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学龄儿童肥胖与肠道菌群多样性及菌属丰度的关联研究
编辑人员丨4天前
目的:分析学龄肥胖儿童和正常体重儿童肠道菌群多样性差异,识别肥胖儿童肠道特征菌属,为后续相关机制研究和学龄儿童肥胖的防治提供依据。方法:基于2016年在上海市嘉定区某小学建立的研究队列人群,将2016-2018年3年均处肥胖状态的儿童共63名纳入肥胖组,其中男生43名,女生20名。在3年均为正常体重的儿童中,根据年龄、性别和所在班级,将其与肥胖组儿童进行1∶1匹配,共选择63名纳入对照组。采用问卷收集儿童基本信息、饮食状况、母乳喂养等情况,收集两组儿童的粪便样本并进行16S rDNA测序。对质量优化后的测序序列按照97%相似性进行可操作分类单元聚类及物种注释。分析肥胖组和对照组儿童肠道菌群多样性及菌属丰度差异。计算肠道菌群的Ace、Chao1、Shannon、Simpson 4种α多样性指数,并利用主坐标分析,在非加权Unifrac距离和加权Unifrac距离的基础上表示β多样性。使用相似性分析(ANOSIM)比较两组β多样性的差异。利用STAMP软件挑选出两组儿童共有菌属中的差异细菌,并利用广义线性模型(GLM)分析肥胖与α多样性以及显著差异菌属的关联。结果:肥胖组的Ace和Chao1指数低于对照组,差异有统计学意义( P值分别为0.026和0.039),Shannon和Simpson指数差异无统计学意义( P值分别为0.879和0.922)。ANOSIM分析结果显示,两组儿童肠道菌群差异有统计学意义( R>0),但是组别贡献不显著(非加权Unifrac距离: R=0.006, P=0.223;加权Unifrac距离: R=0.010, P=0.134)。在肥胖组的特有菌属中,普雷沃菌属( Prevotella)和八叠球菌属( Sarcina)的相对丰度较高。STAMP分析结果显示,共有菌属中,15个菌属的相对丰度在两组儿童中差异有统计学意义( P<0.05)。GLM分析结果显示,在调整年龄、性别、SBP、饮食频次、近一周内抗生素使用情况、分娩方式、母乳喂养时间后,与对照组儿童相比,肥胖组的Ace指数和阿克曼菌属( Akkermansia muciniphila)的相对丰度显著较低,粪球菌属( Coprococcus_3)、瘤胃球菌属( Ruminococcus)、不动杆菌属( Agathobacter)、柯林斯菌属( Collinsella)的相对丰度较高。根据性别分层之后,在肥胖男生中,发现Chao1指数低于正常体重男生。但是,在肥胖女生中,仅发现粪球菌属高于正常体重女生。 结论:与正常体重儿童相比,肥胖儿童肠道菌群α多样性较低、优势益生菌属相对丰度较低,但是与代谢紊乱、炎症促进、胆固醇降低有关的菌属相对丰度较高。
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编辑人员丨4天前
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滇产单子叶植物的多样性格局与保护
编辑人员丨2024/3/30
探讨云南不同地理单元的物种、特有种、受威胁物种的组成及其系统发育多样性的变化,为云南生物多样性保护及资源可持续利用提供科学基础.在完善云南单子叶植物物种数据库的基础上,使用物种丰富度、加权特有性、受威胁程度、系统发育多样性、系统发育特有性、进化特异性全球濒危度指数等指标,揭示云南单子叶植物的空间分布格局,并整合自然保护地的分布,确定云南生物多样性保护的关键区域.结果表明:云南单子叶植物的物种丰富度与系统发育多样性、加权特有性与系统发育特有性、受威胁指数与进化特异性全球濒危度指数均显著(P<0.001)正相关;西北部、南部和东南部具有最高的物种组成和系统发育组成多样性和特有性;除西北部和东南部,其他区域的标准化系统发育多样性均较高;云南西北部、南部和东南部是单子叶植物的重点保护区域,采取有效措施加以保护,将有助于维持该地区生物多样性的进化历史和进化潜能.
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编辑人员丨2024/3/30
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新疆猪毛菜属植物多样性地理分布格局及其环境解释
编辑人员丨2023/11/25
猪毛菜属(Salsola)是新疆干旱区分布最为丰富的被子植物属之一,是盐碱和荒漠区的先锋种和建群种,对西北干旱区植被恢复与建设具有巨大生态价值.基于新疆自然分布的 33 种猪毛菜属物种共 741 个分布数据,整合利用点格局法和物种分布模型法构建了物种丰富度(SR)、加权特有性指数(WE)和校正加权特有性指数(CWE)的分布格局.选取环境能量、水分可获得性、气候季节性、生境异质性、土壤条件和历史气候变化共 6 类 19 种生态因子,利用地理加权回归模型(GWR)探究了环境异质性对猪毛菜属物种丰富度的影响.结果显示:(1)基于现实点位模型和物种分布模型构建的物种丰富度具有一致性,均呈北高南低、西高东低的破碎化分布趋势,但物种分布模型的结果在空间上比点格局法更连续,物种丰富度的高值区主要分布于准噶尔盆地南缘、准噶尔西部山地、天山西端和天山南脉南缘;(2)加权特有性指数和校正加权特有性指数的分布格局与物种丰富度分布格局具有一定差异,其最大值集中分布于准噶尔盆地南缘、伊犁河谷和塔里木盆地西南缘;(3)GWR模型结果表明,海拔变幅、土壤酸碱度和最干月降水量是制约新疆分布的猪毛菜属丰富度和特有性分布的最重要因素.
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编辑人员丨2023/11/25
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尾叶樱桃天然种群叶表型性状变异研究
编辑人员丨2023/8/6
为揭示中国特有植物尾叶樱桃(Cerasus dielsiana)在现代核心分布区天然种群的叶表型地理变异规律及其生态适应性特征,该研究通过多重比较、巢氏方差分析、相关性分析、主成分分析(PCA)、主坐标分析(PCoA)、非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类分析等数理方法,对来自四川、湖北、湖南、江西、台湾5省8个尾叶樱桃天然种群的11个叶表型性状进行了比较分析,研究其不同地理单元间叶表型多样性和地理变异规律及对地理气候的响应.结果显示:1)尾叶樱桃主要叶表型性状变异在种群内和种群间均存在显著差异,平均变异系数为22.44%,其中变异系数最大和最小的分别为叶面积(50.83%)与一级侧脉数(7.96%);平均叶表型性状的分化系数为30.78%,种群内的变异(51.55%)大于种群间的变异(22.55%).2)PCA表明对尾叶樱桃叶表型性状变异起主要贡献作用的前三大主成分累计贡献率达到92.400%,可以综合概括和排序为“大小性状”(73.242%)与“形状性状”(19.158%).3)叶宽(r=-0.641)、叶面积(r=-0.658)和一级侧脉数(r=0.659)性状均与经度呈显著负相关或正相关关系,气温季节变化和最湿季降水量对叶表型性状变异影响较大.4)基于PCoA和UPGMA聚类分析可将8个天然种群划分为4类.尾叶樱桃天然种群叶表型性状变异丰富,在数量上表现出一定的连续性,“大小性状”是性状间变异的主要来源,平均表型分化处于中等程度水平,种群内是叶表型性状变异的主要来源;各种群间表型分化划分结果与地理位置基本一致,在地理空间上呈现以经度为主的梯度变异模式,“气候变异性”与“展叶期降水量”是驱动叶表型性状变异的主要气候因子,推测这是尾叶樱桃在长期进化中与亚热带季风气候环境相适应的结果.
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编辑人员丨2023/8/6
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结直肠癌脑转移的影像学特点
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨结直肠癌脑转移的影像学特点.方法 回顾性分析10例经手术治疗的结直肠癌脑转移病人的影像学和病理学等资料.结果9例病灶MRI T2加权表现为低信号,实性结节状,呈不均匀强化,病变边缘强化明显.1例病人MRI T2加权表现为高信号,囊性,囊壁强化.5例病人术前CT检查提示病变呈不同程度的高密度,周围水肿明显.结论 根据结直肠癌脑转移所特有的MRI T2加权呈现低信号及CT扫描呈高密度的影像学特点,有利于疾病鉴别,对提高临床诊断结直肠癌脑转移有一定帮助.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于系统发育的黄土高原地区木本植物多样性及特有性格局
编辑人员丨2023/8/6
黄土高原地区植被类型多样,森林、草原和荒漠在此交汇并逐渐过渡.由于水热条件限制和人类活动加剧,该地区生态环境脆弱,生物多样性保护面临的形势日益严峻,因此获取该区域物种多样性的空间分布格局并阐明其影响因素成为该地区生物多样性保护的首要任务.本研究首先结合标本采集记录与环境因子,利用物种分布模型获取了293种木本植物的潜在分布区,分析了物种丰富度和物种加权特有性的空间格局.其次,引入系统发育信息,分析系统发育多样性和系统发育特有性的空间格局,并进一步利用环境因子对上述格局分别进行解释.最后,对黄土高原地区的特有中心性质和显著性进行分析.结果 表明,生物多样性热点地区均出现在黄土高原南部水热条件较好的地区,即秦岭和中条山一带.本区域的生物多样性空间格局由年平均降水量和最冷月最低温主导,符合植物区系交汇带的特点.特有中心集中在南部地区和青海省,由南向北分别是古特有中心和混合特有中心,不存在单独的新特有中心.黄土高原地区木本植物起源较为古老,生物多样性格局的形成以来源于热带或亚热带的物种扩散为主,物种的分化不占主导地位.上述结果表明了将植物的进化历史纳入生物多样性保护的重要性.
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编辑人员丨2023/8/6
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不同颈项透明层厚度中位数对孕早期唐氏筛查效能的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨不同颈项透明层(NT)厚度中位数对孕早期唐氏综合征筛查效能的影响.方法 选择我院产前诊断中心11位具有孕早期NT检查资格的超声医师,对23446例单胎妊娠孕妇行NT筛查.NT测值通过英国胎儿医学基金会(FMF)推荐预期中位数转换为NT中位数的倍数(NT-Mom),监测超声医师测量的NT-Mom中位数是否位于0.9~1.1,按NT-Mom中位数所属区间将超声医师分为测量不足组(NT-Mom<0.9)、在控组(NT-Mom 0.9~1.1)、测量过度组(NT-Mom>1.1).再分别用本地中心特有的和NT测量操作者特有的中位数将NT值转换为NT-Mom,观察各组测得的NT-Mom数据分布情况,评估其对唐氏综合征的筛查效能.应用指数加权移动平均(EWMA)质控图分析各组失控率;应用多元Logistic回归分析FMF中位数筛查唐氏综合征的假阳性率与其相关影响因素的关系.结果 23446例胎儿中,21-三体综合征胎儿57例,NT中位数3.40 mm;18-三体综合征胎儿24例,NT中位数5.40 mm;13-三体综合征胎儿6例,NT中位数2.00 mm;Turner综合征23例,NT中位数5.60 mm;其他染色体异常胎儿10例,NT中位数2.25 mm.11位超声医师中,测量不足组2位,在控组6位,测量过度组3位.测量不足组和测量过度组的NT测值使用本地中心特有的中位数转换为NT-Mom后,其中位数所在区间属性不变;而使用操作者特有的中位数转换后,其NT-Mom中位数回归0.9~1.1.唐氏综合征风险截断值为1:250时,FMF、本地中心特有及操作者特有NT中位数对唐氏综合征的检出率分别为77.19%、77.19%、78.95%,差异无统计学意义;假阳性率分别为6.58%、6.23%、6.43%,差异有统计学意义(P<0.05).多元Logistic回归分析显示,以唐氏综合征筛查风险值1:250为截断值,FMF中位数的假阳性率与操作者特有的NT-Mom、EWMA失控率及妊娠年龄均有关,OR值分别为453.72(95%CI:108.05~1922.97)、1.39(95%CI:1.10~1.75)、1.30(95%CI:1.28~1.31).结论 使用NT操作者特有的中位数可一定程度上降低NT测量结果的变异性,提高NT测值对唐氏综合征的筛查效能,保持适当的NT筛查效能需要持续监测超声操作者的检测质量.
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编辑人员丨2023/8/6
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藏药解吉那保基原植物粗茎秦艽品种鉴定及种内遗传多样性分析
编辑人员丨2023/8/5
藏药“解吉那保”(()),能消肿,治白喉等.基于民族药物学考察、自然分布区广泛取样(6省区20个居群163株个体),结合模式标本查阅与形态学比较,将其主流品种之一鉴定为龙胆科龙胆属Gentiana粗茎秦艽Gentiana crassicaulis.粗茎秦艽,我国特有物种,仅在西藏、云南、四川、贵州、青海及甘肃等省区有分布,多见于海拔2 100~4 500m的高山草甸、林下及林缘.应用AFLP技术,以龙胆科花锚属椭圆叶花锚Halenia elliptica及龙胆属近缘种麻花艽G.straminea为外类群,构建DNA指纹谱.从64对引物组合中筛选出12对,共扩增出315个条带,其中多态性条带254条,占比为80.63%.粗茎秦艽种内遗传多样性丰富,遗传变异主要存在于居群间(87%),居群内部遗传变异较小(13%).非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)聚类树物种间拓扑结构与经典分类学观点相一致;物种内分为两大支:支I由西藏、甘肃、青海及四川各居群组成,支Ⅱ由贵州及云南各居群组成.PCA分析及Mantel检验等均表明粗茎秦艽居群间遗传距离与空间地理距离具有显著的正相关关系.同时,结合SSR与SNP标记,探讨了四川康定县居群S1的分化问题.本工作可为藏药“解吉那保”种质资源保护、药材生药学鉴定及道地性探究等提供基础资料.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于层次分析-熵权法的中药质量标志物量化辨识方法研究——以芍药甘草汤为例
编辑人员丨2023/8/5
中药质量标志物是近年来中药质量研究的热点,虽有较多相关探讨与研究实践,但如何科学合理地表征质量标志物仍未有突破性进展.本文尝试建立了基于层次分析(analytic hierarchy process,AHP)-熵权法的中药质量标志物辨识方法,在构建涵盖目标层、要素层、控制层的评价体系基础上,首先采用AHP法对中药成分有效性、可测性、特有性3个核心质量属性进行权重分析,其次对各属性下的具体指标基于文献和实验数据应用熵权法进行分析,得到各具体指标的权重后加权计算各成分的综合评分并排序,从而确认中药质量标志物.采用该方法以解痉止痛经典名方芍药甘草汤为例进行研究,结果发现其质量标志物重要性排序靠前的8个成分为:芍药苷>槲皮素>芍药内酯苷>甘草酸>柚皮素>甘草苷>氧化芍药苷>苯甲酰芍药苷,为相关方剂质量标准建立与全程质量控制提供了重要支撑.该研究也为中药质量标志物的量化评价与精准辨识提供了创新思路与方法.
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编辑人员丨2023/8/5
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西南地区壳斗科物种丰富度和特有性分布格局模拟及其环境解释
编辑人员丨2023/8/5
如何准确地模拟物种宏观丰富度格局和特有性中心是生物多样性保护工作的重点,也是生物地理学的热点话题.西南地区是我国壳斗科植物最丰富的地区之一,但物种多样性格局及环境驱动机制尚不清楚.本研究基于西南地区161种壳斗科植物7258个分布点位数据,利用点格局法和物种分布模型两种方式构建了物种丰富度、加权特有性指数和校正加权特有性指数的分布格局,并采用空间自回归模型(SAR)分析上述3个多样性指数与环境因子间的关系.总体上看,物种分布模型模拟的3个指数在空间上比点格局法更为连续,但数值高低分布情况具有相似性:两种方式模拟的物种丰富度高值区主要分布在滇南边缘、桂北部和桂西南部地区(62~89种);加权特有性指数最大值集中在滇南和桂西地区(1.77~5.02);藏东南、秦岭-大巴山、桂西南部和滇东南地区具有最高的校正加权特有性指数(0.07~0.17).SAR模型结果显示:最干月降雨量、温度季节性变化标准差、海拔变幅和土壤有机碳含量对物种丰富度的影响均显著,最干月降雨量、温度季节性变化标准差、潜在蒸散量和海拔变幅对加权特有性有着显著影响,温度季节性变化标准差、最干月降雨量、历史温度变化、增强型植被指数变异系数和海拔变幅对校正加权特有性的影响显著;SAR模型对物种丰富度、特有性指数和加权特有性指数的拟合效果(R2= 0.857、0.733、0.593)分别优于普通线性模型(R2 =0.689、0.425、0.422).综上,水分可获得性、气候季节性、生境异质性、历史气候变化和土壤状况是制约西南地区壳斗科丰富度和特有性分布的最重要因素.滇南、滇东南、桂西南、桂西、秦岭-大巴山以及藏东南地区是壳斗科物种丰富度中心或特有性中心,应受到重点关注和保护.
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编辑人员丨2023/8/5