目的:了解山东省兰陵县羊携带志贺毒素基因 stx2k新亚型大肠埃希菌的情况及其分子特征。 方法:2019年11月采集山东省兰陵县不同养殖户的羊粪便512份，经EC肉汤增菌后PCR检测 stx基因，阳性样品分别接种科玛嘉(CHROMagar?)ECC及科玛嘉(CHROMagar?)STEC培养基，对 stx基因阳性菌株进行全基因组测序。根据基因组数据分析菌株 stx基因亚型、血清型、多位点序列分型(MLST)情况及毒力基因携带情况。 结果:从512份羊粪中共分离86株产志贺毒素大肠埃希菌，包括5种不同的 stx亚型，其中 stx2k亚型菌株37株；86株菌分为20种O∶H血清型及18种不同ST型。 结论:山东省兰陵县羊携带的产志贺毒素大肠埃希菌在志贺毒素亚型、血清型及毒力基因等分子特征方面存在多样性，且检出了产志贺毒素2k新亚型的大肠埃希菌。

目的:了解我国不同来源产志贺毒素 stx2e亚型大肠埃希菌分离株的分子特征。 方法:对2012年—2018年间监测中发现的3株人源、13株动物源及8株食品来源的携带 stx2e基因亚型的大肠埃希菌进行体外抗生素敏感性试验并进行全基因组测序。根据全基因组序列，对菌株 stx基因亚型、血清型、多位点序列分型(MLST)、毒力基因及耐药基因携带情况、系统进化关系及志贺毒素前噬菌体基因组成进行分析。 结果:24株菌分为19种O∶H血清型和19种序列(ST)型，均携带至少1种耐药相关基因，其中19株菌至少对一种抗生素耐药。3株人源菌株分别属于不同血清型及ST型，但存在与之相同血清型或ST型的动物、食品来源菌株；全基因组进化分析显示相同血清型或ST型的人源菌株分别与动物或食品源菌株具有较近亲缘关系。不同菌株间 stx2e序列高度相似(>99.7%)，但志贺毒素前噬菌体基因组成、大小等存在较大差异。 结论:本研究为我国对罕见的人源性 stx2e亚型大肠埃希菌菌株特征进行报道，结合动物及食品源性菌株，表明我国 stx2e亚型菌株具有高度遗传多样性，存在感染人的风险。

目的:对淮南市发生的一起宋内志贺菌暴发疫情进行病原学溯源分析，并对菌株毒力基因和耐药谱进行检测。方法:采集2020年8月淮南市一起感染性腹泻暴发疫情相关水样、粪便，进行多重病原体核酸检测和分离培养，对分离的宋内志贺菌进行毒力基因PCR检测、微量肉汤法药敏检测、脉冲场电泳和全基因组测序溯源分析。结果:56份黏稀样粪便分离出38株宋内志贺菌（阳性率67.86%），血清型均为宋内志贺菌Ⅰ相；3份末梢水和井水革兰阴性菌（GN）增菌液荧光PCR检测志贺菌阳性；菌株毒力基因携带情况为侵袭性质粒抗原H（ ipaH）阳性（38份），侵袭性质粒抗原H（ ipaH）/侵袭相关基因（ ial）阳性（31份），侵袭性质粒抗原H（ ipaH）/侵袭相关基因（ ial）/肠毒素2基因（ sen）阳性（1份）；耐药谱显示14种抗生素中9种100.00%耐药，仅亚胺培南、氯霉素、头孢他啶、环丙沙星为有效药物；36株菌 XbaⅠ限制性酶切图谱带型完全一致，其中3株菌株基因组ST型分析均为ST152型；全基因组测序和分析验证了此次暴发由单一克隆群菌株引起，且揭示此次暴发分离株与数据库中3株中国菌株、1株韩国菌株聚集成一个大簇，而与其他国家的菌株距离较远。 结论:本起由水源污染单一宋内志贺菌克隆引起，分离株为低毒力株，呈多重耐药表型。

目的 了解浦东新区常见蝇种携带肠道传染病病原体情况,为蝇类防制和感染性腹泻病防控提供科学依据.方法 2021年4-11月每月下旬,采用网捕法,在农户、农贸市场、餐饮外环境3类场所采集家蝇,在公园、居民区、农贸市场3类场所采集丝光绿蝇和棕尾别麻蝇.对捕获的蝇种冷冻后分类鉴定,采用胃肠道感染微流体芯片V3进行感染性腹泻相关病原体筛查.采用Excel 2019和SPSS 22.0软件进行数据整理及统计分析.结果 共捕获家蝇1 544只、丝光绿蝇642只、棕尾别麻蝇509只,家蝇、丝光绿蝇和棕尾别麻蝇的病原体检出率分别为37.29％(44/118)、67.50％(27/40)和70.97％(22/31),差异有统计学意义(x2=17.936,P＜0.001).上述3个蝇种的细菌和病毒检出率差异均有统计学意义(x2=44.547,P＜0.001;x2=26.519,P＜0.001).家蝇共检出11种病原体(6种细菌、3种病毒和2种寄生虫),主要病原体为人芽囊原虫(占总检出病原体数量的42.37％)、札如病毒(占20.34％)和隐孢子虫(占10.17％);丝光绿蝇共检出12种病原体(7种细菌、3种病毒和2种寄生虫),主要病原体为产志贺毒素大肠埃希菌(STEC,占18.75％)、星状病毒(占13.75％)和札如病毒(占11.25％);棕尾别麻蝇共检出10种病原体(5种细菌、3种病毒和2种寄生虫),主要病原体为STEC(占22.22％)、星状病毒(占14.81％)和札如病毒(占14.81％).浦东新区家蝇携带病原体检出率最低,与另外2个蝇种的主要病原体有所差异.结论 浦东新区常见蝇种携带感染性腹泻病原体种类多样,且不同蝇种携带的病原体有所不同,应加强环境整治,科学制定蝇类防控策略.

目的 分析上海市浦东新区餐饮场所蜚蠊侵害及其肠道病原体携带情况,为餐饮场所蜚蠊防制和感染性腹泻病防控提供科学建议.方法 2021年4月-2022年3月,每月中旬使用蜚蠊诱捕器对上海市浦东新区12个街镇5种类型餐饮场所开展1次蜚蠊侵害调查和采样,对捕获的蜚蠊进行肠道病原体检测.采用Excel 2019、SPSS 22.0软件进行数据整理和统计分析.结果 浦东新区餐饮场所蜚蠊侵害率为20.83％,蜚蠊密度为0.74只/个,种类为德国小蠊(占65.79％)和黑胸大蠊(占34.21％),不同类型餐饮场所蜚蠊的构成比差异有统计学意义(x2=126.509,P＜0.001).企事业单位食堂蜚蠊侵害率和密度最高,分别为29.03％和1.32只/个.蜚蠊样本的病原体检出率为28.13％,检出札如病毒、诺如病毒、星状病毒、产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)、嗜水气单胞菌、人芽囊原虫和隐孢子虫共7类病原体53组.德国小蠊携带的优势病原体为札如病毒、人芽囊原虫和STEC,黑胸大蠊携带的优势病原体为札如病毒、STEC和嗜水气单胞菌.结论 浦东新区餐饮场所蜚蠊携带多种人体肠道病原体,应重视餐饮场所的蜚蠊防制,有针对性地制定控制策略.

目的 分析北京市某区2013-2021年腹泻监测中,首次自腹泻病例分离的2株非O157产志贺毒素大肠埃希菌(STEC)病原学及分子生物学特征.方法 应用实时荧光定量PCR方法筛查腹泻病例标本中的肠道致病菌和病毒,对志贺毒素基因(stx)阳性的标本进行细菌分离培养,所得菌株经生化鉴定后,进行血清凝集和微量肉汤稀释法药敏实验,并进行全基因组测序.根据基因组数据分析菌株血清型、多位点序列分型(MLST)、耐药基因及stx亚型,并构建系统发生树.结果 2021年腹泻监测中,2例中年女性腹泻患者样本显示stx基因阳性,未能确定可疑暴露食品.分离所得2株STEC菌株携带stx亚型分别为stxla和stx2k.其中,Stx1a-STEC为O45:H6血清型、ST101型,药敏表型为耐氨苄西林+四环素+头孢噻肟+头孢唑林+庆大霉素+复方磺胺,携带耐药基因 aac(3)-Ⅱd、tetA、lnu(F)、aadA22、aph⑹-Ⅰd、sul3、qnrS1、ant(3")-Ⅰa、blaCTX-M.55,样本同时轮状病毒阳性;Stx2k-STEC为O150:H8血清型、ST906型,对检测的15种抗生素均敏感,未检测出耐药基因.全基因组系统进化分析显示2株分离株与STEC参考株存在较大遗传差异.结论 北京市某区存在STEC引起的感染,并检出了志贺毒素2k新亚型,应加强对STEC的监测.

2017年6月26日,美国犹他州南部的一家医院向犹他州卫生局报告了来自亚利桑那州-犹他州边境一个小社区2名儿童感染产志贺样毒素的大肠埃希菌(STEC)O157∶H7疫情情况.2名儿童均出现了溶血性尿毒综合征,表现为溶血性贫血,急性肾功能衰竭和血小板减少症,并在发病后几天内死亡.在接下来的几天里,社区居民报告了更多与STEC相关的疾病.为确定疫情来源并防止出现更多病例,美国疾病预防控制中心(CDC)会同亚利桑那州和犹他州的地方和州卫生机构开展了联合调查;调查共发现12例病例,其中包括2名死亡儿童.调查人员分析探讨了多种潜在的疾病来源:流行病学和环境调查信息显示,接触牛粪可能是暴发疫情的最初来源,随后是人与人之间的传播.其中1株暴发疫情菌株是从2例患儿社区家庭附近的一个院子里采集的公牛和马粪中分离出来的.当地卫生机构向公众发布了与动物接触和手部卫生有关的建议,以降低STEC传播的风险.在饲养反刍动物社区发生暴发疫情期间,接触动物或动物粪便是STECO157∶H7感染的潜在来源.

目的 了解致泻性大肠埃希菌(DEC)在急性腹泻患儿(<5岁)中的分布、流行状况以及耐药性.方法 2015年8月1日至2016年9月30日,共收集华中科技大学同济医学院附属同济医院684例急性腹泻患儿的大便标本,培养后分离鉴定常见病原菌,鉴定为大肠埃希菌的菌落用PCR法扩增毒力基因,检测DEC感染情况;所有的致病性大肠埃希菌(EPEC)均同时采用血清凝集法进行血清学鉴定.琼脂稀释法进行药物敏感性试验.结果 共分离到149株致病菌,分离率为21.7％;其中DEC 54株,居第2位,发病高峰在夏秋季.最常见的毒力基因型别是EPEC,占50％(27/54),其中非典型EPEC占77.8％(21/27),典型EPEC占22.2％(6/27);其次是肠聚集性大肠埃希菌20.4％(11/54)和肠产毒性大肠埃希菌14.8％(8/54),肠侵袭性大肠埃希菌和产志贺样毒素大肠埃希菌均为3.7％(2/54),混合型占7.4％(4/54).多重PCR与单重PCR一致性为17/18;27株EPEC菌株,仅有11株(40.7％)血清凝集试验阳性.DEC对一线药物(氨苄西林、复方磺胺甲噁唑)以及头孢唑啉、头孢呋辛、头孢噻肟的耐药率均超过50％(27/54);耐药率较低的药物有头孢西丁、阿米卡星、哌拉西林/他唑巴坦以及亚胺培南和美罗培南.5株(9.2％)DEC对碳青霉烯类耐药.结论 DEC耐药现象严重,一线药物氨苄西林、复方磺胺甲噁唑可能不再适合DEC感染的经验性治疗.此外,相对高效的碳青霉烯类也出现了耐药.需加强对DEC的流行病学调查和耐药性分析.

目的 对一起食物中毒进行相关样品的实验室检测,针对分离病原菌进行分子分型溯源和耐药分析.方法 对可疑食品(冰激凌、牛奶)样品、患者呕吐物和粪便标本使用国家标准或其他方法进行沙门菌、志贺菌、致泻大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、单核细胞增生李斯特菌、蜡样芽胞杆菌和诺如病毒检测 对检出的金黄色葡萄球菌进行肠毒素检测、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型和抗生素敏感性检测.结果 从生产冰激凌剩余牛奶及冰激凌样品中检出金黄色葡萄球菌12株,患者呕吐物和粪便标本中检出4株,菌株均产生A+C+E混合型肠毒素,PFGE显示患者呕吐物、粪便、中毒同批冰激凌样品、生产冰激凌用牛奶中检出的金黄色葡萄球菌菌株同源性为100.0％;药敏结果显示,这16株菌株均对青霉素和红霉素耐药.结论 本起事件是由冰激凌加工点使用了被金黄色葡萄球菌污染且产生大量肠毒素的牛奶生产冰激凌所致 建议监管部门加强对农村食品小作坊、牛奶供应站等生产经营场所的监管,预防类似事件的发生.

目的 探讨小儿大肠埃希菌感染毒力因子检测及耐药性临床研究,以指导临床合理用药.方法 非植入导尿管患者尿标本分离非重复感染大肠埃希菌120株,采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)大肠埃希菌毒力因子,包括细胞坏死因子CNF1和CNF2,黏附因子papG和iha,铁载体相关因子fyuA、irp-2和iut,肠侵袭因子Einv,志贺样毒素VT1、VT2及VT2e,Ⅰ型菌毛fimH,其他如traT、aerJ等因子;采用美国临床实验标准化委员会(NCCLS)推荐的纸片扩散法(Kirby-Bauer,K-B法)测定所有毒力因子的耐药性,并分析多药耐药谱的分布率、毒力基因分布与耐药性的关系.结果 所有120株大肠埃希菌临床分离菌株均来源于小儿尿路感染,采用尿液培养获得;毒力基因检出率依次为fimH 90.33％(109/120)、traT 80.83％(97/120)、aerJ 65.00％(78/120)、Einv 60.00％(72/120)、papGⅢ39.17％(47/120)、pAI 30.83％(37/120)、cnf125.83％(31/120)、fyuA 24.17％(29/120)、cnf 220.83％(25/120)、papC 18.33％(22/120)、papG 11.67％(14/120)、hlyA 3.33％(4/120);药敏试验显示,碳青霉烯类(亚胺培南)的敏感性最高,达100％,其次为哌拉西林/他唑巴坦,敏感率为93.33％(112/120),耐药性最高的是青霉素类的氨苄青霉素85.83％(103/120)、左氧氟沙星76.67％(92/120)、复方新诺明67.50％(81/120);耐≥3类的抗菌药物的多药耐药率达54.17％(65/120);毒力因子分布数与耐药性间呈正相关(r=0.019,P<0.05).结论 小儿大肠埃希菌感染涉及的毒力因子较多,临床耐药性严重,且耐药程度与毒力因子分布数密切相关.