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Identification of lncRNA-miRNA-mRNA networks in late-onset pre-eclampsia
编辑人员丨4天前
Objective::Long non-coding RNAs (lncRNAs) are implicated in multiple pathophysiological processes in placenta-related disorders; however, their expression and function in late-onset pre-eclampsia (LOPE) remain unclear. This study aimed to investigate the expression of lncRNAs in LOPE, construct a competing endogenous RNA (ceRNA) network, and identify the pathways associated with LOPE pathogenesis.Methods::We performed lncRNA and mRNAs microarray profiling to identify the differential expression profiles of lncRNAs and mRNAs in LOPE compared to those in normal pregnancy. Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR) was performed to validate differentially expressed genes. Subsequently, we generated an interaction network between lncRNAs, (micro-RNAs) miRNAs, and mRNAs based on the Pearson’s correlation coefficient between lncRNAs and mRNAs. Gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analyses were performed to understand the functional significance of differentially expressed lncRNAs (DElncRNAs) in LOPE.Results::We identified 29 DElncRNAs (25 upregulated and four downregulated) and 212 differentially expressed mRNAs (DEmRNAs; 203 upregulated and nine downregulated) in LOPE placentas. Within them, six lncRNAs and four mRNAs were verified by qRT-PCR. GO and KEGG analyses revealed the potential pathways affected by these mRNAs, such as positive regulation of leukocyte chemotaxis, chemokine signaling pathway, and response to hypoxia. Finally, we constructed a ceRNA network including three DElncRNAs and 124 DEmRNAs, whose competing interactions may be mediated by 17 miRNAs. Two DElncRNAs, ENST00000515376 and ENST00000520544, were found to be hub genes, as they interacted with most miRNAs and mRNAs. ENST00000515376 is most likely related to the metabolic process of arachidonic acid, whereas ENST00000520544 is more likely related to the coagulation system, such as the regulation of blood coagulation and platelet degranulation.Conclusion::Differential expression profile of lncRNAs and the lncRNA-miRNA-mRNA network in LOPE provide potential therapeutic targets for this disease.
Late-onset pre-eclampsia Long non-coding RNAs Competing endogenous RNA network Late-onset pre-eclampsia...不再出现此类内容
编辑人员丨4天前
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IgA肾病患者血清miR-155、SOCS-1水平与肾间质纤维化的相关性
编辑人员丨4天前
目的:探究IgA肾病患者血清微小核糖核酸-155(miR-155)、细胞因子信号转导抑制因子-1(SOCS-1)水平变化及其与肾间质纤维化的关系。方法:选取2009年1月至2018年6月济宁市第一人民医院收治的365例原发性IgA肾病患者作为研究对象,根据肾间质纤维化程度将入组患者分为T0组139例、T1组124例、T2组102例。另选取同期在本院体检的健康者361例作为健康对照组。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测研究对象的血清miR-155表达水平,采用酶联免疫吸附(ELISA)法检测血清SOCS-1、转化生长因子-β1(TGF-β1)、单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)表达水平。采用logistic回归模型分析IgA肾病患者肾间质纤维化发生的影响因素;采用Pearson法分析IgA肾病患者血清miR-155、SOCS-1水平与肾间质纤维化发生影响因素、TGF-β1、MCP-1相关性;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-155、SOCS-1水平对IgA肾病患者肾间质纤维化发生的预测价值。结果:健康对照组、T0组、T1组、T2组SBP、DBP、24 h尿蛋白定量、血肌酐、血尿酸水平及血清miR-155、TGF-β1、MCP-1、尿视黄醇结合蛋白(RBP)、乙酰βD氨基葡萄糖苷酶(NAG)水平依次显著升高,血红蛋白、eGFR、尿渗透压及血清SOCS-1水平依次显著降低(均 P<0.05)。高SBP、高DBP、低血红蛋白、高血肌酐、高尿酸、高24 h尿蛋白定量、低eGFR水平是影响IgA肾病患者肾间质纤维化发生的独立危险因素(均 P<0.05)。IgA肾病患者血清miR-155水平与TGF-β1、MCP-1、SBP、DBP、血肌酐、血尿酸水平及24 h尿蛋白定量呈正相关,与SOCS-1、血红蛋白、eGFR水平呈负相关(均 P<0.05)。血清SOCS-1水平与TGF-β1、MCP-1、SBP、DBP、血肌酐、血尿酸水平及24 h尿蛋白定量呈负相关,与血红蛋白、eGFR水平呈正相关(均 P<0.05)。血清miR-155、SOCS-1水平联合检测预测IgA肾病患者肾间质纤维化发生的曲线下面积为0.882,明显大于血清miR-155、SOCS-1水平单独检测(均 P<0.05)。 结论:IgA肾病患者血清miR-155表达上调、SOCS-1表达下调,可能作为预测因子,对肾间质纤维化发生具有一定评估价值。
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编辑人员丨4天前
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脊髓损伤相关的微小RNA
编辑人员丨4天前
脊髓损伤是一种难治性疾病,给患者和社会带来沉重负担,至今尚缺乏可以精准判断脊髓损伤严重程度及预后的标志物,也没有有效的治疗手段。微小RNA(miRNA,miR)在多种疾病的诊治中显示出一定的潜力,本文拟综述其在脊髓损伤诊治上的研究进展。miRNA与脊髓损伤密切相关,可以通过多种途径调控脊髓损伤的病理生理过程,某些miRNA和脊髓损伤的严重程度有特异的相关性,某些miRNA在脊髓损伤的动物模型中显示出促进脊髓损伤恢复的能力。本文还列举了miR-124、miR-21、miR-223这3种可能对脊髓损伤诊治有帮助的miRNA。
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编辑人员丨4天前
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微小RNA-124通过靶向激活的蛋白激酶C受体1对胃癌细胞增殖、周期和凋亡的影响
编辑人员丨4天前
目的:观察微小RNA(miRNA,miR)-124通过靶向激活的蛋白激酶C受体1(RACK1)对胃癌细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法:选取2020年6月至2022年6月收集的76例胃癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肿瘤组织和癌旁组织miR-124表达水平。采用慢病毒介导对照miRNA和miR-124感染人胃癌细胞系BGC-823,分为对照miRNA和miR-124组,分别采用细胞计数试剂(CCK-8)和EdU染色分析细胞增殖,流式细胞术分析两组细胞的周期和凋亡;采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-124的靶基因;蛋白质印迹法(Western blot)分析肿瘤组织和细胞靶基因表达及其周期和凋亡蛋白表达。组间比较采用 t检验。 结果:癌旁组织miR-124表达水平(1.06±0.22)明显高于胃癌组织(0.56±0.13),差异有统计学意义( t=16.940, P<0.05)。对照miRNA组细胞48 h吸光值A(2.09±0.13)明显高于miR-124组(1.36±0.11),差异有统计学意义( t=10.660, P<0.05)。对照miRNA组细胞EdU阳性率[(86.09±3.35)%]明显高于miR-124组[(73.11±6.69)%],差异有统计学意义( t=4.254, P<0.05)。对照miRNA组细胞G 0/G 1期百分比[(39.17±4.91)%]明显低于miR-124组[(54.17±4.41)%],差异有统计学意义( t=5.569, P<0.05)。对照miRNA组细胞CDK1蛋白表达水平(0.92±0.06)明显高于miR-124组(0.62±0.05),差异有统计学意义( t=9.180, P<0.05)。对照miRNA组细胞凋亡比例[(5.40±1.29)%]明显低于miR-124组[(18.60±1.91)%],差异有统计学意义( t=14.000, P<0.05)。对照miRNA组细胞Caspase-3蛋白表达水平(0.86±0.06)明显低于miR-124组(1.36±0.12),差异有统计学意义( t=8.784, P<0.05)。RACK1是miR-124的靶基因。对照miRNA组细胞RACK1表达水平(1.29±0.08)明显高于miR-124组(0.70±0.08),差异有统计学意义( t=12.540, P<0.05)。 结论:miR-124在胃癌组织低表达导致其靶基因RACK1表达水平显著上调,进而促进胃癌细胞的增殖和周期,抑制胃癌细胞的凋亡。
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编辑人员丨4天前
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基于全转录组测序分析核糖核酸氧化影响胰岛β细胞的分子机制
编辑人员丨4天前
目的:探索高糖诱导核糖核酸氧化增加对胰岛β细胞功能和活性的影响及分子机制。方法:体外培养大鼠胰岛β细胞瘤INS-1细胞,高糖干预后同位素稀释超高效液相串联质谱(ID LC MS/MS)评估核酸氧化。利用8-氧代鸟苷-5'-三磷酸酯(8-oxoGTP)体外模拟INS-1细胞RNA氧化增加,CCK-8评估细胞增殖,流式细胞术评估细胞凋亡,实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)评估胰岛素(INS)、胰-十二指肠同源盒1(PDX1)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Casp3)和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶6(Casp6)基因信使RNA(mRNA)表达,全转录组测序分析RNA氧化影响INS-1细胞的分子机制。结果:高糖致INS-1细胞RNA氧化增加。RNA氧化增加抑制INS-1细胞增殖,降低INS和PDX1基因mRNA水平,促进凋亡相关casp3和casp6基因mRNA合成。全转录组测序分析发现,RNA氧化增加导致INS-1细胞内mRNA、长链非编码RNA(lncRNA)、微RNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)差异表达,显著下调Mafa、Pdx1、Pax6和Mnx1转录因子,上调rno-miR-124-3p,rno-miR-133a-3p,rno-miR-3120,rno-miR-212-3p,rno-miR-7a-2-3p,促使相关lncRNAs差异表达,从而抑制胰岛素合成和分泌及β细胞增殖。结论:RNA氧化增加下调β细胞关键转录因子mRNAs水平,促使相关非编码RNA(ncRNA)特别是lncRNAs差异表达,影响β细胞胰岛素合成和分泌,抑制细胞增殖,是2型糖尿病(T2DM)β细胞功能障碍和活性降低的重要原因。
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编辑人员丨4天前
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老年帕金森病患者血清miR-124、miR-494表达及其临床意义
编辑人员丨4天前
目的:探讨老年帕金森病(Parkinson disease,PD)患者血清微小RNA-124(miR-124)、微小RNA-494(miR-494)表达水平及其临床意义。方法:选取2018年3月~2020年4月在郑州大学附属郑州中心医院住院治疗的90例PD患者(PD组);同期选择在医院体检中心检查且与PD患者年龄、性别相匹配的100名非PD老年人作对照组。所有研究对象空腹12 h后取清晨静脉血4 ml,采用帕金森等级量表(unified Parkinson disease rating scale,UPDRS)对所有PD组患者从精神状态、行为和情感、生活质量、运动检查进行评分,利用帕金森病Hoehn-Yahr分级量表对PD患者进行分级;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测血清miR-124和miR-494表达水平;作ROC曲线判断miR-124、miR-494对PD患者的诊断价值。结果:UPDRS评分≤60分的PD患者Hoehn-Yahr分级明显低于UPDRS>60分的患者[(2.47±0.43)分,(3.42±0.47)分],差异有统计学意义( t=9.055, P<0.001),但血清miR-124、miR-494表达水平差异无统计学意义[miR-124:(0.72±0.14),(0.70±0.12);miR-494:(1.17±0.19),(1.18±0.22)]( t=0.633,0.230, P=0.529,0.819);与对照组相比,PD组血清miR-124表达下调[(0.71±0.20),(1.05±0.24)],miR-494表达上调[(1.18±0.26),(0.96±0.22)]( t=10.542,6.315,均 P<0.001);ROC曲线结果显示,血清miR-124、miR-494诊断PD的曲线下面积(AUC)分别为0.847,0.760,截断值分别为0.901,1.126,灵敏度分别为86.67%、61.11%,特异度分别为75.03%、79.00%;二者联合诊断PD的AUC为0.898,灵敏度和特异度分别为85.56%、85.00%。 结论:PD患者血清miR-124呈低表达,miR-494呈高表达,提示二者的水平变化可能与PD的发生、发展有关。二者均对PD有一定的诊断价值,且联合诊断价值更高。
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编辑人员丨4天前
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MicroRNAs of bone marrow mesenchymal stem cell-derived exosomes regulate acute myeloid leukemia cell proliferation and apoptosis
编辑人员丨4天前
Background::Acute myeloid leukemia (AML) is a malignant hematological disease, originating from hematopoiesis stem cell differentiation obstruction and clonal proliferation. New reagents or biologicals for the treatment of AML are urgently needed, and exosomes have been identified as candidate biomarkers for disease diagnosis and prognosis. This study aimed to investigate the effects of exosomes from bone marrow mesenchymal stem cells (BMSCs) on AML cells as well as the underlying microRNA (miRNA)-mediated mechanisms.Methods::Exosomes were isolated using a precipitation method, followed by validation using marker protein expression and nanoparticle tracking analysis. Differentially expressed miRNAs were identified by deep RNA sequencing and confirmed by quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR). Cell proliferation was assessed by the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-5-(3-carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulfophenyl)-2H-tetrazolium inner salt method, and cell cycle progression and apoptosis were detected by flow cytometry. Functional gene expression was analyzed by qPCR and Western blotting (WB). Significant differences were determined using Student’s t test or analysis of variance. Results::BMSCs-derived exosomes effectively suppressed cell proliferation (both P < 0.0001 at 10 and 20 μg/mL) and cell cycle progression ( P < 0.01 at G0-G1 stage), and also significantly enhanced cell apoptosis ( P < 0.001) in KG-1a cells. There were 1167 differentially expressed miRNAs obtained from BMSCs-derived exosomes compared with KG-1a cell-derived exosomes ( P < 0.05). Knockdown of hsa-miR-124-5p in BMSCs abrogated the effects of BMSCs-derived exosomes in regulating KG-1a such as the change in cell proliferation (both P < 0.0001 vs. normal KG-1a cell [NC] at 48 and 72 h). KG-1a cells treated with BMSCs-derived exosomes suppressed expression of structural maintenance of chromosomes 4 ( P < 0.001 vs. NC by qPCR and P < 0.0001 vs. NC by WB), which is associated with the progression of various cancers. This BMSCs-derived exosomes effect was significantly reversed with knockdown of hsa-miR-124-5p ( P < 0.0001 vs. NC by WB). Conclusions::BMSCs-derived exosomes suppress cell proliferation and cycle progression and promote cell apoptosis in KG-1a cells, likely acting through hsa-miR-124-5p. Our study establishes a basis for a BMSCs-derived exosomes-based AML treatment.
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编辑人员丨4天前
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PD患者治疗期间血清miRNA-124、miRNA-221与非运动症状的相关性分析
编辑人员丨2024/8/10
目的 探讨帕金森病(PD)患者外周血miR-124、miR-224在不同治疗时期的表达水平,并分析其与非运动症状的相关性,为临床PD患者非运动症状监测和治疗提供潜在干预靶点.方法 选择2020年1月至2022年3月PD患者106例,分别于患者治疗前、治疗4、8、12周时,对患者血清miR-124、miR-221水平进行检测,并采用非运动症状评价量表(NMSS)对患者的非运动症状进行评估.采用统计学方法检验分析血清miR-124、miR-221与帕金森患者NMSS评分的相关性.结果 治疗期间,患者血清miR-124逐渐上升,差异均有统计学意义(P<0.05).miR-221表达水平及NMSS评分均逐渐下降,差异均有统计学意义(P<0.05).Pearson相关性分析显示,血清miR-124与患者NMSS评分均呈负相关(r=-0.346,P<0.001);miR-221与患者NMSS评分呈正相关(r=0.409,P<0.001);线性回归分析显示,PD患者血清miR-124和miR-221表达水平是其非运动症状的影响因素(P<0.05).结论 PD患者血清miR-124和miR-221表达水平与非运动症状严重程度密切相关,临床上可考虑通过监测或干预血清miR-124和miR-221表达水平,缓解PD患者非运动症状,进而改善患者预后.
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编辑人员丨2024/8/10
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血清miR-124-3p和miR-495-3p水平在脓毒症严重程度和急性肾损伤评估中的作用
编辑人员丨2024/7/6
目的 探讨血清微小RNA(miRNA)-124-3p和miR-495-3p水平在脓毒症严重程度和急性肾损伤(AKI)评估中的作用.方法 选取2021年1月至2023年1月在该院收治的157例脓毒症患者,根据脓毒症诊断标准,分为脓毒症组(93例)和脓毒症休克组(64例);根据是否出现脓毒症相关AKI,分为AKI组(85例)和非AKI组(72例),另外选取同期在该院进行体检的53名体检健康者作为对照组.采用实时荧光定量PCR对各组血清miR-124-3p、miR-495-3p水平进行检测,采用Pearson相关对患者血清miR-124-3p、miR-495-3p水平与病情严重程度的相关性进行分析,比较AKI组、非AKI组的临床资料,采用多因素Logistic回归分析影响患者病情严重程度及AKI发生的相关因素,进一步通过受试者工作特征(ROC)曲线评估血清miR-124-3p、miR-495-3p水平及二者联合对脓毒症发生AKI的诊断价值.结果 脓毒症休克组血清miR-124-3p、miR-495-3p水平均低于脓毒症组、对照组,且脓毒症组低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05).脓毒症休克组急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHE Ⅱ)评分、序贯器官衰竭评分(SOFA)评分均高于脓毒症组,差异均有统计学意义(P<0.05).Pearson相关分析结果显示,脓毒症患者血清 miR-124-3p、miR-495-3p水平与 A-PACHE Ⅱ评分、SOFA评分呈负相关(P<0.05).AKI组血清miR-124-3p、miR-495-3p水平均低于非AKI组(P<0.05).AKI组与非AKI组的年龄、性别构成、体重指数、是否存在高血压、糖尿病、心脏病比较,差异无统计学意义(P>0.05),APACHE Ⅱ评分、SOFA评分、血尿素氮(BUN)、肌酐(Scr)水平比较,差异有统计学意义(P<0.05).多因素Logistic回归分析显示,血清miR-124-3p、miR-495-3p水平是影响AKI发生的保护因素,APACHE Ⅱ评分、SOFA评分、BUN、Scr水平是影响AKI发生的危险因素(P<0.05);血清miR-124-3p、miR-495-3p联合检测脓毒症发生AKI的曲线下面积、灵敏度和特异度分别为0.962、89.41%和97.22%;二者联合检测优于血清miR-124-3p、miR-495-3p单独检测.结论 血清miR-124-3p、miR-495-3p水平与脓毒症严重程度密切相关,且与AKI是否发生有关.
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编辑人员丨2024/7/6
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microRNA基因多态性与血压钠钾反应性的相关性分析
编辑人员丨2024/6/22
目的 探讨miRNA基因多态性与钠钾饮食干预后血压反应性之间的关系.方法 本课题组2004年从中国陕西宝鸡7个村庄的124个家庭中招募514名参与者进行慢性盐负荷试验干预,包括3 d基线期、7 d低盐饮食、7 d高盐饮食和7 d高盐补钾饮食干预.纳入19个miRNA-SNP位点进行分析研究.结果 在钠钾饮食干预过程中,受试者的血压在低盐期呈下降趋势,高盐期呈现上升趋势,而在高盐补钾后,血压则再次下降.在低盐期,miR-210-3p SNP rs12364149与收缩压反应性、舒张压反应性及平均动脉压反应性显著相关,miR-4638-3p SNP rs6601178与收缩压反应性显著相关,而miR-26b-3p SNPrs115254818与平均动脉压反应性显著相关.在高盐干预后,miR-26b-3p SNP rs115254818与收缩压反应性、舒张压反应性及平均动脉压反应性显著相关;miR-1307-5p SNP rs 11191676、rs2292807与收缩压反应性及平均动脉压反应性密切相关;miR-4638-3p SNP rs6601178、miR-210-3p SNP rs12364149以及miR-382-5p SNP rs4906032、rs4143957与收缩压反应性存在显著关联性.此外,在给予补钾干预后miR-26b-3p SNP rs115254818与收缩压反应性、舒张压反应性及平均动脉压反应性关联显著;miR-1307-5p SNP rs11191676、rs2292807以及miR-19a-3p SNP rss4284505与收缩压反应性显著相关.结论 miRNA基因多态性与血压钠钾反应性密切相关,提示miRNA基因可能参与血压盐敏感性及钾敏感性的形成.
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编辑人员丨2024/6/22
