能注释和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析.结果 玄参组筛选76个DEGs,其中28个上调,48个下调,与对照组相比,差异均具有统计学意义(P＜0.05).KEGG通路分析结果显示,丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、无翅型小鼠乳腺肿瘤病毒整合位点(Wingless-Type MMTV Integration Site Family,Wnt)、转化生长因子-β(Transforming growth factor-β,TGF-β)、非受体酪氨酸激酶家族-信号转导子和转录激活子(Janus Kinase-Signal Transducer and Ac-tivator of Transcription,Jak-STAT)、核因子激活的 B 细胞的 κ-轻链增强(nuclear factor kappa-B,NF-κB)、Toll 样受体(Toll-like receptor)、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR)、催产 素(Oxyto-cin)、神经生长因子受体(TNFRSF16)相关蛋白 1[nerve growth factor receptor(TNFRSF16)associatedprotein 1,Ngfrap1]和神经营养因子受体相关死亡结构域(neurotrophin receptor associated death domain,Neurotrophin)这9条信号通路,包含Mecom、Amhr2、Pias2、Ticam2、Cyp7a1、Ngfrap1和Nfatc4这7个靶基因.经查阅文献,Mecom可能为表征玄参对大鼠潜在保护作用的靶基因,而另外6种则可能为表征玄参对大鼠潜在毒性作用的靶基因.结论 玄参作用的两重性,既可对机体产生预防和治疗作用,也会产生潜在的不良反应.

目的:探索冠心病疾病进展相关基因,并预测冠心Ⅱ号方防治冠心病的作用靶点.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载急性心肌梗死(AMI)与稳定型冠心病(SCAD)病人转录组表达谱,通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选冠心病疾病进展相关基因,并针对冠心病进展相关基因进行基因本体(GO)功能分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库下载冠心Ⅱ号方的有效成分及药效靶点,与冠心病疾病进展相关基因进行交集分析,获得冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在靶点.结果:通过差异表达分析比较 AMI和 SCAD转录组表达谱,共获得 166 个差异表达基因(DEGs).通过 WGCNA获得与 AMI相关的基因模块 Black.取 DEGs与 Black模块的交集,获得 64个冠心病疾病进展相关基因.从 TCMSP数据库共获得 224个冠心Ⅱ号方的药效靶点,将药效靶点与冠心病疾病进展相关基因取交集,得到冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在作用靶点,即过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、单核细胞分化抗原CD14(CD14)和细胞色素P4501b1(CYP1B1).结论:细胞因子信号转导抑制因子 3(SOCS3)、嗜酸性粒细胞阳离子相关蛋白(ECRP)、肿瘤坏死因子受体超家族成员10D(TNFRSF10D)、S100钙结蛋白 A9(S100A9)等 64个基因可能与冠心病疾病进展相关,其中,PPARG、CD14、CYP1B1 是冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在作用靶点.

目的 探讨基因组合表达模型作为辐射生物剂量计的可行性.方法 0～8 Gy 60C0 γ射线照射正常人外周血,利用实时荧光定量PCR检测10个辐射敏感基因表达变化,应用逐步回归方法建立基因组合表达模型;双盲法验证模型估算剂量的准确性.结果 照后6和12 h,10个辐射敏感基因的表达水平随受照剂量的增加而增加,均呈现良好的剂量-效应关系(R2=0.61～0.97,P＜0.05);TNFSF4、PHPT1和FDXR基因相对表达量存在较大的个体间差异;照后6h,PCNA、CCNG1、TNFSF4、PHPT1、GADD45A和FDXR建立的基因组合表达模型R2为0.88(F =54.8,P＜0.001);照后12 h,PCNA、CCNG1、TNFSF4、MDM2、GDF15和TNFRSF10B建立的基因组合表达模型R2为0.82(F =42.767,P＜0.001);各时间点基因组合表达模型估算的受照剂量均接近于真实照射剂量.结论 基因组合表达模型具备作为辐射生物剂量计的基本条件.