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基于UPLC-Q/TOF-MS整合网络药理学的刺五加注射液治疗缺血性脑卒中作用机制研究
编辑人员丨1周前
目的:运用超高效液相色谱-飞行时间质谱联用技术(UPLC-Q/TOF-MS)整合网络药理学研究刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的物质基础及潜在作用机制。方法:利用UPLC-Q/TOF-MS鉴定刺五加注射液的化学成分,通过Swiss Target Prediction、GeneCards和OMIM数据库预测刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的潜在作用靶点,利用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,通过Omicshare平台对治疗靶点进行GO和KEGG富集分析,运用Autodock软件进行分子对接。结果:分析鉴定了刺五加注射液中53种成分,并以此为基础得到刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的相关靶点189个及10个核心靶点,反向筛选发现刺五加注射液中的25个成分可能是治疗缺血性脑卒中的主要有效成分;KEGG富集结果显示,刺五加注射液可能主要通过调节PI3K-Akt信号通路来治疗缺血性脑卒中。结论:刺五加注射液治疗缺血性脑卒中的作用机制可能与抑制炎症反应、抗氧化应激、促进血管新生和保护神经细胞等作用有关。
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编辑人员丨1周前
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双样本双向孟德尔随机化法分析人免疫细胞与增生性瘢痕之间的因果关系
编辑人员丨1周前
目的:运用双样本双向孟德尔随机化法,探讨人免疫细胞与增生性瘢痕(HS)之间的因果关系。方法:该研究基于双样本双向孟德尔随机化(MR)法,分别从全基因组关联分析catalog数据库和FinnGen数据库获取731种人免疫细胞与HS的数据集。设置显著阈值,筛选与免疫细胞及HS显著相关的单核苷酸多态性(SNP)并排除弱工具变量偏倚的影响。采用逆方差加权(IVW)法[同时采用错误发现率(FDR)中的Benjamini-Hochberg法校正其 P值]初步检测免疫细胞与HS的因果关系并筛选与HS有显著因果关系的免疫细胞。进一步地,采用双样本MR分析的5种方法:IVW法、加权中位数法、简单模式法、加权模式法和MR-Egger法绘制散布图检测筛选出的免疫细胞与HS的因果关系。针对符合假设的免疫细胞SNP,进行Cochran Q检验评估异质性,进行MR-Egger回归和MR-PRESSO法排除水平多效性,进行留一法分析来评估显著结果是否由单个SNP决定。采用双样本MR分析中IVW法反向检测HS与免疫细胞之间的因果关系。 结果:731种免疫细胞达到显著阈值的SNP数量从7个到1 786个不等,HS中达到显著阈值的SNP数量有119个,这些SNP的 F值均>10,提示具有弱工具变量偏倚的可能性较小。IVW法分析显示,60种免疫细胞与HS具有潜在因果关系( P值均<0.05),经Benjamini-Hochberg法校正后,仅CD45RA和CD39双阳性调节性T细胞(Treg)与HS具有潜在因果关系( PFDR<0.05)。IVW法(比值比为1.16,95%置信区间为1.08~1.24, P<0.05、 PFDR<0.05)、加权中位数法(比值比为1.16,95%置信区间为1.05~1.28, P<0.05)、加权模式法(比值比为1.14,95%置信区间为1.02~1.27, P<0.05)和MR-Egger 法(比值比为1.18,95%置信区间为1.07~1.30, P<0.05)的散布图均显示,CD45RA和CD39双阳性Treg的14个SNP与HS患病风险存在因果关系;仅简单模式法的散布图显示,CD45RA和CD39双阳性Treg的14个SNP与HS患病风险的因果关系不明显( P>0.05)。Cochran Q检验显示,CD45RA和CD39双阳性Treg与HS的因果关系不存在异质性( P>0.05)。MR-Egger回归、MR-PRESSO法分析显示,CD45RA和CD39双阳性Treg与HS的显著因果关系不存在水平多效性( P>0.05)。留一法分析显示,CD45RA和CD39双阳性Treg与HS的显著因果关系在逐个剔除SNP后结果稳定。双样本反向MR分析显示,HS与731种免疫细胞均无潜在因果关系( P>0.05)。 结论:从遗传学的角度揭示,免疫细胞CD45RA和CD39双阳性Treg可能会增加HS患病风险。
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编辑人员丨1周前
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一种新型脉冲神经元模型及其网络的研究
编辑人员丨1周前
目的:提出一种新型脉冲神经元模型及其网络,描述其建模方法,并用计算机模拟验证其性能。方法:在充分考虑生物学适应性(激活电位阈值和不应期开关),及其对尖峰放电脉冲产生及其传导的动态调节机制基础上,在新型脉冲神经元模型中引入了突出后电位多通道滤波器,实现了输出电流及神经元突触强度的动态调节。提出基于自适应最小均方(LMS)的误差反向传播(BP)学习算法,并将其应用于尖峰放电神经网络的调节。结果:在自发噪声下,新型脉冲神经元模型的尖峰放电间期信号直方图满足泊松分布。通过2个新型脉冲神经元的简单连接,可以形成多种复杂的尖峰放电模式。新型脉冲神经元模型具有自发本征噪声的特征,能够形成复杂的周期尖峰放电模式。对于输入噪声控制,该模型的不应期与门限电位适应性参数的稳定性较好。刺激电流-尖峰放电脉冲频率间的线性关系较好。结论:所提出的新型脉冲神经元模型在自发噪声条件下能产生多种模式的振荡和相干振荡,这与生物神经元极其相似,能实现复杂的噪声信号处理。所采用的具有不同频带的多通道突触后电位滤波器,能使一些突触后电位信号变得平稳。所提出的基于于自适应LMS的BP学习算法克服了尖峰放电信号的瞬态变化特性导致的误差驱动学习算法无法应用的问题。
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编辑人员丨1周前
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LncRNA HOX转录反向RNA参与调节低氧下角质形成细胞低氧诱导因子-1α的表达
编辑人员丨1周前
目的:观察LncRNA HOX转录反向RNA(HOTAIR)对低氧条件下角质形成细胞低氧诱导因子-1α(HIF-1α)表达的影响,探讨LncRNA参与瘢痕疙瘩形成的可能机制。方法:2018年1—12月,在中国医学科学院组织工程研究中心取传代培养的HaCat细胞分为常氧组、低氧组、sh-control组、sh-HOTAIR组。常氧组在常氧条件下培养,低氧组在低氧条件下培养,sh-control组转染sh-control后在低氧条件下培养,sh-HOTAIR组转染sh-HOTAIR后在低氧条件下培养。培养24 h后用双荧光素酶检测LncRNA HOTAIR与HIF-1α的作用关系,用蛋白印迹法检测HIF-1α蛋白表达。结果:双荧光素酶检测显示常氧组、低氧组、sh-control组、sh-HOTAIR组荧光素酶相对活性分别为0.94±0.30、20.39±1.15、18.09±0.80、3.04±1.15,其中低氧组高于常氧组( t=29.03, P<0.05),而sh-HOTAIR组低于低氧组( t=18.57, P<0.05),差异均有统计学意义。蛋白印迹法显示低氧组、sh-control组HIF-1α蛋白表达高于常氧组、sh-HOTAIR组,分别为1.19±0.07、1.15±0.06、0.56±0.29、0.37±0.38。 结论:LncRNA HOTAIR参与低氧条件下角质形成细胞HIF-1α表达上调,LncRNA HOTAIR可能通过HIF-1α途径参与瘢痕疙瘩形成。
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编辑人员丨1周前
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环状RNA在眼底疾病中的研究进展
编辑人员丨1周前
环状RNA(circRNA)是一类通过反向剪接生成的新的内源性非编码RNA,具有miRNA"海绵"、调节转录和剪接、调节蛋白之间的相互作用等功能。最近的研究表明,circRNA在视网膜微血管功能障碍、糖尿病视网膜病变、老年性黄斑变性、增生性玻璃体视网膜病变、高同型半胱氨酸血症所致眼病和眼部恶性肿瘤等眼底疾病的发生和发展过程中发挥着重要作用。在病理状态下,circRNA的差异性表达改变了相应基因的转录和翻译,从而改变细胞的活性和功能。CircRNA可能成为眼底疾病新的标志物和预后指标,其靶向干预也可能成为眼底疾病潜在的治疗方法。
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编辑人员丨1周前
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环状RNA在非小细胞肺癌发生发展和诊疗作用中的进展
编辑人员丨1周前
非小细胞肺癌是肺癌中最常见的一种类型,其病死率位居首位。非小细胞肺癌的发生发展与多基因调节有关。环状RNA是一种反向拼接而成的非编码RNA,在许多类型的生物细胞中均有广泛表达。环状RNA缺乏5′和3′末端,与线性RNA相比,环状RNA对核酸外切酶和核糖核酸酶具有更好的稳定性。随着高通量测序和生物信息学技术的发展,越来越多的环状RNA与肿瘤的相关性逐渐被认识。现就环状RNA在非小细胞肺癌发生发展和诊疗中的作用进行相关综述,旨在为进一步研究其机制提供新的思路。
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编辑人员丨1周前
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ATP1通过调节氧化应激促进白念珠菌逃逸巨噬细胞杀伤的研究
编辑人员丨1周前
目的:通过反向遗传学方法,探索白念珠菌F1Fo-ATP合酶α亚基编码基因(ATP1)通过清除细胞内活性氧以逃逸巨噬细胞杀伤的生理作用。方法:以白念珠菌ATP1缺失株及其亲本株为研究对象,接种平板培养后计算菌落数评估其体外细胞活性,通过尾静脉接种小鼠后计算肾脏组织形成菌落数评估体内细胞活性。将培养过夜的白念珠菌菌液与巨噬细胞共培养后,接种平板,计算菌落数,测定菌的存活率,通过乳酸脱氢酶释放法测定巨噬细胞乳酸脱氢酶水平;以过氧化氢建立模拟巨噬细胞内氧化应激模型,过氧化氢作用白念珠菌后,通过计算菌落数比较各菌株细胞活性,采用DCFH-DA染色测定细胞内活性氧水平,实时荧光定量PCR检测过氧化氢酶1(CAT1)基因、超氧化物歧化酶4(SOD4)基因和超氧化物歧化酶5(SOD5)基因mRNA水平。采用双因素方差分析或Student t检验对数据进行统计学分析。 结果:在体外,亲本株组和ATP1缺失组菌落数随培养时间逐渐增多,24 h后ATP1缺失组菌落数仅为亲本株组的10%,差异有统计学意义( F = 481.84, P < 0.001)。在小鼠体内,亲本株组肾脏组织形成菌落数随时间逐渐增多,但是ATP1缺失组逐渐减少,两组差异有统计学意义( F = 78.27, P = 0.001)。与体内实验结果一致,体外白念珠菌菌体与巨噬细胞共培养后,ATP1缺失组白念珠菌存活率(62.67 ± 3.51)%比亲本株组(82.33 ± 2.52)%显著降低( t = 7.88, P = 0.001),与ATP1缺失组共培养的巨噬细胞乳酸脱氢酶释放百分比(27.80 ± 3.54)%比与亲本株组共培养的巨噬细胞(87.78 ± 0.17)%显著降低( t = 33.89, P < 0.001)。在模仿的巨噬细胞内氧化应激模型中,ATP1缺失组细胞活性比亲本株组显著降低,差异有统计学意义( F = 3 440.65, P < 0.001)。在与巨噬细胞共培养以及模仿的巨噬细胞内氧化应激模型中,ATP1缺失组细胞内活性氧水平均比亲本株组显著增高,差异有统计学意义(均 P < 0.001)。ATP1缺失组CAT1、SOD4、SOD5 mRNA水平均比亲本株组降低,差异均有统计学意义(均 P < 0.001)。 结论:ATP1缺失可能分别通过下调氧化应激和活性氧清除相关基因表达,使白念珠菌抵抗氧化应激和清除活性氧的能力明显减弱,最终不能逃逸巨噬细胞杀灭而被宿主清除。
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编辑人员丨1周前
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自发性早产胎盘组织差异表达基因cDNA文库的构建及初步分析
编辑人员丨1周前
目的:构建自发性早产产妇胎盘与足月产妇胎盘差异表达基因cDNA文库,初步分析自发性早产可能的分子机制。方法:选取50例足月健康产妇胎盘和50例自发性早产产妇胎盘组织,提取胎盘组织总RNA,采用抑制性差减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建相应的cDNA差减文库,进行克隆测序,所得结果通过Blast软件与Genbank中的已知核苷酸序列进行查询和同源性比对,分析可能和早产发生相关的分子机制。结果:从正向及反向文库中随机挑选出200个克隆,进一步筛选出80个差异表达基因片段。生物信息学方法分析显示,两组差异表达基因功能涉及先天免疫、炎症、激素调节、营养代谢、应激及凋亡等方面。结论:早产产妇胎盘组织中存在与先天免疫、炎症、激素调节、营养代谢、应激及凋亡等相关的基因表达变化,其中 GGT2基因很可能是1个新的导致自发性早产发生的基因,其具体调控机制有待进一步深入研究。
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编辑人员丨1周前
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基层中医药健康管理服务质量影响因素模型构建及政策建议
编辑人员丨1周前
目的:构建基层中医药健康管理服务质量影响因素模型,并提出相应的政策建议。方法:本研究为横断面研究,采用典型抽样和随机抽样相结合的方法,于2022年8—10月抽取浙江省15个社区39名基层中医药健康管理服务知情人,针对服务开展项目、实施效果和影响因素进行访谈,基于扎根理论研究方法对访谈记录进行三级编码,根据编码后结果构建基层中医药健康管理服务质量影响因素模型,并提出相应的政策建议。结果:对39份原始访谈资料进行开放式编码,共获得516个参考点,形成了与主题相关的53个初始概念,并归纳为17个一级范畴。通过主轴编码进一步归纳,提取出“政策环境”“健康素养”“社区定位”“能力建设”“健康偏好”“利益冲突”6个主范畴,通过选择式编码分析6个主范畴之间的逻辑关联,以服务质量影响因素的故事线为基础构建了影响因素模型。该模型的故事线为:首先,政策环境是服务质量的外部保障;其次,作为服务需求侧,居民的健康素养、健康偏好是服务质量的调节因素;最后,社区作为服务供给侧,服务能力是关键影响因素,社区职能和目标定位是内驱因素,内/外部利益冲突则对服务质量起到反向制约作用。结论:现阶段对基层中医药外部政策环境保障力度有限,服务需求侧重视不足,服务供给侧功能也存在缺位,应进一步完善外部政策环境,深化中医药服务领域的供需对接,持续推进基层中医药服务能力建设,平衡中医药相关部门利益,进而提升服务质量。
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编辑人员丨1周前
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环状RNA在DNA损伤修复中作用的研究进展
编辑人员丨1周前
环状RNA (CircRNA)是一类由外显子、内含子或基因间区经反向剪接形成的非编码RNA,具有种类丰富、序列保守、结构稳定和细胞组织特异性等特点。CircRNA在多种恶性肿瘤中处于失调状态,其可通过调节放化疗后细胞DNA双链断裂的损伤修复功能,使肿瘤细胞发生增殖失控、远处转移和凋亡受阻等一系列不良反应,进而影响治疗效果和预后。笔者综述了CircRNA的分子生物学特性及其在DNA损伤修复(特别是DNA双链断裂损伤修复)中发挥的作用,并对CircRNA在肿瘤患者的治疗、预后和减轻放化疗产生的不良反应等方面可能发挥的作用进行展望。
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编辑人员丨1周前