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敲低FAM83A对结直肠癌细胞增殖能力的影响及机制研究
编辑人员丨1周前
目的:探索序列相似性83家族成员A(family with sequence similarity 83 member A,FAM83A)在结直肠癌的表达情况,和敲低FAM83A对结直肠癌细胞增殖能力的影响及相关机制。方法:用免疫组化检测102例结直肠癌患者组织及其癌旁组织标本中FAM83A的表达情况。将HCT116细胞分为实验组和对照组,实验组细胞转染FAM83A-siRNA质粒,对照组细胞转染MOCK-siRNA质粒,荧光定量PCR检测各组细胞FAM83A mRNA含量,蛋白质印迹法检测各组细胞的FAM83A、P13K、p-AKT、p-mTOR表达情况,CCK8实验和克隆形成实验检测各组细胞的增殖能力。结果:结直肠癌患者组织FAM83A阳性率为88.23%(90/102),癌旁组织中表达率为10.78%(11/102),FAM83A在结直肠癌组织中的表达率显著高于癌旁组织,差异具有统计学意义( P<0.001)。转染siRNA后,实验组和对照组HCT116细胞中FAM83A mRNA表达量分别为1.23±0.20和0.43±0.12,FAM83A蛋白表达量分别为1.19±0.11和0.23±0.08,P13K的表达量分别为1.21±0.17、0.28±0.09,p-AKT的表达量分别为1.35±0.23、0.57±0.18,p-mTOR表达量分别为1.48±0.20、1.05±0.14,P13K、p-AKT、p-mTOR表达均下调(均 P<0.05)。实验组和对照组HCT116细胞CCK8实验120 h的吸光度分别为1.09±0.22和2.21±0.27,实验组和对照组HCT116细胞的克隆形成率分别为21.6%±2.4%和62.7%±4.1%,实验组细胞增殖能力明显下降( P<0.05)。 结论:FAM83A在结直肠癌组织中表达明显升高,可能与结直肠癌的恶性程度相关;且FAM83A通过P13K/AKT/mTOR信号通路影响结直肠癌细胞的增殖能力。
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编辑人员丨1周前
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FAM83A对胰腺癌细胞PANC-1干细胞样表型和放射敏感性的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨FAM83A对胰腺癌细胞PANC-1干细胞样表型和放射敏感性的影响,旨在为胰腺癌靶向治疗提供新思路.方法 慢病毒感染构建稳定沉默FAM83A的PANC-1细胞株,qPCR和Western blot进行验证;流式细胞仪检测干细胞标记物CD133阳性的细胞数;肿瘤细胞成球实验检测PANC-1细胞成球能力;MTT检测吉西他滨对PANC-1稳转株细胞活力的影响;平板克隆形成实验检测X射线照射对PANC-1稳转株细胞增殖的影响;流式细胞术检测吉西他滨和X射线照射对PANC-1稳转株细胞凋亡的影响;Western blot检测PANC-1稳转株细胞中Wnt/β-catenin信号通路表达变化.结果 沉默FAM83A后PANC-1细胞中FAM83A蛋白表达(0.83±0.08)和mRNA表达(0.29±0.03)较阴性对照组FAM83A蛋白表达(1.95±0.19)和mRNA表达(0.98±0.09)显著降低(t=9.410、12.600,P<0.05);沉默FAM83A后CD133阳性PANC-1细胞率(8.97±0.62)% 较阴性对照组(21.60±2.60)% 显著降低(t=8.184,P<0.05),且细胞成球数(8±1)较阴性对照组(25±3)亦显著降低(t=9.311,P<0.05),PANC-1细胞干细胞样表型显著被抑制;沉默FAM83A联合50μmol/L吉西他滨处理PANC-1细胞72 h后细胞活力(32.33±3.05)% 较吉西他滨处理组(63.06±5.98)%显著降低,细胞凋亡率(76.52±8.34)% 较吉西他滨处理组(40.88±4.91)% 显著增加,差异有统计学意义(t=6.378、7.929,P<0.05);沉默FAM83A联合X射线照射后,PANC-1细胞活力(43.25±4.21)%较X射线照射组(78.13±7.98)%明显降低,细胞凋亡率(44.56±5.32)% 较X射线照射组(15.15±1.95)% 明显增加,差异有统计学意义(t=6.694、8.990,P<0.05);沉默FAM83A后细胞中Wnt/β-catenin信号通路蛋白Active-β-catenin表达降低,p-β-catenin表达增加,且细胞核中 β-catenin表达也降低,差异有统计学意义(t=10.290、8.521、8.969,P<0.05),而Totalβ-catenin无明显变化,细胞中Wnt/β-catenin信号通路活性明显被抑制.结论 沉默FAM83A可能通过Wnt/β-catenin信号抑制胰腺癌细胞干细胞样表型,增强细胞对化疗药物吉西他滨及放射敏感性,FAM83A将可为胰腺癌临床治疗提供新靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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花花柴KcbHLH71基因的克隆及表达分析
编辑人员丨2023/8/6
高温胁迫可引起植物体内生长素类激素含量和活性变化,也可影响其生理生化过程进而产生胁迫蛋白以提高自身抵抗或适应逆境的能力.根据高温胁迫下花花柴转录组测序分析结果,发现生长激素合成相关基因bHLH显著上调,通过PCR克隆获得该基因碱基序列,命名为KcbHLH71,并利用定量PCR对高温胁迫下该基因的表达模式进行分析.结果 显示,花花柴KcbHLH71基因完整ORF为1 038 bp,编码345个氨基酸,分子量大小为38.8 kD,pI为6.8;编码蛋白含有bHLH蛋白家族的特征基序列和保守结构域,有信号肽,无跨膜结构,定位于细胞核.系统发育结果显示花花柴KcbHLH71与菊科的向日葵、莴苣bHLH71蛋白的相似性分别为88%和83%,即认为它们同源性最高,亲缘关系最近.表达分析结果显示,高温胁迫下,花花柴KcbHLH71基因2h的表达量受到最大抑制,之后逐渐上升,当12h时达到高峰,12~24 h再次出现下降,但仍高于对照水平.以上研究结果表明,高温可以显著诱导KcbHLH71基因的表达,推测该基因可能参与花花柴响应高温胁迫的正调控.
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编辑人员丨2023/8/6
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铁皮石斛GRAS转录因子家族基因SCL3克隆及表达分析
编辑人员丨2023/8/6
GRAS家族是一类植物特有的转录调控因子,参与调控植物生长发育及抵御逆境胁迫,并且在赤霉素(gibberellins,GAs)信号转导过程中具有重要作用.本研究采用RT-PCR结合RACE方法从铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)原球茎中克隆到了一个转录因子GRAS家族基因SCL3 (scarecrow-like 3)并对其进行了表达分析.该基因cDNA序列全长2 278 bp,命名为DoSCL3 (GenBank注册号:MG252261),其编码425个氨基酸,分子量为47.88 kD,等电点(PD为6.21.DoSCL3基因编码的蛋白不含跨膜域和信号肽,具有GRAS转录因子家族特有的保守结构域(22~422);多序列比对表明,DoSCL3与小兰屿蝴蝶兰的SCL3蛋白高度同源(相似性达到83%),同时进化树分析结果显示其与小兰屿蝴蝶兰亲缘关系非常相近.qRT-PCR实验结果显示,DoSCL3基因在铁皮石斛种子共生萌发中随着萌发进程的变化(1~3级,萌发至原球茎阶段)其表达量逐渐升高,并且在种子萌发至2级时,共生萌发组表达量显著高于无菌萌发组(为无菌组2.2倍),表明DoSCL3在兰科药用植物铁皮石斛种子共生萌发中菌根共生关系的建立过程起到重要的调控作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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FAM83A对肺癌诊断的临床意义及其对肺癌细胞增殖和迁移的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨序列相似性为83的家族A成员(FAM83A)对肺癌诊断的临床意义及其对肺癌细胞增殖和迁移的影响.方法 "GEPIA"网站分析FAM83A在肺癌组织和正常组织中的表达.然后采用荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测肺癌血清样本中FAM83A mRNA相对表达水平,ROC曲线分析FAM83A mRNA在肺癌诊断中的作用,进一步分析其和肺癌患者临床特征的关系.最后在肺癌细胞A549和SK-MES-1中采用Lipofectamine 2000转染si-FAM83A,qRT-PCR和Western blot分别检测转染si-FAM83A后肺癌细胞中FAM83A mRNA和蛋白表达水平.MTT和Transwell实验分别检测干扰FAM83A后肺癌细胞的增殖和迁移侵袭.结果 "GEPIA"分析结果表明FAM83A在肺癌组织中的相对表达水平显著高于正常组织.进一步检测表明在肺癌患者血清中FAM83A mRNA相对表达水平显著高于体检健康者.采用血清中FAM83A mRNA表达水平诊断肺癌的受试者工作特征曲线下面积为0.927,最佳诊断值为2.12.肺癌患者血清中FAM83A mRNA相对表达水平与患者年龄无关,但与肿瘤大小、TNM分期以及淋巴结转移显著相关.在肺癌细胞A549和SK-MES-1中转染si-FAM83A能有效干扰细胞中FAM83A mRNA和蛋白的表达.干扰FAM83A表达能显著抑制A549和SK-MES-1细胞的增殖、迁移和侵袭.结论 血清中FAM83A mRNA表达水平在肺癌诊断中具有一定的临床意义,干扰FAM83A表达能显著抑制肺癌细胞增殖、迁移和侵袭.
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编辑人员丨2023/8/5
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FAM83A在肺腺癌组织中高表达且促进肺腺癌细胞的侵袭和转移
编辑人员丨2023/8/5
背景与目的:越来越多的研究表明,序列相似性为83的家族成员A(family with sequence similarity 83 member A,FAM83A)与肿瘤的侵袭和转移相关,但FAM83A在肺腺癌中的作用尚不清楚.探讨FAM83A在肺腺癌组织中的表达情况,与肺腺癌患者预后的关系以及对肺腺癌细胞增殖、侵袭转移能力的影响.方法:运用人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas,HPA)和基因表达谱动态分析(Gene Expression Proifling Interactive Analysis,GEPIA)数据库分析并选取与肺腺癌预后相关的基因;运用UALCAN和GEPIA数据库研究FAM83A的表达量对肺腺癌生存率的影响;采用UALCAN数据库分析FAM83A在肺腺癌组织中的表达及其与肺腺癌患者的性别、淋巴结的分期和转移的关系;采用蛋白质印迹法(Western blot)检测人正常肺上皮细胞BEAS-2B和肺腺癌细胞A549中FAM83A蛋白的表达情况及FAM83A的转染效率;采用细胞计数试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)检测转染后敲减FAM83A对肺腺癌细胞增殖能力的影响;采用transwell侵袭实验检测FAM83A对肺腺癌细胞侵袭能力的影响.结果:采用HPA、GEPIA和UALCAN数据库分析发现高表达的FAM83A与肺腺癌不良预后相关且FAM83A在肺腺癌组织中高表达,差异有统计学意义(P<0.05);FAM83A的表达与肺腺癌的临床分期和淋巴结转移相关;Western blot检测结果显示,FAM83A在肺腺癌细胞中高表达且敲减质粒转染成功;CCK-8细胞增殖实验结果提示FAM83A可促进细胞的增殖能力(P<0.05);Transwell侵袭实验提示FAM83A促进A549的侵袭能力(P<0.05).结论:FAM83A在肺腺癌组织和细胞中高表达且促进肺腺癌细胞的增殖、侵袭和转移.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA FAM83H-AS1对胃癌细胞周期、增殖和转移的影响及作用机制
编辑人员丨2023/8/5
目的 研究长链非编码RNA序列相似性家族83成员H反义RNA 1(lncRNA FAM83H-AS1)对胃癌细胞周期、增殖和转移的影响,并探讨其作用的可能机制.方法 qRT-PCR检测FAM83H-AS1在胃癌细胞系MKN-45、SGC-7901、MGC-803和人永生化正常胃上皮细胞GES-1中的表达水平,选择表达最高的胃癌细胞系进行FAM83H-AS1小干扰核糖核酸(siRNA)感染,分为si-NC组和si-FAM83 H-AS1组.qRT-PCR检测各组细胞中FAM83H-AS1的表达水平;流式细胞仪检测FAM83H-AS1对细胞周期的影响;MTS和平板克隆实验检测FAM83H-AS1对细胞增殖能力的影响;Transwell实验检测FAM83H-AS1对细胞转移能力的影响;Western blot检测FAM83H-AS1对cyclinD1和细胞周期蛋白依赖激酶4(CDK4)以及上皮间质转化过程(EMT)标志蛋白的表达影响.结果 qRT-PCR检测结果显示FAM83H-AS1在胃癌细胞系的表达水平高于在人永生化正常胃上皮细胞GES-1中的表达(P<0.05),选择表达水平最高的胃癌细胞系MKN-45转染FAM83H-AS1 siRNA,qRT-PCR结果显示si-FAM83H-AS1组细胞中FAM83H-AS1的表达降低(P<0.05);si-FAM83H-AS1组MKN-45细胞增殖和转移能力下降,细胞中细胞周期蛋白cyclinD1和CDK4蛋白的表达降低,EMT标志蛋白E钙黏蛋白蛋白表达增加,N钙黏蛋白和波形蛋白蛋白表达降低.结论 干扰FAM83H-AS1的表达抑制胃癌细胞增殖和转移能力.FAM83H-AS1可能是胃癌治疗的新型靶标.
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编辑人员丨2023/8/5
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miR-206靶向FAM83A影响Wnt/β-catenin通路调控胰腺癌放疗敏感性
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究microRNA-206(miR-206)对胰腺癌细胞放疗敏感性的影响.方法 通过2 Gy照射胰腺癌细胞(AsPC-1、Capan-2、PL45、PANC-1),以人类正常胰腺上皮细胞(HPNE)作为对照,荧光定量聚合酶链反应(qPCR)实验观察细胞中miR-206的表达量;细胞克隆实验检测过表达miR-206对PANC-1细胞存活率的影响,流式细胞术分析其凋亡率;在线软件Targetscan预测miR-206的靶基因,双荧光素酶报告基因验证miR-206与序列相似性家族83成员(FAM83)A的靶向关系;过表达/敲低miR-206对FAM83A蛋白水平的影响;Western印迹检测共转染过表达miR-206和FAM83A对FAM83A蛋白及β-catenin、细胞周期蛋白(Cyclin)D1蛋白水平的影响.结果 miR-206在放射照射的胰腺癌多种细胞系中表达量显著降低(P<0.05);过表达miR-206显著促进其凋亡(P<0.05);FAM83A是miR-206的直接靶基因;miR-206可负反馈调节FAM83A表达量;共转染过表达miR-206和FAM83A可显著逆转miR-206对FAM83A蛋白水平的抑制作用,恢复其对PANC-1细胞存活分数的抑制、凋亡促进作用,改善miR-206对Wnt/β-catenin信号通路的抑制作用.结论 miR-206靶向抑制FAM83A表达影响Wnt/β-catenin信号通路的活性,从而介导胰腺癌PANC-1细胞的放疗敏感性.
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编辑人员丨2023/8/5
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FAM83A在恶性肿瘤中的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
FAM83A即序列相似性为83的家族成员A基因,是一种蛋白编码基因,含功能有待明确的结构域1669,最初被鉴定为潜在肿瘤基因,其在肺癌、肝癌、乳腺癌等恶性肿瘤中表达上调,促进癌细胞增殖、迁移、侵袭及上皮细胞-间充质转化等作用.目前研究认为多种微RNA能够作为抑癌基因,而circRNA或长链非编码RNA为其上游,直接或间接靶向FAM83A形成轴作用于信号通路,抑制癌症的发生发展,但具体分子机制仍有待进一步深入研究.本文对FAM83A在恶性肿瘤中的表达及作用作一综述.
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编辑人员丨2023/8/5
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多数据库联合分析卵巢癌预后相关基因
编辑人员丨2023/8/5
目的 寻找卵巢癌预后的关键基因,为卵巢癌治疗提供新的靶点.方法 从基因表达汇编(GEO)数据库GSE18520和GSE14407数据集、癌症基因组图谱(TCGA)数据库及基因型-组织表达(GTEx)数据库中下载卵巢癌相关数据,用R 3.6.2软件limma包进行差异表达基因分析,随后使用R 3.6.2软件clusterProfiler包对差异表达基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.使用STRING数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用Cytoscape软件cytoHubba插件筛选核心基因,利用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库验证核心基因在卵巢癌组织中的表达情况,随后使用Kaplan-Meier Plotter数据库对核心基因进行生存分析.结果 通过GEO数据库GSE18520、GSE14407数据集及TCGA、GTEx数据库共同筛选获得69个差异表达基因,主要富集在ABC转运体、视黄醇代谢及Wnt信号通路.蛋白质-蛋白质相互作用网络分析提示共有9个核心基因,GEPIA数据库分析结果表明这9个基因在卵巢癌中高表达.Kaplan-Meier Plotter数据库分析结果表明,中心体相关蛋白55(CEP55)、序列相似性83家族蛋白成员D(FAM83D)、驱动蛋白家族成员20A(KIF20A)、细胞周期依赖性激酶亚基蛋白2(CKS2)和中心体相关激酶2(NEK2)基因高表达的卵巢癌患者总生存期比低表达的患者缩短,CEP55、FAM83D、KIF20A、叉头框蛋白M1(FOXM1)和TTK蛋白激酶(TTK)基因高表达的患者无进展生存期比低表达的患者缩短.结论 CEP55、FAM83D、KIF20A、CKS2、NEK2、FOXM1和TTK的表达与卵巢癌患者的预后密切相关.
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编辑人员丨2023/8/5
