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循环微小RNA-185在骨肉瘤中的表达及临床意义
编辑人员丨6天前
目的:观察微小RNA(miRNA,miR)-185在骨肉瘤患者中的表达,探讨其在骨肉瘤诊断及预后中的价值。方法:采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测54对骨肉瘤患者和健康对照者(性别和年龄匹配)的miR-185表达。根据miR-185的中位数(2.381),将所有患者分为两组:高miR-185表达组(21)和低miR-185表达组(33)。然后分析miR-185表达与患者临床病理因素的相关性。血清样本在郑州大学第一附属医院2012年1月1日至2014年12月份从接受手术但未接受化学疗法或放射疗法的患者中收集,并分析miR-185表达与骨肉瘤患者的临床病理特征和总体生存率的关系。使用Manne Whitney U检验比较骨肉瘤患者和正常对照组血清miR-185水平的差异。对数秩检验和Kaplan-Meier方法评估骨肉瘤患者的总体生存率。采用Cox回归和多因素分析评估预后价值。 结果:与正常对照组比较,骨肉瘤患者血清中的miR-185表达显著降低( U=373.000, P<0.05),差异有统计学意义。miR-185的低表达与较大的肿瘤体积(直径<5 cm比直径≥5 cm的miR-185:3.100±0.359比1.806±0.226, P<0.01),较高的TNM分期(一、二期比三、四期的miR-185:2.986±1.562比1.566±1.305, P<0.01)和远处转移(未转移比转移的miR-185:3.014±1.660比1.590±1.148, P<0.01)密切相关,差异有统计学意义。Kaplan-Meier曲线生存分析和对数秩检验显示,miR-185的低表达与骨肉瘤患者的总生存率降低有关。此外,多变量分析表明,miR-185表达降低是骨肉瘤患者总体生存的独立预后生物标志物( P<0.01),差异有统计学意义。 结论:血清miR-185可作为一种肿瘤抑制因子,有助于骨肉瘤患者的诊断、预后。
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编辑人员丨6天前
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多发性大动脉炎患者血浆外泌体携带的差异微小RNA和蛋白表达谱分析
编辑人员丨6天前
目的:检测初治多发性大动脉炎(TAK)患者血浆外泌体携带的微小RNA和蛋白,分析其在TAK发病机制中的可能作用。方法:选2020年6月至11月北京协和医院风湿免疫科确诊的初治TAK患者10例,另选与之年龄性别匹配的健康对照者5例,分别通过RNA测序和蛋白质谱技术检测血浆外泌体携带的微小RNA和蛋白,筛选出差异表达的微小RNA和蛋白,并对其进行层次聚类分析、功能、信号通路和结构域富集分析,最终筛选出与血管炎有关的微小RNA和蛋白,探究其在TAK发病机制中的可能作用。统计学采用Fisher精确概率检验或 χ2检验。 结果:TAK患者血浆外泌体携带的差异表达的微小RNA 29个,其中miR-101-3p、miR-122-5p、miR-143-3p、miR-185-3p、miR-192-5p、miR-194-5p、miR-19a-3p、miR-19b-3p、miR-20b-5p、miR-21-5p、miR-22-3p、miR-335-5p、miR-34a-5p、miR-3613-5p、miR-548ad-5p、miR-590-3p、miR-7-5p表达上调,miR-1249-3p、miR-141-3p、miR-199a-5p、miR-199b-5p、miR-200a-3p、miR-200c-3p、miR-204-5p、miR-29c-5p、miR-335-3p、miR-381-3p、miR-4433b-5p、miR-584-5p表达下调。差异表达的蛋白357个,其中236个表达上调,121个表达下调,最终筛选前激肽释放酶、激肽原1、桥粒蛋白。结论:血浆外泌体携带的miR-34a-5p、miR-200c-3p、miR-143-3p、miR-22-3p、miR-21-5p、前激肽释放酶、激肽原1、桥粒蛋白可能通过调节血管生理过程、炎症反应、自身免疫等过程参与TAK的发病机制,具有作为TAK生物标志物和治疗靶点的潜在作用。
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编辑人员丨6天前
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X射线诱导非小细胞肺癌A549细胞凋亡的适应性反应及相关miRNA筛选的研究
编辑人员丨6天前
目的:研究X射线辐射诱导非小细胞肺癌(NSCLC) A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选适应性反应相关的微RNA (miRNA)。方法:将NSCLC A549细胞分为6组,包括50 mGy+20 Gy、200 mGy+20 Gy、20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组及对照组(0 Gy),前2组细胞分别用50、200 mGy初始剂量进行照射,培养6 h后用20 Gy的效应剂量进行照射,20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组同时进行照射。培养24 h后使用流式细胞仪检测细胞凋亡情况。利用小RNA测序技术筛选差异表达miRNA,并对其靶基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的功能富集分析。采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)对部分差异表达miRNA进行验证。2组间数据的比较采用Welch t检验。 结果:50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组的A549细胞早期凋亡率分别为(1.81±0.11)%和(2.17±0.19)%,低于20 Gy照射组的(4.54±0.23)%,且差异均有统计学意义( t=10.680、8.006,均 P<0.01)。与20 Gy照射组相比,50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组共同差异表达趋势miRNA有1个上调(miR-3662)、15个下调(miR-185-3p、miR-1908-5p、miR-1307-5p、miR-182-3p、miR-92a-3p、miR-582-5p、miR-501-3p、miR-138-5P、miR-1260b、miR-484、miR-378d、miR- 193b-3P、miR-127-3p、miR-1303及miR-654-5p)。GO富集分析结果显示,差异表达miRNA调控靶基因功能显著富集于细胞通讯调节、代谢过程的正向调节、代谢信号的调节、酶结合及催化活性等过程。KEGG富集分析结果显示,靶基因相关信号通路显著富集于溶酶体、丝裂原活化蛋白激酶、Ras和内吞作用等信号通路。qRT-PCR检测结果显示,miRNA表达情况与基因芯片结果趋势一致(10个miRNA表达水平得到验证)。 结论:X射线50、200 mGy照射剂量均能诱导NSCLC A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选到一组共同差异表达的miRNA,可能在X射线辐射诱导细胞凋亡的适应性反应中发挥了重要作用,有可能成为调节电离辐射生物效应的潜在靶点。
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编辑人员丨6天前
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2型糖尿病患者血浆microRNA差异表达及生物信息学分析
编辑人员丨6天前
目的:构建2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)患者血浆microRNA(miRNA)差异表达谱,探讨miRNA作为T2DM诊疗靶标的可能性。方法:采用miRNA芯片技术检测T2DM患者血浆中miRNA差异表达情况,用实时荧光定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)进行验证,对目标miRNA进行生物信息学分析。结果:T2DM患者血浆中122个miRNAs呈差异表达( FC>2, P<0.05),经多源交集筛选得到差异表达miRNAs 14个,其中上调5个,下调9个。RT-qPCR结果显示,血浆中hsa-miR-185-5p及hsa-miR-328-5p在病例组高表达,差异有统计学意义( P<0.05)。生物信息学分析结果提示,这些miRNAs可能通过胰岛素分泌及PI3K-AKT信号通路途径参与T2DM发生发展过程。 结论:T2DM患者血浆中hsa-miR-185-5p及hsa-miR-328-5p呈差异表达,可能与T2DM发病密切相关。
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编辑人员丨6天前
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乳腺癌新辅助化疗后骨髓抑制患者外周血miR-211-5p的表达及其对Notch信号通路的调控机制
编辑人员丨6天前
目的:探讨乳腺癌新辅助化疗后骨髓抑制患者外周血miR-211-5p的表达及其通过靶向环氧化酶2(COX2)基因对Notch信号通路的调控机制。方法:纳入2018年1月至2021年1月在临沂市人民医院首次就诊并接受新辅助化疗的185例乳腺癌患者作为研究对象。使用定量实时聚合酶联反应测量miR-211-5p、COX2基因和Notch信号通路相关基因(Notch1、Jagged1和Hes1)mRNA的表达水平。分别将miR-211-5p mimic、inhibitor、mimic NC和inhibitor NC转染SD大鼠骨髓间充质干细胞中,48 h后检测miR-10a-3p和COX2基因的mRNA表达量和Notch信号通路相关基因蛋白表达水平。结果:严重骨髓抑制患者的miR-211-5p相对表达量为(2.41±0.32),显著高于轻度骨髓抑制患者的miR-211-5p相对表达量(1.53±0.18)( t=6.39, P<0.001);严重骨髓抑制患者的COX2基因mRNA相对表达量为(3.64±0.74),显著低于轻度骨髓抑制患者的COX2基因mRNA相对表达量(5.37±1.02)( t=7.47, P<0.001)。在严重骨髓抑制患者中,miR-211-5p和COX2基因mRNA水平呈显著负相关关系( r=-0.70, P=0.006)。双荧光素酶报告实验结果证实COX2是miR-211-5p的靶基因。严重骨髓抑制患者外周血Notch信号通路相关基因Notch1、Jagged1、Hes1 mRNA相对表达量分别为(2.35±0.41),(2.76±0.46)和(3.04±0.52),显著低于轻度骨髓抑制患者(4.12±0.63),(4.53±0.58)和(5.12±0.67)( t=5.37、6.11、6.14, P均<0.001)。使用miR-211-5p模拟物和抑制物转染SD大鼠骨髓间充质干细胞后,mimic组的miR-211-5p相对表达量为(3.46±0.49),显著高于mimic NC组(2.24±0.32)、inhibitor组(1.28±0.19)和inhibitor NC组(2.33±0.37)( P<0.001),而inhibitor组的miR-211-5p相对表达量均显著低于其他3组( P<0.001)。mimic组的COX2基因mRNA表达量为(2.73±0.36),显著低于mimic NC组(4.05±0.59)、inhibitor组(6.15±0.86)和inhibitor NC组(4.18±0.65)( P<0.001),而inhibitor组的COX2基因mRNA表达量均显著高于其他3组( P<0.001)。inhibitor组的Notch1、Jagged1、Hes1蛋白表达显著升高,而mimic组的Notch1、Jagged1、Hes1蛋白表达显著降低。 结论:乳腺癌新辅助化疗后严重骨髓抑制患者外周血miR-211-5p的表达水平显著升高,且通过靶向下调COX2基因表达水平抑制Notch信号通路。
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编辑人员丨6天前
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LncRNA BBOX1-AS1通过miR-185-5p/RHOA调节卵巢癌细胞放疗敏感性
编辑人员丨6天前
目的:探究LncRNA BBOX1-AS1在卵巢癌(ovarian cancer,OC)放疗敏感性中的作用及潜在机制。方法:qRT-PCR检测OC组织和细胞中BBOX1-AS1、miR-185-5p的表达。双荧光素酶报告实验确认BBOX1-AS1、miR-185-5p、RHOA之间的相互作用。MTT及流式细胞术观测OC细胞的增殖和凋亡。结果:BBOX1-AS1在OC组织和细胞中上调,相对于si-NC组在2、3、4天的细胞增殖活力(0.89±0.07)(1.48±0.13)(1.69±0.15),si-BBOX1-AS1组的增殖活力(0.59±0.06)(0.97±0.09)(1.21±0.10)显著下降(均 P<0.05)。相对于si-NC组(6.24±0.28),敲减BBOX1-AS1能诱导OC细胞的凋亡(12.07±1.33)(均 P<0.05)。miR-185-5p在OC组织和细胞中表达下调,BBOX1-AS1与miR-185-5p、RHOA与miR-185-5p的靶向关系被证明。敲低miR-185-5p能逆转BBOX1-AS1对OC细胞的影响(均 P<0.05)。 结论:LncRNA BBOX1-AS1通过调控miR-185-5p/RHOA轴抑制OC细胞放疗敏感性。
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编辑人员丨6天前
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长链非编码RNA HAGLR对乳腺癌预后的影响及其竞争性内源RNA互作网络的构建
编辑人员丨6天前
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR在乳腺癌中的表达情况及其对乳腺癌预后的影响,并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。方法:采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology网站检索HAGLR基因染色体定位及转录本表达情况。采用lnclocater网站预测HAGLR亚细胞定位。通过lnCAR数据库分析HAGLR在乳腺癌组织和癌旁组织的差异表达情况,按HAGLR表达水平,将lnCAR数据库患者分为HAGLR高表达组和HAGLR低表达组,采用Kaplan-Meier法分析两组间总生存(OS)及无转移生存情况,并通过UCSC Xena数据库进行验证。通过lnCAR数据库检索HAGLR共表达基因,将排位前200个共表达基因提交至Metascape网站,进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,构建蛋白互作网络(PPI)。采用生物信息学在线分析网站starbase预测HAGLR靶向的微RNA(miRNA)和可直接编码蛋白的mRNA,通过Cytoscape3.8软件构建HAGLR的ceRNA网络。结果:HAGLR基因定位于2q31.1,主要分布于细胞质;HAGLR在乳腺癌组织中的表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义( P<0.001)。对lnCAR数据库和UCSC Xena数据库分析均显示,HAGLR高表达组OS较低表达组均差(均 P<0.01);lnCAR数据库中HAGLR高表达组无转移生存较低表达组差( P=0.030)。前200个HAGLR共表达基因中与HAGLR负相关基因129个,与HAGLR正相关基因71个。KEGG通路分析显示,HAGLR与代谢通路、MAPK信号通路、JAK-STAT信号通路及癌症通路有关;GO注释分析显示,HAGLR主要富集在细胞周期、着丝粒复合体组装、有丝分裂进程、蛋白激酶结合、激酶活性的调节、细胞对DNA损伤刺激的反应等多种功能中。hsa-miR-130b-3p、hsa-miR-1245b-5p、hsa-miR-182b-5p、hsa-miR-512-3p、hsa-miR-302b-3p、hsa-miR-185b-5p、hsa-miR-106b-5p为HAGLR靶向miRNA。 结论:HAGLR在乳腺癌组织中高表达,其可能是乳腺癌预后预测的生物标志物。
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编辑人员丨6天前
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LncRNA HCG18调控miR-185-5p/AGER轴影响糖尿病肾病内质网应激和自噬
编辑人员丨6天前
目的:本研究旨在探讨LncRNA HCG18调控miR-185-5p/AGER轴对糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)内质网应激和自噬的影响。方法:收集DN患者肾脏组织,建立高糖(high glucose,HG)诱导的足细胞损伤模型。检测DN患者肾组织与DN细胞模型中HCG18的表达。确定HCG18在细胞中的定位表达。证实HCG18与miR-185-5p、miR-185-5p与晚期糖基化终产物特异性受体(advanced glycosylation end-product specific receptor,AGER)的调控关系。qRT-PCR和western blot检测内质网应激相关因子(CHOP、XBP1)及自噬相关因子(Beclin-1、p62)的表达。结果:相对于非DN患者,DN患者肾组织中HCG18高表达( P<0.05)。相对于正常糖(normal glucose,NG)组,HG模型中内质网应激相关因子(CHOP、XBP1)的mRNA和蛋白表达增加而自噬相关因子Beclin-1的mRNA和蛋白表达被抑制,p62的mRNA和蛋白表达增强(均 P<0.05)。HCG18通过调控miR-185-5p/AGER轴发挥生物学作用。敲低HCG18能减轻内质网应激,激活自噬并减少足细胞损伤,该作用被miR-185-5p抑制剂部分逆转。 结论:HCG18调控miR-185-5p/AGER信号轴并通过调控内质网应激和自噬促进DN的发生。
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编辑人员丨6天前
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干扰circABCC4靶向微小RNA-185-5p抑制胰腺癌细胞发生发展
编辑人员丨6天前
目的:探讨circABCC4对胰腺癌细胞发生发展的影响及分子机制。方法:收集2020年10月至2023年10月郑州大学第一附属医院收治的39例胰腺癌患者的癌组织及癌旁组织,用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测circABCC4和微小RNA(miR)-185-5p的表达水平;双荧光素酶报告实验检测circABCC4和miR-185-5p的靶向关系。将胰腺癌细胞SW1990分为si-circABCC4组、si-NC组、miR-185-5p mimic组、miR-NC组、si-circABCC4+miR-185-5p inhibitor组、si-circABCC4+抗miR-NC组;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞增殖抑制率;克隆形成实验检测细胞克隆形成数;流式细胞术检测细胞凋亡率;蛋白质印迹法检测蛋白表达;Transwell检测细胞迁移和侵袭数。两组比较行 t检验,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD- t检验。 结果:胰腺癌组织中circABCC4表达水平高于癌旁组织(3.13±0.29比1.03±0.11, t=42.283, P<0.05),miR-185-5p表达水平低于癌旁组织(0.45±0.08比1.09±0.17, t=21.273, P<0.05)。circABCC4靶向结合并负调控miR-185-5p表达( P<0.05)。si-circABCC4组SW1990细胞抑制率[(47.13±2.23)%比0, F=2 376.899, P<0.05]、凋亡率[(18.94±1.08)%比(7.33±0.72)%, F=409.972, P<0.05)和B细胞淋巴瘤/白血病-2相关的x蛋白(bax)表达水平(0.55±0.04比0.21±0.03, F=310.551, P<0.05)高于si-NC组,克隆形成数[(67.44±3.44)个比(112.00±5.94)个, F=296.029, P<0.05]、B细胞淋巴瘤/白血病-2(bcl-2)表达水平(0.27±0.03比0.67±0.05, F=236.571, P<0.05)低于si-NC组。miR-185-5p mimic组SW1990细胞抑制率[(55.52±2.30)%比(0.02±0.01)%, F=2 376.899, P<0.05]、凋亡率[(22.59±1.45)%比(7.11±0.55)%, F=409.972, P<0.05]和bax表达水平(0.65±0.04比0.20±0.02, F=310.551, P<0.05)高于miR-NC组,克隆形成数[(54.11±2.23)个比(112.11±6.15)个, F=296.029, P<0.05]、bcl-2表达水平(0.17±0.02比0.67±0.07, F=236.571, P<0.05)低于miR-NC组;si-circABCC4+miR-185-5p inhibitor组SW1990细胞抑制率[(19.13±0.99)%比(47.09±1.73)%, F=2 376.899, P<0.05]、凋亡率[(10.25±0.57)%比(18.78±1.25)%, F=409.972, P<0.05]和bax表达水平(0.29±0.03比0.57±0.04, F=310.551, P<0.05)低于si-circABCC4+抗miR-NC组,克隆形成数[(96.67±4.45)个比(65.78±2.86)个, F=296.029, P<0.05]、bcl-2表达水平(0.52±0.04比0.26±0.03, F=236.571, P<0.05)高于si-circABCC4+抗miR-NC组。si-circABCC4组SW1990细胞迁移[(97.44±3.65)个比(182.56±10.12)个, F=576.998, P<0.05]和侵袭数[(85.56±3.56)个比(150.56±6.50)个, F=480.065, P<0.05]低于si-NC组;miR-185-5p mimic组SW1990细胞迁移[(74.78±3.22)个比(185.56±7.21)个, F=576.998, P<0.05]和侵袭数[(71.89±4.18)个比(149.67±6.02)个, F=480.065, P<0.05]低于miR-NC组;si-circABCC4+miR-185-5p inhibitor组SW1990细胞迁移[(158.67±6.15)个比(98.11±2.00)个, F=576.998, P<0.05]和侵袭数[(137.89±5.32)个比(85.00±3.40)个, F=480.065, P<0.05]高于si-circABCC4+抗miR-NC组。 结论:干扰circABCC4通过上调miR-185-5p抑制胰腺癌细胞的发生发展。
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编辑人员丨6天前
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三七总皂苷调控破骨细胞外泌体中差异miRNA表达抑制成骨细胞铁死亡
编辑人员丨3周前
背景:激素性股骨头坏死多是由于长期大量使用激素所致,但具体的发病机制尚未明确,有待于进一步研究.目的:筛选出三七总皂苷干预破骨细胞来源外泌体中的差异miRNA,在此基础上构建成骨相关铁死亡调控网络,以探索激素性股骨头坏死发生的潜在机制及研究方向.方法:MTT实验检测不同浓度地塞米松和不同质量浓度三七总皂苷对Raw264.7细胞系的毒性作用;抗酒石酸酸性磷酸酶染色和TUNEL染色检测三七总皂苷对破骨细胞抑制和凋亡的影响;从三七总皂苷干预的破骨细胞中提取外泌体,对外泌体进行测序找出差异表达miRNA,通过CytoScape 3.9.1构建并可视化差异表达的miRNA与mRNA间的调控网络;通过GO分析和KEGG分析筛选候选mRNA;最后筛选出铁死亡相关的差异基因,构建铁死亡相关基因的调控网络.结果与结论:①通过MTT实验确定了适合干预Raw264.7细胞的地塞米松浓度(0.1 μmol/L)和三七总皂苷质量浓度(1 736.85 μg/mL);②三七总皂苷对破骨细胞有抑制作用并能促进其凋亡;③从破骨细胞来源外泌体样本中鉴定出20个差异miRNA,通过靶标mRNA预测出11种成骨相关的差异miRNA,并构建了4个上调的差异表达miRNA对应于155个下调的候选mRNA以及7个下调的差异表达miRNA对应于238个上调的候选mRNA的调控网络;④在差异基因中筛选出与铁死亡相关的基因24个,最终构建了12个网络(miR-98-5p/PTGS2,miR-23b-3p/PTGS2,miR-425-5p/TFRC,miR-133a-3p/TFRC,miR-185-5p/TFRC,miR-23b-3p/NFE2L2,miR-23b-3p/LAMP2,miR-98-5p/LAMP2,miR-182-5p/LAMP2,miR-182-5p/TLR4,miR-23b-3p/ZFP36,miR-182-5p/ZFP36).这些结果表明三七总皂苷可能通过调控破骨细胞外泌体来源miRNA的表达来调节成骨细胞铁死亡,为激素性股骨头坏死的机制研究提供新的思路.
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编辑人员丨3周前
