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血清lncRNAs ABHD11-AS1、miR-1231表达与胃癌根治术后复发转移及远期预后的相关性
编辑人员丨5天前
目的 探究血清长链非编码RNA a/β水解酶域11反义RNA1(lncRNAs ABHD11-AS1)、微小RNA-1231(miR-1231)表达与胃癌根治术后复发转移及远期预后的相关性.方法 选取2018年7月至2020年7月进行胃癌根治术治疗的147例患者(胃癌组),根据复发转移情况,将患者分为复发转移组48例和未复发转移组99例,根据3年预后情况,分为生存组40例和死亡组107例,选取同期体检的健康人员132例作为对照组,采用实时荧光定量PCR 法测定血清 1 ncRNAs ABHD11-AS1、miR-1231 表达水平,采用 Pearson 法分析血清 lncRNAs ABHDl1-AS1、miR-1231的相关性,采用Logistic回归分析影响胃癌根治术后复发转移的因素.结果 与对照组比较,胃癌组lncRNAs ABHD11-AS1表达水平显著升高(P<0.05),miR-1231表达水平显著降低(P<0.05).血清1 ncRNAs ABHD11-AS1和miR-1231表达呈负相关(r=-0.691,P<0.05).复发转移组肿瘤直径>5 cm、TNM分期Ⅲ+Ⅳ期、分化程度低分化、浸润深度T3+T4、有淋巴结转移的患者比例及lncRNAs ABHD11-AS1表达水平显著高于未复发转移组(P<0.05),miR-1231 表达水平显著低于未复发转移患者,差异有统计学意义(P<0.05).肿瘤直径、浸润深度、lncRNAs ABHD11-AS1是胃癌根治术后复发转移的独立危险因素,miR-1231是保护因素(P<0.05).死亡组lncRNAs ABHD11-AS1表达水平显著高于生存组(P<0.05),miR-1231水平显著低于生存组(P<0.05).结论 胃癌患者血清中lncRNAs ABHD11-AS1表达水平升高,miR-1231表达水平降低,与胃癌根治术后复发转移及远期预后密切相关,可能作为胃癌根治术后复发转移及远期预后的标志物.
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编辑人员丨5天前
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微小RNA-34a和微小RNA-204可有效用于早期诊断胰腺导管上皮内瘤变的实验研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨微小RNA(microRNA,miRNA)-34a和miRNA-204的异常表达是否能用于区别慢性胰腺炎(CP)与胰腺导管上皮内瘤变(PanINs)。方法:用部分结扎大鼠胆胰管和置入7,12-二甲基苯并蒽(DMBA)的方法建立SD大鼠(华中科技大学实验动物中心提供)CP-胰腺癌模型,获得16个CP标本和26个PanINs标本。然后用实时定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测4种与胰腺癌相关的miRNAs(miR-34a、miR-204、miR-107和miR-21)在这些标本中的表达。两组之间的差异用方差分析、Kruskal-Wallis检验或Student’s t检验进行统计学分析。 结果:miR-34a在PanIN-1(1.81±0.12比1.00±0.08, t=2.032, P<0.05)、PanIN-2(1.72±0.11比1.00±0.08, t=1.332, P<0.05)和PanIN-3(2.62±0.14比1.00±0.08, t=4.135, P<0.05)标本中的表达显著高于CP组,差异有统计学意义。miR-204在PanIN-2(0.59±0.08比1.00±0.12, t=5.037, P<0.05)和PanIN-3(0.51±0.07比1.00±0.12, t=5.385, P<0.05)标本中的表达显著低于CP组,差异有统计学意义。miR-21只在PanIN-3(2.23±0.21比1.00±0.12, t=4.485, P<0.05)标本中表达显著高于CP组,差异有统计学意义。 结论:miR-34a和miR-204在CP发展到胰腺癌的过程中表达异常,可用于区别CP与PanINs。
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编辑人员丨5天前
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EXODUS系统联合变构DNA纳米开关在帕金森病患者血浆外泌体miR-107检测中的应用
编辑人员丨5天前
探索帕金森病患者血浆外泌体miR-107快速检测方法。采用病例对照设计,收集华中科技大学同济医学院附属同济医院检验科2023年12月至2024年1月帕金森病患者组和健康对照组血浆标本各10例。EXODUS系统分离血浆外泌体,纳米颗粒跟踪分析技术和透射电镜鉴定外泌体粒径和形态,Qiagen miRNeasy Micro Kit提取外泌体RNA,变构DNA纳米开关miRacles检测miR-107,琼脂糖凝胶电泳分析miR-107含量。采用Thermo Fisher RevertAid RT Reverse Transcription Kit对外泌体RNA进行逆转录,实时定量PCR检测miR-107。组间比较采用独立样本 t检验。EXODUS系统1.5 h完成500 μl血浆外泌体的分离,外泌体浓度健康对照组为(4.82±2.02)×10 10 个/ml,帕金森病患者组为(5.08±2.34)×10 10 个/ml,两组间差异无统计学意义( t=-0.168, P=0.872),透射电镜证实外泌体形态。变构DNA纳米开关miRacles能检测fM级miR-107,可有效区分miR-107及其家族成员miR-15a和miR-16。琼脂糖凝胶电泳显示,灰度值相对含量健康对照组为(1.00±0.26),帕金森病患者组为(1.86±0.21),帕金森病患者组miR-107显著高于健康对照( t=-8.143, P<0.001),与逆转录实时定量PCR结果类似。EXODUS系统联合变构DNA纳米开关miRacles能实现帕金森病患者血浆外泌体miR-107快速、非酶促、廉价的检测。
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编辑人员丨5天前
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P物质活化NK92-MI细胞脱颗粒及差异circRNA表达的研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨神经肽P物质(substance P,SP)活化NK92-MI细胞脱颗粒作用,分析差异表达circRNA调控NK92-MI细胞可能的机制。方法:将培养后的NK92-MI细胞分为空白对照组、SP刺激组和NK-1受体拮抗剂(neurokinin-1 receptor antagonist,NK-1RA)组。荧光定量PCR(real-time quantification PCR,qRT-PCR)法检测并分析NK92-MI细胞经SP刺激后穿孔素mRNA表达的时间效应,流式细胞术检测NK92-MI细胞脱颗粒标志物CD107a的表达,高通量测序技术分析circRNA表达谱,qRT-PCR法验证差异倍数最大的circZNF609和circAMBRA1的表达。生物信息学分析circZNF609、circAMBRA1与穿孔素相关的微小RNA(microRNA,miRNA),并分析circZNF609、circAMBRA1与穿孔素mRNA表达的相关性。结果:刺激12 h后,SP刺激组穿孔素mRNA表达较对照组升高约2.06倍,刺激24 h后,穿孔素mRNA表达继续升高,约为对照组3.65倍,差异均具有统计学意义( t值分别为4.00、4.72, P值均<0.05);在12 h时,NK-1RA组穿孔素mRNA的表达高于对照组,差异具有统计学意义( t=2.39, P<0.05),但在24 h时,与对照组比较差异无统计学意义( P>0.05)。与静息NK92-MI细胞组相比,K562刺激组、K562+SP组、K562+SP+NK-1RA组中NK92-MI细胞CD107a的表达显著升高{(0.81±0.38)%比[(9.59±2.52)%,(17.78±1.94)%,(10.19±2.04)%], t值分别为6.27、12.19、7.83, P值均<0.05}。SP作用NK92-MI细胞后共有9个差异表达的circRNAs:circZNF609、circAMBRA1、circCAMSAP1、circAAGAB、circLMBR1、circGNB1、circBPTF、circGPI和circCSNK1G3。NK-1RA可以阻断除circCSNK1G3外的上述8个circRNAs的表达。qRT-PCR验证circZNF609和circAMBRA1的表达与测序结果一致。生物信息学预测,circZNF609、circAMBRA1与穿孔素相关的miRNAs为miR-149-5p、miR-940和miR-942-5p。circZNF609、circAMBRA1与穿孔素mRNA的表达均呈负相关( r值分别为-0.57、-0.74, P值均<0.05)。 结论:SP可以通过与NK-1R结合活化NK92-MI细胞,下调circZNF609和circAMBRA1的表达,上调穿孔素mRNA的表达,促进NK92-MI细胞脱颗粒增强其杀伤功能。
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编辑人员丨5天前
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基于微小核糖核酸-信使核糖核酸网络探讨重复经颅磁刺激治疗缺血性脑卒中的分子机制
编辑人员丨5天前
目的:基于微小核糖核酸(miRNA)-信使核糖核酸(mRNA)调控网络探讨重复经颅磁刺激(rTMS)促进缺血性脑卒中(IS)神经修复的潜在分子机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载rTMS干预7 d后的IS大鼠皮质miRNA表达谱。使用R软件分析差异miRNAs,通过在线数据库预测其对应的下游mRNAs,构建miRNA-mRNA调控网络,筛选关键miRNAs。对靶基因进行功能富集分析,构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络,识别网络中的核心mRNAs。选取无特定病原体动物(SPF)级雄性Sprague-Dawley大鼠24只,按随机数字表法随机分为假手术组、模型组和磁刺激组,每组8只大鼠。模型组和磁刺激组制备IS大鼠模型,仅磁刺激组接受连续7 d的rTMS干预,其余2组不进行干预。采用改良神经功能评分(mNSS)于造模前和造模成功1 d、3 d、7 d后评价3组大鼠的神经功能缺损程度;于造模成功8 d后深度麻醉大鼠,取脑组织行苏木精-伊红和尼氏染色观察组织缺失情况和神经元形态,利用实时荧光定量聚合酶链反应验证差异基因在3组大鼠缺血侧皮质中的表达趋势。结果:共筛选出167个差异miRNAs和预测到25个mRNAs。富集分析表明,这些基因与细胞迁移的正向调节、神经营养因子受体信号通路的正向调节等生物学过程有关,涉及腺苷酸激活蛋白激酶、神经营养因子通路、大鼠肉瘤等信号通路。通过构建miRNA-mRNA调控网络,识别出miR-206-3p、miR-378a-3p、miR-107-3p、miR-92a-3p和miR-29b-3p共5个关键miRNAs;通过蛋白互作网络分析筛选出4个核心mRNAs,分别为整合素亚基β1、水通道蛋白4、脑源性神经生长因子(BDNF)、溶质载体家族2成员4。造模成功7 d后,磁刺激组的mNSS评分显著低于模型组同时间点( P<0.05)。与模型组相比,磁刺激大鼠右侧皮质的miR-206-3p表达明显降低( P<0.05),BDNF表达则显著增高( P<0.05)。 结论:miR-206-3p-BDNF调控网络和相关作用途径在rTMS促进IS大鼠神经修复过程中发挥重要的作用。
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编辑人员丨5天前
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lncRNA TTN-AS1调控 miR-107/ HMGA1信号轴影响乳腺癌细胞放射敏感性的研究
编辑人员丨5天前
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA) TTN-AS1对乳腺癌细胞放射敏感性的影响及机制。 方法:用实时反转录PCR(qRT-PCR)检测 TTN-AS1在各乳腺癌细胞中的表达。将MDA-MB-231细胞分为0 Gy组、4 Gy组、阴性对照(NC)+4 Gy组、si- TTN-AS1+4 Gy组、si- TTN-AS1+ miR-107抑制剂+4 Gy组、si- TTN-AS1+ miR-107抑制剂+si- HMGA1+4 Gy组。用CCK-8法和流式细胞术检测各组细胞增殖和凋亡率。 结果:相较于乳腺上皮细胞, TTN-AS1在乳腺癌细胞株中显著高表达( P<0.001)。相比于NC+4 Gy组,si- TTN-AS1+4 Gy组细胞增殖能力均显著降低( P<0.05),细胞凋亡显著增加( P<0.001)。相比于0 Gy组,4 Gy组细胞 TTN-AS1和 HMGA1在放疗8 h至24 h表达均显著增加( P值均<0.01), miR-107在放疗8 h至24 h表达均显下调( P<0.001)。si- TTN-AS1+ miR-107抑制剂+4 Gy组细胞增殖能力均显著高于si- TTN-AS1+4 Gy组( P<0.001),细胞凋亡显著低于si- TTN-AS1+4 Gy组( P<0.001)。相比于si- TTN-AS1+ miR-107抑制剂+4 Gy组,si- TTN-AS1+ miR-107抑制剂+si- HMGA1+4 Gy组细胞增殖能力均显著降低( P<0.001),细胞凋亡显著增加( P<0.001)。 结论:TTN-AS1可促进乳腺癌细胞的放射敏感性,其机制为调控 miR-107/ HMGA1信号轴。
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编辑人员丨5天前
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血浆微小核糖核酸-101-3p和微小核糖核酸-141-3p在脓毒症患儿中表达的意义
编辑人员丨5天前
目的:探讨血浆微小核糖核酸-101-3p(miR-101-3p)及微小核糖核酸-141-3p(miR-141-3p)在脓毒症患儿中的表达及其临床意义。方法:选择2016年1月至2019年10月三亚市人民医院收治的153例脓毒症患儿,根据其病情严重程度分为脓毒症非休克组(94例)和脓毒症休克组(59例);根据脓毒症患儿28 d的生存情况,将其分为存活组(107例)和死亡组(46例),另选取60例健康儿童作为健康对照组。采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测所有研究对象血浆miR-101-3p及miR-141-3p表达水平。应用受试者工作特征曲线(ROC)分析血浆miR-101-3p、miR-141-3p及降钙素原(PCT)水平对脓毒症诊断及预后评估的价值。采用 Pearson相关分析脓毒症患儿血浆miR-101-3p及miR-141-3p表达水平与PCT、急性生理和慢性健康Ⅱ(APACHE Ⅱ)评分、序贯器官衰竭评分(SOFA评分)、白细胞计数及C反应蛋白水平的相关性。 结果:脓毒症休克组和脓毒症非休克组血浆miR-101-3p、miR-141-3p及PCT水平均高于健康对照组,差异均有统计学意义(均 P<0.001),且脓毒症休克组血浆miR-101-3p(4.25±1.46比1.86±0.75)、miR-141-3p(3.17±1.08比1.20±0.52)及PCT[(20.75±9.36) μg/L比(5.80±2.40) μg/L]水平均明显高于脓毒症非休克组,差异均有统计学意义(均 P<0.001)。死亡组和存活组血浆miR-101-3p、miR-141-3p及PCT水平均明显高于健康对照组,差异均有统计学意义(均 P<0.001),且死亡组血浆miR-101-3p(4.83±1.62比1.40±0.58)、miR-141-3p(3.50±1.13比0.96±0.47)及PCT[(26.30±11.72) μg/L比(3.25±2.16) μg/L]水平均明显高于存活组,差异均有统计学意义(均 P<0.001)。ROC曲线分析显示,miR-101-3p、miR-141-3p及PCT联合诊断脓毒症的曲线下面积(AUC)和95%可信区间(95% CI)明显高于miR-101-3p、miR-141-3p或PCT单独指标[0.908(0.850~0.970)比0.810(0.748~0.873)、0.784(0.723~0.844)、0.825(0.764~0.883), Z1=4.682、 Z2=5.380、 Z3=4.417,均 P<0.05],其敏感度为92.5%,特异度为84.0%。miR-101-3p、miR-141-3p及PCT联合预测脓毒症患儿死亡的AUC和95% CI明显高于miR-101-3p、miR-141-3p或PCT单独指标[0.930(0.872~0.986)比0.848(0.786~0.907)、0.792(0.730~0.853)、0.820(0.762~0.878), Z1=4.537、 Z2=5.728、 Z3=5.106,均 P<0.05],其敏感度为94.6%,特异度为87.0%。相关性分析显示,脓毒症患儿血浆miR-101-3p及miR-141-3p表达水平与PCT( r=0.804、0.773,均 P<0.001)、APACHE Ⅱ评分( r=0.738、0.695,均 P<0.001)及SOFA评分( r=0.752、0.764,均 P<0.001)均呈正相关。 结论:脓毒症患儿血浆miR-101-3p及miR-141-3p表达水平明显升高,与脓毒症患儿的严重程度相关,miR-101-3p及miR-141-3p联合PCT对儿童脓毒症诊断及预后评估具有较高价值。
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编辑人员丨5天前
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MiR-103a-3p与miR-107:骨关节炎进展过程中的潜在生物标志物
编辑人员丨5天前
目的:探讨OA发病机制中潜在的Hub基因、关键miRNAs、生物过程及相关信号通路,为OA的发病机制及治疗提供生物信息学依据。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载OA滑膜组织样本的表达谱芯片,鉴定差异表达基因DEGs,并进行功能富集分析。构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),STRING和Cytoscape进行模块分析,进一步鉴定Hub基因,并对Hub基因进行更深一步的miRNAs挖掘。结果:最终鉴定出与OA进展相关的9个Hub基因[细胞因子信号转导抑制因子(SOCS)3、转导素重复序列包含蛋白(BTRC)、F-框蛋白32(FBXO32)、KLHL22、UBE3A、HUWE1、UBR4、ANAPC5、TRIM50]和2个关键miRNAs(hsa-miR-103a-3P、hsa-miR-107),可能是OA发病机制中的潜在生物标志物。信号转导、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控和蛋白丝氨酸/苏氨酸酶活性与OA的发病机制具有一定的相关性。此外,分析结果表明cAMP信号通路和Rap1信号通路也参与了OA的进展。结论:潜在生物学分子、生物过程及相关通路对于OA的病因研究及治疗研究具有重要的指导意义。
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编辑人员丨5天前
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PDCD4和miR-107在阴茎癌组织中的表达及与患者预后的关系
编辑人员丨1个月前
目的:探究程序性细胞死亡因子4(PDCD4)及微小RNA-107(miR-107)在阴茎癌组织中的表达水平及与患者预后的关系.方法:选取2018年01月至2020年06月经本院确诊阴茎癌并行手术治疗患者32例,术中分别取患者阴茎癌组织(研究组)及癌旁正常阴茎组织(对照组)各32对,应用实时定量PCR(quantitative reverse transcription-PCR)检测两组PDCD4和miR-107的表达水平并分析其与临床病理参数及预后的关系,并采用Kaplan-Meier进行生存曲线分析及Logistic回归分析影响阴茎癌患者预后的因素.结果:研究组PDCD4表达量明显低于对照组,miR-107表达量明显高于对照组(P均<0.05);PDCD4和miR-107的表达与阴茎癌患者淋巴结转移、组织分级相关(P均<0.05),与年龄、吸烟史、饮酒史、肿瘤部位无关(P均>0.05);应用Kaplan-Meier法对生存率进行分析,miR-107低表达组生存率显著高于miR-107高表达组,PDCD4低表达组生存率低于PDCD4高表达组(P均<0.05).多因素分析结果显示,TNM分期高、淋巴结转移、PDCD4低表达和miR-107高表达均是影响阴茎癌患者预后的独立危险因素(均P<0.05).结论:阴茎癌患者miR-107呈异常高表达,PDCD4呈低表达,二者均是影响阴茎癌的独立危险因素且有望作为预测阴茎癌患者预后的重要指标.
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编辑人员丨1个月前
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宫颈HPV持续感染临床特征及宫颈脱落细胞中miR-148a-3p、Pax 1、LMX 1A 表达的诊断价值
编辑人员丨1个月前
目的 探究宫颈人乳头瘤病毒(HPV)持续感染临床特征及脱落细胞中微小RNA-148a-3p(miR-148a-3p)、配对盒基因1(Pax1)、LIM同源盒转录因子1α(LMX 1A)表达的诊断价值.方法 选取中卫市中医医院2019年12月-2022年12月收治的289例宫颈HPV阳性患者,随访6个月,根据是否发生HPV持续感染分为HPV持续感染组107例和HPV非持续感染组182例.分析宫颈HPV阳性患者HPV持续感染发生的临床特征,比较两组脱落细胞中miR-148a-3p、Pax1、LMX 1A表达水平,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析其对宫颈HPV持续感染的诊断价值.结果 289例宫颈HPV阳性患者HPV持续感染发生107例,HPV持续感染发生率为37.02%.两组生殖道炎症、人流次数比较差异有统计学意义(P<0.05);HPV持续感染组脱落细胞中miR-148a-3p、Pax 1、LMX 1A表达水平低于HPV非持续感染组(P<0.05).脱落细胞中miR-148a-3p、Pax 1、LMX 1A联合检测诊断宫颈HPV阳性患者HPV持续感染的曲线下面积(AUC)高于各指标单一检测(P<0.05),且联合检测敏感度、特异度为88.79%、80.22%.结论 宫颈HPV阳性患者HPV持续感染发生率高,其脱落细胞中miR-148a-3p、Pax1、LMX1A水平呈低表达,且三者联合检测可提高宫颈HPV阳性患者HPV持续感染的诊断价值.
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编辑人员丨1个月前
