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复杂网络分析技术在阿尔兹海默症患者脑结构和功能影像中的应用进展
编辑人员丨6天前
对复杂网络分析技术在阿尔兹海默症(AD)脑影像研究中的应用进展进行综述,总结分析该技术在揭示AD患者脑结构和功能异常等方面的研究成果,并探讨其在AD早期诊断和病程监测中的潜在价值,以及当前研究的局限性和挑战,并总结未来研究方向,包括新网络分析技术开发、多模态影像数据整合及机器学习技术等.
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编辑人员丨6天前
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基于数据挖掘和知识图谱探析路志正治疗干燥综合征用药的隐形知识与"顾润燥,纳化常"学术思想
编辑人员丨6天前
目的 运用数据挖掘和知识图谱技术探讨国医大师路志正治疗干燥综合征用药的隐形知识.方法 收集 2009-2019年国医大师路志正治疗干燥综合征的医案,运用频数分析、关联规则、聚类分析和知识图谱对医案进行数据挖掘.结果 本研究共纳入 148 首处方,涉及中药441 味.患者证型中气阴两虚证约占全部病例的66.67%,非气阴两虚证占 33.33%.常用药物的药性以平、微寒、微温为主,药味以甘、苦、辛为主,药物主要归肺经、脾经和胃经.药物分类主要为补气药、补阴药.关联规则分析得到药对麦芽-谷芽、六神曲-山楂、麦芽-谷芽-甘草、龙骨-牡蛎等.复杂网络分析显示处方呈现 7 个类别.选取较能体现学术思想特色用药的苍术为例,在"风湿病'病-证-方(药)'知识图谱系统"中进行可视化分析.结论 国医大师路志正在治疗干燥综合征的过程中,"顾润燥,纳化常"这一学术思想贯穿始终,他强调从顾护津液、燥湿互济论治,用药时注重调整脏腑、益气养血、滋阴润燥,且不忘舒畅情志.
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编辑人员丨6天前
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多组学技术阐明创伤后脓毒症发病机制的作用研究进展
编辑人员丨6天前
脓毒症是一种机体对感染反应失调的全身炎症反应综合征,具有持续感染、过度炎症和免疫抑制等特点,通常会导致器官功能障碍进而危及生命,是创伤后常见的并发症。由于创伤后脓毒症的病因、病程进展、预后等因素错综复杂,目前其发病机制尚不明确。多组学技术可将两个及以上的单一组学联合起来进行全面综合分析的技术,能够从多角度、多方面揭示疾病相关分子间相互作用网络,对创伤后脓毒症发病机制解析具有重大意义。为此,笔者从基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学及多组学技术联合等方面就多组学技术对阐明创伤后脓毒症发病机制作用的研究进展进行综述,为创伤后脓毒症的研究方法提供参考。
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编辑人员丨6天前
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基于复杂网络社团分析探讨《医宗金鉴》治疗便秘核心用药规律
编辑人员丨6天前
目的:利用数据挖掘技术探讨《医宗金鉴》治疗便秘的核心用药规律,为临床治疗便秘提供思路。方法:整理《医宗金鉴》有关便秘的方剂,采用中医传承云计算平台V1.0对数据集进行频次统计、性味归经及功效统计、关联分析和复杂网络分析,并进行可视化展示。结果:纳入治疗便秘方剂106首,涉及中药169味,总频次894次,高频中药有大黄、甘草、黄芩、当归等,以泻下药、补虚药、清热药为主,药味以辛、甘、苦为主,药性以寒、温为主,归经以肺、脾、胃、肝经为主。根据关联规则支持度,二阶关联分析得出大黄-黄芩、大黄-芒硝等10个药物组合,三阶关联分析得出大黄-当归-甘草,黄芩-黄连-大黄等9个药物组合,社团聚类分析得出12类聚类方。结论:《医宗金鉴》治疗便秘用药遵循“温、清、补”思想,以通降法为主,以温中补虚、清热通便为基本治法,寒温并用,脏腑辨治。临证应以病为纲,辨证施治。
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编辑人员丨6天前
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加强临床监测智能化研究 提升患者围麻醉手术期安全性
编辑人员丨6天前
临床监测技术体现了现代医学与生物工程、电脑技术与新材料的完美结合。医学发展与时代科技进步息息相关,临床监测技术更是现代医学与科技完美结合的载体之一 [1]。既往的监测技术不断改进,无线智能监测和人工智能技术等脱颖而出,应用领域正在逐步扩大,极大地丰富了临床监测的内涵,如传统的血氧测量技术改进为数字化血氧测量技术,通过复杂的信号处理系统,提高对动脉灌注信号获取和静脉噪声隔离的水平,使脉搏氧饱和度监测的抗运动干扰性能以及获取弱灌注条件下信号的能力显著提高;超声可视化技术在围麻醉手术期的应用,让麻醉科医师多了"一只眼睛",使血管穿刺置管和区域神经阻滞操作又准又快;经食道超声心动图监测使无数患者心脏手术效果得到了及时评估,并发症得到了及时处理;听觉诱发电位指数和脑电双频谱指数在镇静麻醉深度监测中得到广泛应用;机体、器官组织氧供需平衡监测使危重患者的抢救和治疗得到更直接的指导;新型凝血监测技术使临床对凝血功能障碍的判断和处理更为及时准确。同时网络信息化、人工智能(AI)、虚拟现实(VR)技术进入临床监测领域,使监测大数据信息获取和智能化分析更加完善。
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编辑人员丨6天前
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基于串联质谱标签定量蛋白质组学技术筛选糖尿病足皮肤抗菌肽的可行性和价值
编辑人员丨6天前
目的:探讨基于定量蛋白质组学串联质谱标签(TMT)技术筛选糖尿病足皮肤抗菌肽的可行性和价值。方法:收集2017年4月至2018年12月在东南大学附属中大医院行清创手术的糖尿病足患者的下肢溃疡周围皮肤全层和同期行其他手术非糖尿病患者的下肢皮肤全层标本各3例患者标本。利用TMT技术分别对上述标本进行蛋白组学分析,筛选出发生显著变化的差异蛋白。搜索UniProt-GOA数据库对鉴定到的差异蛋白生物学作用阐释。以鉴定到的蛋白为背景,利用Fisher精确检验法评价差异表达蛋白。利用InterPro数据库分析差异表达蛋白功能结构域的富集情况。结果:共发现133个差异蛋白,其中表达上调和下调的蛋白分别为101个和32个。基因本体(GO)富集分析表明,在蛋白生物学过程中最显著富集的过程为对细菌的防御过程,其次为抗菌体液反应过程。共有19个蛋白涉及对细菌的防御反应过程,其中18个蛋白发生了上调,1个蛋白发生了下调。差异蛋白上调倍数达4倍以上的共有8个,分别为蛋白为溶菌酶C、中性粒细胞弹性蛋白酶、杀菌渗透性增加蛋白、乳铁蛋白、膜相关磷脂酶A2、肽聚糖识别蛋白1、免疫球蛋白J链和蛋白S100-A12。共有8个蛋白涉及抗菌体液反应过程,其中7个蛋白与对细菌的防御反应中涉及的蛋白重叠。通过蛋白互作分析显示,差异表达的抗菌反应蛋白形成了一个包含14个节点和34条边的复杂调控网络,平均节点度为4.86,聚类系数为0.652。结论:通过TMT标记蛋白组学技术发现,参与对细菌的防御反应及抗菌体液免疫反应的差异蛋白,如溶菌酶C、中性粒细胞弹性蛋白酶、杀菌渗透性增加蛋白、乳铁蛋白、膜相关磷脂酶A2、肽聚糖识别蛋白1、免疫球蛋白J链和蛋白S100-A12,有望成为治疗糖尿病足感染的新靶点。
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编辑人员丨6天前
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单细胞测序技术在骨肉瘤中的研究进展
编辑人员丨6天前
骨肉瘤是起源于骨组织的高度恶性肿瘤,具有病死率高、预后差的特点。肿瘤微环境的异质性是影响骨肉瘤发生发展及预后的关键。单细胞测序技术通过鉴定骨肉瘤组织中的肿瘤细胞、免疫细胞和基质细胞的功能特征和基因表达模式,描绘了细胞间复杂的交互网络,是解析肿瘤微环境异质性的重要手段。应用单细胞测序技术的高分辨率优势,在骨肉瘤组织中鉴定了SPP1(+)巨噬细胞、C1QC(+)巨噬细胞和CLEC11A(+)B细胞等新的细胞亚型,它们在肿瘤微环境中起着促进肿瘤生长和侵袭的作用。通过对骨肉瘤干细胞亚群的鉴定,推测SERPINA1_CSCL1、FUS_CSCL2和SPP1_CSCL3这三群干细胞可能是骨肉瘤细胞的起源。运用单细胞测序发现mregDCs通过特异性表达CCR7、CCL17、CCL19和CCL22因子从而招募Treg细胞,促进免疫逃逸和肿瘤进展。此外,单细胞测序技术通过鉴定骨肉瘤耐药的潜在靶点,基于此建立耐药风险评分模型,为制定个性化的化疗方案提供依据。在疾病的预后方面,单细胞测序技术识别了骨肉瘤中与免疫浸润相关的基因(如 EPHX2、 FDPS、 GBP1、 MMD和 ZYX),并以此构建了骨肉瘤的预后分析模型,对预测患者的预后具有指导意义。
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编辑人员丨6天前
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基于古今医案云平台探讨邵念方治疗老年期痴呆肾虚髓亏证用药规律
编辑人员丨6天前
目的:基于数据挖掘技术探讨邵念方教授治疗老年期痴呆肾虚髓亏证的组方用药规律。方法:收集2014年1月1日-2019年10月31日邵老于山东中医药大学附属医院老年医学科住院经诊治的老年期痴呆病肾虚髓亏证患者医案,通过医院电子病历系统进行处方统计,运用古今医案云平台(V1.2.4)对纳入处方的用药进行用药频次、药性药味、归经功效分析,关联规则分析,聚类分析和复杂网络分析。结果:共纳入医案110个,涉及中药238味,使用频次前10的中药依次为茯苓、石菖蒲、酒萸肉、山药、熟地黄、益智仁、生地黄、黄芪、川芎、白术;药性以平、温、微寒、寒为主;药味以甘、苦、辛、淡为主;归经以脾、肝、肺、肾经为主;功效以利水渗湿、清热活血、宁心、清热解毒、化湿开胃、健脾为主;关联分析结果发现,使用频次超过25次的药物组合有15组,分别是:酒萸肉-茯苓、酒萸肉-山药、山药-酒萸肉、熟地黄-酒萸肉、山药-茯苓、黄芪-茯苓、泽泻-茯苓、牡丹皮-茯苓、熟地黄-茯苓、生地黄-茯苓、远志-石菖蒲、牡丹皮-酒萸肉、牡丹皮-山药、泽泻-酒萸肉、泽泻-山药;聚类分析发现4组新处方,第1组为茯苓、生地黄、熟地黄、泽泻、牡丹皮、酒萸肉、山药,第2组为石菖蒲、肉苁蓉、巴戟天,第3组为益智仁、川芎、炙甘草;第4组为白术、党参、黄芪、当归;复杂网络分析结果显示,核心组方为六味地黄丸加减。结论:针对老年期肾虚髓亏证痴呆,邵老重视扶正,治疗以补虚为中心,兼顾利水、清热、解毒、化瘀、开窍之法。研究新发现的四组新处方,可为今后辨证加减药物提供参考。
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编辑人员丨6天前
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不同宫颈病变女性阴道菌群特征变化及菌群间相互关系分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨不同宫颈病变女性阴道菌群的特征变化及菌群间的相互关系。方法:选取2018年1—6月于山西医科大学第二医院就诊、经病理学确诊宫颈病变的女性,其中正常宫颈(NC)41例,低度宫颈上皮内瘤样变(CIN 1)39例,高度宫颈上皮内瘤样变(CIN 2/3)37例,宫颈鳞状细胞癌(SCC)15例。应用16S rDNA测序技术对阴道分泌物中的阴道菌群进行检测,采用共生网络分析菌群间的Spearman相关关系。结果:NC、CIN 1和CIN 2/3患者优势菌均为乳酸杆菌属[构成比分别为79.4%(1 869 598/2 354 098)、63.6%(1 536 466/2 415 100)和58.3%(1 342 896/2 301 536)],嗜胨菌属[20.4%(246 072/1 205 154)]为SCC患者的优势菌。随着宫颈病变的加重,阴道菌群多样性呈升高趋势(Shannon指数 F=6.39, P=0.001;Simpson指数 F=3.95, P=0.012),乳酸杆菌属构成比逐渐降低,嗜胨菌属、纤毛菌属、普雷沃菌属等厌氧菌构成比逐渐增加,特征菌(LDA分值>3.5)由乳酸杆菌属演变为以嗜胨菌属、拟杆菌属、卟啉单胞菌属等为代表的厌氧菌。选取相对丰度居前10位、Spearman相关系数>0.4且 P<0.05的菌属经共生网络分析,结果显示,在不同阶段宫颈病变组中,普雷沃菌属、嗜胨菌属、卟啉单胞菌属、厌氧球菌属、纤毛菌属、奇异菌属、加德纳菌属、链球菌属等厌氧菌属之间呈正相关,而乳酸杆菌属与多种厌氧菌属呈负相关,尤其在CIN 1患者中阴道菌群间关系最为复杂,在SCC患者中仅嗜胨菌属与乳酸杆菌呈负相关。 结论:阴道菌群多样性增加、菌群间相互关系改变与宫颈病变密切相关,嗜胨菌属对宫颈病变的诊断及预测预警具有重要意义。
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编辑人员丨6天前
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空间转录组技术在非小细胞肺癌研究中的应用及展望
编辑人员丨6天前
非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是全球最常见的肿瘤之一,其组织中分子成分的复杂性以及细胞异质性使得临床治疗进展缓慢。近年来,单细胞测序技术在肿瘤异质性的研究中应用广泛,但其技术本身有着无法忽视的缺陷。区别于单细胞测序对组织的机械分离或酶解消化成单细胞悬液的实验过程,空间转录组(spatial transcriptome,ST)技术对组织进行原位转录组测序,实现对组织细胞进行高通量转录组分析的同时,保留细胞的原始位置信息,从而在不破坏细胞间通讯网络的基础上获得组织中不同区域的细胞构成和基因表达状态。本文对应用于肿瘤样本分析的ST技术及其在NSCLC领域的最新进展进行综述,旨在获得对NSCLC空间异质性的新见解。
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编辑人员丨6天前
