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阴道菌群失调与宫腔粘连的关联性研究
编辑人员丨6天前
目的 探讨阴道菌群失调与宫腔粘连(IUA)的关联性.方法 招募2022年1月1日至2022年5月31日于中南大学湘雅三医院接受治疗的IUA患者30例作为IUA组,另选择同期经宫腔镜检查确定无IUA的健康女性30名作为对照组.使用无菌拭子采集阴道中段分泌物样本,通过聚合酶链反应对16S rRNA基因的可变区进行扩增,并在MiSeq Illumina测序平台上进行高通量测序.通过生物信息学分析方法处理测序数据并进行菌群多样性分析等.结果 菌群多样性分析结果显示,IUA组的菌种多样性低于对照组,等级-丰度分布曲线提示对照组阴道中段菌群丰度更高,物种分布更均匀.Alpha多样性分析结果表明,IUA组的Chao指数、ACE指数、谱系多样性指数、香农指数和观测物种数均显著低于对照组(P<0.05),而辛普森指数显著高于对照组(P<0.05).IUA组中厚壁菌门的相对丰度显著高于对照组(P<0.05),而放线菌、拟杆菌、变形杆菌、梭杆菌、扁形菌门、疣微生物、糖杆菌的相对丰度显著低于对照组(P<0.05).IUA组中乳酸杆菌原噬菌体Lj928、肺炎克雷伯菌、罗斯菌的相对丰度显著高于对照组(P<0.05),而阴道阿托波菌、双歧杆菌、假单胞菌、普雷沃菌、维氏气单胞菌、厦门希瓦菌、产黑素拟杆菌、卟啉单胞菌、考拉杆菌属的相对丰度显著低于对照组(P<0.05).结论 IUA患者阴道菌群丰富度及多样性显著下降,这可能是IUA发生的机制之一.改善阴道菌群失调可能有助于IUA的预防和治疗.
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编辑人员丨6天前
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灌丛化对宁夏东部荒漠草原草地植被群落的影响
编辑人员丨6天前
草原灌丛化是全球干旱半干旱地区面临的重要生态问题,对草地植被群落特征的影响较为复杂,尚存在较大争议.在宁夏东部荒漠草原分别选取轻度、中度、重度及未灌丛化样地,利用植被群落调查和经典生态位理论,研究了自然入侵的柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii)对宁夏东部荒漠草原植被群落及生态位特征的影响.结果表明:(1)灌丛化过程中,草本植被群落的高度、地上生物量显著上升,而密度显著下降,群落向着密度稀疏,而生物量增大的方向演替.(2)Shannon-Wiener多样性指数、Simpson多样性指数、Margalef丰富度指数表现为:轻度灌丛化>重度灌丛化>中度灌丛化>未灌丛化样地,Pielou均匀度指数随着灌丛化程度的加剧而显著上升.(3)猪毛蒿(Artemisia scoparia)、猪毛菜(Salsola collina)、蒙古虫实(Corispermum mongolicum)、兴安胡枝子(Lespedeza davurica)、雾冰藜(Grubovia dasyphylla)等物种具有较大的重要值和生态位宽度,作为荒漠草原优势物种.中度灌丛化区域重要值与生态位宽度的拟合度高,置信带区间较窄,相关性强,进一步说明中度灌丛化更适宜于这些优势物种的生存和繁殖.(4)灌丛化模式驱动下,除了部分优势物种的生态位重叠度较高,荒漠草原植被群落整体生态位重叠度普遍较低,物种生态位分化明显,种间竞争小.综上所述,柠条锦鸡儿入侵荒漠草原生态系统,促进了灌下草本植物的生长,且有利于草原生态系统的稳定.
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编辑人员丨6天前
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基于红外相机监测黑龙江凉水国家级自然保护区兽类多样性及其变化
编辑人员丨6天前
兽类作为生态系统重要组成部分,是生物多样性保护管理与评价的关键指示类群.黑龙江凉水国家级自然保护区是野生兽类的重要栖息地之一,为掌握该地区兽类多样性现状及变化趋势,2018年1月至2021年12月、2022年4月至2023年12月,在黑龙江凉水国家级自然保护区利用红外相机对兽类多样性及其变化进行了研究,总计50405个相机有效工作日,5981张独立有效照片.研究发现:1)黑龙江凉水国家级自然保护区兽类共15个物种,隶属5目10科,其中国家一级重点保护兽类1种,为紫貂(Martes zibellina),国家二级重点保护兽类 4 种,为黄喉貂(M.flavigula)、豹猫(Prionailurus bengalensis)、猞猁(Lynx lynx)和黑熊(Ursus thibetanus).2)黑龙江凉水国家级自然保护区相对多度前五的兽类依次为狍(Capriolus pygargus)(7.694)、野猪(Sus scrofa)(1.458)、亚洲狗獾(Meles leucurus)(0.809)、北松鼠(Sciurus vulgari)(0.650)、紫貂(0.564).3)红背?(Myodes rutilus)和黑线姬鼠(Apodemus agrarius)仅在2022年出现,猞猁则在2023年时隔多年被记录.4)通过EstimateS9.1估算,实际监测的兽类物种数在约为全部兽类物种的75%—83.33%.5)凉水国家级自然保护区物种数呈上升趋势,2022年监测到的物种数最高,为14种.年多样性指数起伏波动大(0.833-1.394),没有显著差异(x2=7.496,df=5,P>0.05).均匀度指数年际间存在显著差异呈下降趋势(x2=11.525,df=5,P<0.05).2021年的多样性指数和均匀度指数均为最低值,分别为0.833和0.428.物种本底数据的调查是开展生物多样性保护管理与评价工作的基础,研究通过了解黑龙江凉水国家级自然保护区内兽类多样性现状及其年际间变化,可以为黑龙江凉水国家级自然保护区制定合理有效的兽类多样性保护管理对策提供参考,同时为保护珍稀兽类及其栖息地提供科学依据.
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编辑人员丨6天前
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基于肠道菌群探讨宣痹汤对高尿酸血症大鼠的作用研究
编辑人员丨6天前
目的 基于肠道菌群探讨宣痹汤对高尿酸血症大鼠的作用.方法 将60只SPF级Wistar大鼠按随机数字表法分为正常组、模型组、别嘌醇组、宣痹汤低、中、高剂量组,每组10只.第21天收集大鼠粪便通过宏基因测序技术分析肠道菌群组成差异和代谢通路;通过试剂盒测定大鼠血清尿酸水平,黄嘌呤氧化酶与腺苷脱氨酶的活性;采用HE染色法观察大鼠小肠组织病理变化.结果 与对照组比较,模型组血尿酸水平明显上升,提示造模成功,HE染色结果显示小肠绒毛变短;与模型组比较,宣痹汤不同剂量组的血清尿酸,黄嘌呤氧化酶与腺苷脱氨酶活性均有下降(均P<0.05).宏基因测序结果显示宣痹汤干预后的模型组大鼠Chao1指数显著升高(P<0.05),Beta多样性显示模型组与宣痹汤高剂量组菌群构成具有明显变化,宣痹汤高剂量组一定程度上能够回调模型组的菌群组成.KEGG富集功能分析显示宣痹高剂量汤组上调了脂质代谢、折叠分类降解(P<0.05),下调了异生物素的生物降解代谢、萜类和聚酮化合物的代谢(P<0.05).结论 宣痹汤能够降低HUA大鼠尿酸,抑制ADA与XOD活性,改善小肠的病理变化,其作用机制可能与其提高肠道有益菌群组成丰度有关.
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编辑人员丨6天前
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子宫颈微生态与宫颈鳞状上皮内病变关系的研究
编辑人员丨6天前
目的:探讨子宫颈微生态与宫颈鳞状上皮内病变(squamous intraepithelial lesion,SIL)的关系。方法:选取2019年3月至5月南京医科大学附属无锡第二医院体检中心体检的和妇科就诊的12例子宫颈正常受试者(37~47岁),21例低度鳞状上皮内病变(low-grade squamous intraepithelial lesion,LSIL)患者(39~48岁),5例高度鳞状上皮内病变(high-grade squamous intraepithelial lesion,HSIL)患者(38~45岁)和3例宫颈鳞癌患者(42~43岁),填写调查问卷、行子宫颈检查,同时使用下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)分析子宫颈分泌物的微生态,生物信息学分析NGS结果。根据NGS的人乳头状瘤病毒(human papilloma virus,HPV)检测结果将受试者分为HPV阴性组、低危HPV(low-risk HPV,lrHPV)、16/18型高危HPV(high-risk HPV,hrHPV)和其他hrHPV感染组。分析数据的韦恩图、微生态的多样性、物种的相对丰度和共现性以及受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线。结果:所有受试者子宫颈分泌物共获得种属水平微生态物种909种,各组之间有重叠。在不同宫颈病变受试者中,总HPV感染率、16/18型hrHPV感染率和其他hrHPV感染率差异无统计学意义( P均>0.05)。按HPV感染分组,16/18型hrHPV和其他hrHPV感染患者的子宫颈微生态多样性升高( U分别为39.00和43.00, P均<0.05),而各组之间卷曲乳酸杆菌相对丰度无差异( H=4.37, P=0.213 6)。按子宫颈状况分组,子宫颈病变受试者子宫颈微生态多样性( H=14.60, P=0.002 2)升高,卷曲乳酸杆菌丰度下降( H=13.98, P=0.000 8)。在微生态物种中,支原体、衣原体和B族链球菌具有共现性;惰性乳酸杆菌、阴道加德纳菌、阿托波菌和二路普氏菌具有共现性。以卷曲乳酸杆菌相对丰度作为SIL诊断指标,其ROC曲线下面积(area under ROC curve,AUC)为0.874[95%置信区间(confidence interval, CI):0.732~0.957],卷曲乳酸杆菌和詹氏乳酸杆菌以及支原体联合诊断SIL的AUC为0.943[95 %CI:0.822~0.991]。 结论:子宫颈卷曲乳酸杆菌相对丰度下降和微生态多样性升高可能与HPV感染和子宫颈病变有关;NGS数据简化后可能有助于SIL诊断。
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编辑人员丨6天前
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呼吸道微生物在早产儿支气管肺发育不良中的作用研究进展
编辑人员丨6天前
支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)是早产儿常见的呼吸系统疾病之一。早产儿呼吸道定植微生物因受自身生理基础及外界因素影响出现菌群多样性下降和物种组成变化,直接或间接参与了炎症反应和免疫调节等过程,在BPD的发生发展过程中起了重要作用。本文综述了BPD早产儿呼吸道微生物的特点及其在BPD发生发展过程中作用的研究进展,并就微生物在BPD预测和治疗中的应用前景进行探讨。
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编辑人员丨6天前
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脓毒症儿童的肠道菌群特征及益生菌的干预作用
编辑人员丨6天前
目的:分析脓毒症儿童肠道菌群特征及益生菌的干预作用。方法:采用前瞻性观察性研究方法,纳入收住我院儿童重症医学科(PICU)的脓毒症患儿34例随机分为两组,一组予以常规治疗(常规组,A组, n=17),另一组在常规治疗基础上添加益生菌辅助治疗(益生菌组,B组, n=17),同时选取健康儿童20例作为对照组(C组)。入组24 h内记录所有脓毒症患儿的一般情况及序贯器官衰竭评分(SOFA),并于入组后5~7 d,采集患儿的粪便样本,同期留取健康患儿粪便样本,运用高通量16S rRNA基因测序技术进行肠道菌群检测,进行生物信息学分析并预测肠道菌群功能,比较组间差异。 结果:α多样性指数及β多样性指数分析显示,两组脓毒症患儿肠道菌群的丰度均较健康儿童明显下降,同时菌群的个体差异也呈加大趋势,但是服用益生菌后,上述指标得到了显著改善( P<0.05);在菌门水平上,常规治疗组的拟杆菌门和放线菌门比例最低,变形菌门的数量明显增加( P<0.05);在菌属水平上,肠球菌成为常规治疗组中的优势菌种,而在益生菌组中双歧杆菌、普氏粪杆菌及丹毒丝菌、扭链胃球菌的比例明显提高( P<0.05);益生菌组与常规组相比,两者在线粒体合成、外泌体、mRNA转录降解及半胱氨酸代谢等通路的丰度存在明显差异。 结论:脓毒症儿童肠道菌群的多样性下降,结构稳定性差,同时拟杆菌减少伴变形杆菌增多,而添加益生菌辅助治疗后可增加患儿双歧杆菌及普氏粪杆菌等有益菌的比例,减少肠球菌等机会致病菌的数量,其差异性代谢通路可能与益生菌的作用机制相关。
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编辑人员丨6天前
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粪菌移植对阿霉素肾病小鼠肠道菌群紊乱改善的实验研究
编辑人员丨6天前
目的:研究粪菌移植对阿霉素诱导的肾病综合征小鼠模型的作用。方法:将27只SPF级雄性Balb/c小鼠随机分为3组,分别为空白对照组、阿霉素模型组(Dox组)、阿霉素+粪菌移植(FMT组),其中后两组使用阿霉素尾静脉注射构建肾病综合征小鼠模型,并分别给予PBS或粪菌溶液灌胃,最后分别收集粪便标本以及24 h尿液标本,考马斯亮蓝法-蛋白定量检测24 h尿蛋白,16 s微生物组学测序和生物信息学分析各组小鼠肠道菌群的变化情况和分布特征。结果:与空白对照组相比,Dox组小鼠24 h尿蛋白定量(0.48±0.61 vs 1.71±0.63, P<0.001)明显升高,肠道菌群多样性Shannon指数(7.15±0.29 vs 6.98±0.49)呈减少趋势,肠道菌群紊乱;与Dox组小鼠相比,FMT组24 h尿蛋白定量(1.71±0.63 vs 0.91±0.48, P<0.05)和血肌酐水平(12.47±4.16 vs 7.77±0.75, P<0.05)显著下降,肠道菌群多样性Shannon指数(6.98±0.49 vs 7.09±0.28)呈现增加趋势,肠道菌群紊乱明显改善,产短链脂肪酸细菌富集增加。 结论:粪菌移植可减少阿霉素诱导的肾病小鼠的尿蛋白,改善肠道菌群的紊乱。
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编辑人员丨6天前
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短期极低热量限制对超重/肥胖2型糖尿病患者肠道菌群的影响
编辑人员丨6天前
目的:探究短期极低热量限制(very low-calorie restriction,VLCR)对超重/肥胖2型糖尿病患者的代谢改善疗效,结合微生物多样性检测技术明确肠道菌群的变化,探讨VLCR临床疗效的机制。方法:纳入14例超重/肥胖2型糖尿病患者,住院进行9天VLCR(热量摄入300~600 kcal/d)。在VLCR前后,测量受试者体重、腰围、血压和心率等指标,计算体重指数。检测空腹血糖、餐后2 h血糖、空腹胰岛素、血脂等糖脂代谢指标,并计算稳态模型评估的胰岛素抵抗指数。检测肝肾功能、电解质等指标,计算估计的肾小球滤过率。使用SPSS软件分析上述指标在治疗前后的差异。收集受试者VLCR前后的粪便,运用16S rDNA高通量测序技术对粪便样本进行肠道微生物多样性检测,专业软件分析VLCR前后肠道菌群的差异。结果:9天VLCR后,超重/肥胖2型糖尿病患者的体重、体重指数、腰围、血压、空腹及餐后2 h血糖、胰岛素、胰岛素抵抗指数、碱性磷酸酶、三酰甘油和尿素氮显著降低( P<0.05)。血清丙氨酸转氨酶、天冬氨酸氨基转移酶、γ-谷氨酰转肽酶、高密度脂蛋白胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇、肌酐、估计的肾小球滤过率、尿酸、白蛋白、钙和磷无明显变化( P>0.05)。粪便中肠道菌群的α多样性无显著改变,拟杆菌门的丰度显著升高,厚壁菌门/拟杆菌门的比值从11.79显著下降至4.20。组间差异分析得出狄氏副拟杆菌是关键的差异菌种。 结论:VLCR可显著改善超重/肥胖2型糖尿病患者的体重和糖脂代谢,且无严重不良事件的发生。狄氏副拟杆菌可能是VLCR的标志肠道菌群。
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编辑人员丨6天前
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HPV16阳性子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群构成及特征
编辑人员丨6天前
目的:探讨人乳头瘤病毒(HPV)16亚型感染的子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群的分布及特征。方法:前瞻性横断面研究。选取2019年8月至2020年6月就诊于中国医学科学院肿瘤医院的6例HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者(子宫颈癌组),选取同期体检人群中液基薄层细胞学检查未见异常且HPV阴性6名健康女性为健康对照组。患者抗肿瘤治疗前、健康对照者体检时用无菌棉拭子采集子宫颈后穹窿处分泌物,采用高通量测序技术扩增细菌16S rRNA基因V1-V2高变区,分析菌群分布及特征。结果:子宫颈癌组和健康对照组年龄分别为(51±8)岁、(48±3)岁,差异无统计学意义( t=0.63, P=0.540),两组均有孕产史,无吸烟史。α多样性分析结果显示,与健康对照组比较,子宫颈癌组sobs指数( t=3.25, P=0.009)及chao指数( t=2.91, P=0.016)均高,差异均有统计学意义;子宫颈癌组shannon指数高( t=2.07, P=0.065),simpson指数低( t=1.74, P=0.113),但差异均无统计学意义。采用基于bray-curtis距离的主坐标分析(PCoA)进行数据降维分析显示,子宫颈癌组与健康对照组间β多样性差异具有统计学意义( R2=0.154, P=0.018)。门水平上,与健康对照组相比,子宫颈癌组厚壁菌门占比低(30.21%比68.28%),拟杆菌门占比略低(6.87%比8.11%),而放线菌门(26.91%比14.42%)及变形菌门(27.33%比0.67%)占比高。属水平上,与健康对照组相比,子宫颈癌组乳杆菌属及棒状菌属占比低,失去优势菌群,而红球菌属、克雷伯菌属、气球菌属等占比明显高,且子宫颈癌组菌群种类较健康对照组多。线性判别分析(LDA)显示,属水平上,红球菌属(LDA=5.04)、克雷伯菌属(LDA=4.71)、肠杆菌属(LDA=4.29)、罗尔斯通菌属(LDA=4.28)、苍白杆菌属(LDA=4.23)、韦荣球菌属(LDA=4.14)为子宫颈癌组特征菌群;门水平上,健康对照组厚壁菌门(LDA=5.23)可为标志性物种;种水平上,子宫颈癌组红球菌( P=0.025)、罗尔斯通菌( P=0.045)、韦荣氏球菌( P=0.044)、卡氏伯克霍尔德菌( P=0.045)、假单胞菌( P=0.043)等均较健康对照组多,差异均有统计学意义。 结论:HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群多样性、丰富度较健康女性增加,乳杆菌属丰度下降;红球菌属、克雷伯菌属可作为其标志性下生殖道菌群,但仍需进一步验证。
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编辑人员丨6天前
