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非酒精性脂肪性肝病患者血清外泌体miRNAs表达谱的初步分析和功能研究
编辑人员丨22小时前
目的:鉴定非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者和健康对照组人血清外泌体微小RNAs(microRNAs)差异表达谱,探索miRNAs在NAFLD发病、诊断及治疗中的价值。方法:各取4例人口学特征、个人史相近的S2~3级NAFLD患者和健康对照者进行血清外泌体miRNAs高通量测序,对差异表达最显著的4条miRNAs按S1组、S2~3组、对照(Control)组每组各20例行qRT-PCR验证,并进行靶基因预测,对靶基因进行GO和KEGG富集分析。正态分布的计量资料使用 t检验或方差分析,等级资料和非正态分布资料使用秩和检验,计数资料使用Pearson χ2检验或Fisher精确检验。 结果:初步鉴定出差异有统计学意义( P < 0.05)且差异表达在2倍以上的血清外泌体miRNAs共19条,hsa-miR-122-5p、hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-197-3P的相对表达关系为:S2~3组>S1组>Control组,hsa-miR-483-3p的相对表达关系为:NAFLD组(S1或S2~3)>Control组。GO分析显示靶基因在分子功能、细胞组分、生物过程均有广泛的注释,靶基因显著富集的通路共84条,从20条与NAFLD最密切的通路中筛选出与至少10条通路都相关的靶基因共5个,即PIK3R2、AKT2、AKT3、MAPK1、NFKB1。 结论:初步分析了NAFLD患者和健康对照组血清外泌体miRNAs差异表达谱,研究了4条miRNAs对于判断肝脂肪变性程度的价值,预测了数以千计的靶基因及其参与的复杂信号通路,为寻找无创诊断NAFLD的生物标志物和特异性治疗的新靶点提供了新的参考。
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编辑人员丨22小时前
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心肌肌钙蛋白Ⅰ、血清N末端脑利钠肽前体和微小RNA-146a在多发伤后合并心肌损伤中的诊断价值
编辑人员丨22小时前
目的:探讨心肌肌钙蛋白Ⅰ(cTnⅠ)、血清N末端脑利钠肽前体(NT-proBNP)和微小RNA(miR)-146a在多发伤后合并心肌损伤中的诊断价值。方法:选取诸城市人民医院2021年2月至2023年12月收治的91例多发伤患者作为研究对象,根据患者是否合并心肌损伤,将91例患者分为无心肌损伤的多发伤组(44例)和合并心肌损伤组(47例),分别收集两组患者入院时、入院后3 d的静脉血,测定cTnⅠ和血清NT-proBNP的表达水平,采用荧光PCR分析血清中miR-146a的表达水平。分析两组患者不用时间点cTnⅠ、血清NT-proBNP和miR-146a的表达水平。制作受试者工作曲线,分析cTnⅠ、血清NT-proBNP和miR-146a对诊断多发伤后合并心肌损伤的价值,计量数据比较采用 t检验。 结果:多发伤组患者入院时血清cTnⅠ水平[(0.05±0.01) ng/ml]明显低于合并心肌损伤组患者[(1.46±0.44) ng/ml, t=20.260, P<0.05]。多发伤组患者入院3 d血清cTnⅠ水平[(0.06±0.02) ng/ml]明显低于合并心肌损伤组患者[(0.46±0.14) ng/ml, t=18.510, P<0.05]。合并心肌损伤组患者入院时血清cTnⅠ水平[(1.46±0.44) ng/ml]高于入院3 d患者[(0.46±0.14) ng/ml, t=14.940, P<0.05]。多发伤组患者入院时血清NT-proBNP水平[(240.20±20.37) pg/ml]明显低于合并心肌损伤组患者[(353.57±15.67) pg/ml],差异有统计学意义( t=29.460, P<0.05)。多发伤组患者入院3 d血清NT-proBNP水平[(254.83±20.92) pg/ml]明显低于合并心肌损伤组患者[(302.04±18.67) pg/ml, t=11.190, P<0.05]。合并心肌损伤组患者入院时血清NT-proBNP水平[(353.57±15.67) pg/ml]高于入院3 d患者[(302.04±18.67) pg/ml, t=14.940, P<0.05]。多发伤组患者入院时血清miR-146a水平(1.55±0.13)明显高于合并心肌损伤组患者(0.79±0.17, t=23.050, P<0.05)。多发伤组患者入院3 d血清miR-146a水平(1.49±0.15)明显高于合并心肌损伤组患者(1.36±0.12, t=4.810, P<0.05)。合并心肌损伤组患者入院时血清miR-146a水平(0.79±0.17)明显低于入院3 d后水平(1.36±0.12, t=18.550, P<0.05)。三者联合诊断多发伤合并心肌损伤的敏感性为89.65%,特异性为87.49%,准确性为84.67%。 结论:多发伤合并心肌损伤患者cTnⅠ和血清NT-proBNP水平显著增加,而miR-146a表达水平显著下降,三者联合对诊断多发伤后心肌损伤具有参考价值。
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编辑人员丨22小时前
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微小RNA-937在肝细胞癌组织的表达及其临床意义
编辑人员丨22小时前
目的:探究微小RNA(miR)-937在肝细胞癌组织及癌旁组织的表达,及其表达水平与肝癌患者生存期、临床病理特征与预后的关系。方法:选取2017年3月至2019年3月间146例肝癌及其癌旁组织(定义为距离癌灶边缘>2 cm)作为研究对象。采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)技术检测肝癌组织及癌旁组织中微小miR-937的表达水平;并探究和分析miR-937表达水平与肝癌患者的生存时间、性别、年龄(≥55岁或≤55岁)、甲胎蛋白(AFP,>50 ng/ml或≤50 ng/ml)、组织分化程度、临床分期(Ⅰ~Ⅱ期或Ⅲ~Ⅳ期)的相关性;采用多因素COX分析探究miR-937表达水平与肝癌患者的预后关系。组间比较采用 t检验。 结果:癌旁组织中miR-937表达水平低于肝癌组织中miR-937表达水平(1.04±0.13比2.65±0.49),差异有统计学意义( t=3.159, P<0.05)。临床分期Ⅰ~Ⅱ期患者miR-937表达水平低于Ⅲ~Ⅳ期患者miR-937表达水平(2.43±0.45比2.79±0.34),差异有统计学意义( t=2.873, P<0.05)。miR-937高表达人群的生存时间低于miR-937低表达人群的生存时间(18.7个月比28.6个月),差异有统计学意义(log-rank=4.385, P<0.05)。同时,采用COX回归分析表明肝癌组织中miR-937表达水平能够预测肝癌患者的3年OS率( HR=2.856, P<0.05)。多因素COX分析表明肝癌患者的临床分期(Ⅰ~Ⅱ期比Ⅲ~Ⅳ期)是影响肝癌组织中miR-937表达水平危险因素( P<0.05),miR-937表达水平变化是影响肝癌患者预后的独立影响因素。 结论:miR-937表达水平在肝癌组织中显著上调,且与患者的临床分期和生存时间明显相关。
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编辑人员丨22小时前
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lncRNA KCNQ1OT1和miR-146a-3p在子痫前期胎盘组织中的表达及调控机制的初步研究
编辑人员丨23小时前
目的:观察长链非编码RNA(lncRNA)钾电压门控通道亚家族Q成员1反向转录物1(KCNQ1OT1)和微小RNA(miR)-146a-3p在子痫前期(PE)胎盘组织中的表达,并初步探索两者相互调控后对滋养细胞生物学特性的影响及作用机制。方法:(1)选择2017年7月—2018年7月在海南省人民医院住院的PE孕妇45例为PE组,选择同期正常孕妇55例为对照组,采用实时荧光定量PCR技术检测两组胎盘组织中KCNQ1OT1 mRNA、miR-146a-3p的表达,并分析两者的相关性。(2)采用绒毛膜滋养细胞层细胞系HTR8/SVneo细胞,先分为空白对照组和脂多糖(LPS)组,经LPS处理24 h的HTR8/SVneo细胞再进一步分为短发夹状RNA(sh)-KCNQ1OT1组(即沉默KCNQ1OT1的表达)、miR-146a-3p抑制物(inhibitor)组和sh-KCNQ1OT1+miR-146a-3p inhibitor组,共5组。应用生物信息学软件预测KCNQ1OT1和miR-146a-3p的靶向关系,并采用双荧光素酶报告基因实验加以验证;分别采用活细胞计数(CCK-8)法、划痕实验、穿膜(transwell)小室实验检测HTR8/SVneo细胞的增殖、迁移、侵袭能力,实时荧光定量PCR技术检测细胞中KCNQ1OT1 mRNA、miR-146a-3p的表达,蛋白印迹(western blot)法检测细胞中趋化因子12(CXCL12)和趋化因子受体4(CXCR4)蛋白的表达。结果:(1)PE组胎盘组织中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平低于对照组(分别为0.23±0.03、0.51±0.04),miR-146a-3p的表达水平高于对照组(分别为0.49±0.03、0.31±0.03),两组分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05);PE组胎盘组织中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平与miR-146a-3p的表达水平呈负相关( r=-0.79, P=0.031)。(2)生物信息学软件预测并经双荧光素酶报告基因实验验证显示,KCNQ1OT1与miR-146a-3p存在靶向关系。与空白对照组相比,LPS组细胞中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平下降(分别为0.91±0.03、0.35±0.03),miR-146a-3p的表达水平升高(分别为0.22±0.03、0.63±0.04),细胞的增殖、侵袭、迁移能力及CXCL12、CXCR4蛋白的表达均下降,分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05);sh-KCNQ1OT1组细胞中KCNQ1OT1 mRNA的表达水平(0.23±0.03)进一步下降,miR-146a-3p的表达水平(0.85±0.03)进一步上升,细胞的增殖、侵袭、迁移能力及CXCL12、CXCR4蛋白的表达均进一步下降,分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05);而miR-146a-3p inhibitor组、sh-KCNQ1OT1+miR-146a-3p inhibitor组分别与sh-KCNQ1OT1组比较,KCNQ1OT1 mRNA的表达水平(分别为0.78±0.04、0.50±0.03)升高,miR-146a-3p的表达水平(分别为0.42±0.03、0.46±0.03)下降,细胞的增殖、侵袭、迁移能力及CXCL12、CXCR4蛋白的表达均增高,分别比较,差异均有统计学意义( P<0.05)。 结论:KCNQ1OT1负调控miR-146a-3p的表达,激活CXCL12/CXCR4信号通路后,可促进滋养细胞的增殖、迁移和侵袭,可能参与了PE的发病。
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编辑人员丨23小时前
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妊娠期甲减患者血清miR-124、miR-146a及miR-326表达与妊娠结局的相关性分析
编辑人员丨23小时前
目的:探究妊娠期甲状腺功能减退(简称"妊娠期甲减")患者血清微小RNA-124(microRNA-124,miR-124)、miR-146a及miR-326表达水平及与甲状腺功能及不良妊娠结局的相关性。方法:回顾性分析2017年6月至2019年6月西安医学院第二附属医院内分泌科进行妊娠期甲减治疗的患者为观察组(n=121),对照组为同期来本院建卡正常妊娠的孕妇(n=120)。采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)检测miR-124、miR-146a及miR-326血清表达水平;比较两组受试者血清促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone,TSH)、血清游离三碘甲状腺原氨酸(free triiodothyronine,FT3)、游离T4(FT4)、甲状腺过氧化物酶抗体(thyroid peroxidase antibody,TPOAb)、促甲状腺激素受体抗体(thyrotropin receptor antibodies,TRAb)、甲状腺微粒体抗体(thyroid microsomal antibody,TMAb)及甲状腺球蛋白抗体(thyroglobulin antibodies,TGAb)水平差异。采用Spearman和Pearson相关性分析探究miR-124、miR-146a及miR-326表达及与甲状腺激素各指标的相关性;采用 χ2检验miR-124、miR-146a及miR-326水平与治疗后不良妊娠结局的相关性。 结果:与对照组健康孕妇相比,观察组妊娠期甲减孕妇miR-146a(0.98±0.12 vs 2.71±0.34)及miR-326(1.09±0.22 vs 2.11±0.32)血清表达上调,miR-124表达下调(1.46±0.23 vs 0.56±0.10),差异均有统计学意义( P<0.05);观察组孕妇TSH、TGAb、TRAb、TMAb、TPOAb高于对照组孕妇,FT3、FT4低于对照组孕妇( P<0.05);治疗后FT4、TGAb、TPOAb水平在miR-124、miR-146a及miR-326高表达组及低表达组之间有显著差异( P<0.05);miR-124表达水平与FT3、FT4呈显著正相关,与TSH、TGAb、TRAb、TMAb、TPOAb呈显著负相关,miR-146a、miR-326表达与FT3、FT4呈显著负相关,与TSH、TGAb、TRAb、TMAb、TPOAb呈显著正相关( P<0.05)。 结论:miR-124、miR-146a及miR-326可作为妊娠期甲减疗效评估有关,并可作为不良妊娠结局的预测因子。
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编辑人员丨23小时前
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血清miR-92a和miR-146a表达水平联合肺部超声评分预测ARDS严重程度及预后的价值
编辑人员丨23小时前
目的:探讨血清微小RNA-92a(miR-92a)和微小RNA-146a(miR-146a)表达水平联合肺部超声评分(LUS)预测急性呼吸窘迫综合征(ARDS)严重程度及预后的价值。方法:选择2017年1月至2020年3月儋州市人民医院收治的116例ARDS患者。于患者入院当日,采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测血清miR-92a及miR-146a表达水平,并对12个肺区进行肺部超声检查,总分即为LUS评分。分析28 d不同预后(存活组与死亡组)以及不同程度ARDS患者〔轻度组:200 mmHg<氧合指数(OI)≤300 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa),中度组:10 mmHg
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编辑人员丨23小时前
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微小RNA-146-5p靶向Notch2对非小细胞肺癌增殖、凋亡和侵袭的影响
编辑人员丨23小时前
目的:探讨微小RNA(miRNA,miR)-146-5p靶向Notch2对非小细胞肺癌增殖、凋亡和侵袭的影响。方法:选取南阳医学高等专科学校第一附属医院2018年5月至2022年5月收治的58例非小细胞肺癌和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肿瘤和癌旁组织miR-146-5p表达水平。采用慢病毒建立miR-146-5p过表达非小细胞肺癌A549细胞系,分别为miRNA对照组和miR-146-5p组。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和体外移植瘤实验分析肿瘤细胞增殖能力,采用流式细胞术分析细胞凋亡水平;采用Transwell分析细胞侵袭能力;生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-146-5p靶基因。蛋白质免疫印迹分析靶基因的表达水平。组间数据比较采用 t检验。 结果:癌旁组织中miR-146-5p表达水平(1.09±0.16)明显高于非小细胞肺癌组织表达水平(0.48±0.12),差异有统计学意义( t=23.940, P<0.05)。miRNA对照组细胞miR-146-5p表达水平(0.96±0.41)明显低于miR-146-5p组细胞(2.69±0.25),差异有统计学意义( t=8.094, P<0.05)。miRNA对照组细胞吸光度值(1.96±0.07)明显高于miR-146-5p组细胞(1.56±0.08),差异有统计学意义( t=9.123, P<0.05)。miRNA对照组细胞体内肿瘤体积[(691.50±51.29) mm 3]明显高于miR-146-5p组细胞[(443.80±61.43) mm 3],差异有统计学意义( t=9.787, P<0.05)。miRNA对照组细胞凋亡比例[(3.64±1.24)%]明显低于miR-146-5p组细胞[(23.26±2.91)%],差异有统计学意义( t=13.910, P<0.05)。miRNA对照组细胞侵袭数量[(98.80±14.97)%]明显低于miR-146-5p组细胞[(69.80±10.89)%],差异有统计学意义( t=3.502, P<0.05)。,Nocth2是miR-146-5p的靶基因。miRNA对照组细胞Nocth2蛋白表达水平(1.21±0.12)明显低于miR-146-5p组细胞(0.63±0.10),差异有统计学意义( t=9.282, P<0.05)。 结论:miR-146-5p通过调节靶蛋白Notch2表达水平,调节着非小细胞肺癌的增殖、凋亡和侵袭能力。
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编辑人员丨23小时前
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基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
编辑人员丨3周前
目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制.方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的 miRNA.利用 TargetScan、StarBase、miRDB、miRWalk 4 个数据库预测 miRNA 的靶基因,通过 DAVID 和 Metascape 数据库对靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.运用Cytoscape构建主要信号通路的ceRNA调控网络.结果:测序共检测到14个差异miRNA(均为上调),该差异miRNA的靶基因主要富集在细胞衰老和癌症相关信号通路;构建获得的ceRNA调控网络含47个长链非编码RNA(lncRNA)节点、10个miRNA节点、27个信使RNA(mRNA)节点,该调控网络中 miR-155-5p、miR-132-3p、miR-503-5p、miR-146b-5p 和 miR-212-5p 为排名前 5 的 HUB 基因.结论:本研究通过筛选尿酸盐肾沉积差异miRNA,构建了尿酸盐肾沉积ceRNA网络,为尿酸盐肾沉积机制探讨提供了新思路.
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编辑人员丨3周前
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肝细胞癌预后、诊断和免疫细胞浸润相关关键基因及其潜在治疗药物的生物信息学分析
编辑人员丨3周前
目的:利用生物信息学分析方法筛选与肝细胞癌(HCC)患者预后、诊断和免疫细胞浸润相关的关键基因,并分析其潜在治疗药物.方法:从基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC基因表达谱数据及相应的HCC患者临床信息.采用R软件limma包筛选HCC差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,使用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化并筛选关键基因.通过Kaplan-Meier生存曲线和LASS O回归算法鉴定HCC预后相关关键基因,并利用外部数据集对其表达进行验证和诊断效能分析.采用CIBERSORT算法评估预后相关的关键基因表达与HCC免疫细胞浸润的关系.利用MiRNet和Network Analyst数据库分别构建微小RNA(miRNA)-关键基因mRNA和转录因子(TFs)-关键基因mRNA分子调控网络.利用CMap数据库筛选潜在治疗HCC的小分子药物.结果:共筛选出146个DEGs,其中表达上调基因30个,表达下调基因116个.GO功能和KEGG信号通路富集分析,DEGs明显富集在类固醇、烯化合物和激素代谢等生物过程(BP)及视黄醇代谢、药物代谢-细胞色素P450(CYP450)、补体和凝血级联反应等信号通路.PPI网络分析筛选得到14个关键基因,其中甲酰氨基转移酶环化脱氨酶(FTCD)、分泌型磷蛋白2(SPP2)、凝血酶-抗凝血酶复合物(TAT)、补体C6(C6)和CYP450家族成员2C9(CYP2C9)与HCC患者预后、临床病理分期和组织学分级有明显相关性,在HCC诊断中具有较高的诊断效能,与HCC的免疫细胞浸润有密切关联.Hsa-mir-182-5p、同源框CUT样蛋白1(CUX1)、早期生长反应1(EGR1)、SMAD家族成员4(SMAD4)和肿瘤蛋白P53(TP53)是靶向上述预后相关关键基因的重要调控因子.DL-硫沙芬(DL-thiorphan)、异丙嗪(promethazine)和芹菜素(apigenin)可能对HCC有治疗作用.结论:FTCD、SPP2、TAT、C6和CYP2C9可能是HCC诊断、预后判断和治疗的潜在靶点,预测得到的3种小分子药物DL-thiorphan,promethazine和apigenin可为HCC治疗药物的研发提供参考.
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编辑人员丨3周前
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牙周炎患者病损组织中Foxp3 mRNA、IL-34 mRNA和miR-146a-5p表达水平与牙周指标的关系
编辑人员丨1个月前
目的:分析牙周炎患者炎症病损组织中叉头翼螺旋转录分子(transcription factor forkhead box protein 3,Foxp3)mRNA、白介素-34(interleukin-34,IL-34)mRNA、微小 RNA(micro RNA,miRNA)-146a-5p 的表达水平与牙周指标之间的相关性.方法:将2021年4月~2023年4月我院收治的牙周炎患者118例纳入研究组[轻度(n=51)、中度(n=42)、重度(n=25)],另择同期阻生齿拔除患者125例纳入对照组.比较两组牙周组织中Foxp3 mRNA、IL-34 mRNA、miR-146a-5p的表达水平,不同牙周炎症程度的患者实验室指标及牙周指标,通过Pearson相关性分析法分析牙周炎患者病损组织中Foxp3 mRNA、IL-34 mRNA、miR-146a-5p与牙周指标的相关性.结果:研究组病损组织中Foxp3 mRNA、IL-34 mRNA、miR-146a-5p表达量高于对照组(P<0.05).轻度组、中度组、重度组牙周炎组织中Foxp3 mRNA、IL-34 mRNA、miR-146a-5p 表达量,菌斑指数(plaque index,PLI)、牙龈指数(gingival index,GI)、牙周探诊深度(probing depth,PD)呈升高趋势,组间比较差异均具有统计学意义(P<0.05).牙周炎患者组织中Foxp3 mRNA、IL-34 mRNA、miR-146a-5p 与 PD、PLI、GI 均呈正相关(P<0.05).结论:牙周炎患者组织中 Foxp3 mRNA、IL-34 mRNA、miR-146a-5p表达量与病情进展、牙周指标密切相关,可作为牙周炎防治及疗效评估的潜在靶分子.
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编辑人员丨1个月前
