目的 评估亚洲璃眼蜱在普氏野马分布区域传播疾病的潜在风险,研究雌、雄蜱在宏基因组水平的特征并进行病原体分析.方法 2022年4月,在新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区使用"守株待蜱"法采集硬蜱,利用体视镜进行形态学鉴定,提取48只蜱(雌、雄各24只)DNA,PCR扩增线粒体细胞色素C氧化酶第1亚基(COⅠ)序列进行分子生物学鉴定.将雌、雄亚洲璃眼蜱分组进行宏基因组测序,非冗余基因集与非冗余蛋白(NR)数据库进行比对,分析蜱携带的微生物群落组成;与京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库和抗生素抗性基因数据库(ARDB)进行比对,获取蜱及蜱传病原体的基因功能注释结果以及抗生素抗性功能注释结果.数据的比较采用t检验分析.结果 共采集硬蜱124只,经形态学鉴定亚洲璃眼蜱成虫119只.硬蜱DNA扩增出约700 bp的阳性条带,经测序与亚洲璃眼蜱(GenBank:MH459386.1)的序列一致性为99％～100％.宏基因组测序经质控过滤共获得469 327 812条序列读长,开放阅读框预测得到836 843～1 094 994条序列.NR数据库比对结果显示,亚洲璃眼蜱携带的细菌菌落丰度占注释到的总群落丰度的99.13％,共注释到细菌32门2 040种,变形菌门和放线菌门为优势菌门,分别占细菌群落丰度的51.52％和44.35％;嗜吞噬细胞无形体为优势菌种,占细菌群落丰度的16.35％.病毒菌落丰度占注释到的总群落丰度的0.004％,共注释到病毒5 门 21种.雌蜱和雄蜱携带的细菌群落和病毒群落的丰富度及多样性差异均无统计学意义(t=-1.180、-1.729,均P＞0.05).KEGG基因功能注释到亚洲璃眼蜱新陈代谢基因占比最高(54.38％),主要的功能条目为氨基酸代谢、碳水化合物代谢、膜转运等;共识别出11 352种蛋白通路,其中154种蛋白通路在雌蜱和雄蜱间的差异有统计学意义(t=-2.348,P＜0.05).ARDB注释到亚洲璃眼蜱携带154种抗生素抗性基因,包括49种抗性基因类型,主要抗性基因类型为Baca(占62.53％),抗生素类型为肝菌肽.大部分注释到的抗性基因与多重耐药相关,如Mexf、Mexb、Emrd、Mexw等.雌蜱和雄蜱在抗生素抗性基因类型的差异性对比结果显示,仅雌蜱的Emrd基因抗性高于雄蜱(t=-7.558,P＜0.05).结论 本研究在宏基因组水平上揭示了亚洲璃眼蜱携带的主要细菌、病毒群落及多重耐药相关的抗生素抗性基因,雌蜱及其携带的病原体具有较高的物种丰度和基因丰度.

《齐民要术》造神曲法对后世六神曲的影响深远。药物组成方面：面曲延续至今，后世发展了全麸麦曲与麸曲。野蓼的范围逐渐缩小到辣蓼与红蓼。神曲的制作加工工艺方面：诸鲜药由水煮发展为捣汁与水煮并行，小麦由蒸炒生并用简化为仅用生麦。曲饼“溲欲刚”的干湿程度至今仍为业界圭臬。曲饼的成型方法手抟与用模具成型均有传承。覆盖曲饼的材料由麦秸、青蒿扩展到黄荆，并使用麻叶、楮叶、纸等包裹曲饼。对于发酵过程中的翻曲、聚曲、瓮盛的工艺后世没有传承。晾晒的方法由成串曲饼悬挂发展为纸包单独悬挂。罨曲法至今仍为主流，后世扩展了风曲法与造酱黄法。现代神曲的罨曲法与造酱黄法的制作工艺仍不出《齐民要术》这一渊薮，而添加旧曲的 曲法的基础，仍是罨曲法。尚需进一步研究的问题有：青蒿、辣蓼、苍耳的入药方式；曲饼的形制；单一菌种发酵或优势种群发酵研究；风曲法的研究；曲饼包裹与覆盖的材料研究；面曲、全麸麦曲、麸曲的比较。

婴儿期是肠道菌群形成和发展最为关键的时期，作为肠道菌群演替速度较快的重要阶段，稳定的肠道菌群定植对机体健康、免疫系统的建立及完善有着重大且长远的意义。母乳中富含人乳低聚糖(HMOs)，能够有效促进婴儿肠道中有益细菌的生长，抑制病原菌的侵袭，改善肠道菌群组成，提高菌种多样性，促进婴儿生长发育。现就HMOs的研究现状及其对婴儿肠道菌群的影响进行综述。

目的:探讨头孢噻肟联合左氧氟沙星治疗社区获得性肺炎(CAP)对患者肠道菌群结构和多样性的影响。方法:选择2018年10月至12月浙江省立同德医院感染科收治的CAP住院患者6例，予头孢噻肟注射液2.0 g(1次/8 h)联合左氧氟沙星注射液0.5 g(1次/d)静脉给药治疗，留取患者抗菌药物治疗前和经7 d治疗后粪便样本共12份，采用自身配对设计研究，对治疗前后的粪便样本进行16S核糖体RNA(16S rRNA)测序分析。结果:⑴治疗前和治疗后患者肠道菌群的组成结构：在门水平：厚壁菌门59.2% vs 40.8%，变形菌门18.6% vs 35.5%，拟杆菌门14.8% vs 20.8%，放线菌门5.6% vs 1.2%；在科水平：瘤胃菌科34.5% vs 13.0%、毛螺菌科15.9% vs 9.7%、韦荣球菌科1.8% vs 3.3%、乳杆菌科0.3% vs 8.0%、肠球菌科0.02% vs 5.2%、链球菌科2.9% vs 1.1%、肠杆菌科16.4% vs 34.6%、拟杆菌科13.3% vs 16.8%、紫单胞菌科0.3% vs 3.4%、红蝽杆菌科4.4% vs 0.5%。治疗前后患者肠道菌群的组成结构比较差异无统计学意义( P>0.05)。⑵治疗前和治疗后患者肠道菌群的多样性：OTU值(150.5±59.0) vs (93.2±34.1)， t＝2.72， P＝0.04；Chao1指数(169.25±49.61) vs (117.92±35.06)， t＝3.22， P＝0.02；shannon指数(3.61±0.83) vs (2.31±0.73)， t＝4.54， P＝0.01；simpson指数(0.80±0.10) vs (0.61±0.20)， t＝2.76， P＝0.04。治疗前后患者肠道菌群的多样性比较差异均有统计学意义( P<0.05)。⑶脱硫弧菌为治疗前和治疗后组间差异有统计学意义的菌群，LDA值＝2.03， P＝0.02。 结论:头孢噻肟联合左氧氟沙星治疗一周对CAP患者肠道菌群的多样性有显著影响，治疗后肠道菌群的多样性明显减少，脱硫弧菌是治疗前和治疗后差异有统计学意义的菌种。

目的:研究正常孕妇阴道菌群特征及影响因素。方法:本研究基于2018年2月至2020年2月在安徽医科大学附属安庆医院建立的孕妇队列，将所有符合纳入排除标准的"正常"孕妇阴道样本，按采样孕周顺序排列，以每个孕周为一抽样层，每层随机抽取5例样本，不足5例则全部纳入，使用16S rRNA基因测序技术测得样本V3~V4序列。利用MicrobiomeAnalyst进行优势菌种分析。Alpha多样性以Chao1、Observed Features、Shannon、Simpson、Faith_pd、Pielou′s Evenness指数的对数值进行表示，并依据样本是否以乳酸菌为主导划分为两类，分别利用多重线性回归、Logistic回归探索影响因素。连续性变量采用方差分析、Kruskal Wallis检验，分类数据则采用卡方检验、Fisher检验。 P<0.05时认为数据差异有统计学意义。 结果:本研究纳入91例孕妇/91例阴道标本，平均年龄为(27.37±3.60)岁，孕早期、孕中期、孕晚期分别纳入18个、56个和17个阴道样本，孕周中位数分别为11.93周、19.43周和38.29周。样本物种组成：门水平上，厚壁菌门相对丰度为91.30%；属水平上，乳酸菌属相对丰度为87.67%；种水平上，惰性乳酸菌、卷曲乳酸菌相对丰度分别为42.95%、36.33%。惰性乳酸菌在所有孕期均显示出优势性，其相对丰度较高的样本数随孕期逐渐减少，卷曲乳酸菌在孕中期、孕晚期显示出优势性，其相对丰度较高的样本数随孕期逐渐增加。孕期阴道菌群Alpha多样性随着孕周推进，呈逐渐降低的趋势。不同吸烟习惯孕妇阴道菌群Pielou′s Evenness多样性指标差异有统计学意义( P<0.05)，不同饮酒习惯孕妇阴道菌群Shannon多样性指标差异具有统计学意义( P<0.05)。不同教育水平孕妇阴道菌群Chao1、Observed Features、Faith_pd多样性指标差异有统计学意义( P<0.05)，不同收入水平孕妇阴道菌群Shannon、Simpson多样性指标差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:正常孕妇阴道内以乳酸菌为主导，随着孕期推进，惰性乳酸菌的优势性逐渐降低，卷曲乳酸菌优势性逐渐升高。正常孕妇阴道菌群Alpha多样性与吸烟、饮酒、教育水平、家庭收入水平有关，孕前戒烟、孕前有饮酒习惯的孕妇阴道菌群Alpha多样性较低，较低教育水平、较高家庭收入水平孕妇阴道菌群Alpha多样性较高。

目的:通过比较牛奶蛋白过敏婴儿饮食回避治疗前后肠道菌群的变化，探讨饮食回避治疗对牛奶过敏婴儿肠道菌群的影响。方法:收集我院消化科门诊就诊的人工喂养、临床诊断牛奶蛋白过敏的婴儿，暂停普通配方更换为氨基酸配方粉喂养4周。选择其中成功治疗病例23例，收集治疗前及治疗后的粪便标本，分别提取粪便基因组，对16S rDNA特定区段PCR产物进行高通量测序，结果进行生物信息学分析，比较干预前后菌群组成的差异，寻找组间差异物种。结果:牛奶蛋白过敏患儿饮食回避疗法后，肠道菌群多样性差异无统计学意义( P>0.05)，但肠道菌群的结构发生了变化。在门的水平上，治疗后变形菌门减少，其下级水平纲的水平上，α-变形菌纲与γ-变形菌纲均显著减少，肠杆菌科及肠杆菌属、颗粒链菌属均显著减少。在科的水平上，肉杆菌科、消化链球菌科及梭菌科下的Peptoclostridium菌属均较治疗前显著减少，乳杆菌科及下属乳杆菌属、优杆菌科及下属优杆菌属、瘤胃球菌属、Limosum菌种，以及巴氏杆菌目-巴氏杆菌科-嗜血杆菌属-副流感嗜血杆菌T3T1菌种、长双歧杆菌婴儿亚种ATCC15697/JCM1222/DSM20088和Pseudocatenulatum-DSM20438/JCM1200/LMG10505均较治疗前显著升高，差异均有统计学意义( P均<0.05)。 结论:牛奶蛋白过敏患儿经饮食回避治疗后，肠道菌群中有害菌减少，有益菌增加。

目的:比较先天性巨结肠患儿与正常儿童肠道菌群差异，阐明先天性巨结肠对肠道菌群组成的影响。方法:收集2019年4月至2020年12月来河北省儿童医院就诊的先天性巨结肠患儿与体检的正常儿童粪便样本。10例先天性巨结肠患儿纳入先天性巨结肠患儿组(HDB_Nor组)，其中男7例，女3例；年龄为(1.22±0.65)岁；14例正常儿童纳入对照组，即正常儿童组(Normal组)，其中男8例，女6例；年龄为(1.67±0.84)岁。利用细菌16S rRNA基因序列测序，通过QIIME 2平台对测序数据进行统计分析并绘图，对比分析两组肠道菌群组成、多样性、菌群差异、菌群物种间相关性以及菌群与疾病之间联系。结果:在肠道菌群组成、Beta多样性方面先天性巨结肠患儿与正常儿童肠道菌群差异有统计学意义；LEfSe差异分析结果显示假小链双歧杆菌、两歧双歧杆菌、瘤胃菌属等在先天性巨结肠患儿组中物种显著增加；放线菌属、粘滑罗斯菌属及弗氏柠檬酸杆菌等三个细菌种属在先天性巨结肠患儿组中显著减少。通过肠道菌群与先天性巨结肠相关性分析发现AKK菌属、大肠埃希-志贺氏菌属、肠球菌属和伯克霍尔德菌属等四个种属与疾病关联性影响较大。结论:先天性巨结肠患儿与正常儿童肠道菌群组成及多样性方面存在显著差异，先天性巨结肠影响肠道菌群的组成和多样性，尤其是对AKK菌属和大肠埃希-志贺氏菌属两个菌属的影响更显著。

目的:比较全孕程正常和异常孕妇阴道菌群的特征。方法:收集安徽省安庆市2018年2月—2020年2月孕妇孕早(<14孕周)、孕中(14～28孕周)和孕晚(>28孕周)期阴道拭子，依据全孕程临床诊断划分为正常组和异常组。对拭子进行16S rRNA基因V3～V4区的测序，使用QIIME2平台对测序数据进行分析；对阴道菌群的主导菌种、群落状态类型(community state type，CST)转换、Alpha和Beta多样性进行组间比较；多样性指标经对数转换后进行线性混合模型拟合。结果:本研究共纳入34例孕妇，其中正常孕妇组10例，异常孕妇组24例，共102份样本。两组菌群组成在属水平上乳酸菌属相对丰度均最高，种水平主要为卷曲乳酸菌和惰性乳酸菌；乳酸菌主导性、Alpha多样性和CST变化无不同。两组菌群Alpha多样性指标均随孕周逐渐降低，不同孕周间Chao1、Observed species、Faith′s PD指标不同。正常组Beta多样性指标均呈现降低趋势，且第一距离值较低，菌群稳定性较高，而异常组Bray-Curtis、Weighted UniFrac距离值呈现上升的趋势，稳定性较低；不同孕周间的Jaccard距离的第一距离值、正常和异常孕妇组间Unweighted UniFrac距离的第一距离值存在差异。结论:异常孕妇阴道菌群Weighted UniFrac距离的第一距离值较正常孕妇高，稳定性低。

目的:探讨特应性皮炎（AD）患者面部、上肢和背部皮损真菌群落多样性和结构特征。方法:对2015年9 - 10月来自成都医学院第一附属医院皮肤科门诊的10例AD患者面部、上肢和背部皮损区和10例健康对照相应部位皮肤采样，提取样品DNA行MiSeq高通量测序，进行多样性指数分析、物种组成分析及主成分分析。两组间比较采用独立样本 t检验，多组间均数比较采用单因素方差分析，两两组间多重比较采用LSD- t检验。 结果:多样性指数分析显示，AD患者组面部、上肢、背部皮损区样本Shannon指数均显著高于健康对照组相应区域（ t值分别为2.67、2.37、3.34，均 P < 0.05）。物种组成分析显示，马拉色菌属在AD患者组面部、上肢、背部皮损区和健康对照组相应区域样本中均占主要地位，其中球形马拉色菌和限制马拉色菌丰度合计约为80%。AD患者组总样本念珠菌属、曲霉属丰度显著高于健康对照组（ t值分别为3.515、2.137，均 P < 0.05）。AD患者组与健康对照组面部各主要真菌属丰度差异均无统计学意义（均 P > 0.05）；AD患者组上肢念珠菌属丰度显著高于健康对照组（ t = 3.186， P < 0.05），背部曲霉属丰度显著高于健康对照组（ t = 2.736， P < 0.05）。AD患者组、健康对照组面部、上肢、背部样本间主要真菌属丰度差异均无统计学意义（ P > 0.05）。轻中重度AD患者组样本间各主要真菌属丰度比较，差异均无统计学意义（均 P > 0.05）。主成分分析显示，AD患者组面部、上肢、背部皮损样本真菌群落未按病情严重程度聚类。 结论:AD患者面部、上肢、背部皮损区真菌群落多样性明显高于健康对照相应区域，马拉色菌为AD患者上述部位皮损和健康对照相应区域的优势菌种，AD患者皮损区样本中真菌群落组成与疾病严重程度可能无相关性。

目的:探讨女性泌尿道宿主、环境、微生物菌群间的关系及宿主反应性变化，证明泌尿道存在特征性菌群；探讨菌群变化与尿路感染的关系，对尿路感染诊疗产生观念性改变。方法:临床资料收集于2018年2月至2018年3月期间，应用16SrRNA基因测序对健康绝经后(A组，5例)、健康育龄期(B组，5例)及尿路感染的绝经后女性(C组，14例)尿液进行菌群测定，分析泌尿道菌群结构和组成的多样性及差异性。结果:女性尿液中包含种类繁多的微生物菌群，构成多样化，个体差异明显，一般以一种或两种菌种占优势，健康育龄期、绝经后女性组优势菌种主要为乳酸杆菌属、加德纳菌属及鞘氨醇单胞菌属，而鞘氨醇单胞菌属在尿路感染绝经后女性组丰度则明显下降；同时，尿路感染组优势菌群主要为肠杆菌科及乳酸杆菌属，且肠杆菌科丰度明显高于另外两组；而乳酸杆菌属丰度水平在健康育龄期组则明显高于绝经后两组。结论:女性泌尿道菌群以乳酸杆菌属为优势菌，绝经后尿路感染女性泌尿道菌群表现为乳酸杆菌属、鞘氨醇单胞菌属显著减少及肠杆菌科丰度增加，提示这可能是引起绝经后妇女尿路感染发病率升高的重要原因，为诊断尿路感染及非抗菌素手段治疗尿路感染提供思路。