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基于微小RNA测序技术的儿童扩张型心肌病的诊断学研究
编辑人员丨1周前
目的:研究血清中微小核糖核酸(miRNA)的特异性表达与儿童扩张型心肌病(DCM)发生的相关性。方法:收集2013年11月至2016年3月就诊于北京安贞医院小儿心脏中心且被确诊为DCM的儿童血清(DCM组,16例)及同期于北京安贞医院体检的年龄性别匹配的健康儿童血清(健康对照组,12例),并进行miRNA测序。后期扩大样本量(DCM组扩大为30例,对照组扩大为16例),对测序结果中有统计学意义的11种miRNAs行实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证。结果:血清miRNA测序结果,DCM组患儿较健康对照组儿童有172个miRNAs上调(fold change>2, P<0.001),未发现下调的miRNAs。选择显著上调的top11miRNAs进行qRT-PCR试验验证,发现DCM组患儿血清中8个miRNAs(let-7f、let-7g、miR142-5p、miR143-3p、miR26a、miR27a-3p、miR27b-3p、miR126-3p)显著上调,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。在诊断DCM的受试者工作特征(ROC)曲线中,血清miR142-5p、miR143-3p、miR27b-3p、miR126-3p的曲线下面积分别为0.983、0.992、0.915、0.950,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:本研究发现4个血清miRNAs(miR-142-5p、miR-126-3p、miR-143-3p和miR-27b-3p)可用来区分DCM患儿和健康儿童。循环miRNAs可作为有效的儿童DCM筛查工具。
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编辑人员丨1周前
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基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
编辑人员丨1个月前
目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制.方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的 miRNA.利用 TargetScan、StarBase、miRDB、miRWalk 4 个数据库预测 miRNA 的靶基因,通过 DAVID 和 Metascape 数据库对靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.运用Cytoscape构建主要信号通路的ceRNA调控网络.结果:测序共检测到14个差异miRNA(均为上调),该差异miRNA的靶基因主要富集在细胞衰老和癌症相关信号通路;构建获得的ceRNA调控网络含47个长链非编码RNA(lncRNA)节点、10个miRNA节点、27个信使RNA(mRNA)节点,该调控网络中 miR-155-5p、miR-132-3p、miR-503-5p、miR-146b-5p 和 miR-212-5p 为排名前 5 的 HUB 基因.结论:本研究通过筛选尿酸盐肾沉积差异miRNA,构建了尿酸盐肾沉积ceRNA网络,为尿酸盐肾沉积机制探讨提供了新思路.
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编辑人员丨1个月前
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胎膜早破合并绒毛膜羊膜炎血清NLRP3、sTNFR-Ⅰ、miR-182水平及其预测价值
编辑人员丨1个月前
目的 探究胎膜早破(PROM)合并绒毛膜羊膜炎(CA)血清NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)、可溶性肿瘤坏死因子受体-Ⅰ(sTNFR-Ⅰ)、微小核糖核酸(miR)-182水平及其预测价值.方法 选取2019年1月-2023年6月天津市第五中心医院收治的PROM合并CA产妇52例为研究组,另选同期收治的PROM未合并CA产妇54例为对照组,研究组根据CA分期分为Ⅰ期组25例和Ⅱ~Ⅲ期组27例.比较研究组和对照组、不同CA分期血清NLRP3、sTNFR-Ⅰ、miR-182水平;Spearman分析PROM产妇血清NLRP3、sTN-FR-Ⅰ、miR-182水平与CA分期的相关性,受试者工作特征(ROC)曲线分析三指标对PROM合并CA的预测价值.结果 与对照组相比,研究组血清NLRP3、sTNFR-Ⅰ、miR-182水平升高(P<0.05);与Ⅰ期组相比,Ⅱ~Ⅲ期组血清 NLRP3、sTNFR-Ⅰ、miR-182 水平升高(P<0.05);血清 NLRP3、sTNFR-Ⅰ、miR-182 水平与 CA 分期呈正相关(P<0.05);血清NLRP3、sTNFR-Ⅰ、miR-182联合检测诊断PROM合并CA的曲线下面积(AUC)比单个指标检测值高(P<0.05),且联合检测的敏感度、特异度为86.54%、90.74%.结论 PROM产妇合并CA血清NLRP3、sTNFR-Ⅰ、miR-182水平呈高表达,三指标与CA分期呈正相关,且三指标联合检测可提高PROM产妇合并CA的预测价值.
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编辑人员丨1个月前
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孕晚期阴道B族链球菌定植患者血清型和ASO、CL-1、miR-125及其对妊娠结局的预测价值
编辑人员丨2024/7/20
目的 探究孕晚期阴道B族链球菌定植患者血清型和抗链球菌溶血素O(ASO)、趋化细胞因子配体1(CCL-1)、微小核糖核酸(miR)-125及其对妊娠结局的预测价值.方法 选取2019年3月-2023年3月53例青岛大学附属青岛市海慈医院(青岛市中医医院)孕晚期阴道B族链球菌定植患者(研究组)和55名正常孕检女性(对照组),研究组根据妊娠结局分为正常组(27例)和不良组(26例);分析孕晚期阴道B族链球菌定植患者的血清型,比较两组血清ASO、CCL-1、miR-125水平及其对孕晚期阴道B族链球菌定植患者不良妊娠结局的预测价值.结果 53例孕晚期阴道B族链球菌定植患者血清型Ⅲ型为最常见,其余分别依次为Ⅰb型、Ⅴ型、Ⅰa型、Ⅱ型,Ⅳ型和NT型最少;与对照组相比,研究组血清ASO、CCL-1、miR-125水平升高(P<0.05);不良组血清ASO、CCL-1、miR-125水平高于正常组(P<0.05);血清ASO、CCL-1、miR-125联合检测对孕晚期阴道B族链球菌定植患者不良妊娠结局的诊断曲线下面积(AUC)值高于单独检测(P<0.05),且联合检测的敏感度为96.15%,特异度为88.89%.结论 孕晚期阴道B族链球菌定植患者常见血清型为Ⅲ型,此类患者血清ASO、CCL-1、miR-125水平高表达,且在妊娠结局不良患者中升高,三者联合检测对孕晚期阴道B族链球菌定植患者不良妊娠结局具有较高的诊断价值.
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编辑人员丨2024/7/20
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miR-27a-3p/PSEN1在七氟烷诱发的神经认知功能障碍中的作用
编辑人员丨2024/7/6
目的 观察miR-27 a-3p在七氟烷诱发的神经认知功能障碍中的作用.方法 生物信息学预测及验证:通过生物信息学数据库预测miR-27a-3p的靶基因,用双荧光素酶报告基因法和蛋白质印迹法验证miR-27 a-3p与靶基因的相互作用.细胞实验:将细胞分为2组,miR-27a-3p干涉对照组转染miR-27a-3p干涉对照质粒,miR-27a-3p干涉处理组转染miR-27a-3p干涉质粒,转染质粒之前先用4%的七氟烷处理6 h.以蛋白质印迹法检测各组SY5Y细胞中微管相关蛋白tau(tau)和磷酸化的tau蛋白(p-tau)的表达水平.动物实验:小鼠被随机分为对照组(不做任何处理)、七氟烷处理组(用4%七氟烷处理)、miR-27a-3p干涉对照组(用4%七氟烷处理后注射miR-27a-3p干涉对照质粒)、miR-27a-3p干涉处理组(用4%七氟烷处理后注射miR-27a-3p干涉质粒).通过水迷宫实验测试小鼠的神经认知能力,用免疫荧光法检测小鼠海马组织中的p-tau水平.结果 生物信息学预测及其验证:生物信息学的预测提示早老素1(PSEN1)可能是miR-27a-3p的靶基因.双荧光素酶报告基因法和蛋白质印迹法表明miR-27a-3p与PSEN1存在相互作用.细胞实验:miR-27a-3p干涉对照组和干涉处理组的p-tau水平分别为0.69±0.08和0.21±0.05.动物实验:对照组、七氟烷处理组、miR-27a-3p干涉对照组和miR-27a-3p干涉处理组的逃逸潜伏时间分别为(27.54±3.67)、(52.38±6.12)、(55.16±5.79)和(38.46±4.78)s,新事物探索指数结果分别为0.78±0.11、0.31±0.07、0.33±0.06 和 0.57±0.08,免疫荧光检测结果显示小鼠海马组织中p-tau水平也显著下降(P<0.05).结论 miR-27 a-3p靶向PSEN1基因调控tau蛋白的磷酸化,干涉miR-27a-3p可缓解七氟烷诱发的小鼠神经认知功能障碍.
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编辑人员丨2024/7/6
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高血压并发冠状动脉粥样硬化性心脏病患者血清miR-27a-3p和HOXC6水平表达与冠状动脉病变的相关性研究
编辑人员丨2024/6/22
目的 探讨高血压并发冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)患者血清微小核糖核酸-27a-3p(miR-27a-3p)和同源异型盒C6(homeobox C6,HOXC6)水平表达与冠状动脉病变的相关性,为高血压并发冠心病的防治提供一定参考.方法 选取北大荒集团总医院2021年6月~2023年6月接诊的246例高血压患者为研究对象,其中129例高血压并发冠心病患者作为并发组,117例单纯高血压患者作为未并发组.采用实时荧光定量PCR(quantitative real time PCR,qRT-PCR)检测血清miR-27a-3p和HOXC6表达水平;运用Spearmian法分析高血压并发冠心病患者血清miR-27a-3p和HOXC6水平与冠状动脉病变的相关性;多因素Logistic回归分析高血压并发冠心病的影响因素;受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析血清miR-27a-3p,HOXC6水平对高血压并发冠心病的预测价值.结果 并发组高血压病程(6.69±1.35年)、总胆固醇(total cholesterol,TC)(5.96±0.86mmol/L)、低密度脂蛋白-胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)(3.36±0.51mmol/L)均显著高于未并发组(5.87±1.32 年,5.42±0.67mmol/L,2.98±0.48mmol/L),并发组血清 miR-27a-3p(1.35±0.34),HOXC6(1.29±0.33)水平均显著高于未并发组(1.06±0.23,1.03±0.25),差异具有统计学意义(t=4.808,5.454,6.001,7.755,6.911,均 P<0.05);轻度组、中度组、重度组患者血清 miR-27a-3p(0.54±0.13,1.19±0.31,2.18±0.55)和 HOXC6(0.47±0.12,1.12±0.31,2.13±0.52)表达水平逐渐升高,差异具有统计学意义(F=191.026,191.026,均P<0.05).高血压并发冠心病患者血清miR-27a-3p,HOXC6与SYNTAX评分具呈正相关性(r=0.563,0.517,均P<0.05);血清miR-27a-3p[OR(95%CI:1.627(1.177~2.248)]、HOXC6[OR(95%CI):1.715(1.069~2.750)]是影响高血压并发冠心病的独立危险因素(P<0.05);血清miR-27a-3p和HOXC6联合预测高血压并发冠心病的AUC为0.896(95%CI:0.851~0.931),优于各自单独诊断(Z=2.133,2.815,均P<0.05).结论 高血压并发冠心病患者血清miR-27a-3p,HOXC6水平均显著升高,且与冠状动脉病变密切相关,二者联合对高血压并发冠心病具有较高的预测价值.
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编辑人员丨2024/6/22
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甲状腺相关性眼病表观遗传学的研究进展
编辑人员丨2023/12/16
甲状腺相关性眼病(TAO)的发生与发展及其表观遗传的关系密切。其中,TAO的发生与脱氧核糖核酸甲基化所引起的差异基因表达、非编码核糖核酸(RNA)调控及微小RNA(miRNA)相关。miRNA-155和miRNA-146a通过参与免疫炎症及脂肪组织的增殖分化等参与TAO的病理过程;miRNA-21的表达与TAO的活动性及严重程度相关;miRNA-130a和miRNA-27在TAO眼眶成纤维细胞的成脂分化及脂肪组织增生中发挥着重要作用;miRNA-199a-3p和miRNA-199a-5p可增加患者眼眶脂肪组织的氧化应激和血管生成;TAO患者的miRNA-183和miRNA-96在外周血分化簇(CD)4+T细胞中表达升高,参与TAO病程的调节免疫;miRNA-29可通过抑制转化生长因子β1信号通路抑制细胞纤维化;miRNA-143可通过直接靶向胰岛素样生长因子-1受体,间接降低促甲状腺素受体和核苷酸结合寡聚域样受体热蛋白结构域相关蛋白3浓度,调节TAO的炎症反应。此外,长链非编码RNA、环状RNA、转运RNA衍生片段及组蛋白修饰的表观遗传调控亦与TAO的发病相关。
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编辑人员丨2023/12/16
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微小核糖核酸调控胆固醇稳态的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
胆固醇稳态受多种因素的密切调节,而胆固醇代谢紊乱与2型糖尿病、动脉粥样硬化、非酒精性脂肪性肝病等多种疾病的发生、发展密切相关.微小RNA(microRNA,miRNA)是脂代谢的转录后调控因子,miRNA-185-5p、miRNA-758-5p、miRNA-33a、miRNA-21、miRNA-122和miRNA-370与胆固醇的合成有关,miRNA-33、miRNA-144、miRNA-26、miRNA-758-3p、miRNA-106b、miRNA-10b、miR-NA-302、miRNA-145、miRNA-27a/b和miRNA-613与胆固醇的转运有关,多种microRNA共同参与调控胆固醇代谢中关键蛋白的表达,调控胆固醇的稳态平衡.
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编辑人员丨2023/8/6
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白藜芦醇对人恶性脑胶质瘤模型裸鼠体内肿瘤生长的影响及其机制
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨白藜芦醇对人恶性脑胶质瘤模型裸鼠体内肿瘤生长的影响及其机制.方法 选取4周龄BALB/c雌性裸鼠10只,按随机数字表法分为白藜芦醇组和对照组,每组5只.两组均采用皮下移植成瘤法在裸鼠右前肢前臂皮下接种人恶性脑胶质瘤U251细胞悬液,建立裸鼠恶性脑胶质瘤模型.肿瘤种植后第10天,裸鼠右前肢皮下明显触及肿块,提示造模成功;白藜芦醇组裸鼠用浓度为50 mmol/L白藜芦醇溶液200 μL灌胃,对照组裸鼠以等量等浓度二甲基亚砜生理盐水灌胃,每3日给药1次,共用药7次.第1次用药前记录肿瘤的最长径、最短径,计算肿瘤体积.每次给药后第3天测量肿瘤大小.完成最后一次测量后处死动物,完整取出瘤块.采用Western blot法检测白藜芦醇组和对照组肿瘤组织标本中FOXP2蛋白的表达,实时荧光定量PCR( qPCR)测定miR-9的表达.结果 白藜芦醇组和对照组均成功建立恶性脑胶质瘤移植瘤动物模型.皮下接种肿瘤细胞第10天白藜芦醇组肿瘤体积(12. 94 ± 10. 17)mm3 ,对照组肿瘤体积(6. 46 ± 2. 67) mm3 .第1、2、3、4次给药后,白藜芦醇组肿瘤体积分别为( 25. 58 ± 16. 41 ) mm3 、 ( 32. 33 ± 17. 62 ) mm3 、 ( 58. 81 ± 7. 66)mm3 、(97. 67 ± 20. 76)mm3 ,对照组肿瘤体积分别为(12. 02 ± 8. 71) mm3、(30. 73 ± 15. 74) mm3 、(52. 88 ± 20. 03)mm3 、(88. 50 ± 37. 01)mm3,白藜芦醇组肿瘤体积均大于对照组,但差异均无统计学意义(P 值均 >0. 05);第5、6、7 次给药后,白藜芦醇组肿瘤体积分别为(114. 94 ± 29. 35) mm3 、(237. 42 ± 23. 3)mm3 和(231. 27 ± 12. 6) mm3,均小于对照组的(191. 71 ± 53. 79) mm3 、(314. 67 ± 24. 4)mm3和(374. 03 ± 21. 6)mm3,两组比较差异均有统计学意义( t= -2. 802、-5. 114、-6. 320, P值均<0. 01).白藜芦醇组FOXP2蛋白相对表达量为100. 60 ± 41. 75,低于对照组的165. 51 ± 16. 31, miR-9相对表达量为0. 971 ± 0. 369,高于对照组的0. 496 ± 0. 008,差异均有统计学意义( t=3. 238、2. 878, P值均<0. 05).结论 白藜芦醇能抑制恶性脑胶质瘤模型裸鼠体内肿瘤的生长,其机制可能是通过调节miR-9和FOXP2的表达实现.
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编辑人员丨2023/8/6
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外周血液中miRNA表达与老年性黄斑变性相关性研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 检测微小核糖核酸(microribonucleicacids,miRNA)在老年性黄斑变性(age-related macular degeneration,AMD)患者中的表达,并探讨miRNA的表达量与AMD病程之间的关系.方法 选取2014年1月至2016年11月于同济大学附属第十人民医院眼科门诊就诊的AMD患者6例为试验组,并选取同期6名正常人为对照组,通过基因芯片技术检测两组血液中miR-NA的表达量.扩大样本的病例对照研究中共纳入126例AMD患者和140名正常人,检测其血液样本中miRNA的表达,比较两组人群间miRNA的表达量差异.结果 通过基因芯片技术,在试验组与对照组间共检测出216个miRNA存在表达差异(均为P<0.05),与对照组相比,试验组中111个miRNA表达量上升,105个miRNA表达量下降,差异均有统计学意义(均为P<0.05).扩大样本的病例对照研究结果表明,在AMD患者中,miR-27a-3p、miR-29b-3p、miR-195-5p的表达量显著上升,同时,湿性AMD患者血液中miR-27a-3p的表达量高于干性AMD患者,差异均有统计学意义(均为P<0.05).结论 AMD患者外周血中miRNA表达量水平有明显变化,miR-27a-3p、miR-29b-3p、miR-195-5p可能成为AMD血清学诊断和预后的标志物.
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编辑人员丨2023/8/6
