采用RACE技术克隆获得马氏珠母贝STA RDL3基因cDNA全长序列(Pm-STA RDL3);利用荧光定量技术检测Pm-STA RDL3基因在各个组织中的表达量.结果表明,Pm-STA RDL3基因cDNA序列全长3 655 bp,开放阅读框(ORF)长1 491 bp,编码496个氨基酸,5'非翻译区(5'UTR)长110 bp,3'UTR长2 054 bp.Pm-STARDL3氨基酸序列同源比对分析显示与华贵类栉孔扇贝(Mimachlamys nobilis) STARDL3的序列的相似度最高.SMART软件分析得出,Pm-STARDL3有STARD类蛋白特有的结构域.荧光定量PCR检测结果表明Pm-STARDL3在肝胰腺中表达量最高,其后依次是外套膜、鳃与闭壳肌,各组织的表达量差异具统计学意义(p＜0.05).

为探讨引进种岩扇贝(Crassadoma gigantea)及虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、栉孔扇贝(Chlamys farreri)和海湾扇贝(Argopecten irradians)的遗传变异及其之间的亲缘关系, 研究对4种扇贝的核糖体ITS1序列及5S rDNA序列进行了测定,获得了4种扇贝的ITS1和5S rDNA全序列以及18S rDNA的部分序列,并进行了序列特征、遗传多样性、遗传距离及系统发育等相关分析.结果显示, 基于ITS1序列的单倍型数、核苷酸变异位点、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别在2—6、1—12、0.425—0.800、0.00081—0.00486和0.366—2.442; 基于5S 序列的相应参数分别在2—5、1—14、0.533—0.841、0.00108—0.01058和0.533—5.726.4种扇贝均表现出较低的多样性水平(π<0.01).此外, 4种扇贝基于2种方法计算的种间遗传距离分别在0.040—0.121和0.042—0.413, 均表现为岩扇贝与虾夷扇贝的遗传距离最近, 而岩扇贝与海湾扇贝遗传距离最远.并且系统进化树分析显示岩扇贝与虾夷扇贝独自聚为一支, 说明引进物种岩扇贝与虾夷扇贝的亲缘关系较近.研究结果将为岩扇贝的种质资源保护以及今后的遗传育种研究工作提供参考信息.

为了研究SRBI基因的结构、功能以及在贝类壳色形成中的作用,利用SMART RACE技术克隆得到文蛤(Meretrix meretrix) SRBI (Mm-SRBI)基因的全长序列, 并对其内含子特征及不同组织、不同壳色群体外套膜中的表达差异进行了分析.结果表明:Mm-SRBI基因cDNA全长1676 bp,开放阅读框1515 bp,编码504个氨基酸,结构域预测发现有一个CD36结构域; 氨基酸序列比对发现, 与华贵栉孔扇贝的同源性最高(55%), 与其他物种的相似性在34%—40%,表明该基因变异较大;在Mm-SRBI基因中扩增出12个内含子,均存在于开放阅读框中,且都遵循GT-AG原则;荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明,Mm-SRBI在闭壳肌、外套膜、斧足、鳃、内脏团和水管6个组织均有表达, 其中在外套膜中表达量显著高于其他组织(P<0.01), 这可能与外套膜中类胡萝卜素含量较高有关; 不同壳色群体外套膜中基因表达分析表明, Mm-SRBI在黑斑和红壳文蛤中的表达量显著高于白壳文蛤(P<0.05).实验结果为文蛤壳色形成研究奠定了基础.

硫化物是含有-2价硫离子化合物的统称,会抑制复合体Ⅳ活性,是水产养殖中常见的有毒物质.以水产养殖动物栉孔扇贝为研究对象,评估硫化物对线粒体的损伤.研究结果显示硫化物能显著降低栉孔扇贝各组织线粒体活力和SOD酶活,增加线粒体的肿胀度和MDA含量,影响线粒体的功能,造成线粒体的损伤,进而对栉孔扇贝产生毒害作用.

基于2014-2016年青岛崂山湾人工鱼礁区的生物资源调查数据,利用Ecopath with Ecosim(EwE)软件构建崂山湾人工鱼礁区生态系统生态通道模型(Ecopath),系统分析了崂山湾人工鱼礁区生态系统的能量流动规律和结构特征,估算了栉孔扇贝的养殖容量.该模型由17个功能组组成,基本涵盖了崂山湾人工鱼礁区生态系统能量流动的主要过程.生态网络分析表明,生态系统各功能组的营养级范围为1.0-4.255,星康吉鳗占据了营养级的最高层.能量流动主要有5级,各营养级平均能量传递效率为10.8％,其中来自初级生产者的能量效率为9.8％,来自碎屑的传递效率为10.9％;系统总流量为14256.510 t km-2 a-1,其中68％的能量来自碎屑供给;系统的总初级生产量/总呼吸量为1.127,系统联结指数为0.293,杂食指数为0.333,表明崂山湾人工鱼礁区生态系统成熟度较高,食物网结构较复杂,系统内部稳定性较高.关键种指数分析结果显示,许氏平鲉具有较高的关键指数和相对总影响,表明其可能在当前生态系统中扮演重要的生态角色.吊笼养殖栉孔扇贝生态容纳量为189.679 t/km2,在维持生态系统平衡和稳定的前提下,当前现存量最大可增加18.55％.

本试验建立了4组中型实验生态系统,即空白对照系统、许氏平鮋单养系统、栉孔扇贝单养系统和许氏平鮋-栉孔扇贝混养系统,利用静态箱-气相色谱法对各养殖系统水-气界面CO2通量进行观测,并测定养殖水体物理、化学和生物指标.结果表明:试验期间,空白对照系统表现为稳定的对大气CO2的源,平均通量为12.42 mg·m-2·h-1.扇贝单养系统在试验前期和中期为CO2的源,后期为CO2的汇,试验期间整体为CO2的源,平均通量为10.95 mg·m-2·h-1.许氏平鮋单养系统和许氏平鮋-栉孔扇贝混养系统在试验前期表现为CO2源,实验中后期为CO2的汇,试验期间平均通量分别为-3.53和-10.49 mg·m-2·h-1,整体上均为对大气CO2的汇.回归分析结果显示,水体pH是水-气界面CO2通量较好的预测因子,pH=8.25是系统水-气界面碳源/汇功能发生转变的临界值.线性混合模型分析结果显示,水体净初级生产力是影响各系统水-气界面CO2通量的主要因子,表明浮游植物是调控系统水-气界面CO2通量的主要生物内动力.在本试验混养密度条件下的栉孔扇贝能一定程度上促进浮游植物生物量和水体初级生产力,从而增强系统水-气界面CO2的碳汇功能.

为了解Airin在华贵栉孔扇贝(Chlamys nobilis)中的作用,本研究分离了华贵栉孔扇贝Akirin2基因(命名为CnAkirin 2),并描述了CnAkirin 2的特征.使用转录组分析和PCR方法获得了CnAkirin 2 cDNA序列,通过序列比对分析了Akirin氨基酸序列在不同物种中的保守性,使用MEGA 7.0软件的邻接法构建了Akirin 2的系统进化树,使用实时定量PCR分析了Akirin2在华贵栉孔扇贝6种不同组织中的表达.结果 显示:该基因序列全长1 888 bp,开放阅读框长597 bp,编码氨基酸198个;CnAkirin 2的预测分子量为22.11 kD,理论等电点pI为9.30,具有核定位信号PKRRRCM;不同物种Akirin氨基酸多序列比对结果显示,推译的CnAkirin 2氨基酸序列与其他物种Akirin氨基酸序列在N端和C端具有高度相似性;使用邻接法构建的系统进化树显示CnAkirin 2与牡蛎和其它扇贝等贝类Akirin聚为一支;实时定量PCR结果表明CnAkirin 2在不同组织中均有表达,其中在精巢表达量最高,其次为卵巢,在其它组织中的表达水平最低,推测其可能在性腺发育过程中发挥重要作用.本研究为探索CnAirin 2在华贵栉孔扇贝中的作用奠定了基础.

本研究旨在对香港牡蛎Foxl2基因进行克隆、序列分析及建立其在香港牡蛎组织中的表达模式谱.以GenBank数据库中己上传的太平洋牡蛎Foxl2基因序列为模板,设计特异性引物扩增获得香港牡蛎Foxl2基因;应用生物信息学方法,系统分析和预测香港牡蛎Foxl2基因的遗传进化、蛋白质的理化性质和结构特征;并应用QRT-PCR技术对Foxl2在香港牡蛎组织中的表达进行了差异分析.结果 表明:香港牡蛎Foxl2基因编码区全长1 104 bp,共编码氨基酸367个.多重序列比较分析显示香港牡蛎Foxl2核苷酸序列相似性与太平洋牡蛎、美洲牡蛎、大珠母贝、栉孔扇贝、虾夷扇贝、皱纹盘鲍相应序列的相似性分别为97％、83％、71％、76％、75％、75％,系统进化树分析显示在不同物种以及进化的过程中Foxl2基因具有较高的保守性.Foxl2蛋白质信息学分析结果表明该蛋白呈碱性,N端无信号肽存在,位于胞核中,含有FH等结构.定量分析结果显示:Foxl2在香港牡蛎3种组织中有表达,其中表达量最高的是性腺,其次是唇瓣,鳃中相对表达量最低.本研究成功地克隆了香港牡蛎Foxl2基因,并研究了其在香港牡蛎8种组织中的表达变化规律,为今后阐明其在香港牡蛎性腺发育进程中的功能提供了理论依据.

为了探究远岸深水海区和近岸浅水海区养殖的栉孔扇贝(Chlamys farreri)形态上的差异,运用传统形态测量学和几何形态测量学的方法,对来自近岸浅水海区(15 m水深)和远岸深水海区(30 m水深)底栖养殖的2龄栉孔扇贝进行形态测量学研究和比较分析.结果表明:深水养殖的栉孔扇贝的壳高(SH)、壳长(SL)和壳宽(SW)都极显著大于浅水养殖的栉孔扇贝(P<0.01);通过界标点(Landmarks)和半界标点(Semi-landmarks)的方法,及广义普鲁克分析(GPA)、主成分分析(PCA)和典型变量分析(CVA),结果表明深水养殖的栉孔扇贝的整体壳形尺寸大于浅水养殖的栉孔扇贝,除去尺寸大小因素后两者的壳耳和壳体扇形边缘存在显著差异.文章为栉孔扇贝深水养殖的选育和增养殖工作提供基于形态学研究的理论依据,同时比较分析了传统形态测量学和几何形态测量学的原理和分析方法,为研究生物体形态差异时选择合适的研究方法提供新参考.

目的 研究栉孔扇贝不同部位(柱、性腺、肝脏、外套膜、鳃、足)多糖的抗肿瘤活性.方法 以新鲜栉孔扇贝为原材料,经胰蛋白酶水解、醇沉后得到栉孔扇贝不同部位多糖,通过柱前衍生高效液相色谱法进行栉孔扇贝不同部位多糖的单糖组成分析,以人宫颈癌细胞(HeLa)和人肝癌细胞(HepG2)为对象对栉孔扇贝不同部位多糖的抗肿瘤活性进行研究.结果 从新鲜栉孔扇贝中提取得到6种多糖,分别为栉孔扇贝柱多糖(CFCP)、栉孔扇贝性腺多糖(CFGOP)、栉孔扇贝肝脏多糖(CFLP)、栉孔扇贝外套膜多糖(CFMP)、栉孔扇贝鳃多糖(CFGIP)、栉孔扇贝足多糖(CFFP),其中CFCP仅含1 种单糖,其余5 种多糖均含10 种单糖,且单糖摩尔比各不相同.栉孔扇贝6 种部位多糖对HeLa 细胞的抑制率均随多糖浓度的增大而增大,其中CFLP抑制率最强..CFCP、CFGOP、CFMP对HepG2细胞的抑制率均较弱,CFLP、CFGIP、CFFP对HepG2细胞的抑制率均随多糖浓度的增大而增大,其中CFFP抑制率最强.结论 栉孔扇贝不同部位多糖对HeLa 细胞的抑制率由高到低依次为CFLP＞CFGOP＞CFMP＞CFGIP＞CFFP,对HepG2 细胞的抑制率由高到低依次为CFFP＞CFLP＞CFGIP 同时,CFFP、CFMP、CFGIP、CFLP、CFGOP 5种多糖对HeLa细胞的抑制作用普遍高于HepG2细胞.