目的:通过蛋白质组学、生物信息学、酶联免疫吸附试验（ELISA）筛选脓毒症的差异表达蛋白，以期为脓毒症的诊断和预后判断寻找新的生物标志物。方法:采用成组设计的实验方法，收集2019年1月至12月入住西南医科大学附属医院急诊科的脓毒症患者（脓毒症组）和同期在本院体检健康志愿者（健康对照组）的外周血标本；随机选取两组标本进行数据非依赖性采集模式（DIA）定量检测蛋白，利用生物信息分析方法对差异蛋白在转录水平进行基因本体（GO）功能富集、组间荟萃分析（Meta分析），并构建生存曲线；利用ELISA验证筛选出的指标，将数据与临床血清降钙素原（PCT）、C-反应蛋白（CRP）、血乳酸（Lac）数据共同构建受试者工作特征曲线（ROC曲线），筛选出对脓毒症证具有诊断及预后预测价值的生物标志物。结果:DIA显示，脓毒症组有71个差异蛋白，6个下调、65个上调；这些差异蛋白的GO功能富集于细胞因子介导的信号通路应激反应、炎症反应、白细胞迁移等。组间Meta分析发现，转铁蛋白受体CD71表达在脓毒症组较健康对照组高〔标准化均数差（ SMD）＝-0.47，95%可信区间（95% CI）为-0.93~0.00， P<0.01〕，在死亡组表达较生存组高（ SMD＝-0.44，95% CI为-0.70~-0.18， P＝0.63）。生存曲线分析显示，CD71的表达与生存预后呈负相关，低表达者生存率越高（ P＝0.000 34）。ELISA显示，脓毒症组CD71表达较健康对照组明显升高（nmol/L：156.83±84.71比87.99±47.89， P<0.05），死亡组CD71表达较生存组明显升高（nmol/L：219.63±125.59比130.97±40.45， P<0.05）。ROC曲线分析显示：CD71预测脓毒症的ROC曲线下面积（AUC）＝0.790（敏感度为65.1%，特异度为90.0%）；CD71预测脓毒症患者预后的AUC＝0.744（敏感度为57.1%，特异度为94.1%）；提示CD71对脓毒症的诊断和预后判断能力均强，且预后判断能力优于PCT（AUC＝0.547，敏感度为64.3%，特异度为55.9%）、CRP（AUC＝0.594，敏感度为64.3%，特异度为61.8%）和Lac（AUC＝0.540，敏感度为42.9%，特异度为82.4%）。 结论:CD71对脓毒症有较好的诊断和预后判断价值，具有作为脓毒症生物标志物的潜力。

目的:对脓毒症患者进行蛋白质质谱分析，寻找脓毒症诊治的潜在新靶点。方法:采用横断面观察研究方法，纳入2019年1月至12月在西南医科大学附属医院急诊科急诊重症监护病房（EICU）就诊的12例脓毒症患者及同期9例健康体检者。采集两组受试者外周血进行蛋白质质谱分析，并采用非依赖性采集技术得到各蛋白表达数据。将所得数据导入整合差异表达和通路分析在线网络工具IDEP2，对数据进行ID转换，并进行均一化处理，验证其可比性，再用主成分分析剔除离群数据。以 P<0.05、log 2差异倍数（FC）>1或log 2FC<-1为差异有统计学意义，筛选出差异蛋白。用DAVID在线网站将筛选出的差异蛋白进行基因本体（GO）分析，从蛋白质的生物过程、细胞组分、分子功能3个方面对蛋白进行富集分析，同时进行京都基因与基因组百科全书数据库（KEGG）通路分析。通过基因与蛋白质相互作用检索数据库（STRING）在线网站进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析，找到紧密联系的相关蛋白。 结果:两组数据经均一化处理后提示具有可比性。最终共筛选出125个差异蛋白，其中99个上调，26个下调。GO富集分析显示，筛选出的差异蛋白主要分布在细胞外，具有细胞调节功能及催化活性，参与生物调节、代谢过程及免疫过程；KEGG通路分析提示这些蛋白参与了氨基酸、糖类代谢及免疫相关通路。PPI分析显示，关键蛋白主要为基质金属蛋白酶14（MMP14）、纤维蛋白1（FBLN1）和血浆激肽释放酶1（KLKB1）等，最终筛选出与炎症、免疫等紧密相关的MMP14及KLKB1，二者可能是早期诊治脓毒症的潜在新靶点。结论:MMP14和KLKB1可能为脓毒症诊治及预后判断的潜在生物标志物。

目的:寻找颈椎后纵韧带骨化（OPLL）患者骨化后纵韧带组织与邻近未骨化的后纵韧带组织的差异表达蛋白，探讨OPLL发生的病理生理学机制。方法:选取5例2018年1至3月在北京大学第三医院骨科接受颈椎前路减压手术的颈椎OPLL患者，手术中切除的骨化的后纵韧带组织作为OPLL组，手术中切除的临近未骨化的后纵韧带组织作为对照组，采用基于数据非依赖采集的蛋白质组学技术筛选差异表达的蛋白，通过文献查询明确差异表达蛋白功能，找到在OPLL发生发展中起作用的蛋白质。结果:OPLL组与对照组相比，共有9个蛋白有差异表达（差异倍数≥2和 P<0.05），在骨化后纵韧带组织中的表达均上调，主要与核苷酸转运与代谢、细胞外结构、翻译、核糖体结构与生物发生、一般功能预测、信号转导机制等相关。文献查询后发现其中5个蛋白的功能可能与OPLL的发生发展相关，包括胶原α-1（Ⅱ）链（COL2A1）、基质Gla蛋白（MGP）及信号肽、CUB和EGF-样结构域包含蛋白1（SCUBE1）、骨调节蛋白（OMD）、成纤维细胞生长因子结合蛋白2（FGFBP2）。 结论:本研究筛选到的与OPLL相关的差异表达蛋白，对OPLL病理生理学研究及其生物标志物的发现提供了基础。

目的:探索大学生智能手机成瘾的潜在类别及其在心理和手机使用行为中的特征。方法:2023年7月，选用自编基本信息调查问卷、病人健康问卷抑郁量表(patient health questionnaire，PHQ-9)、UCLA孤独感量表简版(short-form of UCLA loneliness scale，ULS-8)、交往焦虑量表(interaction anxiousness scale，IAS)、错失焦虑量表(fear of missing out scale，FOMOs)、反刍思维量表(ruminative responses scale，RRS)、简版无聊倾向量表(short form version of boredom proneness scale，BPS-SF)、青少年气质量表中的意志控制分问卷、智能手机依赖量表简版(short version of smartphone addiction scale，SAS-SV)对北京市206名大学生进行横断面调查。采集手机使用时间和频率数据。运用SPSS 25.0进行统计描述和组间比较，使用Python 3.8软件K-means算法进行聚类分析，通过随机森林算法评估不同类别影响因素的重要性。结果:(1)手机成瘾[41.00(31.00，47.00)分]与抑郁[6.00(2.00，12.00)分]、孤独感[15.00(11.00，20.00)分]、社交焦虑[46.00(32.75，54.00)分]、错失焦虑[21.00(16.00，28.00)分]、反刍思维[26 .00(22.00，29.00)分]、无聊倾向[41.50(32.00，49.25)分]、平均每日手机使用时间[(513.30±213.29)min]、平均每次手机使用时间[6.60(3.68，14.09)min]呈正相关( r＝0.163～0.626，均 P<0.05)，与意志控制[49.00(44.00，59.00)分]呈负相关( r＝－0.613， P<0.01)。(2)聚类分析结果显示，大学生智能手机成瘾存在3种潜在类别：非成瘾组(32.04%，66/206)、无聊型手机成瘾组(26.70%，55/206)、多风险型手机成瘾组(41.26%，85/206)。(3)不同潜在类别在抑郁、孤独感、社交焦虑、反刍思维、无聊倾向、意志控制、手机成瘾上的得分均差异有统计学意义( H＝138.805，127.342，112.149，88.069，72.146，100.206，115.159，114.926；均 P<0.001)，在平均每日手机使用时间和次数、平均每次手机使用时间上均差异有统计学意义( F/ H＝7.548，9.332，16.086；均 P<0.01)。(4)随机森林算法分析结果显示，非成瘾组特征重要性前3位依次为：意志控制、社交焦虑、错失焦虑，特征重要性分别为0.33、0.23、0.15；无聊型手机成瘾组特征重要性前3位依次为：无聊倾向、错失焦虑、孤独感，特征重要性分别为0.35、0.20、0.15；多风险型手机成瘾组特征重要性前3位依次为：错失焦虑、反刍思维、无聊倾向，特征重要性分别为0.29、0.19、0.17。 结论:大学生智能手机成瘾存在3种潜在类别，各类别在不同心理因素和手机使用行为上差异显著，未来可根据不同大学生群体特点采取针对性心理干预措施。

目的:探究胃肠神经内分泌肿瘤（GI-NENs）原发灶与相应瘤旁组织及肝转移灶中的蛋白表达差异。方法:选取2015年7月至2019年4月于中国医学科学院肿瘤医院手术治疗的9例GI-NENs伴肝脏转移患者的原发灶、肝转移灶组织及相应瘤旁组织，采用数据非依赖性采集（DIA）技术检测其蛋白表达，以 P＜0.05且|log 2FC|＞0.5（FC为差异倍数）作为判定标准，明确原发灶与相应瘤旁组织、原发灶与肝转移灶、不同分化程度原发灶、不同分化程度肝转移灶的差异表达蛋白。对差异表达蛋白进行火山图分析、聚类分析、基因本体（GO）功能分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。 结果:相对于瘤旁组织，胃NENs原发灶中有85种蛋白表达下调，42种蛋白表达上调，差异表达蛋白主要富集在三磷酸鸟苷酶活性调控和脱氧核糖核苷单磷酸盐分解代谢相关的生物过程、糖胺聚糖生物合成-硫酸软骨素/硫酸皮肤素和泛酸盐与CoA生物合成信号通路。肠NENs原发灶中有114种蛋白表达下调，155种蛋白表达上调，差异表达蛋白主要富集在谷胱甘肽代谢和硫化合物代谢相关的生物过程、收集导管酸分泌和牛磺酸、次牛磺酸代谢信号通路。相对于神经内分泌癌（NECs）原发灶，G1～2分化原发灶中有168种蛋白表达下调，278种蛋白上调，差异表达蛋白显著富集在DNA代谢和DNA复制的生物学过程，以及复制和错配修复等通路。相对于NECs转移灶，G1～2分化转移灶中有95种蛋白表达下调，97种蛋白表达上调，差异表达蛋白显著富集到转录共激活子的活性和催化活性功能、碱基切除修复和蛋白外排通路。相对于G1分化的原发灶，G1分化的转移灶中有530种蛋白表达下调，211种蛋白表达上调。相对于G2分化的原发灶，G2分化的转移灶中有53种蛋白表达下调，96种蛋白表达上调。相对于NECs原发灶，NECs转移灶中有109种蛋白表达下调，92种蛋白表达上调。G1和G2分化的GI-NENs原发灶与转移灶差异表达蛋白富集的信号通路中有多条相似，而GI-NECs原发灶与转移灶差异表达蛋白富集的信号通路中只有1条与GI-NENs原发灶与转移灶差异表达蛋白富集的信号通路相同，即药物代谢信号通路。G1分化的原发灶与转移灶差异表达蛋白主要表达于细胞质（20.26%）、线粒体（18.67%）和细胞核（15.48%）。G2分化的原发灶与转移灶差异表达蛋白主要表达于细胞质（20.24%）、细胞核（18.25%）和细胞膜（15.08%）。NECs原发灶与转移灶差异表达蛋白主要表达于细胞核（23.78%）、细胞质（22.7%）和细胞膜（11.35%）。结论:不同部位和分化程度的GI-NENs原发灶、瘤旁组织及转移灶中蛋白表达差异明显。

目的:分析非动脉炎性前部缺血性视神经病变（NAION）模型大鼠视网膜蛋白质表达变化。方法:Sprague-Dawley大鼠20只，随机分为NAION动物（rNAION）模型组、单纯激光照射组、单纯光敏剂孟加拉玫瑰红（RB）组（单纯光敏剂RB组）、正常对照组，每组各为5只，均以右眼为实验眼。采用光动力疗法建立rNAION模型。建模后3 d分离各组大鼠视网膜。采用酶切法进行样本制备；非数据依赖方式采集质谱数据；SWATH定量质谱技术对数据进行定量分析，筛选差异蛋白并进行功能及相关通路分析。结果:rNAION模型组共筛选出差异蛋白184个（表达倍数大于1.5且 P<0.05 ）。其中，上调蛋白99个，下调蛋白85个。胶质纤维酸性蛋白、鸟嘌呤核苷酸结合蛋白4、层粘连蛋白1、14-3-3γ蛋白YWHAG等蛋白表达增加；富含亮氨酸胶质瘤失活蛋白1、分泌载体膜蛋白5及网格蛋白外套蛋白AP180表达降低。差异蛋白主要参与神经生长、能量代谢、囊泡介导的转运、突触可塑性调节、凋亡及炎症反应等生物学进程。通路富集分析结果显示，差异蛋白主要参与磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B （PI3K/Akt）信号通路及补体和凝血酶联反应等信号通路。 结论:NAION的发生可能通过改变能量代谢、神经生长、突触囊泡的运输及PI3K/Akt信号通路等蛋白表达，共同调控神经细胞再生及凋亡。

目的 采用数据非依赖型采集(DIA)蛋白质组学技术分析劳力性热射病(EHS)大鼠血浆蛋白表达的变化.方法 取SPF级雄性SD大鼠10只,随机分为正常对照组(CON组,n=5)和EHS组(n=5),EHS组造模前1周完成温度遥测胶囊植入术,术毕恢复7 d后大鼠在人工气候舱内(温度40℃,相对湿度70％)跑步,监测核心温度达到42.5℃时视为发生EHS.停止跑步后采血进行DIA定量蛋白质组学分析.结果 以表达倍数＞1.5倍且P＜0.05为筛选标准,共筛选出625个上调差异表达蛋白(DEPs)和8个下调DEPs.亚细胞定位注释表明,DEPs主要位于细胞外和细胞质;基因本体论(GO)注释显示,DEPs分子主要功能为蛋白质结合;京都基因与基因组百科全书(KEGG)注释显示,DEPs主要参与免疫反应、能量代谢等信号通路;同源蛋白簇(COG)注释显示,DEPs主要发挥翻译后修饰、蛋白质周转和伴侣功能.蛋白结构域富集分析显示,DEPs结构域主要集中在免疫球蛋白结构域、血小板反应蛋白1型结构域和补体Clr样EGF样结构域;GO富集分析显示,DEPs主要参与血液凝固和纤维蛋白凝块形成、纤溶酶原激活、急性炎症反应的调节等过程;KEGG富集分析显示,DEPs主要参与补体和凝血级联、免疫和细胞黏附分子等信号通路;Reactome通路富集分析显示,DEPs主要参与先天免疫系统、中性粒细胞脱颗粒和血小板活化等信号通路;蛋白互作网络分析发现,参与补体和凝血级联通路的蛋白网络互作较多,且以上调蛋白Fgg、Plg和Serpinc1为主.结论 EHS明显改变大鼠血浆中蛋白表达谱,主要涉及免疫系统异常激活、炎症反应失控和凝血功能紊乱的信号通路.

目的 唾液腺是原发性干燥综合征(pSS)的主要靶器官,因此唾液被认为是腺体病理生理学和疾病状态的镜子.本研究旨在说明pSS患者的唾液蛋白质组学特征,并鉴定可能辅助诊断的潜在生物标志物.方法 发现集包含49个样本[24个来自pSS,25个来自年龄和性别匹配的健康对照(HCs)],验证集包括25个样本(12个来自pSS,13个来自HCs).36例pSS患者和38例健康对照者以2:1的比例集中随机分配至Discovery组或验证组.在2D LC-HRMS/MS平台上使用数据非依赖性采集(DIA)策略分析来自pSS患者和健康对照组的未刺激性全唾液样本,以揭示差异蛋白.根据基因本体(GO)分析和国际药学文摘(IPA)分析的蛋白质注释,使用DIA分析验证了关键蛋白质.随机森林用于建立SS的预测模型.结果共发现1,963个蛋白,其中136个蛋白在pSS患者中表现出差异性.生物信息学研究表明这些蛋白质主要与免疫功能、新陈代谢和炎症有关.一组19个蛋白质生物标志物通过基于P值和随机森林的排序顺序进行鉴定,并验证为具有特殊曲线下面积(AUC)值(发现集:0.817;验证集:0.882)的潜在生物标志物,可用于鉴别pSS患者和健康对照人群.结论新发现的候选蛋白组合可能有助于pSS的诊断.唾液蛋白质组学分析是一种很有前途的无创方法,可用于对pSS患者进行预后评估以及早期和精确治疗.DIA具备最佳的时间效率和数据可靠性,可望成为未来唾液蛋白质组研究的合适选择.

目的:研究鼻咽癌根治后远处转移(rM)和无转移组(CR)患者的血清蛋白质表达谱差异.方法:分别选取5例鼻咽癌根治后发生转移患者及5例无转移患者的血清样本,利用非数据依赖性采集(data-independent acquisition,DIA)质谱技术,比较两组患者的血清蛋白质表达谱,获取差异表达蛋白,并通过GO功能和KEGG通路分析方法对差异蛋白进行富集分析.结果:在所有待测血清样品中最终共鉴定到2 485个蛋白,经筛选共获得差异表达蛋白68个,其中转移组中上调表达蛋白61个,下调表达蛋白7个.富集分析表明差异表达蛋白在补体激活、免疫调控等生物学过程富集,与补体结合及多个酶活性等分子功能密切有关;主要在血液微粒、细胞外区域、细胞外间隙及细胞外泌体等细胞组分间发挥功能.涉及补体与凝血级联、肌动蛋白细胞骨架调控以及细胞凋亡等关键信号通路.结论:血清差异表达蛋白质可能与鼻咽癌转移密切相关,有望成为潜在的鼻咽癌转移预测指标和干预靶点.

目的 基于蛋白质组学,深入揭示1株引起食物中毒事件的肠炎沙门菌21A的分子特征,从而更好地防控食源性疾病的发生.方法 利用定量蛋白质组学技术对肠炎沙门菌株21A进行分析,使用TimsTOF Pro仪器在数据非依赖采集模式下采集质谱数据,利用MSstats软件完成肽段与蛋白的定量以及差异蛋白统计,并对差异表达蛋白的生物学功能进行GO、KOG功能富集、KEGG通路富集分析与CAZY注释、互作分析.结果 菌株21A中共鉴定出3183种蛋白质,其中差异蛋白300种.GO分析表明,差异蛋白主要与催化、结合、细胞内过程和代谢有关;KOG和KEGG分析显示,差异蛋白主要富集在6种代谢通路中;CAZY分析发现,37.96％的蛋白质为糖苷水解酶.结论 本研究揭示了肠炎沙门菌株21A的蛋白质组学特征,该菌株在入侵和感染过程中采用多种生存策略,包括增强毒力因子表达,增加脂质降解和诱导铁获取等.对代谢相关蛋白质的深入分析,有助于深入了解该菌的传播与感染机制,更好地防控食源性疾病的发生.